faiss 0.1.7 → 0.2.3

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  1. checksums.yaml +4 -4
  2. data/CHANGELOG.md +18 -0
  3. data/README.md +7 -7
  4. data/ext/faiss/ext.cpp +1 -1
  5. data/ext/faiss/extconf.rb +8 -2
  6. data/ext/faiss/index.cpp +102 -69
  7. data/ext/faiss/index_binary.cpp +24 -30
  8. data/ext/faiss/kmeans.cpp +20 -16
  9. data/ext/faiss/numo.hpp +867 -0
  10. data/ext/faiss/pca_matrix.cpp +13 -14
  11. data/ext/faiss/product_quantizer.cpp +23 -24
  12. data/ext/faiss/utils.cpp +10 -37
  13. data/ext/faiss/utils.h +2 -13
  14. data/lib/faiss/version.rb +1 -1
  15. data/lib/faiss.rb +0 -5
  16. data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
  17. data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
  18. data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +334 -195
  19. data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +88 -35
  20. data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
  21. data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
  22. data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
  23. data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
  24. data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +139 -164
  25. data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -22
  26. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
  27. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
  28. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
  29. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
  30. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
  31. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
  32. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
  33. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
  34. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
  35. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
  36. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
  37. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
  38. data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +116 -147
  39. data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +35 -46
  40. data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.cpp +372 -348
  41. data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
  42. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +474 -454
  43. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +146 -113
  44. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +248 -250
  45. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
  46. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +457 -516
  47. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +74 -66
  48. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
  49. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
  50. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
  51. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
  52. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +125 -133
  53. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +19 -21
  54. data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +75 -96
  55. data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +21 -26
  56. data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
  57. data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
  58. data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +231 -0
  59. data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
  60. data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +303 -0
  61. data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
  62. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +405 -464
  63. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -67
  64. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
  65. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
  66. data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
  67. data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
  68. data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +115 -131
  69. data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +22 -23
  70. data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
  71. data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
  72. data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.cpp +291 -0
  73. data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.h +152 -0
  74. data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +120 -155
  75. data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -45
  76. data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
  77. data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
  78. data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
  79. data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
  80. data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
  81. data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
  82. data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
  83. data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +652 -474
  84. data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +61 -89
  85. data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +77 -73
  86. data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
  87. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
  88. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
  89. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +197 -170
  90. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
  91. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
  92. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
  93. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
  94. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
  95. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
  96. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
  97. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
  98. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
  99. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
  100. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
  101. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
  102. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
  103. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
  104. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
  105. data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
  106. data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
  107. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
  108. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
  109. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
  110. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
  111. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
  112. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
  113. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
  114. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
  115. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
  116. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
  117. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
  118. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
  119. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
  120. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
  121. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
  122. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
  123. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
  124. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
  125. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
  126. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
  127. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
  128. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
  129. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
  130. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
  131. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
  132. data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +270 -0
  133. data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +115 -0
  134. data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
  135. data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
  136. data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
  137. data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
  138. data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
  139. data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +595 -611
  140. data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
  141. data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +672 -0
  142. data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +172 -0
  143. data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
  144. data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
  145. data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +682 -0
  146. data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
  147. data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
  148. data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
  149. data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
  150. data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
  151. data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h +76 -87
  152. data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp +448 -0
  153. data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h +130 -0
  154. data/vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h +96 -132
  155. data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +648 -701
  156. data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
  157. data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
  158. data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
  159. data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +547 -479
  160. data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +497 -407
  161. data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +75 -94
  162. data/vendor/faiss/faiss/impl/io.h +31 -41
  163. data/vendor/faiss/faiss/impl/io_macros.h +40 -29
  164. data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
  165. data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
  166. data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
  167. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
  168. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
  169. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
  170. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
  171. data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
  172. data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +269 -218
  173. data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +6 -7
  174. data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
  175. data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
  176. data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
  177. data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
  178. data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
  179. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
  180. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
  181. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
  182. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
  183. data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
  184. data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
  185. data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
  186. data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
  187. data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
  188. data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
  189. data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
  190. data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
  191. data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
  192. data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +301 -310
  193. data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +133 -118
  194. data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +456 -516
  195. data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
  196. data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
  197. data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
  198. data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h +260 -209
  199. data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
  200. data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
  201. data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
  202. data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
  203. data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
  204. data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
  205. data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
  206. data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
  207. data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
  208. data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h +4 -2
  209. data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h +88 -85
  210. data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h +226 -165
  211. data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h +832 -0
  212. data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp +304 -287
  213. data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.h +53 -48
  214. metadata +26 -12
  215. data/lib/faiss/index.rb +0 -20
  216. data/lib/faiss/index_binary.rb +0 -20
  217. data/lib/faiss/kmeans.rb +0 -15
  218. data/lib/faiss/pca_matrix.rb +0 -15
  219. data/lib/faiss/product_quantizer.rb +0 -22
@@ -9,142 +9,130 @@
9
9
 
10
10
  #include <faiss/invlists/DirectMap.h>
11
11
 
12
- #include <cstdio>
13
12
  #include <cassert>
13
+ #include <cstdio>
14
14
 
15
- #include <faiss/impl/FaissAssert.h>
16
15
  #include <faiss/impl/AuxIndexStructures.h>
16
+ #include <faiss/impl/FaissAssert.h>
17
17
 
18
18
  namespace faiss {
19
19
 
20
- DirectMap::DirectMap(): type(NoMap)
21
- {}
20
+ DirectMap::DirectMap() : type(NoMap) {}
22
21
 
23
- void DirectMap::set_type (Type new_type, const InvertedLists *invlists, size_t ntotal) {
24
-
25
- FAISS_THROW_IF_NOT (new_type == NoMap || new_type == Array ||
26
- new_type == Hashtable);
22
+ void DirectMap::set_type(
23
+ Type new_type,
24
+ const InvertedLists* invlists,
25
+ size_t ntotal) {
26
+ FAISS_THROW_IF_NOT(
27
+ new_type == NoMap || new_type == Array || new_type == Hashtable);
27
28
 
28
29
  if (new_type == type) {
29
30
  // nothing to do
30
31
  return;
31
32
  }
32
33
 
33
- array.clear ();
34
- hashtable.clear ();
34
+ array.clear();
35
+ hashtable.clear();
35
36
  type = new_type;
36
37
 
37
38
  if (new_type == NoMap) {
38
39
  return;
39
40
  } else if (new_type == Array) {
40
- array.resize (ntotal, -1);
41
+ array.resize(ntotal, -1);
41
42
  } else if (new_type == Hashtable) {
42
- hashtable.reserve (ntotal);
43
+ hashtable.reserve(ntotal);
43
44
  }
44
45
 
45
46
  for (size_t key = 0; key < invlists->nlist; key++) {
46
- size_t list_size = invlists->list_size (key);
47
- InvertedLists::ScopedIds idlist (invlists, key);
47
+ size_t list_size = invlists->list_size(key);
48
+ InvertedLists::ScopedIds idlist(invlists, key);
48
49
 
49
50
  if (new_type == Array) {
50
51
  for (long ofs = 0; ofs < list_size; ofs++) {
51
- FAISS_THROW_IF_NOT_MSG (
52
- 0 <= idlist [ofs] && idlist[ofs] < ntotal,
53
- "direct map supported only for seuquential ids");
54
- array [idlist [ofs]] = lo_build(key, ofs);
52
+ FAISS_THROW_IF_NOT_MSG(
53
+ 0 <= idlist[ofs] && idlist[ofs] < ntotal,
54
+ "direct map supported only for seuquential ids");
55
+ array[idlist[ofs]] = lo_build(key, ofs);
55
56
  }
56
57
  } else if (new_type == Hashtable) {
57
58
  for (long ofs = 0; ofs < list_size; ofs++) {
58
- hashtable [idlist [ofs]] = lo_build(key, ofs);
59
+ hashtable[idlist[ofs]] = lo_build(key, ofs);
59
60
  }
60
61
  }
61
62
  }
62
63
  }
63
64
 
64
- void DirectMap::clear()
65
- {
66
- array.clear ();
67
- hashtable.clear ();
65
+ void DirectMap::clear() {
66
+ array.clear();
67
+ hashtable.clear();
68
68
  }
69
69
 
70
-
71
- DirectMap::idx_t DirectMap::get (idx_t key) const
72
- {
70
+ DirectMap::idx_t DirectMap::get(idx_t key) const {
73
71
  if (type == Array) {
74
- FAISS_THROW_IF_NOT_MSG (
75
- key >= 0 && key < array.size(), "invalid key"
76
- );
72
+ FAISS_THROW_IF_NOT_MSG(key >= 0 && key < array.size(), "invalid key");
77
73
  idx_t lo = array[key];
78
74
  FAISS_THROW_IF_NOT_MSG(lo >= 0, "-1 entry in direct_map");
79
75
  return lo;
80
76
  } else if (type == Hashtable) {
81
- auto res = hashtable.find (key);
82
- FAISS_THROW_IF_NOT_MSG (res != hashtable.end(), "key not found");
77
+ auto res = hashtable.find(key);
78
+ FAISS_THROW_IF_NOT_MSG(res != hashtable.end(), "key not found");
83
79
  return res->second;
84
80
  } else {
85
- FAISS_THROW_MSG ("direct map not initialized");
81
+ FAISS_THROW_MSG("direct map not initialized");
86
82
  }
87
83
  }
88
84
 
89
-
90
-
91
- void DirectMap::add_single_id (idx_t id, idx_t list_no, size_t offset)
92
- {
93
- if (type == NoMap) return;
85
+ void DirectMap::add_single_id(idx_t id, idx_t list_no, size_t offset) {
86
+ if (type == NoMap)
87
+ return;
94
88
 
95
89
  if (type == Array) {
96
- assert (id == array.size());
90
+ assert(id == array.size());
97
91
  if (list_no >= 0) {
98
- array.push_back (lo_build (list_no, offset));
92
+ array.push_back(lo_build(list_no, offset));
99
93
  } else {
100
- array.push_back (-1);
94
+ array.push_back(-1);
101
95
  }
102
96
  } else if (type == Hashtable) {
103
97
  if (list_no >= 0) {
104
- hashtable[id] = lo_build (list_no, offset);
98
+ hashtable[id] = lo_build(list_no, offset);
105
99
  }
106
100
  }
107
-
108
101
  }
109
102
 
110
- void DirectMap::check_can_add (const idx_t *ids) {
103
+ void DirectMap::check_can_add(const idx_t* ids) {
111
104
  if (type == Array && ids) {
112
- FAISS_THROW_MSG ("cannot have array direct map and add with ids");
105
+ FAISS_THROW_MSG("cannot have array direct map and add with ids");
113
106
  }
114
107
  }
115
108
 
116
109
  /********************* DirectMapAdd implementation */
117
110
 
118
-
119
- DirectMapAdd::DirectMapAdd (DirectMap &direct_map, size_t n, const idx_t *xids):
120
- direct_map(direct_map), type(direct_map.type), n(n), xids(xids)
121
- {
122
- if (type == DirectMap::Array) {
123
- FAISS_THROW_IF_NOT (xids == nullptr);
111
+ DirectMapAdd::DirectMapAdd(DirectMap& direct_map, size_t n, const idx_t* xids)
112
+ : direct_map(direct_map), type(direct_map.type), n(n), xids(xids) {
113
+ if (type == DirectMap::Array) {
114
+ FAISS_THROW_IF_NOT(xids == nullptr);
124
115
  ntotal = direct_map.array.size();
125
- direct_map.array.resize (ntotal + n, -1);
116
+ direct_map.array.resize(ntotal + n, -1);
126
117
  } else if (type == DirectMap::Hashtable) {
127
118
  // can't parallel update hashtable so use temp array
128
- all_ofs.resize (n, -1);
119
+ all_ofs.resize(n, -1);
129
120
  }
130
121
  }
131
122
 
132
-
133
- void DirectMapAdd::add (size_t i, idx_t list_no, size_t ofs)
134
- {
123
+ void DirectMapAdd::add(size_t i, idx_t list_no, size_t ofs) {
135
124
  if (type == DirectMap::Array) {
136
- direct_map.array [ntotal + i] = lo_build (list_no, ofs);
125
+ direct_map.array[ntotal + i] = lo_build(list_no, ofs);
137
126
  } else if (type == DirectMap::Hashtable) {
138
- all_ofs [i] = lo_build (list_no, ofs);
127
+ all_ofs[i] = lo_build(list_no, ofs);
139
128
  }
140
129
  }
141
130
 
142
- DirectMapAdd::~DirectMapAdd ()
143
- {
131
+ DirectMapAdd::~DirectMapAdd() {
144
132
  if (type == DirectMap::Hashtable) {
145
133
  for (int i = 0; i < n; i++) {
146
134
  idx_t id = xids ? xids[i] : ntotal + i;
147
- direct_map.hashtable [id] = all_ofs [i];
135
+ direct_map.hashtable[id] = all_ofs[i];
148
136
  }
149
137
  }
150
138
  }
@@ -154,9 +142,7 @@ DirectMapAdd::~DirectMapAdd ()
154
142
  using ScopedCodes = InvertedLists::ScopedCodes;
155
143
  using ScopedIds = InvertedLists::ScopedIds;
156
144
 
157
-
158
- size_t DirectMap::remove_ids(const IDSelector& sel, InvertedLists *invlists)
159
- {
145
+ size_t DirectMap::remove_ids(const IDSelector& sel, InvertedLists* invlists) {
160
146
  size_t nlist = invlists->nlist;
161
147
  std::vector<idx_t> toremove(nlist);
162
148
 
@@ -166,16 +152,16 @@ size_t DirectMap::remove_ids(const IDSelector& sel, InvertedLists *invlists)
166
152
  // exhaustive scan of IVF
167
153
  #pragma omp parallel for
168
154
  for (idx_t i = 0; i < nlist; i++) {
169
- idx_t l0 = invlists->list_size (i), l = l0, j = 0;
170
- ScopedIds idsi (invlists, i);
155
+ idx_t l0 = invlists->list_size(i), l = l0, j = 0;
156
+ ScopedIds idsi(invlists, i);
171
157
  while (j < l) {
172
- if (sel.is_member (idsi[j])) {
158
+ if (sel.is_member(idsi[j])) {
173
159
  l--;
174
- invlists->update_entry (
175
- i, j,
176
- invlists->get_single_id (i, l),
177
- ScopedCodes (invlists, i, l).get()
178
- );
160
+ invlists->update_entry(
161
+ i,
162
+ j,
163
+ invlists->get_single_id(i, l),
164
+ ScopedCodes(invlists, i, l).get());
179
165
  } else {
180
166
  j++;
181
167
  }
@@ -191,30 +177,28 @@ size_t DirectMap::remove_ids(const IDSelector& sel, InvertedLists *invlists)
191
177
  }
192
178
  }
193
179
  } else if (type == Hashtable) {
194
- const IDSelectorArray *sela =
195
- dynamic_cast<const IDSelectorArray*>(&sel);
196
- FAISS_THROW_IF_NOT_MSG (
197
- sela,
198
- "remove with hashtable works only with IDSelectorArray"
199
- );
180
+ const IDSelectorArray* sela =
181
+ dynamic_cast<const IDSelectorArray*>(&sel);
182
+ FAISS_THROW_IF_NOT_MSG(
183
+ sela, "remove with hashtable works only with IDSelectorArray");
200
184
 
201
185
  for (idx_t i = 0; i < sela->n; i++) {
202
186
  idx_t id = sela->ids[i];
203
- auto res = hashtable.find (id);
187
+ auto res = hashtable.find(id);
204
188
  if (res != hashtable.end()) {
205
- size_t list_no = lo_listno (res->second);
206
- size_t offset = lo_offset (res->second);
207
- idx_t last = invlists->list_size (list_no) - 1;
208
- hashtable.erase (res);
189
+ size_t list_no = lo_listno(res->second);
190
+ size_t offset = lo_offset(res->second);
191
+ idx_t last = invlists->list_size(list_no) - 1;
192
+ hashtable.erase(res);
209
193
  if (offset < last) {
210
- idx_t last_id = invlists->get_single_id (list_no, last);
211
- invlists->update_entry (
212
- list_no, offset,
213
- last_id,
214
- ScopedCodes (invlists, list_no, last).get()
215
- );
194
+ idx_t last_id = invlists->get_single_id(list_no, last);
195
+ invlists->update_entry(
196
+ list_no,
197
+ offset,
198
+ last_id,
199
+ ScopedCodes(invlists, list_no, last).get());
216
200
  // update hash entry for last element
217
- hashtable [last_id] = list_no << 32 | offset;
201
+ hashtable[last_id] = list_no << 32 | offset;
218
202
  }
219
203
  invlists->resize(list_no, last);
220
204
  nremove++;
@@ -227,41 +211,41 @@ size_t DirectMap::remove_ids(const IDSelector& sel, InvertedLists *invlists)
227
211
  return nremove;
228
212
  }
229
213
 
230
- void DirectMap::update_codes (InvertedLists *invlists,
231
- int n, const idx_t *ids,
232
- const idx_t *assign,
233
- const uint8_t *codes)
234
- {
235
- FAISS_THROW_IF_NOT (type == Array);
214
+ void DirectMap::update_codes(
215
+ InvertedLists* invlists,
216
+ int n,
217
+ const idx_t* ids,
218
+ const idx_t* assign,
219
+ const uint8_t* codes) {
220
+ FAISS_THROW_IF_NOT(type == Array);
236
221
 
237
222
  size_t code_size = invlists->code_size;
238
223
 
239
224
  for (size_t i = 0; i < n; i++) {
240
225
  idx_t id = ids[i];
241
- FAISS_THROW_IF_NOT_MSG (0 <= id && id < array.size(),
242
- "id to update out of range");
226
+ FAISS_THROW_IF_NOT_MSG(
227
+ 0 <= id && id < array.size(), "id to update out of range");
243
228
  { // remove old one
244
- idx_t dm = array [id];
245
- int64_t ofs = lo_offset (dm);
246
- int64_t il = lo_listno (dm);
247
- size_t l = invlists->list_size (il);
229
+ idx_t dm = array[id];
230
+ int64_t ofs = lo_offset(dm);
231
+ int64_t il = lo_listno(dm);
232
+ size_t l = invlists->list_size(il);
248
233
  if (ofs != l - 1) { // move l - 1 to ofs
249
- int64_t id2 = invlists->get_single_id (il, l - 1);
250
- array[id2] = lo_build (il, ofs);
251
- invlists->update_entry (il, ofs, id2,
252
- invlists->get_single_code (il, l - 1));
234
+ int64_t id2 = invlists->get_single_id(il, l - 1);
235
+ array[id2] = lo_build(il, ofs);
236
+ invlists->update_entry(
237
+ il, ofs, id2, invlists->get_single_code(il, l - 1));
253
238
  }
254
- invlists->resize (il, l - 1);
239
+ invlists->resize(il, l - 1);
255
240
  }
256
241
  { // insert new one
257
242
  int64_t il = assign[i];
258
- size_t l = invlists->list_size (il);
259
- idx_t dm = lo_build (il, l);
260
- array [id] = dm;
261
- invlists->add_entry (il, id, codes + i * code_size);
243
+ size_t l = invlists->list_size(il);
244
+ idx_t dm = lo_build(il, l);
245
+ array[id] = dm;
246
+ invlists->add_entry(il, id, codes + i * code_size);
262
247
  }
263
248
  }
264
249
  }
265
250
 
266
-
267
- }
251
+ } // namespace faiss
@@ -13,21 +13,20 @@
13
13
  #include <faiss/invlists/InvertedLists.h>
14
14
  #include <unordered_map>
15
15
 
16
-
17
16
  namespace faiss {
18
17
 
19
18
  // When offsets list id + offset are encoded in an uint64
20
19
  // we call this LO = list-offset
21
20
 
22
- inline uint64_t lo_build (uint64_t list_id, uint64_t offset) {
23
- return list_id << 32 | offset;
21
+ inline uint64_t lo_build(uint64_t list_id, uint64_t offset) {
22
+ return list_id << 32 | offset;
24
23
  }
25
24
 
26
- inline uint64_t lo_listno (uint64_t lo) {
25
+ inline uint64_t lo_listno(uint64_t lo) {
27
26
  return lo >> 32;
28
27
  }
29
28
 
30
- inline uint64_t lo_offset (uint64_t lo) {
29
+ inline uint64_t lo_offset(uint64_t lo) {
31
30
  return lo & 0xffffffff;
32
31
  }
33
32
 
@@ -38,36 +37,38 @@ struct DirectMap {
38
37
  typedef Index::idx_t idx_t;
39
38
 
40
39
  enum Type {
41
- NoMap = 0, // default
42
- Array = 1, // sequential ids (only for add, no add_with_ids)
43
- Hashtable = 2 // arbitrary ids
40
+ NoMap = 0, // default
41
+ Array = 1, // sequential ids (only for add, no add_with_ids)
42
+ Hashtable = 2 // arbitrary ids
44
43
  };
45
44
  Type type;
46
45
 
47
46
  /// map for direct access to the elements. Map ids to LO-encoded entries.
48
- std::vector <idx_t> array;
49
- std::unordered_map <idx_t, idx_t> hashtable;
47
+ std::vector<idx_t> array;
48
+ std::unordered_map<idx_t, idx_t> hashtable;
50
49
 
51
50
  DirectMap();
52
51
 
53
52
  /// set type and initialize
54
- void set_type (Type new_type, const InvertedLists *invlists, size_t ntotal);
53
+ void set_type(Type new_type, const InvertedLists* invlists, size_t ntotal);
55
54
 
56
55
  /// get an entry
57
- idx_t get (idx_t id) const;
56
+ idx_t get(idx_t id) const;
58
57
 
59
58
  /// for quick checks
60
- bool no () const {return type == NoMap; }
59
+ bool no() const {
60
+ return type == NoMap;
61
+ }
61
62
 
62
63
  /**
63
64
  * update the direct_map
64
65
  */
65
66
 
66
67
  /// throw if Array and ids is not NULL
67
- void check_can_add (const idx_t *ids);
68
+ void check_can_add(const idx_t* ids);
68
69
 
69
70
  /// non thread-safe version
70
- void add_single_id (idx_t id, idx_t list_no, size_t offset);
71
+ void add_single_id(idx_t id, idx_t list_no, size_t offset);
71
72
 
72
73
  /// remove all entries
73
74
  void clear();
@@ -77,44 +78,39 @@ struct DirectMap {
77
78
  */
78
79
 
79
80
  /// remove ids from the InvertedLists, possibly using the direct map
80
- size_t remove_ids(const IDSelector& sel, InvertedLists *invlists);
81
+ size_t remove_ids(const IDSelector& sel, InvertedLists* invlists);
81
82
 
82
83
  /// update entries, using the direct map
83
- void update_codes (InvertedLists *invlists,
84
- int n, const idx_t *ids,
85
- const idx_t *list_nos,
86
- const uint8_t *codes);
87
-
88
-
89
-
84
+ void update_codes(
85
+ InvertedLists* invlists,
86
+ int n,
87
+ const idx_t* ids,
88
+ const idx_t* list_nos,
89
+ const uint8_t* codes);
90
90
  };
91
91
 
92
92
  /// Thread-safe way of updating the direct_map
93
93
  struct DirectMapAdd {
94
-
95
94
  typedef Index::idx_t idx_t;
96
95
 
97
96
  using Type = DirectMap::Type;
98
97
 
99
- DirectMap &direct_map;
98
+ DirectMap& direct_map;
100
99
  DirectMap::Type type;
101
100
  size_t ntotal;
102
101
  size_t n;
103
- const idx_t *xids;
102
+ const idx_t* xids;
104
103
 
105
104
  std::vector<idx_t> all_ofs;
106
105
 
107
- DirectMapAdd (DirectMap &direct_map, size_t n, const idx_t *xids);
106
+ DirectMapAdd(DirectMap& direct_map, size_t n, const idx_t* xids);
108
107
 
109
108
  /// add vector i (with id xids[i]) at list_no and offset
110
- void add (size_t i, idx_t list_no, size_t offset);
109
+ void add(size_t i, idx_t list_no, size_t offset);
111
110
 
112
- ~DirectMapAdd ();
111
+ ~DirectMapAdd();
113
112
  };
114
113
 
115
-
116
-
117
- }
118
-
114
+ } // namespace faiss
119
115
 
120
116
  #endif