faiss 0.2.0 → 0.2.1
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- checksums.yaml +4 -4
- data/CHANGELOG.md +4 -0
- data/lib/faiss/version.rb +1 -1
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.cpp +292 -291
- data/vendor/faiss/faiss/AutoTune.h +55 -56
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.cpp +334 -195
- data/vendor/faiss/faiss/Clustering.h +88 -35
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.cpp +171 -195
- data/vendor/faiss/faiss/IVFlib.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/Index.cpp +85 -103
- data/vendor/faiss/faiss/Index.h +54 -48
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.cpp +139 -164
- data/vendor/faiss/faiss/Index2Layer.h +22 -22
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.cpp +45 -37
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinary.h +140 -132
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.cpp +73 -53
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFlat.h +29 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.cpp +46 -43
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryFromFloat.h +16 -15
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.cpp +215 -232
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHNSW.h +25 -24
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.cpp +182 -177
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryHash.h +41 -34
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.cpp +489 -461
- data/vendor/faiss/faiss/IndexBinaryIVF.h +97 -68
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.cpp +116 -147
- data/vendor/faiss/faiss/IndexFlat.h +35 -46
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.cpp +372 -348
- data/vendor/faiss/faiss/IndexHNSW.h +57 -41
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.cpp +474 -454
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVF.h +146 -113
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.cpp +248 -250
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFFlat.h +48 -51
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.cpp +457 -516
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQ.h +74 -66
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.cpp +406 -372
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQFastScan.h +82 -57
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.cpp +104 -102
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFPQR.h +33 -28
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.cpp +125 -133
- data/vendor/faiss/faiss/IndexIVFSpectralHash.h +19 -21
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.cpp +75 -96
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLSH.h +21 -26
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.cpp +42 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexLattice.h +11 -16
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.cpp +231 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNNDescent.h +72 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.cpp +303 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexNSG.h +85 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.cpp +405 -464
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQ.h +64 -67
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.cpp +143 -170
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPQFastScan.h +46 -32
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.cpp +120 -150
- data/vendor/faiss/faiss/IndexPreTransform.h +33 -36
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.cpp +115 -131
- data/vendor/faiss/faiss/IndexRefine.h +22 -23
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.cpp +147 -153
- data/vendor/faiss/faiss/IndexReplicas.h +62 -56
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.cpp +291 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexResidual.h +152 -0
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.cpp +120 -155
- data/vendor/faiss/faiss/IndexScalarQuantizer.h +41 -45
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.cpp +256 -240
- data/vendor/faiss/faiss/IndexShards.h +85 -73
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.cpp +112 -97
- data/vendor/faiss/faiss/MatrixStats.h +7 -10
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.cpp +135 -157
- data/vendor/faiss/faiss/MetaIndexes.h +40 -34
- data/vendor/faiss/faiss/MetricType.h +7 -7
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.cpp +652 -474
- data/vendor/faiss/faiss/VectorTransform.h +61 -89
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.cpp +77 -73
- data/vendor/faiss/faiss/clone_index.h +4 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.cpp +33 -38
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuAutoTune.h +11 -9
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.cpp +197 -170
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuCloner.h +53 -35
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.cpp +12 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuClonerOptions.h +27 -25
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuDistance.h +116 -112
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuFaissAssert.h +1 -2
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndex.h +134 -137
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexBinaryFlat.h +76 -73
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexFlat.h +173 -162
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVF.h +67 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFFlat.h +89 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFPQ.h +150 -141
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndexIVFScalarQuantizer.h +101 -103
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuIndicesOptions.h +17 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.cpp +116 -128
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/GpuResources.h +182 -186
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.cpp +433 -422
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/StandardGpuResources.h +131 -130
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.cpp +468 -456
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/InterleavedCodes.h +25 -19
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.cpp +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/impl/RemapIndices.h +9 -8
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper-inl.h +39 -44
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/IndexWrapper.h +16 -14
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfClustering.cpp +77 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/PerfIVFPQAdd.cpp +109 -88
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/perf/WriteIndex.cpp +75 -64
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestCodePacking.cpp +230 -215
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexBinaryFlat.cpp +80 -86
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexFlat.cpp +284 -277
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFFlat.cpp +416 -416
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFPQ.cpp +611 -517
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuIndexIVFScalarQuantizer.cpp +166 -164
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestGpuMemoryException.cpp +61 -53
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.cpp +274 -238
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/TestUtils.h +73 -57
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/test/demo_ivfpq_indexing_gpu.cpp +47 -50
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/DeviceUtils.h +79 -72
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.cpp +140 -146
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StackDeviceMemory.h +69 -71
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/StaticUtils.h +21 -16
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.cpp +25 -29
- data/vendor/faiss/faiss/gpu/utils/Timer.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.cpp +270 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AdditiveQuantizer.h +115 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.cpp +90 -120
- data/vendor/faiss/faiss/impl/AuxIndexStructures.h +81 -65
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissAssert.h +73 -58
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.cpp +56 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/FaissException.h +41 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.cpp +595 -611
- data/vendor/faiss/faiss/impl/HNSW.h +179 -200
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.cpp +672 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/LocalSearchQuantizer.h +172 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.cpp +487 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NNDescent.h +154 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.cpp +682 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/NSG.h +199 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.cpp +484 -454
- data/vendor/faiss/faiss/impl/PolysemousTraining.h +52 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer-inl.h +26 -47
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.cpp +469 -459
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ProductQuantizer.h +76 -87
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.cpp +448 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResidualQuantizer.h +130 -0
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ResultHandler.h +96 -132
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.cpp +648 -701
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ScalarQuantizer.h +48 -46
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex-inl.h +129 -131
- data/vendor/faiss/faiss/impl/ThreadedIndex.h +61 -55
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_read.cpp +547 -479
- data/vendor/faiss/faiss/impl/index_write.cpp +497 -407
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.cpp +75 -94
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io.h +31 -41
- data/vendor/faiss/faiss/impl/io_macros.h +40 -29
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.cpp +137 -186
- data/vendor/faiss/faiss/impl/lattice_Zn.h +40 -51
- data/vendor/faiss/faiss/impl/platform_macros.h +29 -8
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.cpp +77 -124
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan.h +39 -48
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_1.cpp +41 -52
- data/vendor/faiss/faiss/impl/pq4_fast_scan_search_qbs.cpp +80 -117
- data/vendor/faiss/faiss/impl/simd_result_handlers.h +109 -137
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.cpp +269 -218
- data/vendor/faiss/faiss/index_factory.h +6 -7
- data/vendor/faiss/faiss/index_io.h +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.cpp +67 -75
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/BlockInvertedLists.h +22 -24
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.cpp +96 -112
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/DirectMap.h +29 -33
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.cpp +307 -364
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedLists.h +151 -151
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.cpp +29 -34
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/InvertedListsIOHook.h +17 -18
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.cpp +257 -293
- data/vendor/faiss/faiss/invlists/OnDiskInvertedLists.h +50 -45
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.cpp +23 -26
- data/vendor/faiss/faiss/python/python_callbacks.h +9 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/AlignedTable.h +79 -44
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.cpp +40 -48
- data/vendor/faiss/faiss/utils/Heap.h +186 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.cpp +67 -76
- data/vendor/faiss/faiss/utils/WorkerThread.h +32 -33
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.cpp +301 -310
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances.h +133 -118
- data/vendor/faiss/faiss/utils/distances_simd.cpp +456 -516
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances-inl.h +117 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.cpp +113 -232
- data/vendor/faiss/faiss/utils/extra_distances.h +30 -29
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming-inl.h +260 -209
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.cpp +375 -469
- data/vendor/faiss/faiss/utils/hamming.h +62 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/ordered_key_value.h +16 -18
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.cpp +393 -318
- data/vendor/faiss/faiss/utils/partitioning.h +26 -21
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.cpp +78 -66
- data/vendor/faiss/faiss/utils/quantize_lut.h +22 -20
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.cpp +39 -63
- data/vendor/faiss/faiss/utils/random.h +13 -16
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib.h +4 -2
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_avx2.h +88 -85
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_emulated.h +226 -165
- data/vendor/faiss/faiss/utils/simdlib_neon.h +832 -0
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.cpp +304 -287
- data/vendor/faiss/faiss/utils/utils.h +53 -48
- metadata +20 -2
@@ -9,11 +9,12 @@
|
|
9
9
|
|
10
10
|
#include <faiss/Index2Layer.h>
|
11
11
|
|
12
|
+
#include <faiss/impl/platform_macros.h>
|
13
|
+
#include <stdint.h>
|
14
|
+
#include <cassert>
|
12
15
|
#include <cinttypes>
|
13
16
|
#include <cmath>
|
14
17
|
#include <cstdio>
|
15
|
-
#include <cassert>
|
16
|
-
#include <stdint.h>
|
17
18
|
|
18
19
|
#ifdef __SSE3__
|
19
20
|
#include <immintrin.h>
|
@@ -23,12 +24,11 @@
|
|
23
24
|
|
24
25
|
#include <faiss/IndexIVFPQ.h>
|
25
26
|
|
26
|
-
#include <faiss/impl/FaissAssert.h>
|
27
|
-
#include <faiss/utils/utils.h>
|
28
|
-
#include <faiss/impl/AuxIndexStructures.h>
|
29
27
|
#include <faiss/IndexFlat.h>
|
28
|
+
#include <faiss/impl/AuxIndexStructures.h>
|
29
|
+
#include <faiss/impl/FaissAssert.h>
|
30
30
|
#include <faiss/utils/distances.h>
|
31
|
-
|
31
|
+
#include <faiss/utils/utils.h>
|
32
32
|
|
33
33
|
/*
|
34
34
|
#include <faiss/utils/Heap.h>
|
@@ -40,22 +40,21 @@
|
|
40
40
|
|
41
41
|
*/
|
42
42
|
|
43
|
-
|
44
43
|
namespace faiss {
|
45
44
|
|
46
|
-
|
47
45
|
/*************************************
|
48
46
|
* Index2Layer implementation
|
49
47
|
*************************************/
|
50
48
|
|
51
|
-
|
52
|
-
|
53
|
-
|
54
|
-
|
55
|
-
|
56
|
-
|
57
|
-
|
58
|
-
|
49
|
+
Index2Layer::Index2Layer(
|
50
|
+
Index* quantizer,
|
51
|
+
size_t nlist,
|
52
|
+
int M,
|
53
|
+
int nbit,
|
54
|
+
MetricType metric)
|
55
|
+
: Index(quantizer->d, metric),
|
56
|
+
q1(quantizer, nlist),
|
57
|
+
pq(quantizer->d, M, nbit) {
|
59
58
|
is_trained = false;
|
60
59
|
for (int nbyte = 0; nbyte < 7; nbyte++) {
|
61
60
|
if ((1L << (8 * nbyte)) >= nlist) {
|
@@ -67,122 +66,125 @@ Index2Layer::Index2Layer (Index * quantizer, size_t nlist,
|
|
67
66
|
code_size = code_size_1 + code_size_2;
|
68
67
|
}
|
69
68
|
|
70
|
-
Index2Layer::Index2Layer
|
71
|
-
{
|
69
|
+
Index2Layer::Index2Layer() {
|
72
70
|
code_size = code_size_1 = code_size_2 = 0;
|
73
71
|
}
|
74
72
|
|
75
|
-
Index2Layer::~Index2Layer
|
76
|
-
{}
|
73
|
+
Index2Layer::~Index2Layer() {}
|
77
74
|
|
78
|
-
void Index2Layer::train(idx_t n, const float* x)
|
79
|
-
{
|
75
|
+
void Index2Layer::train(idx_t n, const float* x) {
|
80
76
|
if (verbose) {
|
81
|
-
printf
|
82
|
-
n, d);
|
77
|
+
printf("training level-1 quantizer %" PRId64 " vectors in %dD\n", n, d);
|
83
78
|
}
|
84
79
|
|
85
|
-
q1.train_q1
|
80
|
+
q1.train_q1(n, x, verbose, metric_type);
|
86
81
|
|
87
82
|
if (verbose) {
|
88
83
|
printf("computing residuals\n");
|
89
84
|
}
|
90
85
|
|
91
|
-
const float
|
86
|
+
const float* x_in = x;
|
92
87
|
|
93
|
-
x = fvecs_maybe_subsample
|
94
|
-
|
95
|
-
|
88
|
+
x = fvecs_maybe_subsample(
|
89
|
+
d,
|
90
|
+
(size_t*)&n,
|
91
|
+
pq.cp.max_points_per_centroid * pq.ksub,
|
92
|
+
x,
|
93
|
+
verbose,
|
94
|
+
pq.cp.seed);
|
96
95
|
|
97
|
-
ScopeDeleter<float> del_x
|
96
|
+
ScopeDeleter<float> del_x(x_in == x ? nullptr : x);
|
98
97
|
|
99
98
|
std::vector<idx_t> assign(n); // assignement to coarse centroids
|
100
|
-
q1.quantizer->assign
|
99
|
+
q1.quantizer->assign(n, x, assign.data());
|
101
100
|
std::vector<float> residuals(n * d);
|
102
101
|
for (idx_t i = 0; i < n; i++) {
|
103
|
-
q1.quantizer->compute_residual
|
104
|
-
|
102
|
+
q1.quantizer->compute_residual(
|
103
|
+
x + i * d, residuals.data() + i * d, assign[i]);
|
105
104
|
}
|
106
105
|
|
107
106
|
if (verbose)
|
108
|
-
printf
|
109
|
-
|
107
|
+
printf("training %zdx%zd product quantizer on %" PRId64
|
108
|
+
" vectors in %dD\n",
|
109
|
+
pq.M,
|
110
|
+
pq.ksub,
|
111
|
+
n,
|
112
|
+
d);
|
110
113
|
pq.verbose = verbose;
|
111
|
-
pq.train
|
114
|
+
pq.train(n, residuals.data());
|
112
115
|
|
113
116
|
is_trained = true;
|
114
117
|
}
|
115
118
|
|
116
|
-
void Index2Layer::add(idx_t n, const float* x)
|
117
|
-
{
|
119
|
+
void Index2Layer::add(idx_t n, const float* x) {
|
118
120
|
idx_t bs = 32768;
|
119
121
|
if (n > bs) {
|
120
122
|
for (idx_t i0 = 0; i0 < n; i0 += bs) {
|
121
123
|
idx_t i1 = std::min(i0 + bs, n);
|
122
124
|
if (verbose) {
|
123
|
-
printf("Index2Layer::add: adding %" PRId64 ":%" PRId64
|
124
|
-
|
125
|
+
printf("Index2Layer::add: adding %" PRId64 ":%" PRId64
|
126
|
+
" / %" PRId64 "\n",
|
127
|
+
i0,
|
128
|
+
i1,
|
129
|
+
n);
|
125
130
|
}
|
126
|
-
add
|
131
|
+
add(i1 - i0, x + i0 * d);
|
127
132
|
}
|
128
133
|
return;
|
129
134
|
}
|
130
135
|
|
131
|
-
std::vector<idx_t> codes1
|
132
|
-
q1.quantizer->assign
|
136
|
+
std::vector<idx_t> codes1(n);
|
137
|
+
q1.quantizer->assign(n, x, codes1.data());
|
133
138
|
std::vector<float> residuals(n * d);
|
134
139
|
for (idx_t i = 0; i < n; i++) {
|
135
|
-
q1.quantizer->compute_residual
|
136
|
-
|
140
|
+
q1.quantizer->compute_residual(
|
141
|
+
x + i * d, residuals.data() + i * d, codes1[i]);
|
137
142
|
}
|
138
|
-
std::vector<uint8_t> codes2
|
143
|
+
std::vector<uint8_t> codes2(n * code_size_2);
|
139
144
|
|
140
|
-
pq.compute_codes
|
145
|
+
pq.compute_codes(residuals.data(), codes2.data(), n);
|
141
146
|
|
142
|
-
codes.resize
|
143
|
-
uint8_t
|
147
|
+
codes.resize((ntotal + n) * code_size);
|
148
|
+
uint8_t* wp = &codes[ntotal * code_size];
|
144
149
|
|
145
150
|
{
|
146
151
|
int i = 0x11223344;
|
147
|
-
const char
|
148
|
-
FAISS_THROW_IF_NOT_MSG
|
149
|
-
|
152
|
+
const char* ip = (char*)&i;
|
153
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT_MSG(
|
154
|
+
ip[0] == 0x44, "works only on a little-endian CPU");
|
150
155
|
}
|
151
156
|
|
152
157
|
// copy to output table
|
153
158
|
for (idx_t i = 0; i < n; i++) {
|
154
|
-
memcpy
|
159
|
+
memcpy(wp, &codes1[i], code_size_1);
|
155
160
|
wp += code_size_1;
|
156
|
-
memcpy
|
161
|
+
memcpy(wp, &codes2[i * code_size_2], code_size_2);
|
157
162
|
wp += code_size_2;
|
158
163
|
}
|
159
164
|
|
160
165
|
ntotal += n;
|
161
|
-
|
162
166
|
}
|
163
167
|
|
164
168
|
void Index2Layer::search(
|
165
|
-
|
166
|
-
|
167
|
-
|
168
|
-
|
169
|
-
|
170
|
-
|
169
|
+
idx_t /*n*/,
|
170
|
+
const float* /*x*/,
|
171
|
+
idx_t /*k*/,
|
172
|
+
float* /*distances*/,
|
173
|
+
idx_t* /*labels*/) const {
|
174
|
+
FAISS_THROW_MSG("not implemented");
|
171
175
|
}
|
172
176
|
|
173
|
-
|
174
|
-
void Index2Layer::reconstruct_n(idx_t i0, idx_t ni, float* recons) const
|
175
|
-
{
|
177
|
+
void Index2Layer::reconstruct_n(idx_t i0, idx_t ni, float* recons) const {
|
176
178
|
std::vector<float> recons1(d);
|
177
|
-
FAISS_THROW_IF_NOT
|
178
|
-
const uint8_t
|
179
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT(i0 >= 0 && i0 + ni <= ntotal);
|
180
|
+
const uint8_t* rp = &codes[i0 * code_size];
|
179
181
|
|
180
182
|
for (idx_t i = 0; i < ni; i++) {
|
181
183
|
idx_t key = 0;
|
182
|
-
memcpy
|
183
|
-
q1.quantizer->reconstruct
|
184
|
+
memcpy(&key, rp, code_size_1);
|
185
|
+
q1.quantizer->reconstruct(key, recons1.data());
|
184
186
|
rp += code_size_1;
|
185
|
-
pq.decode
|
187
|
+
pq.decode(rp, recons);
|
186
188
|
for (idx_t j = 0; j < d; j++) {
|
187
189
|
recons[j] += recons1[j];
|
188
190
|
}
|
@@ -191,53 +193,44 @@ void Index2Layer::reconstruct_n(idx_t i0, idx_t ni, float* recons) const
|
|
191
193
|
}
|
192
194
|
}
|
193
195
|
|
194
|
-
void Index2Layer::transfer_to_IVFPQ
|
195
|
-
|
196
|
-
FAISS_THROW_IF_NOT
|
197
|
-
FAISS_THROW_IF_NOT
|
198
|
-
FAISS_THROW_IF_NOT (other.ntotal == 0);
|
196
|
+
void Index2Layer::transfer_to_IVFPQ(IndexIVFPQ& other) const {
|
197
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT(other.nlist == q1.nlist);
|
198
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT(other.code_size == code_size_2);
|
199
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT(other.ntotal == 0);
|
199
200
|
|
200
|
-
const uint8_t
|
201
|
+
const uint8_t* rp = codes.data();
|
201
202
|
|
202
203
|
for (idx_t i = 0; i < ntotal; i++) {
|
203
204
|
idx_t key = 0;
|
204
|
-
memcpy
|
205
|
+
memcpy(&key, rp, code_size_1);
|
205
206
|
rp += code_size_1;
|
206
|
-
other.invlists->add_entry
|
207
|
+
other.invlists->add_entry(key, i, rp);
|
207
208
|
rp += code_size_2;
|
208
209
|
}
|
209
210
|
|
210
211
|
other.ntotal = ntotal;
|
211
|
-
|
212
212
|
}
|
213
213
|
|
214
|
-
|
215
|
-
|
216
|
-
void Index2Layer::reconstruct(idx_t key, float* recons) const
|
217
|
-
{
|
218
|
-
reconstruct_n (key, 1, recons);
|
214
|
+
void Index2Layer::reconstruct(idx_t key, float* recons) const {
|
215
|
+
reconstruct_n(key, 1, recons);
|
219
216
|
}
|
220
217
|
|
221
|
-
void Index2Layer::reset()
|
222
|
-
{
|
218
|
+
void Index2Layer::reset() {
|
223
219
|
ntotal = 0;
|
224
|
-
codes.clear
|
220
|
+
codes.clear();
|
225
221
|
}
|
226
222
|
|
227
|
-
|
228
223
|
namespace {
|
229
224
|
|
230
|
-
|
231
225
|
struct Distance2Level : DistanceComputer {
|
232
226
|
size_t d;
|
233
227
|
const Index2Layer& storage;
|
234
228
|
std::vector<float> buf;
|
235
|
-
const float
|
229
|
+
const float* q;
|
236
230
|
|
237
231
|
const float *pq_l1_tab, *pq_l2_tab;
|
238
232
|
|
239
|
-
explicit Distance2Level(const Index2Layer& storage)
|
240
|
-
: storage(storage) {
|
233
|
+
explicit Distance2Level(const Index2Layer& storage) : storage(storage) {
|
241
234
|
d = storage.d;
|
242
235
|
FAISS_ASSERT(storage.pq.dsub == 4);
|
243
236
|
pq_l2_tab = storage.pq.centroids.data();
|
@@ -250,67 +243,64 @@ struct Distance2Level : DistanceComputer {
|
|
250
243
|
return fvec_L2sqr(buf.data() + d, buf.data(), d);
|
251
244
|
}
|
252
245
|
|
253
|
-
void set_query(const float
|
246
|
+
void set_query(const float* x) override {
|
254
247
|
q = x;
|
255
248
|
}
|
256
249
|
};
|
257
250
|
|
258
251
|
// well optimized for xNN+PQNN
|
259
252
|
struct DistanceXPQ4 : Distance2Level {
|
260
|
-
|
261
253
|
int M, k;
|
262
254
|
|
263
255
|
explicit DistanceXPQ4(const Index2Layer& storage)
|
264
|
-
|
265
|
-
const IndexFlat
|
266
|
-
|
256
|
+
: Distance2Level(storage) {
|
257
|
+
const IndexFlat* quantizer =
|
258
|
+
dynamic_cast<IndexFlat*>(storage.q1.quantizer);
|
267
259
|
|
268
260
|
FAISS_ASSERT(quantizer);
|
269
261
|
M = storage.pq.M;
|
270
262
|
pq_l1_tab = quantizer->xb.data();
|
271
263
|
}
|
272
264
|
|
273
|
-
float operator
|
265
|
+
float operator()(idx_t i) override {
|
274
266
|
#ifdef __SSE3__
|
275
|
-
const uint8_t
|
267
|
+
const uint8_t* code = storage.codes.data() + i * storage.code_size;
|
276
268
|
long key = 0;
|
277
|
-
memcpy
|
269
|
+
memcpy(&key, code, storage.code_size_1);
|
278
270
|
code += storage.code_size_1;
|
279
271
|
|
280
272
|
// walking pointers
|
281
|
-
const float
|
282
|
-
const __m128
|
283
|
-
const __m128
|
273
|
+
const float* qa = q;
|
274
|
+
const __m128* l1_t = (const __m128*)(pq_l1_tab + d * key);
|
275
|
+
const __m128* pq_l2_t = (const __m128*)pq_l2_tab;
|
284
276
|
__m128 accu = _mm_setzero_ps();
|
285
277
|
|
286
278
|
for (int m = 0; m < M; m++) {
|
287
279
|
__m128 qi = _mm_loadu_ps(qa);
|
288
|
-
__m128 recons = l1_t[m]
|
289
|
-
__m128 diff = qi
|
290
|
-
accu
|
280
|
+
__m128 recons = _mm_add_ps(l1_t[m], pq_l2_t[*code++]);
|
281
|
+
__m128 diff = _mm_sub_ps(qi, recons);
|
282
|
+
accu = _mm_add_ps(accu, _mm_mul_ps(diff, diff));
|
291
283
|
pq_l2_t += 256;
|
292
284
|
qa += 4;
|
293
285
|
}
|
294
286
|
|
295
|
-
accu = _mm_hadd_ps
|
296
|
-
accu = _mm_hadd_ps
|
297
|
-
return
|
287
|
+
accu = _mm_hadd_ps(accu, accu);
|
288
|
+
accu = _mm_hadd_ps(accu, accu);
|
289
|
+
return _mm_cvtss_f32(accu);
|
298
290
|
#else
|
299
291
|
FAISS_THROW_MSG("not implemented for non-x64 platforms");
|
300
292
|
#endif
|
301
293
|
}
|
302
|
-
|
303
294
|
};
|
304
295
|
|
305
296
|
// well optimized for 2xNN+PQNN
|
306
297
|
struct Distance2xXPQ4 : Distance2Level {
|
307
|
-
|
308
298
|
int M_2, mi_nbits;
|
309
299
|
|
310
300
|
explicit Distance2xXPQ4(const Index2Layer& storage)
|
311
|
-
|
312
|
-
const MultiIndexQuantizer
|
313
|
-
|
301
|
+
: Distance2Level(storage) {
|
302
|
+
const MultiIndexQuantizer* mi =
|
303
|
+
dynamic_cast<MultiIndexQuantizer*>(storage.q1.quantizer);
|
314
304
|
|
315
305
|
FAISS_ASSERT(mi);
|
316
306
|
FAISS_ASSERT(storage.pq.M % 2 == 0);
|
@@ -319,59 +309,55 @@ struct Distance2xXPQ4 : Distance2Level {
|
|
319
309
|
pq_l1_tab = mi->pq.centroids.data();
|
320
310
|
}
|
321
311
|
|
322
|
-
float operator
|
323
|
-
const uint8_t
|
312
|
+
float operator()(idx_t i) override {
|
313
|
+
const uint8_t* code = storage.codes.data() + i * storage.code_size;
|
324
314
|
long key01 = 0;
|
325
|
-
memcpy
|
315
|
+
memcpy(&key01, code, storage.code_size_1);
|
326
316
|
code += storage.code_size_1;
|
327
317
|
#ifdef __SSE3__
|
328
318
|
|
329
319
|
// walking pointers
|
330
|
-
const float
|
331
|
-
const __m128
|
332
|
-
const __m128
|
320
|
+
const float* qa = q;
|
321
|
+
const __m128* pq_l1_t = (const __m128*)pq_l1_tab;
|
322
|
+
const __m128* pq_l2_t = (const __m128*)pq_l2_tab;
|
333
323
|
__m128 accu = _mm_setzero_ps();
|
334
324
|
|
335
325
|
for (int mi_m = 0; mi_m < 2; mi_m++) {
|
336
326
|
long l1_idx = key01 & ((1L << mi_nbits) - 1);
|
337
|
-
const __m128
|
327
|
+
const __m128* pq_l1 = pq_l1_t + M_2 * l1_idx;
|
338
328
|
|
339
329
|
for (int m = 0; m < M_2; m++) {
|
340
330
|
__m128 qi = _mm_loadu_ps(qa);
|
341
|
-
__m128 recons = pq_l1[m]
|
342
|
-
__m128 diff = qi
|
343
|
-
accu
|
331
|
+
__m128 recons = _mm_add_ps(pq_l1[m], pq_l2_t[*code++]);
|
332
|
+
__m128 diff = _mm_sub_ps(qi, recons);
|
333
|
+
accu = _mm_add_ps(accu, _mm_mul_ps(diff, diff));
|
344
334
|
pq_l2_t += 256;
|
345
335
|
qa += 4;
|
346
336
|
}
|
347
337
|
pq_l1_t += M_2 << mi_nbits;
|
348
338
|
key01 >>= mi_nbits;
|
349
339
|
}
|
350
|
-
accu = _mm_hadd_ps
|
351
|
-
accu = _mm_hadd_ps
|
352
|
-
return
|
340
|
+
accu = _mm_hadd_ps(accu, accu);
|
341
|
+
accu = _mm_hadd_ps(accu, accu);
|
342
|
+
return _mm_cvtss_f32(accu);
|
353
343
|
#else
|
354
344
|
FAISS_THROW_MSG("not implemented for non-x64 platforms");
|
355
345
|
#endif
|
356
346
|
}
|
357
|
-
|
358
347
|
};
|
359
348
|
|
349
|
+
} // namespace
|
360
350
|
|
361
|
-
|
362
|
-
|
363
|
-
|
364
|
-
DistanceComputer * Index2Layer::get_distance_computer() const {
|
351
|
+
DistanceComputer* Index2Layer::get_distance_computer() const {
|
365
352
|
#ifdef __SSE3__
|
366
|
-
const MultiIndexQuantizer
|
367
|
-
|
353
|
+
const MultiIndexQuantizer* mi =
|
354
|
+
dynamic_cast<MultiIndexQuantizer*>(q1.quantizer);
|
368
355
|
|
369
356
|
if (mi && pq.M % 2 == 0 && pq.dsub == 4) {
|
370
357
|
return new Distance2xXPQ4(*this);
|
371
358
|
}
|
372
359
|
|
373
|
-
const IndexFlat
|
374
|
-
dynamic_cast<IndexFlat*> (q1.quantizer);
|
360
|
+
const IndexFlat* fl = dynamic_cast<IndexFlat*>(q1.quantizer);
|
375
361
|
|
376
362
|
if (fl && pq.dsub == 4) {
|
377
363
|
return new DistanceXPQ4(*this);
|
@@ -381,57 +367,46 @@ DistanceComputer * Index2Layer::get_distance_computer() const {
|
|
381
367
|
return Index::get_distance_computer();
|
382
368
|
}
|
383
369
|
|
384
|
-
|
385
370
|
/* The standalone codec interface */
|
386
|
-
size_t Index2Layer::sa_code_size
|
387
|
-
{
|
371
|
+
size_t Index2Layer::sa_code_size() const {
|
388
372
|
return code_size;
|
389
373
|
}
|
390
374
|
|
391
|
-
void Index2Layer::sa_encode
|
392
|
-
|
393
|
-
|
394
|
-
|
395
|
-
q1.quantizer->assign (n, x, list_nos.get());
|
375
|
+
void Index2Layer::sa_encode(idx_t n, const float* x, uint8_t* bytes) const {
|
376
|
+
FAISS_THROW_IF_NOT(is_trained);
|
377
|
+
std::unique_ptr<int64_t[]> list_nos(new int64_t[n]);
|
378
|
+
q1.quantizer->assign(n, x, list_nos.get());
|
396
379
|
std::vector<float> residuals(n * d);
|
397
380
|
for (idx_t i = 0; i < n; i++) {
|
398
|
-
q1.quantizer->compute_residual
|
399
|
-
|
381
|
+
q1.quantizer->compute_residual(
|
382
|
+
x + i * d, residuals.data() + i * d, list_nos[i]);
|
400
383
|
}
|
401
|
-
pq.compute_codes
|
384
|
+
pq.compute_codes(residuals.data(), bytes, n);
|
402
385
|
|
403
386
|
for (idx_t i = n - 1; i >= 0; i--) {
|
404
|
-
uint8_t
|
405
|
-
memmove
|
406
|
-
|
407
|
-
q1.encode_listno (list_nos[i], code);
|
387
|
+
uint8_t* code = bytes + i * code_size;
|
388
|
+
memmove(code + code_size_1, bytes + i * code_size_2, code_size_2);
|
389
|
+
q1.encode_listno(list_nos[i], code);
|
408
390
|
}
|
409
|
-
|
410
391
|
}
|
411
392
|
|
412
|
-
void Index2Layer::sa_decode
|
413
|
-
{
|
414
|
-
|
393
|
+
void Index2Layer::sa_decode(idx_t n, const uint8_t* bytes, float* x) const {
|
415
394
|
#pragma omp parallel
|
416
395
|
{
|
417
|
-
std::vector<float> residual
|
396
|
+
std::vector<float> residual(d);
|
418
397
|
|
419
398
|
#pragma omp for
|
420
399
|
for (idx_t i = 0; i < n; i++) {
|
421
|
-
const uint8_t
|
422
|
-
int64_t list_no = q1.decode_listno
|
423
|
-
float
|
424
|
-
pq.decode
|
425
|
-
q1.quantizer->reconstruct
|
400
|
+
const uint8_t* code = bytes + i * code_size;
|
401
|
+
int64_t list_no = q1.decode_listno(code);
|
402
|
+
float* xi = x + i * d;
|
403
|
+
pq.decode(code + code_size_1, xi);
|
404
|
+
q1.quantizer->reconstruct(list_no, residual.data());
|
426
405
|
for (int j = 0; j < d; j++) {
|
427
406
|
xi[j] += residual[j];
|
428
407
|
}
|
429
408
|
}
|
430
409
|
}
|
431
|
-
|
432
410
|
}
|
433
411
|
|
434
|
-
|
435
|
-
|
436
|
-
|
437
412
|
} // namespace faiss
|