studium 0.10.1

data/lib/studium/exam_topics/phytochemie

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+# =========================================================================== #
+# === PHYTOCHEMIE
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+# Phytochemie Tag. Phyto tag. Phyt tag.
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+- Welches <one>Gift</one> produziert die "castor-oil plant"? <one>Ricin</one>.
+- Welche 2 Dinge kann RUBISCO? CO₂ übertragen und O übertragen.
+- Warum speichert die Pflanze Stärke? Die Polymerisierung von Glucose in Stärke erfolgt da sie osmotisch weniger aktiv ist als Glucose, die akkumulieren würde.
+- Nenne zwei photosynthetische Zellen bei C4-Pflanzen. A: Mesophylzellen und Bündelscheidezellen.
+- Temperaturoptima C3 und C4 Pflanzen? C3 bei 15-20°C, C4 Pflanzen wie Mais bei 30-40°C.
+- Nenne 3 Produkte der Lichtreaktion. A: (1) ATP, (2) NADPH, (3) O2.
+- Nenne 3 wichtige Bedeutungen der Flavonoide für den Menschen. A: (1) Antioxidative Wirkung (2) Wirkung auf verschiedene Enzymsysteme (3) antikarzinogene Eigenschaften
+- Welcher Zucker entsteht im Calvin-Zyklus? G3P (Glycerinaldehyd-3-Phosphat).
+- Nenne 2 Vertreter des CAM Weg. A: Kakteen, Ananas.
+- Flavonoide gehören zu den? Pflanzlichen Phenolen.
+- Wie wirkt Ricin? Es inaktiviert die Ribosome.
+- Bei C3-Pflanzen, was ist das erste Produkt der CO₂-Fixierung? 3-Phosphoglycerate.
+- In Pflanzen, woran ist der C4-Dicarbonsäureweg gekoppelt? An einen besonderen anatomischen Aufbau des Blattes.
+- Definiere Photophosphorylierung. A: Bindung einer Phosphatgruppe an ADP in der Lichtreaktion.
+- Wie ist Cellulose verknüpft? 1,4-Verknüpfung von Beta-Glucosemonomeren.
+- Zwei wichtige C4 Pflanzen nennen. A: Mais und Zuckerrohr.
+- Warum der Name C4 Pflanze? Da sie eine andere Art der Kohlenstoff-Fixierung vorgeschaltet haben, den C4-Dicarbonsäureweg.
+- RuBP (Ribulose-1,5-bisphosphat) hat n C? 5.
+- Wann läuft der Calvin-Zyklus in Pflanzen ab? Bei Tageslicht.
+- Temperaturoptima von C3 und C4 Pflanzen? C3 bei 15-20° C und C4 bei 30-40° C.
+- Was sind Xerophyten? Pflanzen die gut bei Trockenheit leben können.
+- Welche zwei Aktivitäten hat RUBISCO? Die CO₂ Übertragung und die O Übertragung.
+- Erster Schritt des Calvin-Zyklus? Einbau des Kohlenstoffes.
+- Was lässt sich allgemein zum ATP und NADPH-Verbrauch im Calvin-Zyklus festhalten? Er verbraucht mehr ATP als NADPH.
+- In der Photosynthese werden Protonen und Elektronen von Wasser auf ... übertragen? NADP+.
+- Nenne eine wichtige Funktion der Carotinoide. A: Lichtschutz. Sie absorbieren und verteilen überschüssige Lichtenergie.
+- Beschreibe die Porphyrinstruktur des Chlorophylls. A: Hydrophobe Phytolgruppe, den Schwanz der das Moelkül verankert, und den lichtabsorbierenden Kopf, der Porphyrinring.

data/lib/studium/exam_topics/plant_biotechnology

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+# =========================================================================== #
+# === PLANT_BIOTECHNOLOGY
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+# Plant biotechnology, Plant Biotech tag. Plant Biotechnology tag.
+# Pflanzenbiotechnologie tag.
+#
+# Auch "plant tissue culture".
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+- Wir erzeugen mit Röntgenstrahlen neue Merkmale in Pflanzen - aber nur wann ist das auch wirklich von Nutzen? Wenn <one>diese Merkmale auch erblich sind</one>.
+- In Plant Biotechnology, we <one>may have to sterilize seeds</one>. This varies, however had, dependent on which 2 aspects? (1) surface structure of the seeds (2) year of harvest
+- What is the characteristic feature of the <one>FlavrSavr tomatoes</one>? <one>Slow softening</one>.
+- Welchen Effekt hat <one>Abscisinsäure</one> auf eine Pflanze? Abscisinsäure bewirkt, das die Pflanze ihre <one>Stomata schliesst</one>.
+- <one>Scopolamin</one> wird von welcher Pflanze produziert? <one>Duboisia</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Duboisia
+- A. W. für <one>gm-Pflanzen dritter Generation</one>? <one>Plant factories</one>.
+- One advantage of <one>semidwarf plant varieties</one>? They are <one>more resistant to damage caused by rain and wind</one>.
+- Give an example for an enzyme or a group of enzyme that can be used in <one>lignin degradation</one>. A: <one>Laccases</one>.
+- If you have to modify the natural T-DNA, and if you could <one>only add 3 new genes</one>, which ones may you choose? (1) antibiotic resistance gene (2) gene of interest (3) reporter gene
+- In Plant Biotechnology, the <one>FlavrSavr tomato</one> was developed. What was its "characteristic trait" that was marketed the most? Its ability of <one>slow softening</one>.
+- In plant biotechnology: name a solid advantage of <one>the floral dip method</one>, aside from its simplicity? It is <one>a very fast method</one>.
+- Ripe <one>tomatoes</one> normally produce which enzyme that can digest pectin? <one>Polygalacturonase</one> (<royalblue>PG</royalblue>). URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Polygalacturonase
+- In der pflanzlichen Biotechnologie mögen wir <one>Histogenese</one> verwenden um ... ? Um <royalblue>vaskuläre Elemente</royalblue> zu erstellen, also "Xylem" und "Phloen".
+- The <one>van Montague lab</one> reported the first transgenic plant, tobacco. In what year? <one>1984</one>.
+- Im welchen Jahr wurden in den USA erstmals gentechnisch veränderte Pflanzen ausgesät? Im Jahre <tomato>1996</tomato>.
+- Kasugamycin is an <tomato>aminoglycoside</tomato> that is also used in agriculture. Why? It is a <one>agricultural fungicide</one>.
+- Bei der Pflanzenvermehrung, der "direkten Morphogenese" versus der "indirekten Morphogenese" - haben wir jeweils ein "Explantat". Bei einem der beiden sehen wir eine Kallusbildung. Wo genau? Bei der "indirekten Morphogenese" sehen wir einen Kallus.
+- In "<u>plant biotechnology</u>", if we add more cytokinin than auxin into a plant cell culture, what may we wish to achieve with this? We may wish to "induce shoots".
+- Im "<u>Ti-Plasmid</u>", zwischen der "LB-Region" und der "RB-Region" liegen ... welche Gene? Die "onc-Gene".
+- Warum ist der "Chmielewski-Paradeiser" für die pflanzliche Biotechnologie interessant? Dieser Paradeiser hat die Eigenschaft viel an Zucker einzulagern.
+- Phosphat-Zugabe für Pflanzen in welcher Form? "KH2PO4".
+- What was the "first genetically modified plant"? "Tobacco".
+- Warum ist es schwierig Gene zu finden mit einer erhöhten Resistenz gegenüber Krankheiten, in der Pflanzenbiotechnologie? Da diese merkmale oft von mehreren Genen (polygen) gesteuert/beeinflusst werden.
+- Was sind "transplastomische Pflanzen"? Diese besitzen "Fremd-DNA" in ihrer "Plastiden-DNA".
+- Wie bezeichnen wir von Pflanzenarten isolierte Zellen, die als Suspension in einer flüssigen Nährlösung kultiviert werden? Dies ist eine "Zellsuspensionskultur".
+- Is "agar-agar" physiologically inert? No, not completely.
+- Der Prozess der Übertragung der T-DNA in die Pflanze ähnelt ... ? Der "bakteriellen Konjugation".
+- A. W. für "Caulogenese"? Sprossmorphogenese.
+- Zeatin is what kind of plant protein? It is a "Cytokinin".
+- Was ist ein "Explantat"? Ein Stück lebendes Gewebe, aus einer Pflanze entnommen.
+- Many methods to transfer genes into plant cells require what? The "removal of the plant cell wall", in order to "form protoplasts".
+- Nenne 1 konkreten Vorteil für ein Saatzuchtunternehmen, wenn dieses Genomik "einsetzt". A: Eine erheblich schnellere Sortenentwicklung, im Vergleich zur konventionellen Züchtung.
+- In Biolistics, for plant DNA, which type of tissues do we use? Tissues that have a "good regeneration capacity", such as meristems or embryos.
+- Was meinen wir mit dem Begriff "Explantat"? Dies ist ein Stück lebendes Pflanzengewebe, das entnommen wurde.
+- Vakzinstrategie bei transgenen Pflanzen? Essbare Vakzine. Diese mögen dann vor allem für die dritte Welt wichtig sein.
+- Warum wird "Gelrite" in der pflanzlichen Biotechnologie verwendet? Primär zur Verfestigung.
+- Andere Bezeichnung für "isoliertes Pflanzenmaterial". A: Explantat.
+- Nenne 1 Methode, mit einer chemischen Substanz, wie wir Protoplastenzellen fusionen können. A: Polyethylenglykol. 
+- Shikonin ist was für eine Verbindung? Eine "Naphthochinon-Verbindung".
+- In plant biotechnology, which medium types require a "filter bridge"? Some "liquid medium" require a filter bridge.
+- For Agrobacterium, which border is more important for transferring T-DNA - the right or left border? The right border is indispensable for T-DNA transfer.
+- Was hat "Luther Burbank" in der Pflanzenbiotechnologie erreicht? Er züchtete "weiße Brombeeren".
+- Nenne 1 Vorteil von Pflanzen gegenüber Tieren in der (pflanzlichen) Biotechnologie. A: Pflanzen verfügen, im Verlgiech zu Tieren, über ein besseres, regeneratives Potenzial.
+- Name 1 huge advantage of using plants for protein production, compared to bacteria. A: Plants may be grown in the field at a much lower cost, compared to "transgenic bacteria".
+- Give another term for "oleosins". A: Oiled body proteins. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Oleosin
+- The "35S promoter" originated from which species? It originated from "cauliflower mosaic virus" (CMV). 
+- Give 2 reasons why we may wish to get rid of "marker genes" that were added into a transgenic plant. A: The markergene may be (a) toxic (b) allergenic
+- Die Druckkammer einer "gene gun" ist zumeist womit gefüllt? (1) Helium (2) Stickstoff
+- Bei den gene guns, was ist der Durchmesser der Wolframkügelchen? Etwa 1 Mikrometer (10 ** -6 Meter)
+- Agrobacterium T-DNA hat LB und RB. Wie lang sind diese Sequenzen jeweils? Etwa 25bp.
+- Mündungssgeschwindigkeit der Wolframkügelchen bei Genkanonen in der Pflanzenbiotechnologie? Etwa 430 m/s.
+- Wie lang ist die DNA, die mit "gene guns" (biolistische Transformation) verschossen wird? Etwa 3-4 kb.
+- Nenne 1 Substanz die wichtig ist für die "somatische Embryogenese" in Pflanzen. A: Polyamin.
+- Welche Phytohormone sind für pflanzliche Zellkulturen eminent wichtig? (1) Auxine (2) Cytokinine
+- Nenne 2 Möglichkeiten der Regeneration von Pflanzenzellen in der Agrarbiotechnologie. A: (1) somatische Embryogenese (2) Adventivsprossbildung
+- Nenne 2 konstitutive Promotoren in Pflanzenzellen, die auch in der Agrarbiotechnologie Verwendung finden. A: (1) 35S-Promotor (CMV) (2) Nos-Promotor (A. tumefaciens)
+- Why may we wish to use "filter bridges" in plant cell cultures? Filter bridges, as solid supports, support the aerated growth of explants on liquid media without the need of agitation.
+- Who invented "filter bridges" in plant biotechnology? Heller. Heller and Gautheret, in 1949, found that tissues could be satisfactorily cultured on pieces of ashless filter paper moistened by contact with liquid medium.
+- In "plant biotechnology", in an agar-agrar medium, we may also use "activated charcoal". Why? This "adsorbs toxic compounds".
+- Name 5 different ways for "direct gene transfer" in plant biotechnology. A: (1) PEG-method (2) electroporation (3) microinjection (4) microprojectiles (5) laser beams
+- In plant biotechnology, name a common goal for modification of "potatoes". A: We may want to grow potatoes that are resistant to fungi.
+- "Powell-Abel et al." developed the first transgenic plants, TMV resistant tobacco plants. In what year? In 1986.
+- In plant biotechnology, when we cut out small parts from the leaf in order to cultivate these cells, how do we call these small things? Leaf discs.
+- In Plant Biotechnology, we require aseptic conditions. Name 5 ways how to achieve this for surface sterilisation of instruments. A: (1) filtration (2) chemical desinfection (3) UV radiation (4) humid heat (5) dry heat
+- What was the "first native cytokinin" that was discovered? Zeatin.
+- Which method can we use if we wish to establish buds of fruit trees? The "Chinosol method".
+- The "surface desinfestation" of branches of perennial woody species requires some special care, due to which two major problems? (1) the degree of infestation and (2) the amount of phenolic compounds in the tissues
+- Name 3 different carbohydrates that are often used in "plant tissue culture". A: (1) Glucose (2) Sorbitol (3) Maltose
+- We may have to sterilize plant cells sometimes, the plant explants. What is the oldest method for sterilisation of explans? 70% ethanol.
+- Why do plant breeders dislike diploidy? Because they want to find new recessive mutations, but the second allele can mask the mutation.
+- Welche Firma entwickelte damals die Anti-Matsch Tomate "Flavr Savr"? Calgene.
+- Give another term for "microprojectile bombardment". A: Biolistics.
+- Rein praktisch betrachtet, wieso sollten wir Viren verstehen wollen in der "Plant Biotechnology"? Da wir hier Pflanzen erstellen können, die eine bessere Virus-Resistenz haben mögen.
+- Die "Flavr Savr" Tomate wurde wann eingeführt? 1994.
+- It is easier to cultivate explants from monocotyledonoues plants or from dicotyldeons? From dicotyledons.
+- In order to reliably work with plant cells, what is the most important part to take into consideration? That we have to work under "aseptic conditions".
+- Welchen Effekt hat die "Verwendung von Abscisinsäure" auf Pflanzen? Dies schliesst die pflanzlichen Stomata.
+- Nenne 2 Agrobacterium species. A: (1) A. tumefaciens (2) A. rhizogenes
+- Who formulated the "theory of totipotency of plant cells"? Gottlieb Haberlandt, in 1902.
+- Give 3 different, brief examples how any plant/tree may initiate a wound callus. A: (1) mechanical injury (2) invasion by microbes (3) insect attack
+- What is "Caulogenesis"? This is a type of organogenesis, by which only adventitious shoot bud initiation takes place in the callus tissue.
+- Ich gebe "Chalone" zu Pflanzenzellen. Welchen Effekt erzielt dies? Die Pflanzenzellen (deren Teilungsaktivitäten) werden gehemmt.
+- Bei den "Gene Guns" werden welche Microparticles eingesetzt? Tungsten-Microparticles.
+- Why do we use "Pseudomonas syringae" in Agrar-Biotech? To "limit the extent of frost damage to plants".
+- When did we see the "first genetically engineered plant" (tobacco)? In 1983.
+- When was the Bt gene transferred into a plant genome for the first time? In 1987.
+- Eine Gewebekultur von Pflanzen kann man auf welchen 2 unterschiedlichen Wegen aufrecht erhalten? (1) als feste Kalluskultur (2) als flüssige Suspensionskultur
+- Können wir mit Pflanzen menschliche Hormone produzieren? Ja. Transgene Tabakpflanzen können menschliche Wachstumshormone produzieren.
+- Wann wurde Bt als Pflanzenpestizid erstmals registriert? 1961.
+- Nenne die 3 klassischen Methoden, ohne Gentechnik, die Produktausbeute in der pflanzlichen Agrarproduktion zu erhöhen. A: (1) Pflanzenbau (2) Pflanzenschutz (3) Züchtung
+- Why do we employ the method "floral dipping"? Because it is a fast method.
+- The European "Plants for the Future" forum was started by the "European Commission" in what year? In 2003.
+- Name 2 forms of "spoilage in plants". A: (1) rotting (2) wilting
+- Which ORIs, origin of replications, does the modified Ti-Plasmid vector have? (1) Ori-Agro (2) Ori-Ecoli
+- Was ist die "Zöliakie" und wieso ist dies für die Biotechnologie wichtig? Unverträglichkeit von Gluten. Man kann bestimmte Pflanzen gentechnisch so verändern, das dies verhindert wird.
+- In 1957, Skoog and Miller discovered something important in regards to the regulation of plant tissue organ formation. How did they discover that? By simply changing the ratio of "auxin" to "cytokinin".
+- In early plant tissue cultures, list one important reason why they did make use of "in-vitro methods"? In order to eliminate pathogens. 
+- In Plant Biotechnology, we may make use of "PGRs". What are PGRs? Plant Growth Regulators.
+- When was the first tissue culture of carrots established? In 1939.
+- When did "P.A. White" etablish the first tissue culture of tomato? In 1939.
+- When was it discovered that the Ti plasmid is the tumor-inducing principle of Agrobacterium tumefaciens? 1974.
+- Indol-3-essigsäure (IAA) ist für Auxin wichtig. Welche Aminosäure ist mit IAA strukturell verwandt? Tryptophan.
+- What do we mean with "plant tissue culture"? Plant tissue culture is a collection of techniques used to maintain or grow plant cells, tissues or organs under sterile conditions on a nutrient culture medium of known composition.
+- Warum verwende ich "Phytase"? Um an das Phosphat in Pflanzen heranzugelangen (Phytat).
+- Was ist die 3. Generation in der Pflanzenbiotechnologie? "Plant factories" die Pharmaceuticals produzieren.
+- In der Biotechnologie, woraus entstehen die Kalluskulturen von Pflanzen? Aus dem "Explantat" einer Pflanze, das in einer Petrischale mit Phytohormonen behandelt wird.
+- Warum schütteln wir eine pflanzliche Kallus-Kultur? Um sie mit CO2 zu versorgen.
+- Wenn das Enzym "Dihydroflavinol-Reduktase" (DFR) ausgeknocked wird, ist was der Fall in der Pflanze? Weisse Blüten - denn DFR überführt farblose Pigment-Vorläufer in farbige Produkte.
+- Wer hat den "golden rice" (mit)erfunden? Ingo Potrykus.
+- Mit "transgenem Raps" will man welches Produkt erzeugen? PHB.
+- What is the biggest hurdle to overcome in the production of foreign proteins in plants? The purification of the transgene-product from the mass of plant tissue.
+- Welche Firma produzierte "StarLink Corn"? Aventis.
+- Was ist die "Agroinfiltration"? Rekombinante Agrobakterien werden in Pflanzengewebe infiltriert, es erfolgt danach eine zeitlich begrenzte Expression im Gewebe, die Pflanze selbst bleibt jedoch unverändert.
+- Can the Agrobacterium Ti-System be used in corn? No, corn is a monocot.
+- Wie heisst "Agrobacterium tumefaciens" heute? Rhizobium radiobacter. URL: http://en.wikipedia.org/wiki/Agrobacterium_tumefaciens
+- In plant biotechnology we also make use of zinc-finger nucleases (ZFNs). Each monomer usually contains how many zinc fingers? 3.
+- What is the most important characteristics for plant breeding? Yield, Yield and Yield.
+- In Plant Biotechnology, what is "Cisgenesis"? This is the genetic modification of a recipient plant with a natural gene from a crossable-sexually compatible-plant. Such a gene includes its introns and is flanked by its native promoter and terminator in the normalsense orientation. Cisgenic plants can harbour one or more cisgenes, but they do not contain any transgenes!

data/lib/studium/exam_topics/plant_breeding

@@ -0,0 +1,64 @@
+# =========================================================================== #
+# === Pflanzenzüchtung
+#
+# Alles über Pflanzenzüchtung tag. (aka "plant breeding tag").
+#
+# Auch "Plant breeding - principles and methods".
+# =========================================================================== #
+
+- Für die Erteilung des Sortenschutzes gibt es die sogenannte <one>Registerprüfung</one>. Nenne 3 Kriterien hierzu. A: (1) Unterscheidbarkeit ("distinctness") (2) Homogenität ("uniformity") (3) Beständigkeit ("stability")
+- Anderer Begriff für die <one>Elternsorte</one>? <one>Ursprungssorte</one>. []
+- Unterschied zwischen <one>Art</one> und <one>Sorte</one>? (1) Arten sind biologische Einheiten, die zumeist nicht mit einander kreuzbar sind. (2) Sorten hingegen sind Formen innerhalb einer Art, von Gruppen von in sich ähnlichen Individuen.
+- Wer waren die ersten bei der künstlichen Bestäubung von Dattelpalmen? Die "Assyrer".
+- Nenne 3 Gründe, wieso der "Svalbard Global Seed Vault" (https://en.wikipedia.org/wiki/Svalbard_Global_Seed_Vault), auf den Spitzbergen, als Ort für den Pflanzensamen-Tresor gewählt wurde. A: (1) Permafrost (2) kann nicht überschwemmt werden (3) Erdbeben sind eher unwahrscheinlich
+- Was meinen wir mit einer "Hybridpflanze"? Dies ist eine Pflanze, die durch die Kreuzung verschiedener Sorten miteinander entstanden ist.
+- In plant breeding, how can we remove negative alleles practically? Via "self-fertilization" (inbreeding). This is highly efficient for removing negative alleles from a population.
+- Name one advantage that "doubled haploidy" has compared to "conventional inbreeding". A: The "conventional inbreeding procedures" takes six generations to achieve complete homozygosity. The "doubled haploidy" method achieves it in just one generation.
+- Mention two methods for making "doubled haploids". A: (1) colchicine (2) selfing
+- In plant breeding, why do we make use of "double haploid plants"? Because that way we can create "homozygous plants" much more rapidly so.
+- In TILLING, which substance is usually used to induce the mutations? EMS. Sometimes NaN3.
+- Give another term for "cross pollination" and "self pollination". A: (1) cross pollation: allogamy (2) self pollation:  autogamy
+- Plant breeding activities can be grouped into which three principal phases? (1) Designing of a breeding goal (2) Generation of genetic variability (3) Utilization of genetic variability
+- Name the 2 most common chemical substances used for TILLING. A: (1) EMS (2) NaN3
+- Name 3 advantages of TILLING. A: (1) efficient for small genes (2) applicable to almost every organism (3) mutations are irreversible
+- What can we achieve via "haploid inducer lines"? We can eliminate "unwanted" chromosomes.
+- Nennen Sie das Ursprungsgebiet von "Mais". A: Mexiko.
+- Nennen Sie das Ursprungsgebiet von "Weizen". A: Aus dem Gebiet des fruchtbaren Halbmonds.
+- Nennen Sie das Ursprungsgebiet von "Sojabohne". A: Ostasien.
+- Nennen Sie das Ursprungsgebiet von "Kartoffel". A: In den Anden; also Venezuela, Argentinien aber auch die Insel Chiloe.
+- Nennen Sie das Ursprungsgebiet von "Gerste". A: Der Vordere Orient; fruchtbarer Halbmond.
+- Which level of annual yield increase (in%) is likely to be needed to keep up with the projected increase in demand of e.g. wheat during the coming decades? Required yield increase per year: ~1.7%.
+- What do you think was the contribution of Plant Breeding in the yield increase of for example WHEAT during the past 40 years in Central Europe? A "yield increase" of about ~30%, due to improved cultivars.
+- Der "Internationale Verband zum Schutz von Pflanzenzüchtungen", UPOV, ist eine zwischenstaatliche Organisation mit Sitz in Genf. Zweck des Übereinkommens? Der "Schutz neuer Pflanzensorten".
+- What is the genetic status of a doupled haploid? Homozygous.
+- Name a pioneer in "wheat cytogenetics". A: Ernest Robert Sears.
+- Give an example for a plant that is an "allopolyploid species". A: Rapeseed.
+- Why is "mutation breeding" used? So that we can create new variation that is not found in nature.
+- In 2008, the world average wheat yield was how much per ha? About 3 t per ha (3t/ha).
+- When did the "Green Revolution" occur, roughly? Between the 1930s and the late 1960s.
+- Bei welcher Züchtungsmethode bei Pflanzen wird "Heterosis" verwendet? Bei der "Hybridzüchtung". 
+- Was ist "synthetisches Saatgut"? Synthetisches Saatgut ist vegetatives Vermehrungsmaterial nackt oder in einer wasserhaltigen oder trockenen Umhüllung. Es besteht i.d.R. aus somatischen Embryonen und einer schützenden Umhüllung.
+- Bei der Sortenwahl von Pflanzen, nenne vier Kriterien. A: (1) Ertragsleistung (2) Qualität (3) Ertragssicherheit (4) Arbeitserleichterung
+- Wer gilt als "Entdecker der Insektenbestäubung"? Kölreuter.
+- Was ist Herkogamie? Als Herkogamie wird in der Botanik die räumliche Trennung von männlichen und weiblichen Geschlechtsorganen innerhalb einer Blüte bezeichnet.
+- Bei der Pflanzenzüchtung gibt es die sogenannte "Wertprüfung". Wie lange dauert diese? Zwischen zwei bis drei Jahre.
+- Vorläufermethode der Antherenkultur? Die "Bulbosum-Methode".
+- A. W. für "Populationszüchtung"? Panmiktische Fremdbefruchtung.
+- Nenne 2 wichtige Ziele in der Pflanzenzüchtung, die auch erklären wieso wir Pflanzenzüchtung betreiben. A: (1) Ertragsverbesserung (2) Ertragssicherung
+- A. W. für "Kastration" in der Pflanzenzüchtung? Emasculation.
+- Was meinen wir mit "Transgression" in der Pflanzenzüchtung? Dies ist die neue, zusätzliche Variabilität.
+- Was ist die "Transgressionszüchtung"? Dies ist die Steigerung eines Merkmals über die elterlichen Ausprägungen hinaus.
+- Was steht am Beginn einer züchterischen Arbeit in der Pflanzenzüchtung? Die Formulierung eines Zuchtziels.
+- Nenne 3 verschiedene natürliche Reproduktionssysteme in der Pflanzenzüchtung. A: (1) Selbstbefruchtung (2) Fremdbefruchtung (3) Asexuelle Vermehrung
+- Wie können wir diploide Pflanzen aus haploiden Pflanzen erhalten? Mit Hilfe von "Colchicin".
+- Was ist "Amphimixis"? Dies ist die geschlechtliche Vereinigung von Genomen zweier Individuen.
+- Bei der Pflanzenzüchtung, was ist die "Registerprüfung"? Dies ist eine amtliche Prüfung einer Sorte auf Unterscheidbarkeit, Homogenität und Beständigkeit im Rahmen des Sortenzulassungsverfahren.
+- Das Saatgutgesetz entstand in Österreich wann? 1997.
+- Das "Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo" befindet sich wo? In Mexiko.
+- In der Pflanzenzüchtung, was heisst "cop-value"? "coefficient of parentage".
+- Gib ein Beispiel an für die "genetische Verwundbarkeit". A: Mais ("Texas Cytoplasma"). Diese Pflanze ist männlich steril, zugleich ist sie anfälliger für die Blattkrankheit "Southern Corn Leaf Blight".
+- Genetische Erosion hat welche 2 möglichen Folgen? A: (1) Genetische Verarmung: Verminderung der genetischen Diversität im Anbau (2) Genetische Verwundbarkeit: erhöhtes Risiko für das großflächige Auftreten von Krankheiten
+- Was meinen wir mit dem "primären Genpool" in der Pflanzenzüchtung? Dies ist die Kulturart selbst und leicht damit kreuzbare Arten.
+- Was meinen wir mit "Landsorten"? Dies sind Pflanzensorten, die von Landwirten vermehrt werden.
+- Was meinen wir mit "genetischen Ressourcen"? Genetische Ressourcen sind die Gesamtheit aller Genotypen einer Kulturart, die zur Züchtung dieser Art zur Verfügung stehen und somit für Pflanzenzüchtung und landwirtschaftlichen Anbau nutzbar sind.
+- Nenne 4 Gründe wieso wir die Biodiversität in der agrarischen Produktion von Pflanzen erhalten sollten. A: (1) Artenvielfalt (2) Sortenvielfalt (3) verringertes Produktionsrisiko (4) größere Produktvielfalt

data/lib/studium/exam_topics/plant_development

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+# =========================================================================== #
+# === Plant development
+#
+# Everything about plant-development.
+# =========================================================================== #
+
+- Eine Pflanze hat welche 3 <one>Grundorgane</one>? (1) <one>Sprossachse</one> (2) <one>Wurzel</one> (3) <one>Blätter</one> []
+- How long does it take <one>Arabidopsis</one>, from <two>germination</two> to <two>mature seed</two>? About <one>6 weeks</one>.
+- Besitzen <one>Pflanzen</one> <two>Hox-Gene</two>? Nein.
+- Das ruhende Zentrum ("quiescent center") in Arabidopsis ist Teil ... ? Der "Wurzelspitze".
+- Nenne 2 verschiedene Möglichkeiten, wie wir die Kallusbildung bei Pflanzen im Labor induzieren können. A: (1) Zugabe von Kokosnussmilch (2) Zugabe von Auxin
+- In Arabidopsis thaliana, after the "late heart stage", which stage comes next? The "mature embryo stage".
+- Bildet eine Pflanze mehr oder weniger Blätter wenn sie weniger Licht erhält? Sie bildet mehr Blätter.
+- In welchem Organismus finden wir "Monopteros"? In Arabidopsis thaliana. MONOPTEROS kodiert für einen Transkriptionsfaktor, der wichtig ist bei der Entstehung der "embryonalen Achse".
+- What are "periclinal" and "anticlinal" cell divisions? (1) periclinal: parallel to the organ surface (2) anticlinal: at right angle to the surface
+- At the 16-cell stage of plants, how do we call the "epidermal layer" of a plant? Dermatogen.
+- Name 2 functions of the plant "suspensor". A: (1) Attach the embryo to maternal tissue (2) it is a source of nutrients
+- Which plant hormone is important in order to establish the apical-basal axis? Auxin.
+- PIN7 is what type of protein? PIN7 is an auxin-efflux protein.
+- Auxin, in general, may have what role in regards to Aux/IAA proteins? It promotes the ubiquitination and degradation of their transcriptional regulator proteins.
+- In the plant flower model ABCDE, which combinations are mutually exclusive? Class A and C genes act "mutually antagonistic".
+- There are the "WOX transcription factors". What does WOX stand for? "WUSCHEL-related homeobox".
+- Was tut das "Popeye protein"? Diser bHLH Transkriptionsfaktor spielt eine wichtige Rolle im Eisen-Haushalt einer Pflanze, indem andere Gene reguliert werden. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675571
+- Two major events are required for embryonic patterning in plant embryos. Which ones? (1) Activate zygotic genome (2) Coordinate gene expression programs
+- In plant development, the "maternal-to-zygotic transition", give another term for this. A: This is the "transfer of developmental control to the zygotic genome".
+- Give another term for "morphogenesis". A: Pattern formation.
+- "Embryo morphogenesis" in plants has which two major steps/phases? (1) Morphogenesis (2) Maturation
+- In plant development, the protein SSP may be important. What does SSP code for? SSP encodes a "receptor-like protein".
+- In plant development, YDA may be important. What does YDA encode for? YDA encodes "MAP3K", mitogen-activated triple kinase.
+- In Arabidopsis morphogenesis, the last step in it can be called the "mature" phase. What is the name of the three steps before this last step? (1) Late globular (2) Heart (3) Torpedo
+- Auxin belongs to which family? Auxin belongs to the "ARF family of transcription factors".
+- Fördern oder hemmen AUX/IAA Komplexe eher die Transkription? Sie hemmen eher die Transkription.
+- The logic behind the spatial layout of gene expression that patterns a developing flower, is similar to ...? That of Hox gene action in patterning the body axis in animals.
+- Some differentiated cells of the adult plant may retain totipotency - and so behave like ...? Animal embryonic stem cells.
+- A. W. für "apical-basal axis"? Shoot-root polarity of the plant body.
+- In plant development, what means "TAI"? Transcriptome age index.
+- In plant genomics, what does the "TAI" tell us? It represents the "mean evolutionary age of a transcriptome".
+- We may say a "high TAI value" from transcriptomes of early plant embryonic stages. What does this mean? It means that these are assumed to be "evolutionarily young".
+- AUX/IAAs degradation is mediated by which complex? It is mediated by the "SCF1 complex".
+- RPK1 and TOAD2 receptor-like kinases are redundantly required for ...? Radial patterning.
+- Nenne einen "Modellorganismus für Bäume". A: Populus trichocarpa; hat ein relativ kleines Genom von 470 Mb Basenpaaren.
+- Give two examples for "primary meristems" in plants. A: (1) shoot apical meristem (2) root apical meristem
+- What does the "STM gene", the STM, stand for? Shoot Meristemless.
+- Arabidopsis mag im Zuge der Entwicklung des Embryos einige interessante Gene oder Mutanten dieser Gene exprimieren, die abgekürzt werden. So gibt es "STM", "CLV" und "CUC". Was heissen die jeweils? (1) STM: Shoot meristemless (2) CLV: Clavata (3) CUC: Cup-shaped cotyledons
+- Give another term for "sexually mature state" in a plant. A: To "transition towards flowering".
+- The ABC model of flower development was first formulated in what year? 1988.
+- STM is a ... identity gene. A: It is a "meristem identity gene".
+- Name a protein WUSCHEL interacts with. A: CLAVATA.
+- How do we call the "male part of a flower"? Stamen.
+- What is "Florigen" assumed to do? This molecule should be  responsible for controlling and triggering flowering in plants.

data/lib/studium/exam_topics/populationsgenetik

@@ -0,0 +1,136 @@
+# =========================================================================== #
+# === POPULATIONSGENETIK Tag
+#
+# Pop tag. Popgen tag. Evolutionsgenetik tag. Evogen tag.
+# Auch RFLP und Populationsuntersuchungen. Evolutionsgenetik.
+# Sowie "conservation genetics".
+# =========================================================================== #
+
+- Was ist eine <one>genetische Bürde</one> in der Populationsgenetik? Gib ein Beispiel hierfür. A: Das Vorhandensein mancher Allele, wie "Sichelzellanämie" beim Menschen, ist eine genetische Bürde für eine Population.
+- Anderes Wort für "short tandem repeat loci"? <one>Microsatellites</one>.
+- A <one>genetic bottleneck</one> leads to ...? A <one>loss of diversity</one>. []
+- Name a general way how there may be a reduction of variation between/in populations. A: By <one>migration</one>.
+- A population may go through a <one>population bottleneck</one>. What direct consequences may arise? There may be <one>a drastic reduction of population size</one>.
+- Name a famous concept that originated from <one>population genetics</one>. A: The <one>concept of the gene pool</one>.
+- Name the two most commonly studied types of polymorphisms in population genetics. A: (1) SNPs (2) microsatellites
+- A "haplotype network analysis" for humans usually analyses what first? The <one>mtDNA</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Mitochondrial_DNA
+- What is the "HapMap"? This is a genome-wide haplotype map. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/International_HapMap_Project
+- Name an important goal of population genetics. A: To understand the transmission of alleles from one generation to the next.
+- What is "negative assortative mating"? When unlike individuals mate - opposites attract.
+- Why may "genetic drift" be bad? It may "lead to loss of genetic variation".
+- What were the first used DNA-markers? "RFLPs": "restriction fragment length polymorphisms". URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/docs/techrflp/
+- SNPs can occur in which 3 general places in a genome? (1) "exons" (2) "introns" (3) "regulatory regions"
+- Ein Mensch der an "Favismus" leidet isst Ackerbohnen. Was passiert? Eine "Hämolyse" kann ausgelöst werden, welche in seltenen Fällen sogar zum Tod führen kann.
+- When was "AFLP" established? In "1995". URL: https://de.wikipedia.org/wiki/AFLP
+- Define "absolute fitness". A: This is "the total number of offspring" an individual has.
+- When may we see a fitness value of 0? If a member of a population dies, without having had an offspring.
+- Warum sind "populationsgenetische Untersuchungen am Menschen" so schwierig? Aufgrund der "langen Generationsdauer".
+- By definition - in a declining population, the "average number of offspring" must be ... (a constraint)? "Below 1".
+- Give another word for the "ability to survive and reproduce". A: "Fitness". URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Fitness_%28Biologie%29
+- In der Populationsgenetik, was heisst ein "fixiertes Allel"? Wenn alle Mitglieder einer Population "homozygot für das jeweilige Allel" sind. Das heisst konsequenterweise auch, das diese Population kein alternatives Allel mehr besitzt.
+- How do we call "SNPs located outside of coding sequences"? "Silent SNPs".
+- Die Hardy-Weinberg Regel gilt nur für welche Populationen genau? Für "Populationen unendlicher Größe".
+- Why may it be of important practical value to understand the Hardy-Weinberg equation? Because we may wish to know the "frequences of disease-causing alleles in a population".
+- When do genotypes re-form? Genotypes re-form from alleles in each generation.
+- For a large population, how to (realistically) analyze its gene pool? We take a "representative sample" of the population.
+- What does the abbreviation "STRP" stand for, in population genetics? "Short tandem repeats". URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Microsatellite
+- What is the "allele frequency"? How often a particular allele is found in a population.
+- Is a population larger than the "effective population"? Yes.
+- Wozu kann die "effektive Populationsgröße" verwendet werden? Man kann sie verwenden um die "kleinste überlebensfähige Population" (MVP = "minimum viable population") zu berechnen. 
+- In population genetics, what does the abbrevation "MVP" stand for? "Minimum viable population".
+- Vergleiche die "Substitutionsrate von Genen". Bei welchen Genen mögen wir wenig Substitutionen finden? Bei Genen die eine wichtige Funktion haben.
+- How do we call the introduction of new genetic variation into an (inbred) population? "Genetic rescue".
+- The amount of "drift" in any given population, depends heavily on which single characteristic? "Population size".
+- In population genetics: if we "eliminate many alleles", we also eliminate a large proportion of ...? The "genetic diversity".
+- Welche zwei Komponenten umfasst die "phänotypische Variation"? "Genetische Variation" + "umweltbedingte Variation".
+- What is the "life expectancy of a genotype"? The life expectancy of a genotype is "a single generation".
+- Is there a locus that is "always hemizygous"? Yes - male XY. They are either Xa Y or XA Y.
+- Welche Allele möchte eine Population loswerden? "Lethale Allele"; sprich - alle Allele die als genetische Last wirken können.
+- Wie nennen wir die Unterschiede zwischen individuellen Genomen einer Art? "Polymorphismen".
+- How to indicate consanguinity between two people in a genetic pedigree chart? Draw a "double horizontal line".
+- Wie hat man erstmals "repetitive Sequenzen" entdecken können? Indem man die "Reassoziationskinetik von Genomen" verglichen und analysiert hat. Hierbei wird die DNA geschert, erhitzt und somit denaturiert, und danach unter Standardbedingungen wieder reassoziieren lassen. Man erkannte, das repetitive DNA schneller reassoziiert als nicht-repetitive DNA.
+- In Evolutiongenetics, name the 6 types of "substitutions" possible. A: (1) "single substitution" (2) "multiple substitution" (3) "coincidental substitution" (4) "parallel substitution" (5) "convergent substitution" (6) "back substitution"
+- Gibt es Nachteile in einer Population zu leben? Falls ja nenne drei Nachteile. A: (1) Krankheitsübertragung (2) Futterkonkurrenz (3) Individuen sind auffälliger in einer Gruppe
+- Small populations lose "genetic variation" over time through ... ? (1) "inbreeding" (2) "genetic drift"
+- Name two ways how "new alleles" enter a population, starting with the letter "m". A: (1) "Mutation" (2) "Migration"
+- In population genetics, what is meant with "genetic rescue"? This is the introduction of new genetic variation into an (inbred) population, in order to ensure its long-term survival.
+- Most "natural populations" can be subdivided into ...? demes.
+- Humans have n microsatellites in their genome? Over a million. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Microsatellite
+- Welche Technik nennen wir "RAPD"? "Randomly amplified polymorphic DNA".
+- A. W. für "Mikrosatellit"? "SSR" (simple sequence repeat)
+- Was ist die Grundlage für die Entstehung von Multigenfamilien? "Genduplikation".
+- When is the condition of "random mating" fulfilled? When all individuals in the given population are "equally likely" to be choosen as a mate.
+- Give a specific example for "positive assortative mating". A: This is for example when tall individuals preferentially mate with other tall individuals.
+- Name an important goal of population genetics. A: Understand the transmission of alleles from one generation to the next.
+- What is "assortative mating"? This is when "individuals choose mates based on resemblance to themselves".
+- Give 3 example for random mating. A: (1) Assortative mating (2) isolation by distance (3) inbreeding
+- Name 3 types of bias in mating choice violating the assumption of "random mating". A: (1) assortative mating (2) isolation by distance (3) inbreeding
+- In population genetics, what do we mean with the term "Inbreeding"? This is the tendency for mates to be more closely related than two individuals drawn at random from the population.
+- What does the "inbreeding coefficient" tell us? The inbreeding coefficient (Fi) of an individual is the probability that both alleles of a randomly chosen locus are identical by descent.
+- Nenne einen Unterschied zwischen "VNTRs" und "STRs". A: STRs sind viel kürzer (VNTRs sind somit viel länger).
+- A. W. für "random mating occurs"? "Panmixis".
+- What exactly is the key assumption underlying the Hardy-Weinberg principle? The assumption of "random mating".
+- In der Populationsgenetik, was ist eine sogenannte "ideale Population"? Eine Population ohne 'genetische Evolution', sprich - eine Population deren Genpool sich nicht verändert.
+- How do we call SNPs with a "frequency below 5%"? "Rare SNPs".
+- Wofür steht die Abkürzung "AFLP"? "Amplified fragment length polymorphism".
+- Why are microsatellites better for population genetic analysis than SNPs? Because there are more number of alleles at a microsatellite.
+- Gilt beim Panda die Hardy-Weinberg Regel? Nein - er hat "eine zu geringe Individuenanzahl".
+- How can we mathematically connect phenotype to genotype? We "use a function" that connects the "genotype" and the "environment", such as: P = f(G, E)
+- Wie können Populationen schrumpfen? (1) "Sterberate" (2) "Emigration"
+- Should we rather use linked or non-linked loci in population genetics? We should rather use "non-linked loci".
+- How can we "globally measure the distribution of SNPs"? Via "DNA microarrays".
+- Are there "more rare SNPs" or "more common SNPs" in the human genome? There are "more rare SNPs", which is logical if we remember the "definition of a rare SNP".
+- Another term for "genotype"? "Allelic composition".
+- SNPs occur within genes. They can be classified into one of which three groups? (1) "synonymous SNPs" (2) "nonsynonymous SNPs" (3) "nonsense SNPs"
+- What does it mean when we have a "polymorphic locus"? This is "a locus that has more than one allele".
+- Wie ist der "Genpool" definiert? Dies sind "alle Allele der Mitglieder einer Population".
+- What is a "haplotype network"? This network "shows the relationships among different haplotypes".
+- "Natural selection" always acts on ... ? The "phenotype".
+- Nenne die Hauptbedingung dafür, das ein "dominant-letales Allel" in einer Population fortbestehen kann. A: Die betroffene Person muss Kinder haben.
+- Why is the name "gene pool" actually a misnomer? Because we should call this the "allele pool".
+- How does the gene pool of a species change, as time passes by? The gene pool, due to mutations, becomes progressively "more heterogeneous".
+- Name two motivations for "conservation genetics" today. A: (1) to "reduce the current rates of extinction" (2) to "preserve biodiversity"
+- What is the difference between an "effective population" and "just" a population? An "effective population" is one that can reproduce - thus, they are capable of "genetic exchange".
+- Die Krankheit "Favismus" ist, genetisch gesehen, auf welchem Chromosom zu finden? Auf dem "X-Chromosom".
+- In einem "Dendrogramm", wie nennen wir die terminalen Äste? OTUs: "operational taxonomic units".
+- Give an example for a "morphometric trait". A: "Body weight".
+- Definiere den Begriff "Populationsgenetik". A: Dies ist die Untersuchung der genetischen Variationen in Populationen - und wie sich diese im Laufe der Zeit verändern.
+- Wie nennen wir den "Erblichkeitsgrad" mit einem Fachwort? "Heritabilität".
+- Wo finden wir allgemein eine "geringere, interspezifische Diversität"? Bei Ökosystemen mit einer "schwierigen Lebensumgebung".
+- Give another term for "deleterious mutations". A: "Mutational load".
+- Give an example in population genetics about a gene-culture coevolution. A: The early european humans keeping lactase active throughout their lifetime.
+- In population genetics, we can apply the so-called "F-statistics". In particular, what does F IS tell us? F IS is a measure of departure from the Hardy-Weinberg (HW) proportions, within local subpopulations, due to "nonrandom mating".
+- Give an example for a "meristic trait". A: The number of offspring that an individual has.
+- What exactly is "linkage disequilibrium"? Non-random association of alleles at two or more loci (marker).
+- Name 2 different "marker types" that could be used in population analysis. A: (1) dominant markers (2) co-dominant markers
+- A. W. für "Panmixie", auf Deutsch? Zufallspaarung.
+- Name a way to deal with "complex pedigrees" in population genetics. A: By making use of the "tabular method".
+- Which 3 steps do we require in an "AFLP" (Amplified fragment length polymorphism) experiment? (1) Restriction enzyme digestion (2) Ligation of adaptors (3) Selective amplification of restriction fragments
+- The "microsatellite polymorphism" is mainly caused how? By "replication slippage".
+- Give another name for a "polymorphic locus". A: multiallelic locus.
+- What is an "Ecotype"? An Ecotype is a subpopulation within a breed that is genetically adapted to a very specific habitat.
+- What do we mean with "allelic diversity"? Allelic diversity is the "average number of alleles per locus".
+- A. W. für "population size" (auch englisch)? census size.
+- What is meant with an "at-risk breed"? This is a breed with demographic characteristics suggesting that it will fail to exist in the future. A "conservation programme" may be able to rescue such a breed.
+- Give an example for an "indirect genetic relationship". A: Two individuals with a common ancestor
+- Es gibt eine Krankheit die "Favismus" genannt wird. Woher kommt dieser Name? Von "faba", Bohne.
+- What do we mean with the term "Inbreeding depression"? Inbreeding depression is the reduced survival and fertility of offspring of related individuals.
+- How is a "wild-type allele" defined? More than 1% in a natural population under study.
+- Wie nennen wir eine Population, die das Hardy-Weinberg Gesetz erfüllt? Eine Mendel-Population.
+- Bei den "Sequenzevolutions-Modellen" gibt es das berühmte "Jukes-Cantor" Modell. Welchen Vorteil hat es? Es berücksichtigt "Mehrfachsubstitutionen".
+- A. W. für "minisatellites"? VNTRs (variable number of tandem repeats).
+- A. W. für "qualitative traits"? categorical traits.
+- What do we mean with "genetic diversity"? This is a part of biodiversity as a measure of genetic variability present in a population as a consequence of its evolution.  
+- Give 5 reasons for conserving biodiversity. A: (1) Economic value of bio-resources (2) Ecosystem services (3) Aesthetics (4) Cultural value (5) Ethical reasons
+- What is the goal of "conservation genetics"? To deal with the genetic factors that affect the risk of extinction of a population/species.
+- How long are microsatellite loci? 2-6 base pairs
+- Ab wann sagen wir das ein genetischer Locus "polymorph" ist? Wenn das seltenste Allel dieses Locus mit einer Häufigkeit von zumindest 0.01% in einer Population auftritt.
+- Was bezeichnen wir mit "Polymorphismus"? Dies ist ein Gen mit vielen verschiedenen Allelen, von welchen keines in einer Population dominiert.
+- Nenne eine Hypothese zur Entstehung von Introns. A: Die "Intron-early" Hypothese.
+- Was ist die "Sequenzdivergenz"? Dies ist ein Maß für die Differenzierung zwischen homologen Sequenzen.
+- Compare the genetic variety between crop plants with wild plants. A: Less genetic variation in crop plants.
+- Name four forces that upset the Hardy-Weinberg equilibrium. A: (1) Migration (2) Mutation (3) Natural Selection (4) Random genetic drift
+- Was ist "Inzucht Depression"? Dies ist ein Maß für den Verlust von Fitness, der durch Inzucht verursacht wird.
+- How many alles per locus do SNPs have? Never more than 4.
+- Was sind die beiden Hauptvorhersagen des Hardy-Weinberg Gesetzes? (1) die Allelhäufigkeit in einer Population verändern sich nicht von einer Generation zur anderen (2) Man kann Genotyphäufigkeiten nach einer Generation zufälliger Paarung aus der Allelhäufigkeit vorhersagen
+- Welches ist die häufigste Enzym-Krankheit des Menschen? Favismus.

data/lib/studium/exam_topics/posttranslationale_modifikation_von_proteinen

@@ -0,0 +1,186 @@
+# =========================================================================== #
+# === Posttranslationale Modifikation von Proteinen Tag
+#
+# Farnesylierungen, Geranylierungen und Myristoylierungen.
+#
+# Ptm tag. posttrans tag.
+# =========================================================================== #
+
+- Kann die Massenspektrometrie Methylierungsstellen in Proteinen nachweisen? Ja.
+- <one>Carbamidomethylation</one> (CAM) is a deliberate post-translational modification introduced to which amino acid? To cysteine residues, by reacting it with iodoacetamide. 
+- Nenne ein Protein das <one>geranylgeranyliert</one> wird. A: Das kleine G-Protein <one>Rho</one>. []
+- How many of the human proteins are glycosylated? About <one>50%</one> of them. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5358406/
+- <one>Ubiquitinierung</one> findet an welcher Aminosäure statt? An <one>Lysinen</one>. []
+- Gib ein Beispiel für eine <one>Lipidierung</one>. A: Der <one>GPI-Anker</one>.
+- Nenne eine <one>PTM</one>, welches die Carboxylgruppe eines "terminalen Cysteins" methyliert. A: Die <one>Prenylierung</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Prenylierung
+- Nenne drei nicht-enzymatische, posttranslationale Modifikationen von Proteinen. A: (1) <one>Inteine</one> (2) <one>Maillard-Reaktion</one>
+- Die <one>Hedgehog-Proteine</one> sind autokatalytisch aktiv und weisen eine Ähnlicheit zu ... auf. A: Zu den <one>Inteinen</one>.
+- <one>Protein geranylgeranyltransferases</one> consist of n subunits? They consist of "two subunits".
+- A <one>mannose sugar</one> can be added as part of a post-translation modification, onto which amino acid? Onto a <one>tryptophan residue</one>.
+- Nicht alle der 20 Aminosäuren werden posttranslational modifiziert. Welche fünf Aminosäuren werden nicht modifiziert? <one>VALIF</one> (aka <three>V-A-L-I-F</three>), ähnlich wie <two>VALID</two>. (1) <one>V</one> - Valin (2) "A" - Alanin (3) "L" - Leucin (4) <one>I</one> - Isoleucin (5) <one>F</one> - Phenylalanin
+- Inkludiert <one>UniProt</one> auch Informationen zu <two>post-translationalen Veränderungen</two> an Proteinen? Ja. URL: https://www.uniprot.org/ []
+- Existieren Histon_Demethylasen? Ja, seit 2004 ist dies dokumentiert.
+- Sind <one>Kinasen</one> das selbe wie <two>Proteinkinasen</two>? Nicht unbedingt. Enzyme, die die ATP-abhängige Phosphorylierung katalysieren werden "Kinasen" genannt. Ist das Substrat ein Protein so nennt man diese Kinasen "Proteinkinasen" ("PK").
+- Name three possible post-translation modifications of <one>serine</one> and <one>threonine</one>. A: (1) Phosphorylation (2) O-linked glycosylation (3) N-acetylation (N-terminus) 
+- Wieviele C-Atome haben jeweils <one>Farnesyl</one> und <one>Geranyl</one>? (1) "Farnesyl": <one>C15</one> (2) "Geranyl":  <one>C20</one>
+- Ist die Glykosylierung von Proteinen wichtig für die molekulare Erkennungs- und Sortierungsvorgänge von Proteinen? Ja.
+- Für die <one>Geranylgeranylierung</one>: weche Aminosäure ist am wichtigsten? <one>Cystein</one>, da der Prenylrest auf die -SH Gruppe von Cystein übertragen wird.
+- Bei welchem <one>zellulären Prozess</one> spielt eine gezielte Myristoylierung von Proteinen eine Rolle? Bei dem Signalweg der "Apoptose"; insbesondere über "Myristoylierung von Aktin".
+- The <one>N-acetyl Lysine group</one> is specifically recognized by discrete protein domains called ... ? <one>Bromodomains</one>.
+- Nenne einen Rezeptor, der <one>sulfatiert</one> wird. A: Der <one>Chemokine Rezeptor CCR5</one>.
+- Alle <one>Sulfatasen</one> benötigen die Ausbildung eines <lightseagreen>Fgly</lightseagreen> im aktiven Zentrum. Wofür steht <lightseagreen>Fgly</lightseagreen>? <one>C-alpha-Formylglycin</one>.
+- Welcher <one>Zucker</one> wird direkt bei N- oder O-glycosidischer Verknüpfung verwendet? <one>N-Acetylglucosamin</one>.
+- <one>SAM</one> ("S-Adenosylmethionin") tritt im Stoffwechsel als Methyldonor auf. Dabei wird es zu welchen zwei Produkten hydrolysiert? (1) <one>Adenosin</one> (2) <one>Homocystein</one>
+- Wer ist <one>der Donor für Methylgruppen</one>, die im Zuge von Methylierungen in der Zelle eingesetzt werden? <royalblue>SAM</royalblue> (<one>S-Adenosyl methionine</one>). URL: https://en.wikipedia.org/wiki/S-Adenosyl_methionine
+- Die <one>Sulfatierung</one> findet an welchen Aminosäuren statt? An <one>Tyrosinen</one>.
+- Ausser <one>Arginin</one> und <one>Lysin</one>: nenne drei weitere Aminosäuren die N-Methyliert werden können. A: (1) "Histidin" (2) "Asparagin" (3) <one>Glutamin</one>
+- <one>Acetylierung</one> spielt in Bakterien eine wichtige Rolle. Gib ein Beispiel hierzu. A: Die Umwandlung von Glutaminsäure zu N-Acetylglutaminsäre, als wichtigen Zwischenschritt für die "Biosynthese von Ornithin" in Bakterien.
+- <one>Poly-Ubiquitin</one> führt zum Abbau von Proteinen. Wieviele Ubiquitine müssen minimal angeheftet werden? <one>Vier</one>. "Ub4" ist die minimale Länge des Ub-Tags, die zum Transport ins Proteasom und dem anschließenden Abbau des Proteins führt.
+- Proteins with <one>SH2 domains</one> gain which ability? They can bind to <one>phosphorylated Tyrosines</one>.
+- <one>Acetylation of Lysines</one> in the p53-transcription factor can prolong its half-life. Why is that so? Because this acetylation <one>prevents ubiquitinylation at these residues</one>.
+- Nenne eine PTM an <one>Prolin</one>. A: Die <one>C-Hydroxylierung</one> von Prolin in Kollagen.
+- Name four aminoacids that can be <one>glycosylated</one>. A: (1) "Asparagine" ("N") (2) "Serine"     ("S") (3) "Threonine"  ("T") (4) <one>Tryptophan</one> (<royalblue>W</royalblue>)
+- Name a fairly new technology that allows us to study <one>post-translational protein modifications</one>. A: <royalblue>MudPIT</royalblue>: <one>multidimensional protein identification technology</one>. This is a combinatorial method, combining "chromatography" in conjunction with "mass spectrometry".
+- Gibt es die <one>S-Nitrosylierung</one> als PTM? Ja.
+- In welchem Jahr wurde <one>S-Adenosylmethionin</one> entdeckt? Im Jahre <one>1952</one>.
+- <one>Farnesylation</one> makes use of which motif? <one>CaaX</one>.
+- In regards to <one>hydrophobicity</one>: does "methylation" on an aminoacid, as part of a post-translational operation, have any change to it? Yes - methylation, aka "the addition of a -CH3 methyl group", in general <one>increases the hydrophobic character of that amino acid</one>.
+- Welchen Cofaktor verwenden die <one>Sirtuine</one>? <one>NAD</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Sirtuin
+- Typically, <one>Ras family proteins</one> may have a "CaaX motif" at the C terminus. Which modification is associated with this motif, usually? <one>Farnesylation</one> - especially when X is a small amino acid, such as "Alanin" or "Serin".
+- In welchem Protein mögen wir <one>farnesyliertes Cystein</one> finden? Im <one>Signalüberträgerprotein Ras</one>.
+- Give a slightly better word for the term <one>phosphorylation</one> in living cells. A: <one>ATP-dependent phosphorylation</one>.
+- <one>SAM</one>, der Methylgruppen-Donor in der Zelle, besteht aus welchen zwei Komponenten? (1) <one>Adenosin</one> (2) <one>Methionin</one>
+- Bei den Phosphorylierungs-Reaktionen: ist die "Hydroxyl-Gruppe" wichtig? Ja - sie wird als <one>Nukleophil</one> benötigt.
+- <one>Histidin</one> kann phosphoryliert werden; die Phosphat-Gruppe wird danach oft auf welche Aminosäure übertragen? Auf <one>Aspartat</one> (<royalblue>D</royalblue>).
+- <one>SH2 Domänen</one> erkennen was? <one>Phosphotyrosin</one> (<royalblue>pY</royalblue>).
+- Ist das <one>Abspalten einer Signalsequenz</one> eine "posttranslationale Modifikation" von Proteinen? Ja.
+- How many times can <one>Lysine</one> be methylated, at max? Three times.
+- <one>Lipidverankerungen</one> dienen häufig dazu, Proteine in bestimmten Membranen zu verankern - typischerweise über welche Aminosäuren? <one>Cystein</one>.
+- Wo an einem Protein, das ins <one>Mitochondrium</one> importiert werden soll, findet man die "Signalsequenz"? <one>Aminoterminal</one> (= N-Terminal).
+- Give a prominent example of a protein or a group of proteins with "ubiquitin-binding domains". A: <one>Protein chaperones</one>.
+- A. W. für "Adenylylation"? <one>AMP Transfer</one>.
+- Nenne ein Protein das <one>farnesyliert</one> wird. A: Das "G-Protein Ras".
+- Kann <one>Histidin</one> phosphoryliert werden? Ja.
+- Name a technique that can be used to "perform high throughput analysis of PTMs". A: <one>Mass spectrometry</one>.
+- Nenne ein Motif das wir in "Ras" (Ras-Isoformen) finden mögen. A: Das "CaaX motif". URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867400806078
+- Die Hedgehog-Modifkation ähnelt ... ? Dem "Intein-Mechanismus".
+- In Säugetieren gibt es zwei Familien von Ser/Thr-Proteinphosphatasen. Nenne diese beiden Familien. A: (1) "PPP-Familie" (2) "PPM-Familie"
+- "Palmitoylierung" umfasst n C-Atome? "16".
+- Two types of "protein ubiquitylation" can be distinguished. Which ones are these? (1) "monoubiquitylation" (2) "polyubiquitylation"
+- Was ist das "Kinom"? Dies ist die "Anzahl / Summe aller Kinasen" in einem bestimmten Genom.
+- Die zeitliche Kontrolle von Proteasen erfolgt oft durch ... ? die "Expression als Zymogene".
+- Welche Aminosäure wird <one>C-Glykosyliert</one>? <one>Tryptophan</one>.
+- 2x ... = 1x Farnesyl. A: 2x "Prenyl".
+- Arginine-methylation usually occurs at "GAR motifs". What does this mean? This refers to "glycine and arginine-rich regions".
+- Which enzyme methylates "lysine"? The "lysine methyltransferases".
+- Wer oder was erkennt "Trimethyl-Lysin", in der Zelle? "Chromodomänen".
+- Ist die Methylierung von Arginin rückgängig zu machen, von der Zelle? Ja, über eine "Arginindemethylase". Die erste Argininddemethylase wurde im Jahr 2007 beschrieben.
+- The transfer of methyl groups to certain histones is catalyzed by enzymes known as "histone methyltransferases", but where do they obtain the methyl-group? From "S-adenosyl methionine". 
+- Arginine can be methylated how many times, in a cell? Arginine can be methylated (up to) twice.
+- Which protein methylates Arginine? PRMTs: aka the "protein arginine methyltransferases".
+- Gibt es "Poly-SUMOylierungen"? Nein; zumindest wurden diese noch nicht beobachtet.
+- "PAPS" wird durch Zerlegung von n ATP-Molekülen hergestellt? 2.
+- Können wir im Urin die Ausscheidung von "sulfo-Tyrosin" nachweisen? Ja.
+- Ist die "Polyubiquitylierung" reversibel? Ja, über "Deubiquitylasen".
+- "GPI-linked proteins" contain a "signal sequence", which directs them towards ... ? The "endoplasmic reticulum" (ER).
+- Was heisst "GPI"? "Glycosylphosphatidylinositol" ("Glycosyl|Phosphatidyl|Inositol").
+- The <one>GPI-anchor</one> is synthesized where within a cell? In the "endoplasmic reticulum".
+- Is the "GPI anchor" attached at the C-terminus or the N-terminus? It is attached to the "C-terminus".
+- Name "a general group of enzymes" that can cleave off the "GPI anchor". A: The "phospholipases" - such as "Phospholipase C".
+- Name three post-translational "lipid modifications". A: (1) "prenylation" (2) "palmitoylation" (3) "GPI anchor attachment" ("glycosyl phosphatidylinositol")
+- In prokaryotischen Systemen können "Histidin-Kinasen" autophosphorylieren (sie fungieren hier als "sensor kinases"). Die Phosphatgruppe geht dann über zu dem "response regulator" und zwar ... an welche Aminosäure dort? An "Aspartat".
+- "Myristoylation" is usually catalyzed by which enzyme? By the "N-myristoyltransferase". URL: https://en.wikipedia.org/wiki/N-myristoyltransferase_1
+- Wieviele "Sulfatasen" sind im menschlichen Genom bekannt? "13".
+- Welche Enzyme ermöglichen "Glykosylierungen"? Die hochspezifischen "Glykosyltransferasen", Enzyme. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Glycosyltransferasen
+- When we speak of "polyubiquitylation", how many ubiquitins do we mean, normally? Four or more ubiquitins.
+- Was meinen wir mit den "Aus-Schaltern" in der Zellbiologie? Dies sind die "Phosphoprotein-Phosphatasen" ("PPP").
+- Nenne eine "irreversible Modifikation" an Proteinen. A: "Proteolyse".
+- Die "Myristoylierung" erfolgt an welcher Aminosäure? "Glycin".
+- "Myristic acid" is added where exactly onto a protein? To the "N-terminal amino group" of a protein.
+- "S-Adenosylmethionin" hat wieviele C-Atome? "15".
+- "ADP ribosylation" may depend on which cofactor? It is "NAD-dependent", thus "it depends on NAD as a cofactor".
+- Does "proteome diversification via covalent modification" occur in prokaryotes? Yes.
+- Die "Amidierung" ist eine PTM. An welchem Terminus eines Proteins findet sie statt? Am "C-Terminus".
+- Die Zelle kann Proteine methylieren. Woher stammt die "Methylgruppe"? Von "S-Adenosylmethionine" ("SAM").
+- A. W. für "Glykosylierung"? "Verzuckerung".
+- Die "N-Myristoylierung", bei die Myristinsäure an den N-terminalen Glycinrest von Proteinen angehängt wird, kann sowohl cotranslational aber auch posttranslational passieren. Welche davon kommt häufiger zum Einsatz? Das "cotranslationale Anheften der Myristinsäure".
+- What kind of kinases are the "Cyclin-dependent kinases"? They are "serine-threonine kinases".
+- Name an aminoacid that can be modified via "sulfation". A: "Tyrosine".
+- Name an aminoacid that can be modified via "N-methylation". A: "Lysine".
+- Sirtuins, which play a role in post-translation modification, came from yeast (Sir2 gene). What does this name indicate? Sir2 stands for ... ? "Silent mating-type information regulation 2".
+- Die "Pyrrolysin-Biosynthese" benötigt, beziehungsweise geht aus von ...? "Zwei Lysinen".
+- We can group and categorize PTMs by something "new". Explain that. A: We can group the PTM by the "new function enabled via the particular covalent addition".
+- Die "SH2-Domäne" kann ... erkennen. A: "Phosphotyrosin".
+- Die "Ubiquitin ligase" (E3) heftet Ubiquitin an sein Substrat. Welches Enzym ist praktisch der Gegenspieler zu E3? Die "Isopeptidase".
+- Which "terminus" of a histone is more likely to be phosphorylated? The "N-Terminus" of the histone.
+- Bei der "Phosphorylierung von Aminosäuren" benötigen wir ATP aber auch ... was genau und warum? "Mg 2+"; dieses koordiniert 2 Sauerstoffe des ATP, um den Angriff eines "elektronenreichen Nukleophils" zu ermöglichen.
+- Name an "aminoacid residue" that is often "geranylgeranylated". A: "Cysteine residues".
+- Säugetiere haben wieviele Familien von "Ser/Thr-Proteinphosphatasen"? 2.
+- Warum interessieren sich auch Lebensmittelbetriebe für Testsysteme auf "Hydroxyprolin"? Da man damit "Betrug nachweisen kann", i. e. wenn der Hydroxyprolin-Gehalt in Fleisch zu niedrig ist.
+- Die Zuckermoleküle von "Dolicholphosphat" werden auf welche Aminosäure übertragen? "Asparagin".
+- Does "biotinylation" require energy? Yes - in the form of "ATP".
+- Welche Aminosäure ist die am häufigsten phosphorylierte? "Serin" ist die am häufigsten phosphorylierte Aminosäure. (Man kann sich dies merken, da Serin auch die am häufigsten vorkommende Aminosäure im menschlichen Genom ist.)
+- 2x Prenylgruppe in Verbindung ergibt ...? Eine "Farnesylgruppe".
+- Nenne eine PTM die mit dem Buchstaben "L" beginnt. A: "Lipidierung".
+- Phosphotyrosin wurde erst 1979 entdeckt. Wieso so spät? In einem Zellextrakt hat man einen viel stärkeren "Phosphothreonine-Peak", der den Phosphotyrosine-Anteil überdecken kann.
+- Gibt es "Sulfo-Serin"? Ja.
+- Trimethyl-Lysin 9 in H3 recruits which partner protein ... by binding to its chromodomain? A: It recruits the protein "HP1".
+- Bei der "Myristoylierung" wird was genau an das Protein angeheftet? Ein "C14-Acylrest".
+- In der Proteinchemie, was meinen wir mit dem Kürzel "pY"? "Phosphotyrosin".
+- How many of the 20 common proteinogenic amino acid side chains are modified post-translationally? 15.
+- Das kleine G-Proteinen "Arf" kann myristoyliert werden. Welche neue Fähigkeit erlang es dadurch? Es kann dadurch reversibel an das "Endoplasmatische Retikulum" binden.
+- Die "Myristoylierung" erfolgt an welchem Ende eines Proteins? "N-terminal".
+- Bei der Sulfatierung von Tyrosinen, wer ist der "Sulfat-Donor"? "PAPS" (3'-Phosphoadenosine-5'-phosphosulfate).
+- About n% of the genomes of higher eukaryotes can be dedicated to enzymes that carry out posttranslational modifications of the proteomes. A: "5%".
+- The "Ras GTPase superfamily" have members that can be prenylated on ... side chains? "Cys thiolate".
+- Bei der "Phosphorylierung", was genau wird angeheftet? Eine "PO3 (2-) Phosphatgruppe".
+- Name an aminoacid that can be modified via "C-hydroxylation". A: "Prolin", thus forming "4-Hydroxyproline".
+- Gib ein allgemeines Beispiel für eine "reversible PTM". A: Die "Proteinphosphorylierung".
+- Name three different post-translational modifications that occur at the aminoacid "lysine". A: (1) "N-Methylation" (2) "N-Acetylation" (3) "C-Hydroxylation"
+- The "methyl group" from "S-adenosylmethionine" (SAM) is most often transferred to the side chains of which two aminoacids? (1) "Lysin"   ("K") (2) "Arginin" ("R")
+- Wie verändern sich "Stickstoffatome", je mehr Methylgruppen sie tragen? "Stickstoff wird allgemein reaktiver", je mehr Methylgruppen an diesem Stickstoff-Atom befestigt sind.
+- Name an aminoacid that can be modified via "O-glycosylation". A: "Serine".
+- Wenn "Arginin" an den N-Terminus posttranslational angefügt wird, führt dies zu ...? Zum "gezielten Abbau".
+- Die "Proteintransnitrosylierung" erfolgt an welcher Aminosäure? "Cystein".
+- Nenne ein Enzym das durch eine "Liponsäure" modifiziert werden kann. A: Die "Pyruvat-Dehydrogenase".
+- Können "Acetylierungen" an Proteinen rückgängig gemacht werden? Ja.
+- The enzyme "N-myristoyltransferase" is necessary to add myristoyl-groups to a protein, but it requires the action of another enzyme before it can do its work. Which enzyme is that? The "methionine aminopeptidase".
+- Give two examples of "N-myristoylated proteins". A: (1) "HIV Gag protein" (2) "Protein kinase A"
+- Nenne zwei Enzyme der "terminalen Glykosylierung". A: (1) Glykosidase (2) Glykosyltransferase
+- Give an example for an aminoacid that can be "O-Glycosylated". A: "Serine" (or "Threonine").
+- "Tyrosin" kann sulfatiert werden. Welches Motiv ist dafür wahrscheinlich notwendig? Mehrere "negative Ladungen" in der Nachbarschaft eines Tyrosins, also etwa "bis zu 5 Glu/Asp-Reste".
+- Die "C-Glykosylierung" ist sehr selten. An welcher Aminosäure mag sie auftreten? "Tryptophan".
+- Nenne zwei "post-translationale Modifikationen", die mit dem Buchstaben "A" beginnen. A: (1) "Acetylierung" (2) "ADP-Ribosylierung"
+- Was sind "Sirtuine"? "Deacylases". URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Sirtuin
+- Name the most-well-studied example of "S-palmitoylation of cysteines" in the C-terminal region of proteins. A: The "Ras GTPase".
+- Bei der "Phosphorylierung von Proteinen", zum Beispiel an Serin, wer agiert hier als Nukleophil das unbedingt benötigt wird? Die "Hydroxyl-Gruppe", also "-OH", von Serin.
+- Name two organisms that have "phosphoHis" as part of their "phosphoproteomes". A: (1) "Bacteria" (2) "Fungi"
+- Nenne ein Beispiel für ein "sekretiertes Protein", das an "Tyrosin-Resten" sulfatiert wird. A: "Faktor VIII".
+- Kommt es im Zuge von "Proteinsplicing" zu einer "Umesterung"? Ja - und zwar zwischen "N-Extein" und "C-Extein".
+- 5 Aminosäuren haben keine PTMs. Welche? "V,A,L,I,V" (mnemoic: "valid"... "valif")
+- "Sulfurylation" depends on ... which cofactor? "PAPS".
+- Wie hat man in den 1950er/1960er Jahren posttranslationale Modifikationen an Proteinen nachgewiesen? Mit Hilfe von "Radioaktivität"; man hat einfach "heisses ATP" zwecks Markierung verwendet.
+- Why may "biotinylation" be important for a cell? It may allow the cell, respetively the enzyme, to "carry -CO2 groups"; in particular this is "important for CO2 fixation".
+- Die derzeit bekannten "Sulfatasen" ähneln welch anderem Enzym? Der "alkaline phosphatase".
+- Can tryptophan be "mannosylated"? Yes - at the C2 atom of its indole ring, although this modification is quite rare.
+- "Phosphatasen" können Phosphatgruppen abspalten und damit den Kinasen entgegenwirken. Was aber benötigen Phosphatasen noch, damit sie ihre Reaktion durchführen können? Eine "H2O Gruppe" - also "Wasser".
+- Name at the least three different glycosylation types. A: (1) "C-glycosylation" (2) "N-glycosylation" (3) "O-glycosylation"
+- "Sulfotransferasen" erzeugen sulfatierte ...-Reste in Proteinen? "Sulfatierte Tyrosin-Reste".
+- Gib ein Beispiel wo wir "Asn N-Methylierung" beobachten könnten. A: In "Phycobilisomen".
+- Wie nennen wir die "Modifikation mit Isoprenabkömmlingen" bei Proteinen? "Prenylierung".
+- Was ist die Hauptfunktion des "GPI-Ankers"? Die feste Verankerung von Glycoproteinen an der Außenseite der Plasmamembran.
+- Name an enzyme that is important for "palmitoylation". A: The "palmitoyl-S-protein transferase".
+- Nenne drei verschiedene "PTM-Datenbanken". A: (1) "UniProt" (2) "HPRD" (3) "Phospho.ELM"
+- Benötigt "Proteinspleißen" Energie? Nein.
+- "Histone acetyltransferasen" (HATs) können Acetylgruppen an ihr Substrat anheften - aber woher stammt diese Acetylgruppe? Von "Acetyl CoA".
+- How many different covalent modifications of aminoacids are known? More than 200.
+- Die "eukaroytischen S/T/Y-Kinasen" besitzen eine "ATP-Bindetasche", die welchem bakteriellen Protein ähnelt? Dem "Hsp90-Protein".
+- Name the five most common types of PTMs (covalent additions) to proteins. A: (1) "phosphorylation" (2) "acylation" (3) "alkylation" (4) "glycosylation" (5) "oxidation"
+- Nur welche zwei Gruppen von Proteinen können "Sulfotyrosin" als eine posttranslationale Modifikation erhalten? (1) "Membranproteine" (2) "Proteine, die sekretiert werden"
+- "Lipoylation" goes onto which amino acid normally? Onto a "Lysine".
+- Enzymes can gain catalytic function by being tethered to certain groups. Give three examples of such groups. A: (1) "biotinyl groups" (2) "lipoyl groups" (3) "phosphopantetheinyl groups"
+- What is "the most common posttranslational modification of proteins" in eukaryotes, aside from folding? "N-linked glycosylation".
+- Lysosomale Proteine werden modifiziert, um mit Rezeptoren in der Membran des Golgi-Apparates zu interagieren, und schließlich zu den Lysosomen zu gelangen. Welche Modifikation vor allem? A: "Saccharide".
+- Die "Analyse von Sulfatierungspositionen" erfolgt mit Hilfe welch zweier Techniken? (1) "Proteolyse" (2) "LC-MS"
+- Was meinen wir mit "TPSTasen"? Dies sind "Tyrosin Protein Sulfotransferasen".
+- Sometimes "phosphorylation sites" are masked transiently how ...? By the "reversible covalent modification" with the sugar "N-acetyl glucosamine".