@sjcrh/proteinpaint-server 2.44.0 → 2.46.1

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
Files changed (82) hide show
  1. package/dataset/clinvar.hg19.js +53 -52
  2. package/dataset/clinvar.hg38.js +74 -73
  3. package/dataset/clinvar.js +164 -47
  4. package/dataset/termdb.test.js +257 -0
  5. package/genome/CriGri.js +1859 -27
  6. package/genome/cgc.js +743 -7
  7. package/genome/danRer10.js +1108 -46
  8. package/genome/dm3.js +71 -44
  9. package/genome/dm6.js +1926 -45
  10. package/genome/galGal5.js +23522 -46
  11. package/genome/galGal6.js +512 -46
  12. package/genome/hg19.js +293 -198
  13. package/genome/hg38.js +472 -105
  14. package/genome/hg38.test.js +406 -40
  15. package/genome/hgvirus.js +45 -20
  16. package/genome/mm10.js +135 -67
  17. package/genome/mm9.js +116 -79
  18. package/genome/rn6.js +1002 -47
  19. package/package.json +31 -35
  20. package/routes/_template_.js +30 -0
  21. package/routes/burden.js +149 -0
  22. package/routes/dataset.js +266 -0
  23. package/routes/dsdata.js +127 -0
  24. package/routes/gdc.maf.js +120 -0
  25. package/routes/gdc.mafBuild.js +106 -0
  26. package/routes/gdc.topMutatedGenes.js +465 -0
  27. package/routes/gene2canonicalisoform.js +41 -0
  28. package/routes/genelookup.js +52 -0
  29. package/routes/genomes.js +144 -0
  30. package/routes/healthcheck.js +30 -0
  31. package/routes/hicdata.js +98 -0
  32. package/routes/hicstat.js +55 -0
  33. package/routes/isoformlst.js +57 -0
  34. package/routes/ntseq.js +43 -0
  35. package/routes/pdomain.js +61 -0
  36. package/routes/snp.js +107 -0
  37. package/routes/termdb.categories.js +209 -0
  38. package/routes/termdb.cluster.js +228 -0
  39. package/routes/termdb.cohort.summary.js +38 -0
  40. package/routes/termdb.cohorts.js +49 -0
  41. package/routes/termdb.config.js +202 -0
  42. package/routes/termdb.getdescrstats.js +102 -0
  43. package/routes/termdb.getnumericcategories.js +92 -0
  44. package/routes/termdb.getpercentile.js +108 -0
  45. package/routes/termdb.getrootterm.js +65 -0
  46. package/routes/termdb.gettermchildren.js +67 -0
  47. package/routes/termdb.singleSampleMutation.js +80 -0
  48. package/routes/termdb.singlecellData.js +46 -0
  49. package/routes/termdb.singlecellSamples.js +160 -0
  50. package/routes/termdb.termsbyids.js +59 -0
  51. package/routes/termdb.topVariablyExpressedGenes.js +171 -0
  52. package/routes/termdb.violin.js +77 -0
  53. package/src/app.js +41500 -0
  54. package/src/serverconfig.js +14 -8
  55. package/start.js +3 -3
  56. package/routes/README.md +0 -84
  57. package/routes/burden.ts +0 -143
  58. package/routes/gdc.maf.ts +0 -195
  59. package/routes/gdc.mafBuild.ts +0 -114
  60. package/routes/gdc.topMutatedGenes.ts +0 -586
  61. package/routes/genelookup.ts +0 -50
  62. package/routes/healthcheck.ts +0 -29
  63. package/routes/hicdata.ts +0 -111
  64. package/routes/hicstat.ts +0 -55
  65. package/routes/termdb.categories.ts +0 -245
  66. package/routes/termdb.cluster.ts +0 -248
  67. package/routes/termdb.getdescrstats.ts +0 -102
  68. package/routes/termdb.getnumericcategories.ts +0 -99
  69. package/routes/termdb.getpercentile.ts +0 -118
  70. package/routes/termdb.getrootterm.ts +0 -73
  71. package/routes/termdb.gettermchildren.ts +0 -82
  72. package/routes/termdb.singleSampleMutation.ts +0 -87
  73. package/routes/termdb.singlecellData.ts +0 -49
  74. package/routes/termdb.singlecellSamples.ts +0 -175
  75. package/routes/termdb.termsbyids.ts +0 -63
  76. package/routes/termdb.topVariablyExpressedGenes.ts +0 -214
  77. package/routes/termdb.violin.ts +0 -77
  78. package/server.js +0 -2
  79. package/server.js.map +0 -1
  80. package/shared/common.js +0 -1080
  81. package/shared/termdb.initbinconfig.js +0 -96
  82. package/shared/vcf.js +0 -629
package/genome/galGal6.js CHANGED
@@ -1,48 +1,514 @@
1
- "use strict";
2
- Object.defineProperty(exports, "__esModule", { value: true });
3
- exports.default = {
4
- species: 'chicken',
5
- genomefile: 'genomes/galGal6.gz',
6
- genedb: {
7
- dbfile: 'anno/genes.galGal6.db'
1
+ var galGal6_default = {
2
+ species: "chicken",
3
+ genomefile: "genomes/galGal6.gz",
4
+ genedb: {
5
+ dbfile: "anno/genes.galGal6.db"
6
+ },
7
+ tracks: [
8
+ {
9
+ __isgene: true,
10
+ translatecoding: true,
11
+ file: "anno/ncbiRefSeq.galGal6.gz",
12
+ type: "bedj",
13
+ name: "NCBI RefSeq genes",
14
+ stackheight: 16,
15
+ stackspace: 1,
16
+ vpad: 4,
17
+ color: "#1D591D"
8
18
  },
9
- tracks: [
10
- {
11
- __isgene: true,
12
- translatecoding: true,
13
- file: 'anno/ncbiRefSeq.galGal6.gz',
14
- type: 'bedj',
15
- name: 'NCBI RefSeq genes',
16
- stackheight: 16,
17
- stackspace: 1,
18
- vpad: 4,
19
- color: '#1D591D'
20
- },
21
- {
22
- type: 'bedj',
23
- name: 'RepeatMasker',
24
- stackheight: 14,
25
- file: 'anno/rmsk.galGal6.gz',
26
- onerow: true,
27
- categories: {
28
- SINE: { color: '#ED8C8E', label: 'SINE' },
29
- LINE: { color: '#EDCB8C', label: 'LINE' },
30
- LTR: { color: '#E38CED', label: 'LTR' },
31
- DNA: { color: '#8C8EED', label: 'DNA transposon' },
32
- simple: { color: '#8EB88C', label: 'Simple repeats' },
33
- low_complexity: { color: '#ACEBA9', label: 'Low complexity' },
34
- satellite: { color: '#B59A84', label: 'Satellite' },
35
- RNA: { color: '#9DE0E0', label: 'RNA repeat' },
36
- other: { color: '#9BADC2', label: 'Other' },
37
- unknown: { color: '#858585', label: 'Unknown' }
38
- }
39
- }
40
- ],
41
- defaultcoord: {
42
- chr: 'chr2',
43
- start: 32430516,
44
- stop: 32858004
45
- },
46
- majorchr: "\nchr1\t197608386\nchr2\t149682049\nchr3\t110838418\nchr4\t91315245\nchrZ\t82529921\nchr5\t59809098\nchr7\t36742308\nchr6\t36374701\nchr8\t30219446\nchr9\t24153086\nchr10\t21119840\nchr12\t20387278\nchr11\t20200042\nchr13\t19166714\nchr14\t16219308\nchr20\t13897287\nchr15\t13062184\nchr18\t11373140\nchr17\t10762512\nchr19\t10323212\nchr27\t8080432\nchr33\t7821666\nchr21\t6844979\nchrW\t6813114\nchr24\t6491222\nchr31\t6153034\nchr23\t6149580\nchr26\t6055710\nchr22\t5459462\nchr28\t5116882\nchr25\t3980610\nchr16\t2844601",
47
- minorchr: "\n\nchrUn_NW_020110167v1\t2023903\nchrUn_NW_020110164v1\t2003471\nchrUn_NW_020110165v1\t1977309\nchr30\t1818525\nchrUn_NW_020110162v1\t1222195\nchrUn_NW_020110163v1\t900507\nchr32\t725831\nchrUn_NW_020110160v1\t696307\nchrUn_NW_020110161v1\t665899\nchrUn_NW_020110158v1\t468536\nchrUn_NW_020110159v1\t199634\nchrUn_NW_020110156v1\t177577\nchr16_NW_020109758v1_random\t149503\nchrUn_NW_020110157v1\t94788\nchrUn_NW_020110154v1\t61939\nchrUn_NW_020110155v1\t53716\nchrUn_NW_020110152v1\t52554\nchrUn_NW_020110153v1\t48347\nchrUn_NW_020110150v1\t42067\nchrUn_NW_020110151v1\t39545\nchrUn_NW_020110148v1\t34471\nchrUn_NW_020110149v1\t34291\nchrUn_NW_020109843v1\t33802\nchrUn_NW_020109841v1\t33731\nchrUn_NW_020109842v1\t33531\nchrUn_NW_020109840v1\t33083\nchrUn_NW_020109839v1\t33030\nchrUn_NW_020109838v1\t30818\nchrUn_NW_020109837v1\t30439\nchrUn_NW_020109836v1\t30225\nchrUn_NW_020109835v1\t30157\nchrUn_NW_020109834v1\t29697\nchrUn_NW_020109833v1\t28243\nchrW_NW_020109826v1_random\t28212\nchr9_NW_020109754v1_random\t27963\nchrUn_NW_020109832v1\t27830\nchrW_NW_020109825v1_random\t27808\nchrUn_NW_020109831v1\t27130\nchrUn_NW_020109830v1\t27104\nchrUn_NW_020110147v1\t26960\nchrUn_NW_020110145v1\t26595\nchrUn_NW_020110146v1\t26310\nchrUn_NW_020110143v1\t26298\nchrUn_NW_020110144v1\t26150\nchrUn_NW_020110141v1\t26131\nchrUn_NW_020110142v1\t25700\nchrUn_NW_020110139v1\t25466\nchrUn_NW_020110140v1\t25409\nchrUn_NW_020110137v1\t25301\nchrUn_NW_020110138v1\t24712\nchrUn_NW_020110135v1\t24315\nchrUn_NW_020110136v1\t24179\nchrW_NW_020109824v1_random\t24105\nchrUn_NW_020110133v1\t23907\nchrUn_NW_020110134v1\t23766\nchrUn_NW_020110131v1\t23748\nchrW_NW_020109823v1_random\t23209\nchrUn_NW_020110132v1\t23190\nchrUn_NW_020110129v1\t22982\nchrW_NW_020109822v1_random\t22964\nchrUn_NW_020110130v1\t22641\nchrUn_NW_020110127v1\t22621\nchrUn_NW_020110128v1\t22381\nchrUn_NW_020110125v1\t22379\nchr1_NW_020109743v1_random\t22289\nchrUn_NW_020110126v1\t21751\nchrUn_NW_020110123v1\t21699\nchrUn_NW_020110124v1\t21677\nchrUn_NW_020110121v1\t21586\nchrUn_NW_020110122v1\t21580\nchr1_NW_020109742v1_random\t21511\nchrUn_NW_020110119v1\t21427\nchrUn_NW_020110120v1\t21266\nchrUn_NW_020110117v1\t20717\nchrUn_NW_020110118v1\t20496\nchrUn_NW_020110115v1\t20494\nchrUn_NW_020110116v1\t20270\nchrW_NW_020109821v1_random\t19928\nchrUn_NW_020110113v1\t19903\nchrW_NW_020109820v1_random\t19850\nchrW_NW_020109819v1_random\t19721\nchrUn_NW_020110114v1\t19536\nchrW_NW_020109818v1_random\t19471\nchrW_NW_020109817v1_random\t19204\nchrUn_NW_020110111v1\t19095\nchrW_NW_020109816v1_random\t19032\nchrUn_NW_020110112v1\t18989\nchr23_NW_020109766v1_random\t18922\nchr6_NW_020109753v1_random\t18845\nchrUn_NW_020110109v1\t18705\nchrUn_NW_020110110v1\t18507\nchrUn_NW_020110107v1\t18412\nchrUn_NW_020110108v1\t18344\nchrUn_NW_020110105v1\t18101\nchrUn_NW_020110106v1\t18034\nchrW_NW_020109815v1_random\t18028\nchrW_NW_020109814v1_random\t17442\nchrUn_NW_020110103v1\t17402\nchrW_NW_020109813v1_random\t17321\nchrUn_NW_020110104v1\t17237\nchrW_NW_020109812v1_random\t17224\nchrW_NW_020109811v1_random\t17217\nchrUn_NW_020110101v1\t17007\nchrM\t16775\nchrUn_NW_020110102v1\t16505\nchrUn_NW_020110099v1\t16464\nchrW_NW_020109810v1_random\t16320\nchrUn_NW_020110100v1\t16245\nchrUn_NW_020110097v1\t16233\nchr23_NW_020109765v1_random\t16157\nchrUn_NW_020110098v1\t16140\nchrUn_NW_020110095v1\t16129\nchrUn_NW_020110096v1\t16106\nchrW_NW_020109809v1_random\t16043\nchrUn_NW_020110093v1\t16031\nchrUn_NW_020110094v1\t15929\nchrUn_NW_020110091v1\t15680\nchrUn_NW_020110092v1\t15663\nchrUn_NW_020110089v1\t15638\nchrZ_NW_020109829v1_random\t15587\nchrUn_NW_020110090v1\t15492\nchrW_NW_020109808v1_random\t15438\nchrUn_NW_020110087v1\t15417\nchrUn_NW_020110088v1\t15387\nchrUn_NW_020110085v1\t15167\nchrUn_NW_020110086v1\t15134\nchrUn_NW_020110083v1\t15132\nchrUn_NW_020110084v1\t15049\nchr23_NW_020109764v1_random\t15003\nchrW_NW_020109807v1_random\t14810\nchrUn_NW_020110081v1\t14773\nchrUn_NW_020110082v1\t14715\nchrUn_NW_020110079v1\t14655\nchrUn_NW_020110080v1\t14613\nchrUn_NW_020110077v1\t14604\nchrUn_NW_020110078v1\t14494\nchrW_NW_020109806v1_random\t14330\nchrUn_NW_020110075v1\t14298\nchrUn_NW_020110076v1\t14205\nchrUn_NW_020110073v1\t14131\nchrUn_NW_020110074v1\t14086\nchrW_NW_020109805v1_random\t14047\nchrUn_NW_020110071v1\t13985\nchrUn_NW_020110072v1\t13913\nchrW_NW_020109804v1_random\t13829\nchrUn_NW_020110069v1\t13798\nchrUn_NW_020110070v1\t13793\nchrW_NW_020109803v1_random\t13691\nchrUn_NW_020110067v1\t13671\nchrUn_NW_020110068v1\t13599\nchrUn_NW_020110065v1\t13513\nchrUn_NW_020110066v1\t13240\nchrUn_NW_020110063v1\t13224\nchrUn_NW_020110064v1\t13157\nchrUn_NW_020110061v1\t13139\nchrUn_NW_020110062v1\t13021\nchrUn_NW_020110059v1\t12987\nchrUn_NW_020110060v1\t12986\nchrUn_NW_020110057v1\t12789\nchrW_NW_020109802v1_random\t12728\nchrUn_NW_020110058v1\t12721\nchrUn_NW_020110055v1\t12562\nchrUn_NW_020110056v1\t12537\nchrUn_NW_020110053v1\t12430\nchrUn_NW_020110054v1\t12389\nchrUn_NW_020110051v1\t12152\nchrUn_NW_020110052v1\t12129\nchrW_NW_020109801v1_random\t12127\nchrUn_NW_020110049v1\t12125\nchrUn_NW_020110050v1\t12040\nchrUn_NW_020110047v1\t11985\nchrUn_NW_020110048v1\t11970\nchrUn_NW_020110045v1\t11891\nchrUn_NW_020110046v1\t11743\nchrUn_NW_020110043v1\t11663\nchrUn_NW_020110044v1\t11473\nchrUn_NW_020110041v1\t11376\nchr31_NW_020109771v1_random\t11340\nchr31_NW_020109770v1_random\t11305\nchrUn_NW_020110042v1\t11254\nchrUn_NW_020110039v1\t11212\nchrUn_NW_020110040v1\t11204\nchrW_NW_020109800v1_random\t11068\nchrUn_NW_020110037v1\t11066\nchrUn_NW_020110038v1\t10993\nchrUn_NW_020110035v1\t10984\nchr6_NW_020109752v1_random\t10928\nchrW_NW_020109799v1_random\t10871\nchr1_NW_020109741v1_random\t10869\nchrUn_NW_020110036v1\t10816\nchr6_NW_020109751v1_random\t10724\nchrUn_NW_020110033v1\t10691\nchrW_NW_020109798v1_random\t10551\nchrUn_NW_020110034v1\t10473\nchrUn_NW_020110031v1\t10371\nchrW_NW_020109797v1_random\t10371\nchrW_NW_020109796v1_random\t10224\nchrW_NW_020109795v1_random\t10162\nchrW_NW_020109794v1_random\t10106\nchrUn_NW_020110032v1\t10066\nchrUn_NW_020110029v1\t10056\nchrUn_NW_020110030v1\t10010\nchrUn_NW_020110027v1\t9935\nchrUn_NW_020110028v1\t9888\nchrUn_NW_020110025v1\t9858\nchrUn_NW_020110026v1\t9696\nchrUn_NW_020110023v1\t9688\nchrUn_NW_020110024v1\t9619\nchrUn_NW_020110021v1\t9617\nchrW_NW_020109793v1_random\t9607\nchrUn_NW_020110022v1\t9579\nchrUn_NW_020110019v1\t9568\nchr31_NW_020109769v1_random\t9481\nchrUn_NW_020110020v1\t9469\nchrUn_NW_020110017v1\t9308\nchrW_NW_020109792v1_random\t9182\nchrUn_NW_020110018v1\t9172\nchrUn_NW_020110015v1\t9118\nchrW_NW_020109791v1_random\t9034\nchrUn_NW_020110016v1\t9032\nchrUn_NW_020110013v1\t8999\nchrUn_NW_020110014v1\t8915\nchrUn_NW_020110011v1\t8913\nchrW_NW_020109790v1_random\t8909\nchrUn_NW_020110012v1\t8891\nchrUn_NW_020110009v1\t8846\nchrUn_NW_020110010v1\t8788\nchrUn_NW_020110007v1\t8749\nchrUn_NW_020110008v1\t8722\nchrUn_NW_020110005v1\t8656\nchrUn_NW_020110006v1\t8637\nchrW_NW_020109789v1_random\t8559\nchrUn_NW_020110003v1\t8516\nchrUn_NW_020110004v1\t8464\nchrUn_NW_020110001v1\t8294\nchrW_NW_020109788v1_random\t8275\nchrW_NW_020109787v1_random\t8267\nchrUn_NW_020110002v1\t8247\nchrUn_NW_020109999v1\t8242\nchrUn_NW_020110000v1\t8189\nchrUn_NW_020109997v1\t8180\nchrW_NW_020109786v1_random\t8166\nchrUn_NW_020109998v1\t8152\nchrUn_NW_020109995v1\t8118\nchrUn_NW_020109996v1\t8110\nchrUn_NW_020109993v1\t8038\nchrUn_NW_020109994v1\t8025\nchrUn_NW_020109991v1\t7923\nchrUn_NW_020109992v1\t7918\nchrW_NW_020109785v1_random\t7878\nchrW_NW_020109784v1_random\t7765\nchrUn_NW_020109989v1\t7675\nchrUn_NW_020109990v1\t7655\nchrUn_NW_020109987v1\t7621\nchrUn_NW_020109988v1\t7511\nchrUn_NW_020110168v1\t7419\nchrUn_NW_020109985v1\t7336\nchrUn_NW_020109986v1\t7298\nchr3_NW_020109747v1_random\t7246\nchrUn_NW_020109983v1\t7090\nchrW_NW_020109783v1_random\t7074\nchrUn_NW_020109984v1\t6958\nchrW_NW_020109782v1_random\t6929\nchrUn_NW_020109981v1\t6925\nchrUn_NW_020109982v1\t6885\nchrUn_NW_020109979v1\t6881\nchrW_NW_020109781v1_random\t6830\nchrUn_NW_020109977v1\t6824\nchrUn_NW_020109980v1\t6824\nchrUn_NW_020109978v1\t6814\nchrUn_NW_020109975v1\t6808\nchrUn_NW_020109976v1\t6764\nchrUn_NW_020109973v1\t6698\nchrW_NW_020109780v1_random\t6668\nchrUn_NW_020109974v1\t6638\nchrUn_NW_020109971v1\t6586\nchrUn_NW_020109972v1\t6564\nchrUn_NW_020109969v1\t6539\nchrUn_NW_020109970v1\t6414\nchrUn_NW_020109967v1\t6378\nchrUn_NW_020109968v1\t6349\nchrUn_NW_020109965v1\t6324\nchrUn_NW_020109966v1\t6318\nchr3_NW_020109746v1_random\t6272\nchrUn_NW_020109963v1\t6269\nchrUn_NW_020109964v1\t6243\nchrUn_NW_020109961v1\t6185\nchrUn_NW_020109962v1\t6066\nchrUn_NW_020109959v1\t6042\nchrUn_NW_020109960v1\t5955\nchr1_NW_020109740v1_random\t5861\nchrUn_NW_020109957v1\t5791\nchrUn_NW_020109958v1\t5694\nchrUn_NW_020109955v1\t5685\nchrUn_NW_020109956v1\t5662\nchrUn_NW_020109953v1\t5637\nchrW_NW_020109779v1_random\t5587\nchrUn_NW_020109954v1\t5521\nchrUn_NW_020109951v1\t5419\nchrUn_NW_020109952v1\t5289\nchrUn_NW_020109949v1\t5230\nchr6_NW_020109750v1_random\t5224\nchrUn_NW_020109950v1\t5199\nchrUn_NW_020109947v1\t5075\nchrUn_NW_020109948v1\t5044\nchrUn_NW_020110169v1\t4840\nchrUn_NW_020109945v1\t4808\nchrUn_NW_020109946v1\t4777\nchrUn_NW_020109943v1\t4766\nchrUn_NW_020109944v1\t4730\nchrUn_NW_020109941v1\t4685\nchr1_NW_020109739v1_random\t4675\nchrUn_NW_020109942v1\t4652\nchrUn_NW_020109939v1\t4621\nchrUn_NW_020109940v1\t4617\nchrUn_NW_020109937v1\t4511\nchrUn_NW_020109938v1\t4451\nchr6_NW_020109749v1_random\t4448\nchrUn_NW_020110166v1\t4360\nchrUn_NW_020109935v1\t4359\nchrUn_NW_020109936v1\t4266\nchrUn_NW_020109933v1\t4245\nchrUn_NW_020109934v1\t4206\nchrUn_NW_020109931v1\t4198\nchrUn_NW_020109932v1\t4154\nchr6_NW_020109748v1_random\t4087\nchrUn_NW_020109929v1\t4040\nchrUn_NW_020109930v1\t4037\nchrUn_NW_020109927v1\t3973\nchrUn_NW_020109928v1\t3863\nchrUn_NW_020109925v1\t3847\nchrUn_NW_020109926v1\t3687\nchrUn_NW_020109923v1\t3680\nchrUn_NW_020109924v1\t3660\nchrUn_NW_020109921v1\t3657\nchrUn_NW_020109922v1\t3647\nchrUn_NW_020109919v1\t3584\nchrUn_NW_020109920v1\t3581\nchrUn_NW_020109917v1\t3531\nchrUn_NW_020109918v1\t3516\nchrUn_NW_020109915v1\t3504\nchrUn_NW_020109916v1\t3436\nchrUn_NW_020109913v1\t3346\nchrW_NW_020109778v1_random\t3094\nchrUn_NW_020109914v1\t3019\nchrUn_NW_020109911v1\t2991\nchrUn_NW_020109912v1\t2985\nchrUn_NW_020109909v1\t2979\nchrUn_NW_020109910v1\t2948\nchrUn_NW_020109907v1\t2928\nchrUn_NW_020109908v1\t2902\nchrUn_NW_020109905v1\t2898\nchrUn_NW_020109906v1\t2883\nchrUn_NW_020109903v1\t2758\nchrUn_NW_020109904v1\t2663\nchrUn_NW_020109901v1\t2615\nchrUn_NW_020109902v1\t2610\nchrUn_NW_020109899v1\t2599\nchrUn_NW_020109900v1\t2568\nchrUn_NW_020109897v1\t2566\nchrUn_NW_020109898v1\t2555\nchrUn_NW_020109895v1\t2520\nchrUn_NW_020109896v1\t2481\nchrUn_NW_020109893v1\t2462\nchrUn_NW_020109894v1\t2402\nchr1_NW_020109738v1_random\t2384\nchrUn_NW_020109891v1\t2308\nchrUn_NW_020109892v1\t2262\nchrUn_NW_020109889v1\t2260\nchrUn_NW_020109890v1\t2214\nchr13_NW_020109755v1_random\t2157\nchrUn_NW_020109887v1\t2149\nchrW_NW_020109777v1_random\t2092\nchrUn_NW_020109888v1\t2087\nchrUn_NW_020109885v1\t2071\nchr15_NW_020109757v1_random\t2034\nchrUn_NW_020109886v1\t2033\nchrW_NW_020109776v1_random\t2003\nchrUn_NW_020109883v1\t1935\nchrUn_NW_020109884v1\t1908\nchr25_NW_020109767v1_random\t1884\nchrUn_NW_020109881v1\t1840\nchrUn_NW_020109882v1\t1834\nchrUn_NW_020109879v1\t1800\nchr3_NW_020109745v1_random\t1783\nchrUn_NW_020109880v1\t1782\nchr1_NW_020109737v1_random\t1765\nchrUn_NW_020109877v1\t1756\nchrUn_NW_020109878v1\t1752\nchrUn_NW_020109875v1\t1748\nchrUn_NW_020109876v1\t1664\nchr23_NW_020109763v1_random\t1662\nchrUn_NW_020109873v1\t1643\nchrUn_NW_020109874v1\t1589\nchrUn_NW_020109871v1\t1579\nchrW_NW_020109775v1_random\t1568\nchrUn_NW_020109872v1\t1547\nchr28_NW_020109768v1_random\t1519\nchrUn_NW_020109869v1\t1453\nchrUn_NW_020109870v1\t1394\nchrUn_NW_020109867v1\t1381\nchrUn_NW_020109868v1\t1367\nchr23_NW_020109762v1_random\t1264\nchrUn_NW_020109865v1\t1173\nchrUn_NW_020109866v1\t1167\nchr19_NW_020109759v1_random\t1131\nchrUn_NW_020109863v1\t1115\nchrUn_NW_020109864v1\t1086\nchrUn_NW_020109861v1\t966\nchrUn_NW_020109862v1\t955\nchrUn_NW_020109859v1\t950\nchr22_NW_020109760v1_random\t918\nchrUn_NW_020109860v1\t848\nchrUn_NW_020109857v1\t806\nchrUn_NW_020109858v1\t791\nchr14_NW_020109756v1_random\t765\nchrUn_NW_020109855v1\t678\nchrUn_NW_020109856v1\t677\nchrUn_NW_020109853v1\t676\nchrUn_NW_020109854v1\t644\nchrUn_NW_020109851v1\t623\nchrUn_NW_020109852v1\t597\nchrUn_NW_020109849v1\t579\nchrUn_NW_020109850v1\t555\nchr3_NW_020109744v1_random\t509\nchrUn_NW_020109847v1\t345\nchrUn_NW_020109848v1\t342\nchr23_NW_020109761v1_random\t322\nchrUn_NW_020109845v1\t246\nchrUn_NW_020109846v1\t195\nchr33_NW_020109772v1_random\t182\nchrUn_NW_020109844v1\t87"
19
+ {
20
+ type: "bedj",
21
+ name: "RepeatMasker",
22
+ stackheight: 14,
23
+ file: "anno/rmsk.galGal6.gz",
24
+ onerow: true,
25
+ categories: {
26
+ SINE: { color: "#ED8C8E", label: "SINE" },
27
+ LINE: { color: "#EDCB8C", label: "LINE" },
28
+ LTR: { color: "#E38CED", label: "LTR" },
29
+ DNA: { color: "#8C8EED", label: "DNA transposon" },
30
+ simple: { color: "#8EB88C", label: "Simple repeats" },
31
+ low_complexity: { color: "#ACEBA9", label: "Low complexity" },
32
+ satellite: { color: "#B59A84", label: "Satellite" },
33
+ RNA: { color: "#9DE0E0", label: "RNA repeat" },
34
+ other: { color: "#9BADC2", label: "Other" },
35
+ unknown: { color: "#858585", label: "Unknown" }
36
+ }
37
+ }
38
+ ],
39
+ defaultcoord: {
40
+ chr: "chr2",
41
+ start: 32430516,
42
+ stop: 32858004
43
+ },
44
+ majorchr: `
45
+ chr1 197608386
46
+ chr2 149682049
47
+ chr3 110838418
48
+ chr4 91315245
49
+ chrZ 82529921
50
+ chr5 59809098
51
+ chr7 36742308
52
+ chr6 36374701
53
+ chr8 30219446
54
+ chr9 24153086
55
+ chr10 21119840
56
+ chr12 20387278
57
+ chr11 20200042
58
+ chr13 19166714
59
+ chr14 16219308
60
+ chr20 13897287
61
+ chr15 13062184
62
+ chr18 11373140
63
+ chr17 10762512
64
+ chr19 10323212
65
+ chr27 8080432
66
+ chr33 7821666
67
+ chr21 6844979
68
+ chrW 6813114
69
+ chr24 6491222
70
+ chr31 6153034
71
+ chr23 6149580
72
+ chr26 6055710
73
+ chr22 5459462
74
+ chr28 5116882
75
+ chr25 3980610
76
+ chr16 2844601`,
77
+ minorchr: `
78
+
79
+ chrUn_NW_020110167v1 2023903
80
+ chrUn_NW_020110164v1 2003471
81
+ chrUn_NW_020110165v1 1977309
82
+ chr30 1818525
83
+ chrUn_NW_020110162v1 1222195
84
+ chrUn_NW_020110163v1 900507
85
+ chr32 725831
86
+ chrUn_NW_020110160v1 696307
87
+ chrUn_NW_020110161v1 665899
88
+ chrUn_NW_020110158v1 468536
89
+ chrUn_NW_020110159v1 199634
90
+ chrUn_NW_020110156v1 177577
91
+ chr16_NW_020109758v1_random 149503
92
+ chrUn_NW_020110157v1 94788
93
+ chrUn_NW_020110154v1 61939
94
+ chrUn_NW_020110155v1 53716
95
+ chrUn_NW_020110152v1 52554
96
+ chrUn_NW_020110153v1 48347
97
+ chrUn_NW_020110150v1 42067
98
+ chrUn_NW_020110151v1 39545
99
+ chrUn_NW_020110148v1 34471
100
+ chrUn_NW_020110149v1 34291
101
+ chrUn_NW_020109843v1 33802
102
+ chrUn_NW_020109841v1 33731
103
+ chrUn_NW_020109842v1 33531
104
+ chrUn_NW_020109840v1 33083
105
+ chrUn_NW_020109839v1 33030
106
+ chrUn_NW_020109838v1 30818
107
+ chrUn_NW_020109837v1 30439
108
+ chrUn_NW_020109836v1 30225
109
+ chrUn_NW_020109835v1 30157
110
+ chrUn_NW_020109834v1 29697
111
+ chrUn_NW_020109833v1 28243
112
+ chrW_NW_020109826v1_random 28212
113
+ chr9_NW_020109754v1_random 27963
114
+ chrUn_NW_020109832v1 27830
115
+ chrW_NW_020109825v1_random 27808
116
+ chrUn_NW_020109831v1 27130
117
+ chrUn_NW_020109830v1 27104
118
+ chrUn_NW_020110147v1 26960
119
+ chrUn_NW_020110145v1 26595
120
+ chrUn_NW_020110146v1 26310
121
+ chrUn_NW_020110143v1 26298
122
+ chrUn_NW_020110144v1 26150
123
+ chrUn_NW_020110141v1 26131
124
+ chrUn_NW_020110142v1 25700
125
+ chrUn_NW_020110139v1 25466
126
+ chrUn_NW_020110140v1 25409
127
+ chrUn_NW_020110137v1 25301
128
+ chrUn_NW_020110138v1 24712
129
+ chrUn_NW_020110135v1 24315
130
+ chrUn_NW_020110136v1 24179
131
+ chrW_NW_020109824v1_random 24105
132
+ chrUn_NW_020110133v1 23907
133
+ chrUn_NW_020110134v1 23766
134
+ chrUn_NW_020110131v1 23748
135
+ chrW_NW_020109823v1_random 23209
136
+ chrUn_NW_020110132v1 23190
137
+ chrUn_NW_020110129v1 22982
138
+ chrW_NW_020109822v1_random 22964
139
+ chrUn_NW_020110130v1 22641
140
+ chrUn_NW_020110127v1 22621
141
+ chrUn_NW_020110128v1 22381
142
+ chrUn_NW_020110125v1 22379
143
+ chr1_NW_020109743v1_random 22289
144
+ chrUn_NW_020110126v1 21751
145
+ chrUn_NW_020110123v1 21699
146
+ chrUn_NW_020110124v1 21677
147
+ chrUn_NW_020110121v1 21586
148
+ chrUn_NW_020110122v1 21580
149
+ chr1_NW_020109742v1_random 21511
150
+ chrUn_NW_020110119v1 21427
151
+ chrUn_NW_020110120v1 21266
152
+ chrUn_NW_020110117v1 20717
153
+ chrUn_NW_020110118v1 20496
154
+ chrUn_NW_020110115v1 20494
155
+ chrUn_NW_020110116v1 20270
156
+ chrW_NW_020109821v1_random 19928
157
+ chrUn_NW_020110113v1 19903
158
+ chrW_NW_020109820v1_random 19850
159
+ chrW_NW_020109819v1_random 19721
160
+ chrUn_NW_020110114v1 19536
161
+ chrW_NW_020109818v1_random 19471
162
+ chrW_NW_020109817v1_random 19204
163
+ chrUn_NW_020110111v1 19095
164
+ chrW_NW_020109816v1_random 19032
165
+ chrUn_NW_020110112v1 18989
166
+ chr23_NW_020109766v1_random 18922
167
+ chr6_NW_020109753v1_random 18845
168
+ chrUn_NW_020110109v1 18705
169
+ chrUn_NW_020110110v1 18507
170
+ chrUn_NW_020110107v1 18412
171
+ chrUn_NW_020110108v1 18344
172
+ chrUn_NW_020110105v1 18101
173
+ chrUn_NW_020110106v1 18034
174
+ chrW_NW_020109815v1_random 18028
175
+ chrW_NW_020109814v1_random 17442
176
+ chrUn_NW_020110103v1 17402
177
+ chrW_NW_020109813v1_random 17321
178
+ chrUn_NW_020110104v1 17237
179
+ chrW_NW_020109812v1_random 17224
180
+ chrW_NW_020109811v1_random 17217
181
+ chrUn_NW_020110101v1 17007
182
+ chrM 16775
183
+ chrUn_NW_020110102v1 16505
184
+ chrUn_NW_020110099v1 16464
185
+ chrW_NW_020109810v1_random 16320
186
+ chrUn_NW_020110100v1 16245
187
+ chrUn_NW_020110097v1 16233
188
+ chr23_NW_020109765v1_random 16157
189
+ chrUn_NW_020110098v1 16140
190
+ chrUn_NW_020110095v1 16129
191
+ chrUn_NW_020110096v1 16106
192
+ chrW_NW_020109809v1_random 16043
193
+ chrUn_NW_020110093v1 16031
194
+ chrUn_NW_020110094v1 15929
195
+ chrUn_NW_020110091v1 15680
196
+ chrUn_NW_020110092v1 15663
197
+ chrUn_NW_020110089v1 15638
198
+ chrZ_NW_020109829v1_random 15587
199
+ chrUn_NW_020110090v1 15492
200
+ chrW_NW_020109808v1_random 15438
201
+ chrUn_NW_020110087v1 15417
202
+ chrUn_NW_020110088v1 15387
203
+ chrUn_NW_020110085v1 15167
204
+ chrUn_NW_020110086v1 15134
205
+ chrUn_NW_020110083v1 15132
206
+ chrUn_NW_020110084v1 15049
207
+ chr23_NW_020109764v1_random 15003
208
+ chrW_NW_020109807v1_random 14810
209
+ chrUn_NW_020110081v1 14773
210
+ chrUn_NW_020110082v1 14715
211
+ chrUn_NW_020110079v1 14655
212
+ chrUn_NW_020110080v1 14613
213
+ chrUn_NW_020110077v1 14604
214
+ chrUn_NW_020110078v1 14494
215
+ chrW_NW_020109806v1_random 14330
216
+ chrUn_NW_020110075v1 14298
217
+ chrUn_NW_020110076v1 14205
218
+ chrUn_NW_020110073v1 14131
219
+ chrUn_NW_020110074v1 14086
220
+ chrW_NW_020109805v1_random 14047
221
+ chrUn_NW_020110071v1 13985
222
+ chrUn_NW_020110072v1 13913
223
+ chrW_NW_020109804v1_random 13829
224
+ chrUn_NW_020110069v1 13798
225
+ chrUn_NW_020110070v1 13793
226
+ chrW_NW_020109803v1_random 13691
227
+ chrUn_NW_020110067v1 13671
228
+ chrUn_NW_020110068v1 13599
229
+ chrUn_NW_020110065v1 13513
230
+ chrUn_NW_020110066v1 13240
231
+ chrUn_NW_020110063v1 13224
232
+ chrUn_NW_020110064v1 13157
233
+ chrUn_NW_020110061v1 13139
234
+ chrUn_NW_020110062v1 13021
235
+ chrUn_NW_020110059v1 12987
236
+ chrUn_NW_020110060v1 12986
237
+ chrUn_NW_020110057v1 12789
238
+ chrW_NW_020109802v1_random 12728
239
+ chrUn_NW_020110058v1 12721
240
+ chrUn_NW_020110055v1 12562
241
+ chrUn_NW_020110056v1 12537
242
+ chrUn_NW_020110053v1 12430
243
+ chrUn_NW_020110054v1 12389
244
+ chrUn_NW_020110051v1 12152
245
+ chrUn_NW_020110052v1 12129
246
+ chrW_NW_020109801v1_random 12127
247
+ chrUn_NW_020110049v1 12125
248
+ chrUn_NW_020110050v1 12040
249
+ chrUn_NW_020110047v1 11985
250
+ chrUn_NW_020110048v1 11970
251
+ chrUn_NW_020110045v1 11891
252
+ chrUn_NW_020110046v1 11743
253
+ chrUn_NW_020110043v1 11663
254
+ chrUn_NW_020110044v1 11473
255
+ chrUn_NW_020110041v1 11376
256
+ chr31_NW_020109771v1_random 11340
257
+ chr31_NW_020109770v1_random 11305
258
+ chrUn_NW_020110042v1 11254
259
+ chrUn_NW_020110039v1 11212
260
+ chrUn_NW_020110040v1 11204
261
+ chrW_NW_020109800v1_random 11068
262
+ chrUn_NW_020110037v1 11066
263
+ chrUn_NW_020110038v1 10993
264
+ chrUn_NW_020110035v1 10984
265
+ chr6_NW_020109752v1_random 10928
266
+ chrW_NW_020109799v1_random 10871
267
+ chr1_NW_020109741v1_random 10869
268
+ chrUn_NW_020110036v1 10816
269
+ chr6_NW_020109751v1_random 10724
270
+ chrUn_NW_020110033v1 10691
271
+ chrW_NW_020109798v1_random 10551
272
+ chrUn_NW_020110034v1 10473
273
+ chrUn_NW_020110031v1 10371
274
+ chrW_NW_020109797v1_random 10371
275
+ chrW_NW_020109796v1_random 10224
276
+ chrW_NW_020109795v1_random 10162
277
+ chrW_NW_020109794v1_random 10106
278
+ chrUn_NW_020110032v1 10066
279
+ chrUn_NW_020110029v1 10056
280
+ chrUn_NW_020110030v1 10010
281
+ chrUn_NW_020110027v1 9935
282
+ chrUn_NW_020110028v1 9888
283
+ chrUn_NW_020110025v1 9858
284
+ chrUn_NW_020110026v1 9696
285
+ chrUn_NW_020110023v1 9688
286
+ chrUn_NW_020110024v1 9619
287
+ chrUn_NW_020110021v1 9617
288
+ chrW_NW_020109793v1_random 9607
289
+ chrUn_NW_020110022v1 9579
290
+ chrUn_NW_020110019v1 9568
291
+ chr31_NW_020109769v1_random 9481
292
+ chrUn_NW_020110020v1 9469
293
+ chrUn_NW_020110017v1 9308
294
+ chrW_NW_020109792v1_random 9182
295
+ chrUn_NW_020110018v1 9172
296
+ chrUn_NW_020110015v1 9118
297
+ chrW_NW_020109791v1_random 9034
298
+ chrUn_NW_020110016v1 9032
299
+ chrUn_NW_020110013v1 8999
300
+ chrUn_NW_020110014v1 8915
301
+ chrUn_NW_020110011v1 8913
302
+ chrW_NW_020109790v1_random 8909
303
+ chrUn_NW_020110012v1 8891
304
+ chrUn_NW_020110009v1 8846
305
+ chrUn_NW_020110010v1 8788
306
+ chrUn_NW_020110007v1 8749
307
+ chrUn_NW_020110008v1 8722
308
+ chrUn_NW_020110005v1 8656
309
+ chrUn_NW_020110006v1 8637
310
+ chrW_NW_020109789v1_random 8559
311
+ chrUn_NW_020110003v1 8516
312
+ chrUn_NW_020110004v1 8464
313
+ chrUn_NW_020110001v1 8294
314
+ chrW_NW_020109788v1_random 8275
315
+ chrW_NW_020109787v1_random 8267
316
+ chrUn_NW_020110002v1 8247
317
+ chrUn_NW_020109999v1 8242
318
+ chrUn_NW_020110000v1 8189
319
+ chrUn_NW_020109997v1 8180
320
+ chrW_NW_020109786v1_random 8166
321
+ chrUn_NW_020109998v1 8152
322
+ chrUn_NW_020109995v1 8118
323
+ chrUn_NW_020109996v1 8110
324
+ chrUn_NW_020109993v1 8038
325
+ chrUn_NW_020109994v1 8025
326
+ chrUn_NW_020109991v1 7923
327
+ chrUn_NW_020109992v1 7918
328
+ chrW_NW_020109785v1_random 7878
329
+ chrW_NW_020109784v1_random 7765
330
+ chrUn_NW_020109989v1 7675
331
+ chrUn_NW_020109990v1 7655
332
+ chrUn_NW_020109987v1 7621
333
+ chrUn_NW_020109988v1 7511
334
+ chrUn_NW_020110168v1 7419
335
+ chrUn_NW_020109985v1 7336
336
+ chrUn_NW_020109986v1 7298
337
+ chr3_NW_020109747v1_random 7246
338
+ chrUn_NW_020109983v1 7090
339
+ chrW_NW_020109783v1_random 7074
340
+ chrUn_NW_020109984v1 6958
341
+ chrW_NW_020109782v1_random 6929
342
+ chrUn_NW_020109981v1 6925
343
+ chrUn_NW_020109982v1 6885
344
+ chrUn_NW_020109979v1 6881
345
+ chrW_NW_020109781v1_random 6830
346
+ chrUn_NW_020109977v1 6824
347
+ chrUn_NW_020109980v1 6824
348
+ chrUn_NW_020109978v1 6814
349
+ chrUn_NW_020109975v1 6808
350
+ chrUn_NW_020109976v1 6764
351
+ chrUn_NW_020109973v1 6698
352
+ chrW_NW_020109780v1_random 6668
353
+ chrUn_NW_020109974v1 6638
354
+ chrUn_NW_020109971v1 6586
355
+ chrUn_NW_020109972v1 6564
356
+ chrUn_NW_020109969v1 6539
357
+ chrUn_NW_020109970v1 6414
358
+ chrUn_NW_020109967v1 6378
359
+ chrUn_NW_020109968v1 6349
360
+ chrUn_NW_020109965v1 6324
361
+ chrUn_NW_020109966v1 6318
362
+ chr3_NW_020109746v1_random 6272
363
+ chrUn_NW_020109963v1 6269
364
+ chrUn_NW_020109964v1 6243
365
+ chrUn_NW_020109961v1 6185
366
+ chrUn_NW_020109962v1 6066
367
+ chrUn_NW_020109959v1 6042
368
+ chrUn_NW_020109960v1 5955
369
+ chr1_NW_020109740v1_random 5861
370
+ chrUn_NW_020109957v1 5791
371
+ chrUn_NW_020109958v1 5694
372
+ chrUn_NW_020109955v1 5685
373
+ chrUn_NW_020109956v1 5662
374
+ chrUn_NW_020109953v1 5637
375
+ chrW_NW_020109779v1_random 5587
376
+ chrUn_NW_020109954v1 5521
377
+ chrUn_NW_020109951v1 5419
378
+ chrUn_NW_020109952v1 5289
379
+ chrUn_NW_020109949v1 5230
380
+ chr6_NW_020109750v1_random 5224
381
+ chrUn_NW_020109950v1 5199
382
+ chrUn_NW_020109947v1 5075
383
+ chrUn_NW_020109948v1 5044
384
+ chrUn_NW_020110169v1 4840
385
+ chrUn_NW_020109945v1 4808
386
+ chrUn_NW_020109946v1 4777
387
+ chrUn_NW_020109943v1 4766
388
+ chrUn_NW_020109944v1 4730
389
+ chrUn_NW_020109941v1 4685
390
+ chr1_NW_020109739v1_random 4675
391
+ chrUn_NW_020109942v1 4652
392
+ chrUn_NW_020109939v1 4621
393
+ chrUn_NW_020109940v1 4617
394
+ chrUn_NW_020109937v1 4511
395
+ chrUn_NW_020109938v1 4451
396
+ chr6_NW_020109749v1_random 4448
397
+ chrUn_NW_020110166v1 4360
398
+ chrUn_NW_020109935v1 4359
399
+ chrUn_NW_020109936v1 4266
400
+ chrUn_NW_020109933v1 4245
401
+ chrUn_NW_020109934v1 4206
402
+ chrUn_NW_020109931v1 4198
403
+ chrUn_NW_020109932v1 4154
404
+ chr6_NW_020109748v1_random 4087
405
+ chrUn_NW_020109929v1 4040
406
+ chrUn_NW_020109930v1 4037
407
+ chrUn_NW_020109927v1 3973
408
+ chrUn_NW_020109928v1 3863
409
+ chrUn_NW_020109925v1 3847
410
+ chrUn_NW_020109926v1 3687
411
+ chrUn_NW_020109923v1 3680
412
+ chrUn_NW_020109924v1 3660
413
+ chrUn_NW_020109921v1 3657
414
+ chrUn_NW_020109922v1 3647
415
+ chrUn_NW_020109919v1 3584
416
+ chrUn_NW_020109920v1 3581
417
+ chrUn_NW_020109917v1 3531
418
+ chrUn_NW_020109918v1 3516
419
+ chrUn_NW_020109915v1 3504
420
+ chrUn_NW_020109916v1 3436
421
+ chrUn_NW_020109913v1 3346
422
+ chrW_NW_020109778v1_random 3094
423
+ chrUn_NW_020109914v1 3019
424
+ chrUn_NW_020109911v1 2991
425
+ chrUn_NW_020109912v1 2985
426
+ chrUn_NW_020109909v1 2979
427
+ chrUn_NW_020109910v1 2948
428
+ chrUn_NW_020109907v1 2928
429
+ chrUn_NW_020109908v1 2902
430
+ chrUn_NW_020109905v1 2898
431
+ chrUn_NW_020109906v1 2883
432
+ chrUn_NW_020109903v1 2758
433
+ chrUn_NW_020109904v1 2663
434
+ chrUn_NW_020109901v1 2615
435
+ chrUn_NW_020109902v1 2610
436
+ chrUn_NW_020109899v1 2599
437
+ chrUn_NW_020109900v1 2568
438
+ chrUn_NW_020109897v1 2566
439
+ chrUn_NW_020109898v1 2555
440
+ chrUn_NW_020109895v1 2520
441
+ chrUn_NW_020109896v1 2481
442
+ chrUn_NW_020109893v1 2462
443
+ chrUn_NW_020109894v1 2402
444
+ chr1_NW_020109738v1_random 2384
445
+ chrUn_NW_020109891v1 2308
446
+ chrUn_NW_020109892v1 2262
447
+ chrUn_NW_020109889v1 2260
448
+ chrUn_NW_020109890v1 2214
449
+ chr13_NW_020109755v1_random 2157
450
+ chrUn_NW_020109887v1 2149
451
+ chrW_NW_020109777v1_random 2092
452
+ chrUn_NW_020109888v1 2087
453
+ chrUn_NW_020109885v1 2071
454
+ chr15_NW_020109757v1_random 2034
455
+ chrUn_NW_020109886v1 2033
456
+ chrW_NW_020109776v1_random 2003
457
+ chrUn_NW_020109883v1 1935
458
+ chrUn_NW_020109884v1 1908
459
+ chr25_NW_020109767v1_random 1884
460
+ chrUn_NW_020109881v1 1840
461
+ chrUn_NW_020109882v1 1834
462
+ chrUn_NW_020109879v1 1800
463
+ chr3_NW_020109745v1_random 1783
464
+ chrUn_NW_020109880v1 1782
465
+ chr1_NW_020109737v1_random 1765
466
+ chrUn_NW_020109877v1 1756
467
+ chrUn_NW_020109878v1 1752
468
+ chrUn_NW_020109875v1 1748
469
+ chrUn_NW_020109876v1 1664
470
+ chr23_NW_020109763v1_random 1662
471
+ chrUn_NW_020109873v1 1643
472
+ chrUn_NW_020109874v1 1589
473
+ chrUn_NW_020109871v1 1579
474
+ chrW_NW_020109775v1_random 1568
475
+ chrUn_NW_020109872v1 1547
476
+ chr28_NW_020109768v1_random 1519
477
+ chrUn_NW_020109869v1 1453
478
+ chrUn_NW_020109870v1 1394
479
+ chrUn_NW_020109867v1 1381
480
+ chrUn_NW_020109868v1 1367
481
+ chr23_NW_020109762v1_random 1264
482
+ chrUn_NW_020109865v1 1173
483
+ chrUn_NW_020109866v1 1167
484
+ chr19_NW_020109759v1_random 1131
485
+ chrUn_NW_020109863v1 1115
486
+ chrUn_NW_020109864v1 1086
487
+ chrUn_NW_020109861v1 966
488
+ chrUn_NW_020109862v1 955
489
+ chrUn_NW_020109859v1 950
490
+ chr22_NW_020109760v1_random 918
491
+ chrUn_NW_020109860v1 848
492
+ chrUn_NW_020109857v1 806
493
+ chrUn_NW_020109858v1 791
494
+ chr14_NW_020109756v1_random 765
495
+ chrUn_NW_020109855v1 678
496
+ chrUn_NW_020109856v1 677
497
+ chrUn_NW_020109853v1 676
498
+ chrUn_NW_020109854v1 644
499
+ chrUn_NW_020109851v1 623
500
+ chrUn_NW_020109852v1 597
501
+ chrUn_NW_020109849v1 579
502
+ chrUn_NW_020109850v1 555
503
+ chr3_NW_020109744v1_random 509
504
+ chrUn_NW_020109847v1 345
505
+ chrUn_NW_020109848v1 342
506
+ chr23_NW_020109761v1_random 322
507
+ chrUn_NW_020109845v1 246
508
+ chrUn_NW_020109846v1 195
509
+ chr33_NW_020109772v1_random 182
510
+ chrUn_NW_020109844v1 87`
511
+ };
512
+ export {
513
+ galGal6_default as default
48
514
  };