faiss 0.1.7 → 0.2.3
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- checksums.yaml +4 -4
- data/CHANGELOG.md +18 -0
- data/README.md +7 -7
- data/ext/faiss/ext.cpp +1 -1
- data/ext/faiss/extconf.rb +8 -2
- data/ext/faiss/index.cpp +102 -69
- data/ext/faiss/index_binary.cpp +24 -30
- data/ext/faiss/kmeans.cpp +20 -16
- data/ext/faiss/numo.hpp +867 -0
- data/ext/faiss/pca_matrix.cpp +13 -14
- data/ext/faiss/product_quantizer.cpp +23 -24
- data/ext/faiss/utils.cpp +10 -37
- data/ext/faiss/utils.h +2 -13
- data/lib/faiss/version.rb +1 -1
- data/lib/faiss.rb +0 -5
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +334 -195
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +88 -35
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
- data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +139 -164
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -22
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +116 -147
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +35 -46
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.cpp +372 -348
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +474 -454
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +146 -113
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +248 -250
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +457 -516
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +74 -66
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +125 -133
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +19 -21
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +75 -96
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +21 -26
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +231 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +303 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +405 -464
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -67
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +115 -131
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +22 -23
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.cpp +291 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.h +152 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +120 -155
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -45
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
- data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +652 -474
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +61 -89
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +77 -73
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +197 -170
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +270 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +115 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +595 -611
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +672 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +172 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +682 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h +76 -87
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp +448 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h +130 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h +96 -132
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +648 -701
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +547 -479
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +497 -407
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +75 -94
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.h +31 -41
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io_macros.h +40 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
- data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
- data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +269 -218
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +6 -7
- data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +301 -310
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +133 -118
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +456 -516
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h +260 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h +4 -2
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h +88 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h +226 -165
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h +832 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp +304 -287
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.h +53 -48
- metadata +26 -12
- data/lib/faiss/index.rb +0 -20
- data/lib/faiss/index_binary.rb +0 -20
- data/lib/faiss/kmeans.rb +0 -15
- data/lib/faiss/pca_matrix.rb +0 -15
- data/lib/faiss/product_quantizer.rb +0 -22
@@ -5,126 +5,120 @@
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5
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* LICENSE file in the root directory of this source tree.
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6
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*/
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7
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-
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8
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#include <faiss/IndexBinaryFlat.h>
|
10
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#include <faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h>
|
11
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#include <faiss/gpu/StandardGpuResources.h>
|
12
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-
#include <faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h>
|
13
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#include <faiss/gpu/test/TestUtils.h>
|
12
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+
#include <faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h>
|
14
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#include <faiss/utils/utils.h>
|
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#include <gtest/gtest.h>
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#include <sstream>
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#include <vector>
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void compareBinaryDist(
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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-
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49
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-
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50
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-
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51
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-
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-
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53
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-
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54
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-
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55
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-
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-
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-
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58
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-
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+
void compareBinaryDist(
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+
const std::vector<int>& cpuDist,
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+
const std::vector<faiss::IndexBinary::idx_t>& cpuLabels,
|
21
|
+
const std::vector<int>& gpuDist,
|
22
|
+
const std::vector<faiss::IndexBinary::idx_t>& gpuLabels,
|
23
|
+
int numQuery,
|
24
|
+
int k) {
|
25
|
+
for (int i = 0; i < numQuery; ++i) {
|
26
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+
// The index order can be permuted within a group that has the same
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27
|
+
// distance, since this is based on the order in which the algorithm
|
28
|
+
// encounters the values. The last set of equivalent distances seen in
|
29
|
+
// the min-k might be truncated, so we can't check that set, but all
|
30
|
+
// others we can check.
|
31
|
+
std::set<faiss::IndexBinary::idx_t> cpuLabelSet;
|
32
|
+
std::set<faiss::IndexBinary::idx_t> gpuLabelSet;
|
33
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+
|
34
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+
int curDist = -1;
|
35
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+
|
36
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+
for (int j = 0; j < k; ++j) {
|
37
|
+
int idx = i * k + j;
|
38
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+
|
39
|
+
if (curDist == -1) {
|
40
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+
curDist = cpuDist[idx];
|
41
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+
}
|
42
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+
|
43
|
+
if (curDist != cpuDist[idx]) {
|
44
|
+
// Distances must be monotonically increasing
|
45
|
+
EXPECT_LT(curDist, cpuDist[idx]);
|
46
|
+
|
47
|
+
// This is a new set of distances
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+
EXPECT_EQ(cpuLabelSet, gpuLabelSet);
|
49
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+
curDist = cpuDist[idx];
|
50
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+
cpuLabelSet.clear();
|
51
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+
gpuLabelSet.clear();
|
52
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+
}
|
53
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+
|
54
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+
cpuLabelSet.insert(cpuLabels[idx]);
|
55
|
+
gpuLabelSet.insert(gpuLabels[idx]);
|
56
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+
|
57
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+
// Because the distances are reproducible, they must be exactly the
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58
|
+
// same
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+
EXPECT_EQ(cpuDist[idx], gpuDist[idx]);
|
60
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+
}
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}
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60
|
-
}
|
61
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|
}
|
62
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template <int DimMultiple>
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void testGpuIndexBinaryFlat(int kOverride = -1) {
|
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-
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+
faiss::gpu::StandardGpuResources res;
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67
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+
res.noTempMemory();
|
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68
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-
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69
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-
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69
|
+
faiss::gpu::GpuIndexBinaryFlatConfig config;
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70
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+
config.device = faiss::gpu::randVal(0, faiss::gpu::getNumDevices() - 1);
|
70
71
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71
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-
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72
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-
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73
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-
|
72
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+
// multiples of 8 and multiples of 32 use different implementations
|
73
|
+
int dims = faiss::gpu::randVal(1, 20) * DimMultiple;
|
74
|
+
faiss::gpu::GpuIndexBinaryFlat gpuIndex(&res, dims, config);
|
74
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75
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-
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76
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+
faiss::IndexBinaryFlat cpuIndex(dims);
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76
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77
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-
|
78
|
-
|
79
|
-
|
80
|
-
|
78
|
+
int k = kOverride > 0
|
79
|
+
? kOverride
|
80
|
+
: faiss::gpu::randVal(1, faiss::gpu::getMaxKSelection());
|
81
|
+
int numVecs = faiss::gpu::randVal(k + 1, 20000);
|
82
|
+
int numQuery = faiss::gpu::randVal(1, 1000);
|
81
83
|
|
82
|
-
|
83
|
-
|
84
|
-
|
84
|
+
auto data = faiss::gpu::randBinaryVecs(numVecs, dims);
|
85
|
+
gpuIndex.add(numVecs, data.data());
|
86
|
+
cpuIndex.add(numVecs, data.data());
|
85
87
|
|
86
|
-
|
88
|
+
auto query = faiss::gpu::randBinaryVecs(numQuery, dims);
|
87
89
|
|
88
|
-
|
89
|
-
|
90
|
+
std::vector<int> cpuDist(numQuery * k);
|
91
|
+
std::vector<faiss::IndexBinary::idx_t> cpuLabels(numQuery * k);
|
90
92
|
|
91
|
-
|
92
|
-
|
93
|
-
k,
|
94
|
-
cpuDist.data(),
|
95
|
-
cpuLabels.data());
|
93
|
+
cpuIndex.search(
|
94
|
+
numQuery, query.data(), k, cpuDist.data(), cpuLabels.data());
|
96
95
|
|
97
|
-
|
98
|
-
|
96
|
+
std::vector<int> gpuDist(numQuery * k);
|
97
|
+
std::vector<faiss::IndexBinary::idx_t> gpuLabels(numQuery * k);
|
99
98
|
|
100
|
-
|
101
|
-
|
102
|
-
k,
|
103
|
-
gpuDist.data(),
|
104
|
-
gpuLabels.data());
|
99
|
+
gpuIndex.search(
|
100
|
+
numQuery, query.data(), k, gpuDist.data(), gpuLabels.data());
|
105
101
|
|
106
|
-
|
107
|
-
gpuDist, gpuLabels,
|
108
|
-
numQuery, k);
|
102
|
+
compareBinaryDist(cpuDist, cpuLabels, gpuDist, gpuLabels, numQuery, k);
|
109
103
|
}
|
110
104
|
|
111
105
|
TEST(TestGpuIndexBinaryFlat, Test8) {
|
112
|
-
|
113
|
-
|
114
|
-
|
106
|
+
for (int tries = 0; tries < 4; ++tries) {
|
107
|
+
testGpuIndexBinaryFlat<8>();
|
108
|
+
}
|
115
109
|
}
|
116
110
|
|
117
111
|
TEST(TestGpuIndexBinaryFlat, Test32) {
|
118
|
-
|
119
|
-
|
120
|
-
|
112
|
+
for (int tries = 0; tries < 4; ++tries) {
|
113
|
+
testGpuIndexBinaryFlat<32>();
|
114
|
+
}
|
121
115
|
}
|
122
116
|
|
123
117
|
int main(int argc, char** argv) {
|
124
|
-
|
118
|
+
testing::InitGoogleTest(&argc, argv);
|
125
119
|
|
126
|
-
|
127
|
-
|
120
|
+
// just run with a fixed test seed
|
121
|
+
faiss::gpu::setTestSeed(100);
|
128
122
|
|
129
|
-
|
123
|
+
return RUN_ALL_TESTS();
|
130
124
|
}
|