tnfr 4.5.2__py3-none-any.whl → 7.0.0__py3-none-any.whl

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Potentially problematic release.


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Files changed (195) hide show
  1. tnfr/__init__.py +275 -51
  2. tnfr/__init__.pyi +33 -0
  3. tnfr/_compat.py +10 -0
  4. tnfr/_generated_version.py +34 -0
  5. tnfr/_version.py +49 -0
  6. tnfr/_version.pyi +7 -0
  7. tnfr/alias.py +117 -31
  8. tnfr/alias.pyi +108 -0
  9. tnfr/cache.py +6 -572
  10. tnfr/cache.pyi +16 -0
  11. tnfr/callback_utils.py +16 -38
  12. tnfr/callback_utils.pyi +79 -0
  13. tnfr/cli/__init__.py +34 -14
  14. tnfr/cli/__init__.pyi +26 -0
  15. tnfr/cli/arguments.py +211 -28
  16. tnfr/cli/arguments.pyi +27 -0
  17. tnfr/cli/execution.py +470 -50
  18. tnfr/cli/execution.pyi +70 -0
  19. tnfr/cli/utils.py +18 -3
  20. tnfr/cli/utils.pyi +8 -0
  21. tnfr/config/__init__.py +13 -0
  22. tnfr/config/__init__.pyi +10 -0
  23. tnfr/{constants_glyphs.py → config/constants.py} +26 -20
  24. tnfr/config/constants.pyi +12 -0
  25. tnfr/config/feature_flags.py +83 -0
  26. tnfr/{config.py → config/init.py} +11 -7
  27. tnfr/config/init.pyi +8 -0
  28. tnfr/config/operator_names.py +93 -0
  29. tnfr/config/operator_names.pyi +28 -0
  30. tnfr/config/presets.py +84 -0
  31. tnfr/config/presets.pyi +7 -0
  32. tnfr/constants/__init__.py +80 -29
  33. tnfr/constants/__init__.pyi +92 -0
  34. tnfr/constants/aliases.py +31 -0
  35. tnfr/constants/core.py +4 -4
  36. tnfr/constants/core.pyi +17 -0
  37. tnfr/constants/init.py +1 -1
  38. tnfr/constants/init.pyi +12 -0
  39. tnfr/constants/metric.py +7 -15
  40. tnfr/constants/metric.pyi +19 -0
  41. tnfr/dynamics/__init__.py +165 -633
  42. tnfr/dynamics/__init__.pyi +82 -0
  43. tnfr/dynamics/adaptation.py +267 -0
  44. tnfr/dynamics/aliases.py +23 -0
  45. tnfr/dynamics/coordination.py +385 -0
  46. tnfr/dynamics/dnfr.py +2283 -400
  47. tnfr/dynamics/dnfr.pyi +24 -0
  48. tnfr/dynamics/integrators.py +406 -98
  49. tnfr/dynamics/integrators.pyi +34 -0
  50. tnfr/dynamics/runtime.py +881 -0
  51. tnfr/dynamics/sampling.py +10 -5
  52. tnfr/dynamics/sampling.pyi +7 -0
  53. tnfr/dynamics/selectors.py +719 -0
  54. tnfr/execution.py +70 -48
  55. tnfr/execution.pyi +45 -0
  56. tnfr/flatten.py +13 -9
  57. tnfr/flatten.pyi +21 -0
  58. tnfr/gamma.py +66 -53
  59. tnfr/gamma.pyi +34 -0
  60. tnfr/glyph_history.py +110 -52
  61. tnfr/glyph_history.pyi +35 -0
  62. tnfr/glyph_runtime.py +16 -0
  63. tnfr/glyph_runtime.pyi +9 -0
  64. tnfr/immutable.py +69 -28
  65. tnfr/immutable.pyi +34 -0
  66. tnfr/initialization.py +16 -16
  67. tnfr/initialization.pyi +65 -0
  68. tnfr/io.py +6 -240
  69. tnfr/io.pyi +16 -0
  70. tnfr/locking.pyi +7 -0
  71. tnfr/mathematics/__init__.py +81 -0
  72. tnfr/mathematics/backend.py +426 -0
  73. tnfr/mathematics/dynamics.py +398 -0
  74. tnfr/mathematics/epi.py +254 -0
  75. tnfr/mathematics/generators.py +222 -0
  76. tnfr/mathematics/metrics.py +119 -0
  77. tnfr/mathematics/operators.py +233 -0
  78. tnfr/mathematics/operators_factory.py +71 -0
  79. tnfr/mathematics/projection.py +78 -0
  80. tnfr/mathematics/runtime.py +173 -0
  81. tnfr/mathematics/spaces.py +247 -0
  82. tnfr/mathematics/transforms.py +292 -0
  83. tnfr/metrics/__init__.py +10 -10
  84. tnfr/metrics/__init__.pyi +20 -0
  85. tnfr/metrics/coherence.py +993 -324
  86. tnfr/metrics/common.py +23 -16
  87. tnfr/metrics/common.pyi +46 -0
  88. tnfr/metrics/core.py +251 -35
  89. tnfr/metrics/core.pyi +13 -0
  90. tnfr/metrics/diagnosis.py +708 -111
  91. tnfr/metrics/diagnosis.pyi +85 -0
  92. tnfr/metrics/export.py +27 -15
  93. tnfr/metrics/glyph_timing.py +232 -42
  94. tnfr/metrics/reporting.py +33 -22
  95. tnfr/metrics/reporting.pyi +12 -0
  96. tnfr/metrics/sense_index.py +987 -43
  97. tnfr/metrics/sense_index.pyi +9 -0
  98. tnfr/metrics/trig.py +214 -23
  99. tnfr/metrics/trig.pyi +13 -0
  100. tnfr/metrics/trig_cache.py +115 -22
  101. tnfr/metrics/trig_cache.pyi +10 -0
  102. tnfr/node.py +542 -136
  103. tnfr/node.pyi +178 -0
  104. tnfr/observers.py +152 -35
  105. tnfr/observers.pyi +31 -0
  106. tnfr/ontosim.py +23 -19
  107. tnfr/ontosim.pyi +28 -0
  108. tnfr/operators/__init__.py +601 -82
  109. tnfr/operators/__init__.pyi +45 -0
  110. tnfr/operators/definitions.py +513 -0
  111. tnfr/operators/definitions.pyi +78 -0
  112. tnfr/operators/grammar.py +760 -0
  113. tnfr/operators/jitter.py +107 -38
  114. tnfr/operators/jitter.pyi +11 -0
  115. tnfr/operators/registry.py +75 -0
  116. tnfr/operators/registry.pyi +13 -0
  117. tnfr/operators/remesh.py +149 -88
  118. tnfr/py.typed +0 -0
  119. tnfr/rng.py +46 -143
  120. tnfr/rng.pyi +14 -0
  121. tnfr/schemas/__init__.py +8 -0
  122. tnfr/schemas/grammar.json +94 -0
  123. tnfr/selector.py +25 -19
  124. tnfr/selector.pyi +19 -0
  125. tnfr/sense.py +72 -62
  126. tnfr/sense.pyi +23 -0
  127. tnfr/structural.py +522 -262
  128. tnfr/structural.pyi +69 -0
  129. tnfr/telemetry/__init__.py +35 -0
  130. tnfr/telemetry/cache_metrics.py +226 -0
  131. tnfr/telemetry/nu_f.py +423 -0
  132. tnfr/telemetry/nu_f.pyi +123 -0
  133. tnfr/telemetry/verbosity.py +37 -0
  134. tnfr/tokens.py +1 -3
  135. tnfr/tokens.pyi +36 -0
  136. tnfr/trace.py +270 -113
  137. tnfr/trace.pyi +40 -0
  138. tnfr/types.py +574 -6
  139. tnfr/types.pyi +331 -0
  140. tnfr/units.py +69 -0
  141. tnfr/units.pyi +16 -0
  142. tnfr/utils/__init__.py +217 -0
  143. tnfr/utils/__init__.pyi +202 -0
  144. tnfr/utils/cache.py +2395 -0
  145. tnfr/utils/cache.pyi +468 -0
  146. tnfr/utils/chunks.py +104 -0
  147. tnfr/utils/chunks.pyi +21 -0
  148. tnfr/{collections_utils.py → utils/data.py} +147 -90
  149. tnfr/utils/data.pyi +64 -0
  150. tnfr/utils/graph.py +85 -0
  151. tnfr/utils/graph.pyi +10 -0
  152. tnfr/utils/init.py +770 -0
  153. tnfr/utils/init.pyi +78 -0
  154. tnfr/utils/io.py +456 -0
  155. tnfr/{helpers → utils}/numeric.py +51 -24
  156. tnfr/utils/numeric.pyi +21 -0
  157. tnfr/validation/__init__.py +113 -0
  158. tnfr/validation/__init__.pyi +77 -0
  159. tnfr/validation/compatibility.py +95 -0
  160. tnfr/validation/compatibility.pyi +6 -0
  161. tnfr/validation/grammar.py +71 -0
  162. tnfr/validation/grammar.pyi +40 -0
  163. tnfr/validation/graph.py +138 -0
  164. tnfr/validation/graph.pyi +17 -0
  165. tnfr/validation/rules.py +281 -0
  166. tnfr/validation/rules.pyi +55 -0
  167. tnfr/validation/runtime.py +263 -0
  168. tnfr/validation/runtime.pyi +31 -0
  169. tnfr/validation/soft_filters.py +170 -0
  170. tnfr/validation/soft_filters.pyi +37 -0
  171. tnfr/validation/spectral.py +159 -0
  172. tnfr/validation/spectral.pyi +46 -0
  173. tnfr/validation/syntax.py +40 -0
  174. tnfr/validation/syntax.pyi +10 -0
  175. tnfr/validation/window.py +39 -0
  176. tnfr/validation/window.pyi +1 -0
  177. tnfr/viz/__init__.py +9 -0
  178. tnfr/viz/matplotlib.py +246 -0
  179. tnfr-7.0.0.dist-info/METADATA +179 -0
  180. tnfr-7.0.0.dist-info/RECORD +185 -0
  181. {tnfr-4.5.2.dist-info → tnfr-7.0.0.dist-info}/licenses/LICENSE.md +1 -1
  182. tnfr/grammar.py +0 -344
  183. tnfr/graph_utils.py +0 -84
  184. tnfr/helpers/__init__.py +0 -71
  185. tnfr/import_utils.py +0 -228
  186. tnfr/json_utils.py +0 -162
  187. tnfr/logging_utils.py +0 -116
  188. tnfr/presets.py +0 -60
  189. tnfr/validators.py +0 -84
  190. tnfr/value_utils.py +0 -59
  191. tnfr-4.5.2.dist-info/METADATA +0 -379
  192. tnfr-4.5.2.dist-info/RECORD +0 -67
  193. {tnfr-4.5.2.dist-info → tnfr-7.0.0.dist-info}/WHEEL +0 -0
  194. {tnfr-4.5.2.dist-info → tnfr-7.0.0.dist-info}/entry_points.txt +0 -0
  195. {tnfr-4.5.2.dist-info → tnfr-7.0.0.dist-info}/top_level.txt +0 -0
@@ -0,0 +1,202 @@
1
+ from __future__ import annotations
2
+
3
+ from typing import Any, Final
4
+
5
+ from threading import Lock
6
+
7
+ from .cache import (
8
+ CacheCapacityConfig,
9
+ CacheLayer,
10
+ CacheManager,
11
+ CacheStatistics,
12
+ InstrumentedLRUCache,
13
+ ManagedLRUCache,
14
+ MappingCacheLayer,
15
+ RedisCacheLayer,
16
+ ShelveCacheLayer,
17
+ prune_lock_mapping,
18
+ DNFR_PREP_STATE_KEY,
19
+ DnfrPrepState,
20
+ DnfrCache,
21
+ NODE_SET_CHECKSUM_KEY,
22
+ ScopedCounterCache,
23
+ EdgeCacheManager,
24
+ cached_node_list,
25
+ cached_nodes_and_A,
26
+ clear_node_repr_cache,
27
+ configure_graph_cache_limits,
28
+ configure_global_cache_layers,
29
+ edge_version_cache,
30
+ edge_version_update,
31
+ ensure_node_index_map,
32
+ ensure_node_offset_map,
33
+ new_dnfr_cache,
34
+ _SeedHashCache,
35
+ _GRAPH_CACHE_MANAGER_KEY,
36
+ _graph_cache_manager,
37
+ build_cache_manager,
38
+ get_graph_version,
39
+ increment_edge_version,
40
+ increment_graph_version,
41
+ node_set_checksum,
42
+ reset_global_cache_manager,
43
+ stable_json,
44
+ _GRAPH_CACHE_LAYERS_KEY,
45
+ )
46
+ from .data import (
47
+ MAX_MATERIALIZE_DEFAULT,
48
+ STRING_TYPES,
49
+ convert_value,
50
+ normalize_optional_int,
51
+ ensure_collection,
52
+ flatten_structure,
53
+ is_non_string_sequence,
54
+ mix_groups,
55
+ negative_weights_warn_once,
56
+ normalize_counter,
57
+ normalize_materialize_limit,
58
+ normalize_weights,
59
+ )
60
+ from .chunks import auto_chunk_size, resolve_chunk_size
61
+ from .graph import (
62
+ get_graph,
63
+ get_graph_mapping,
64
+ mark_dnfr_prep_dirty,
65
+ supports_add_edge,
66
+ )
67
+ from .numeric import (
68
+ angle_diff,
69
+ angle_diff_array,
70
+ clamp,
71
+ clamp01,
72
+ kahan_sum_nd,
73
+ similarity_abs,
74
+ within_range,
75
+ )
76
+ from .init import (
77
+ _DEFAULT_CACHE_SIZE,
78
+ _FAILED_IMPORT_LIMIT,
79
+ _IMPORT_STATE,
80
+ _LOGGING_CONFIGURED,
81
+ EMIT_MAP,
82
+ IMPORT_LOG,
83
+ LazyImportProxy,
84
+ WarnOnce,
85
+ _configure_root,
86
+ _reset_import_state,
87
+ _reset_logging_state,
88
+ _warn_failure,
89
+ cached_import,
90
+ get_logger,
91
+ get_nodenx,
92
+ get_numpy,
93
+ prune_failed_imports,
94
+ warm_cached_import,
95
+ warn_once,
96
+ )
97
+ from .io import (
98
+ DEFAULT_PARAMS,
99
+ JsonDumpsParams,
100
+ StructuredFileError,
101
+ clear_orjson_param_warnings,
102
+ json_dumps,
103
+ read_structured_file,
104
+ safe_write,
105
+ )
106
+ __all__ = (
107
+ "IMPORT_LOG",
108
+ "WarnOnce",
109
+ "cached_import",
110
+ "warm_cached_import",
111
+ "LazyImportProxy",
112
+ "get_logger",
113
+ "get_lock",
114
+ "get_nodenx",
115
+ "get_numpy",
116
+ "prune_failed_imports",
117
+ "warn_once",
118
+ "convert_value",
119
+ "normalize_optional_int",
120
+ "normalize_weights",
121
+ "normalize_counter",
122
+ "normalize_materialize_limit",
123
+ "ensure_collection",
124
+ "flatten_structure",
125
+ "is_non_string_sequence",
126
+ "STRING_TYPES",
127
+ "MAX_MATERIALIZE_DEFAULT",
128
+ "negative_weights_warn_once",
129
+ "mix_groups",
130
+ "angle_diff",
131
+ "angle_diff_array",
132
+ "clamp",
133
+ "clamp01",
134
+ "auto_chunk_size",
135
+ "resolve_chunk_size",
136
+ "CacheCapacityConfig",
137
+ "CacheLayer",
138
+ "CacheManager",
139
+ "CacheStatistics",
140
+ "InstrumentedLRUCache",
141
+ "ManagedLRUCache",
142
+ "MappingCacheLayer",
143
+ "RedisCacheLayer",
144
+ "ShelveCacheLayer",
145
+ "prune_lock_mapping",
146
+ "EdgeCacheManager",
147
+ "DNFR_PREP_STATE_KEY",
148
+ "DnfrPrepState",
149
+ "DnfrCache",
150
+ "NODE_SET_CHECKSUM_KEY",
151
+ "ScopedCounterCache",
152
+ "cached_node_list",
153
+ "cached_nodes_and_A",
154
+ "clear_node_repr_cache",
155
+ "edge_version_cache",
156
+ "edge_version_update",
157
+ "configure_global_cache_layers",
158
+ "ensure_node_index_map",
159
+ "ensure_node_offset_map",
160
+ "new_dnfr_cache",
161
+ "get_graph_version",
162
+ "increment_edge_version",
163
+ "increment_graph_version",
164
+ "configure_graph_cache_limits",
165
+ "build_cache_manager",
166
+ "_graph_cache_manager",
167
+ "_GRAPH_CACHE_MANAGER_KEY",
168
+ "node_set_checksum",
169
+ "stable_json",
170
+ "reset_global_cache_manager",
171
+ "_SeedHashCache",
172
+ "_GRAPH_CACHE_LAYERS_KEY",
173
+ "get_graph",
174
+ "get_graph_mapping",
175
+ "mark_dnfr_prep_dirty",
176
+ "supports_add_edge",
177
+ "JsonDumpsParams",
178
+ "DEFAULT_PARAMS",
179
+ "json_dumps",
180
+ "clear_orjson_param_warnings",
181
+ "read_structured_file",
182
+ "safe_write",
183
+ "StructuredFileError",
184
+ "kahan_sum_nd",
185
+ "similarity_abs",
186
+ "within_range",
187
+ "_configure_root",
188
+ "_LOGGING_CONFIGURED",
189
+ "_reset_logging_state",
190
+ "_reset_import_state",
191
+ "_IMPORT_STATE",
192
+ "_warn_failure",
193
+ "_FAILED_IMPORT_LIMIT",
194
+ "_DEFAULT_CACHE_SIZE",
195
+ "EMIT_MAP",
196
+ )
197
+
198
+ def get_lock(name: str, /) -> Lock: ...
199
+
200
+ _DYNAMIC_EXPORTS: Final[frozenset[str]]
201
+
202
+ def __getattr__(name: str) -> Any: ...