faiss 0.1.7 → 0.2.3
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- checksums.yaml +4 -4
- data/CHANGELOG.md +18 -0
- data/README.md +7 -7
- data/ext/faiss/ext.cpp +1 -1
- data/ext/faiss/extconf.rb +8 -2
- data/ext/faiss/index.cpp +102 -69
- data/ext/faiss/index_binary.cpp +24 -30
- data/ext/faiss/kmeans.cpp +20 -16
- data/ext/faiss/numo.hpp +867 -0
- data/ext/faiss/pca_matrix.cpp +13 -14
- data/ext/faiss/product_quantizer.cpp +23 -24
- data/ext/faiss/utils.cpp +10 -37
- data/ext/faiss/utils.h +2 -13
- data/lib/faiss/version.rb +1 -1
- data/lib/faiss.rb +0 -5
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +334 -195
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +88 -35
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
- data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +139 -164
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -22
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +116 -147
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +35 -46
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.cpp +372 -348
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +474 -454
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +146 -113
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +248 -250
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +457 -516
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +74 -66
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +125 -133
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +19 -21
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +75 -96
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +21 -26
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +231 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +303 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +405 -464
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -67
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +115 -131
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +22 -23
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.cpp +291 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.h +152 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +120 -155
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -45
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
- data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +652 -474
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +61 -89
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +77 -73
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +197 -170
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +270 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +115 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +595 -611
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +672 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +172 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +682 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h +76 -87
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp +448 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h +130 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h +96 -132
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +648 -701
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +547 -479
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +497 -407
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +75 -94
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.h +31 -41
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io_macros.h +40 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
- data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
- data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +269 -218
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +6 -7
- data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +301 -310
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +133 -118
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +456 -516
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h +260 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h +4 -2
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h +88 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h +226 -165
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h +832 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp +304 -287
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.h +53 -48
- metadata +26 -12
- data/lib/faiss/index.rb +0 -20
- data/lib/faiss/index_binary.rb +0 -20
- data/lib/faiss/kmeans.rb +0 -15
- data/lib/faiss/pca_matrix.rb +0 -15
- data/lib/faiss/product_quantizer.rb +0 -22
@@ -17,6 +17,7 @@
|
|
17
17
|
#define FAISS_utils_h
|
18
18
|
|
19
19
|
#include <stdint.h>
|
20
|
+
#include <string>
|
20
21
|
|
21
22
|
#ifdef _MSC_VER
|
22
23
|
#define strtok_r strtok_s
|
@@ -24,29 +25,31 @@
|
|
24
25
|
|
25
26
|
#include <faiss/utils/Heap.h>
|
26
27
|
|
27
|
-
|
28
28
|
namespace faiss {
|
29
29
|
|
30
|
+
/****************************************************************************
|
31
|
+
* Get compile specific variables
|
32
|
+
***************************************************************************/
|
33
|
+
|
34
|
+
/// get compile options
|
35
|
+
std::string get_compile_options();
|
30
36
|
|
31
37
|
/**************************************************
|
32
38
|
* Get some stats about the system
|
33
|
-
**************************************************/
|
34
|
-
|
39
|
+
**************************************************/
|
35
40
|
|
36
41
|
/// ms elapsed since some arbitrary epoch
|
37
|
-
double getmillisecs
|
42
|
+
double getmillisecs();
|
38
43
|
|
39
44
|
/// get current RSS usage in kB
|
40
|
-
size_t get_mem_usage_kb
|
45
|
+
size_t get_mem_usage_kb();
|
41
46
|
|
42
|
-
|
43
|
-
uint64_t get_cycles ();
|
47
|
+
uint64_t get_cycles();
|
44
48
|
|
45
49
|
/***************************************************************************
|
46
50
|
* Misc matrix and vector manipulation functions
|
47
51
|
***************************************************************************/
|
48
52
|
|
49
|
-
|
50
53
|
/** compute c := a + bf * b for a, b and c tables
|
51
54
|
*
|
52
55
|
* @param n size of the tables
|
@@ -54,34 +57,37 @@ uint64_t get_cycles ();
|
|
54
57
|
* @param b size n
|
55
58
|
* @param c restult table, size n
|
56
59
|
*/
|
57
|
-
void fvec_madd
|
58
|
-
float bf, const float *b, float *c);
|
59
|
-
|
60
|
+
void fvec_madd(size_t n, const float* a, float bf, const float* b, float* c);
|
60
61
|
|
61
62
|
/** same as fvec_madd, also return index of the min of the result table
|
62
63
|
* @return index of the min of table c
|
63
64
|
*/
|
64
|
-
int fvec_madd_and_argmin
|
65
|
-
|
66
|
-
|
65
|
+
int fvec_madd_and_argmin(
|
66
|
+
size_t n,
|
67
|
+
const float* a,
|
68
|
+
float bf,
|
69
|
+
const float* b,
|
70
|
+
float* c);
|
67
71
|
|
68
72
|
/* perform a reflection (not an efficient implementation, just for test ) */
|
69
|
-
void reflection
|
70
|
-
|
73
|
+
void reflection(const float* u, float* x, size_t n, size_t d, size_t nu);
|
71
74
|
|
72
75
|
/** compute the Q of the QR decomposition for m > n
|
73
76
|
* @param a size n * m: input matrix and output Q
|
74
77
|
*/
|
75
|
-
void matrix_qr
|
78
|
+
void matrix_qr(int m, int n, float* a);
|
76
79
|
|
77
80
|
/** distances are supposed to be sorted. Sorts indices with same distance*/
|
78
|
-
void ranklist_handle_ties
|
81
|
+
void ranklist_handle_ties(int k, int64_t* idx, const float* dis);
|
79
82
|
|
80
83
|
/** count the number of comon elements between v1 and v2
|
81
84
|
* algorithm = sorting + bissection to avoid double-counting duplicates
|
82
85
|
*/
|
83
|
-
size_t ranklist_intersection_size
|
84
|
-
|
86
|
+
size_t ranklist_intersection_size(
|
87
|
+
size_t k1,
|
88
|
+
const int64_t* v1,
|
89
|
+
size_t k2,
|
90
|
+
const int64_t* v2);
|
85
91
|
|
86
92
|
/** merge a result table into another one
|
87
93
|
*
|
@@ -91,41 +97,38 @@ size_t ranklist_intersection_size (size_t k1, const int64_t *v1,
|
|
91
97
|
* @param translation add this value to all I1's indexes
|
92
98
|
* @return nb of values that were taken from the second table
|
93
99
|
*/
|
94
|
-
size_t merge_result_table_with
|
95
|
-
|
96
|
-
|
97
|
-
|
98
|
-
|
99
|
-
|
100
|
+
size_t merge_result_table_with(
|
101
|
+
size_t n,
|
102
|
+
size_t k,
|
103
|
+
int64_t* I0,
|
104
|
+
float* D0,
|
105
|
+
const int64_t* I1,
|
106
|
+
const float* D1,
|
107
|
+
bool keep_min = true,
|
108
|
+
int64_t translation = 0);
|
100
109
|
|
101
110
|
/// a balanced assignment has a IF of 1
|
102
|
-
double imbalance_factor
|
111
|
+
double imbalance_factor(int n, int k, const int64_t* assign);
|
103
112
|
|
104
113
|
/// same, takes a histogram as input
|
105
|
-
double imbalance_factor
|
106
|
-
|
107
|
-
|
108
|
-
void fvec_argsort (size_t n, const float *vals,
|
109
|
-
size_t *perm);
|
114
|
+
double imbalance_factor(int k, const int* hist);
|
110
115
|
|
111
|
-
void
|
112
|
-
size_t *perm);
|
116
|
+
void fvec_argsort(size_t n, const float* vals, size_t* perm);
|
113
117
|
|
118
|
+
void fvec_argsort_parallel(size_t n, const float* vals, size_t* perm);
|
114
119
|
|
115
120
|
/// compute histogram on v
|
116
|
-
int ivec_hist
|
121
|
+
int ivec_hist(size_t n, const int* v, int vmax, int* hist);
|
117
122
|
|
118
123
|
/** Compute histogram of bits on a code array
|
119
124
|
*
|
120
125
|
* @param codes size(n, nbits / 8)
|
121
126
|
* @param hist size(nbits): nb of 1s in the array of codes
|
122
127
|
*/
|
123
|
-
void bincode_hist(size_t n, size_t nbits, const uint8_t
|
124
|
-
|
128
|
+
void bincode_hist(size_t n, size_t nbits, const uint8_t* codes, int* hist);
|
125
129
|
|
126
130
|
/// compute a checksum on a table.
|
127
|
-
size_t ivec_checksum
|
128
|
-
|
131
|
+
size_t ivec_checksum(size_t n, const int* a);
|
129
132
|
|
130
133
|
/** random subsamples a set of vectors if there are too many of them
|
131
134
|
*
|
@@ -136,9 +139,13 @@ size_t ivec_checksum (size_t n, const int *a);
|
|
136
139
|
* @param seed random seed to use for sampling
|
137
140
|
* @return x or an array allocated with new [] with *n vectors
|
138
141
|
*/
|
139
|
-
const float
|
140
|
-
|
141
|
-
|
142
|
+
const float* fvecs_maybe_subsample(
|
143
|
+
size_t d,
|
144
|
+
size_t* n,
|
145
|
+
size_t nmax,
|
146
|
+
const float* x,
|
147
|
+
bool verbose = false,
|
148
|
+
int64_t seed = 1234);
|
142
149
|
|
143
150
|
/** Convert binary vector to +1/-1 valued float vector.
|
144
151
|
*
|
@@ -146,7 +153,7 @@ const float *fvecs_maybe_subsample (
|
|
146
153
|
* @param x_in input binary vector (uint8_t table of size d / 8)
|
147
154
|
* @param x_out output float vector (float table of size d)
|
148
155
|
*/
|
149
|
-
void binary_to_real(size_t d, const uint8_t
|
156
|
+
void binary_to_real(size_t d, const uint8_t* x_in, float* x_out);
|
150
157
|
|
151
158
|
/** Convert float vector to binary vector. Components > 0 are converted to 1,
|
152
159
|
* others to 0.
|
@@ -155,16 +162,14 @@ void binary_to_real(size_t d, const uint8_t *x_in, float *x_out);
|
|
155
162
|
* @param x_in input float vector (float table of size d)
|
156
163
|
* @param x_out output binary vector (uint8_t table of size d / 8)
|
157
164
|
*/
|
158
|
-
void real_to_binary(size_t d, const float
|
159
|
-
|
165
|
+
void real_to_binary(size_t d, const float* x_in, uint8_t* x_out);
|
160
166
|
|
161
167
|
/** A reasonable hashing function */
|
162
|
-
uint64_t hash_bytes
|
168
|
+
uint64_t hash_bytes(const uint8_t* bytes, int64_t n);
|
163
169
|
|
164
170
|
/** Whether OpenMP annotations were respected. */
|
165
171
|
bool check_openmp();
|
166
172
|
|
167
|
-
} //
|
168
|
-
|
173
|
+
} // namespace faiss
|
169
174
|
|
170
175
|
#endif /* FAISS_utils_h */
|
metadata
CHANGED
@@ -1,14 +1,14 @@
|
|
1
1
|
--- !ruby/object:Gem::Specification
|
2
2
|
name: faiss
|
3
3
|
version: !ruby/object:Gem::Version
|
4
|
-
version: 0.
|
4
|
+
version: 0.2.3
|
5
5
|
platform: ruby
|
6
6
|
authors:
|
7
7
|
- Andrew Kane
|
8
8
|
autorequire:
|
9
9
|
bindir: bin
|
10
10
|
cert_chain: []
|
11
|
-
date: 2021-
|
11
|
+
date: 2021-12-17 00:00:00.000000000 Z
|
12
12
|
dependencies:
|
13
13
|
- !ruby/object:Gem::Dependency
|
14
14
|
name: rice
|
@@ -16,14 +16,14 @@ dependencies:
|
|
16
16
|
requirements:
|
17
17
|
- - ">="
|
18
18
|
- !ruby/object:Gem::Version
|
19
|
-
version:
|
19
|
+
version: 4.0.2
|
20
20
|
type: :runtime
|
21
21
|
prerelease: false
|
22
22
|
version_requirements: !ruby/object:Gem::Requirement
|
23
23
|
requirements:
|
24
24
|
- - ">="
|
25
25
|
- !ruby/object:Gem::Version
|
26
|
-
version:
|
26
|
+
version: 4.0.2
|
27
27
|
- !ruby/object:Gem::Dependency
|
28
28
|
name: numo-narray
|
29
29
|
requirement: !ruby/object:Gem::Requirement
|
@@ -53,16 +53,12 @@ files:
|
|
53
53
|
- ext/faiss/index.cpp
|
54
54
|
- ext/faiss/index_binary.cpp
|
55
55
|
- ext/faiss/kmeans.cpp
|
56
|
+
- ext/faiss/numo.hpp
|
56
57
|
- ext/faiss/pca_matrix.cpp
|
57
58
|
- ext/faiss/product_quantizer.cpp
|
58
59
|
- ext/faiss/utils.cpp
|
59
60
|
- ext/faiss/utils.h
|
60
61
|
- lib/faiss.rb
|
61
|
-
- lib/faiss/index.rb
|
62
|
-
- lib/faiss/index_binary.rb
|
63
|
-
- lib/faiss/kmeans.rb
|
64
|
-
- lib/faiss/pca_matrix.rb
|
65
|
-
- lib/faiss/product_quantizer.rb
|
66
62
|
- lib/faiss/version.rb
|
67
63
|
- vendor/faiss/LICENSE
|
68
64
|
- vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp
|
@@ -107,6 +103,10 @@ files:
|
|
107
103
|
- vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h
|
108
104
|
- vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp
|
109
105
|
- vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h
|
106
|
+
- vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp
|
107
|
+
- vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h
|
108
|
+
- vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp
|
109
|
+
- vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h
|
110
110
|
- vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp
|
111
111
|
- vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h
|
112
112
|
- vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp
|
@@ -117,6 +117,8 @@ files:
|
|
117
117
|
- vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h
|
118
118
|
- vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp
|
119
119
|
- vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h
|
120
|
+
- vendor/faiss/faiss/IndexResidual.cpp
|
121
|
+
- vendor/faiss/faiss/IndexResidual.h
|
120
122
|
- vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp
|
121
123
|
- vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h
|
122
124
|
- vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp
|
@@ -175,6 +177,8 @@ files:
|
|
175
177
|
- vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h
|
176
178
|
- vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp
|
177
179
|
- vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h
|
180
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp
|
181
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h
|
178
182
|
- vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp
|
179
183
|
- vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h
|
180
184
|
- vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h
|
@@ -182,11 +186,19 @@ files:
|
|
182
186
|
- vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h
|
183
187
|
- vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp
|
184
188
|
- vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h
|
189
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp
|
190
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h
|
191
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp
|
192
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h
|
193
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp
|
194
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h
|
185
195
|
- vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp
|
186
196
|
- vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h
|
187
197
|
- vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h
|
188
198
|
- vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp
|
189
199
|
- vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h
|
200
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp
|
201
|
+
- vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h
|
190
202
|
- vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h
|
191
203
|
- vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp
|
192
204
|
- vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h
|
@@ -228,6 +240,7 @@ files:
|
|
228
240
|
- vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp
|
229
241
|
- vendor/faiss/faiss/utils/distances.h
|
230
242
|
- vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp
|
243
|
+
- vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h
|
231
244
|
- vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp
|
232
245
|
- vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h
|
233
246
|
- vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h
|
@@ -243,9 +256,10 @@ files:
|
|
243
256
|
- vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h
|
244
257
|
- vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h
|
245
258
|
- vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h
|
259
|
+
- vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h
|
246
260
|
- vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp
|
247
261
|
- vendor/faiss/faiss/utils/utils.h
|
248
|
-
homepage: https://github.com/ankane/faiss
|
262
|
+
homepage: https://github.com/ankane/faiss-ruby
|
249
263
|
licenses:
|
250
264
|
- MIT
|
251
265
|
metadata: {}
|
@@ -257,14 +271,14 @@ required_ruby_version: !ruby/object:Gem::Requirement
|
|
257
271
|
requirements:
|
258
272
|
- - ">="
|
259
273
|
- !ruby/object:Gem::Version
|
260
|
-
version: '2.
|
274
|
+
version: '2.6'
|
261
275
|
required_rubygems_version: !ruby/object:Gem::Requirement
|
262
276
|
requirements:
|
263
277
|
- - ">="
|
264
278
|
- !ruby/object:Gem::Version
|
265
279
|
version: '0'
|
266
280
|
requirements: []
|
267
|
-
rubygems_version: 3.2.
|
281
|
+
rubygems_version: 3.2.32
|
268
282
|
signing_key:
|
269
283
|
specification_version: 4
|
270
284
|
summary: Efficient similarity search and clustering for Ruby
|
data/lib/faiss/index.rb
DELETED
@@ -1,20 +0,0 @@
|
|
1
|
-
module Faiss
|
2
|
-
class Index
|
3
|
-
def train(objects)
|
4
|
-
objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
|
5
|
-
_train(objects.shape[0], objects)
|
6
|
-
end
|
7
|
-
|
8
|
-
def add(objects)
|
9
|
-
objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
|
10
|
-
_add(objects.shape[0], objects)
|
11
|
-
end
|
12
|
-
|
13
|
-
def search(objects, k)
|
14
|
-
objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
|
15
|
-
n = objects.shape[0]
|
16
|
-
distances, labels = _search(n, objects, k)
|
17
|
-
[Numo::SFloat.from_binary(distances).reshape(n, k), Numo::Int64.from_binary(labels).reshape(n, k)]
|
18
|
-
end
|
19
|
-
end
|
20
|
-
end
|
data/lib/faiss/index_binary.rb
DELETED
@@ -1,20 +0,0 @@
|
|
1
|
-
module Faiss
|
2
|
-
class IndexBinary
|
3
|
-
def train(objects)
|
4
|
-
objects = Numo::UInt8.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::UInt8)
|
5
|
-
_train(objects.shape[0], objects)
|
6
|
-
end
|
7
|
-
|
8
|
-
def add(objects)
|
9
|
-
objects = Numo::UInt8.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::UInt8)
|
10
|
-
_add(objects.shape[0], objects)
|
11
|
-
end
|
12
|
-
|
13
|
-
def search(objects, k)
|
14
|
-
objects = Numo::UInt8.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::UInt8)
|
15
|
-
n = objects.shape[0]
|
16
|
-
distances, labels = _search(n, objects, k)
|
17
|
-
[Numo::UInt32.from_binary(distances).reshape(n, k), Numo::Int64.from_binary(labels).reshape(n, k)]
|
18
|
-
end
|
19
|
-
end
|
20
|
-
end
|
data/lib/faiss/kmeans.rb
DELETED
@@ -1,15 +0,0 @@
|
|
1
|
-
module Faiss
|
2
|
-
class Kmeans
|
3
|
-
attr_reader :index
|
4
|
-
|
5
|
-
def train(objects)
|
6
|
-
objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
|
7
|
-
@index = IndexFlatL2.new(d)
|
8
|
-
_train(objects.shape[0], objects, @index)
|
9
|
-
end
|
10
|
-
|
11
|
-
def centroids
|
12
|
-
Numo::SFloat.from_binary(_centroids).reshape(k, d)
|
13
|
-
end
|
14
|
-
end
|
15
|
-
end
|
data/lib/faiss/pca_matrix.rb
DELETED
@@ -1,15 +0,0 @@
|
|
1
|
-
module Faiss
|
2
|
-
class PCAMatrix
|
3
|
-
def train(objects)
|
4
|
-
objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
|
5
|
-
_train(objects.shape[0], objects)
|
6
|
-
end
|
7
|
-
|
8
|
-
def apply(objects)
|
9
|
-
objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
|
10
|
-
n = objects.shape[0]
|
11
|
-
res = _apply(n, objects)
|
12
|
-
Numo::SFloat.from_binary(res).reshape(n, d_out)
|
13
|
-
end
|
14
|
-
end
|
15
|
-
end
|
@@ -1,22 +0,0 @@
|
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1
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module Faiss
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class ProductQuantizer
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def train(objects)
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objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
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_train(objects.shape[0], objects)
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end
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def compute_codes(objects)
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objects = Numo::SFloat.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::SFloat)
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n = objects.shape[0]
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res = _compute_codes(n, objects)
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Numo::UInt8.from_binary(res).reshape(n, m)
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end
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def decode(objects)
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objects = Numo::UInt8.cast(objects) unless objects.is_a?(Numo::UInt8)
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n = objects.shape[0]
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res = _decode(n, objects)
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Numo::SFloat.from_binary(res).reshape(n, d)
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end
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end
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end
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