openbabel-ruby 3.1.1.2-arm64-darwin

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  760. metadata +808 -0
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@@ -0,0 +1,39 @@
1
+ *
2
+ * Copyright (c) Merck and Co., Inc., 1994
3
+ * All Rights Reserved
4
+ *
5
+ * MMFF Default Stretch-Bend Parameters
6
+ * Row in
7
+ * Periodic Table
8
+ * IR JR KR F(I_J,K) F(K_J,I)
9
+ 0 1 0 0.15 0.15
10
+ 0 1 1 0.10 0.30
11
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19
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20
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21
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26
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28
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29
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30
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31
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33
+ 2 2 2 0.25 0.25
34
+ 2 2 3 0.25 0.25
35
+ 2 2 4 0.25 0.25
36
+ 3 2 3 0.25 0.25
37
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38
+ 4 2 4 0.25 0.25
39
+ $
data/lib/openbabel/3.2.0/data/3.1.1/mmffoop.par ADDED
@@ -0,0 +1,127 @@
1
+ *
2
+ * Copyright (c) Merck and Co., Inc., 1994
3
+ * All Rights Reserved
4
+ *
5
+ * MMFF OUT-OF-PLANE PARAMETERS- Rev: 15-OCT-93 Source: MMFF94
6
+ * C94 - CORE MMFF94 parameter, from fits to HF/6-31G* 2nd D's
7
+ * #C94 - Value adjusted from CORE MMFF93 value
8
+ *
9
+ * MMFF atom types koop Source
10
+ 1 2 1 2 0.030 C94
11
+ 1 2 2 2 0.027 C94
12
+ 1 2 2 3 0.026 C94
13
+ 1 2 2 5 0.013 C94
14
+ 1 2 2 37 0.032 C94
15
+ 2 2 2 5 0.013 C94
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17
+ 2 2 5 5 0.006 C94
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+ 2 2 5 6 0.027 C94
19
+ 2 2 5 37 0.017 C94
20
+ 2 2 5 40 0.012 C94
21
+ 2 2 5 41 0.008 C94
22
+ 0 2 0 0 0.020 *-2-*-* C94 DEF
23
+ 1 3 1 7 0.146 C94
24
+ 1 3 2 7 0.138 C94
25
+ 1 3 3 7 0.134 C94
26
+ 1 3 5 7 0.122 C94
27
+ 1 3 6 7 0.141 C94
28
+ 1 3 7 10 0.129 C94
29
+ 1 3 7 37 0.138 C94
30
+ 2 3 5 7 0.113 C94
31
+ 2 3 5 9 0.081 C94
32
+ 2 3 6 7 0.127 C94
33
+ 2 3 7 10 0.116 C94
34
+ 3 3 5 7 0.113 C94
35
+ 3 3 6 7 0.127 C94
36
+ 5 3 5 7 0.103 C94
37
+ 5 3 5 9 0.074 C94
38
+ 5 3 5 54 0.078 C94
39
+ 5 3 6 7 0.119 C94
40
+ 5 3 7 10 0.102 C94
41
+ 5 3 9 40 0.067 C94
42
+ 6 3 7 37 0.127 C94
43
+ 7 3 10 10 0.113 C94
44
+ 7 3 20 20 0.151 C94
45
+ 9 3 40 40 0.057 C94
46
+ 0 3 0 0 0.130 *-3-*-* C94 DEF
47
+ 0 8 0 0 0.000 *-8-*-* C94 DEF
48
+ 1 10 1 3 -0.02 #C94 (C93=-0.034)
49
+ 1 10 3 6 -0.033 C94
50
+ 1 10 3 28 -0.02 #C94 (C93=-0.030)
51
+ 3 10 3 28 -0.030 C94
52
+ 3 10 28 28 -0.019 C94
53
+ 0 10 0 0 -0.020 *-10-*-* C94 DEF
54
+ 0 17 0 0 0.000 *-17-*-* E94 DEF
55
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56
+ 5 30 20 30 0.008 C94
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+ 0 30 0 0 0.010 *-30-*-* C94 DEF
58
+ 1 37 37 37 0.040 C94
59
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60
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61
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+ 0 37 0 0 0.035 *-37-*-* C94 DEF
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72
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+ 0 39 0 0 0.020 *-39-*-* C94 DEF
76
+ 1 40 28 37 -0.006 C94
77
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78
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79
+ 28 40 28 37 0.004 C94
80
+ 0 40 0 0 -0.005 *-40-*-* C94 DEF
81
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82
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83
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84
+ 0 41 0 0 0.180 *-41-*-* C94 DEF
85
+ 0 43 0 0 0.000 *-43-*-* E94 DEF
86
+ 0 45 0 0 0.150 *-45-*-* E94 DEF
87
+ 50 49 50 50 0.000 #C94
88
+ 0 49 0 0 0.000 *-49-*-* E94 DEF
89
+ 1 54 3 36 0.016 C94
90
+ 3 54 36 36 0.018 C94
91
+ 0 54 0 0 0.020 *-54-*-* C94 DEF
92
+ 1 55 36 57 0.020 #C94
93
+ 36 55 36 57 0.020 #C94
94
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95
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96
+ 36 56 36 57 0.020 #C94
97
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98
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99
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100
+ 0 57 0 0 0.080 *-57-*-* C94 DEF
101
+ 0 58 0 0 0.025 *-58-*-* E94 DEF
102
+ 5 63 39 64 0.019 C94
103
+ 5 63 39 66 0.068 C94
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109
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110
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117
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120
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121
+ 0 78 0 0 0.045 *-78-*-* C94 DEF
122
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+ 0 81 0 0 0.025 *-81-*-* C94 DEF
126
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127
+ $
data/lib/openbabel/3.2.0/data/3.1.1/mmffpbci.par ADDED
@@ -0,0 +1,106 @@
1
+ *
2
+ * Copyright (c) Merck and Co., Inc., 1994
3
+ * All Rights Reserved
4
+ *
5
+ * MMFF Partial Bond Charge Incs and Formal-Charge Adj. Factors: 19-MAY-1994
6
+ *
7
+ * type pbci fcadj Origin/Comment
8
+ 0 1 0.000 0.000 Fitted default
9
+ 0 2 -0.135 0.000 Fitted default
10
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11
+ 0 4 -0.200 0.000 Fitted default
12
+ 0 5 -0.023 0.000 Fitted default
13
+ 0 6 -0.243 0.000 Fitted default
14
+ 0 7 -0.687 0.000 Fitted default
15
+ 0 8 -0.253 0.000 Fitted default
16
+ 0 9 -0.306 0.000 Fitted default
17
+ 0 10 -0.244 0.000 Fitted default
18
+ 0 11 -0.317 0.000 Fitted default
19
+ 0 12 -0.304 0.000 Fitted default
20
+ 0 13 -0.238 0.000 Fitted default
21
+ 0 14 -0.208 0.000 Fitted default
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+ 0 15 -0.236 0.000 Fitted default
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+ 0 16 -0.475 0.000 Fitted default
24
+ 0 17 -0.191 0.000 Fitted default
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26
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28
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29
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+ 0 25 0.012 0.000 Fitted default
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+ 0 35 -0.456 0.500 Fitted default
43
+ 0 36 -0.031 0.000 Fitted default
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46
+ 0 39 -0.104 0.000 Fitted default
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+ 0 57 -0.105 0.000 Fitted default
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+ 0 58 -0.488 0.000 Fitted default
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+ 0 59 -0.337 0.000 Fitted default
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+ 0 62 -0.125 0.250 Fitted default
70
+ 0 63 -0.180 0.000 Fitted default
71
+ 0 64 -0.181 0.000 Fitted default
72
+ 0 65 -0.475 0.000 Fitted default
73
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74
+ 0 67 -0.099 0.000 == 69
75
+ 0 68 -0.135 0.000 Fitted default
76
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79
+ 0 72 -0.580 0.500 Fitted default
80
+ 0 73 -0.200 0.000 Fitted default
81
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82
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83
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84
+ 0 77 -0.282 0.000 Fitted default
85
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86
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87
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88
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106
+ $
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+ *
2
+ * Copyright (c) Merck and Co., Inc., 1993
3
+ * All Rights Reserved
4
+ *
5
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6
+ *
7
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1
+ *
2
+ * Copyright (c) Merck and Co., Inc., 1994,1995,1996,1997,1998,1999
3
+ * All Rights Reserved
4
+ *
5
+ * MMFF94s OUT-OF-PLANE PARAMETERS
6
+ * C94 - CORE MMFF94 parameter, from fits to HF/6-31G* 2nd D's
7
+ * C94S - CORE MMFF94s parameter,adjusted to promote planarity
8
+ * #C94 - Value adjusted from CORE MMFF94 value
9
+ *
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47
+ 0 3 0 0 0.130 *-3-*-* C94 DEF
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49
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55
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69
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70
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71
+ 0 37 0 0 0.035 *-37-*-* C94 DEF
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80
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+ 0 40 0 0 0.030 *-40-*-* C94S DEF
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+ 1 41 32 32 0.178 C94
83
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+ 0 41 0 0 0.180 *-41-*-* C94 DEF
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87
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88
+ 50 49 50 50 0.000 #C94
89
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96
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97
+ 36 56 36 57 0.020 #C94
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99
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100
+ 56 57 56 56 0.158 C94
101
+ 0 57 0 0 0.080 *-57-*-* C94 DEF
102
+ 0 58 0 0 0.025 *-58-*-* E94 DEF
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106
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108
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109
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110
+ 0 63 0 0 0.050 *-63-*-* C94 DEF
111
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114
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115
+ 37 64 63 64 -0.011 C94
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119
+ 0 69 0 0 0.070 *-69-*-* C94 DEF
120
+ 0 73 0 0 0.000 *-73-*-* E94 DEF
121
+ 5 78 78 81 0.046 C94
122
+ 0 78 0 0 0.045 *-78-*-* C94 DEF
123
+ 5 80 81 81 0.057 C94
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+ 0 80 0 0 0.080 *-80-*-* C94 DEF
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+ 36 81 78 80 0.016 C94
126
+ 0 81 0 0 0.025 *-81-*-* C94 DEF
127
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128
+ $