studium 0.18.7

data/lib/studium/exam_topics/signal_transduction_and_laser_systems

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+# =========================================================================== #
+# === Signal Transduction
+#
+# LDIGC Tag. Signaltransduktion tag. Signal tag. Information Tag. Info Tag.
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+# Teilweise auch Physik. Kros Tag, Laser tag, Lasertag.
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+# Also includes Photochemistry of DNA and second messengers.
+# =========================================================================== #
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+- <one>Biological clocks</one> are typically synchronized to ... ? the <one>cycles of light</one>.
+- Nenne <one>zwei sekundäre Botenstoffe</one> die <two>Proteinkinasen direkt aktivieren</two>. A: (1) <one>cGMP </one> (2) <one>Ca2+</one>
+- Signale werden durch Rezeptoren wahrgenommen. Wie nennt man diesen ersten Schritt in der Signaltransduktion? <one>Perzeption</one>.
+- <one>SOS1</one> (Son of Sevenless Homolog 1) spielt eine Rolle in welchem Signalweg? <one>Ras/Raf/MAPK-Signalwegs</one>.
+- In mammals: MAP kinases are grouped into how many different families? Three families: ERKs, JNKs, and p38/SAPKs.
+- Inositoltrisphosphat bewirkt als second messenger was genau? Er führt nach Bindung an seinen Rezeptor dazu das Calcium-Ionen aus dem endoplasmatischen Retikulum freigesetzt werden.
+- <one>Inositoltrisphosphat</one> (ein second messenger) bindet an welchen spezifischen Rezeptor? Den <one>IP3-Rezeptor</one>.
+- The <one>splitting of water</one> <two>using light</two> is called ... ? <three>photolysis</three>.
+- How do we know that a <one>Ras protein</one> is inactive? If it has bound GDP then we can assume it is inactive.
+- Receptor tyrosine kinases (RTKs) are associated with which protein, inside of the cell? With <one>Ras</one>.
+- Are there receptors that can phosphorylate a molecule? <one>Yes</one> - the <two>receptor tyrosine kinases (RTKs)</two>.
+- Just about the best-studied group of enzyme-linked receptors are ... ? The <one>receptor tyrosine kinases</one> (<two>RTKs</two>).
+- Aktivieren <one>Guaninnukleotid-Austauschfaktoren</one> (GEFs) <two>G-Proteine</two>? <one>Ja</one>.
+- Vermitteln G-Protein-gekoppelte Rezeptoren ihr Signal über Rezeptorphosphorylierung? Nein.
+- Does the <one>platelet-derived growth factor</one> <two>cause cells to divide</two>? <one>Yes</one>.
+- Der <one>JAK-STAT Signalweg</one> kann in eukaryotischen Zellen gefunden werden. Historisch betrachtet wurde dieser Signalweg wie entdeckt? Über die <one>Behandlung von Zellen mit Interferonen</one>.
+- Viele <one>G-Proteine</one> <two>wirken intern über</two> <three>welches Enzym</three>? Die <one>Adenylat-Cyclase</one>.
+- <one>Chlorophyll</one> <two>absorbiert hauptsächlich</two> welche zwei Lichtwellen-Farben? (1) Rotlicht (2) <one>Blaulicht</one>
+- Nenne <one>ein Motif</one> das phosphoryliertes Tyrosin erkennen kann. A: Die <one>SH2-Domäne</one>.
+- Why is <one>paracrine signaling</one> usually limited to only nearby cells? Because <one>paracrine messenger molecules</one> <two>are inherently unstable</two>, so they are degraded quickly by enzyme.
+- Nenne <one>drei Signale</one> bei der Signaltransduktion in vielzelligen Organismen. A: (1) Wachstumsfaktoren (2) Neurotransmitter (3) <one>Hormone</one>
+- <one>PTEN</one> <two>regulates PI3K signaling</two>, by dephosphorylating ... ? <one>PTEN</one> dephosphorylates the lipid signaling intermediate called <one>PIP3</one>.
+- Der <one>Transkriptionsfaktor</one> <two>NF-κB</two> wurde in welchem Jahr entdeckt? <one>1986</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/NF-%CE%BAB
+- Die <one>G-Protein-gekoppelten Rezeptoren</one> besitzten n Transmembranhelices (TM-Helices)? <one>Sieben</one>.
+- Nenne ein spezifisches Beispiel für "bidirektionales signalisieren". A: <one>Integrine</one>.
+- In der Signaltransduktion: <one>wie</one> unterscheiden sich <two>hydrophile Liganden</two> von <two>lipophilen Liganden</two> bei der Signalweiterleitung? (1) Die "hydrophilen Liganden" wirken über "Membranrezeptoren". (2) Die "lipophilen Liganden"  wirken über "intrazelluläre Rezeptorproteine.
+- Allgemein formuliert: was besitzen "enzymgekoppelte Rezeptoren" auf ihrer cytosolischen Seite? Ein <one>katalytisches Zentrum</one>.
+- Name <one>an intercellular signaling molecule</one> that starts with the letter "p". A: <one>Prostaglandine</one>.
+- The <one>physical basis for lasers is ... </one>? <one>STED</one>: <two>Stimulated Emission Depletion</two>.
+- <one>Dictyostelium discoideum</one> makes use of cAMP, in order to aggregate. The initial stimulus needed to start aggregation is ... ? <one>starvation</one>.
+- The <one>GPCRs</one> (<two>G-protein-coupled receptors</two>) <three>typically have how many different subunits</three>? <one>Three</one>.
+- <one>STED lasers</one> typically have which two laser types? (1) excitation laser (2) depletion laser
+- The <one>Hippo pathway</one> is involved in ... ? <one>cell contact inhibition</one>.
+- Some plants contain proteins containing LOV-domains. What is LOV an abbreviation for? Light, oxygen, voltage.
+- Do <one>GPCRs</one> contain a binding site? <one>Yes</one>, on their extracellular side.
+- Diffundiert <one>Inositoltriphosphat</one> zum ER? <one>Ja</one>.
+- Bindet die <one>Adenylatcyclase</one> an die <two>cAMP-abhängige Proteinkinase A</two>? <one>Nein</one>.
+- Vermitteln <one>G-Protein-gekoppelte Rezeptoren</one> ihr Signal über Rezeptorphosphorylierung? <one>Nein</one>.
+- Nenne <one>zwei Stufen</one> die auf aktiviertes Ras folgen. A: (1) Raf (2) <one>Map-Kinase</one>
+- Ist ein <one>Maser</one> <two>ein Laser</two>? <one>Ja</one>.
+- Can <one>nucleic acids</one> be induced via "laser UV irradiation"? <one>Yes</one>.
+- <one>Fas</one> ist ein Membran-Rezptor; <two>FasL</two> ist sein Ligand. Was passiert wenn <two>FasL</two> an <one>Fas</one> bindet? In dieser Zelle wird hierdurch die <one>Apoptose ausgelöst</one>.
+- <one>Wann</one> entdeckte Einstein das Prinzip der "Lichtverstärkung"? <one>1916</one>.
+- <one>Kinases</one> <two>take the P-group where from</two>? From <one>ATP</one>.
+- <one>Tyrosinkinasen</one> spielen wo eine wichtige Rolle, in bezug auf "Signaltransduktion"? Im <one>JAK-STAT-Signalweg</one>.
+- <one>G-Proteine</one> <two>besitzen meistens wieviele Untereinheiten</two>? <one>Drei</one> (<one>3</one>). Es sind daher meistens <two>heterotrimere Proteine</two>.
+- Nenne <one>drei Beispiele</one> für <two>second messengers</two>. A: (1) cAMP ("cyclic AMP") (2) IP3 ("Inositoltriphosphat") (3) <one>Ca 2+</one> (<two>Calciumionen</two>)
+- Können <one>alle drei Aggregatzustände</one> als Lasermedium dienen? <one>Ja</one>.
+- <one>Welchen allgemeinen Effekt</one> hat ein <two>GEF</two> (guanine nucleotide exchange factor), in Bezug auf die Signaltransduktion? GEF-Proteine können den <one>Zyklus monomerer G-Proteine beschleunigen</one>.
+- Im <one>Wnt-Signalweg</one> wird welches wichtige Protein abgebaut? <one>β-Catenin</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Catenin_beta-1
+- Does <one>Protein kinase A</one>-activity (<one>PKA</one>) <two>depend on cAMP</two>? <one>Yes</one>. https://en.wikipedia.org/wiki/Protein_kinase_A
+- Nenne die duale Rolle eines <one>second messengers</one>. A: (1) Umwandlung von extrazellulären in intrazelluläre Signale. (2) Verstärkung und Modulation der Signalwirkung der externen Signale.
+- <one>Der erste Laser</one> - <two>ein Rubinlaser</two> - wurde von Theodore Maiman in welchem Jahre festiggestellt? Im Jahre <one>1960</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Laser#Geschichte
+- The <one>proteins</one> that are part of signal transduction pathways, inside of the cell, after the intracellular signaling proteins, are called ... ? <one>Effector proteins</one>.
+- <one>When</one> was the first working Maser built? <one>1954</one>.
+- <one>Signaltransduktion</one> kann durch Proteolyse beeinflusst werden? Ja - bestimmte Proteine können gezielt abgebaut werden.
+- Earliest MEDLINE entry for <one>signal transduction</one> dates back to what year ...? <one>1972</one>.
+- <one>JAKs</one> (<one>Janus-Kinases</one>) <two>phosphorylieren typischerweise welche Proteine</two>? <one>STAT-Proteine</one>.
+- <one>Welcher Lasertyp</one> eignet sich aufgrund seines <two>sehr hohen Wirkungsgrad</two> zum optischen Pumpen <b>anderer</b> Laser? Der <one>Diodenlaser</one>.
+- Der <one>TGF-Signalweg</one> ist, zum Beispiel, wobei involviert? In der <one>Differenzierung von Zellen</one>.
+- What is the central role of "signaling enzymes"? To <one>relay information</one>.
+- Was ist <one>Lichtkoagulation</one>? Dies ist <one>Gerinnung durch einen Laser</one>.
+- <one>RanGAP1</one> is <two>an abbreviation for ... </two>? A: <one>Ran GTPase-Activating Protein 1</one>. URL: https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=RANGAP1
+- <one>Membranständige Rezeptoren</one> wirken über welche 3 verschiedene Wege? (1) Liganden gesteuerte Ionenkanäle (2) G-Proteine (3) <one>Kinasen</one>
+- In eukaryotes: are phosphorylations at tyrosine as common as phosphorylation on threonine? No. Phosphoryaltion on serine and threonine accounts for a total of 99%, so tyrosine phosphorylations are fairly rare.
+- Was heisst <one>Map Kinase</one>? <one>Mitogen-activated protein kinase</one>.
+- Was heisst jeweils <one>PKA-R</one> und PKA-C? R ... regulative, c ... catalytic.
+- Der wichtigste Effektor von G-Proteinen ist … ? Die <one>Adenylatzyklase</one>, die den intrazellulären cAMP Level ansteigen lässt.
+- <one>Wo</one> vor allem wird der CO2-Laser eingesetzt? Vor allem in der Industrie.
+- Ist <one>ATP</one> ein sekundärer messenger? <one>Nein</one>.
+- <one>Which enzyme</one> makes the autoinducer AHL (Acyl homoserin lactone)? <one>AHL-Synthase</one>.
+- Finden wir in G-Protein-gekoppelten Rezeptoren <one>Disulfidbrücken</one> auf der extrazellulären Seite? Meistens ja.
+- Korrektur von Sehfehlern des menschlichen Augese kann erfolgen durch ... ? <one>Laserablation der Hornhaut</one> - dem <two>LASIK-Verfahren</two>.
+- In der <one>Signaltransduktion</one>, bei einem "Informations-Wechsel" über on/off, wie könnten wir das noch nennen, molekularbiologisch betrachtet? <one>Konformationsänderungen</one>.
+- Give another name for <one>endocrine messengers</one>. A: <one>Hormones</one>.
+- Cells can only respond to a particular extracellular message if ... ? If they express a receptor that specifically recognizes and binds that messenger molecule.
+- The molecule that binds to a cellular receptor is, in general, called ... ? A <one>ligand</one>.
+- Regardless of the nature of the signal, the target cell responds by means of ... ? A <one>receptor</one>.
+- <one>Receptors</one> employed by a cell in signal transduction are typically ... ? <one>Transmembrane proteins</one>.
+- Reception of the signals to a cell depend on ... which proteins in general? On <one>receptor proteins</one>. These are usually at the cell surface.
+- The human genome contains about n different genes that encode receptor proteins relevant in signal transduction? About <one>1500 different genes</one>.
+- A <one>GPCR</one> (G-protein-coupled receptor) contains seven transmembrane helices, and also ... ? An extracellular side for <one>ligand binding</one>.
+- Um eine höhere Speicherdichte auf CD/DVDs zu erreichen, mit Hilfe eines Lasersystems, muss man generell was verändern? Man muss <one>kürzere Laserwellenlängen</one> verwenden.
+- <one>Lichtleiter</one>, wie bei Glasfaserkabeln, haben welche zwei wesentliche Anforderungen zu erfüllen? (1) Das eingekoppelte Licht darf nicht aus der Faser austreten. (2) Die Verluste durch Absorption und Streuung in dem Fasermaterial müssen möglichst gering sein.
+- Give <one>three different examples for small signaling molecules</one>. A: (1) <one>cAMP</one> (2) <one>cGMP</one> (3) <one>Ca²⁺</one>
+- Das ...-Verfahren (ein Laser-Verfahren) kommt zum Einsatz bei der Umweltanalyse. A: Das <one>LIDAR-Verfahren</one>.
+- In <one>Diskotheken</one> kommen vor allem welche Laser zum Einsatz? Die <one>Argonlaser</one>.
+- Welcher Lasertyp führte zur Entstehung der DVD und der „blue ray disc“? Der <one>Diodenlaser</one>.
+- Die am besten bekannte Eigenschaft von Laserstrahlung ist ... ? <one>Kohärenz</one>. 
+- Der am häufigsten angewendete Festköprerlaser ist der Nd:YAG-Laser, im Vier-Niveau-System. Bei welcher Wellenlänge, in nm, arbeitet dieser Laser? Bei <one>1064nm</one>.
+- Der erste eingeführte Gaslaser war ein ... -Laser. A: Ein <one>He-Ne-Laser</one>.
+- Der gebräuchlichste Halbleiterlaser ist ... ? der <one>Injektionslaser</one>.
+- Bei den <one>Excimer-Laser</one> kommt üblicherweise ein Gasgemisch aus Edelgasen und Halogeniden zum Einsatz. Welches Puffergas wird hier noch eingesetzt? <one>Helium</one>.
+- Die notwendige Pumpenergie für Lasersysteme kann auch durch einen elektrischen Stromfluss erreicht werden. Bei welchem Lasersystem ist dies der Fall? Bei den <one>dotierten Halbleiterlasern</one>.
+- Bei Lasersystemen: sind <one>Verluste über die Resonatorspiegel</one> vermeidbar? Nein.
+- Die Wellenlänge des Rubinlasers liegt bei ... ? <one>694 nm</one>.
+- Warum hat der <one>Faserlaser</one> diesen Namen? Da er eine <one>Glasfaser</one> besitzt.
+- Der erste Gaslaser wurde im Jahre ... eingeführt. A: <one>1961</one>.
+- Ein Resonator wie der <one>Fabry-Perot-Resonator</one>, der bei Laser zum Einsatz kommt, besteht typischerweise aus wievielen Spiegeln? <one>Zwei</one>.
+- Der <one>Prototyp aller Laserresonatoren</one> ist ... ? Der <one>Fabry-Perot-Resonator</one>.
+- Erreichen Laser <one>Petawatt-Leistungen</one>? <one>Ja</one>.
+- Kann man mit <one>Lasern</one> <two>Temperaturen wie bei der Kernfusion auf der Sonne</two> erreichen? Ja, prinzipiell ist dies möglich.
+- Nenne einen Laser mit sehr langer Lebensdauer. A: Der <one>Diodenlaser</one>.
+- Zu den am meisten verbreiteten Lasersystemen gehören ... ? <one>Strichcode-Lesegeräte</one>, wie zum Beispiel in einem Supermarkt an der Kassa.
+- Woher stammt meistens das <one>P</one> für die <two>Proteinkinasen</two>? A: Meistens aus <one>ATP</one>.
+- Benötigt der <one>JAK-STAT Signalweg</one> einen <two>second messenger</two>? Nein - der JAK-STAT Signalweg stellt eine direkte Route in den Zellkern dar.
+- Nenne ein Toxin, das die G-alpha Untereinheit von G-Proteinen modifiziert. A: Das Choleratoxin modifiziert die G-Alpha Untereinheit von G-Proteinen in Darmepithelzellen.
+- <one>Which specific complex</one> catalyzes the ubiquitination of proteins destined for 26S proteasomal degradation? The <one>SCF complex</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/SCF_complex
+- Das <one>Erkennungssignal für das 26S-Proteasom</one> ist ... ? Eine <one>Ubiquitinkette</one> am Protein.
+- Mutationen in Genen des JAK/STAT-Signalwegs finden sich häufig in Patienten mit L...? <one>Leukämien</one>.
+- <one>STAT-Proteine</one> besitzen was für eine Domäne? STAT-Proteine besitzen eine <one>SH2-Domäne</one>.
+- <one>JAKs</one> sind was für Kinasen (typ)? <one>Tyrosinkinasen</one>.
+- Das menschliche Genom hat <one>n Gene für STAT-Proteine</one>? <one>7</one>. STAT1 bis STAT7.
+- Der Transkriptionsfaktor <one>NF-κB</one> hat welche besondere Domäne? Eine <one>Rel-Homologiedomäne</one>; es ist auch ein <one>Rel-Protein</one>.
+- <three>Welches Cytokin</three> aktiviert insbesondere den Transkriptionsfaktor <one>NF-κB</one>? <one>Interleukin-1</one> (<two>IL-1</two>).
+- In der Genexpression respektive bei der Signaltransduktion gibt es die <one>R-SMADs</one>. Wieso der Buchstabe R hier? R steht für <one>regulated SMADs</one>.
+- In plants: typically n% of the incident solar energy is used for photosynthesis? Only around 40%.
+- Can <one>light</one> activate CREB in animals? Yes, for example in Drosophila. URL: https://www.the-scientist.com/the-literature/lasting-memories-67441?utm_content=129380840&utm_medium=social&utm_source=facebook&hss_channel=fbp-212009668822281&fbclid=IwAR1Efxqp_PgGkBHdxTa1--Jwj-4zrU-XVeDqk3moLgyQEFYLbEmEUkTlHOY
+- The <one>premier erythroid cytokine</one> in the human body is ... ? <one>Erythropoietin</one>, aka <two>Epo</two>.
+- Nenne die zwei <one>am verbreitesten sekundäre Botenstoffe</one>. A: (1) <one>cAMP</one> (2) <one>Ca2+</one>
+- Im menschlichen Genom: <one>wieviel % der Gene</one> kodieren für <two>Proteinkinasen</two>? <one>2%</one>.
+- <one>Excimerlaser</one> werden, zum Beispiel, wo eingesetzt? Bei <one>LASIK</one>.
+- Was heisst <one>TGF</one>? <one>Transforming Growth Factor</one>.
+- Bei einem <one>Laser</one>: welche Funktion hat ein <two>Kollimator</two>? Ein Kollimator dient der Erzeugung von Licht mit annähernd parallelem Strahlengang aus einer divergenten Quelle.
+- Der <one>Photosensibilisator</one> hat die Fähigkeit, die Energie des Lichtes aufzunehmen und an ...  weiterzugeben. A: An <one>Sauerstoffmoleküle</one>.
+- Most of the receptors in signal transduction (in cells) are ... ? <one>Kinases</one>.
+- Was sind sogenannte <one>Excimerlaser</one>? <one>Excimerlaser</one> sind <two>Gaslaser</two>, die elektromagnetische Strahlung im ultravioletten Wellenlängenbereich erzeugen können.
+- <one>SOS</one>, son of sevenless, displaces ... from Ras. A: <one>GDP</one>.
+- Wieviele verschiedene Gene, in etwa, kodieren für GPCRs im humanen Genom? Etwa <one>800</one>.
+- Extrazellulär besitzen viele G-Protein-gekoppelte Rezeptoren welche Struktur? <one>Kohlenhydratseitenketten</one>.
+- Allgemein betrachtet: <one>G-Protein-gekoppelte Rezeptoren</one> steuern welche zwei Hauptroute der Signaltransduktion? (1) ein Weg verändert die itnrazleluäre konzentration von cyclischen nucleotiden wie cAMP oder GMP (2) ein anderer Weg wirkdt über Inosiot-1,4,5-trisphopshat (IP3) und setzt zudem Ca2+ frei
+- Können sich aktivierte G-Proteine selbst abschalten? Ja - sie besitzen eine intrinsische GTP-Hydrolyseaktivität.
+- Das einkommende Signal ist bei den G-Proteinen so gut wie immer was genau? Ein <one>extrazellulärer Ligand</one>.
+- Die <one>α-Untereinheit bei den G-Proteinen</one> kann, im Grundzustand, was genau binden? <one>GDP</one>.
+- <one>G-Proteine</one> bestehen typischerweise aus welchen Untereinheiten? (1) <one>α</one> (2) <one>β</one> (3) <one>γ</one>
+- Das Flagschiff unter den <one>G-Protein-gekoppelten Rezeptoren</one> ist ... ? Der Lichtrezeptor <one>Rhodopsin</one>, der beim Sehvorgang von zentraler Bedeutung ist.
+- The <cadetblue>Hippo pathway</cadetblue> consists of a core kinase cascade in which Hpo phosphorylates the protein kinase called ... ? <one>Warts</one> (Wts).
+- Most of the Hippo pathway components were identified in which organism? In the fruit fly (<one>Drosophila melanogaster</one>).
+- Hippo (Hpo) is important in the Hippo signaling pathway. What type of protein is it? It is a <one>protein kinase</one>.
+- The Hippo signaling pathway controls what? It <one>controls organ size in animals</one>.
+- Eine "Adenylylcyclase" katalysiert die Bildung von cAMP aus ATP. Wieviele cAMP Moleküle werden pro Sekunde maximal erzeugt? Etwa <one>100</one>.
+- Wellenlängenbereich von sichtbarem Licht? Zwischen etwa <one>400 nm</one> und <one>700 nm</one>.
+- Wenn Ras mutiert ist, insbesondere in der GTP-Bindungstasche, ist welche Signaltransduktionskaskade hyperaktiviert? Die <one>MAPK-Signalkaskade</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/MAP-Kinase-Weg
+- Das <one>Ras-Protein</one> aktiviert welche drei <one>Kinasen</one>? (1) Raf (2) MEK (3) MAPK
+- Das <one>Ras-Protein</one> ist im welchen Signalweg aktiv? Im <one>MAPK-Signalweg</one>.
+- Aus Sicht der Signaltransduktion: Proteine wie die G-Proteine interagieren mit weiteren Proteinen. Wie nennen wir diese Proteine allgemein? <one>Effektorproteine</one>.
+- Rezeptoren der Cytoplasmamembran sind eigentlich immer ... ? <one>Transmembranproteine</one>.
+- Für die Signalübertragung in/an Zellen ist was extrem wichtig? <one>Rezeptoren</one> in der Zellmembran. 
+- Was ist das Input-Molekül der Adenylatzyklase? ATP ("Adenosintriphosphat").
+- Cytokines typically relay information to which protein? A "JAK protein".
+- Signalwege sind "... Netzwerke". A: Es sind "hierarchische Netzwerke".
+- In signaling, what does the abbreviation "SAPK" stand for? "Stress-activated protein kinases".
+- Rather than call it a "pathway" or a "signal pathway", what other term could we use? "Information network".
+- The "EGF hormone" can bind to the EGF receptor. From a "cell biologist's view", what is the only function of the hormone? The hormone stabilizes "receptor dimerization".
+- Gib ein Beispiel für einen "autokrinen Modus" im Körper. A: Die Lymphocyten, die durch Antigenkontakt stimuliert wurden, und daraufhin Cytokin herstellen, welche sie wiederum auch selbst beeinflussen.
+- Nenne zwei allgemeine Beispiee für "nachgeschaltene Effektoren" einer Zelle - also nach den Rezeptoren. A: (1) "Enzyme" (2) "Transkriptionsfaktoren"
+- When DAG is cleaved, what substance is created? Arachidonic acid. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Arachidonic_acid#The_synthesis_and_cascade_in_humans
+- A. W. für "kleine "und "große" G-Proteine? monomere G-Proteine; heteromere G-Proteine.
+- Die drei zentralen Komponenten von "Signaltransduktionskaskaden" sind ... ? (1) Liganden (2) Rezeptoren (3) Effektoren
+- Was meinen wir mit einem <one>bivalenten Liganden</one>? Dies ist ein <one>monomerer Ligand</one>, der an 2 Rezeptormolekülen gleichzeitig binden kann.
+- Nenne 1 "downstream-Effektor von Phospholipase", der mit C beginnt. A: <one>Calmodulin</one>.
+- What can we say about the "excited state" during light absorption, in general? The excited state is "generally unstable".
+- Wie wird die Direktionalität der Signalkaskade bei gekoppelten Rezeptoren garantiert? Durch die hohe Substratspezifizität der beteilgiten Kinasen.
+- Nenne eine allgemeine, charakteristische Eigenschaft der meisten sekundären Botenstoffe. A: Sie sind meistens "chemisch labil".
+- Bei MALDI, was für ein Laser wird typischerweise verwendet? Ein UV Laser.
+- Licht das auf Materie trifft hat welche 3 Möglichkeiten? (1) es wird reflektiert (2) es wird transmittiert (3) es wird absorbiert
+- The retinoblastoma protein can halt the cell cycle in ...? G1. 
+- Name one big difference between RNA polymerase and polynucleotide phosphorylase, in-vitroa. A: Polynucleotide phosphorylase does not require a DNA template.
+- What is the normal role of "Polynucleotide Phosphorylase" in the cell? To degrade RNA.
+- How do we denote the "ground state"? E zero (E0).
+- Wann wurde ein LASER erstmals realisiert? 1969.
+- Aus welchen 3 Bestandteilen besteht ein Laser konzeptionell? (1) Aktives Medium (Lasermedium) (2) Pumpe (3) Resonator (Modenselektion)
+- Nenne 1 Vorteil der polynucleotide phosphorylase gegenüber der RNA-Polymerase. A: The polynucleotide phosphorylase does not require a template.
+- Was ist der "MASER"? Ein Laser im Mikrowellenbereich.
+- Was heißt <one>LASER</one>, als Abkürzung? <one>Light Amplification by Stimulated Emission of Radiation</one>.
+- In der Signaltransduktion gibt es "Fak". Wofür steht diese Abkürzung? "focal adhesion kinase" 
+- Retinal in bacteriorhodopin assumes which configuration by default? The trans configuration.
+- Welches Enzym konvertiert cAMP in AMP? Die Phosphodiesterase.
+- Wie wirkt das Choleratoxin? Es modifiziert ein G-Protein kovalent.
+- Most famous example for a RTK (Receptor tyrosine kinase)? The insulin receptor.
+- A. W. für "Signal transduction"? cell signaling.
+- Wann wurde der Rubin-Laser erfunden? Im Jahre <one>1960</one>.
+- Why the name "cytokinin"? Because it makes cells divide.
+- Was heisst "R-SMADs"? receptor-regulated SMADs. 
+- Wo liegt der R-Punkt einer Zelle? Zwischen G1 und S-Phase.
+- Wann wurde das Enzym Polynucleotid-phosphorylase entdeckt? 1955.
+- Wie ist das G-Protein p21-Ras an die Membran verankert? Mittels eines Farnesylrest (= "Lipidanker").
+- Was macht ein Amplifier? Nimmt ein Input-Signal und verstärkt es.
+- Nenne einen Vorteil der Mehrstufigkeit bei Signaltransduktion. A: 1 Signal kann im hohen Masse verstärkt werden.
+- Welche 3 Stadien kennt die Signaltransduktion allgemein? (1) Erkennung (2) Übertragung (3) Antwort
+- In der Zelle, wo vor allem spielt "tyrosine phosphorylation" eine Rolle? In der Signaltransduktion.
+- Was sind die 3 allgemeinen Schritte in der Signalverarbeitung? (1) Aufnahme (2) Übertragung (3) Antwort
+- Unterscheide autokrin, parakrin und endokrin. A: Autokrin wird von der Zelle produziert und wirkt auf die selbe Zelle ein, parakrine Signalmoleküle diffundieren zu benachbarten Zellen, endokrine Signalstoffe werden hingegen weiträumig über das Blutsystem verteilt.
+- What is an "orphan receptor"? A receptor whose chemical ligand remains to be determined.
+- Welche Zellen können "stumm" sein? Zellen ohne Rezeptor.
+- A. W. für "Signalverstärkung"? Amplifizierung.
+- In signal transductions, regulatory systems are tightly coupled to ...? Sensor systems.
+- Was ist "Chemilumineszenz"? Lichtemission wird durch eine chemische Reaktion verursacht, z. Bsp. die Bindung von Ca2+-Ionen.
+- Beim <one>MAP-Kinase Pathway</one>: erfolgt die Phosphorylierung von <two>MAP3K→MAP2K→MAPK</two> oder von <two>MAPK→MAP2K→MAP3K</two>? Von <one>MAP3K→MAP2K→MAPK</one>. []
+- Besitzt ein <one>Laser</one> eine <two>ausgeprägte Kohärenz</two>? <one>Ja</one>. []
+- Ist <one>ATP</one> ein <two>sekundärer Messenger</two>? <one>Nein</one>. []
+- <one>Was</one> signalisiert ein <two>hoher AMP-Spiegel in einer Zelle</two>? Das ein <one>Energiemangel</one> <two>vorherrscht</two>. []
+- Is the <one>Hippo signaling pathway</one> <two>conserved</two>? <one>Yes</one> - it appears to be <two>highly conserved</two>. []
+- Sind <one>STAT-Proteine</one> als <two>Monomere</two> aktiv? <one>Nein</one> - <two>STAT-Proteine</two> funktionieren als <three>Dimer</three>. []
+- Der Schmetterling verwandelt sich von Raupe zu Puppe zu adultem Tier. Wie wird dies allgemein gesteuert? Durch interne, chemische Signale.

data/lib/studium/exam_topics/sozialbiologie

@@ -0,0 +1,17 @@
+# =========================================================================== #
+# === Sozialbiologie
+#
+# Dies inkludiert auch technische Ansätze, i. e. wie Technik das
+# Leben der Menschen verbessert und vereinfacht.
+# =========================================================================== #
+
+- Nenne ein Beispiel für einen technischen Ansatz zur Verbesserung der Pflegearbeiter. A: Der Einsatz von Robotersysteme, zum Beispiel beim Putzen von Gebäuden und Gerätschaften.
+- Universitätsgelehrte entstammten früher häufig ... ? der <one>Aristokratie</one>.
+- Wenn wir Sammeln und Jagen vergleichen: welchen Vorteil mag Sammeln bieten? Beim Sammeln kam der Ertrag eher konstant; bei der Jagd hingegen kam der Ertrag in Wellen.
+- Wie kann eine menschliche Gesellschaft gegen Inzest vorgehen, also ein Inzesttabu durchsetzen? Zum Beispiel über <one>Heiratsregeln</one>.
+- Ein moderner Anthropologie könnte was analysieren, auf menschliches Verhalten in der Vergangenheit Rückschlüsse zu ziehen? Müll könnte analysiert werden.
+- Das Gefangenendilemma beantwortet eigentlich welche Frage? <one>„Warum helfen wir anderen Menschen?“</one>
+- Nenne <one>ein Beispiel</one> für einen genetischen Sexualdimorphismus bei Mann und Frau. A: Das chromosomale Geschlecht: XX (Frau) oder XY (Mann).
+- Haben Frauen eher mehr enge Freunde als Männer? <one>Ja</one>.
+- Laut der Hypothese von Robert Trivers treffen bei Menschen nur wer die Partnerwahl? Nur Frauen.
+- <one>John Bolby</one> described the special mother child relationship as ... ? <one>attachment</one>.

data/lib/studium/exam_topics/soziologie

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+# === Soziologie
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+- Der Mensch kann als Bedrohung der Natur wahrgenommen werden. Nenne hierfür ein Beispiel. A: Die <one>Ausrottung von Tierarten</one>.

data/lib/studium/exam_topics/splicing_exons_and_introns

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+# === Splicing, exons and introns
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+# This file will collect knowledge about splicing, exons and introns
+# in different organisms.
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+- Was passiert beim <one>trans-Spleißen</one>? Beim trans-Spleißen werden Exons aus mehreren verschiedenen Prä-mRNA-Molekülen miteinander verknüpft.
+- The <one>branch-point sequence for splicing</one> in the human genome is a 7-nucleotide sequence with a curious "name". What is it? <one>YNYURAY</one>. The <two>A</two> is <three>the branch point</three>.
+- <one>How</one> does <two>mRNA-Splicing</two> differ from <three>tRNA-Splicing</three>? (1) <one>tRNA splicing</one> does not generate a lariat (2) <one>tRNA splicing</one> uses a cut-and-paste mechanism catalyzed by proteins
+- What does the <one>introns-late</one> concept posit, essentially? That introns have evolved from the <one>invasion of self-splicing group II introns</one>.
+- <one>Splicing</one> is a multi-step process. It involves more than n proteins. A: More than <one>80 proteins</one>.
+- Das <one>Spliceosome</one> <two>führt welche chemische Reaktion durch</two>? <one>Umesterungsreaktionen</one>.
+- <one>How many snRNPs</one> are known to exist in humans? <one>5</one>.
+- <one>n% of human genes</one> are alternatively spliced? <one>7%</one>.
+- The most important protein family for splicing is the <one>SR protein family</one>. This protein family has a characteristic domain, the so-called <one>RS domain</one>, which is rich in which two aminoacids? (1) Arginine (2) <one>Serine</one>
+- Give two specific examples how a point mutation may alter mRNA splicing. A: (1) A C, in a GC, may be changed into a T. Thus, a new 5' GC splice site is created, leading to the loss of the exon (and nucleotides before the old GT site). (2) A GT can be changed into a TT, thus a G->T transition occurs, which will eliminate a 5' splice site, causing the intron to be retained rather than spliced out.
+- Das <one>Spliceosome</one> <two>erkennt Exon-Intron Grenzen</two> mit Hilfe sogenannter ... ? <one>ESEs</one>: <two>Exon Splicing Enhancers</two>.
+- Beim <one>autokatalytischen Splicing</one> benötigen wir welche zwei Cofaktoren? (1) <one>Mg2⁺</one> (2) ein <one>Guanosin</one>
+- <one>Why</one> must <two>splicing</two> be correct? So that we can <one>avoid frame shifts</one>.
+- Was ist besonders bemerkenswert - und auch eminent wichtig - beim <one>Splicing-Vorgang</one>? Der Splicing-Vorgang muss sehr präzise ablaufen.
+- Do <one>snRNA transcripts</one> <two>contain introns</two>? <one>No</one>.
+- Is tRNA splicing distinct from splicing of pre-mRNAs? Yes - this is also why it requires a different protein machinery.
+- Sequenzfolge des <one>U12 Introns</one>? <one>AT-AC</one>. The <two>attack intron</two>.
+- Das Bemerkenswerteste am Splicing ist ... ? Dessen <one>Genauigkeit</one>.
+- Warum hat <one>U1</one> oder <one>U2</one> den Buchstaben U? Dies deutet Uracil-reiche Stellen an.
+- Im Zuge von <one>RNA-Editing</one> entsteht aus ApoB-100 die kürzere Form ... ? <one>ApoB-48</one>. Diese kürzere Variante hat auch eine andere Funktion als <two>ApoB-100</two>.
+- Does the <one>NMD</one> (non-sense mediated RNA decay) depend on splicing? Yes. The EJC (exon-junction complex) plays a large role in this regard.
+- Der erste Schritt bei dem <one>Aufbau des Spliceosomes</one> ist ... ? Die Bindung der <one>U1-snRNA</one> an die <two>5'-Spleißstelle</two>.
+- <one>Group I introns</one> tend to have how many hairpins? <one>Nine</one> (<one>9</one>).
+- Name <one>an eukaryotic organism without normal splicing</one>. A: <one>Trypanosomes</one>.
+- In which biological system were <one>Introns</one> discovered? In an <one>Adenovirus</one>, in the year <two>1977</two>. URL: https://www.pnas.org/content/113/4/801
+- Überlappt <one>U1-snRNP</one> mit der <two>Exon-Intron Grenze</two>? Ja.
+- Die Struktur aus <one>prä-mRNA</one>, <one>snRNPs</one> und <one>Proteinen</one> wird (<two>am Spliceosome</two>) oft wie genannt? <one>Komplex A</one>.
+- <one>U2-snRNP</one> benötigt die Hilfe welcher <two>zweier RNA-bindender Proteine</two>? (1) <one>SF1</one> (2) <one>U2AF</one>
+- Die <one>Komponenten des Spliceosomes</one> wurden, historisch betrachtet, zuerst wie entdeckt? Primär über <one>spezielle Hefemutanten</one>.
+- Die <one>U2-snRNP</one>, im Zuge des Aufbaus des Spliceosome, bindet an ... ? Die <one>Verzweigungsstelle im Intron</one> selbst, eben dem Adenin.
+- Die <one>U4-snRNP</one> interagiet mit welch anderer snRNP? <one>U6-snRPN</one>.
+- Andere Bezeichung für Proteine die beim Spleißenn eine Rolle spielen, ohne aber zu den snRNPs dazu zu gehören? <one>Spleißfaktoren</one>.
+- Components of the <one>spliceosome</one> interact with which other cellular component, aside from the mRNA? They interact with the <one>CTD</one>.
+- Which person was a pioneer in regatds to the discovery of the splicing machinery? <one>Joan Steitz</one>.
+- When was splicing discovered? <one>1977</one>.
+- Inkludiert die <one>prä-mRNA</one> Exons und Introns? Ja.
+- Which RNA is very important for the act of splicing in a cell? The <one>snRNA</one>.
+- The <cadetblue>major spliceosome</cadetblue> contains which U-snRNAs? <one>U1/U2/U4/U5/U6 snRNAs</one>.
+- Welchen Vorteil hat "Splicing"? Wir können mehrere, verschiedene Proteine erstellen.
+- Nenne ein markantes Kennzeichen der U snRNAs fürs Splicing. A: Sie sind "Uracil-reich".
+- Do introns relate to gene expression in any way? Yes: they enable quality control and fine-tuning of gene expression.
+- For <one>group I introns</one>, which nucleotide is required for the catalytic reaction? <one>Guanosine</one>.
+- Wann dürfen wir <cadetblue>exons</cadetblue> skippen? A: Beim <one>alternative splicing</one>.
+- Which intron group is self-splicing? The <one>group I introns</one>.
+- Nenne etwas, das durch <one>RNA-Splicing</one> entsteht. A: Ein <one>Lariat</one>.
+- We have self-splicing introns, Group I and Group II. At the 3' or 2' position, which nucleotide is central in Group I and Group II introns, respectively? (1) Group  I: <one>G</one> (2) Group II: <one>A</one>
+- What happens if we delete the "branch point" found in an Intron? This will <one>prevent splicing</one>.
+- What are "mutually exclusive exons"? One or the other exon is included - but not both.
+- Nenne 5 Wege eine RNA zu splicen! A: (1) normal (2) alternative exons (3) exon-skipped (4) exon-extended (5) intro-retained
+- Das <violet>Titin-Gen</violet> hat wie viele Exons? 178.
+- Do Introns have an "open reading frame"? Usually not.
+- Group II Introns require how many "transesterification steps" in order to be excised? Two.
+- Do Introns improve gene expression? Yes; curiously enough they do.
+- Describe briefly the second step of splicing. A: The 3'-OH of the end of the first exon attacks the phosphodiester bond linking the intron to the second exon (the "3'-splice site").
+- In splicing of nuclear mRNA precursor, what is the first step seen mechanistically? The 2'-hydroxyl group of the Adenosine nucleotide at the branchpoint, attacks the phosphodiester bond between the exon, and the GU start part of the intron.
+- Does splicing occur before polyadenylation? No - it occurs <one>after the polyadenylation</one>.
+- Do <one>tRNAs</one> <two>of Archaebacteria</two> <three>contain introns</three>? <one>Yes</one>. []
+- Ist das <one>Spliceosom</one> ein <two>Ribozym</two>? <one>Ja</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Spliceosom []
+- Who or what is performing <one>minor splicing</one>? The <one>minor spliceosome</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Minor_spliceosome []
+- How many "different group of introns" are known? <one>3</one>.

data/lib/studium/exam_topics/sport_und_sportverletzungen

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+# === Sport und Sportverletzungen
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+- <one>Knieverletzungen</one> sind im Sport sehr häufig, vor allem in welcher Sportart? Im <one>Fußball</one>.
+- Ist <one>Nozizeption</one> äquivalent zu Schmerz? Nein. Nozizeption ist noch kein Schmerz, sondern eine Warnung vor einem möglichen Schmerz.