faiss 0.1.7 → 0.2.3
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- checksums.yaml +4 -4
- data/CHANGELOG.md +18 -0
- data/README.md +7 -7
- data/ext/faiss/ext.cpp +1 -1
- data/ext/faiss/extconf.rb +8 -2
- data/ext/faiss/index.cpp +102 -69
- data/ext/faiss/index_binary.cpp +24 -30
- data/ext/faiss/kmeans.cpp +20 -16
- data/ext/faiss/numo.hpp +867 -0
- data/ext/faiss/pca_matrix.cpp +13 -14
- data/ext/faiss/product_quantizer.cpp +23 -24
- data/ext/faiss/utils.cpp +10 -37
- data/ext/faiss/utils.h +2 -13
- data/lib/faiss/version.rb +1 -1
- data/lib/faiss.rb +0 -5
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +334 -195
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +88 -35
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
- data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +139 -164
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -22
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +116 -147
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +35 -46
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.cpp +372 -348
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +474 -454
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +146 -113
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +248 -250
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +457 -516
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +74 -66
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +125 -133
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +19 -21
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +75 -96
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +21 -26
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +231 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +303 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +405 -464
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -67
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +115 -131
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +22 -23
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.cpp +291 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.h +152 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +120 -155
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -45
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
- data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +652 -474
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +61 -89
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +77 -73
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +197 -170
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +270 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +115 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +595 -611
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +672 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +172 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +682 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h +76 -87
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp +448 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h +130 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h +96 -132
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +648 -701
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +547 -479
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +497 -407
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +75 -94
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.h +31 -41
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io_macros.h +40 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
- data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
- data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +269 -218
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +6 -7
- data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +301 -310
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +133 -118
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +456 -516
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h +260 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h +4 -2
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h +88 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h +226 -165
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h +832 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp +304 -287
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.h +53 -48
- metadata +26 -12
- data/lib/faiss/index.rb +0 -20
- data/lib/faiss/index_binary.rb +0 -20
- data/lib/faiss/kmeans.rb +0 -15
- data/lib/faiss/pca_matrix.rb +0 -15
- data/lib/faiss/product_quantizer.rb +0 -22
@@ -5,8 +5,6 @@
|
|
5
5
|
* LICENSE file in the root directory of this source tree.
|
6
6
|
*/
|
7
7
|
|
8
|
-
// -*- c++ -*-
|
9
|
-
|
10
8
|
#pragma once
|
11
9
|
|
12
10
|
#include <faiss/Index.h>
|
@@ -16,10 +14,11 @@ namespace faiss {
|
|
16
14
|
|
17
15
|
/** Build and index with the sequence of processing steps described in
|
18
16
|
* the string. */
|
19
|
-
Index
|
20
|
-
|
21
|
-
|
22
|
-
|
17
|
+
Index* index_factory(
|
18
|
+
int d,
|
19
|
+
const char* description,
|
20
|
+
MetricType metric = METRIC_L2);
|
23
21
|
|
22
|
+
IndexBinary* index_binary_factory(int d, const char* description);
|
24
23
|
|
25
|
-
}
|
24
|
+
} // namespace faiss
|
@@ -12,10 +12,9 @@
|
|
12
12
|
#ifndef FAISS_INDEX_IO_H
|
13
13
|
#define FAISS_INDEX_IO_H
|
14
14
|
|
15
|
-
|
16
15
|
#include <cstdio>
|
17
|
-
#include <typeinfo>
|
18
16
|
#include <string>
|
17
|
+
#include <typeinfo>
|
19
18
|
#include <vector>
|
20
19
|
|
21
20
|
/** I/O functions can read/write to a filename, a file handle or to an
|
@@ -36,13 +35,13 @@ struct IOReader;
|
|
36
35
|
struct IOWriter;
|
37
36
|
struct InvertedLists;
|
38
37
|
|
39
|
-
void write_index
|
40
|
-
void write_index
|
41
|
-
void write_index
|
38
|
+
void write_index(const Index* idx, const char* fname);
|
39
|
+
void write_index(const Index* idx, FILE* f);
|
40
|
+
void write_index(const Index* idx, IOWriter* writer);
|
42
41
|
|
43
|
-
void write_index_binary
|
44
|
-
void write_index_binary
|
45
|
-
void write_index_binary
|
42
|
+
void write_index_binary(const IndexBinary* idx, const char* fname);
|
43
|
+
void write_index_binary(const IndexBinary* idx, FILE* f);
|
44
|
+
void write_index_binary(const IndexBinary* idx, IOWriter* writer);
|
46
45
|
|
47
46
|
// The read_index flags are implemented only for a subset of index types.
|
48
47
|
const int IO_FLAG_READ_ONLY = 2;
|
@@ -51,32 +50,30 @@ const int IO_FLAG_READ_ONLY = 2;
|
|
51
50
|
const int IO_FLAG_ONDISK_SAME_DIR = 4;
|
52
51
|
// don't load IVF data to RAM, only list sizes
|
53
52
|
const int IO_FLAG_SKIP_IVF_DATA = 8;
|
54
|
-
// try to memmap data (useful to load an ArrayInvertedLists as an
|
53
|
+
// try to memmap data (useful to load an ArrayInvertedLists as an
|
54
|
+
// OnDiskInvertedLists)
|
55
55
|
const int IO_FLAG_MMAP = IO_FLAG_SKIP_IVF_DATA | 0x646f0000;
|
56
56
|
|
57
|
+
Index* read_index(const char* fname, int io_flags = 0);
|
58
|
+
Index* read_index(FILE* f, int io_flags = 0);
|
59
|
+
Index* read_index(IOReader* reader, int io_flags = 0);
|
57
60
|
|
58
|
-
|
59
|
-
|
60
|
-
|
61
|
+
IndexBinary* read_index_binary(const char* fname, int io_flags = 0);
|
62
|
+
IndexBinary* read_index_binary(FILE* f, int io_flags = 0);
|
63
|
+
IndexBinary* read_index_binary(IOReader* reader, int io_flags = 0);
|
61
64
|
|
62
|
-
|
63
|
-
|
64
|
-
IndexBinary *read_index_binary (IOReader *reader, int io_flags = 0);
|
65
|
+
void write_VectorTransform(const VectorTransform* vt, const char* fname);
|
66
|
+
VectorTransform* read_VectorTransform(const char* fname);
|
65
67
|
|
66
|
-
|
67
|
-
|
68
|
+
ProductQuantizer* read_ProductQuantizer(const char* fname);
|
69
|
+
ProductQuantizer* read_ProductQuantizer(IOReader* reader);
|
68
70
|
|
69
|
-
ProductQuantizer
|
70
|
-
ProductQuantizer
|
71
|
-
|
72
|
-
void write_ProductQuantizer (const ProductQuantizer*pq, const char *fname);
|
73
|
-
void write_ProductQuantizer (const ProductQuantizer*pq, IOWriter *f);
|
74
|
-
|
75
|
-
void write_InvertedLists (const InvertedLists *ils, IOWriter *f);
|
76
|
-
InvertedLists *read_InvertedLists (IOReader *reader, int io_flags = 0);
|
71
|
+
void write_ProductQuantizer(const ProductQuantizer* pq, const char* fname);
|
72
|
+
void write_ProductQuantizer(const ProductQuantizer* pq, IOWriter* f);
|
77
73
|
|
74
|
+
void write_InvertedLists(const InvertedLists* ils, IOWriter* f);
|
75
|
+
InvertedLists* read_InvertedLists(IOReader* reader, int io_flags = 0);
|
78
76
|
|
79
77
|
} // namespace faiss
|
80
78
|
|
81
|
-
|
82
79
|
#endif
|
@@ -12,81 +12,80 @@
|
|
12
12
|
#include <faiss/impl/io.h>
|
13
13
|
#include <faiss/impl/io_macros.h>
|
14
14
|
|
15
|
-
|
16
15
|
namespace faiss {
|
17
16
|
|
18
|
-
BlockInvertedLists::BlockInvertedLists
|
19
|
-
size_t nlist,
|
20
|
-
size_t
|
21
|
-
|
22
|
-
|
23
|
-
|
24
|
-
|
25
|
-
|
17
|
+
BlockInvertedLists::BlockInvertedLists(
|
18
|
+
size_t nlist,
|
19
|
+
size_t n_per_block,
|
20
|
+
size_t block_size)
|
21
|
+
: InvertedLists(nlist, InvertedLists::INVALID_CODE_SIZE),
|
22
|
+
n_per_block(n_per_block),
|
23
|
+
block_size(block_size) {
|
24
|
+
ids.resize(nlist);
|
25
|
+
codes.resize(nlist);
|
26
26
|
}
|
27
27
|
|
28
|
-
BlockInvertedLists::BlockInvertedLists
|
29
|
-
|
30
|
-
|
31
|
-
{}
|
32
|
-
|
33
|
-
|
34
|
-
size_t
|
35
|
-
|
36
|
-
|
37
|
-
{
|
38
|
-
if (n_entry == 0)
|
39
|
-
|
40
|
-
|
41
|
-
|
42
|
-
|
43
|
-
|
28
|
+
BlockInvertedLists::BlockInvertedLists()
|
29
|
+
: InvertedLists(0, InvertedLists::INVALID_CODE_SIZE),
|
30
|
+
n_per_block(0),
|
31
|
+
block_size(0) {}
|
32
|
+
|
33
|
+
size_t BlockInvertedLists::add_entries(
|
34
|
+
size_t list_no,
|
35
|
+
size_t n_entry,
|
36
|
+
const idx_t* ids_in,
|
37
|
+
const uint8_t* code) {
|
38
|
+
if (n_entry == 0)
|
39
|
+
return 0;
|
40
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT(list_no < nlist);
|
41
|
+
size_t o = ids[list_no].size();
|
42
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT(
|
43
|
+
o == 0); // not clear how we should handle subsequent adds
|
44
|
+
ids[list_no].resize(o + n_entry);
|
45
|
+
memcpy(&ids[list_no][o], ids_in, sizeof(ids_in[0]) * n_entry);
|
44
46
|
|
45
47
|
// copy whole blocks
|
46
48
|
size_t n_block = (n_entry + n_per_block - 1) / n_per_block;
|
47
|
-
codes
|
48
|
-
memcpy
|
49
|
+
codes[list_no].resize(n_block * block_size);
|
50
|
+
memcpy(&codes[list_no][o * code_size], code, n_block * block_size);
|
49
51
|
return o;
|
50
52
|
}
|
51
53
|
|
52
|
-
size_t BlockInvertedLists::list_size(size_t list_no) const
|
53
|
-
|
54
|
-
assert (list_no < nlist);
|
54
|
+
size_t BlockInvertedLists::list_size(size_t list_no) const {
|
55
|
+
assert(list_no < nlist);
|
55
56
|
return ids[list_no].size();
|
56
57
|
}
|
57
58
|
|
58
|
-
const uint8_t
|
59
|
-
|
60
|
-
assert (list_no < nlist);
|
59
|
+
const uint8_t* BlockInvertedLists::get_codes(size_t list_no) const {
|
60
|
+
assert(list_no < nlist);
|
61
61
|
return codes[list_no].get();
|
62
62
|
}
|
63
63
|
|
64
|
-
const InvertedLists::idx_t
|
65
|
-
|
66
|
-
assert (list_no < nlist);
|
64
|
+
const InvertedLists::idx_t* BlockInvertedLists::get_ids(size_t list_no) const {
|
65
|
+
assert(list_no < nlist);
|
67
66
|
return ids[list_no].data();
|
68
67
|
}
|
69
68
|
|
70
|
-
void BlockInvertedLists::resize
|
71
|
-
|
72
|
-
ids[list_no].resize (new_size);
|
69
|
+
void BlockInvertedLists::resize(size_t list_no, size_t new_size) {
|
70
|
+
ids[list_no].resize(new_size);
|
73
71
|
size_t prev_nbytes = codes[list_no].size();
|
74
72
|
size_t n_block = (new_size + n_per_block - 1) / n_per_block;
|
75
73
|
size_t new_nbytes = n_block * block_size;
|
76
|
-
codes[list_no].resize
|
74
|
+
codes[list_no].resize(new_nbytes);
|
77
75
|
if (prev_nbytes < new_nbytes) {
|
78
76
|
// set new elements to 0
|
79
|
-
memset(
|
80
|
-
|
81
|
-
|
82
|
-
);
|
77
|
+
memset(codes[list_no].data() + prev_nbytes,
|
78
|
+
0,
|
79
|
+
new_nbytes - prev_nbytes);
|
83
80
|
}
|
84
81
|
}
|
85
82
|
|
86
|
-
void BlockInvertedLists::update_entries
|
87
|
-
|
88
|
-
|
89
|
-
|
83
|
+
void BlockInvertedLists::update_entries(
|
84
|
+
size_t,
|
85
|
+
size_t,
|
86
|
+
size_t,
|
87
|
+
const idx_t*,
|
88
|
+
const uint8_t*) {
|
90
89
|
FAISS_THROW_MSG("not impemented");
|
91
90
|
/*
|
92
91
|
assert (list_no < nlist);
|
@@ -96,29 +95,25 @@ void BlockInvertedLists::update_entries (
|
|
96
95
|
*/
|
97
96
|
}
|
98
97
|
|
99
|
-
|
100
|
-
BlockInvertedLists::~BlockInvertedLists ()
|
101
|
-
{}
|
98
|
+
BlockInvertedLists::~BlockInvertedLists() {}
|
102
99
|
|
103
100
|
/**************************************************
|
104
101
|
* IO hook implementation
|
105
102
|
**************************************************/
|
106
103
|
|
107
|
-
BlockInvertedListsIOHook::BlockInvertedListsIOHook()
|
108
|
-
|
109
|
-
{}
|
110
|
-
|
104
|
+
BlockInvertedListsIOHook::BlockInvertedListsIOHook()
|
105
|
+
: InvertedListsIOHook("ilbl", typeid(BlockInvertedLists).name()) {}
|
111
106
|
|
112
|
-
void BlockInvertedListsIOHook::write(const InvertedLists
|
113
|
-
{
|
114
|
-
uint32_t h = fourcc
|
115
|
-
WRITE1
|
116
|
-
const BlockInvertedLists
|
117
|
-
|
118
|
-
WRITE1
|
119
|
-
WRITE1
|
120
|
-
WRITE1
|
121
|
-
WRITE1
|
107
|
+
void BlockInvertedListsIOHook::write(const InvertedLists* ils_in, IOWriter* f)
|
108
|
+
const {
|
109
|
+
uint32_t h = fourcc("ilbl");
|
110
|
+
WRITE1(h);
|
111
|
+
const BlockInvertedLists* il =
|
112
|
+
dynamic_cast<const BlockInvertedLists*>(ils_in);
|
113
|
+
WRITE1(il->nlist);
|
114
|
+
WRITE1(il->code_size);
|
115
|
+
WRITE1(il->n_per_block);
|
116
|
+
WRITE1(il->block_size);
|
122
117
|
|
123
118
|
for (size_t i = 0; i < il->nlist; i++) {
|
124
119
|
WRITEVECTOR(il->ids[i]);
|
@@ -126,13 +121,13 @@ void BlockInvertedListsIOHook::write(const InvertedLists *ils_in, IOWriter *f) c
|
|
126
121
|
}
|
127
122
|
}
|
128
123
|
|
129
|
-
InvertedLists
|
130
|
-
{
|
131
|
-
BlockInvertedLists
|
132
|
-
READ1
|
133
|
-
READ1
|
134
|
-
READ1
|
135
|
-
READ1
|
124
|
+
InvertedLists* BlockInvertedListsIOHook::read(IOReader* f, int /* io_flags */)
|
125
|
+
const {
|
126
|
+
BlockInvertedLists* il = new BlockInvertedLists();
|
127
|
+
READ1(il->nlist);
|
128
|
+
READ1(il->code_size);
|
129
|
+
READ1(il->n_per_block);
|
130
|
+
READ1(il->block_size);
|
136
131
|
|
137
132
|
il->ids.resize(il->nlist);
|
138
133
|
il->codes.resize(il->nlist);
|
@@ -145,7 +140,4 @@ InvertedLists * BlockInvertedListsIOHook::read(IOReader *f, int /* io_flags */)
|
|
145
140
|
return il;
|
146
141
|
}
|
147
142
|
|
148
|
-
|
149
|
-
|
150
|
-
|
151
143
|
} // namespace faiss
|
@@ -5,13 +5,12 @@
|
|
5
5
|
* LICENSE file in the root directory of this source tree.
|
6
6
|
*/
|
7
7
|
|
8
|
-
|
9
8
|
#pragma once
|
10
9
|
|
10
|
+
#include <faiss/index_io.h>
|
11
11
|
#include <faiss/invlists/InvertedLists.h>
|
12
12
|
#include <faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h>
|
13
13
|
#include <faiss/utils/AlignedTable.h>
|
14
|
-
#include <faiss/index_io.h>
|
15
14
|
|
16
15
|
namespace faiss {
|
17
16
|
|
@@ -28,49 +27,48 @@ namespace faiss {
|
|
28
27
|
* The writing functions add_entries and update_entries operate on block-aligned
|
29
28
|
* data.
|
30
29
|
*/
|
31
|
-
struct BlockInvertedLists: InvertedLists {
|
32
|
-
|
33
|
-
size_t
|
34
|
-
size_t block_size; // nb bytes per block
|
30
|
+
struct BlockInvertedLists : InvertedLists {
|
31
|
+
size_t n_per_block; // nb of vectors stored per block
|
32
|
+
size_t block_size; // nb bytes per block
|
35
33
|
|
36
34
|
std::vector<AlignedTable<uint8_t>> codes;
|
37
35
|
std::vector<std::vector<idx_t>> ids;
|
38
36
|
|
39
|
-
|
40
|
-
BlockInvertedLists (
|
41
|
-
size_t nlist, size_t vec_per_block,
|
42
|
-
size_t block_size
|
43
|
-
);
|
37
|
+
BlockInvertedLists(size_t nlist, size_t vec_per_block, size_t block_size);
|
44
38
|
|
45
39
|
BlockInvertedLists();
|
46
40
|
|
47
41
|
size_t list_size(size_t list_no) const override;
|
48
|
-
const uint8_t
|
49
|
-
const idx_t
|
42
|
+
const uint8_t* get_codes(size_t list_no) const override;
|
43
|
+
const idx_t* get_ids(size_t list_no) const override;
|
50
44
|
|
51
45
|
// works only on empty BlockInvertedLists
|
52
46
|
// the codes should be of size ceil(n_entry / n_per_block) * block_size
|
53
47
|
// and padded with 0s
|
54
|
-
size_t add_entries
|
55
|
-
|
56
|
-
|
48
|
+
size_t add_entries(
|
49
|
+
size_t list_no,
|
50
|
+
size_t n_entry,
|
51
|
+
const idx_t* ids,
|
52
|
+
const uint8_t* code) override;
|
57
53
|
|
58
54
|
/// not implemented
|
59
|
-
void update_entries
|
60
|
-
|
55
|
+
void update_entries(
|
56
|
+
size_t list_no,
|
57
|
+
size_t offset,
|
58
|
+
size_t n_entry,
|
59
|
+
const idx_t* ids,
|
60
|
+
const uint8_t* code) override;
|
61
61
|
|
62
62
|
// also pads new data with 0s
|
63
|
-
void resize
|
64
|
-
|
65
|
-
~BlockInvertedLists () override;
|
63
|
+
void resize(size_t list_no, size_t new_size) override;
|
66
64
|
|
65
|
+
~BlockInvertedLists() override;
|
67
66
|
};
|
68
67
|
|
69
68
|
struct BlockInvertedListsIOHook : InvertedListsIOHook {
|
70
69
|
BlockInvertedListsIOHook();
|
71
|
-
void write(const InvertedLists
|
72
|
-
InvertedLists
|
70
|
+
void write(const InvertedLists* ils, IOWriter* f) const override;
|
71
|
+
InvertedLists* read(IOReader* f, int io_flags) const override;
|
73
72
|
};
|
74
73
|
|
75
|
-
|
76
74
|
} // namespace faiss
|