search_biomodel 1.0.0 → 1.0.1

data/search_biomodel/ruby/1.8/gems/nokogiri-1.4.6/ext/nokogiri/depend

@@ -1,358 +0,0 @@
-html_document.o: html_document.c html_document.h nokogiri.h xml_io.h	\
-  xml_document.h html_entity_lookup.h xml_node.h xml_text.h		\
-  xml_cdata.h xml_attr.h xml_processing_instruction.h			\
-  xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
-  xml_node_set.h xml_dtd.h xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h	\
-  xml_entity_decl.h xml_xpath_context.h xml_element_content.h		\
-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
-  xml_reader.h html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h		\
-  xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h			\
-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-html_element_description.o: html_element_description.c			\
- html_element_description.h nokogiri.h xml_io.h xml_document.h		\
- html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h xml_text.h		\
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- xml_entity_decl.h xml_xpath_context.h xml_element_content.h		\
- xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
- xml_reader.h html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h		\
- xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h xml_namespace.h		\
- xml_encoding_handler.h
-
-html_entity_lookup.o: html_entity_lookup.c html_entity_lookup.h		\
-  nokogiri.h xml_io.h xml_document.h html_document.h xml_node.h		\
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-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
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-  xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h			\
-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
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- xml_reader.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h xml_schema.h		\
- xml_relax_ng.h html_element_description.h xml_namespace.h		\
- xml_encoding_handler.h
-
-nokogiri.o: nokogiri.c nokogiri.h xml_io.h xml_document.h		\
-  html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h xml_text.h		\
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-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
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-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_attr.o: xml_attr.c xml_attr.h nokogiri.h xml_io.h xml_document.h	\
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-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
-  xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h xml_reader.h			\
-  html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h	\
-  xml_schema.h xml_relax_ng.h html_element_description.h		\
-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_attribute_decl.o: xml_attribute_decl.c xml_attribute_decl.h		\
-  nokogiri.h xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h		\
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-  xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h			\
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-
-xml_cdata.o: xml_cdata.c xml_cdata.h nokogiri.h xml_io.h		\
-  xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h	\
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-
-xml_comment.o: xml_comment.c xml_comment.h nokogiri.h xml_io.h		\
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-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_document.o: xml_document.c xml_document.h nokogiri.h xml_io.h	\
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-
-xml_document_fragment.o: xml_document_fragment.c			\
-  xml_document_fragment.h nokogiri.h xml_io.h xml_document.h		\
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-  xml_reader.h html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h		\
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-
-xml_element_content.o: xml_element_content.c xml_element_content.h	\
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-  xml_xpath_context.h xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h		\
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-
-xml_element_decl.o: xml_element_decl.c xml_element_decl.h nokogiri.h	\
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-
-xml_encoding_handler.o: xml_encoding_handler.c xml_encoding_handler.h	\
-  nokogiri.h xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h		\
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-  xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h			\
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-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
-  xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h xml_reader.h			\
-  html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h	\
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-  xml_namespace.h
-
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-  xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h	\
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-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_entity_reference.o: xml_entity_reference.c xml_entity_reference.h	\
-  nokogiri.h xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h		\
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-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
-  xml_reader.h html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h		\
-  xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h			\
-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_io.o: xml_io.c xml_io.h nokogiri.h xml_document.h			\
-  html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h xml_text.h		\
-  xml_cdata.h xml_attr.h xml_processing_instruction.h			\
-  xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
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-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
-  xml_reader.h html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h		\
-  xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h			\
-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_namespace.o: xml_namespace.c xml_namespace.h nokogiri.h xml_io.h	\
-  xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h	\
-  xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h xml_processing_instruction.h	\
-  xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
-  xml_node_set.h xml_dtd.h xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h	\
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-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
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-
-xml_node.o: xml_node.c xml_node.h nokogiri.h xml_io.h xml_document.h	\
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-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
-  xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h xml_reader.h			\
-  html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h	\
-  xml_schema.h xml_relax_ng.h html_element_description.h		\
-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_node_set.o: xml_node_set.c xml_node_set.h nokogiri.h xml_io.h	\
-  xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h	\
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-  xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
-  xml_dtd.h xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h xml_entity_decl.h	\
-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
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-  html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h	\
-  xml_schema.h xml_relax_ng.h html_element_description.h		\
-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_processing_instruction.o: xml_processing_instruction.c		\
- xml_processing_instruction.h nokogiri.h xml_io.h xml_document.h	\
- html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h xml_text.h		\
- xml_cdata.h xml_attr.h xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h	\
- xml_comment.h xml_node_set.h xml_dtd.h xml_attribute_decl.h		\
- xml_element_decl.h xml_entity_decl.h xml_xpath_context.h		\
- xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h	\
- xml_sax_push_parser.h xml_reader.h html_sax_parser_context.h		\
- xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h	\
- html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_reader.o: xml_reader.c xml_reader.h nokogiri.h xml_io.h		\
-  xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h	\
-  xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h xml_processing_instruction.h	\
-  xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
-  xml_node_set.h xml_dtd.h xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h	\
-  xml_entity_decl.h xml_xpath_context.h xml_element_content.h		\
-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
-  html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h	\
-  xml_schema.h xml_relax_ng.h html_element_description.h		\
-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_relax_ng.o: xml_relax_ng.c xml_relax_ng.h nokogiri.h xml_io.h	\
-  xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h	\
-  xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h xml_processing_instruction.h	\
-  xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
-  xml_node_set.h xml_dtd.h xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h	\
-  xml_entity_decl.h xml_xpath_context.h xml_element_content.h		\
-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
-  xml_reader.h html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h		\
-  xml_syntax_error.h xml_schema.h html_element_description.h		\
-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_sax_parser.o: xml_sax_parser.c xml_sax_parser.h nokogiri.h		\
-  xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h		\
-  xml_node.h xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h				\
-  xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h			\
-  xml_document_fragment.h xml_comment.h xml_node_set.h xml_dtd.h	\
-  xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h xml_entity_decl.h		\
-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
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-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_sax_parser_context.o: xml_sax_parser_context.c			\
- xml_sax_parser_context.h nokogiri.h xml_io.h xml_document.h		\
- html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h xml_text.h		\
- xml_cdata.h xml_attr.h xml_processing_instruction.h			\
- xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
- xml_node_set.h xml_dtd.h xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h	\
- xml_entity_decl.h xml_xpath_context.h xml_element_content.h		\
- xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h xml_reader.h			\
- html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h		\
- xml_schema.h xml_relax_ng.h html_element_description.h			\
- xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_sax_push_parser.o: xml_sax_push_parser.c xml_sax_push_parser.h	\
-  nokogiri.h xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h		\
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-  xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h			\
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-  xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h xml_entity_decl.h		\
-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
-  xml_sax_parser.h xml_reader.h html_sax_parser_context.h		\
-  xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h	\
-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_schema.o: xml_schema.c xml_schema.h nokogiri.h xml_io.h		\
-  xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h	\
-  xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h xml_processing_instruction.h	\
-  xml_entity_reference.h xml_document_fragment.h xml_comment.h		\
-  xml_node_set.h xml_dtd.h xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h	\
-  xml_entity_decl.h xml_xpath_context.h xml_element_content.h		\
-  xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h	\
-  xml_reader.h html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h		\
-  xml_syntax_error.h xml_relax_ng.h html_element_description.h		\
-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_syntax_error.o: xml_syntax_error.c xml_syntax_error.h nokogiri.h	\
-  xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h		\
-  xml_node.h xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h				\
-  xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h			\
-  xml_document_fragment.h xml_comment.h xml_node_set.h xml_dtd.h	\
-  xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h xml_entity_decl.h		\
-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
-  xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h xml_reader.h			\
-  html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_schema.h		\
-  xml_relax_ng.h html_element_description.h xml_namespace.h		\
-  xml_encoding_handler.h
-
-xml_text.o: xml_text.c xml_text.h nokogiri.h xml_io.h xml_document.h	\
-  html_entity_lookup.h html_document.h xml_node.h xml_cdata.h		\
-  xml_attr.h xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h	\
-  xml_document_fragment.h xml_comment.h xml_node_set.h xml_dtd.h	\
-  xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h xml_entity_decl.h		\
-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
-  xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h xml_reader.h			\
-  html_sax_parser_context.h xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h	\
-  xml_schema.h xml_relax_ng.h html_element_description.h		\
-  xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xml_xpath_context.o: xml_xpath_context.c xml_xpath_context.h		\
-  nokogiri.h xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h		\
-  html_document.h xml_node.h xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h		\
-  xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h			\
-  xml_document_fragment.h xml_comment.h xml_node_set.h xml_dtd.h	\
-  xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h xml_entity_decl.h		\
-  xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h xml_sax_parser.h	\
-  xml_sax_push_parser.h xml_reader.h html_sax_parser_context.h		\
-  xslt_stylesheet.h xml_syntax_error.h xml_schema.h xml_relax_ng.h	\
-  html_element_description.h xml_namespace.h xml_encoding_handler.h
-
-xslt_stylesheet.o: xslt_stylesheet.c xslt_stylesheet.h nokogiri.h	\
-  xml_io.h xml_document.h html_entity_lookup.h html_document.h		\
-  xml_node.h xml_text.h xml_cdata.h xml_attr.h				\
-  xml_processing_instruction.h xml_entity_reference.h			\
-  xml_document_fragment.h xml_comment.h xml_node_set.h xml_dtd.h	\
-  xml_attribute_decl.h xml_element_decl.h xml_entity_decl.h		\
-  xml_xpath_context.h xml_element_content.h xml_sax_parser_context.h	\
-  xml_sax_parser.h xml_sax_push_parser.h xml_reader.h			\
-  html_sax_parser_context.h xml_syntax_error.h xml_schema.h		\
-  xml_relax_ng.h html_element_description.h xml_namespace.h		\
-  xml_encoding_handler.h

data/search_biomodel/ruby/1.8/gems/nokogiri-1.4.6/ext/nokogiri/extconf.rb

@@ -1,118 +0,0 @@
-ENV['RC_ARCHS'] = '' if RUBY_PLATFORM =~ /darwin/
-
-# :stopdoc:
-
-require 'mkmf'
-
-RbConfig::MAKEFILE_CONFIG['CC'] = ENV['CC'] if ENV['CC']
-
-ROOT = File.expand_path(File.join(File.dirname(__FILE__), '..', '..'))
-LIBDIR = Config::CONFIG['libdir']
-INCLUDEDIR = Config::CONFIG['includedir']
-
-if defined?(RUBY_ENGINE) && RUBY_ENGINE == 'macruby'
-  $LIBRUBYARG_STATIC.gsub!(/-static/, '')
-end
-
-$CFLAGS << " #{ENV["CFLAGS"]}"
-$LIBS << " #{ENV["LIBS"]}"
-
-if Config::CONFIG['target_os'] == 'mingw32' || Config::CONFIG['target_os'] =~ /mswin32/
-  $CFLAGS << " -DXP_WIN -DXP_WIN32 -DUSE_INCLUDED_VASPRINTF"
-elsif Config::CONFIG['target_os'] =~ /solaris/
-  $CFLAGS << " -DUSE_INCLUDED_VASPRINTF"
-else
-  $CFLAGS << " -g -DXP_UNIX"
-end
-
-if RbConfig::MAKEFILE_CONFIG['CC'] =~ /mingw/
-  $CFLAGS << " -DIN_LIBXML"
-end
-
-if RbConfig::MAKEFILE_CONFIG['CC'] =~ /gcc/
-  $CFLAGS << " -O3 -Wall -Wcast-qual -Wwrite-strings -Wconversion -Wmissing-noreturn -Winline"
-end
-
-if Config::CONFIG['target_os'] =~ /mswin32/
-  lib_prefix = 'lib'
-
-  # There's no default include/lib dir on Windows. Let's just add the Ruby ones
-  # and resort on the search path specified by INCLUDE and LIB environment
-  # variables
-  HEADER_DIRS = [INCLUDEDIR]
-  LIB_DIRS = [LIBDIR]
-  XML2_HEADER_DIRS = [File.join(INCLUDEDIR, "libxml2"), INCLUDEDIR]
-
-else
-  lib_prefix = ''
-
-  HEADER_DIRS = [
-    # First search /opt/local for macports
-    '/opt/local/include',
-
-    # Then search /usr/local for people that installed from source
-    '/usr/local/include',
-
-    # Check the ruby install locations
-    INCLUDEDIR,
-
-    # Finally fall back to /usr
-    '/usr/include',
-    '/usr/include/libxml2',
-  ]
-
-  LIB_DIRS = [
-    # First search /opt/local for macports
-    '/opt/local/lib',
-
-    # Then search /usr/local for people that installed from source
-    '/usr/local/lib',
-
-    # Check the ruby install locations
-    LIBDIR,
-
-    # Finally fall back to /usr
-    '/usr/lib',
-  ]
-
-  XML2_HEADER_DIRS = [
-    '/opt/local/include/libxml2',
-    '/usr/local/include/libxml2',
-    File.join(INCLUDEDIR, "libxml2")
-  ] + HEADER_DIRS
-end
-
-dir_config('zlib', HEADER_DIRS, LIB_DIRS)
-dir_config('iconv', HEADER_DIRS, LIB_DIRS)
-dir_config('xml2', XML2_HEADER_DIRS, LIB_DIRS)
-dir_config('xslt', HEADER_DIRS, LIB_DIRS)
-
-def asplode(lib)
-  abort "-----\n#{lib} is missing.  please visit http://nokogiri.org/tutorials/installing_nokogiri.html for help with installing dependencies.\n-----"
-end
-
-pkg_config('libxslt') if RUBY_PLATFORM =~ /mingw/
-
-asplode "libxml2"  unless find_header('libxml/parser.h')
-asplode "libxslt"  unless find_header('libxslt/xslt.h')
-asplode "libexslt" unless find_header('libexslt/exslt.h')
-asplode "libiconv" unless have_func('iconv_open', 'iconv.h') or have_library('iconv', 'iconv_open', 'iconv.h')
-asplode "libxml2"  unless find_library("#{lib_prefix}xml2", 'xmlParseDoc')
-asplode "libxslt"  unless find_library("#{lib_prefix}xslt", 'xsltParseStylesheetDoc')
-asplode "libexslt" unless find_library("#{lib_prefix}exslt", 'exsltFuncRegister')
-
-have_func 'xmlFirstElementChild'
-have_func('xmlRelaxNGSetParserStructuredErrors')
-have_func('xmlRelaxNGSetParserStructuredErrors')
-have_func('xmlRelaxNGSetValidStructuredErrors')
-have_func('xmlSchemaSetValidStructuredErrors')
-have_func('xmlSchemaSetParserStructuredErrors')
-
-if ENV['CPUPROFILE']
-  unless find_library('profiler', 'ProfilerEnable', *LIB_DIRS)
-    abort "google performance tools are not installed"
-  end
-end
-
-create_makefile('nokogiri/nokogiri')
-# :startdoc:

data/search_biomodel/ruby/1.8/gems/nokogiri-1.4.6/ext/nokogiri/html_document.c

@@ -1,154 +0,0 @@
-#include <html_document.h>
-
-/*
- * call-seq:
- *  new
- *
- * Create a new document
- */
-static VALUE new(int argc, VALUE *argv, VALUE klass)
-{
-  VALUE uri, external_id, rest, rb_doc;
-  htmlDocPtr doc;
-
-  rb_scan_args(argc, argv, "0*", &rest);
-  uri         = rb_ary_entry(rest, (long)0);
-  external_id = rb_ary_entry(rest, (long)1);
-
-  doc = htmlNewDoc(
-      RTEST(uri) ? (const xmlChar *)StringValuePtr(uri) : NULL,
-      RTEST(external_id) ? (const xmlChar *)StringValuePtr(external_id) : NULL
-  );
-  rb_doc = Nokogiri_wrap_xml_document(klass, doc);
-  rb_obj_call_init(rb_doc, argc, argv);
-  return rb_doc ;
-}
-
-/*
- * call-seq:
- *  read_io(io, url, encoding, options)
- *
- * Read the HTML document from +io+ with given +url+, +encoding+,
- * and +options+.  See Nokogiri::HTML.parse
- */
-static VALUE read_io( VALUE klass,
-                      VALUE io,
-                      VALUE url,
-                      VALUE encoding,
-                      VALUE options )
-{
-  const char * c_url    = NIL_P(url)      ? NULL : StringValuePtr(url);
-  const char * c_enc    = NIL_P(encoding) ? NULL : StringValuePtr(encoding);
-  VALUE error_list      = rb_ary_new();
-  VALUE document;
-  htmlDocPtr doc;
-
-  xmlResetLastError();
-  xmlSetStructuredErrorFunc((void *)error_list, Nokogiri_error_array_pusher);
-
-  doc = htmlReadIO(
-      io_read_callback,
-      io_close_callback,
-      (void *)io,
-      c_url,
-      c_enc,
-      (int)NUM2INT(options)
-  );
-  xmlSetStructuredErrorFunc(NULL, NULL);
-
-  if(doc == NULL) {
-    xmlErrorPtr error;
-
-    xmlFreeDoc(doc);
-
-    error = xmlGetLastError();
-    if(error)
-      rb_exc_raise(Nokogiri_wrap_xml_syntax_error((VALUE)NULL, error));
-    else
-      rb_raise(rb_eRuntimeError, "Could not parse document");
-
-    return Qnil;
-  }
-
-  document = Nokogiri_wrap_xml_document(klass, doc);
-  rb_iv_set(document, "@errors", error_list);
-  return document;
-}
-
-/*
- * call-seq:
- *  read_memory(string, url, encoding, options)
- *
- * Read the HTML document contained in +string+ with given +url+, +encoding+,
- * and +options+.  See Nokogiri::HTML.parse
- */
-static VALUE read_memory( VALUE klass,
-                          VALUE string,
-                          VALUE url,
-                          VALUE encoding,
-                          VALUE options )
-{
-  const char * c_buffer = StringValuePtr(string);
-  const char * c_url    = NIL_P(url)      ? NULL : StringValuePtr(url);
-  const char * c_enc    = NIL_P(encoding) ? NULL : StringValuePtr(encoding);
-  int len               = (int)RSTRING_LEN(string);
-  VALUE error_list      = rb_ary_new();
-  VALUE document;
-  htmlDocPtr doc;
-
-  xmlResetLastError();
-  xmlSetStructuredErrorFunc((void *)error_list, Nokogiri_error_array_pusher);
-
-  doc = htmlReadMemory(c_buffer, len, c_url, c_enc, (int)NUM2INT(options));
-  xmlSetStructuredErrorFunc(NULL, NULL);
-
-  if(doc == NULL) {
-    xmlErrorPtr error;
-
-    xmlFreeDoc(doc);
-
-    error = xmlGetLastError();
-    if(error)
-      rb_exc_raise(Nokogiri_wrap_xml_syntax_error((VALUE)NULL, error));
-    else
-      rb_raise(rb_eRuntimeError, "Could not parse document");
-
-    return Qnil;
-  }
-
-  document = Nokogiri_wrap_xml_document(klass, doc);
-  rb_iv_set(document, "@errors", error_list);
-  return document;
-}
-
-/*
- * call-seq:
- *  type
- *
- * The type for this document
- */
-static VALUE type(VALUE self)
-{
-  htmlDocPtr doc;
-  Data_Get_Struct(self, xmlDoc, doc);
-  return INT2NUM((long)doc->type);
-}
-
-VALUE cNokogiriHtmlDocument ;
-void init_html_document()
-{
-  VALUE nokogiri  = rb_define_module("Nokogiri");
-  VALUE html      = rb_define_module_under(nokogiri, "HTML");
-  VALUE xml       = rb_define_module_under(nokogiri, "XML");
-  VALUE node      = rb_define_class_under(xml, "Node", rb_cObject);
-  VALUE xml_doc   = rb_define_class_under(xml, "Document", node);
-  VALUE klass     = rb_define_class_under(html, "Document", xml_doc);
-
-  cNokogiriHtmlDocument = klass;
-
-  rb_define_singleton_method(klass, "read_memory", read_memory, 4);
-  rb_define_singleton_method(klass, "read_io", read_io, 4);
-  rb_define_singleton_method(klass, "new", new, -1);
-
-  rb_define_method(klass, "type", type, 0);
-}

data/search_biomodel/ruby/1.8/gems/nokogiri-1.4.6/ext/nokogiri/html_document.h

@@ -1,10 +0,0 @@
-#ifndef NOKOGIRI_HTML_DOCUMENT
-#define NOKOGIRI_HTML_DOCUMENT
-
-#include <nokogiri.h>
-
-void init_html_document();
-
-extern VALUE cNokogiriHtmlDocument ;
-
-#endif