nabu 2024.1.1__py3-none-any.whl → 2024.1.2__py3-none-any.whl
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- nabu/__init__.py +1 -1
- nabu/app/cast_volume.py +11 -2
- nabu/app/multicor.py +24 -2
- nabu/io/cast_volume.py +3 -3
- nabu/io/utils.py +2 -2
- nabu/stitching/tests/test_z_stitching.py +0 -1
- nabu/stitching/z_stitching.py +3 -3
- {nabu-2024.1.1.dist-info → nabu-2024.1.2.dist-info}/METADATA +2 -2
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- nabu-2024.1.2.dist-info/top_level.txt +2 -0
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- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/doc/create_conf_doc.py +0 -38
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/doc/get_mathjax.py +0 -34
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/__init__.py +0 -17
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/bootstrap.py +0 -88
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/bootstrap_stitching.py +0 -69
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/cast_volume.py +0 -272
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/cli_configs.py +0 -626
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/compare_volumes.py +0 -94
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/composite_cor.py +0 -144
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/correct_rot.py +0 -70
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/create_distortion_map_from_poly.py +0 -153
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/diag_to_pix.py +0 -358
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/diag_to_rot.py +0 -449
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/double_flatfield.py +0 -143
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/generate_header.py +0 -261
- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/histogram.py +0 -197
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- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/parse_reconstruction_log.py +0 -151
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- build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app/reconstruct.py +0 -120
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- build/lib/nabu/estimation/tests/test_translation.py +0 -78
- build/lib/nabu/estimation/tilt.py +0 -214
- build/lib/nabu/estimation/translation.py +0 -193
- build/lib/nabu/estimation/utils.py +0 -39
- build/lib/nabu/io/__init__.py +0 -2
- build/lib/nabu/io/cast_volume.py +0 -371
- build/lib/nabu/io/detector_distortion.py +0 -305
- build/lib/nabu/io/reader.py +0 -628
- build/lib/nabu/io/reader_helical.py +0 -114
- build/lib/nabu/io/tests/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/io/tests/test_cast_volume.py +0 -339
- build/lib/nabu/io/tests/test_detector_distortion.py +0 -178
- build/lib/nabu/io/tests/test_writers.py +0 -187
- build/lib/nabu/io/tiffwriter_zmm.py +0 -99
- build/lib/nabu/io/utils.py +0 -263
- build/lib/nabu/io/writer.py +0 -892
- build/lib/nabu/misc/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/misc/binning.py +0 -98
- build/lib/nabu/misc/fftshift.py +0 -6
- build/lib/nabu/misc/filters.py +0 -24
- build/lib/nabu/misc/fourier_filters.py +0 -152
- build/lib/nabu/misc/histogram.py +0 -6
- build/lib/nabu/misc/histogram_cuda.py +0 -8
- build/lib/nabu/misc/kernel_base.py +0 -4
- build/lib/nabu/misc/padding.py +0 -83
- build/lib/nabu/misc/padding_base.py +0 -6
- build/lib/nabu/misc/processing_base.py +0 -4
- build/lib/nabu/misc/rotation.py +0 -6
- build/lib/nabu/misc/rotation_cuda.py +0 -6
- build/lib/nabu/misc/tests/__init__.py +0 -1
- build/lib/nabu/misc/tests/test_binning.py +0 -48
- build/lib/nabu/misc/tests/test_interpolation.py +0 -70
- build/lib/nabu/misc/transpose.py +0 -6
- build/lib/nabu/misc/unsharp.py +0 -4
- build/lib/nabu/misc/unsharp_cuda.py +0 -6
- build/lib/nabu/misc/unsharp_opencl.py +0 -8
- build/lib/nabu/misc/utils.py +0 -117
- build/lib/nabu/opencl/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/opencl/fft.py +0 -6
- build/lib/nabu/opencl/kernel.py +0 -135
- build/lib/nabu/opencl/memcpy.py +0 -35
- build/lib/nabu/opencl/padding.py +0 -6
- build/lib/nabu/opencl/processing.py +0 -62
- build/lib/nabu/opencl/tests/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/opencl/utils.py +0 -292
- build/lib/nabu/pipeline/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/pipeline/config.py +0 -265
- build/lib/nabu/pipeline/config_validators.py +0 -589
- build/lib/nabu/pipeline/datadump.py +0 -164
- build/lib/nabu/pipeline/dataset_validator.py +0 -211
- build/lib/nabu/pipeline/detector_distortion_provider.py +0 -20
- build/lib/nabu/pipeline/estimators.py +0 -1012
- build/lib/nabu/pipeline/fallback_utils.py +0 -149
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/chunked.py +0 -849
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/chunked_cuda.py +0 -152
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/computations.py +0 -260
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/dataset_validator.py +0 -63
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/nabu_config.py +0 -590
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/processconfig.py +0 -825
- build/lib/nabu/pipeline/fullfield/reconstruction.py +0 -851
- build/lib/nabu/pipeline/helical/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/pipeline/helical/dataset_validator.py +0 -19
- build/lib/nabu/pipeline/helical/fbp.py +0 -147
- build/lib/nabu/pipeline/helical/filtering.py +0 -246
- build/lib/nabu/pipeline/helical/gridded_accumulator.py +0 -575
- build/lib/nabu/pipeline/helical/helical_chunked_regridded.py +0 -1670
- build/lib/nabu/pipeline/helical/helical_chunked_regridded_cuda.py +0 -119
- build/lib/nabu/pipeline/helical/helical_reconstruction.py +0 -598
- build/lib/nabu/pipeline/helical/helical_utils.py +0 -42
- build/lib/nabu/pipeline/helical/nabu_config.py +0 -175
- build/lib/nabu/pipeline/helical/processconfig.py +0 -62
- build/lib/nabu/pipeline/helical/span_strategy.py +0 -483
- build/lib/nabu/pipeline/helical/tests/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/pipeline/helical/tests/test_accumulator.py +0 -157
- build/lib/nabu/pipeline/helical/tests/test_pipeline_elements_full.py +0 -355
- build/lib/nabu/pipeline/helical/tests/test_strategy.py +0 -61
- build/lib/nabu/pipeline/helical/utils.py +0 -51
- build/lib/nabu/pipeline/helical/weight_balancer.py +0 -101
- build/lib/nabu/pipeline/params.py +0 -163
- build/lib/nabu/pipeline/processconfig.py +0 -210
- build/lib/nabu/pipeline/tests/test_chunk_reader.py +0 -78
- build/lib/nabu/pipeline/tests/test_estimators.py +0 -149
- build/lib/nabu/pipeline/utils.py +0 -116
- build/lib/nabu/pipeline/writer.py +0 -193
- build/lib/nabu/pipeline/xrdct/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/preproc/__init__.py +0 -7
- build/lib/nabu/preproc/alignment.py +0 -11
- build/lib/nabu/preproc/ccd.py +0 -161
- build/lib/nabu/preproc/ccd_cuda.py +0 -169
- build/lib/nabu/preproc/ctf.py +0 -361
- build/lib/nabu/preproc/ctf_cuda.py +0 -142
- build/lib/nabu/preproc/distortion.py +0 -92
- build/lib/nabu/preproc/double_flatfield.py +0 -212
- build/lib/nabu/preproc/double_flatfield_cuda.py +0 -174
- build/lib/nabu/preproc/double_flatfield_variable_region.py +0 -68
- build/lib/nabu/preproc/flatfield.py +0 -448
- build/lib/nabu/preproc/flatfield_cuda.py +0 -144
- build/lib/nabu/preproc/flatfield_variable_region.py +0 -79
- build/lib/nabu/preproc/phase.py +0 -425
- build/lib/nabu/preproc/phase_cuda.py +0 -143
- build/lib/nabu/preproc/shift.py +0 -95
- build/lib/nabu/preproc/shift_cuda.py +0 -102
- build/lib/nabu/preproc/tests/__init__.py +0 -1
- build/lib/nabu/preproc/tests/test_ccd_corr.py +0 -59
- build/lib/nabu/preproc/tests/test_ctf.py +0 -250
- build/lib/nabu/preproc/tests/test_double_flatfield.py +0 -86
- build/lib/nabu/preproc/tests/test_flatfield.py +0 -626
- build/lib/nabu/preproc/tests/test_paganin.py +0 -67
- build/lib/nabu/preproc/tests/test_vshift.py +0 -73
- build/lib/nabu/processing/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/processing/convolution_cuda.py +0 -375
- build/lib/nabu/processing/fft_base.py +0 -163
- build/lib/nabu/processing/fft_cuda.py +0 -256
- build/lib/nabu/processing/fft_opencl.py +0 -54
- build/lib/nabu/processing/fftshift.py +0 -134
- build/lib/nabu/processing/histogram.py +0 -286
- build/lib/nabu/processing/histogram_cuda.py +0 -103
- build/lib/nabu/processing/kernel_base.py +0 -126
- build/lib/nabu/processing/medfilt_cuda.py +0 -159
- build/lib/nabu/processing/muladd.py +0 -29
- build/lib/nabu/processing/muladd_cuda.py +0 -68
- build/lib/nabu/processing/padding_base.py +0 -71
- build/lib/nabu/processing/padding_cuda.py +0 -75
- build/lib/nabu/processing/padding_opencl.py +0 -77
- build/lib/nabu/processing/processing_base.py +0 -123
- build/lib/nabu/processing/roll_opencl.py +0 -64
- build/lib/nabu/processing/rotation.py +0 -63
- build/lib/nabu/processing/rotation_cuda.py +0 -66
- build/lib/nabu/processing/tests/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/processing/tests/test_fft.py +0 -268
- build/lib/nabu/processing/tests/test_fftshift.py +0 -71
- build/lib/nabu/processing/tests/test_histogram.py +0 -55
- build/lib/nabu/processing/tests/test_medfilt.py +0 -77
- build/lib/nabu/processing/tests/test_muladd.py +0 -54
- build/lib/nabu/processing/tests/test_padding.py +0 -247
- build/lib/nabu/processing/tests/test_roll.py +0 -63
- build/lib/nabu/processing/tests/test_rotation.py +0 -83
- build/lib/nabu/processing/tests/test_transpose.py +0 -72
- build/lib/nabu/processing/tests/test_unsharp.py +0 -106
- build/lib/nabu/processing/transpose.py +0 -126
- build/lib/nabu/processing/unsharp.py +0 -79
- build/lib/nabu/processing/unsharp_cuda.py +0 -53
- build/lib/nabu/processing/unsharp_opencl.py +0 -75
- build/lib/nabu/reconstruction/__init__.py +0 -3
- build/lib/nabu/reconstruction/cone.py +0 -241
- build/lib/nabu/reconstruction/fbp.py +0 -124
- build/lib/nabu/reconstruction/fbp_base.py +0 -391
- build/lib/nabu/reconstruction/fbp_opencl.py +0 -78
- build/lib/nabu/reconstruction/filtering.py +0 -220
- build/lib/nabu/reconstruction/filtering_cuda.py +0 -103
- build/lib/nabu/reconstruction/filtering_opencl.py +0 -111
- build/lib/nabu/reconstruction/projection.py +0 -240
- build/lib/nabu/reconstruction/reconstructor.py +0 -174
- build/lib/nabu/reconstruction/reconstructor_cuda.py +0 -44
- build/lib/nabu/reconstruction/rings.py +0 -248
- build/lib/nabu/reconstruction/rings_cuda.py +0 -322
- build/lib/nabu/reconstruction/sinogram.py +0 -467
- build/lib/nabu/reconstruction/sinogram_cuda.py +0 -250
- build/lib/nabu/reconstruction/sinogram_opencl.py +0 -40
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/__init__.py +0 -1
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_cone.py +0 -308
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_deringer.py +0 -220
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_fbp.py +0 -252
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_filtering.py +0 -133
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_halftomo.py +0 -100
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_projector.py +0 -164
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_reconstructor.py +0 -93
- build/lib/nabu/reconstruction/tests/test_sino_normalization.py +0 -85
- build/lib/nabu/resources/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/resources/cli/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/resources/cor.py +0 -5
- build/lib/nabu/resources/dataset_analyzer.py +0 -469
- build/lib/nabu/resources/gpu.py +0 -169
- build/lib/nabu/resources/logger.py +0 -130
- build/lib/nabu/resources/nxflatfield.py +0 -217
- build/lib/nabu/resources/templates/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/resources/tests/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/resources/tests/test_nxflatfield.py +0 -104
- build/lib/nabu/resources/tests/test_units.py +0 -47
- build/lib/nabu/resources/utils.py +0 -174
- build/lib/nabu/stitching/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/stitching/alignment.py +0 -184
- build/lib/nabu/stitching/config.py +0 -1286
- build/lib/nabu/stitching/definitions.py +0 -6
- build/lib/nabu/stitching/frame_composition.py +0 -155
- build/lib/nabu/stitching/overlap.py +0 -373
- build/lib/nabu/stitching/sample_normalization.py +0 -60
- build/lib/nabu/stitching/slurm_utils.py +0 -204
- build/lib/nabu/stitching/tests/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_alignment.py +0 -99
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_config.py +0 -226
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_frame_composition.py +0 -180
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_overlap.py +0 -98
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_sample_normalization.py +0 -49
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_slurm_utils.py +0 -146
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_utils.py +0 -21
- build/lib/nabu/stitching/tests/test_z_stitching.py +0 -1183
- build/lib/nabu/stitching/utils.py +0 -563
- build/lib/nabu/stitching/z_stitching.py +0 -2279
- build/lib/nabu/tests.py +0 -51
- build/lib/nabu/testutils.py +0 -375
- build/lib/nabu/thirdparty/__init__.py +0 -0
- build/lib/nabu/thirdparty/algotom_convert_sino.py +0 -276
- build/lib/nabu/thirdparty/pore3d_deringer_munch.py +0 -108
- build/lib/nabu/thirdparty/tomocupy_remove_stripe.py +0 -586
- build/lib/nabu/thirdparty/tomopy_phase.py +0 -239
- build/lib/nabu/thirdparty/tomwer_load_flats_darks.py +0 -162
- build/lib/nabu/utils.py +0 -836
- nabu-2024.1.1.dist-info/RECORD +0 -2375
- nabu-2024.1.1.dist-info/top_level.txt +0 -4
- {build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/app → nabu/app/tests}/__init__.py +0 -0
- {nabu-2024.1.1.dist-info → nabu-2024.1.2.dist-info}/LICENSE +0 -0
- {nabu-2024.1.1.dist-info → nabu-2024.1.2.dist-info}/entry_points.txt +0 -0
@@ -1,149 +0,0 @@
|
|
1
|
-
""" This module is meant to contain classes which are in the process of being superseed by new classes depending on recent packages
|
2
|
-
with fast development cycles in order to be able to fall-back in two cases :
|
3
|
-
-- the new packages, or one of their parts, break from one version to another.
|
4
|
-
-- For parts of Nabu which need some extra time to adapt.
|
5
|
-
"""
|
6
|
-
from ..resources.logger import LoggerOrPrint
|
7
|
-
from ..utils import check_supported
|
8
|
-
from ..io.writer import Writers, LegacyNXProcessWriter
|
9
|
-
from ..resources.utils import is_hdf5_extension
|
10
|
-
from os import path, mkdir
|
11
|
-
from .params import files_formats
|
12
|
-
|
13
|
-
|
14
|
-
class WriterConfigurator:
|
15
|
-
"""No dependency on tomoscan for this class. The new class would be WriterManager which depend on tomoscan."""
|
16
|
-
|
17
|
-
_overwrite_warned = False
|
18
|
-
|
19
|
-
def __init__(
|
20
|
-
self,
|
21
|
-
output_dir,
|
22
|
-
file_prefix,
|
23
|
-
file_format="hdf5",
|
24
|
-
overwrite=False,
|
25
|
-
start_index=None,
|
26
|
-
logger=None,
|
27
|
-
nx_info=None,
|
28
|
-
write_histogram=False,
|
29
|
-
histogram_entry="entry",
|
30
|
-
writer_options=None,
|
31
|
-
extra_options=None,
|
32
|
-
):
|
33
|
-
"""
|
34
|
-
Create a Writer from a set of parameters.
|
35
|
-
|
36
|
-
Parameters
|
37
|
-
----------
|
38
|
-
output_dir: str
|
39
|
-
Directory where the file(s) will be written.
|
40
|
-
file_prefix: str
|
41
|
-
File prefix (without leading path)
|
42
|
-
start_index: int, optional
|
43
|
-
Index to start the files numbering (filename_0123.ext).
|
44
|
-
Default is 0.
|
45
|
-
Ignored for HDF5 extension.
|
46
|
-
logger: nabu.resources.logger.Logger, optional
|
47
|
-
Logger object
|
48
|
-
nx_info: dict, optional
|
49
|
-
Dictionary containing the nexus information.
|
50
|
-
write_histogram: bool, optional
|
51
|
-
Whether to also write a histogram of data. If set to True, it will configure
|
52
|
-
an additional "writer".
|
53
|
-
histogram_entry: str, optional
|
54
|
-
Name of the HDF5 entry for the output histogram file, if write_histogram is True.
|
55
|
-
Ignored if the output format is already HDF5 : in this case, nx_info["entry"] is taken.
|
56
|
-
writer_options: dict, optional
|
57
|
-
Other advanced options to pass to Writer class.
|
58
|
-
"""
|
59
|
-
self.logger = LoggerOrPrint(logger)
|
60
|
-
self.start_index = start_index
|
61
|
-
self.write_histogram = write_histogram
|
62
|
-
self.overwrite = overwrite
|
63
|
-
writer_options = writer_options or {}
|
64
|
-
self.extra_options = extra_options or {}
|
65
|
-
|
66
|
-
check_supported(file_format, list(Writers.keys()), "output file format")
|
67
|
-
|
68
|
-
self._set_output_dir(output_dir)
|
69
|
-
self._set_file_name(file_prefix, file_format)
|
70
|
-
|
71
|
-
# Init Writer
|
72
|
-
writer_cls = Writers[file_format]
|
73
|
-
writer_args = [self.fname]
|
74
|
-
writer_kwargs = self._get_initial_writer_kwarg()
|
75
|
-
self._writer_exec_args = []
|
76
|
-
self._writer_exec_kwargs = {}
|
77
|
-
self._is_hdf5_output = is_hdf5_extension(file_format)
|
78
|
-
|
79
|
-
if self._is_hdf5_output:
|
80
|
-
writer_kwargs["entry"] = nx_info["entry"]
|
81
|
-
writer_kwargs["filemode"] = "a"
|
82
|
-
writer_kwargs["overwrite"] = overwrite
|
83
|
-
self._writer_exec_args.append(nx_info["process_name"])
|
84
|
-
self._writer_exec_kwargs["processing_index"] = nx_info["processing_index"]
|
85
|
-
self._writer_exec_kwargs["config"] = nx_info["config"]
|
86
|
-
else:
|
87
|
-
writer_kwargs["start_index"] = self.start_index
|
88
|
-
if writer_options.get("tiff_single_file", False) and "tif" in file_format:
|
89
|
-
do_append = writer_options.get("single_tiff_initialized", False)
|
90
|
-
writer_kwargs.update({"multiframe": True, "append": do_append})
|
91
|
-
|
92
|
-
if files_formats.get(file_format, None) == "jp2":
|
93
|
-
cratios = self.extra_options.get("jpeg2000_compression_ratio", None)
|
94
|
-
if cratios is not None:
|
95
|
-
cratios = [cratios]
|
96
|
-
writer_kwargs["cratios"] = cratios
|
97
|
-
writer_kwargs["float_clip_values"] = self.extra_options.get("float_clip_values", None)
|
98
|
-
self.writer = writer_cls(*writer_args, **writer_kwargs)
|
99
|
-
|
100
|
-
if self.write_histogram and not (self._is_hdf5_output):
|
101
|
-
self._init_separate_histogram_writer(histogram_entry)
|
102
|
-
|
103
|
-
def _get_initial_writer_kwarg(self):
|
104
|
-
return {}
|
105
|
-
|
106
|
-
def _set_output_dir(self, output_dir):
|
107
|
-
self.output_dir = output_dir
|
108
|
-
if path.exists(self.output_dir):
|
109
|
-
if not (path.isdir(self.output_dir)):
|
110
|
-
raise ValueError(
|
111
|
-
"Unable to create directory %s: already exists and is not a directory" % self.output_dir
|
112
|
-
)
|
113
|
-
else:
|
114
|
-
self.logger.debug("Creating directory %s" % self.output_dir)
|
115
|
-
mkdir(self.output_dir)
|
116
|
-
|
117
|
-
def _set_file_name(self, file_prefix, file_format):
|
118
|
-
self.file_prefix = file_prefix
|
119
|
-
self.file_format = file_format
|
120
|
-
self.fname = path.join(self.output_dir, file_prefix + "." + file_format)
|
121
|
-
if path.exists(self.fname):
|
122
|
-
err = "File already exists: %s" % self.fname
|
123
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-
if self.overwrite:
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124
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-
if not (WriterConfigurator._overwrite_warned):
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125
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-
self.logger.warning(err + ". It will be overwritten as requested in configuration")
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126
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-
WriterConfigurator._overwrite_warned = True
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127
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-
else:
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128
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-
self.logger.fatal(err)
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129
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-
raise ValueError(err)
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130
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-
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131
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-
def _init_separate_histogram_writer(self, hist_entry):
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132
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-
hist_fname = path.join(self.output_dir, "histogram_%06d.hdf5" % self.start_index)
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133
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-
self.histogram_writer = LegacyNXProcessWriter(
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134
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-
hist_fname,
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135
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-
entry=hist_entry,
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136
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-
filemode="w",
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137
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-
overwrite=True,
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138
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-
)
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139
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-
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140
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-
def get_histogram_writer(self):
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141
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-
if not (self.write_histogram):
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142
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-
return None
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143
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-
if self._is_hdf5_output:
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144
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-
return self.writer
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145
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-
else:
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146
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-
return self.histogram_writer
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147
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-
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148
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-
def write_data(self, data):
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149
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-
self.writer.write(data, *self._writer_exec_args, **self._writer_exec_kwargs)
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build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/build/lib/nabu/pipeline/fullfield/__init__.py
DELETED
File without changes
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