studium 0.13.1

Sign up to get free protection for your applications and to get access to all the features.

Potentially problematic release.


This version of studium might be problematic. Click here for more details.

Files changed (871) hide show
  1. checksums.yaml +7 -0
  2. data/README.md +2785 -0
  3. data/bin/ask_exam_question +7 -0
  4. data/bin/check_description_of_these_lectures +7 -0
  5. data/bin/curriculum_module_displayer +7 -0
  6. data/bin/cycle +7 -0
  7. data/bin/d10 +7 -0
  8. data/bin/d100 +7 -0
  9. data/bin/d15 +7 -0
  10. data/bin/d20 +7 -0
  11. data/bin/d25 +7 -0
  12. data/bin/d3 +7 -0
  13. data/bin/d30 +7 -0
  14. data/bin/d5 +7 -0
  15. data/bin/determine_curricula +7 -0
  16. data/bin/display_lecture_url +7 -0
  17. data/bin/exam_registration_at +7 -0
  18. data/bin/exam_statistics +7 -0
  19. data/bin/exams_per_month +9 -0
  20. data/bin/finished_exams_at_this_university +7 -0
  21. data/bin/flashcards +7 -0
  22. data/bin/from_curriculum_id_to_university +9 -0
  23. data/bin/location_to_this_exam_topic.rb +7 -0
  24. data/bin/mandatory_continuous_assessment +7 -0
  25. data/bin/mandatory_upcoming_courses +7 -0
  26. data/bin/n_ECTS +7 -0
  27. data/bin/n_exam_questions_already_answered +16 -0
  28. data/bin/nquestions +7 -0
  29. data/bin/nsolved +7 -0
  30. data/bin/open_last_exam_question_asked_file +7 -0
  31. data/bin/passed_exams +7 -0
  32. data/bin/passed_pr/303/274fungsimmanente_courses +7 -0
  33. data/bin/pdf_for +7 -0
  34. data/bin/random_exam_topic +7 -0
  35. data/bin/report_solved_topics +7 -0
  36. data/bin/return_n_ects_from_this_file +7 -0
  37. data/bin/search_for_n_ects +7 -0
  38. data/bin/show_lectures_on_the_commandline +7 -0
  39. data/bin/show_themes +7 -0
  40. data/bin/solved +9 -0
  41. data/bin/solved_ects +7 -0
  42. data/bin/studienkennzahl +7 -0
  43. data/bin/studium +7 -0
  44. data/bin/studium_skeleton +7 -0
  45. data/bin/ufind +7 -0
  46. data/bin/upcoming_exams +7 -0
  47. data/bin/week_parser +7 -0
  48. data/doc/ECTS_CONSIDERATIONS.md +81 -0
  49. data/doc/HOW_TO_DETERMINE_WHICH_PART_IS_THE_QUESTION_AND_WHICH_PART_IS_THE_ANSWER.md +44 -0
  50. data/doc/README.gen +2742 -0
  51. data/doc/SQL_database_specification.md +46 -0
  52. data/doc/deprecated_components.md +24 -0
  53. data/doc/documentation_for_the_file_lecture_information.md +311 -0
  54. data/doc/elegant_colours.md +21 -0
  55. data/doc/todo/TODO_FOR_STUDIUM_GEM.md +112 -0
  56. data/doc/todo/TODO_FOR_THE_GRAPHICAL_PARTS_OF_THE_STUDIUM_GEM_INCLUDING_WWW_RELATED_ASPECTS.md +35 -0
  57. data/img/STUDIES.png +0 -0
  58. data/lib/studium/autoinclude.rb +7 -0
  59. data/lib/studium/base/base.rb +2710 -0
  60. data/lib/studium/base/prototype.rb +543 -0
  61. data/lib/studium/c/README.md +2 -0
  62. data/lib/studium/c/a.out +0 -0
  63. data/lib/studium/c/obtain_random_entry.c +11 -0
  64. data/lib/studium/check_and_sanitize/README.md +11 -0
  65. data/lib/studium/check_and_sanitize/check_curriculum_for_correct_separation_of_bachelor_and_master.rb +141 -0
  66. data/lib/studium/check_and_sanitize/check_for_all_exam_topics_being_registered.rb +110 -0
  67. data/lib/studium/check_and_sanitize/check_for_correct_themes_of_each_course.rb +90 -0
  68. data/lib/studium/check_and_sanitize/check_for_existing_description_of_this_lecture.rb +189 -0
  69. data/lib/studium/check_and_sanitize/check_the_lecture_information_file.rb +163 -0
  70. data/lib/studium/check_and_sanitize/find_duplicate_lectures.rb +115 -0
  71. data/lib/studium/check_and_sanitize/missing_priority_entry.rb +44 -0
  72. data/lib/studium/check_and_sanitize/sanitize_this_string_containing_the_lva_dates.rb +79 -0
  73. data/lib/studium/colours/colours.rb +549 -0
  74. data/lib/studium/colours/sfancy.rb +46 -0
  75. data/lib/studium/colours/sfile.rb +35 -0
  76. data/lib/studium/colours/simp.rb +40 -0
  77. data/lib/studium/colours/use_colours.rb +39 -0
  78. data/lib/studium/colours/use_this_colour_for_exam_questions_and_exam_answers.rb +80 -0
  79. data/lib/studium/commandline/commandline.rb +932 -0
  80. data/lib/studium/commandline/menu.rb +903 -0
  81. data/lib/studium/constants/colours.rb +14 -0
  82. data/lib/studium/constants/constants.rb +2142 -0
  83. data/lib/studium/constants/image_constants.rb +217 -0
  84. data/lib/studium/constants/web_constants.rb +25 -0
  85. data/lib/studium/css/project.css +267 -0
  86. data/lib/studium/curricula/curriculum.rb +210 -0
  87. data/lib/studium/curricula/curriculum_as_string.rb +280 -0
  88. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/constants.rb +33 -0
  89. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/curriculum_module_displayer.rb +417 -0
  90. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/initialize.rb +25 -0
  91. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/menu.rb +45 -0
  92. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/reset.rb +74 -0
  93. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/run.rb +20 -0
  94. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/set_use_this_curriculum.rb +93 -0
  95. data/lib/studium/curricula/curriculum_module_displayer/show_and_report.rb +190 -0
  96. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/constants.rb +11 -0
  97. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/determine_curricula.rb +36 -0
  98. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/help.rb +39 -0
  99. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/initialize.rb +48 -0
  100. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/menu.rb +151 -0
  101. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/misc.rb +403 -0
  102. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/report.rb +143 -0
  103. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/reset.rb +59 -0
  104. data/lib/studium/curricula/determine_curricula/run.rb +19 -0
  105. data/lib/studium/curricula/determine_elective_courses_in_this_curriculum.rb +112 -0
  106. data/lib/studium/curricula/display_bachelor_curricula.rb +90 -0
  107. data/lib/studium/curricula/mitteilungsbl/303/244tter/mitteilungsbl/303/244tter.rb +324 -0
  108. data/lib/studium/curricula/modules/display_on_the_commandline.rb +319 -0
  109. data/lib/studium/curricula/modules/return_n_ects_in_this_module.rb +75 -0
  110. data/lib/studium/curricula/n_percent_solved_in_this_curriculum.rb +75 -0
  111. data/lib/studium/curricula/prepare_individual_curriculum.rb +304 -0
  112. data/lib/studium/curricula/random_curriculum_creator/random_curriculum_creator.rb +163 -0
  113. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum.rb +114 -0
  114. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum_id/constants.rb +11 -0
  115. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum_id/initialize.rb +27 -0
  116. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum_id/menu.rb +35 -0
  117. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum_id/misc.rb +264 -0
  118. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum_id/report.rb +163 -0
  119. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum_id/reset.rb +64 -0
  120. data/lib/studium/curricula/show_lectures_of_this_curriculum_id/show_lectures_of_this_curriculum_id.rb +38 -0
  121. data/lib/studium/curricula/show_solved_percentage_among_the_registered_curricula.rb +87 -0
  122. data/lib/studium/ects/boku_ects_splitter.rb +128 -0
  123. data/lib/studium/ects/ects_per_university.rb +179 -0
  124. data/lib/studium/ects/ects_scanner.rb +141 -0
  125. data/lib/studium/ects/ects_to_university_parser.rb +142 -0
  126. data/lib/studium/ects/last_entry_is_curriculum.rb +150 -0
  127. data/lib/studium/ects/n_ects_in_these_lectures.rb +196 -0
  128. data/lib/studium/ects/n_ects_points_in_mandatory_presence_courses.rb +50 -0
  129. data/lib/studium/ects/return_n_ects_from_this_file.rb +59 -0
  130. data/lib/studium/ects/return_n_ects_from_this_url.rb +196 -0
  131. data/lib/studium/ects/search_for_n_ects.rb +614 -0
  132. data/lib/studium/ects/show_completed_ects_in_all_curricula.rb +191 -0
  133. data/lib/studium/ects/show_passed_credits_per_curriculum.rb +276 -0
  134. data/lib/studium/ects/simple_total_ects_points.rb +135 -0
  135. data/lib/studium/ects/solved_ects/constants.rb +19 -0
  136. data/lib/studium/ects/solved_ects/reset.rb +51 -0
  137. data/lib/studium/ects/solved_ects/solved_ects.rb +325 -0
  138. data/lib/studium/ects/solved_ects_per_university/reset.rb +25 -0
  139. data/lib/studium/ects/solved_ects_per_university/solved_ects_per_university.rb +106 -0
  140. data/lib/studium/ects/still_missing.rb +129 -0
  141. data/lib/studium/ects/sum_of_ects.rb +144 -0
  142. data/lib/studium/encoding/encoding.rb +108 -0
  143. data/lib/studium/exam_topics/RNAi_siRNA_and_miRNA +86 -0
  144. data/lib/studium/exam_topics/abfall_als_ressource +86 -0
  145. data/lib/studium/exam_topics/advanced_biochemistry +781 -0
  146. data/lib/studium/exam_topics/advanced_biotechnology +214 -0
  147. data/lib/studium/exam_topics/advanced_cellbiology +27 -0
  148. data/lib/studium/exam_topics/advanced_chemistry +504 -0
  149. data/lib/studium/exam_topics/advanced_microbiology +43 -0
  150. data/lib/studium/exam_topics/advanced_topics_in_plant_sciences +85 -0
  151. data/lib/studium/exam_topics/advanced_virology +218 -0
  152. data/lib/studium/exam_topics/ageing +114 -0
  153. data/lib/studium/exam_topics/agrar_ecology +63 -0
  154. data/lib/studium/exam_topics/agrarmarkt +71 -0
  155. data/lib/studium/exam_topics/agrarphysik +35 -0
  156. data/lib/studium/exam_topics/alcohols +29 -0
  157. data/lib/studium/exam_topics/algorithms +52 -0
  158. data/lib/studium/exam_topics/allergie +75 -0
  159. data/lib/studium/exam_topics/allgemeine_genetik +1006 -0
  160. data/lib/studium/exam_topics/allgemeine_mikrobiologie +946 -0
  161. data/lib/studium/exam_topics/aminoacids +438 -0
  162. data/lib/studium/exam_topics/analytische_chemie_1 +132 -0
  163. data/lib/studium/exam_topics/analytische_chemie_2 +31 -0
  164. data/lib/studium/exam_topics/anatomie +290 -0
  165. data/lib/studium/exam_topics/anorganische_chemie +311 -0
  166. data/lib/studium/exam_topics/anthropologie +116 -0
  167. data/lib/studium/exam_topics/antibodies_and_antigens +764 -0
  168. data/lib/studium/exam_topics/apoptosis +35 -0
  169. data/lib/studium/exam_topics/archaea +60 -0
  170. data/lib/studium/exam_topics/architecture +8 -0
  171. data/lib/studium/exam_topics/artificial_intelligence +81 -0
  172. data/lib/studium/exam_topics/atomemissionsspektrometrie +6 -0
  173. data/lib/studium/exam_topics/audio +11 -0
  174. data/lib/studium/exam_topics/bacteriophages +240 -0
  175. data/lib/studium/exam_topics/basic_biochemistry +1002 -0
  176. data/lib/studium/exam_topics/basic_biotechnology +1001 -0
  177. data/lib/studium/exam_topics/basic_chemistry +1007 -0
  178. data/lib/studium/exam_topics/basic_virology +1008 -0
  179. data/lib/studium/exam_topics/bauwesen +6 -0
  180. data/lib/studium/exam_topics/betriebssysteme +126 -0
  181. data/lib/studium/exam_topics/betriebswirtschaftslehre +29 -0
  182. data/lib/studium/exam_topics/bioanalytik_und_biosensoren +382 -0
  183. data/lib/studium/exam_topics/biochips +78 -0
  184. data/lib/studium/exam_topics/bioelektrochemie +57 -0
  185. data/lib/studium/exam_topics/biofilms +22 -0
  186. data/lib/studium/exam_topics/bioinformatics +503 -0
  187. data/lib/studium/exam_topics/biological_therapeutics +153 -0
  188. data/lib/studium/exam_topics/biologie +137 -0
  189. data/lib/studium/exam_topics/biomarkers +106 -0
  190. data/lib/studium/exam_topics/biomaterials +89 -0
  191. data/lib/studium/exam_topics/biomembranes +6 -0
  192. data/lib/studium/exam_topics/bionik +65 -0
  193. data/lib/studium/exam_topics/biophysik +34 -0
  194. data/lib/studium/exam_topics/biopolymers +10 -0
  195. data/lib/studium/exam_topics/bioprozesstechnik +149 -0
  196. data/lib/studium/exam_topics/bioressourcenmanagement +78 -0
  197. data/lib/studium/exam_topics/bodenkunde +373 -0
  198. data/lib/studium/exam_topics/bodenmikrobiologie +40 -0
  199. data/lib/studium/exam_topics/cancerbiology +442 -0
  200. data/lib/studium/exam_topics/cell_cultures +155 -0
  201. data/lib/studium/exam_topics/cellbiology +995 -0
  202. data/lib/studium/exam_topics/cellular_transport_and_protein_secretion +27 -0
  203. data/lib/studium/exam_topics/cellulose +6 -0
  204. data/lib/studium/exam_topics/chemische_technologie_anorganischer_stoffe +209 -0
  205. data/lib/studium/exam_topics/chemische_technologie_organischer_stoffe +25 -0
  206. data/lib/studium/exam_topics/chemisches_labor +60 -0
  207. data/lib/studium/exam_topics/chemotaxis_and_motility_in_prokaryotes +87 -0
  208. data/lib/studium/exam_topics/citric_acid_cycle +80 -0
  209. data/lib/studium/exam_topics/clinical_microbiology +492 -0
  210. data/lib/studium/exam_topics/computer_graphics +5 -0
  211. data/lib/studium/exam_topics/computer_science +280 -0
  212. data/lib/studium/exam_topics/crispr +28 -0
  213. data/lib/studium/exam_topics/cyanobacteria +42 -0
  214. data/lib/studium/exam_topics/cytogenetics_and_chromosome_biology +551 -0
  215. data/lib/studium/exam_topics/cytokines +5 -0
  216. data/lib/studium/exam_topics/databases_and_sql +106 -0
  217. data/lib/studium/exam_topics/dna_mutation_and_dna_repair +35 -0
  218. data/lib/studium/exam_topics/dna_replication +56 -0
  219. data/lib/studium/exam_topics/ecogenetics +26 -0
  220. data/lib/studium/exam_topics/ecological_agriculture +12 -0
  221. data/lib/studium/exam_topics/ecology +314 -0
  222. data/lib/studium/exam_topics/economy +211 -0
  223. data/lib/studium/exam_topics/elektronenmikroskopie +354 -0
  224. data/lib/studium/exam_topics/elektrophorese +89 -0
  225. data/lib/studium/exam_topics/elektrotechnik_und_elektrizit/303/244t +41 -0
  226. data/lib/studium/exam_topics/elisa +54 -0
  227. data/lib/studium/exam_topics/embryologie_und_entwicklung +547 -0
  228. data/lib/studium/exam_topics/endospores_and_spores +104 -0
  229. data/lib/studium/exam_topics/enzymes_and_cofactors +345 -0
  230. data/lib/studium/exam_topics/epigenetik +179 -0
  231. data/lib/studium/exam_topics/ethik +138 -0
  232. data/lib/studium/exam_topics/evolution_and_evolutionary_genetics +328 -0
  233. data/lib/studium/exam_topics/excel +7 -0
  234. data/lib/studium/exam_topics/fish +19 -0
  235. data/lib/studium/exam_topics/fluorescence_microscopy +7 -0
  236. data/lib/studium/exam_topics/food_microbiology_and_food_biotechnology +71 -0
  237. data/lib/studium/exam_topics/forensik +11 -0
  238. data/lib/studium/exam_topics/forstwirtschaft +53 -0
  239. data/lib/studium/exam_topics/fortgeschrittene_genetik +511 -0
  240. data/lib/studium/exam_topics/fortgeschrittene_gentechnik +211 -0
  241. data/lib/studium/exam_topics/fortgeschrittene_physik +6 -0
  242. data/lib/studium/exam_topics/fungi +79 -0
  243. data/lib/studium/exam_topics/genetische_krankheiten +176 -0
  244. data/lib/studium/exam_topics/genexpression +1008 -0
  245. data/lib/studium/exam_topics/genomics_and_metagenomics +244 -0
  246. data/lib/studium/exam_topics/gentechnik_und_praktische_biochemie +901 -0
  247. data/lib/studium/exam_topics/geochemistry +67 -0
  248. data/lib/studium/exam_topics/geography +8 -0
  249. data/lib/studium/exam_topics/geologie_und_mineralogie +621 -0
  250. data/lib/studium/exam_topics/geometrie +47 -0
  251. data/lib/studium/exam_topics/geschichte +93 -0
  252. data/lib/studium/exam_topics/gluconeogenesis +59 -0
  253. data/lib/studium/exam_topics/glycogen +25 -0
  254. data/lib/studium/exam_topics/glycolysis +109 -0
  255. data/lib/studium/exam_topics/glykomik +100 -0
  256. data/lib/studium/exam_topics/glyoxylatzyklus +31 -0
  257. data/lib/studium/exam_topics/grassland_cultivation +32 -0
  258. data/lib/studium/exam_topics/hormone +134 -0
  259. data/lib/studium/exam_topics/html +7 -0
  260. data/lib/studium/exam_topics/human_ecology +8 -0
  261. data/lib/studium/exam_topics/hygiene +191 -0
  262. data/lib/studium/exam_topics/imaging_and_microscopy +241 -0
  263. data/lib/studium/exam_topics/immunanalytik +94 -0
  264. data/lib/studium/exam_topics/immunologie +982 -0
  265. data/lib/studium/exam_topics/informatik +97 -0
  266. data/lib/studium/exam_topics/innate_immunity +22 -0
  267. data/lib/studium/exam_topics/insekten +57 -0
  268. data/lib/studium/exam_topics/insulin_and_diabetes +57 -0
  269. data/lib/studium/exam_topics/java +502 -0
  270. data/lib/studium/exam_topics/javascript +12 -0
  271. data/lib/studium/exam_topics/klima +6 -0
  272. data/lib/studium/exam_topics/kryptographie +5 -0
  273. data/lib/studium/exam_topics/landtechnik +26 -0
  274. data/lib/studium/exam_topics/lebensmittel +208 -0
  275. data/lib/studium/exam_topics/lebensmitteltechnologie +16 -0
  276. data/lib/studium/exam_topics/linux +5 -0
  277. data/lib/studium/exam_topics/lipids +94 -0
  278. data/lib/studium/exam_topics/macroeconomics +40 -0
  279. data/lib/studium/exam_topics/mathematics +254 -0
  280. data/lib/studium/exam_topics/medizin_und_biomedizinische_technik +250 -0
  281. data/lib/studium/exam_topics/medizinische_chemie_und_pharmazie +398 -0
  282. data/lib/studium/exam_topics/messtechnik_und_regeltechnik +104 -0
  283. data/lib/studium/exam_topics/metabolismus +406 -0
  284. data/lib/studium/exam_topics/microbial_ecology +35 -0
  285. data/lib/studium/exam_topics/microcontrollers +11 -0
  286. data/lib/studium/exam_topics/mikrobielle_lebensgemeinschaften +33 -0
  287. data/lib/studium/exam_topics/mikrobielle_physiologie +172 -0
  288. data/lib/studium/exam_topics/mitochondria +32 -0
  289. data/lib/studium/exam_topics/mixed +278 -0
  290. data/lib/studium/exam_topics/molecular_biology_of_plants +242 -0
  291. data/lib/studium/exam_topics/molekulare_medizin +131 -0
  292. data/lib/studium/exam_topics/nanotechnologie +453 -0
  293. data/lib/studium/exam_topics/nature_conservation_and_biodiversity +166 -0
  294. data/lib/studium/exam_topics/naturstoffe +9 -0
  295. data/lib/studium/exam_topics/netzwerke +32 -0
  296. data/lib/studium/exam_topics/neurobiology +267 -0
  297. data/lib/studium/exam_topics/nucleotide_sequencing +32 -0
  298. data/lib/studium/exam_topics/nutztierethologie +11 -0
  299. data/lib/studium/exam_topics/object_oriented_modeling +14 -0
  300. data/lib/studium/exam_topics/obstbau +234 -0
  301. data/lib/studium/exam_topics/organische_chemie +1007 -0
  302. data/lib/studium/exam_topics/organische_chemie_2 +118 -0
  303. data/lib/studium/exam_topics/paleobiology +35 -0
  304. data/lib/studium/exam_topics/parasitic_diseases_and_molecular_infection_biology +335 -0
  305. data/lib/studium/exam_topics/patent_law +55 -0
  306. data/lib/studium/exam_topics/pathologie +717 -0
  307. data/lib/studium/exam_topics/pcr +144 -0
  308. data/lib/studium/exam_topics/pentosephosphatweg +41 -0
  309. data/lib/studium/exam_topics/peroxisomes_glycosomes_and_lysosomes +54 -0
  310. data/lib/studium/exam_topics/pflanzenanatomie +255 -0
  311. data/lib/studium/exam_topics/pflanzenbau +24 -0
  312. data/lib/studium/exam_topics/pflanzenschutz +35 -0
  313. data/lib/studium/exam_topics/pflanzenwissenschaften +1009 -0
  314. data/lib/studium/exam_topics/pharmaceutical_biotechnology +250 -0
  315. data/lib/studium/exam_topics/physik +433 -1
  316. data/lib/studium/exam_topics/physikalische_chemie +86 -0
  317. data/lib/studium/exam_topics/physiology_and_histology +506 -0
  318. data/lib/studium/exam_topics/phytochemie +33 -0
  319. data/lib/studium/exam_topics/plant_biotechnology +128 -0
  320. data/lib/studium/exam_topics/plant_breeding +64 -0
  321. data/lib/studium/exam_topics/plant_development +50 -0
  322. data/lib/studium/exam_topics/populationsgenetik +136 -0
  323. data/lib/studium/exam_topics/posttranslationale_modifikation_von_proteinen +191 -0
  324. data/lib/studium/exam_topics/projektmanagement +219 -0
  325. data/lib/studium/exam_topics/prokaryote_genetics +531 -0
  326. data/lib/studium/exam_topics/protein_engineering +8 -0
  327. data/lib/studium/exam_topics/proteolyse +33 -0
  328. data/lib/studium/exam_topics/proteomik +40 -0
  329. data/lib/studium/exam_topics/prozesstechnik +95 -0
  330. data/lib/studium/exam_topics/psychologie +13 -0
  331. data/lib/studium/exam_topics/python +353 -0
  332. data/lib/studium/exam_topics/quality_management +256 -0
  333. data/lib/studium/exam_topics/rechtsgrundlagen +115 -0
  334. data/lib/studium/exam_topics/research_topics_in_immunobiology +42 -0
  335. data/lib/studium/exam_topics/rna_and_dna +395 -0
  336. data/lib/studium/exam_topics/rna_seq +11 -0
  337. data/lib/studium/exam_topics/ruby +146 -0
  338. data/lib/studium/exam_topics/ruby_on_rails +63 -0
  339. data/lib/studium/exam_topics/scientific_writing_and_publishing +38 -0
  340. data/lib/studium/exam_topics/semisynthese_von_proteinen_und_nukleotiden +120 -0
  341. data/lib/studium/exam_topics/sexualbiologie +62 -0
  342. data/lib/studium/exam_topics/signal_transduction_and_laser_systems +167 -0
  343. data/lib/studium/exam_topics/splicing_exons_and_introns +63 -0
  344. data/lib/studium/exam_topics/statistik +233 -0
  345. data/lib/studium/exam_topics/stemcells +158 -0
  346. data/lib/studium/exam_topics/stickstofffixierung +75 -0
  347. data/lib/studium/exam_topics/structural_bioinformatics +54 -0
  348. data/lib/studium/exam_topics/strukturbiologie +380 -0
  349. data/lib/studium/exam_topics/system_biology_and_synthetic_biology +101 -0
  350. data/lib/studium/exam_topics/systematische_zoologie +433 -0
  351. data/lib/studium/exam_topics/technical_ecology +144 -0
  352. data/lib/studium/exam_topics/technische_chemie +202 -0
  353. data/lib/studium/exam_topics/technische_grundlagen_der_informatik +26 -0
  354. data/lib/studium/exam_topics/technische_mikrobiologie +393 -0
  355. data/lib/studium/exam_topics/technisches_zeichnen +5 -0
  356. data/lib/studium/exam_topics/the_bacterial_cell_wall +97 -0
  357. data/lib/studium/exam_topics/the_c_plus_plus_programming_language +489 -0
  358. data/lib/studium/exam_topics/the_c_programming_language +129 -0
  359. data/lib/studium/exam_topics/the_cellcycle +81 -0
  360. data/lib/studium/exam_topics/the_european_union +119 -0
  361. data/lib/studium/exam_topics/the_interferon_system +38 -0
  362. data/lib/studium/exam_topics/the_microbiome +163 -0
  363. data/lib/studium/exam_topics/the_universe +12 -0
  364. data/lib/studium/exam_topics/theoretische_chemie +5 -0
  365. data/lib/studium/exam_topics/theoretische_informatik +157 -0
  366. data/lib/studium/exam_topics/tierzucht +94 -0
  367. data/lib/studium/exam_topics/toxikologie +408 -0
  368. data/lib/studium/exam_topics/transcription +82 -0
  369. data/lib/studium/exam_topics/translation_ribosomes_and_translational_control +142 -0
  370. data/lib/studium/exam_topics/umweltbiotechnologie +63 -0
  371. data/lib/studium/exam_topics/umweltchemie +233 -0
  372. data/lib/studium/exam_topics/urbanism_and_traffic +19 -0
  373. data/lib/studium/exam_topics/urea_cycle +55 -0
  374. data/lib/studium/exam_topics/vaccines_and_vaccination +242 -0
  375. data/lib/studium/exam_topics/vectors_and_gene_therapy +240 -0
  376. data/lib/studium/exam_topics/verfahrenstechnik +32 -0
  377. data/lib/studium/exam_topics/veterinary_medicine +10 -0
  378. data/lib/studium/exam_topics/vitamine +24 -0
  379. data/lib/studium/exam_topics/wasserkunde +137 -0
  380. data/lib/studium/exam_topics/weinbau +59 -0
  381. data/lib/studium/exam_topics/wissenschaft +18 -0
  382. data/lib/studium/exam_topics/yeast +102 -0
  383. data/lib/studium/exam_topics/zoologie +330 -0
  384. data/lib/studium/exams/afterburn/afterburn.rb +257 -0
  385. data/lib/studium/exams/ask_exam_from_the_upcoming_exams_pool.rb +150 -0
  386. data/lib/studium/exams/ask_exam_topic_question.rb +112 -0
  387. data/lib/studium/exams/ask_question_from_alias.rb +141 -0
  388. data/lib/studium/exams/ask_question_from_any_of_the_still_missing_lectures.rb +131 -0
  389. data/lib/studium/exams/ask_question_from_grouped_themes.rb +141 -0
  390. data/lib/studium/exams/ask_question_from_last_topic.rb +91 -0
  391. data/lib/studium/exams/ask_random_question.rb +195 -0
  392. data/lib/studium/exams/autoinclude.rb +7 -0
  393. data/lib/studium/exams/csv/create_csv_passed_exams_file.rb +217 -0
  394. data/lib/studium/exams/cycle.rb +291 -0
  395. data/lib/studium/exams/dataset.rb +123 -0
  396. data/lib/studium/exams/designate_ten_random_exam_topics/designate_ten_random_exam_topics.rb +88 -0
  397. data/lib/studium/exams/exam/exam.rb +130 -0
  398. data/lib/studium/exams/exam_question/README.md +3 -0
  399. data/lib/studium/exams/exam_question/answer.rb +177 -0
  400. data/lib/studium/exams/exam_question/constants.rb +111 -0
  401. data/lib/studium/exams/exam_question/exam_question.rb +1135 -0
  402. data/lib/studium/exams/exam_question/menu.rb +333 -0
  403. data/lib/studium/exams/exam_question/misc.rb +895 -0
  404. data/lib/studium/exams/exam_question/question.rb +91 -0
  405. data/lib/studium/exams/exam_question/reset.rb +96 -0
  406. data/lib/studium/exams/exam_registration_at/constants.rb +49 -0
  407. data/lib/studium/exams/exam_registration_at/exam_registration_at.rb +242 -0
  408. data/lib/studium/exams/exam_registration_at/help.rb +46 -0
  409. data/lib/studium/exams/exam_registration_at/menu.rb +81 -0
  410. data/lib/studium/exams/exam_registration_at/report_and_show.rb +133 -0
  411. data/lib/studium/exams/exam_registration_at/reset.rb +54 -0
  412. data/lib/studium/exams/exam_statistics_from_this_file/exam_statistics_from_this_file.rb +119 -0
  413. data/lib/studium/exams/exam_topics.rb +194 -0
  414. data/lib/studium/exams/exams.rb +20 -0
  415. data/lib/studium/exams/exams_per_month/exams_per_month.rb +2438 -0
  416. data/lib/studium/exams/exams_this_week.rb +182 -0
  417. data/lib/studium/exams/fix_exam_dates.rb +121 -0
  418. data/lib/studium/exams/frozen.rb +36 -0
  419. data/lib/studium/exams/last_exams/last_exams.rb +398 -0
  420. data/lib/studium/exams/lectures_without_exam_entry.rb +137 -0
  421. data/lib/studium/exams/mandatory_continuous_assessment/mandatory_continuous_assessment.rb +1956 -0
  422. data/lib/studium/exams/move_the_last_exam_question_to_the_top_of_the_file/move_the_last_exam_question_to_the_top_of_the_file.rb +111 -0
  423. data/lib/studium/exams/n_exams_in_these_topics.rb +404 -0
  424. data/lib/studium/exams/next_exam.rb +107 -0
  425. data/lib/studium/exams/next_exams.rb +378 -0
  426. data/lib/studium/exams/open_exam_associated_url.rb +154 -0
  427. data/lib/studium/exams/open_last_exam_question_asked_file/constants.rb +15 -0
  428. data/lib/studium/exams/open_last_exam_question_asked_file/initialize.rb +29 -0
  429. data/lib/studium/exams/open_last_exam_question_asked_file/open_last_exam_question_asked_file.rb +109 -0
  430. data/lib/studium/exams/pr/303/274fung.rb +289 -0
  431. data/lib/studium/exams/push_solved_questions_on_top.rb +180 -0
  432. data/lib/studium/exams/questions_solved_from_day_to_day/questions_solved_from_day_to_day.rb +377 -0
  433. data/lib/studium/exams/remote_ftp_url.rb +52 -0
  434. data/lib/studium/exams/repeat_last_question.rb +78 -0
  435. data/lib/studium/exams/show_all_passed_exams_of_this_university.rb +252 -0
  436. data/lib/studium/exams/show_backlog_of_exams.rb +117 -0
  437. data/lib/studium/exams/show_next_exams_for.rb +133 -0
  438. data/lib/studium/exams/show_themes/constants.rb +28 -0
  439. data/lib/studium/exams/show_themes/menu.rb +61 -0
  440. data/lib/studium/exams/show_themes/misc.rb +537 -0
  441. data/lib/studium/exams/show_themes/reset.rb +62 -0
  442. data/lib/studium/exams/show_themes/show_themes.rb +27 -0
  443. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/consider_autogenerating_exam_aliases.rb +181 -0
  444. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/constants.rb +82 -0
  445. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/help.rb +33 -0
  446. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/initialize.rb +77 -0
  447. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/menu.rb +60 -0
  448. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/report.rb +200 -0
  449. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/reset.rb +45 -0
  450. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/run.rb +20 -0
  451. data/lib/studium/exams/show_upcoming_exams/show_upcoming_exams.rb +544 -0
  452. data/lib/studium/exams/solve_all_questions_from_this_topic.rb +114 -0
  453. data/lib/studium/exams/solved/constants.rb +32 -0
  454. data/lib/studium/exams/solved/help.rb +24 -0
  455. data/lib/studium/exams/solved/initialize.rb +55 -0
  456. data/lib/studium/exams/solved/menu.rb +41 -0
  457. data/lib/studium/exams/solved/reset.rb +28 -0
  458. data/lib/studium/exams/solved/solved.rb +313 -0
  459. data/lib/studium/exams/unsolve_all_questions_from_this_topic.rb +162 -0
  460. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/constants.rb +15 -0
  461. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/help.rb +41 -0
  462. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/initialize.rb +27 -0
  463. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/menu.rb +79 -0
  464. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/misc.rb +415 -0
  465. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/reset.rb +34 -0
  466. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/run.rb +26 -0
  467. data/lib/studium/exams/upcoming_exams/upcoming_exams.rb +32 -0
  468. data/lib/studium/exams/upcoming_exams_at_the_boku/constants.rb +23 -0
  469. data/lib/studium/exams/upcoming_exams_at_the_boku/html.rb +64 -0
  470. data/lib/studium/exams/upcoming_exams_at_the_boku/upcoming_exams_at_the_boku.rb +194 -0
  471. data/lib/studium/exams/upcoming_exams_dataset.rb +247 -0
  472. data/lib/studium/exams/upload_exam_topics.rb +360 -0
  473. data/lib/studium/graphviz/README.md +4 -0
  474. data/lib/studium/graphviz/bachelor_vector_based_strategies.dot +160 -0
  475. data/lib/studium/graphviz/master_vector_based_strategies.dot +46 -0
  476. data/lib/studium/gui/gtk3/README.md +1 -0
  477. data/lib/studium/gui/gtk3/ask_exam_question/ask_exam_question.config +6 -0
  478. data/lib/studium/gui/gtk3/ask_exam_question/ask_exam_question.rb +760 -0
  479. data/lib/studium/gui/gtk3/ask_exam_question/manifest.yml +12 -0
  480. data/lib/studium/gui/gtk3/control_panel/control_panel.rb +39 -0
  481. data/lib/studium/gui/gtk3/curriculum_viewer/curriculum_viewer.rb +510 -0
  482. data/lib/studium/gui/gtk3/ects_per_university/ects_per_university.rb +217 -0
  483. data/lib/studium/gui/gtk3/exam_question_widget/exam_question_widget.rb +1887 -0
  484. data/lib/studium/gui/gtk3/expand_time_range/expand_time_range.rb +34 -0
  485. data/lib/studium/gui/gtk3/information_about_a_lecture/information_about_a_lecture.rb +34 -0
  486. data/lib/studium/gui/gtk3/lecture_information/lecture_information.rb +200 -0
  487. data/lib/studium/gui/gtk3/show_upcoming_exams/show_upcoming_exams.rb +34 -0
  488. data/lib/studium/gui/java/exam_question/ExamQuestion$1.class +0 -0
  489. data/lib/studium/gui/java/exam_question/ExamQuestion.class +0 -0
  490. data/lib/studium/gui/java/exam_question/ExamQuestion.java +215 -0
  491. data/lib/studium/gui/javafx/exam_question_widget/exam_question_widget.rb +58 -0
  492. data/lib/studium/gui/jruby/exam_question_widget/exam_question_widget.rb +317 -0
  493. data/lib/studium/gui/libui/ask_exam_question/ask_exam_question.rb +349 -0
  494. data/lib/studium/gui/shared_code/control_panel/control_panel_module.rb +314 -0
  495. data/lib/studium/gui/shared_code/exam_question_widget/exam_question_widget_module.rb +39 -0
  496. data/lib/studium/gui/shared_code/expand_time_range/expand_time_range.css +0 -0
  497. data/lib/studium/gui/shared_code/expand_time_range/expand_time_range_module.rb +190 -0
  498. data/lib/studium/gui/shared_code/information_about_a_lecture/information_about_a_lecture_module.rb +180 -0
  499. data/lib/studium/gui/shared_code/show_upcoming_exams/show_upcoming_exams_module.rb +206 -0
  500. data/lib/studium/images/libui_ask_exam_question.png +0 -0
  501. data/lib/studium/images/small_logos/DNA.png +0 -0
  502. data/lib/studium/images/small_logos/README.md +2 -0
  503. data/lib/studium/images/studies_favicon.png +0 -0
  504. data/lib/studium/java/Mkdir.java +15 -0
  505. data/lib/studium/java/README.md +2 -0
  506. data/lib/studium/java/ask_exam_question/AskExamQuestion.java +477 -0
  507. data/lib/studium/java/solved/Solved.class +0 -0
  508. data/lib/studium/java/solved/Solved.java +110 -0
  509. data/lib/studium/java/utility_scripts/OpenLastExamQuestionurlLinkViaTheBrowser.class +0 -0
  510. data/lib/studium/java/utility_scripts/OpenLastExamQuestionurlLinkViaTheBrowser.java +80 -0
  511. data/lib/studium/logging/README.md +2 -0
  512. data/lib/studium/logging/ensure_that_the_log_directory_exists.rb +47 -0
  513. data/lib/studium/logging/html_log_directory.rb +41 -0
  514. data/lib/studium/logging/log_directory.rb +112 -0
  515. data/lib/studium/logging/store_last_question_asked_into_file.rb +137 -0
  516. data/lib/studium/parsers/README.md +2 -0
  517. data/lib/studium/parsers/custom_exam_results_parser.rb +206 -0
  518. data/lib/studium/parsers/parse_lva_dates.rb +190 -0
  519. data/lib/studium/parsers/parse_remote_lecture.rb +325 -0
  520. data/lib/studium/project/project.rb +76 -0
  521. data/lib/studium/requires/common_popular_requires.rb +37 -0
  522. data/lib/studium/requires/commonly_used_requires.rb +14 -0
  523. data/lib/studium/requires/require_class_exams_solved.rb +7 -0
  524. data/lib/studium/requires/require_ects_scripts.rb +27 -0
  525. data/lib/studium/requires/require_encoding.rb +7 -0
  526. data/lib/studium/requires/require_the_check_and_sanitize_files.rb +31 -0
  527. data/lib/studium/requires/require_the_curricula_files.rb +28 -0
  528. data/lib/studium/requires/require_the_exam_question_class.rb +7 -0
  529. data/lib/studium/requires/require_the_exams_files.rb +45 -0
  530. data/lib/studium/requires/require_the_logging_files.rb +23 -0
  531. data/lib/studium/requires/require_the_parsers.rb +28 -0
  532. data/lib/studium/requires/require_the_studium_constants.rb +10 -0
  533. data/lib/studium/requires/require_the_studium_project.rb +54 -0
  534. data/lib/studium/requires/require_the_toplevel_methods.rb +27 -0
  535. data/lib/studium/requires/require_the_utility_scripts.rb +49 -0
  536. data/lib/studium/requires/require_upcoming_exams.rb +7 -0
  537. data/lib/studium/requires/require_yaml.rb +7 -0
  538. data/lib/studium/requires/return_remote_homepage_of_this_lecture.rb +7 -0
  539. data/lib/studium/requires/with_GUI.rb +13 -0
  540. data/lib/studium/requires/www_mode.rb +17 -0
  541. data/lib/studium/statistics/README.md +4 -0
  542. data/lib/studium/statistics/best_exam_months.rb +92 -0
  543. data/lib/studium/statistics/curriculum_comparer.rb +336 -0
  544. data/lib/studium/statistics/determine_exam_statistics_from_this_file.rb +142 -0
  545. data/lib/studium/statistics/exam_topics_that_are_about_to_be_completed.rb +119 -0
  546. data/lib/studium/statistics/max_stats.rb +170 -0
  547. data/lib/studium/statistics/new_questions_per_year.rb +147 -0
  548. data/lib/studium/statistics/report_how_many_ects_points_per_curriculum_were_completed.rb +167 -0
  549. data/lib/studium/statistics/report_how_many_exam_questions_were_answered.rb +473 -0
  550. data/lib/studium/statistics/show_exam_statistics.rb +60 -0
  551. data/lib/studium/statistics/show_which_courses_are_in_a_bachelor_or_master_curriculum_respectively.rb +104 -0
  552. data/lib/studium/statistics/top_stats.rb +127 -0
  553. data/lib/studium/toplevel_methods/all_passed_exams.rb +37 -0
  554. data/lib/studium/toplevel_methods/already_solved_this_lecture.rb +100 -0
  555. data/lib/studium/toplevel_methods/available_topics.rb +156 -0
  556. data/lib/studium/toplevel_methods/average_grade.rb +141 -0
  557. data/lib/studium/toplevel_methods/calculate_pr/303/274fungsimmanente_lectures_from_this_file.rb +55 -0
  558. data/lib/studium/toplevel_methods/copy_the_last_backup_of_file_lecture_information.rb +34 -0
  559. data/lib/studium/toplevel_methods/curriculum_related_code.rb +999 -0
  560. data/lib/studium/toplevel_methods/determine_local_directory_of_this_lecture.rb +72 -0
  561. data/lib/studium/toplevel_methods/does_this_course_require_mandatory_presence.rb +51 -0
  562. data/lib/studium/toplevel_methods/download.rb +163 -0
  563. data/lib/studium/toplevel_methods/e.rb +16 -0
  564. data/lib/studium/toplevel_methods/ects_from_lectures.rb +250 -0
  565. data/lib/studium/toplevel_methods/editor.rb +65 -0
  566. data/lib/studium/toplevel_methods/esystem.rb +22 -0
  567. data/lib/studium/toplevel_methods/filter_away_invalid_questions.rb +77 -0
  568. data/lib/studium/toplevel_methods/find_exam_topic_and_exam_title.rb +3442 -0
  569. data/lib/studium/toplevel_methods/handle_archive_of_the_exam_questions.rb +136 -0
  570. data/lib/studium/toplevel_methods/has_this_lecture_been_already_passed_but_the_id_was_changed_lateron.rb +42 -0
  571. data/lib/studium/toplevel_methods/has_this_module_been_completed.rb +206 -0
  572. data/lib/studium/toplevel_methods/install_the_project_on_the_given_hostsystem.rb +32 -0
  573. data/lib/studium/toplevel_methods/is_on_roebe.rb +26 -0
  574. data/lib/studium/toplevel_methods/is_this_exam_topic_included.rb +46 -0
  575. data/lib/studium/toplevel_methods/is_this_homepage_registered.rb +31 -0
  576. data/lib/studium/toplevel_methods/is_this_lecture_a_practical_course.rb +100 -0
  577. data/lib/studium/toplevel_methods/is_this_lecture_registered_in_upcoming_exams.rb +42 -0
  578. data/lib/studium/toplevel_methods/java.rb +32 -0
  579. data/lib/studium/toplevel_methods/lecture_information.rb +106 -0
  580. data/lib/studium/toplevel_methods/lva_numbers.rb +355 -0
  581. data/lib/studium/toplevel_methods/main_dataset.rb +73 -0
  582. data/lib/studium/toplevel_methods/methods_related_to_directories.rb +225 -0
  583. data/lib/studium/toplevel_methods/methods_related_to_files.rb +205 -0
  584. data/lib/studium/toplevel_methods/misc.rb +169 -0
  585. data/lib/studium/toplevel_methods/n_questions_available.rb +137 -0
  586. data/lib/studium/toplevel_methods/n_topics_available.rb +63 -0
  587. data/lib/studium/toplevel_methods/names_of_all_solved_exams.rb +71 -0
  588. data/lib/studium/toplevel_methods/note_down_the_start_time_and_how_many_exams_have_been_already_solved.rb +69 -0
  589. data/lib/studium/toplevel_methods/opnn.rb +25 -0
  590. data/lib/studium/toplevel_methods/passed_this_exam_on.rb +105 -0
  591. data/lib/studium/toplevel_methods/pristine.rb +69 -0
  592. data/lib/studium/toplevel_methods/read_delay_between_questions_from_file.rb +34 -0
  593. data/lib/studium/toplevel_methods/regexes.rb +90 -0
  594. data/lib/studium/toplevel_methods/registered_for_this_exam.rb +62 -0
  595. data/lib/studium/toplevel_methods/remove_comments.rb +26 -0
  596. data/lib/studium/toplevel_methods/remove_exam_topics_that_were_already_answered.rb +27 -0
  597. data/lib/studium/toplevel_methods/remove_tags.rb +32 -0
  598. data/lib/studium/toplevel_methods/report.rb +419 -0
  599. data/lib/studium/toplevel_methods/return_all_exams_on_this_day.rb +66 -0
  600. data/lib/studium/toplevel_methods/return_dataset_for_this_exam_topic.rb +41 -0
  601. data/lib/studium/toplevel_methods/return_div_timetable_of_upcoming_exams.rb +498 -0
  602. data/lib/studium/toplevel_methods/return_ects_from_this_lecture_stored_in_the_file_lecture_information.rb +194 -0
  603. data/lib/studium/toplevel_methods/return_hash_of_already_solved_lectures.rb +46 -0
  604. data/lib/studium/toplevel_methods/return_last_exam_question.rb +34 -0
  605. data/lib/studium/toplevel_methods/return_local_path_of_this_pwdstud.rb +60 -0
  606. data/lib/studium/toplevel_methods/return_lva_number_of_this_lecture.rb +72 -0
  607. data/lib/studium/toplevel_methods/return_n_percent_solved_from_this_topic.rb +90 -0
  608. data/lib/studium/toplevel_methods/return_n_questions_were_answered_for_this_topic.rb +60 -0
  609. data/lib/studium/toplevel_methods/return_proper_university_image.rb +86 -0
  610. data/lib/studium/toplevel_methods/return_question_answer_string_from_this_topic.rb +63 -0
  611. data/lib/studium/toplevel_methods/return_remote_homepage_of_this_lecture.rb +9400 -0
  612. data/lib/studium/toplevel_methods/return_remote_moodle_link_of_this_lecture.rb +1661 -0
  613. data/lib/studium/toplevel_methods/return_sanitized_dataset_from_the_file_lecture_information.rb +110 -0
  614. data/lib/studium/toplevel_methods/return_theme_of_the_next_upcoming_exam.rb +38 -0
  615. data/lib/studium/toplevel_methods/rinstall2.rb +34 -0
  616. data/lib/studium/toplevel_methods/rti_conflict.rb +35 -0
  617. data/lib/studium/toplevel_methods/runmode.rb +87 -0
  618. data/lib/studium/toplevel_methods/sanitized_dataset_from_file_passed_exams_per_month.rb +52 -0
  619. data/lib/studium/toplevel_methods/set_last_file_for_exam_questions.rb +64 -0
  620. data/lib/studium/toplevel_methods/set_this_cd_alias_to.rb +86 -0
  621. data/lib/studium/toplevel_methods/show_passed_exams_having_this_grade.rb +34 -0
  622. data/lib/studium/toplevel_methods/spacer.rb +18 -0
  623. data/lib/studium/toplevel_methods/time.rb +239 -0
  624. data/lib/studium/toplevel_methods/total_ects_points_passed.rb +72 -0
  625. data/lib/studium/toplevel_methods/try_to_guess_the_most_likely_lva_id.rb +57 -0
  626. data/lib/studium/toplevel_methods/try_to_return_the_expanded_name_of_this_lecture.rb +63 -0
  627. data/lib/studium/toplevel_methods/unfinished.rb +51 -0
  628. data/lib/studium/toplevel_methods/url.rb +100 -0
  629. data/lib/studium/toplevel_methods/verbose_truth.rb +36 -0
  630. data/lib/studium/toplevel_methods/when_was_this_lecture_passed.rb +54 -0
  631. data/lib/studium/toplevel_methods/word_wrap.rb +56 -0
  632. data/lib/studium/toplevel_methods/write_into_file_related_functionality.rb +189 -0
  633. data/lib/studium/toplevel_methods/yes_or_no_ja_oder_nein.rb +33 -0
  634. data/lib/studium/universities_in_austria/README.md +2 -0
  635. data/lib/studium/universities_in_austria/boku/README.md +4 -0
  636. data/lib/studium/universities_in_austria/boku/boku_/303/266ffnungszeiten.rb +28 -0
  637. data/lib/studium/universities_in_austria/boku/show_three_pillars_of_these_lectures.rb +110 -0
  638. data/lib/studium/universities_in_austria/boku/three_pillars.rb +237 -0
  639. data/lib/studium/universities_in_austria/tu_vienna/README.md +6 -0
  640. data/lib/studium/universities_in_austria/tu_vienna/tu_ferien.rb +42 -0
  641. data/lib/studium/universities_in_austria/tu_vienna/tu_/303/266ffnungszeiten.rb +34 -0
  642. data/lib/studium/utility_scripts/attribute_lecture_to_curriculum/attribute_boku_lecture_to_curriculum.rb +384 -0
  643. data/lib/studium/utility_scripts/attribute_lecture_to_curriculum/attribute_lecture_to_curriculum.rb +238 -0
  644. data/lib/studium/utility_scripts/attribute_lectures_to_university/attribute_lectures_to_university.rb +375 -0
  645. data/lib/studium/utility_scripts/audio_stats.rb +171 -0
  646. data/lib/studium/utility_scripts/auto_stud/auto_stud.rb +252 -0
  647. data/lib/studium/utility_scripts/auto_stud/constants.rb +18 -0
  648. data/lib/studium/utility_scripts/auto_stud/initialize.rb +23 -0
  649. data/lib/studium/utility_scripts/auto_stud/misc.rb +18 -0
  650. data/lib/studium/utility_scripts/autopurge_this_lecture_date.rb +93 -0
  651. data/lib/studium/utility_scripts/average_grade_of_this_curriculum.rb +101 -0
  652. data/lib/studium/utility_scripts/calendar/README.md +2 -0
  653. data/lib/studium/utility_scripts/calendar/calendar.rb +251 -0
  654. data/lib/studium/utility_scripts/calendar/misc.rb +35 -0
  655. data/lib/studium/utility_scripts/check_description_of_these_lectures.rb +221 -0
  656. data/lib/studium/utility_scripts/create_database/create_database.rb +106 -0
  657. data/lib/studium/utility_scripts/current_lectures_belonging_to_both_bachelor_and_master_curriculum.rb +113 -0
  658. data/lib/studium/utility_scripts/currently_participating_in_these_lectures/currently_participating_in_these_lectures.rb +104 -0
  659. data/lib/studium/utility_scripts/display_lecture_url.rb +160 -0
  660. data/lib/studium/utility_scripts/expand_time_range/expand_time_range.rb +414 -0
  661. data/lib/studium/utility_scripts/finished_exams_at_this_university.rb +94 -0
  662. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/constants.rb +23 -0
  663. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/foreign_language_percentage.rb +149 -0
  664. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/help.rb +31 -0
  665. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/initialize.rb +25 -0
  666. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/menu.rb +158 -0
  667. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/report.rb +62 -0
  668. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/reset.rb +50 -0
  669. data/lib/studium/utility_scripts/foreign_language_percentage/run.rb +19 -0
  670. data/lib/studium/utility_scripts/generate_spreadsheet/generate_spreadsheet.rb +354 -0
  671. data/lib/studium/utility_scripts/generate_spreadsheet/misc.rb +144 -0
  672. data/lib/studium/utility_scripts/holidays/holidays.rb +150 -0
  673. data/lib/studium/utility_scripts/homepage_of_these_courses.rb +118 -0
  674. data/lib/studium/utility_scripts/lecture_downloader.rb +107 -0
  675. data/lib/studium/utility_scripts/lectures_attributed_to_universities.rb +336 -0
  676. data/lib/studium/utility_scripts/lva_dates_of_the_important_courses.rb +111 -0
  677. data/lib/studium/utility_scripts/lva_nummer.rb +431 -0
  678. data/lib/studium/utility_scripts/mandatory_lectures_in_this_month/mandatory_lectures_in_this_month.rb +316 -0
  679. data/lib/studium/utility_scripts/name_of_this_lva_id.rb +110 -0
  680. data/lib/studium/utility_scripts/new_stud.rb +324 -0
  681. data/lib/studium/utility_scripts/next_week.rb +103 -0
  682. data/lib/studium/utility_scripts/open_last_exam_question_url_link_via_the_browser.rb +76 -0
  683. data/lib/studium/utility_scripts/passed_ects_per_year/passed_ects_per_year.rb +177 -0
  684. data/lib/studium/utility_scripts/passed_pr/303/274fungsimmanente_courses/passed_pr/303/274fungsimmanente_courses.rb +181 -0
  685. data/lib/studium/utility_scripts/pdf/README.md +2 -0
  686. data/lib/studium/utility_scripts/pdf/create_pdf_file_for_this_exam_topic.rb +355 -0
  687. data/lib/studium/utility_scripts/pdf/hexapdf_support.rb +50 -0
  688. data/lib/studium/utility_scripts/preparatory_meetings/preparatory_meetings.rb +312 -0
  689. data/lib/studium/utility_scripts/priority.rb +164 -0
  690. data/lib/studium/utility_scripts/priority_points/priority_points.rb +263 -0
  691. data/lib/studium/utility_scripts/publish_my_exams.rb +174 -0
  692. data/lib/studium/utility_scripts/regexes/README.md +1 -0
  693. data/lib/studium/utility_scripts/regexes/generate_regex.rb +300 -0
  694. data/lib/studium/utility_scripts/regexes/generate_regexes_for_the_available_moodle_links.rb +55 -0
  695. data/lib/studium/utility_scripts/regexes/generate_regexes_for_the_registered_lectures.rb +48 -0
  696. data/lib/studium/utility_scripts/report_outdated_timetable_entries/report_outdated_timetable_entries.rb +142 -0
  697. data/lib/studium/utility_scripts/report_total_amount_of_questions_and_answers_for.rb +116 -0
  698. data/lib/studium/utility_scripts/report_whether_this_lecture_is_registered_in_the_file_lecture_information.rb +128 -0
  699. data/lib/studium/utility_scripts/resolve_practical_courses_date_conflicts/individual_resolve_practical_courses_date_conflicts.rb +254 -0
  700. data/lib/studium/utility_scripts/resolve_practical_courses_date_conflicts/resolve_practical_courses_date_conflicts.rb +265 -0
  701. data/lib/studium/utility_scripts/scrape_remote_university_url.rb +138 -0
  702. data/lib/studium/utility_scripts/semester_schedule_creator/semester_container.rb +144 -0
  703. data/lib/studium/utility_scripts/semester_schedule_creator/semester_schedule_creator.rb +374 -0
  704. data/lib/studium/utility_scripts/semesterplaner.rb +289 -0
  705. data/lib/studium/utility_scripts/set_aliases_based_on_this_file.rb +95 -0
  706. data/lib/studium/utility_scripts/show_all_passed_master_lectures.rb +119 -0
  707. data/lib/studium/utility_scripts/show_conflicting_lva_lectures/show_conflicting_lva_lectures.rb +1238 -0
  708. data/lib/studium/utility_scripts/show_descriptions_of_lectures_belonging_to_this_module/constants.rb +23 -0
  709. data/lib/studium/utility_scripts/show_descriptions_of_lectures_belonging_to_this_module/menu.rb +63 -0
  710. data/lib/studium/utility_scripts/show_descriptions_of_lectures_belonging_to_this_module/reset.rb +33 -0
  711. data/lib/studium/utility_scripts/show_descriptions_of_lectures_belonging_to_this_module/run.rb +50 -0
  712. data/lib/studium/utility_scripts/show_descriptions_of_lectures_belonging_to_this_module/show_descriptions_of_lectures_belonging_to_this_module.rb +145 -0
  713. data/lib/studium/utility_scripts/show_lecturers/show_lecturers.rb +147 -0
  714. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/constants.rb +11 -0
  715. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/help.rb +34 -0
  716. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/initialize.rb +23 -0
  717. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/menu.rb +127 -0
  718. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/misc.rb +584 -0
  719. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/reset.rb +89 -0
  720. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/run.rb +27 -0
  721. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures/show_lectures.rb +48 -0
  722. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_fitting_to_this_language/show_lectures_fitting_to_this_language.rb +121 -0
  723. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_fitting_to_this_theme/show_lectures_fitting_to_this_theme.rb +105 -0
  724. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/constants.rb +17 -0
  725. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/determine.rb +673 -0
  726. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/help.rb +44 -0
  727. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/html.rb +605 -0
  728. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/initialize.rb +56 -0
  729. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/konsole.rb +32 -0
  730. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/menu.rb +472 -0
  731. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/misc.rb +837 -0
  732. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/reset.rb +121 -0
  733. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/run.rb +44 -0
  734. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/show.rb +106 -0
  735. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/show_lectures_on_the_commandline.rb +261 -0
  736. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_the_commandline/sorted_individual_curricula.rb +121 -0
  737. data/lib/studium/utility_scripts/show_lectures_on_this_day.rb +149 -0
  738. data/lib/studium/utility_scripts/show_lva_dates_of_this_lecture.rb +169 -0
  739. data/lib/studium/utility_scripts/show_mixed_bachelor_master_courses/show_mixed_bachelor_master_courses.rb +91 -0
  740. data/lib/studium/utility_scripts/show_outdated_lva_dates/show_outdated_lva_dates.rb +210 -0
  741. data/lib/studium/utility_scripts/show_solved_english_lectures/show_solved_english_lectures.rb +139 -0
  742. data/lib/studium/utility_scripts/steop/README.md +4 -0
  743. data/lib/studium/utility_scripts/steop/show_all_steop_lectures.rb +93 -0
  744. data/lib/studium/utility_scripts/steop/steop_lectures_in_this_curriculum.rb +284 -0
  745. data/lib/studium/utility_scripts/steop/steop_lva_dates.rb +119 -0
  746. data/lib/studium/utility_scripts/studienkennzahl.rb +116 -0
  747. data/lib/studium/utility_scripts/studium_skeleton/studium_skeleton.rb +227 -0
  748. data/lib/studium/utility_scripts/stundenplan.rb +595 -0
  749. data/lib/studium/utility_scripts/sync_studium_relevant_entries_one_level_downwards.rb +217 -0
  750. data/lib/studium/utility_scripts/ufind/ufind.rb +98 -0
  751. data/lib/studium/utility_scripts/upcoming_mandatory_presence_courses/constants.rb +26 -0
  752. data/lib/studium/utility_scripts/upcoming_mandatory_presence_courses/run.rb +20 -0
  753. data/lib/studium/utility_scripts/upcoming_mandatory_presence_courses/upcoming_mandatory_presence_courses.rb +181 -0
  754. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/constants.rb +23 -0
  755. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/help.rb +32 -0
  756. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/menu.rb +59 -0
  757. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/misc.rb +373 -0
  758. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/reset.rb +65 -0
  759. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/run.rb +18 -0
  760. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/show.rb +236 -0
  761. data/lib/studium/utility_scripts/week_parser/week_parser.rb +49 -0
  762. data/lib/studium/utility_scripts/weekday_parser.rb +155 -0
  763. data/lib/studium/utility_scripts/weekly_schedule.rb +198 -0
  764. data/lib/studium/utility_scripts/wochenplanung.rb +261 -0
  765. data/lib/studium/version/version.rb +46 -0
  766. data/lib/studium/www/curricula_displayer.cgi +197 -0
  767. data/lib/studium/www/curriculum_displayer.rb +162 -0
  768. data/lib/studium/www/exams.cgi +53 -0
  769. data/lib/studium/www/fast_ask_exam_question.cgi +155 -0
  770. data/lib/studium/www/sinatra/app.rb +231 -0
  771. data/lib/studium/www/sinatra/misc.rb +115 -0
  772. data/lib/studium/www/statistics/statistics.cgi +59 -0
  773. data/lib/studium/yaml/ad_hoc_trainer/README.md +2 -0
  774. data/lib/studium/yaml/ad_hoc_trainer/exam_topics.md +15 -0
  775. data/lib/studium/yaml/allowed_themes_for_exams.yml +344 -0
  776. data/lib/studium/yaml/array_allowed_entries_for_the_file_lecture_information.yml +70 -0
  777. data/lib/studium/yaml/available_exam_topics/available_exam_topics.yml +234 -0
  778. data/lib/studium/yaml/backlog_of_exams.yml +37 -0
  779. data/lib/studium/yaml/colours/custom_colours.yml +28 -0
  780. data/lib/studium/yaml/colours/use_colours.yml +1 -0
  781. data/lib/studium/yaml/current_exams.yml +19 -0
  782. data/lib/studium/yaml/curricula/README.md +9 -0
  783. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_agrarwissenschaften_033255.yml +142 -0
  784. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_biologie_basisblock_033630.yml +65 -0
  785. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_biologie_botanik_033630.yml +84 -0
  786. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_biologie_ecology_033630.yml +74 -0
  787. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_biologie_mikrobiologie_und_genetik_033630.yml +120 -0
  788. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_biologie_molekulare_biologie_033630.yml +104 -0
  789. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_biologie_zoologie_033630.yml +87 -0
  790. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_chemie_033662.yml +165 -0
  791. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_dummy_curriculum.yml +183 -0
  792. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_elektrotechnik_und_informationstechnik_033235.yml +13 -0
  793. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_forstwirtschaft_033225.yml +115 -0
  794. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_informatik_033521.yml +130 -0
  795. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_ktww_033231.yml +84 -0
  796. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_lmbt_033217.yml +118 -0
  797. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_medizinische_informatik_033533.yml +203 -0
  798. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_molekularbiologie_033665.yml +95 -0
  799. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_nutrition_science_033638.yml +119 -0
  800. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_pharmazie_033305.yml +170 -0
  801. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_technische_chemie_033290.yml +129 -0
  802. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_technische_informatik_033535.yml +23 -0
  803. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_ubrm_033227.yml +136 -0
  804. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_verfahrenstechnik_033273.yml +167 -0
  805. data/lib/studium/yaml/curricula/bachelor/bachelor_wirtschaftsinformatik_033526.yml +29 -0
  806. data/lib/studium/yaml/curricula/individual/bachelor_informatik_und_molekulare_biologie.yml +1161 -0
  807. data/lib/studium/yaml/curricula/individual/bachelor_vector_based_strategies_in_life_sciences_molecular_medicine_and_biotechnology.yml +1157 -0
  808. data/lib/studium/yaml/curricula/individual/master_bioinformatics_and_nanobiotechnology_in_molecular_medicine.yml +306 -0
  809. data/lib/studium/yaml/curricula/individual/master_vector_based_strategies_in_life_sciences_molecular_medicine_and_biotechnology.yml +741 -0
  810. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_bioinformatik_066875.yml +76 -0
  811. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_biologie_molekulare_mikrobiologie_mikrobielle_oekologie_und_immunbiologie_066830.yml +78 -0
  812. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_biologische_chemie_066863.yml +61 -0
  813. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_dummy_curriculum.yml +197 -0
  814. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_genetik_und_entwicklungsbiologie_066877.yml +89 -0
  815. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_lmbt_066418.yml +111 -0
  816. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_molekulare_biologie_066834.yml +142 -0
  817. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_pharmazie_066605.yml +170 -0
  818. data/lib/studium/yaml/curricula/master/master_technische_chemie_066490.yml +123 -0
  819. data/lib/studium/yaml/curricula/outdated/master_bioinformatics_and_molecular_biotechnology_including_aspects_from_molecular_medicine.yml +438 -0
  820. data/lib/studium/yaml/curricula/outdated/master_food_science_and_plant_biotechnology.yml +31 -0
  821. data/lib/studium/yaml/curricula.yml +538 -0
  822. data/lib/studium/yaml/daily_questions_solved.yml +1468 -0
  823. data/lib/studium/yaml/default_delay.yml +4 -0
  824. data/lib/studium/yaml/default_encoding.yml +1 -0
  825. data/lib/studium/yaml/directory_to_the_exam_topics.yml +0 -0
  826. data/lib/studium/yaml/editor.yml +1 -0
  827. data/lib/studium/yaml/file_for_exam_questions.yml +1 -0
  828. data/lib/studium/yaml/german/README.md +2 -0
  829. data/lib/studium/yaml/german/german_to_english_month_names.yml +16 -0
  830. data/lib/studium/yaml/grouped_themes.yml +192 -0
  831. data/lib/studium/yaml/holidays.yml +194 -0
  832. data/lib/studium/yaml/important_exams.yml +226 -0
  833. data/lib/studium/yaml/inscription_dates_of_universities.yml +60 -0
  834. data/lib/studium/yaml/lecture_aliases.yml +138 -0
  835. data/lib/studium/yaml/lecture_information/lecture_information.yml +55870 -0
  836. data/lib/studium/yaml/log_dir.yml +1 -0
  837. data/lib/studium/yaml/main_topic.yml +11 -0
  838. data/lib/studium/yaml/max_stats.yml +241 -0
  839. data/lib/studium/yaml/meta_themes/README.md +13 -0
  840. data/lib/studium/yaml/meta_themes/biochemistry.md +6 -0
  841. data/lib/studium/yaml/meta_themes/bioinformatics.md +6 -0
  842. data/lib/studium/yaml/meta_themes/biotechnology.md +9 -0
  843. data/lib/studium/yaml/meta_themes/chemistry.md +9 -0
  844. data/lib/studium/yaml/meta_themes/genetics.md +10 -0
  845. data/lib/studium/yaml/meta_themes/immunology.md +5 -0
  846. data/lib/studium/yaml/meta_themes/metabolic_pathways.md +12 -0
  847. data/lib/studium/yaml/meta_themes/molecular_biology.md +9 -0
  848. data/lib/studium/yaml/meta_themes/protein_engineering.md +10 -0
  849. data/lib/studium/yaml/meta_themes/statistics.md +2 -0
  850. data/lib/studium/yaml/mitbelegung/README.md +4 -0
  851. data/lib/studium/yaml/mitbelegung/mitbelegung.yml +23 -0
  852. data/lib/studium/yaml/mitteilungsbl/303/244tter/mitteilungsbl/303/244tter.yml +363 -0
  853. data/lib/studium/yaml/n_total_questions.yml +1 -0
  854. data/lib/studium/yaml/rename_konsole_tab.yml +1 -0
  855. data/lib/studium/yaml/show_topic.yml +1 -0
  856. data/lib/studium/yaml/statistics/max_stats.yml +239 -0
  857. data/lib/studium/yaml/statistics/statistics.yml +69 -0
  858. data/lib/studium/yaml/week/01_monday.yml +5 -0
  859. data/lib/studium/yaml/week/02_tuesday.yml +75 -0
  860. data/lib/studium/yaml/week/03_wednesday.yml +62 -0
  861. data/lib/studium/yaml/week/04_thursday.yml +14 -0
  862. data/lib/studium/yaml/week/05_friday.yml +31 -0
  863. data/lib/studium/yaml/week/06_saturday.yml +16 -0
  864. data/lib/studium/yaml/week/07_sunday.yml +0 -0
  865. data/lib/studium/yaml/week/README.md +13 -0
  866. data/lib/studium.rb +5 -0
  867. data/studium.gemspec +80 -0
  868. data/test/testing_studium.rb +244 -0
  869. data/test/testing_studium_base_class.rb +17 -0
  870. data/test/testing_time_component.rb +29 -0
  871. metadata +1078 -0
@@ -0,0 +1,104 @@
1
+ # =========================================================================== #
2
+ # === Endospores and Spores
3
+ #
4
+ # This is a subtopic of microbiology, but in theory we can store any
5
+ # kind of information related to sustaining life.
6
+ # =========================================================================== #
7
+
8
+ - Nenne <one>zwei Sigmafaktoren</one> in der <two>Vorspore von Bacillus subtilis</two>. A: (1) <one>Sigma-F</one> (2) <one>Sigma-G</one> URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC239352/ []
9
+ - <one>Endospore development</one> requires <two>n different sigma factors</two> - at the least in <three>Bacillus subtilis</three>? <one>5</one>. []
10
+ - <one>Compare the water content</one> of <two>an endospore</two> to the <two>vegetative cell</two> (from-to). A: The endospore has only about <one>10-25% of the water content</one> compared to a vegetative cell.
11
+ - <one>Endospore formation</one> is usually preceded by which other <two>cellular mechanism</two>? <one>Cellular cannibalism</one>. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4451673/
12
+ - Nenne einen <one>aeroben Sporenbildner</one>. A: <one>Bacillus thuringiensis</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Bacillus_thuringiensis []
13
+ - Eine <one>Endospore</one> konvertiert in eine vegetative Zelle. Welche drei Stufen umfasst dies (auf deutsch)? (1) <one>Aktivierung</one> (2) <one>Keimung</one> (3) <one>Auswachsen</one> []
14
+ - Name <one>an important component</one> of the classical <two>endospore-staining protocol</two>. A: <one>Malachite green</one>. URL: http://www.uwyo.edu/molb2021/virtual-edge/lab11/exp_11a.html []
15
+ - If we wish to <one>find</one> a <two>sporulation protein</two>, for applying a dye onto it, in order to <three>perform fluoresence microscopy</three> - where could we look for such a protein? We could look at <one>a protein in the spore coat</one>. []
16
+ - Die <one>Endospore</one> enthält viel an welcher Substanz? <one>Calciumdipicolinat</one>. []
17
+ - <one>In which stage</one> does the <two>prespore</two> form, during sporulation of an endospore? In <one>stage II</one>. []
18
+ - Name two representatives of the <violet>Bacillus species</violet> that form endospores. A: (1) <one>Bacillus anthracis</one> (2) <one>Bacillus cereus</one> []
19
+ - Eine <one>Endospore</one> verwandelt sich in eine vegetative Zelle. Welche 3 Schritte sind hierzu notwendig? (1) <one>Aktivierung</one> (2) <one>Keimung</one> (3) <one>Auswachsen</one> []
20
+ - <one>Endospores</one> function as ... ? <one>Survival structures</one>. []
21
+ - <one>Wie viele N-Atome</one> besitzt die <two>Dipicolinsäure</two>? 1 N Atom. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Dipicolins%C3%A4ure []
22
+ - <one>Welche Ionen</one> sind wichtig für die <two>Endosporenbildung</two>? <one>Ca²⁺Ionen</one>. []
23
+ - Eine <one>Endospore</one> besteht aus <two>welchen drei Teilen</two>? (<one>3xC</one>) (1) <one>Core</one> (2) <one>Cortex</one> (3) <one>Coat</one>
24
+ - <one>In which stage</one> does <two>septation</two> occur of an Endospore? In <deepskyblue>stage II</deepskyblue> - thus very early.
25
+ - Name <one>the four different sigma factors used in endospore development in Bacillus subtilis</one>. A: (E,F,G,K) (1) <one>sigmafactor-E</one> (2) <one>sigmafactor-F</one> (3) <one>sigmafactor-G</one> (4) <one>sigmafactor-K</one> []
26
+ - <orange>Gram-positive bacteria</orange> may form endospores, as a survival strategy. Can we conclude something simple, in general, about the genome of such bacteria? They tend to have a <one>low GC content</one>.
27
+ - The core cytoplasm of an endospore is similar to ... ? A <one>gel</one>. []
28
+ - Do actively growing cells <one>sporulate</one>? <one>No</one>; only when the <one>conditions</one> are unfavourable, such as during <two>nutrient starvation</two>.
29
+ - <one>Bacillus subtilis</one> requires how many hours if it transitions from a vegetative cell into an endospore? About <one>8 hours</one>. []
30
+ - Eine <one>Endospore</one> hat einen hohen Gehalt an welchem Atom? <one>Calcium</one> (<two>Ca²⁺-Ionen</two>). []
31
+ - The <one>model organism for studies of sporulation</one> is ... ? <one>Bacillus subtilis</one>. []
32
+ - Die <orange>Sporenhülle einer Endospore</orange> ist reich an welcher der 20 regulären Aminosäuren? <one>Cystein</one>. []
33
+ - How do we call the <one>genetic wake-up programm</one> of an Endospore. A: <one>Germination</one>. []
34
+ - In <one>Endospore formation</one>: in which stage will the chromosomes of the mother cell disintegrate? In <one>stage IV</one> (<two>stage 4</two>).
35
+ - <one>Endospores</one> are extremely resistant to ... which 3 aspects? (1) <one>heat</one> (2) <one>harsh chemicals</one> (3) <one>radiation</one> []
36
+ - Wieso verwendet <one>Candida albicans</one> eine <two>Chlamydospore</two>? Diese dient der <one>Überdauerung des Organismus</one>.
37
+ - Which bacteria group can produce endospores? Only a few <one>gram-positive bacteria</one>. []
38
+ - <one>Ab welcher Phase</one> bei der <two>Endosporen-Bildung</two> kommt es zur <three>beginnenden Dehydrierung</three>? Ab <one>Phase IV</one>.
39
+ - How is <one>Endospore formation</one> triggered? Usually by <one>a lack of nutrients</one>.
40
+ - <one>Heat record</one> for bacterial endospores? Up to <one>150°C</one>. []
41
+ - Which stain is used in the <one>classical endospore-staining protocol</one>? The stain <one>malachite green</one>. It is infused into the spore with the aid of <two>steam</two>. []
42
+ - In <one>endospore formation</one>: <two>SpoOA</two> first activates which sigmafactor in the cell that will become the (future) endospore? <one>Sigma-F</one>. []
43
+ - Können <one>Endosporen</one> rasch reaktiviert werden? Ja - sogar bereits <one>innerhalb einiger Minuten</one>.
44
+ - Nenne <one>zwei allgemeine Beispiele</one> für Bakterien die <two>Endosporen</two> verwenden. A: (1) <one>Bacillus</one> (2) <one>Clostridium</one> []
45
+ - Nenne drei Möglichkeiten wo die Endospore <one>lokalisiert</one> sein kann. A: <one>Terminal</one>, <one>subterminal</one>, <one>zentral</one>. []
46
+ - Bei einer <one>Endospore</one>: was heisst <two>SASP</two>? <one>Small acid-soluble spore proteins</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Endospore#Structure []
47
+ - Is <one>Bacillus megaterium</one> <two>capable of forming endospore</two>? Yes it is. []
48
+ - Bei der Sporulation in gram-positiven Bakterien ist oft die Dipicolinsäure wichtig. Wieviele <one>N-Atome</one> hat diese Substanz? Ein <one>N-Atom</one>, das zentral vorzufinden ist. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Dipicolinic_acid []
49
+ - Die reifen Endosporen werden wie freigesetzt? Durch <one>Autolyse der Mutterzelle</one>. []
50
+ - <one>Wie</one> kann die <two>Dipicocolinsäure</two> stabilisiert werden? Durch <one>Ca²⁺ Ionen</one>. []
51
+ - How can <one>endospores</one> be discovered via <two>phase-contrast microscopy</two>? <one>Endospores will appear significantly brighter</one>. []
52
+ - How is <one>the process of endospore formation</one> called? <one>Sporulation</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Endospore []
53
+ - The end result of sporulation is ... ? A <one>free endospore</one>. []
54
+ - <one>Endospore formation</one> occurs in which gram bacteria? In <one>gram-positive bacteria</one>. (<two>Bacillus</two> is gram-positive too.) []
55
+ - Name <one>three different ways</one> how <two>endospore formation</two> is triggered in <three>Bacillus subtilis</three>. A: (1) <one>starvation</one> (2) <one>desiccation</one> (3) <one>growth-inhibitory temperatures</one>
56
+ - Die <one>Kinasen</one>, die bei der Endosporenbildung zum Einsatz kommen, werden reguliert durch ... welche drei Punkte? (1) <one>Phosphatasen</one> (2) den <one>ATP-Gehalt der Zelle</one> (3) eine <one>aktive Chromosomen-Replikation</one>
57
+ - Name a bacterium with a <one>subterminal endospore</one>. A: <one>Bacillus subtilis</one>. []
58
+ - In Endospore formation: <one>when</one> is <two>dipicolinic acid</two> synthesized? In <one>stage VI</one> (<two>stage 6</two>).
59
+ - The protein ywdL has been identified in Bacillus cereus as important for exosporium formation. Deletion of the ywdl gene leads to a fragile and easily damaged exosporium. Will such a modified strain respond to calcium dipicolinate? No. This would <crimson>not</crimson> induce germination. []
60
+ - <one>Sporulation in Bacillus</> requires how many <two>spore-specific genes</two>? About <one>200</one>. []
61
+ - Sporenfärbung nach ...? Sporenfärbung nach <one>Rakette</one> (== Malachitgrün). URL: http://www.aeisner.de/methoden/farb74.html []
62
+ - Name <one>three distinct morphological</one> <two>spore types</two>. A: (1) <one>terminal spores</one> (2) <one>subterminal spores</one> (3) <one>central spores</one> []
63
+ - In <one>endospore formation</one> in Bacillus subtilis: at which stage does the <two>asymmetric cell division</two> begin? At <one>stage II</one>. []
64
+ - Are endospores vulnerable to <violet>lysozyme</violet>? No, they are resistant to lysozyme. []
65
+ - Welcher Organismus bildet <one>Chlamydosporen</one> aus? <one>Candida albicans</one>. []
66
+ - Name three different conditions that may <one>trigger Endospore-Formation</one> in bacteria. A: (1) <one>heat</one> (2) <one>dryness</one> (3) <one>nutrient limitation</one>
67
+ - Welche Bakterien bilden Endosporen? Nur <one>gram-positive Bakterien</one>. (Mnemonic: <two>E. coli</two> ist gram-negativ und bildet <three>keine</three> Endosporen.)
68
+ - Der <one>Cortex einer Endospore</one> bildet sich in welcher Phase (Stage) aus? <one>Stage VII</one>. []
69
+ - Die Keimfähigkeit der Endsporen von Bakterien ist pH-abhängig? Ja - im <one>sauren Milieu</one> vermögen Endosporen nicht zu keimen.
70
+ - Can <orange>Endospores</orange> be found in water? Yes, of course. They may survive there for long periods of time. []
71
+ - Das <one>Core</one> einer reifen <two>Endospore</two> ist in was für einem Zustand? In einem <one>dehydratisierten Zustand</one>. []
72
+ - <one>Endosporenbildung</one>: sehen wir dies eher bei <two>gram-positiven</two> oder bei <two>gram-negativen Bakterien</two>? Bei gram-positiven Bakterien. []
73
+ - What is the major trigger for the formation of an Endospore? <one>Nutrient starvation</one>. []
74
+ - Der Name <one>Dipicolinsäure</one> deutet auf welche charakteristische, chemische Besonderheit hin? Auf <one>2x COOH Gruppen</one>; bei Ladung sind diese Gruppen COO⁻ die dann mit Ca²⁺ komplexieren können.
75
+ - Do <one>Archaea</one> form <two>endospores</two>? No - at the least no Archaea doing so has been found so far.
76
+ - The <one>stages in sporulation</one> were largely defined from which two analyses of sporulation in Bacillus subtilis? (1) <one>genetic analyses of sporulation</one> (2) <one>microscopic analyses of sporulation</one>
77
+ - Name the 4 sigma factors that control spore formation in <one>Bacillus subtilis</one>. A: Sigmafactors E/K and F/G.
78
+ - How can we identify the intracellular location of endospores? We could make use of <one>phase-contrast microscopy</one> to determine the location. []
79
+ - Warum triggered die Zugabe von <one>Mangan</one> die Endosporenbildung? Mangan ist <orange>ein essenzieller Kofaktor vieler Enzyme</orange>. Zudem kann es zu Konformationsänderungen in der Sekundärstruktur der RNA kommen. Die Zelle wird dadurch einem Stress ausgesetzt. Dieser Stress führt zur Einleitung der Endosporenbildung. Dies ist der Grund, wieso "Sporulation Agar" Mangan aufweisen. (Mangan ist auch in natürlichen Böden enthalten.) URL: https://www.researchgate.net/post/what_are_the_methods_used_to_understand_the_interaction_of_spore_with_medium
80
+ - Wie sieht die <one>Dipicocolinsäure</one>, die in einer <one>Endospore</one> gefunden werden kann, aus? Es ist ein <one>Benzenring</one> mit einem N-Atom, sowie 2x COO- Gruppen an den Seiten (<one>im geladenen Zustand</one>; ansonsten natürlich <cadetblue>COOH</cadetblue>).
81
+ - Does the form of DNA change in an endospore? Yes - from the B form to the A form. []
82
+ - Damit sich eine Endospore ausbilden kann, muss (abgesehen von ungünstigen Umweltbedingungen) welche Bedingung erfüllt sein? Es müssen viele Bakterien vorhanden sein; praktisch eine <one>bakterielle Überbevölkerung</one>.
83
+ - Wir isolieren ein unbekanntes Bakterium, das in Form einer <orange>Endospore</orange> vorliegt. Welche Voraussage können wir bezüglich des Genoms dieses Bakteriums treffen? Es hat einen <one>niedrigen G+C Gehalt</one> - und ist wohl ein <two>gram-positives Bakterium</two>.
84
+ - Welche Bakteriengruppe neigt zur <one>Endosporenbildung</one>? <one>Grampositive Bakterien</one> (<two>gram⁺ Bakterien</two>). []
85
+ - Bevor es zur Endosporenbildung kommt muss was innerhalb der bakteriellen Zelle geschehen? Das <one>bakterielle Chromosom</one> muss repliziert worden sein.
86
+ - The <one>endospore core</one> contains high levels of small acid-soluble spore proteins (SASPs). Name one very important function of these proteins. A: SASPs bind tightly to DNA in the core and protect it from potential damage - in particular ultraviolet radiation, desiccation, and dry heat.
87
+ - Der äusserster Teil der Endospore wird wie genannt? Dies ist das <one>Exosporium</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Exosporium
88
+ - Give a general example for <one>Exosporium proteins</one>. A: The <one>Cot protein</one>.
89
+ - Which 3 steps are required to <orange>reactivate a dormant endospore</orange>? (1) Activation (2) Germination (3) <one>Outgrowth</one>
90
+ - What is characteristic for the <one>outgrowth</one> step of endospore-activation? Size increase and swelling due to <one>water uptake</one>.
91
+ - What is an <one>endospore</one>? This is <crimson>a spore formed inside a mother cell</crimson>, in certain bacteria.
92
+ - Die zwei bestuntersuchtesten Bakterien bezüglich Endosporen sind ...? <one>Bacillus</one> und <one>Clostridium</one>.
93
+ - Name proteins that we can find in an endospore. A: The <one>small acid-soluble proteins</one> (<two>SASPs</two>). URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Endospore#Structure
94
+ - Wieviele <one>Ascosporen</one> produziert <royalblue>Neurospora</royalblue>? 8. []
95
+ - What is <one>the most important acid in an endospore</one>? The <one>dipicolinic acid</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Dipicolinic_acid []
96
+ - The <one>SASPs</one> in an endospore not only protect the DNA, but also have which other useful function? They may serve as a <one>carbon source</one> and an <one>energy source</one> during germination (= <dodgerblue>outgrowth</dodgerblue>).
97
+ - Name a <one>characteristic substance</one> that can be found in Endospores. A: <one>Dipicolinic acid</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Dipicolinic_acid []
98
+ - Why is the endospore not a <one>true spore</one>? Because it is <one>not an offspring</one>.
99
+ - Name one reason why endospores are so <one>heat-resistent</one>. A: They are <two>very deprived of water</two> (aka <one>low water content</one>). []
100
+ - Is <one>sporulation</one> initiated automatically upon <two>nutrient limitation</two>? No. []
101
+ - Was lässt sich zum <violet>pH Wert</violet> von Endosporen festhalten? Das <one>Core der Endospore</one> hat einen pH-Wert der "um eine Einheit niedriger" ist als der pH der vegetativen Zelle im Cytoplasma.
102
+ - Bilden alle Endosporenbildenden Bakterien ein <one>Exosporium</one> aus? Nein. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Exosporium
103
+ - Some bacteria can enter sporulation, but they may also make which two prior decisions? (1) The <orange>decision to wait</orange> (aka delay sporulation) (2) The <orange>decision to escape into competence</orange> (and take up DNA)
104
+ - Name the five bacterial <crimson>endospore layers</crimson>. A: (1) exosporium (2) spore coat (3) core wall (4) cortex (5) DNA
@@ -0,0 +1,345 @@
1
+ # =========================================================================== #
2
+ # === ENZYMES
3
+ #
4
+ # All about the enzymes. Enzyme tag, Enzymes tag. ee tag. Enzyme tag.
5
+ # Enz tag. Enzym tag.
6
+ #
7
+ # This also includes methods for creating new enzymes.
8
+ # =========================================================================== #
9
+
10
+ - Wie heißen die Enzyme, die <one>Fettsäuren</one> spalten können? <one>Lipasen</one>. []
11
+ - Enzymtyp der "Enteropeptidasen"? Enteropeptidasen sind <two>Proteasen</two>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Enteropeptidase
12
+ - <one>Aminotransferasen</one> - die <two>Transaminasen</two> enthalten welchen Cofaktor (also Coenzym)? <one>Pyridoxalphosphat</one>.
13
+ - <one>Papain</one> is a proteolytic enzyme. Is it highly specific? Not really - it will cleave any peptide bond with little regard to the identity of the adjacent side chains.
14
+ - Die <one>Kinasen</one> zählen zu welcher Enzymklasse? <one>Transferasen</one>.
15
+ - <one>Kinasen</one> benötigen welches Metall-Ion? Sie benötigen ein <one>Magnesium-Ion</one>.
16
+ - Ein besserer Name für die <one>Kinasen</one> wäre eigentlich ... ? <one>Phosphoryltransferasen</one>.
17
+ - <one>Kinasen</one> bevorzugen welches Metall? <one>Magnesium</one>.
18
+ - Name a functional difference between the <one>Hexokinase</one> and the "Glucokinase". A: The Hexokinases transfer phosphoryl groups onto hexoses; the Glukokinase on the other hand transfers phosphoryl groups only onto D-Glucose.
19
+ - A. W. für <one>qualifizierte Enzyme</one>? <one>Cofaktor</one>.
20
+ - <one>NAD</one> hat wieviele terminale Aminogruppen, aka -NH2? Zwei.
21
+ - Was ist der Cofaktor bei der "Lactat-Dehydrogenase"? <one>NAD+</one>.
22
+ - Nenne ein Beispiel für eine "NAD+ abhängige Oxidoreduktase". A: GAP-DH.
23
+ - Die "Lactat-Dehydrogenase" erzeugt ausgehend von Pyruvat, Lactat. Dabei verbraucht sie was? <one>NADH</one>.
24
+ - Nenne die 5 Koenzyme des Pyruvat-Dehydrogenase Komplexes. A: (1) TPP (2) Lipoat (3) NAD (4) FAD (5) <one>CoA</one>
25
+ - Nenne die zwei Nebenprodukte des Pyruvat-Dehydrogenase Komplexes. A: (1) CO2 (2) <one>NADH</one>
26
+ - Name an enzyme that requires NADPH and that is also important for DNA. A: The "ribonucleotide reductase".
27
+ - Flavin-Koenyzme (FAD, FMN) sind vor allem in welcher Enzymgruppe wichtig? Nenne auch ein Beispiel hierzu. A: Oxidoruktasen, wie die <two>NADH-Dehydrogenase</two>.
28
+ - Wieso können wir NADH und NADPH benutzen, um die Enzymakvitität zu bestimmen, zumindest mancher Enzyme? NADH/NADPH wirken auch als Coenzyme und im Gegensatz zu den oxidierten formen, also NAD+ und NADP+, erreichen sie bei 340 nm ein Absorptionsmaximum.
29
+ - Benötigt die <one>Lactate-Dehydrogenase</one> ein <two>Coenzzym</two>? Ja, und zwar <one>NADH</one>.
30
+ - Das Cosubstrat der GADPDH ist ...? <one>NAD+</one>.
31
+ - Give another term for <one>old, yellow enzyme</one>. A: <one>Flavoprotein-NADH-Oxidase</one>.
32
+ - <one>Dehydrogenasen</one> gehören eigentlich zu den ... ? <one>Oxidoreduktasen</one>.
33
+ - Name an Enzyme without -ase as part of its name. A: <one>Trypsin</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Trypsin []
34
+ - Was machen <one>Proteasen</one>? <one>Proteasen</one> <two>spalten Peptidbindungen</two>.
35
+ - Wieviele Stellen enthält die Klassifikationsnummer der Enzyme? 4. []
36
+ - Englisch für <one>Schrittmacher-Enzym</one>. A: <one>Pacemaker enzyme</one>. []
37
+ - The <one>first enzyme isolated in a pure, crystalline form</one> was Urease. This enzyme can attack urease, yielding NH3 and ... ? <one>CO2</one>.
38
+ - Welches Enzym wurde als erstes kristallisiert? <one>Urease</one>.
39
+ - The portion of the enzyme to which a substrate binds is called ... ? The <one>enzyme's active site</one>.
40
+ - Nenne eine sehr bekannte <one>Aspartatprotease</one> (<two>aspartic protease</two>), die im Jahr 1825 entdeckt wude. A: <one>Pepsin</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Pepsin
41
+ - Gesamter Output der <one>Pyruvat-Dehydrogenase</one>? <one>Acetyl-CoA</one> und <one>CO₂</one>. []
42
+ - Topoisomerase werden auch ... genannt. A: <one>nicking-closing enzymes</one>.
43
+ - Besitzen Menschen die <one>Acetyl-CoA-Synthetase</one>? Ja. []
44
+ - Das Enzym <one>Carboanhydrase</one> benötigt als Cofaktor welches Metall-Ion? Ein "Zink-Ion". URL: https://de.wikipedia.org/wiki/%CE%91-Carboanhydrasen
45
+ - <one>Ligningspaltende Enzyme</one> sind vor allem in welchen 3 Enzymgruppen zu finden? Häm-Enzyme, Ligninperoxide, Mn-abhängige Peroxidase.
46
+ - Fungal enzymes typically have a pH-optimum of ... ? About 4-6, thus slightly acidic conditions.
47
+ - In <one>2018</one>, Enzyme Commission number 7 was added. Which enzyme group is part of EC 7? The <one>translocases</one>.
48
+ - <one>Wann</one> wurde der Begriff <two>Enzyme</two> eingeführt? <one>1878</one>.
49
+ - Nenne <two>je ein Enzym</two> für <one>Oxidoreduktasen</one>, <one>Transferasen</one>, Hydrolasen, Lyasen, Isomerasen, Ligasen. A: (1) Lactat-Dehydrogenase (2) Alanin-Transaminase (3) Pyrophosphatase (4) Pyruvat-Decarboxylase (5) Alanin-Racemase (6) <one>Glutamin-Synthetase</one>
50
+ - Nenne ein Enzym das "Cholesterin" verkleinern kann. A: Die <one>Cholesterin-Oxidase</one>.
51
+ - <one>TPP</one> in der Transketolase benötigt welchen Cofaktor? <one>Mg2+</one>.
52
+ - What is meant with the term <one>enzyme promiscuity</one>? This is <one>the ability of an enzyme to accept multiple substrates</one>.
53
+ - Do <one>enzymes</one> alter the reaction equilibrium? No - enzymes only alter the reaction rate and not the reaction equilibrium.
54
+ - Can we conclude something if we see two enzymes use the same coenzyme? They may perform catalysis by similar mechanisms.
55
+ - An enzyme without its cofactor is called ... ? An <one>apoenzyme</one>.
56
+ - What is the <one>apoenzyme</one>? The purely protein component of an enzyme.
57
+ - Why are <one>cofactors</one> important for an enzyme? Because cofactros are able to execute chemical reactions that cannot be performed by the standard set of twenty amino acids.
58
+ - The <one>P450 proteins</one> can catalyze ... ? <one>Monooxygenase activity</one>.
59
+ - One of the fastest enzymes known is ... ? <one>Carbonic anhydrase</one>. Each enzyme molecule can hydrate 106 molecules of CO2 per second.
60
+ - Enzymes catalyze reactions by ... ? By <one>stabilizing transition states</one>. These transition states are the highest-energy species in reaction pathways. By selectively stabilizing a transition state, an enzyme determines which one of several potential chemical reactions actually takes place.
61
+ - What is the most striking characteristics of enzymes? Their catalytic power and specificity.
62
+ - The enzyme <one>aequorin</one> catalyzes a reaction that will to release CO2 and light. But what substance does it also need? Calcium - so it can only work in the presence of calcium.
63
+ - Die <one>Tyrosinhydroxylase</one>, die L-DOPA aus Tyrosin herstellen kann, verwendet was genau als Cofaktor? <one>Tetrahydrobiopterin</one>,
64
+ - Enzymes that catalyze the addition of <one>deoxynucleotides</one> are called ... ? "DNA polymerases".
65
+ - Die "Pyruvat-Decarboxylase" gehört zu ... welcher Familie? Zu den <one>Lyasen</one>.
66
+ - Was meinen wir mit den <one>Dehydrogenasen</one>? Dies sind <two>Enzyme</two>, die <one>Wasserstoffatome aus dem Substrat entfernen</one> beziehungsweise abspalten.
67
+ - Input/Output of the enzyme <one>adenylyl cyclase</one>? (1) Input: <one>ATP</one> (2) Output: <one>cAMP</one> URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Adenylyl_cyclase []
68
+ - Welche Enzyme sind für das AB0-Blutgruppensystem des Menschen hauptverantwortlich? Die <one>Glykosyltransferasen</one>.
69
+ - In Bezug auf Enzyme: was meinen wir mit <one>recyclable shuttles</one>? Zum Beispiel "Co-Enzyme", die während der Reaktion verändert werden und im Anschluss regeneriert werden müssen.
70
+ - Can there be <one>several transition states during an enzymatic reaction</one>? Yes. []
71
+ - Welche Reaktion katalysiert die <one>Triosephosphatisomerase</one>? A: Die Konvertierung von "Dihydroxyacetonphosphat" zu "Glycerinaldehyd-3-Phosphat" (GAP).
72
+ - How do we call <one>the states in an enzyme reaction</one>? (1) <one>ground state</one> (2) <one>transition state</one>
73
+ - Nenne ein Enzym das NO quasi als <one>Abfallprodukt</one> produziert. A: Die <one>NO-Synthase</one>.
74
+ - Was machen die <one>Aminopeptidasen</one>? Aminopeptidasen verdauen Proteine vom aminoterminalen Ende her.
75
+ - The enzyme <one>luciferase</one> consists of how many subunits typically? It is a <one>heterodimer</one>, composed of α and β subunits that are encoded by luxA and luxB, respectively.
76
+ - Nenne ein Enzym, das "Acetyl-CoA" erzeugt. A: Die <one>Pyruvat-Dehydrogenase</one>.
77
+ - Nenne <one>eine Lyase</one>, die mit dem Buchstaben "A" beginnt! A: <one>Aldolase</one>.
78
+ - What is an <one>esterase</one>? An esterase is a hydrolase enzyme that splits esters into an acid and an alcohol in a chemical reaction with water called hydrolysis. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Esterase
79
+ - Eine vollständige Liste aller Enzyme finden wir wo? In <one>BRENDA</one> (<two>Comprehensive Enzyme Information System</two>). URL: https://www.brenda-enzymes.org/ []
80
+ - Nenne 3 katalytische wirkende Coenzyme des <one>Pyruvat-Dehydrogenase</one> Komplexes. A: FAD, Liponsäure, <one>TPP</one>.
81
+ - Was macht das Enzym <one>Polygalacturonase</one> (PG)? Baut das Pectin pflanzlicher Zellwände ab.
82
+ - Nenne ein Enzym das <one>Dextran</one> herstellt. A: Die <one>Dextran-Saccharase</one>.
83
+ - What is a <one>theozyme</one>? A theozyme is a theoretical enzyme - typically one that was computationally engineered.
84
+ - Nenne ein Enzym, in dem die seltene Aminosäure <one>Selenocystein</one> gefunden werden kann. A: Die <one>Glutathione Peroxidase</one>.
85
+ - Name the two substrates that the enzyme <one>pyranose oxidase</one> requires. A: (1) <one>D-glucose</one> (2) <one>O2</one>
86
+ - Why do <one>monooxygenases</one>, such as the P450 isoenzyme family, need the heme groupe? Because the molecular O2 attaches to the heme group; the <one>Fe atom</one> there.
87
+ - The <one>P450 monooxygenases</one> contain which factor? A <one>heme group</one>.
88
+ - On their given substrate, <one>natural enzymes stabilize</one> ... ? The <one>transition state</one>.
89
+ - In enzyme kinetics: which <one>k-value</one> comes between <two>ES</two> and <two>E+P</two>? <one>kcat</one>
90
+ - Give another word for the <one>man-made design and evolution of enzyme</one>. A: <one>Enzyme engineering</one>.
91
+ - Which formula may describe the <one>catalytic efficiency of an enzyme</one>? <one>kcat</one> / <one>Km</one>
92
+ - In <one>enzyme kinetics<one>: what is <two>Vmax</two>? This is a measure of how well an enzyme binds to a given substrate.
93
+ - Name three k-values that are important for enzyme kinetics. A: (1) k1 (2) k2 (3) kcat
94
+ - Nenne zwei Enzyme die <one>Ammoniak</one> einbauen. A: (1) Glutamat-Dehydrogenase (2) <one>Glutamin-Synthetase</one>
95
+ - Welche Enzyme können eine Verseifung (=Hydrolyse eines Esters) durchführen? Die <one>Esterasen</one>.
96
+ - Welche Enzyme ermöglichen einen <one>Seitenwechsel</one>? <one>Flippasen</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Flippase
97
+ - Give one general example for a "phosphorylase". A: The <one>Glycosyltransferases</one>.
98
+ - Welche Aminosäure ist im aktiven Zentrum der <one>Topoisomerasen</one> zu finden? <one>Tyrosin</one>.
99
+ - Nenne zwei Vertreter der <one>Serinproteasen</one>. A: (1) Trypsin (2) <one>Chymotrypsin</one>
100
+ - Enzymtyp <one>Thrombin</one>? Thrombin ist eine <one>Protease</one>.
101
+ - Welche Enzyme bilden "ungesättigte Fettsäuren"? Die <one>terminalen Desaturasen</one>.
102
+ - Wie viele Untereinheiten hat das Enzym <one>Glutamin-Synthetase</one> aus E. coli? <one>12</one>.
103
+ - Die <one>Pyruvat-Decarboxylase</one> gehört zu welcher Enzymklasse? Sie gehört zu den <one>Lyasen</one>.
104
+ - Die <one>Pyruvat-Carboxylase</one> synthetisiert welche Substanz? <one>Oxalacetat</one>.
105
+ - Was machen <one>Transferasen</one>? <one>Transfer funktioneller Gruppen</one>.
106
+ - Anderer Begriff für die <one>Substratbindungsstelle eines Enzyms</one>? A: <one>Aktives Zentrum</one>.
107
+ - Andere Bezeichnung für einen <one>ES-Komplex</one> (Enzym-Substrat Komplex)? <one>Michaelis-Komplex</one>. URL: http://www.spektrum.de/lexikon/biochemie/michaelis-menten-kinetik/3971
108
+ - Ist <one>Km</one> (die Michaelis-Menten Konstante) ein Maß für die Affinität eines Enzyms für sein Substrat? Ja.
109
+ - Nenne das wichtigste <one>Zink-enthaltende Enzym</one> im menschlichen Körper. A: Die <one>Carboanhydrase</one>.
110
+ - Welches Enzym modifiziert <one>PPT</one>? Die <one>PPT-Acetyltransferase</one>.
111
+ - Welches Enzym hydratisiert <one>Kohlendioxid</one>? Die <one>Carboanhydrase</one>.
112
+ - Was genau machen <one>Desaturasen</one>? Sie übertragen Elektronen von einem Molekül auf ein anderes. Das Substrat wird dabei "entsättigt", sprich - <one>eine Mehrfachbindung wird eingebaut</one>.
113
+ - <one>Plasmin</one> ist ein Enzym. Zu welcher Enzymgruppe genau gehört es? Zu der <one>Gruppe der Peptidasen</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Plasmin
114
+ - Die <one>Aconitase</one> erzeugt (letzten Endes) Isocitrat. Was eliminiert sie bei ihrer katalytischen Reaktion? Wasser.
115
+ - <one>6-Mercaptopurine</one> wird von welchem Enzym metabolisiert? Thiopurine Methyltransferase.
116
+ - The <one>Cytochrome P450</one> (CYPs) family of enzymes contains which cofactor? <one>Heme</one>.
117
+ - Das <one>Anti-Skorbut Enzym</one> ist ... ? Die <one>Gulonolacton-Oxidase</one>.
118
+ - Was ist eine <one>Amidase</one>? Eine Amidase ist ein Enzym das die Hydrolyiserung von Amiden katalysiert.
119
+ - Können <one>enzymatisch katalysierte Reaktionen</one> reversibel sein? Ja.
120
+ - Was macht die Glykogenphosphorylase? Sie setzt Zuckereinheiten aus dem Energiespeicher <one>Glykogen</one> frei.
121
+ - Ein-Substrat-Reaktionen sind meistens ... ? Isomerisierungen.
122
+ - Können wir die Michaelis-Menten Gleichung auch praktisch einsetzen? Ja, zum Beispiel zur <one>Konzentrationsbestimmung eines Enzyms</one>.
123
+ - Die Geschwindigkeit der Gesamtreaktion zwischen E+S hängt von welchen zwei Konzentrationen ab? (1) <one>Konzentration des Substrat</one> (2) <one>Konzentration des Katalysator</one> (also des Enzyms)
124
+ - Which metal does the enzyme <one>carbonic anhydrase</one> require in its active site? "Zinc".
125
+ - Which enzyme may typically be meant with the abbreviation "<u>MMP</u>"? A <one>Matrix metalloproteinase</one>.
126
+ - The new EC class proposed, EC 7, is for the ... ? "Translocases".
127
+ - In regards to enzymes, what organization is displayed by the abbreviation "EFI"? This is the "Enzyme Function Initiative".
128
+ - Früher wurden die Enzyme auch als ... bezeichnet. A: "Fermente".
129
+ - Welche Enzymklasse führt eine "<ud>Eliminierungsreaktion</ud>" durch? "Lyasen".
130
+ - Prosthetische Gruppe bei der "<ud>Pyruvat Carboxylase</ud>"? "Biotin".
131
+ - Most phosphonate natural products share a common first biosynthetic step - the rearrangement of phosphoenol pyruvate (PEP) to phosphonopyruvate (PnPy), catalyzed by ... which enzyme? The "PEP-mutase".
132
+ - Nenne zwei Beispiele für "Ligasen", die die "Knüpfung von Bindungen" katalysieren. A: (1) "DNA-Ligase" (2) "DNA-Polymerase"
133
+ - What does the name "phosphotransferase" indicate? That this enzyme catalyzes the transfer of a phosphoryl group from ATP to "Glucose".
134
+ - "Restriktionsenzyme" zählen allgemein zu welcher Enzymklasse? Sie zählen zu den "Hydrolasen".
135
+ - Why are "active site residues" of an enzyme family usually conserved? Because they are responsible for the "catalytic function".
136
+ - Was machen "Isomerasen", kurz formuliert? Intramolekulare Gruppenübertragungen - also "Transfer von Gruppen innerhalb von Molekülen".
137
+ - Es gibt Enzyme, die "Kinasen" genannt werden. Gib eine etwas längere Bezeichnung an für "Kinasen". A: "Proteinkinasen".
138
+ - Allgemein, wie werden "Hexokinasen" gehemmt? Sie werden durch ihr Endprodukt gehemmt.
139
+ - Welches Enzym konvertiert "Glycerin" -> "Glycerin-3-phosphat"? Die "Glycerin-Kinase".
140
+ - Hexokinase-Isozymes are typically "allosterically inhibited" by ...? By their product, "glucose-6-phosphate".
141
+ - Die "Glucokinase" führt welche Reaktion durch? Glucose -> Glucose-6-phosphat.
142
+ - "Oxidoreduktasen" haben welche prosthetische Gruppe? FAD oder FMN.
143
+ - SAM wird als Cofaktor welcher Enzymklasse benötigt? EC 2: Transferasen.
144
+ - Was sind "Oxygenasen"? Enzyme die den Einbau von Sauerstoff, aus O2, in organische Verbindungen katalysieren.
145
+ - Enzymes stabilize which state? The "transition state". URL: http://education.seattlepi.com/enzymes-lower-transition-state-4735.html
146
+ - Was ist praktisch das Gegenteil einer "Substratsättigung"? Die "Substratuntersättigung".
147
+ - Wie geht die "ultimative Enzym-Formel"? "E+S <--> [ES] <--> [EP] <--> E+P".
148
+ - Welches Enzym, also dessen Trivialname, ist "EC 1.1.1.1"? Dies ist die "Alkohol-Dehydrogenase", eine "Oxidoreduktase".
149
+ - Die EC Nummer, also "Enzyme Commission" oder "Enyme class", hat wieviele relevante Stellen? "4".
150
+ - Was ist das "schnellste Enzym" überhaupt? Die Carboanhydrase". Sie setzt 10 Moleküle Substrat pro Sekunde um.
151
+ - Gegeben ist das Enzym "Aconitase". Nach der IUPC ist das nicht der systematische Name. Wie geht der systematische Name von Aconitase? "Aconitat-Hydratase".
152
+ - Was meinen wir mit "breathing core" bei dem "Pyruvat-Dehydrogenase Komplex"? Das der Kern dieses Enzyms relativ flexibel ist und seine Größe um bis zu 20% verändern kann.
153
+ - Welches Enzym, konvertiert 3-Phosphoglycerat zu 2-Phosphoglycerat? Die "Phosphoglycerate-Mutase". URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Phosphoglycerate_mutase
154
+ - Die "Aconitase" enthält welche zwei Metalle? Dieses "Eisen-Schwefel Protein" enthält: (1) "Eisen" (2) "Schwefel
155
+ - Die "Carbamoylphosphat-Synthetase" kommt, zumindest beim Menschen, in wievielen Varianten vor? In zwei Varianten.
156
+ - Nenne ein Enzym das Glucose zu Fructose isomerisieren kann. A: "Xylose-Isomerase".
157
+ - Die "Carbamoylphosphat-Synthetasen" sind Enyzme aus welcher Enyzm-Gruppe? "Ligasen".
158
+ - Wie können wir, einfach formuliert, "Reaktionsmechanismen von Enzymen" untersuchen? Mit Hilfe sogenannter "Inhibitorstudien". URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11325042
159
+ - Was meinen wir mit "Nebenaktivitäten" eines Enzyms? Dies ist bei manchen Enzymen der Fall, wenn diese auch andere Substrate als das eigentliche "Hauptsubstrat" umsetzen.
160
+ - Welche Krankheit manifestiert sich bei zu wenig "Vitamin B1"? Die "Beri-Beri Krankheit".
161
+ - Which enzyme breaks down Glycogen into Glucose? The enzyme "glycogen phosphorylase".
162
+ - Die "Cytochrom-Oxidase" mag welches Metall? "Kupfer".
163
+ - Was machen "Mechanoenzyme"? Sie konvertieren Energie aus der "ATP-Hydrolyse" - also chemischer Energie - in mechanische Energie um, im Zuge einer Kontraktion (also mechanische Arbeit).
164
+ - Enzyme, die mittels Phosphat eine Bindung spalten, nennt man ... ? "Phosphorylasen".
165
+ - Dehydrogenasen gehören zu welcher Gruppe? Sie gehören zu den "Oxidoreduktasen".
166
+ - What is the fastest known enzyme today (2018)? "Carbonic anhydrase". URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Carbonic_anhydrase
167
+ - Was ist die einfachste Regulationsform bei Enzymen? Die "Produkthemmung".
168
+ - Die "Aldolase" konvertiert Fructose-1,6 bisphosphat in? Glycerinaldehyd-3P und Dihydroxyaceton.
169
+ - Vor allem welche Enzymgruppe verwendet "Riboflavin"? Die Oxidoreduktasen, über FMN/FAD.
170
+ - Biotin ist ein Kofaktor der ... ? Acetyl-CoA-Carboxylase.
171
+ - The enzyme "adenylate kinase" does perform which reaction? 2 ADP -> AMP + ATP. (BUT CHECK THiS ON WIKIPEDIA).
172
+ - Nenne ein Enzym, das Ammoniak direkt in Glutamat einbauen kann. A: Die "Glutamin-Synthetase". URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Glutamat-Ammonium-Ligase
173
+ - Das Enzym "Fumarase" erzeugt ...? Malat. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Fumarase
174
+ - Was für Enzymgruppen erkennen PEST-Sequenzen? Vor allem <one>proteolytische Enzyme</one>.
175
+ - Nenne eine prominente Enzymgruppe, die auf die "Säure-Base-Katalyse" setzt. A: <one>Proteolytische Enzyme</one>.
176
+ - Temperaturoptima mesophiler Enzyme? Bei etwa 37°C.
177
+ - Input / Output der "Tryptophanase"? (1) I: Tryptophan (2) O: Indole
178
+ - What is the enzyme "Aspartokinase" doing? It catalyzes the phosphorylation of the amino acid "aspartate".
179
+ - Welches Enzym nimmt GTP+ADP und erzeugt so ATP (und GDP)? Die "Nucleosiddiphosphat-Kinase".
180
+ - FAD als prosthetische Gruppe findet man vor allem bei welcher Enzymklasse? Bei den "Dehydrogenasen".
181
+ - TPP (Thiaminpyrophosphat) finde ich als prosthetische Gruppe in welchem Enzym? In der "Transketolase".
182
+ - Sind Enzyme nett zu ihren Substraten? Nein. Sie "schränken deren Translations- und Rotationsbewegungen ein". (Dies ist wichtig für den Übergangszustand.)
183
+ - In der praktischen Enzymologie, wieso mögen wir eine "pH-Kurve" erstellen mögen? Dadurch können wir zum Beispiel den "optimalen pH-Wert" ermitteln.
184
+ - Statine inhibieren welches Enzym? Die "HMG-CoA-Reduktase", die in der menschlichen Cholesterinsynthese wichtig ist.
185
+ - Die Alkohol-Dehydrogenase hat welches Metall im katalytischen Zentrum? Zink.
186
+ - Input und Output des Enzyms "Adenosin-Desaminase"? (1) Input: Adenosin (2) Output: Inosin
187
+ - Was macht die <one>Aconitase</one>? A: Dieses Enzym aus dem Citratzyklus, konvertiert "Citrat" -> "Isocitrat". URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Aconitase
188
+ - Metalloproteases often have what "metal ion" in their active centers? Zinc.
189
+ - Hydrolasen sind eine eigene Enzymklasse, aber eigentlich gehören sie zur Klasse ... ? Der "Hydrolysen". URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Hydrolase
190
+ - Nenne 1 funktionellen Unterschied zwischen Enzymen und Ribozymen. A: Enzyme weisen eine wesentlich "höhere Aktivität" als Ribozyme auf.
191
+ - Nenne 2 mit dem PDH-Komplex assoziierte Proteine. A: (1) PDH-Kinase (2) PDH-Phosphatase
192
+ - Das Coenzym FAD ist mit welcher Untereinheit des "Pyruvat-Dehydrogenase-Komplexes" assoziiert? Mit "E3".
193
+ - Nenne 2 Cysteinproteasen die mit "C" beginnen. A: (1) Caspasen (2) Cathepsin
194
+ - Energie für die "Phosphoenolpyruvate-Carboxykinase" von ... ? GTP.
195
+ - Was machen die "Peptidyl-Prolyl-cis/trans-Isomerasen"? Sie beschleunigen die Umwandlung zwischen der cis- und der trans-Form der "Prolylpeptidbindung", also cis-Prolin und trans-Prolin.
196
+ - Cyclophiline gehören zur Enzymklasse der ... (genau)? Isomerasen; genauer der "Peptidyl-Prolyl-cis/trans-Isomerasen".
197
+ - Was macht das Enzym "alkalische Phosphatase"? Es entfernt Phosphat-Gruppen (= "Dephosphorylierung"). Dieses Enzym arbeitet am besten bei einem alkalischen pH-Wert. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Alkalische_Phosphatase
198
+ - Welches Enzym konvertiert Phosphoenolpyruvat in Pyruvat? Die "Pyruvat-Kinase".
199
+ - How do we call the enzymes that "hydrolyze glycosidic bonds"? Glycosidases.
200
+ - Nenne 2 Aminosäuren, an denen das Enzym "Elastase" schneiden kann. A: (1) Alanin (2) Serin
201
+ - Was ist eine "Lyase"? Eine Lyase ist ein Enzym, das eine Molekülspaltung katalysieren kann.
202
+ - What are "Phosphorylases"? These are enzymes that catalyze the addition of a phosphate group from an inorganic phosphate to an acceptor.
203
+ - Wo spielt das Enzym "Phosphorylase" eine Rolle? Beim "Abbau von Glykogen".
204
+ - Die Epimerasen gehören zu welcher Enzymklasse? Sie gehören zu den "Isomerasen".
205
+ - Gib ein Beispiel für eine Epimerase. A: Das Enzym "UDP-Glucose-4-Epimerase", welches "UDP-Galactose" in "UDP Glucose" konvertiert.
206
+ - Chymotrypsin gehört zu welcher der 6 Enzymklassen? Es gehört zu den "Hydrolasen".
207
+ - Die "Pyruvat-Decarboxylase" gehört zu welcher Enzymklasse? Zu den "Lyasen".
208
+ - Größte Subklasse der "Oxidoreduktasen" nimmt welche Gruppe ein? Die "Dehydrogenasen".
209
+ - Dehydrogenasen sind ... ? Oxidoreduktasen.
210
+ - Was machen "Lyasen"? Gruppeneliminierungen unter Bildung von Doppelbindungen oder Addition einer Gruppe an eine Doppelbindung.
211
+ - Which enzymes can interconvert enantiomers? Racemases.
212
+ - Kinasen gehören zu welcher Enzymklasse? Kinasen gehören zur Klasse der "Transferasen".
213
+ - Welche Reaktion katalysiert die "Alkohol-Dehydrogenase"? Von Ethanol zu Acetaldehyd.
214
+ - In der Zelle, welches Enzym kann Disulfid-Brücken umlagern? Die "Disulfidisomerase".
215
+ - A. W. für "Aminotransferasen"? Transaminasen.
216
+ - Die Ornithin-Decarboxylase in Säugetieren hat eine Halbwertszeit von ~11 Minuten. Dieses Enzym is an der Synthese von ... beteiligt? Polyamin.
217
+ - Was machen "Oxidoreduktasen"? Transfer von H-Atomen, O-Atomen oder Elektronen zwischen Metaboliten.
218
+ - Was machen "Hydrolasen"? Katalyse hydrolytischer Reaktionen.
219
+ - Was machen "Ligasen"? Knüpfung kovalenter Bindungen unter gleichzeitiger Spaltung von Nucleosidtriphosphaten.
220
+ - Give the archetypical general example for a "Transferase". A: The Kinases.
221
+ - Zu welcher Enzymklasse gehört das Enzym "Galaktose 6-Oxidase" ("GalOx")? Es gehört zu den "Oxidoreduktasen".
222
+ - Merkslogan für die 6 Enzymklassen? OTH-LIL ("Otto-Lyli").
223
+ - Charakteristisch für den "aeroben Abbau von Glukose" ist die Aktivität welchen Enzyms? "Pyruvat-Dehydrogenase".
224
+ - Nenne ein wichtiges "Einbahn-Enzym". A: Die "Pyruvat-Dehydrogenase".
225
+ - Was macht das Enzym "Fumarase" (Angabe des Endprodukts ist ausreichend)? Katalysiert Fumarat + Wasser-> L-Malat (stellt also L-Malat her).
226
+ - Eine "Carboxylase" ist ein Enzym, das mit Hilfe von ... und ATP Carbonat überträgt. A: Biotin.
227
+ - Was machen die "Dehydrogenasen" in der Biochemie? Sie katalysieren die Entfernung von 2 Wasserstoffatomen (2 Protonen + 2 Elektronen).
228
+ - n% aller bekannten Enzyme benötigt Metallkationen zum Erreichen ihrer vollen, katalytischen Aktivität? Etwa 25%.
229
+ - The Dehydrogenases are a subclass of ...? Oxidoreductases.
230
+ - Was können wir pauschal über Enzyme sagen, deren Aktivität reguliert wird? Ihre Struktur ist komplizierter als die Struktur anderer Enzyme.
231
+ - The enzyme "pyruvate carboxylase" takes Pyruvat as input and yields what substance? Oxalacetate.
232
+ - Nenne 1 Enzym, das überschüssiges Pyruvat aus dem Körper entfernt. A: Die "Lactat-Dehydrogenase".
233
+ - In welchem Enzym mögen wir "Pyrrolysin" finden? In der "Methyltransferase" (in Archaea).
234
+ - Wieviele Konformationen hat das Enzym "Hexokinase"? 2 - eine mit gebundener Glucose, eine ohne gebundene Glucose.
235
+ - "DNA Glycosylases" are classified under which EC number? EC 3.2.2
236
+ - Das Enzym "Muraminidase" hat n Alpha-Helices? 27.
237
+ - Was für ein Enzym katalysiert die Bildung von Phenylpyruvat? Ein bifunktionelles Enzym (Chorismat-Mutase & Prephenat Dehydratase).
238
+ - What is the "net reaction" for the "ATP synthase"? ADP + Pi + 4H <- -> ATP + H2O + 4H+ (matrix)
239
+ - Die "Glutamin-Synthase" hat n Untereinheiten? 12 identische Untereinheiten.
240
+ - Die "Ribonuclease" hat n Disulfidbrücken? 4.
241
+ - What do "fatty acid desaturase" create? It creates a carbon/carbon double bond.
242
+ - Enzymtyp Katalase? Die Katalase ist eine "Oxidoreduktase".
243
+ - What is an <one>Endopeptidase</one>? A proteolytic peptidase that breaks peptide bonds of "nonterminal amino acids".
244
+ - Nenne 1 Enzym der "biotin-dependent carboxylases". A: Acetyl-CoA Carboxylase.
245
+ - A. W. für die "Transketolase"? Glycoaldehyd-Transferase.
246
+ - Input, Output bei der "Pyruvat-Dehydrogenase"? A: Input ist Pyruvat, Output ist Acetyl-CoA.
247
+ - Wovon sind die Transferasen immer abhängig? Von Coenzymen.
248
+ - Wieviele Isomere hat die "Lactat-Dehydrogenase" im Menschen? 5.
249
+ - Was macht Chymosin? Hydrolysiert Alpha-Kasein der Milch.
250
+ - Was macht die "Glucose-Oxidase"? Konvertiert Glucose und Sauerstoff zu Gluconolacton und Wasserstoffperoxid.
251
+ - Spaltungsreaktionen sind in der Biochemie überwiegend homo- oder heterolytisch? Heterolytisch.
252
+ - Die "Nitratreduktase" von Ecoli akzeptiert Elektronen von ... ? Cytochrom B.
253
+ - Welches Enzym kann Citronensäure abbauen? Aconitase.
254
+ - Nenne 1 Enzym, das Acetaldehyd in Ethanol umwandelt. A: Alkohol-Dehydrogenase.
255
+ - Welches Enzym ist schneller - die Hexokinase IV oder die Hexokinase I? Hexokinase I. Sie ist wichtig für die Regulation der Blutzuckerkonzentration. Das erklärt auch ihre eigenwillige Aktivitätskurve.
256
+ - Welche Rolle in der Zelle erfüllt die AMPK ("AMP-aktivierte Proteinkinase")? Die Aufgabe der AMPK ist es, Zellen vor ATP-Mangel, also einem Energiemangel, zu schützen. Sie ist ein AMP Sensor.
257
+ - What are "Isoenzymes"? These are enzymes that catalyze the same reaction but are subject to different regulatory controls.
258
+ - Wie viele Restriktionsendonucleasen sind bekannt? A: Über 3000. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Restriction_enzyme
259
+ - Was machen "Aminotransferasen"? Aminotransferasen sind Enzyme, welche die Übertragung von Alpha-Aminogruppen von einem Donor- auf ein Akzeptormolekül katalysieren (= "Transaminierung").
260
+ - A. W. für "Enzym"? Biokatalysator.
261
+ - Welches Enzym konvertiert Pyruvat zu Lactat? Die "Lactat-Dehydrogenase".
262
+ - How do we call the rate at which an enzyme converts its substrate into product? Velocity (v).
263
+ - Was ist wenn ein Substrat extrem fest an sein Enzym bindet? Dann gibt es so gut wie keine katalytische Aktivität.
264
+ - Was genau macht die "Pyruvate Dehydrogenase"? Transfers an acetyl group from pyruvate to coenzyme A via TPP and dihydroxyliponamid.
265
+ - What is the enzyme "RNase H" doing? It cleaves RNA of a hybrid DNA/RNA strand.
266
+ - A. W. für "Enzyminduktion"! A: Gezielte Synthese von Enzymen.
267
+ - Definiere "Kinases". A: An enzyme that transfers a phosphoryl group from ATP to another substance.
268
+ - A. W. für "Hexokinase"? Glucokinase. Die Glucokinase wird nicht durch Glucose gehemmt.
269
+ - Nenne das Substrat der Peroxidase. A: Wasserstoffperoxid.
270
+ - Welches Enzym konvertiert Ribose zu Desoxyribose? Ribonukleotidreduktase.
271
+ - Glutamat-Dehydrogenase. Input-Output? Input ist Alpha-Ketoglutarat, Output ist Glutamat.
272
+ - Die "Pyruvat-Decarboxylase" erzeugt welches Molekül? Acetaldehyd. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Acetaldehyde
273
+ - Nenne 1 temporären CO2-Carrier der ein Bestandteil einer Carboxylase ist. A: Die Biotinylgruppe bei der "Biotin-Carboxylase".
274
+ - Das Enzym "Lactase" macht was? Spaltet Lactose in Glucose und Galactose.
275
+ - Wann wurde die Xylose-Isomerase entdeckt? 1957.
276
+ - Was sind "Oxidoreduktasen"? Das sind Enzyme, die Redoxreaktionen katalysieren.
277
+ - Coenzyme erhöhen was? Die "Vielfalt der Redoxreaktionen".
278
+ - Die "Squalen-Monooxygenase" ist eine Oxidase die wichtig bei der Cholesterin-Biosynthese ist. Welches Cosubstrat benötigt sie? NADPH.
279
+ - Was macht die "Cytochrom-Oxidase"? Konvertiert H2 zu Wasser.
280
+ - Was produziert die Hydrogenase? H2.
281
+ - What coenzyme is used by "glyceraldehyde-3-P-dehydrogenase"? <one>NAD-</one>.
282
+ - Wie arbeitet "Trypsin"? Spaltet auf der Carboxylseite von Lysin (K) & Argininresten (R).
283
+ - Was kann das Enzym "Nitrilase"? A: Inaktiviert Bromxynil (welcher seinerseits die Photosynthese hemmen kann.)
284
+ - Nenne ein Enzym das Pyruvat als Input akzeptiert. A: Pyruvat-Decarboxylase.
285
+ - A. W. für "Ligasen"? Synthetasen.
286
+ - Unterschied Phosphatase zu Nuclease? Phosphatase hydrolysiert nur einen "terminal ester bond", Nuclease hydrolysiert "internal ester bond".
287
+ - Welche Polymerase tauscht RNA-Primer durch DNA aus? Die DNA Polymerase I.
288
+ - Die Dinitrogenase hat n Untereinheiten? 4 (Tetramer).
289
+ - Die "DNA-Polymerase" nutzt ein funktionelles Nucleophil, das wichtig ist für die Polymerisationsreaktion. Welches? Am 3-Prime Ende hat DNA eine freie OH-Gruppe. Diese greift die Alpha-Phosphatgruppe des hinzukommenden Basenpaar an. Obwohl die Bildung einer neuen Phosphodiesterbindung reversibel ist, macht die nachfolgende Hydrolyse des PPi die gesamte Reaktion irreversibel.
290
+ - Gib 1 Beispiel für eine "enzymatische Phosphorylgruppenübertragung". A: Das Glykolyseenzym "Hexokinase".
291
+ - Welche Reaktion führen die "Transferasen" durch? Sie übertragen "funktionelle Gruppen".
292
+ - Trypsin gehört zu welcher der 6 Enzymklassen? Hydrolase (Klasse 3 also) URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Trypsin .
293
+ - Mutasen gehören zu welcher Enzymuntergruppe und machen was? Gehören zu den "Isomerasen". Sie verändern ein Molekül indem sie intramolekular funktionelle Gruppen verschieben.
294
+ - Welches Enzym wandelt "Glucose-1-phosphat" in "Glucose-6-phosphat" um? Die "Glucosephosphat-Mutase".
295
+ - Nenne 3 Enzyme die TPP benötigen. A: (1) Transketolase (2) Pyruvat-Decarboxylase (3) Alpha-Ketoglutarat-Dehydrogenase
296
+ - Nenne ein Enzym das die Umwandlung von 2-Oxoglutarat zu Citronensäure katalysiert. A: Die "Oxoglutarat-Dehydrogenase".
297
+ - Welches Enzym konvertiert "2-Oxoglutarat" im Citronensäurezyklus? Oxoglutarat-Dehydrogenase.
298
+ - Welches Enzym hydrolysiert cAMP zu 5-Strich-AMP? cyclic AMP phosphodiesterase.
299
+ - In der Glykolyse wird "2-Phosphoglycerat" zu PEP konvertiert. Welches Enzym macht dies? Die Enolase.
300
+ - Welche allgemeine Reaktion werden von den "Lyasen" durchgeführt? Eine Eliminierung von Gruppen unter Ausbildung von Doppelbindungen.
301
+ - Nenne ein Enzym mit einem [4Fe-4S]-Eisen-Schwefel-Cluster. A: Aconitase.
302
+ - Die Phosphoglycerat-Kinase erzeugt 3PG (3-Phosphoglycerat) sowie welche weitere Substanz? ATP.
303
+ - What are "Metalloproteases"? These are Proteases that contain a metal ion at their active site, which acts as a catalyst.
304
+ - Welches Enzym interkonvertiert Dihydroxyacetone phosphate und D-glyceraldehyde 3-phosphate? A: Die Triosephosphat-Isomerase. URL: en.wikipedia.org/wiki/Triosephosphate_isomerase
305
+ - The activity of "Glutamine Synthetase" requires what? ATP.
306
+ - Wir haben 6 Enzymklassen. Nenne diese in korrekter Reihenfolge, und erkläre kurz die Art der Tätigkeit. A: (1) Oxidoreduktasen: Oxidations-Reduktions-Reaktionen (2) Transferasen: Übertragen funktionelle Gruppen (3) Hydrolasen: Hydrolasereaktionen (4) Lyasen: Eliminierung von Gruppen, unter Ausbildung von Doppelbindungen (5) Isomerasen: Isomerisierungen (6) Ligasen: mit ATP-Hydrolyse gekoppelte Knüpfungen von Bindungen
307
+ - Adenylylcyclasen gehören zu welcher Enzymklasse? Zur Klasse der "Lyasen".
308
+ - Prosthetische Gruppe bei der "Glucose-Oxidase"? FAD.
309
+ - Was produziert das Enzym "Pyruvat-Dehydrogenase"? A: Acetyl-CoA.
310
+ - Enzymtyp DNA-Polymerase? Ist eine Transferase.
311
+ - Output der "Citrat-Lyase"? Oxalacetat + Acetat.
312
+ - In der Glykolyse gibt es das Enzym "Phosphofructokinase". Es bildet Fructose 1.6-Bisphosphat aus Fructose 6-Phosphat. Was benötigt es hierzu? ATP.
313
+ - Biotin ist das Coenzym sämtlicher ...reaktionen? Carboxylierungsreaktionen.
314
+ - Das Enzym "Pyruvate Carboxylase" gehört zu welcher Enzymklasse? Ligase.
315
+ - Wie sollten wir das Enzym "Aspartokinase" eigentlich nennen? Aspartatkinase.
316
+ - Für die Nitrogenase-Reduktion brauche ich ein starkes Oxidationsmittel? Nein, ein starkes Reduktionsmittel.
317
+ - Was macht das bakterielle Enzym "Alaninracemase"? Wandelt Alanin um, und zwar konvertiert es L-Alanin in D-Alanin.
318
+ - Gib ein Beispiel für eine "Glycosylase" die mit dem Buchstaben "M" beginnt. A: MBD4.
319
+ - Wieviele Enzyme sind bis heute beschrieben? 3000.
320
+ - Was macht das Enzym "Katalase" genau, inklusive ihrer Endprodukte? Spaltet Wasserstoffperoxid (H2O2), in Sauerstoff und Wasser.
321
+ - Niacin fehlt. Welche Enzymklasse funktioniert nicht mehr? Und welche Krankheit mag daraus resultieren? Die Enzymklase der "Dehydrogenasen", einer Unterklasse der Oxidoreductasen. Pellagra ist die Krankheit. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Pellagra
322
+ - Enzymklasse DNA-Polymerasen? Transferase.
323
+ - Desaturasen gehören zu welcher Enzymklasse? Zu den Oxidoreduktasen (1).
324
+ - In 1868, Friedrich Miescher used which enzyme on cells? Pepsin.
325
+ - Das Enzym "Phosphoglycerat-Mutase" hat in seinem katalytischen Zentrum eine Modifikation an His 8. Welche? Eine gebundene Phosphorylgruppe.
326
+ - Welches Enzym produziert Inosin? Adenosin-Desaminase. (Aus Adenin.)
327
+ - Die meisten Oxidoreduktasen gehören zu den? Dehydrogenasen.
328
+ - Inwiefern unterscheiden sich Hydrolasen von Lyasen? Hydrolasen führen eine hydrolytische Spaltung durch, Lyasen führen eine nicht-hydrolytische Spaltung durch.
329
+ - Welches Enzym würde gegen Skorbut helfen? Gulonolacton-Oxidase.
330
+ - Die Hexokinase ist das erste Enzym der Glykolyse. Welches Enzym kommt danach? Die "Phosphoglucoisomerase".
331
+ - In der Enzymkinetik, andere Bezeichnung für "maximale Reaktionsgeschwindigkeit"? V max.
332
+ - Die "Transketolase" ist ein Schlüsselenzym wo genau? Im Pentosephosphatzyklus.
333
+ - Name the two types of "enzyme inhibition". A: (1) Suicide substrates (2) Transition state analogues
334
+ - Enzymes can be incativated by "suicide substrates". How do these work? They build a covalent linkage with the catalytic centre. The enzyme thus "kills itself", by accepting these substrates.
335
+ - Nenne ein "Biotinabhängiges-Enzym". A: Die ACC, die "Acetyl-CoA-Carboxylase".
336
+ - Die Separase ist was für ein Enzym? Die Separase ist eine "Cystein-Protease".
337
+ - Nenne ein Enzym das 6-Mercaptopurin inaktivieren kann. A: Die "Thiopurine methyltransferase". URL: http://emedicine.medscape.com/article/1829596-overview
338
+ - Welches Enzym in der Biochemie steht für "ACC", und wo kommen dessen zwei Isoformen vor? ACC steht für "Acetyl-CoA-Carboxylase", die in der Fettsäurebiosynthese eine Rolle spielt. Die eine Isoform kommt im Fettgewebe vor, die andere in Herzmuskelzellen.
339
+ - Die Isocitratlyase akzeptiert Isocitrat und erstellt welche 2 Produkte? (1) Glyoxylat (2) Succinat
340
+ - Was für ein Enzymtyp kann 3-Phosphoglycerate in 2-Phosphoglycerate konvertieren? Eine Mutase.
341
+ - Nenne das "cheese enzyme" (auf deutsch). A: Rennin.
342
+ - Optimaler pH Wert der meisten Enzyme? 7.2
343
+ - Hexokinasen haben eine hohe Affinität zu ...? Glucose.
344
+ - Nenne die 3 Enzyme des Glykogen-Abbaus. A: (1) Phosphorylase (2) Transferase (3) Alpha-1,6-Glucosidase
345
+ - Was genau macht die "Adenylat-Zyklase" im biochemischen Detail? A: Sie: (1) spaltet zwei Phosphate von ATP ab, und (2) verbindet den Rest zu einem cAMP Molekül (an C3 Strich und C5 Strich).