faiss 0.2.0 → 0.2.4
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- checksums.yaml +4 -4
- data/CHANGELOG.md +16 -0
- data/LICENSE.txt +1 -1
- data/README.md +7 -7
- data/ext/faiss/extconf.rb +6 -3
- data/ext/faiss/numo.hpp +4 -4
- data/ext/faiss/utils.cpp +1 -1
- data/ext/faiss/utils.h +1 -1
- data/lib/faiss/version.rb +1 -1
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +365 -194
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +102 -35
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
- data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +126 -224
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -36
- data/vendor/faiss/faiss/IndexAdditiveQuantizer.cpp +407 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexAdditiveQuantizer.h +195 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +115 -176
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +42 -59
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlatCodes.cpp +67 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlatCodes.h +47 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.cpp +372 -348
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +545 -453
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +169 -118
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFAdditiveQuantizer.cpp +316 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFAdditiveQuantizer.h +121 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +247 -252
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +459 -517
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +75 -67
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +163 -150
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +38 -25
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +66 -113
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +20 -38
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +229 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +301 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +387 -495
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -82
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +139 -127
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +32 -23
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +111 -172
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -59
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
- data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +654 -475
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +64 -89
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +78 -73
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +198 -171
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIcmEncoder.h +60 -0
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +503 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +175 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +606 -617
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +855 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +244 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +679 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h +76 -87
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp +758 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h +188 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h +96 -132
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +647 -707
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +631 -480
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +547 -407
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +76 -95
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.h +31 -41
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io_macros.h +60 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/kmeans1d.cpp +301 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/kmeans1d.h +48 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
- data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
- data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +619 -397
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +8 -6
- data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +305 -312
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +170 -122
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +498 -508
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h +260 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h +4 -2
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h +88 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h +226 -165
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h +832 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp +304 -287
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.h +54 -49
- metadata +29 -4
@@ -24,13 +24,11 @@
|
|
24
24
|
#ifndef FAISS_hamming_h
|
25
25
|
#define FAISS_hamming_h
|
26
26
|
|
27
|
-
|
28
27
|
#include <stdint.h>
|
29
28
|
|
30
29
|
#include <faiss/impl/platform_macros.h>
|
31
30
|
#include <faiss/utils/Heap.h>
|
32
31
|
|
33
|
-
|
34
32
|
/* The Hamming distance type */
|
35
33
|
typedef int32_t hamdis_t;
|
36
34
|
|
@@ -42,8 +40,7 @@ namespace faiss {
|
|
42
40
|
|
43
41
|
struct RangeSearchResult;
|
44
42
|
|
45
|
-
void bitvec_print
|
46
|
-
|
43
|
+
void bitvec_print(const uint8_t* b, size_t d);
|
47
44
|
|
48
45
|
/* Functions for casting vectors of regular types to compact bits.
|
49
46
|
They assume proper allocation done beforehand, meaning that b
|
@@ -52,53 +49,45 @@ void bitvec_print (const uint8_t * b, size_t d);
|
|
52
49
|
/* Makes an array of bits from the signs of a float array. The length
|
53
50
|
of the output array b is rounded up to byte size (allocate
|
54
51
|
accordingly) */
|
55
|
-
void fvecs2bitvecs
|
56
|
-
const float * x,
|
57
|
-
uint8_t * b,
|
58
|
-
size_t d,
|
59
|
-
size_t n);
|
60
|
-
|
61
|
-
void bitvecs2fvecs (
|
62
|
-
const uint8_t * b,
|
63
|
-
float * x,
|
64
|
-
size_t d,
|
65
|
-
size_t n);
|
52
|
+
void fvecs2bitvecs(const float* x, uint8_t* b, size_t d, size_t n);
|
66
53
|
|
54
|
+
void bitvecs2fvecs(const uint8_t* b, float* x, size_t d, size_t n);
|
67
55
|
|
68
|
-
void fvec2bitvec
|
56
|
+
void fvec2bitvec(const float* x, uint8_t* b, size_t d);
|
69
57
|
|
70
58
|
/** Shuffle the bits from b(i, j) := a(i, order[j])
|
71
59
|
*/
|
72
|
-
void bitvec_shuffle
|
73
|
-
|
74
|
-
|
75
|
-
|
76
|
-
|
60
|
+
void bitvec_shuffle(
|
61
|
+
size_t n,
|
62
|
+
size_t da,
|
63
|
+
size_t db,
|
64
|
+
const int* order,
|
65
|
+
const uint8_t* a,
|
66
|
+
uint8_t* b);
|
77
67
|
|
78
68
|
/***********************************************
|
79
69
|
* Generic reader/writer for bit strings
|
80
70
|
***********************************************/
|
81
71
|
|
82
|
-
|
83
72
|
struct BitstringWriter {
|
84
|
-
uint8_t
|
73
|
+
uint8_t* code;
|
85
74
|
size_t code_size;
|
86
75
|
size_t i; // current bit offset
|
87
76
|
|
88
77
|
// code_size in bytes
|
89
|
-
BitstringWriter(uint8_t
|
78
|
+
BitstringWriter(uint8_t* code, size_t code_size);
|
90
79
|
|
91
80
|
// write the nbit low bits of x
|
92
81
|
void write(uint64_t x, int nbit);
|
93
82
|
};
|
94
83
|
|
95
84
|
struct BitstringReader {
|
96
|
-
const uint8_t
|
85
|
+
const uint8_t* code;
|
97
86
|
size_t code_size;
|
98
87
|
size_t i;
|
99
88
|
|
100
89
|
// code_size in bytes
|
101
|
-
BitstringReader(const uint8_t
|
90
|
+
BitstringReader(const uint8_t* code, size_t code_size);
|
102
91
|
|
103
92
|
// read nbit bits from the code
|
104
93
|
uint64_t read(int nbit);
|
@@ -108,15 +97,12 @@ struct BitstringReader {
|
|
108
97
|
* Hamming distance computation functions
|
109
98
|
**************************************************/
|
110
99
|
|
111
|
-
|
112
|
-
|
113
100
|
FAISS_API extern size_t hamming_batch_size;
|
114
101
|
|
115
102
|
inline int popcount64(uint64_t x) {
|
116
103
|
return __builtin_popcountl(x);
|
117
104
|
}
|
118
105
|
|
119
|
-
|
120
106
|
/** Compute a set of Hamming distances between na and nb binary vectors
|
121
107
|
*
|
122
108
|
* @param a size na * nbytespercode
|
@@ -124,15 +110,13 @@ inline int popcount64(uint64_t x) {
|
|
124
110
|
* @param nbytespercode should be multiple of 8
|
125
111
|
* @param dis output distances, size na * nb
|
126
112
|
*/
|
127
|
-
void hammings
|
128
|
-
const uint8_t
|
129
|
-
const uint8_t
|
130
|
-
size_t na,
|
113
|
+
void hammings(
|
114
|
+
const uint8_t* a,
|
115
|
+
const uint8_t* b,
|
116
|
+
size_t na,
|
117
|
+
size_t nb,
|
131
118
|
size_t nbytespercode,
|
132
|
-
hamdis_t
|
133
|
-
|
134
|
-
|
135
|
-
|
119
|
+
hamdis_t* dis);
|
136
120
|
|
137
121
|
/** Return the k smallest Hamming distances for a set of binary query vectors,
|
138
122
|
* using a max heap.
|
@@ -142,22 +126,22 @@ void hammings (
|
|
142
126
|
* @param ncodes size of the binary codes (bytes)
|
143
127
|
* @param ordered if != 0: order the results by decreasing distance
|
144
128
|
* (may be bottleneck for k/n > 0.01) */
|
145
|
-
void hammings_knn_hc
|
146
|
-
int_maxheap_array_t
|
147
|
-
const uint8_t
|
148
|
-
const uint8_t
|
129
|
+
void hammings_knn_hc(
|
130
|
+
int_maxheap_array_t* ha,
|
131
|
+
const uint8_t* a,
|
132
|
+
const uint8_t* b,
|
149
133
|
size_t nb,
|
150
134
|
size_t ncodes,
|
151
135
|
int ordered);
|
152
136
|
|
153
137
|
/* Legacy alias to hammings_knn_hc. */
|
154
|
-
void hammings_knn
|
155
|
-
|
156
|
-
|
157
|
-
|
158
|
-
|
159
|
-
|
160
|
-
|
138
|
+
void hammings_knn(
|
139
|
+
int_maxheap_array_t* ha,
|
140
|
+
const uint8_t* a,
|
141
|
+
const uint8_t* b,
|
142
|
+
size_t nb,
|
143
|
+
size_t ncodes,
|
144
|
+
int ordered);
|
161
145
|
|
162
146
|
/** Return the k smallest Hamming distances for a set of binary query vectors,
|
163
147
|
* using counting max.
|
@@ -171,66 +155,59 @@ void hammings_knn (
|
|
171
155
|
* neighbors
|
172
156
|
* @param labels output ids of the k nearest neighbors to each query vector
|
173
157
|
*/
|
174
|
-
void hammings_knn_mc
|
175
|
-
|
176
|
-
|
177
|
-
|
178
|
-
|
179
|
-
|
180
|
-
|
181
|
-
|
182
|
-
|
158
|
+
void hammings_knn_mc(
|
159
|
+
const uint8_t* a,
|
160
|
+
const uint8_t* b,
|
161
|
+
size_t na,
|
162
|
+
size_t nb,
|
163
|
+
size_t k,
|
164
|
+
size_t ncodes,
|
165
|
+
int32_t* distances,
|
166
|
+
int64_t* labels);
|
183
167
|
|
184
168
|
/** same as hammings_knn except we are doing a range search with radius */
|
185
|
-
void hamming_range_search
|
186
|
-
|
187
|
-
|
188
|
-
|
189
|
-
|
190
|
-
|
191
|
-
|
192
|
-
|
193
|
-
|
169
|
+
void hamming_range_search(
|
170
|
+
const uint8_t* a,
|
171
|
+
const uint8_t* b,
|
172
|
+
size_t na,
|
173
|
+
size_t nb,
|
174
|
+
int radius,
|
175
|
+
size_t ncodes,
|
176
|
+
RangeSearchResult* result);
|
194
177
|
|
195
178
|
/* Counting the number of matches or of cross-matches (without returning them)
|
196
179
|
For use with function that assume pre-allocated memory */
|
197
|
-
void hamming_count_thres
|
198
|
-
const uint8_t
|
199
|
-
const uint8_t
|
180
|
+
void hamming_count_thres(
|
181
|
+
const uint8_t* bs1,
|
182
|
+
const uint8_t* bs2,
|
200
183
|
size_t n1,
|
201
184
|
size_t n2,
|
202
185
|
hamdis_t ht,
|
203
186
|
size_t ncodes,
|
204
|
-
size_t
|
187
|
+
size_t* nptr);
|
205
188
|
|
206
189
|
/* Return all Hamming distances/index passing a thres. Pre-allocation of output
|
207
190
|
is required. Use hamming_count_thres to determine the proper size. */
|
208
|
-
size_t match_hamming_thres
|
209
|
-
const uint8_t
|
210
|
-
const uint8_t
|
191
|
+
size_t match_hamming_thres(
|
192
|
+
const uint8_t* bs1,
|
193
|
+
const uint8_t* bs2,
|
211
194
|
size_t n1,
|
212
195
|
size_t n2,
|
213
196
|
hamdis_t ht,
|
214
197
|
size_t ncodes,
|
215
|
-
int64_t
|
216
|
-
hamdis_t
|
198
|
+
int64_t* idx,
|
199
|
+
hamdis_t* dis);
|
217
200
|
|
218
201
|
/* Cross-matching in a set of vectors */
|
219
|
-
void crosshamming_count_thres
|
220
|
-
const uint8_t
|
202
|
+
void crosshamming_count_thres(
|
203
|
+
const uint8_t* dbs,
|
221
204
|
size_t n,
|
222
205
|
hamdis_t ht,
|
223
206
|
size_t ncodes,
|
224
|
-
size_t
|
225
|
-
|
207
|
+
size_t* nptr);
|
226
208
|
|
227
209
|
/* compute the Hamming distances between two codewords of nwords*64 bits */
|
228
|
-
hamdis_t hamming
|
229
|
-
const uint64_t * bs1,
|
230
|
-
const uint64_t * bs2,
|
231
|
-
size_t nwords);
|
232
|
-
|
233
|
-
|
210
|
+
hamdis_t hamming(const uint64_t* bs1, const uint64_t* bs2, size_t nwords);
|
234
211
|
|
235
212
|
} // namespace faiss
|
236
213
|
|
@@ -5,8 +5,6 @@
|
|
5
5
|
* LICENSE file in the root directory of this source tree.
|
6
6
|
*/
|
7
7
|
|
8
|
-
|
9
|
-
|
10
8
|
#pragma once
|
11
9
|
|
12
10
|
#include <climits>
|
@@ -14,7 +12,6 @@
|
|
14
12
|
|
15
13
|
#include <limits>
|
16
14
|
|
17
|
-
|
18
15
|
namespace faiss {
|
19
16
|
|
20
17
|
/*******************************************************************
|
@@ -34,8 +31,10 @@ namespace faiss {
|
|
34
31
|
template <typename T_, typename TI_>
|
35
32
|
struct CMax;
|
36
33
|
|
37
|
-
template<typename T>
|
38
|
-
|
34
|
+
template <typename T>
|
35
|
+
inline T cmin_nextafter(T x);
|
36
|
+
template <typename T>
|
37
|
+
inline T cmax_nextafter(T x);
|
39
38
|
|
40
39
|
// traits of minheaps = heaps where the minimum value is stored on top
|
41
40
|
// useful to find the *max* values of an array
|
@@ -44,10 +43,10 @@ struct CMin {
|
|
44
43
|
typedef T_ T;
|
45
44
|
typedef TI_ TI;
|
46
45
|
typedef CMax<T_, TI_> Crev; // reference to reverse comparison
|
47
|
-
inline static bool cmp
|
46
|
+
inline static bool cmp(T a, T b) {
|
48
47
|
return a < b;
|
49
48
|
}
|
50
|
-
inline static T neutral
|
49
|
+
inline static T neutral() {
|
51
50
|
return std::numeric_limits<T>::lowest();
|
52
51
|
}
|
53
52
|
static const bool is_max = false;
|
@@ -57,18 +56,15 @@ struct CMin {
|
|
57
56
|
}
|
58
57
|
};
|
59
58
|
|
60
|
-
|
61
|
-
|
62
|
-
|
63
59
|
template <typename T_, typename TI_>
|
64
60
|
struct CMax {
|
65
61
|
typedef T_ T;
|
66
62
|
typedef TI_ TI;
|
67
63
|
typedef CMin<T_, TI_> Crev;
|
68
|
-
inline static bool cmp
|
64
|
+
inline static bool cmp(T a, T b) {
|
69
65
|
return a > b;
|
70
66
|
}
|
71
|
-
inline static T neutral
|
67
|
+
inline static T neutral() {
|
72
68
|
return std::numeric_limits<T>::max();
|
73
69
|
}
|
74
70
|
static const bool is_max = true;
|
@@ -77,22 +73,24 @@ struct CMax {
|
|
77
73
|
}
|
78
74
|
};
|
79
75
|
|
80
|
-
|
81
|
-
|
76
|
+
template <>
|
77
|
+
inline float cmin_nextafter<float>(float x) {
|
82
78
|
return std::nextafterf(x, -HUGE_VALF);
|
83
79
|
}
|
84
80
|
|
85
|
-
template<>
|
81
|
+
template <>
|
82
|
+
inline float cmax_nextafter<float>(float x) {
|
86
83
|
return std::nextafterf(x, HUGE_VALF);
|
87
84
|
}
|
88
85
|
|
89
|
-
template<>
|
86
|
+
template <>
|
87
|
+
inline uint16_t cmin_nextafter<uint16_t>(uint16_t x) {
|
90
88
|
return x - 1;
|
91
89
|
}
|
92
90
|
|
93
|
-
template<>
|
91
|
+
template <>
|
92
|
+
inline uint16_t cmax_nextafter<uint16_t>(uint16_t x) {
|
94
93
|
return x + 1;
|
95
94
|
}
|
96
95
|
|
97
|
-
|
98
96
|
} // namespace faiss
|