faiss 0.2.0 → 0.2.4

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Files changed (215) hide show
  1. checksums.yaml +4 -4
  2. data/CHANGELOG.md +16 -0
  3. data/LICENSE.txt +1 -1
  4. data/README.md +7 -7
  5. data/ext/faiss/extconf.rb +6 -3
  6. data/ext/faiss/numo.hpp +4 -4
  7. data/ext/faiss/utils.cpp +1 -1
  8. data/ext/faiss/utils.h +1 -1
  9. data/lib/faiss/version.rb +1 -1
  10. data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
  11. data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
  12. data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +365 -194
  13. data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +102 -35
  14. data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
  15. data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
  16. data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
  17. data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
  18. data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +126 -224
  19. data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -36
  20. data/vendor/faiss/faiss/IndexAdditiveQuantizer.cpp +407 -0
  21. data/vendor/faiss/faiss/IndexAdditiveQuantizer.h +195 -0
  22. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
  23. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
  24. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
  25. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
  26. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
  27. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
  28. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
  29. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
  30. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
  31. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
  32. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
  33. data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
  34. data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +115 -176
  35. data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +42 -59
  36. data/vendor/faiss/faiss/IndexFlatCodes.cpp +67 -0
  37. data/vendor/faiss/faiss/IndexFlatCodes.h +47 -0
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  39. data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
  40. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +545 -453
  41. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +169 -118
  42. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFAdditiveQuantizer.cpp +316 -0
  43. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFAdditiveQuantizer.h +121 -0
  44. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +247 -252
  45. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
  46. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +459 -517
  47. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +75 -67
  48. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
  49. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
  50. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
  51. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
  52. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +163 -150
  53. data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +38 -25
  54. data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +66 -113
  55. data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +20 -38
  56. data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
  57. data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
  58. data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +229 -0
  59. data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
  60. data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +301 -0
  61. data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
  62. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +387 -495
  63. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -82
  64. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
  65. data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
  66. data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
  67. data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
  68. data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +139 -127
  69. data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +32 -23
  70. data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
  71. data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
  72. data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +111 -172
  73. data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -59
  74. data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
  75. data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
  76. data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
  77. data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
  78. data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
  79. data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
  80. data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
  81. data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +654 -475
  82. data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +64 -89
  83. data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +78 -73
  84. data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
  85. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
  86. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
  87. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +198 -171
  88. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
  89. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
  90. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
  91. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
  92. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
  93. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIcmEncoder.h +60 -0
  94. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
  95. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
  96. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
  97. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
  98. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
  99. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
  100. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
  101. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
  102. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
  103. data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
  104. data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
  105. data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
  106. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
  107. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
  108. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
  109. data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
  110. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
  111. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
  112. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
  113. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
  114. data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
  115. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
  116. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
  117. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
  118. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
  119. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
  120. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
  121. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
  122. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
  123. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
  124. data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
  125. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
  126. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
  127. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
  128. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
  129. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
  130. data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
  131. data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +503 -0
  132. data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +175 -0
  133. data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
  134. data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
  135. data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
  136. data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
  137. data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
  138. data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +606 -617
  139. data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
  140. data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +855 -0
  141. data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +244 -0
  142. data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
  143. data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
  144. data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +679 -0
  145. data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
  146. data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
  147. data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
  148. data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
  149. data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
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  154. data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +647 -707
  155. data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
  156. data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
  157. data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
  158. data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +631 -480
  159. data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +547 -407
  160. data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +76 -95
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  164. data/vendor/faiss/faiss/impl/kmeans1d.h +48 -0
  165. data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
  166. data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
  167. data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
  168. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
  169. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
  170. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
  171. data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
  172. data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
  173. data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +619 -397
  174. data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +8 -6
  175. data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
  176. data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
  177. data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
  178. data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
  179. data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
  180. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
  181. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
  182. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
  183. data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
  184. data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
  185. data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
  186. data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
  187. data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
  188. data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
  189. data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
  190. data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
  191. data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
  192. data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
  193. data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +305 -312
  194. data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +170 -122
  195. data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +498 -508
  196. data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
  197. data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
  198. data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
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  200. data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
  201. data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
  202. data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
  203. data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
  204. data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
  205. data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
  206. data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
  207. data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
  208. data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
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  215. metadata +29 -4
checksums.yaml CHANGED
@@ -1,7 +1,7 @@
1
1
  ---
2
2
  SHA256:
3
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4
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4
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5
5
  SHA512:
6
- metadata.gz: 6ad4dcb525a55f0b6743fddeb856d6132c8a518eb92be3dc2ce57302ff05b921fb3ba517aecc76bde78aa6e8bf11d9199fa97cbfe4f3a00e4d466d47f0cabe14
7
- data.tar.gz: b333df087e863c8ee828b66c1611d8576976064419403710b0b238346d46cc58e69f1c2c708e35bdbc995754b02f50a976389bb0eb102273e7b9f92d771ac395
6
+ metadata.gz: 598f6e626d5c970e408cff68ec479bf1aa2d6ee18adeeeb2489d1c4fbf627dacbc6e398ce149f0483720080a439df4d2887e5b6c9dc9f465e8ffa1bbeede84a8
7
+ data.tar.gz: fefebfbbbbceb58ac6c6b02636630943d30db7af4ee92521586b4fb40e73bf1aa2b401e28e4c27872bf9344f60e3c9fb288ec6420abc1ffccd05ffd3ec7379fd
data/CHANGELOG.md CHANGED
@@ -1,3 +1,19 @@
1
+ ## 0.2.4 (2022-01-10)
2
+
3
+ - Updated Faiss to 1.7.2
4
+
5
+ ## 0.2.3 (2021-12-17)
6
+
7
+ - Fixed installation error with ARM Mac
8
+
9
+ ## 0.2.2 (2021-06-08)
10
+
11
+ - Fixed installation error
12
+
13
+ ## 0.2.1 (2021-06-07)
14
+
15
+ - Updated Faiss to 1.7.1
16
+
1
17
  ## 0.2.0 (2021-05-23)
2
18
 
3
19
  - Improved performance
data/LICENSE.txt CHANGED
@@ -1,7 +1,7 @@
1
1
  MIT License
2
2
 
3
3
  Copyright (c) Facebook, Inc. and its affiliates.
4
- Copyright (c) 2020-2021 Andrew Kane
4
+ Copyright (c) 2020-2022 Andrew Kane
5
5
 
6
6
  Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
7
7
  of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
data/README.md CHANGED
@@ -1,10 +1,10 @@
1
- # Faiss
1
+ # Faiss Ruby
2
2
 
3
3
  [Faiss](https://github.com/facebookresearch/faiss) - efficient similarity search and clustering - for Ruby
4
4
 
5
5
  Learn more about [Faiss](https://engineering.fb.com/data-infrastructure/faiss-a-library-for-efficient-similarity-search/)
6
6
 
7
- [![Build Status](https://github.com/ankane/faiss/workflows/build/badge.svg?branch=master)](https://github.com/ankane/faiss/actions)
7
+ [![Build Status](https://github.com/ankane/faiss-ruby/workflows/build/badge.svg?branch=master)](https://github.com/ankane/faiss-ruby/actions)
8
8
 
9
9
  ## Installation
10
10
 
@@ -220,22 +220,22 @@ Numo::NArray.cast([[1, 2, 3], [4, 5, 6]])
220
220
 
221
221
  ## History
222
222
 
223
- View the [changelog](https://github.com/ankane/faiss/blob/master/CHANGELOG.md)
223
+ View the [changelog](https://github.com/ankane/faiss-ruby/blob/master/CHANGELOG.md)
224
224
 
225
225
  ## Contributing
226
226
 
227
227
  Everyone is encouraged to help improve this project. Here are a few ways you can help:
228
228
 
229
- - [Report bugs](https://github.com/ankane/faiss/issues)
230
- - Fix bugs and [submit pull requests](https://github.com/ankane/faiss/pulls)
229
+ - [Report bugs](https://github.com/ankane/faiss-ruby/issues)
230
+ - Fix bugs and [submit pull requests](https://github.com/ankane/faiss-ruby/pulls)
231
231
  - Write, clarify, or fix documentation
232
232
  - Suggest or add new features
233
233
 
234
234
  To get started with development:
235
235
 
236
236
  ```sh
237
- git clone --recursive https://github.com/ankane/faiss.git
238
- cd faiss
237
+ git clone --recursive https://github.com/ankane/faiss-ruby.git
238
+ cd faiss-ruby
239
239
  bundle install
240
240
  bundle exec rake compile
241
241
  bundle exec rake test
data/ext/faiss/extconf.rb CHANGED
@@ -1,13 +1,16 @@
1
1
  require "mkmf-rice"
2
+ require "numo/narray"
2
3
 
3
4
  abort "BLAS not found" unless have_library("blas")
4
5
  abort "LAPACK not found" unless have_library("lapack")
5
6
  abort "OpenMP not found" unless have_library("omp") || have_library("gomp")
6
7
 
7
- numo = $LOAD_PATH.find { |v| File.exist?("#{v}/numo/numo/narray.h") }
8
- abort "Numo not found" unless numo && find_header("numo/narray.h", "#{numo}/numo")
8
+ numo = File.join(Gem.loaded_specs["numo-narray"].require_path, "numo")
9
+ abort "Numo not found" unless find_header("numo/narray.h", numo)
9
10
 
10
- $CXXFLAGS << " -std=c++17 $(optflags) -DFINTEGER=int " << with_config("optflags", "-march=native")
11
+ # -march=native not supported with ARM Mac
12
+ default_optflags = RbConfig::CONFIG["host_os"] =~ /darwin/i && RbConfig::CONFIG["host_cpu"] =~ /arm|aarch64/i ? "" : "-march=native"
13
+ $CXXFLAGS << " -std=c++17 $(optflags) -DFINTEGER=int " << with_config("optflags", default_optflags)
11
14
 
12
15
  ext = File.expand_path(".", __dir__)
13
16
  vendor = File.expand_path("../../vendor/faiss", __dir__)
data/ext/faiss/numo.hpp CHANGED
@@ -24,19 +24,19 @@ namespace numo {
24
24
  return this->_value;
25
25
  }
26
26
 
27
- size_t ndim() {
27
+ size_t ndim() const {
28
28
  return RNARRAY_NDIM(this->_value);
29
29
  }
30
30
 
31
- size_t* shape() {
31
+ size_t* shape() const {
32
32
  return RNARRAY_SHAPE(this->_value);
33
33
  }
34
34
 
35
- size_t size() {
35
+ size_t size() const {
36
36
  return RNARRAY_SIZE(this->_value);
37
37
  }
38
38
 
39
- bool is_contiguous() {
39
+ bool is_contiguous() const {
40
40
  return nary_check_contiguous(this->_value) == Qtrue;
41
41
  }
42
42
 
data/ext/faiss/utils.cpp CHANGED
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  #include "utils.h"
2
2
 
3
- size_t check_shape(numo::NArray objects, size_t k) {
3
+ size_t check_shape(const numo::NArray& objects, size_t k) {
4
4
  auto ndim = objects.ndim();
5
5
  if (ndim != 2) {
6
6
  throw Rice::Exception(rb_eArgError, "expected 2 dimensions, not %d", ndim);
data/ext/faiss/utils.h CHANGED
@@ -2,4 +2,4 @@
2
2
 
3
3
  #include "numo.hpp"
4
4
 
5
- size_t check_shape(numo::NArray objects, size_t k);
5
+ size_t check_shape(const numo::NArray& objects, size_t k);
data/lib/faiss/version.rb CHANGED
@@ -1,3 +1,3 @@
1
1
  module Faiss
2
- VERSION = "0.2.0"
2
+ VERSION = "0.2.4"
3
3
  end