faiss 0.1.7 → 0.2.3
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- checksums.yaml +4 -4
- data/CHANGELOG.md +18 -0
- data/README.md +7 -7
- data/ext/faiss/ext.cpp +1 -1
- data/ext/faiss/extconf.rb +8 -2
- data/ext/faiss/index.cpp +102 -69
- data/ext/faiss/index_binary.cpp +24 -30
- data/ext/faiss/kmeans.cpp +20 -16
- data/ext/faiss/numo.hpp +867 -0
- data/ext/faiss/pca_matrix.cpp +13 -14
- data/ext/faiss/product_quantizer.cpp +23 -24
- data/ext/faiss/utils.cpp +10 -37
- data/ext/faiss/utils.h +2 -13
- data/lib/faiss/version.rb +1 -1
- data/lib/faiss.rb +0 -5
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +334 -195
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +88 -35
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
- data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +139 -164
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -22
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +116 -147
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +35 -46
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.cpp +372 -348
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +474 -454
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +146 -113
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +248 -250
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +457 -516
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +74 -66
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +125 -133
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +19 -21
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +75 -96
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +21 -26
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +231 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +303 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +405 -464
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -67
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +115 -131
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +22 -23
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.cpp +291 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.h +152 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +120 -155
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -45
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
- data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +652 -474
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +61 -89
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +77 -73
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +197 -170
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +270 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +115 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +595 -611
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +672 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +172 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +682 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h +76 -87
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp +448 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h +130 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h +96 -132
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +648 -701
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +547 -479
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +497 -407
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +75 -94
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.h +31 -41
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io_macros.h +40 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
- data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
- data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +269 -218
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +6 -7
- data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +301 -310
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +133 -118
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +456 -516
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h +260 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h +4 -2
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h +88 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h +226 -165
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h +832 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp +304 -287
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.h +53 -48
- metadata +26 -12
- data/lib/faiss/index.rb +0 -20
- data/lib/faiss/index_binary.rb +0 -20
- data/lib/faiss/kmeans.rb +0 -15
- data/lib/faiss/pca_matrix.rb +0 -15
- data/lib/faiss/product_quantizer.rb +0 -22
@@ -5,49 +5,38 @@
|
|
5
5
|
* LICENSE file in the root directory of this source tree.
|
6
6
|
*/
|
7
7
|
|
8
|
-
|
9
8
|
/*
|
10
9
|
* Structures that collect search results from distance computations
|
11
10
|
*/
|
12
11
|
|
13
12
|
#pragma once
|
14
13
|
|
15
|
-
|
14
|
+
#include <faiss/impl/AuxIndexStructures.h>
|
16
15
|
#include <faiss/utils/Heap.h>
|
17
16
|
#include <faiss/utils/partitioning.h>
|
18
|
-
#include <faiss/impl/AuxIndexStructures.h>
|
19
|
-
|
20
17
|
|
21
18
|
namespace faiss {
|
22
19
|
|
23
|
-
|
24
|
-
|
25
20
|
/*****************************************************************
|
26
21
|
* Heap based result handler
|
27
22
|
*****************************************************************/
|
28
23
|
|
29
|
-
|
30
|
-
template<class C>
|
24
|
+
template <class C>
|
31
25
|
struct HeapResultHandler {
|
32
|
-
|
33
26
|
using T = typename C::T;
|
34
27
|
using TI = typename C::TI;
|
35
28
|
|
36
29
|
int nq;
|
37
|
-
T
|
38
|
-
TI
|
30
|
+
T* heap_dis_tab;
|
31
|
+
TI* heap_ids_tab;
|
39
32
|
|
40
|
-
int64_t k;
|
33
|
+
int64_t k; // number of results to keep
|
41
34
|
|
42
|
-
HeapResultHandler(
|
43
|
-
|
44
|
-
|
45
|
-
|
46
|
-
|
47
|
-
heap_dis_tab(heap_dis_tab), heap_ids_tab(heap_ids_tab), k(k)
|
48
|
-
{
|
49
|
-
|
50
|
-
}
|
35
|
+
HeapResultHandler(size_t nq, T* heap_dis_tab, TI* heap_ids_tab, size_t k)
|
36
|
+
: nq(nq),
|
37
|
+
heap_dis_tab(heap_dis_tab),
|
38
|
+
heap_ids_tab(heap_ids_tab),
|
39
|
+
k(k) {}
|
51
40
|
|
52
41
|
/******************************************************
|
53
42
|
* API for 1 result at a time (each SingleResultHandler is
|
@@ -55,20 +44,20 @@ struct HeapResultHandler {
|
|
55
44
|
*/
|
56
45
|
|
57
46
|
struct SingleResultHandler {
|
58
|
-
HeapResultHandler
|
47
|
+
HeapResultHandler& hr;
|
59
48
|
size_t k;
|
60
49
|
|
61
|
-
T
|
62
|
-
TI
|
50
|
+
T* heap_dis;
|
51
|
+
TI* heap_ids;
|
63
52
|
T thresh;
|
64
53
|
|
65
|
-
SingleResultHandler(HeapResultHandler
|
54
|
+
SingleResultHandler(HeapResultHandler& hr) : hr(hr), k(hr.k) {}
|
66
55
|
|
67
56
|
/// begin results for query # i
|
68
57
|
void begin(size_t i) {
|
69
58
|
heap_dis = hr.heap_dis_tab + i * k;
|
70
59
|
heap_ids = hr.heap_ids_tab + i * k;
|
71
|
-
heap_heapify<C>
|
60
|
+
heap_heapify<C>(k, heap_dis, heap_ids);
|
72
61
|
thresh = heap_dis[0];
|
73
62
|
}
|
74
63
|
|
@@ -82,11 +71,10 @@ struct HeapResultHandler {
|
|
82
71
|
|
83
72
|
/// series of results for query i is done
|
84
73
|
void end() {
|
85
|
-
heap_reorder<C>
|
74
|
+
heap_reorder<C>(k, heap_dis, heap_ids);
|
86
75
|
}
|
87
76
|
};
|
88
77
|
|
89
|
-
|
90
78
|
/******************************************************
|
91
79
|
* API for multiple results (called from 1 thread)
|
92
80
|
*/
|
@@ -97,20 +85,21 @@ struct HeapResultHandler {
|
|
97
85
|
void begin_multiple(size_t i0, size_t i1) {
|
98
86
|
this->i0 = i0;
|
99
87
|
this->i1 = i1;
|
100
|
-
for(size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
101
|
-
heap_heapify<C>
|
88
|
+
for (size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
89
|
+
heap_heapify<C>(k, heap_dis_tab + i * k, heap_ids_tab + i * k);
|
102
90
|
}
|
103
91
|
}
|
104
92
|
|
105
93
|
/// add results for query i0..i1 and j0..j1
|
106
|
-
void add_results(size_t j0, size_t j1, const T
|
107
|
-
|
108
|
-
for (
|
109
|
-
T
|
110
|
-
TI
|
94
|
+
void add_results(size_t j0, size_t j1, const T* dis_tab) {
|
95
|
+
#pragma omp parallel for
|
96
|
+
for (int64_t i = i0; i < i1; i++) {
|
97
|
+
T* heap_dis = heap_dis_tab + i * k;
|
98
|
+
TI* heap_ids = heap_ids_tab + i * k;
|
99
|
+
const T* dis_tab_i = dis_tab + (j1 - j0) * (i - i0) - j0;
|
111
100
|
T thresh = heap_dis[0];
|
112
101
|
for (size_t j = j0; j < j1; j++) {
|
113
|
-
T dis =
|
102
|
+
T dis = dis_tab_i[j];
|
114
103
|
if (C::cmp(thresh, dis)) {
|
115
104
|
heap_replace_top<C>(k, heap_dis, heap_ids, dis, j);
|
116
105
|
thresh = heap_dis[0];
|
@@ -122,11 +111,10 @@ struct HeapResultHandler {
|
|
122
111
|
/// series of results for queries i0..i1 is done
|
123
112
|
void end_multiple() {
|
124
113
|
// maybe parallel for
|
125
|
-
for(size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
126
|
-
heap_reorder<C>
|
114
|
+
for (size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
115
|
+
heap_reorder<C>(k, heap_dis_tab + i * k, heap_ids_tab + i * k);
|
127
116
|
}
|
128
117
|
}
|
129
|
-
|
130
118
|
};
|
131
119
|
|
132
120
|
/*****************************************************************
|
@@ -138,31 +126,25 @@ struct HeapResultHandler {
|
|
138
126
|
* distance array.
|
139
127
|
*****************************************************************/
|
140
128
|
|
141
|
-
|
142
|
-
|
143
129
|
/// Reservoir for a single query
|
144
|
-
template<class C>
|
130
|
+
template <class C>
|
145
131
|
struct ReservoirTopN {
|
146
132
|
using T = typename C::T;
|
147
133
|
using TI = typename C::TI;
|
148
134
|
|
149
|
-
T
|
150
|
-
TI
|
135
|
+
T* vals;
|
136
|
+
TI* ids;
|
151
137
|
|
152
|
-
size_t i;
|
153
|
-
size_t n;
|
154
|
-
size_t capacity;
|
138
|
+
size_t i; // number of stored elements
|
139
|
+
size_t n; // number of requested elements
|
140
|
+
size_t capacity; // size of storage
|
155
141
|
|
156
142
|
T threshold; // current threshold
|
157
143
|
|
158
144
|
ReservoirTopN() {}
|
159
145
|
|
160
|
-
ReservoirTopN(
|
161
|
-
|
162
|
-
T *vals, TI *ids
|
163
|
-
):
|
164
|
-
vals(vals), ids(ids),
|
165
|
-
i(0), n(n), capacity(capacity) {
|
146
|
+
ReservoirTopN(size_t n, size_t capacity, T* vals, TI* ids)
|
147
|
+
: vals(vals), ids(ids), i(0), n(n), capacity(capacity) {
|
166
148
|
assert(n < capacity);
|
167
149
|
threshold = C::neutral();
|
168
150
|
}
|
@@ -184,55 +166,47 @@ struct ReservoirTopN {
|
|
184
166
|
assert(i == capacity);
|
185
167
|
|
186
168
|
threshold = partition_fuzzy<C>(
|
187
|
-
|
188
|
-
&i);
|
169
|
+
vals, ids, capacity, n, (capacity + n) / 2, &i);
|
189
170
|
}
|
190
171
|
|
191
|
-
void to_result(T
|
192
|
-
|
172
|
+
void to_result(T* heap_dis, TI* heap_ids) const {
|
193
173
|
for (int j = 0; j < std::min(i, n); j++) {
|
194
|
-
heap_push<C>(
|
195
|
-
j + 1, heap_dis, heap_ids,
|
196
|
-
vals[j], ids[j]
|
197
|
-
);
|
174
|
+
heap_push<C>(j + 1, heap_dis, heap_ids, vals[j], ids[j]);
|
198
175
|
}
|
199
176
|
|
200
177
|
if (i < n) {
|
201
|
-
heap_reorder<C>
|
178
|
+
heap_reorder<C>(i, heap_dis, heap_ids);
|
202
179
|
// add empty results
|
203
|
-
heap_heapify<C>
|
180
|
+
heap_heapify<C>(n - i, heap_dis + i, heap_ids + i);
|
204
181
|
} else {
|
205
182
|
// add remaining elements
|
206
|
-
heap_addn<C>
|
207
|
-
heap_reorder<C>
|
183
|
+
heap_addn<C>(n, heap_dis, heap_ids, vals + n, ids + n, i - n);
|
184
|
+
heap_reorder<C>(n, heap_dis, heap_ids);
|
208
185
|
}
|
209
|
-
|
210
186
|
}
|
211
|
-
|
212
187
|
};
|
213
188
|
|
214
|
-
|
215
|
-
|
216
|
-
template<class C>
|
189
|
+
template <class C>
|
217
190
|
struct ReservoirResultHandler {
|
218
|
-
|
219
191
|
using T = typename C::T;
|
220
192
|
using TI = typename C::TI;
|
221
193
|
|
222
194
|
int nq;
|
223
|
-
T
|
224
|
-
TI
|
195
|
+
T* heap_dis_tab;
|
196
|
+
TI* heap_ids_tab;
|
225
197
|
|
226
|
-
int64_t k;
|
198
|
+
int64_t k; // number of results to keep
|
227
199
|
size_t capacity; // capacity of the reservoirs
|
228
200
|
|
229
201
|
ReservoirResultHandler(
|
230
|
-
|
231
|
-
|
232
|
-
|
233
|
-
|
234
|
-
|
235
|
-
|
202
|
+
size_t nq,
|
203
|
+
T* heap_dis_tab,
|
204
|
+
TI* heap_ids_tab,
|
205
|
+
size_t k)
|
206
|
+
: nq(nq),
|
207
|
+
heap_dis_tab(heap_dis_tab),
|
208
|
+
heap_ids_tab(heap_ids_tab),
|
209
|
+
k(k) {
|
236
210
|
// double then round up to multiple of 16 (for SIMD alignment)
|
237
211
|
capacity = (2 * k + 15) & ~15;
|
238
212
|
}
|
@@ -243,23 +217,26 @@ struct ReservoirResultHandler {
|
|
243
217
|
*/
|
244
218
|
|
245
219
|
struct SingleResultHandler {
|
246
|
-
ReservoirResultHandler
|
220
|
+
ReservoirResultHandler& hr;
|
247
221
|
|
248
222
|
std::vector<T> reservoir_dis;
|
249
223
|
std::vector<TI> reservoir_ids;
|
250
224
|
ReservoirTopN<C> res1;
|
251
225
|
|
252
|
-
SingleResultHandler(ReservoirResultHandler
|
253
|
-
|
254
|
-
|
255
|
-
|
226
|
+
SingleResultHandler(ReservoirResultHandler& hr)
|
227
|
+
: hr(hr),
|
228
|
+
reservoir_dis(hr.capacity),
|
229
|
+
reservoir_ids(hr.capacity) {}
|
256
230
|
|
257
231
|
size_t i;
|
258
232
|
|
259
233
|
/// begin results for query # i
|
260
234
|
void begin(size_t i) {
|
261
235
|
res1 = ReservoirTopN<C>(
|
262
|
-
|
236
|
+
hr.k,
|
237
|
+
hr.capacity,
|
238
|
+
reservoir_dis.data(),
|
239
|
+
reservoir_ids.data());
|
263
240
|
this->i = i;
|
264
241
|
}
|
265
242
|
|
@@ -270,8 +247,8 @@ struct ReservoirResultHandler {
|
|
270
247
|
|
271
248
|
/// series of results for query i is done
|
272
249
|
void end() {
|
273
|
-
T
|
274
|
-
TI
|
250
|
+
T* heap_dis = hr.heap_dis_tab + i * hr.k;
|
251
|
+
TI* heap_ids = hr.heap_ids_tab + i * hr.k;
|
275
252
|
res1.to_result(heap_dis, heap_ids);
|
276
253
|
}
|
277
254
|
};
|
@@ -295,20 +272,22 @@ struct ReservoirResultHandler {
|
|
295
272
|
reservoirs.clear();
|
296
273
|
for (size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
297
274
|
reservoirs.emplace_back(
|
298
|
-
|
299
|
-
|
300
|
-
|
301
|
-
|
275
|
+
k,
|
276
|
+
capacity,
|
277
|
+
reservoir_dis.data() + (i - i0) * capacity,
|
278
|
+
reservoir_ids.data() + (i - i0) * capacity);
|
302
279
|
}
|
303
280
|
}
|
304
281
|
|
305
282
|
/// add results for query i0..i1 and j0..j1
|
306
|
-
void add_results(size_t j0, size_t j1, const T
|
283
|
+
void add_results(size_t j0, size_t j1, const T* dis_tab) {
|
307
284
|
// maybe parallel for
|
308
|
-
|
309
|
-
|
285
|
+
#pragma omp parallel for
|
286
|
+
for (int64_t i = i0; i < i1; i++) {
|
287
|
+
ReservoirTopN<C>& reservoir = reservoirs[i - i0];
|
288
|
+
const T* dis_tab_i = dis_tab + (j1 - j0) * (i - i0) - j0;
|
310
289
|
for (size_t j = j0; j < j1; j++) {
|
311
|
-
T dis =
|
290
|
+
T dis = dis_tab_i[j];
|
312
291
|
reservoir.add(dis, j);
|
313
292
|
}
|
314
293
|
}
|
@@ -317,32 +296,27 @@ struct ReservoirResultHandler {
|
|
317
296
|
/// series of results for queries i0..i1 is done
|
318
297
|
void end_multiple() {
|
319
298
|
// maybe parallel for
|
320
|
-
for(size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
299
|
+
for (size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
321
300
|
reservoirs[i - i0].to_result(
|
322
|
-
|
301
|
+
heap_dis_tab + i * k, heap_ids_tab + i * k);
|
323
302
|
}
|
324
303
|
}
|
325
|
-
|
326
304
|
};
|
327
305
|
|
328
|
-
|
329
306
|
/*****************************************************************
|
330
307
|
* Result handler for range searches
|
331
308
|
*****************************************************************/
|
332
309
|
|
333
|
-
|
334
|
-
|
335
|
-
template<class C>
|
310
|
+
template <class C>
|
336
311
|
struct RangeSearchResultHandler {
|
337
312
|
using T = typename C::T;
|
338
313
|
using TI = typename C::TI;
|
339
314
|
|
340
|
-
RangeSearchResult
|
315
|
+
RangeSearchResult* res;
|
341
316
|
float radius;
|
342
317
|
|
343
|
-
RangeSearchResultHandler(RangeSearchResult
|
344
|
-
|
345
|
-
{}
|
318
|
+
RangeSearchResultHandler(RangeSearchResult* res, float radius)
|
319
|
+
: res(res), radius(radius) {}
|
346
320
|
|
347
321
|
/******************************************************
|
348
322
|
* API for 1 result at a time (each SingleResultHandler is
|
@@ -353,11 +327,10 @@ struct RangeSearchResultHandler {
|
|
353
327
|
// almost the same interface as RangeSearchResultHandler
|
354
328
|
RangeSearchPartialResult pres;
|
355
329
|
float radius;
|
356
|
-
RangeQueryResult
|
330
|
+
RangeQueryResult* qr = nullptr;
|
357
331
|
|
358
|
-
SingleResultHandler(RangeSearchResultHandler
|
359
|
-
|
360
|
-
{}
|
332
|
+
SingleResultHandler(RangeSearchResultHandler& rh)
|
333
|
+
: pres(rh.res), radius(rh.radius) {}
|
361
334
|
|
362
335
|
/// begin results for query # i
|
363
336
|
void begin(size_t i) {
|
@@ -366,15 +339,13 @@ struct RangeSearchResultHandler {
|
|
366
339
|
|
367
340
|
/// add one result for query i
|
368
341
|
void add_result(T dis, TI idx) {
|
369
|
-
|
370
342
|
if (C::cmp(radius, dis)) {
|
371
343
|
qr->add(dis, idx);
|
372
344
|
}
|
373
345
|
}
|
374
346
|
|
375
347
|
/// series of results for query i is done
|
376
|
-
void end() {
|
377
|
-
}
|
348
|
+
void end() {}
|
378
349
|
|
379
350
|
~SingleResultHandler() {
|
380
351
|
pres.finalize();
|
@@ -387,8 +358,8 @@ struct RangeSearchResultHandler {
|
|
387
358
|
|
388
359
|
size_t i0, i1;
|
389
360
|
|
390
|
-
std::vector
|
391
|
-
std::vector
|
361
|
+
std::vector<RangeSearchPartialResult*> partial_results;
|
362
|
+
std::vector<size_t> j0s;
|
392
363
|
int pr = 0;
|
393
364
|
|
394
365
|
/// begin
|
@@ -399,8 +370,8 @@ struct RangeSearchResultHandler {
|
|
399
370
|
|
400
371
|
/// add results for query i0..i1 and j0..j1
|
401
372
|
|
402
|
-
void add_results(size_t j0, size_t j1, const T
|
403
|
-
RangeSearchPartialResult
|
373
|
+
void add_results(size_t j0, size_t j1, const T* dis_tab) {
|
374
|
+
RangeSearchPartialResult* pres;
|
404
375
|
// there is one RangeSearchPartialResult structure per j0
|
405
376
|
// (= block of columns of the large distance matrix)
|
406
377
|
// it is a bit tricky to find the poper PartialResult structure
|
@@ -414,39 +385,32 @@ struct RangeSearchResultHandler {
|
|
414
385
|
pres = partial_results[pr];
|
415
386
|
pr++;
|
416
387
|
} else { // did not find this j0
|
417
|
-
pres = new RangeSearchPartialResult
|
388
|
+
pres = new RangeSearchPartialResult(res);
|
418
389
|
partial_results.push_back(pres);
|
419
390
|
j0s.push_back(j0);
|
420
391
|
pr = partial_results.size();
|
421
392
|
}
|
422
393
|
|
423
394
|
for (size_t i = i0; i < i1; i++) {
|
424
|
-
const float
|
425
|
-
RangeQueryResult
|
395
|
+
const float* ip_line = dis_tab + (i - i0) * (j1 - j0);
|
396
|
+
RangeQueryResult& qres = pres->new_result(i);
|
426
397
|
|
427
398
|
for (size_t j = j0; j < j1; j++) {
|
428
399
|
float dis = *ip_line++;
|
429
400
|
if (C::cmp(radius, dis)) {
|
430
|
-
qres.add
|
401
|
+
qres.add(dis, j);
|
431
402
|
}
|
432
403
|
}
|
433
404
|
}
|
434
405
|
}
|
435
406
|
|
436
|
-
void end_multiple() {
|
437
|
-
|
438
|
-
}
|
407
|
+
void end_multiple() {}
|
439
408
|
|
440
409
|
~RangeSearchResultHandler() {
|
441
410
|
if (partial_results.size() > 0) {
|
442
|
-
RangeSearchPartialResult::merge
|
411
|
+
RangeSearchPartialResult::merge(partial_results);
|
443
412
|
}
|
444
413
|
}
|
445
|
-
|
446
414
|
};
|
447
415
|
|
448
|
-
|
449
|
-
|
450
|
-
|
451
|
-
} // namespace faiss
|
452
|
-
|
416
|
+
} // namespace faiss
|