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pyxllib/text/levenshtein.py

@@ -1,303 +1,303 @@
-#!/usr/bin/env python3
-# -*- coding: utf-8 -*-
-# @Author : 陈坤泽
-# @Email  : 877362867@qq.com
-# @Date   : 2021/06/06 17:01
-
-from pyxllib.prog.pupil import check_install_package
-
-# 这个需要C++14编译器 https://download.microsoft.com/download/5/f/7/5f7acaeb-8363-451f-9425-68a90f98b238/visualcppbuildtools_full.exe
-# 在需要的时候安装，防止只是想用pyxllib很简单的功能，但是在pip install阶段处理过于麻烦
-# MatchSimString计算编辑距离需要
-check_install_package('Levenshtein', 'python-Levenshtein')
-
-from collections import defaultdict
-from more_itertools import chunked
-import warnings
-
-import Levenshtein
-import numpy as np
-import pandas as pd
-
-from pyxllib.prog.pupil import run_once
-from pyxllib.prog.specialist import dataframe_str
-from pyxllib.text.pupil import briefstr
-
-# 忽略特定的警告
-warnings.filterwarnings("ignore", category=FutureWarning,
-                        module="sklearn.cluster._agglomerative",
-                        lineno=1005)
-
-
-@run_once('str')
-def get_levenshtein_similar(x, y):
-    """ 缓存各字符串之间的编辑距离 """
-    return Levenshtein.ratio(x, y)
-
-
-class MatchSimString:
-    """ 匹配近似字符串
-
-    mss = MatchSimString()
-
-    # 1 添加候选对象
-    mss.append_candidate('福州+厦门2018初数暑假讲义-请录入-快乐学习\初一福厦培优-测试用')
-    mss.append_candidate('2018_快乐数学_六年级_秋季_第01讲_圆柱与圆锥_教案（教师版）')
-    mss.append_candidate('删除所有标签中间多余的空白')
-
-    # 2 需要匹配的对象1
-    s = '奕本初一福周厦门培油'
-
-    idx, sim = mss.match(s)
-    print('匹配目标：', mss[idx])  # 匹配目标： 福州+厦门2018初数暑假讲义-请录入-快乐学习\初一福厦培优-测试用
-    print('相似度：', sim)         # 相似度： 0.22
-
-    # 3 需要匹配的对象2
-    s = '圆柱与【圆锥】_教案空白版'
-
-    idx, sim = mss.match(s)
-    print('匹配目标：', mss[idx])  # 2018_快乐数学_六年级_秋季_第01讲_圆柱与圆锥_教案（教师版）
-    print('相似度：', sim)         # 相似度： 0.375
-
-    如果append_candidate有传递2个扩展信息参数，可以索引获取：
-    mss.ext_value[idx]
-    """
-
-    def __init__(self, method=briefstr):
-        self.preproc = method
-        self.origin_str = []  # 原始字符串内容
-        self.key_str = []  # 对原始字符串进行处理后的字符
-        self.ext_value = []  # 扩展存储一些信息
-
-    def __getitem__(self, item):
-        return self.origin_str[item]
-
-    def __delitem__(self, item):
-        del self.origin_str[item]
-        del self.key_str[item]
-        del self.ext_value[item]
-
-    def __len__(self):
-        return len(self.key_str)
-
-    def get_similarity(self, x, y):
-        """ 计算两对数据之间的相似度 """
-        pass
-
-    def append_candidate(self, k, v=None):
-        self.origin_str.append(k)
-        if callable(self.preproc):
-            k = self.preproc(k)
-        self.key_str.append(k)
-        self.ext_value.append(v)
-
-    def match(self, s):
-        """ 跟候选字符串进行匹配，返回最佳匹配结果
-        """
-        idx, sim = -1, 0
-        for i in range(len(self)):
-            k, v = self.key_str[i], self.ext_value[i]
-            sim_ = Levenshtein.ratio(k, s)
-            if sim_ > sim:
-                sim = sim_
-                idx = i
-            i += 1
-        return idx, sim
-
-    def match_many(self, s, count=1):
-        """跟候选字符串进行匹配，返回多个最佳匹配结果
-        :param str s: 待匹配的字符串
-        :param int count: 需要返回的匹配数量
-        :return: 匹配结果列表，列表中的元素为(idx, sim)对
-        """
-        scores = [(i, Levenshtein.ratio(self.key_str[i], s)) for i in range(len(self))]
-        # 根据相似度排序并返回前count个结果
-        return sorted(scores, key=lambda x: x[1], reverse=True)[:count]
-
-    def match_test(self, s, count=-1, showstr=lambda x: x[:50]):
-        """输入一个字符串s，和候选项做近似匹配
-
-        :param s: 需要进行匹配的字符串s
-        :param count: 只输出部分匹配结果
-            -1：输出所有匹配结果
-            0 < count < 1：例如0.4，则只输出匹配度最高的40%结果
-            整数：输出匹配度最高的count个结果
-        :param showstr: 字符串显示效果
-        """
-        # 1 计算编辑距离，存储结果到res
-        res = []
-        n = len(self)
-        for i in range(n):
-            k, v = self.key_str[i], self.ext_value[i]
-            sim = Levenshtein.ratio(k, s)
-            res.append([i, v, sim, showstr(k)])  # 输出的时候从0开始编号
-            i += 1
-
-        # 2 排序、节选结果
-        res = sorted(res, key=lambda x: -x[2])
-        if 0 < count < 1:
-            n = max(1, int(n * count))
-        elif isinstance(count, int) and count > 0:
-            n = min(count, n)
-        res = res[:n]
-
-        # 3 输出
-        df = pd.DataFrame.from_records(res, columns=('序号', '标签', '编辑距离', '内容'))
-        s = dataframe_str(df)
-        s = s.replace('\u2022', '')  # texstudio无法显示会报错的字符
-        print(s)
-
-    def agglomerative_clustering(self, threshold=0.5):
-        """ 对内部字符串进行层次聚类
-
-        :param threshold: 可以理解成距离的阈值，距离小于这个阈值的字符串会被聚为一类
-            值越小，分出的类别越多越细
-        """
-        check_install_package('sklearn', 'scikit-learn')
-        from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
-
-        # 1 给每个样本标类别
-        distance_matrix = np.zeros((len(self), len(self)))
-        for i in range(len(self)):
-            for j in range(i + 1, len(self)):
-                # 我们需要距离，所以用1减去相似度
-                distance = 1 - Levenshtein.ratio(self.key_str[i], self.key_str[j])
-                distance_matrix[i, j] = distance_matrix[j, i] = distance
-
-        # 进行层次聚类
-        clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, affinity='precomputed',
-                                             distance_threshold=threshold,
-                                             linkage='complete')
-        labels = clustering.fit_predict(distance_matrix)
-
-        return labels
-
-    def display_clusters(self, threshold=0.5):
-        """ 根据agglomerative_clustering的结果，显示各个聚类的内容 """
-
-        labels = self.agglomerative_clustering(threshold=threshold)
-        cluster_dict = defaultdict(list)
-
-        # 组织数据到字典中
-        for idx, label in enumerate(labels):
-            cluster_dict[label].append(self.origin_str[idx])
-
-        # 按标签排序并显示
-        result = {}
-        for label, items in sorted(cluster_dict.items(), key=lambda x: -len(x[1])):
-            result[label] = items
-
-        return result
-
-
-class HierarchicalMatchSimString(MatchSimString):
-    """ 在面对数据量很大的候选数据情况下，建议使用这个层次聚类后的匹配方法 """
-
-    def __init__(self, method=briefstr):
-        super().__init__(method)
-        self.groups = dict()
-
-    def get_center_sample(self, indices=None):
-        """ 输入一组下标，计算中心样本，未输入参数值的时候，则在全量样本里找 """
-        if indices is None:
-            indices = range(len(self))
-
-        # 用于存储之前计算的结果
-        cached_results = {}
-
-        def get_similarity(i, j):
-            """ 获取两个索引的相似度，利用缓存来避免重复计算 """
-            if (i, j) in cached_results:
-                return cached_results[(i, j)]
-            sim_val = Levenshtein.ratio(self.key_str[i], self.key_str[j])
-            cached_results[(i, j)] = cached_results[(j, i)] = sim_val
-            return sim_val
-
-        center_idx = max(indices, key=lambda x: sum(get_similarity(x, y) for y in indices))
-        return center_idx
-
-    def merge_group(self, indices, threshold=0.5, strategy='center'):
-        """ 对输入的indexs清单，按照threshold的阈值进行合并
-        返回的是一个字典，key是代表性样本，value是同组内的数据编号
-
-        :param strategy: 代表样本的挑选策略
-            center，中心样本
-            first，第一个样本
-        """
-        check_install_package('sklearn', 'scikit-learn')
-        from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
-
-        # 1 给每个样本标类别
-        n = len(indices)
-        distance_matrix = np.zeros((n, n))
-        for i in range(n):
-            for j in range(i + 1, n):
-                # 我们需要距离，所以用1减去相似度
-                distance = 1 - Levenshtein.ratio(self.key_str[indices[i]], self.key_str[indices[j]])
-                distance_matrix[i, j] = distance_matrix[j, i] = distance
-
-        # 进行层次聚类
-        clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, affinity='precomputed',
-                                             distance_threshold=threshold,
-                                             linkage='complete')
-        labels = clustering.fit_predict(distance_matrix)
-
-        # 2 分组字典
-        cluster_dict = defaultdict(list)
-        # 组织数据到字典中
-        for i, label in enumerate(labels):
-            cluster_dict[label].append(indices[i])
-
-        # 3 改成代表样本映射到一组里，并且按照样本数从多到少排序
-        result = {}
-        for label, items in sorted(cluster_dict.items(), key=lambda x: -len(x[1])):
-            if strategy == 'first':
-                representative = items[0]
-            elif strategy == 'center':
-                # 使用局部索引计算平均距离
-                local_indices = [i for i, idx in enumerate(indices) if idx in items]
-                sub_matrix = distance_matrix[np.ix_(local_indices, local_indices)]
-                avg_distances = sub_matrix.mean(axis=1)
-                representative_idx = np.argmin(avg_distances)
-                representative = items[representative_idx]
-            else:
-                raise ValueError(f'Invalid strategy: {strategy}')
-            result[representative] = items
-
-        return result
-
-    def init_groups(self, threshold=0.5, batch_size=1000):
-        """
-        :param threshold: 按照阈值进行分组，在这个距离内的都会归到一组
-        :param batch_size: 因为数据可能太大，不可能一次性全量两两比较，这里可以分batch处理
-            这样虽然结果不太精确，但能大大减小运算量
-        """
-        # 1 最开始每个样本都是一个组
-        groups = {i: [i] for i in range(len(self))}
-        new_groups = {}
-
-        # 2 不断合并，直到没有组数变化
-        while len(groups) > 1:
-            for indices in chunked(groups.keys(), batch_size):
-                # 对于这里返回的字典，原groups里的values也要对应拼接的
-                indices2 = self.merge_group(indices, threshold=threshold)
-                for idx, idxs in indices2.items():
-                    # 获取原始分组中的索引
-                    original_idxs = [groups[original_idx] for original_idx in idxs]
-                    # 展平列表并分配到新分组中
-                    new_groups[idx] = [item for sublist in original_idxs for item in sublist]
-
-            # 如果分组没有发生变化，退出循环
-            if len(new_groups) == len(groups):
-                break
-
-            groups = new_groups
-            new_groups = {}
-
-        # 3 按数量从多到少排序
-        new_groups = {}
-        for label, items in sorted(groups.items(), key=lambda x: -len(x[1])):
-            new_groups[label] = items  # 暂用第一个出现的作为代表
-
-        self.groups = new_groups
-        return self.groups
+#!/usr/bin/env python3
+# -*- coding: utf-8 -*-
+# @Author : 陈坤泽
+# @Email  : 877362867@qq.com
+# @Date   : 2021/06/06 17:01
+
+# from pyxllib.prog.pupil import check_install_package
+
+# 这个需要C++14编译器 https://download.microsoft.com/download/5/f/7/5f7acaeb-8363-451f-9425-68a90f98b238/visualcppbuildtools_full.exe
+# 在需要的时候安装，防止只是想用pyxllib很简单的功能，但是在pip install阶段处理过于麻烦
+# MatchSimString计算编辑距离需要
+# check_install_package('Levenshtein', 'python-Levenshtein')
+
+from collections import defaultdict
+from more_itertools import chunked
+import warnings
+
+import Levenshtein
+import numpy as np
+import pandas as pd
+
+from pyxllib.prog.pupil import run_once
+from pyxllib.prog.specialist import dataframe_str
+from pyxllib.text.pupil import briefstr
+
+# 忽略特定的警告
+warnings.filterwarnings("ignore", category=FutureWarning,
+                        module="sklearn.cluster._agglomerative",
+                        lineno=1005)
+
+
+@run_once('str')
+def get_levenshtein_similar(x, y):
+    """ 缓存各字符串之间的编辑距离 """
+    return Levenshtein.ratio(x, y)
+
+
+class MatchSimString:
+    """ 匹配近似字符串
+
+    mss = MatchSimString()
+
+    # 1 添加候选对象
+    mss.append_candidate('福州+厦门2018初数暑假讲义-请录入-快乐学习\初一福厦培优-测试用')
+    mss.append_candidate('2018_快乐数学_六年级_秋季_第01讲_圆柱与圆锥_教案（教师版）')
+    mss.append_candidate('删除所有标签中间多余的空白')
+
+    # 2 需要匹配的对象1
+    s = '奕本初一福周厦门培油'
+
+    idx, sim = mss.match(s)
+    print('匹配目标：', mss[idx])  # 匹配目标： 福州+厦门2018初数暑假讲义-请录入-快乐学习\初一福厦培优-测试用
+    print('相似度：', sim)         # 相似度： 0.22
+
+    # 3 需要匹配的对象2
+    s = '圆柱与【圆锥】_教案空白版'
+
+    idx, sim = mss.match(s)
+    print('匹配目标：', mss[idx])  # 2018_快乐数学_六年级_秋季_第01讲_圆柱与圆锥_教案（教师版）
+    print('相似度：', sim)         # 相似度： 0.375
+
+    如果append_candidate有传递2个扩展信息参数，可以索引获取：
+    mss.ext_value[idx]
+    """
+
+    def __init__(self, method=briefstr):
+        self.preproc = method
+        self.origin_str = []  # 原始字符串内容
+        self.key_str = []  # 对原始字符串进行处理后的字符
+        self.ext_value = []  # 扩展存储一些信息
+
+    def __getitem__(self, item):
+        return self.origin_str[item]
+
+    def __delitem__(self, item):
+        del self.origin_str[item]
+        del self.key_str[item]
+        del self.ext_value[item]
+
+    def __len__(self):
+        return len(self.key_str)
+
+    def get_similarity(self, x, y):
+        """ 计算两对数据之间的相似度 """
+        pass
+
+    def append_candidate(self, k, v=None):
+        self.origin_str.append(k)
+        if callable(self.preproc):
+            k = self.preproc(k)
+        self.key_str.append(k)
+        self.ext_value.append(v)
+
+    def match(self, s):
+        """ 跟候选字符串进行匹配，返回最佳匹配结果
+        """
+        idx, sim = -1, 0
+        for i in range(len(self)):
+            k, v = self.key_str[i], self.ext_value[i]
+            sim_ = Levenshtein.ratio(k, s)
+            if sim_ > sim:
+                sim = sim_
+                idx = i
+            i += 1
+        return idx, sim
+
+    def match_many(self, s, count=1):
+        """跟候选字符串进行匹配，返回多个最佳匹配结果
+        :param str s: 待匹配的字符串
+        :param int count: 需要返回的匹配数量
+        :return: 匹配结果列表，列表中的元素为(idx, sim)对
+        """
+        scores = [(i, Levenshtein.ratio(self.key_str[i], s)) for i in range(len(self))]
+        # 根据相似度排序并返回前count个结果
+        return sorted(scores, key=lambda x: x[1], reverse=True)[:count]
+
+    def match_test(self, s, count=-1, showstr=lambda x: x[:50]):
+        """输入一个字符串s，和候选项做近似匹配
+
+        :param s: 需要进行匹配的字符串s
+        :param count: 只输出部分匹配结果
+            -1：输出所有匹配结果
+            0 < count < 1：例如0.4，则只输出匹配度最高的40%结果
+            整数：输出匹配度最高的count个结果
+        :param showstr: 字符串显示效果
+        """
+        # 1 计算编辑距离，存储结果到res
+        res = []
+        n = len(self)
+        for i in range(n):
+            k, v = self.key_str[i], self.ext_value[i]
+            sim = Levenshtein.ratio(k, s)
+            res.append([i, v, sim, showstr(k)])  # 输出的时候从0开始编号
+            i += 1
+
+        # 2 排序、节选结果
+        res = sorted(res, key=lambda x: -x[2])
+        if 0 < count < 1:
+            n = max(1, int(n * count))
+        elif isinstance(count, int) and count > 0:
+            n = min(count, n)
+        res = res[:n]
+
+        # 3 输出
+        df = pd.DataFrame.from_records(res, columns=('序号', '标签', '编辑距离', '内容'))
+        s = dataframe_str(df)
+        s = s.replace('\u2022', '')  # texstudio无法显示会报错的字符
+        print(s)
+
+    def agglomerative_clustering(self, threshold=0.5):
+        """ 对内部字符串进行层次聚类
+
+        :param threshold: 可以理解成距离的阈值，距离小于这个阈值的字符串会被聚为一类
+            值越小，分出的类别越多越细
+        """
+        check_install_package('sklearn', 'scikit-learn')
+        from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
+
+        # 1 给每个样本标类别
+        distance_matrix = np.zeros((len(self), len(self)))
+        for i in range(len(self)):
+            for j in range(i + 1, len(self)):
+                # 我们需要距离，所以用1减去相似度
+                distance = 1 - Levenshtein.ratio(self.key_str[i], self.key_str[j])
+                distance_matrix[i, j] = distance_matrix[j, i] = distance
+
+        # 进行层次聚类
+        clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, affinity='precomputed',
+                                             distance_threshold=threshold,
+                                             linkage='complete')
+        labels = clustering.fit_predict(distance_matrix)
+
+        return labels
+
+    def display_clusters(self, threshold=0.5):
+        """ 根据agglomerative_clustering的结果，显示各个聚类的内容 """
+
+        labels = self.agglomerative_clustering(threshold=threshold)
+        cluster_dict = defaultdict(list)
+
+        # 组织数据到字典中
+        for idx, label in enumerate(labels):
+            cluster_dict[label].append(self.origin_str[idx])
+
+        # 按标签排序并显示
+        result = {}
+        for label, items in sorted(cluster_dict.items(), key=lambda x: -len(x[1])):
+            result[label] = items
+
+        return result
+
+
+class HierarchicalMatchSimString(MatchSimString):
+    """ 在面对数据量很大的候选数据情况下，建议使用这个层次聚类后的匹配方法 """
+
+    def __init__(self, method=briefstr):
+        super().__init__(method)
+        self.groups = dict()
+
+    def get_center_sample(self, indices=None):
+        """ 输入一组下标，计算中心样本，未输入参数值的时候，则在全量样本里找 """
+        if indices is None:
+            indices = range(len(self))
+
+        # 用于存储之前计算的结果
+        cached_results = {}
+
+        def get_similarity(i, j):
+            """ 获取两个索引的相似度，利用缓存来避免重复计算 """
+            if (i, j) in cached_results:
+                return cached_results[(i, j)]
+            sim_val = Levenshtein.ratio(self.key_str[i], self.key_str[j])
+            cached_results[(i, j)] = cached_results[(j, i)] = sim_val
+            return sim_val
+
+        center_idx = max(indices, key=lambda x: sum(get_similarity(x, y) for y in indices))
+        return center_idx
+
+    def merge_group(self, indices, threshold=0.5, strategy='center'):
+        """ 对输入的indexs清单，按照threshold的阈值进行合并
+        返回的是一个字典，key是代表性样本，value是同组内的数据编号
+
+        :param strategy: 代表样本的挑选策略
+            center，中心样本
+            first，第一个样本
+        """
+        check_install_package('sklearn', 'scikit-learn')
+        from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
+
+        # 1 给每个样本标类别
+        n = len(indices)
+        distance_matrix = np.zeros((n, n))
+        for i in range(n):
+            for j in range(i + 1, n):
+                # 我们需要距离，所以用1减去相似度
+                distance = 1 - Levenshtein.ratio(self.key_str[indices[i]], self.key_str[indices[j]])
+                distance_matrix[i, j] = distance_matrix[j, i] = distance
+
+        # 进行层次聚类
+        clustering = AgglomerativeClustering(n_clusters=None, affinity='precomputed',
+                                             distance_threshold=threshold,
+                                             linkage='complete')
+        labels = clustering.fit_predict(distance_matrix)
+
+        # 2 分组字典
+        cluster_dict = defaultdict(list)
+        # 组织数据到字典中
+        for i, label in enumerate(labels):
+            cluster_dict[label].append(indices[i])
+
+        # 3 改成代表样本映射到一组里，并且按照样本数从多到少排序
+        result = {}
+        for label, items in sorted(cluster_dict.items(), key=lambda x: -len(x[1])):
+            if strategy == 'first':
+                representative = items[0]
+            elif strategy == 'center':
+                # 使用局部索引计算平均距离
+                local_indices = [i for i, idx in enumerate(indices) if idx in items]
+                sub_matrix = distance_matrix[np.ix_(local_indices, local_indices)]
+                avg_distances = sub_matrix.mean(axis=1)
+                representative_idx = np.argmin(avg_distances)
+                representative = items[representative_idx]
+            else:
+                raise ValueError(f'Invalid strategy: {strategy}')
+            result[representative] = items
+
+        return result
+
+    def init_groups(self, threshold=0.5, batch_size=1000):
+        """
+        :param threshold: 按照阈值进行分组，在这个距离内的都会归到一组
+        :param batch_size: 因为数据可能太大，不可能一次性全量两两比较，这里可以分batch处理
+            这样虽然结果不太精确，但能大大减小运算量
+        """
+        # 1 最开始每个样本都是一个组
+        groups = {i: [i] for i in range(len(self))}
+        new_groups = {}
+
+        # 2 不断合并，直到没有组数变化
+        while len(groups) > 1:
+            for indices in chunked(groups.keys(), batch_size):
+                # 对于这里返回的字典，原groups里的values也要对应拼接的
+                indices2 = self.merge_group(indices, threshold=threshold)
+                for idx, idxs in indices2.items():
+                    # 获取原始分组中的索引
+                    original_idxs = [groups[original_idx] for original_idx in idxs]
+                    # 展平列表并分配到新分组中
+                    new_groups[idx] = [item for sublist in original_idxs for item in sublist]
+
+            # 如果分组没有发生变化，退出循环
+            if len(new_groups) == len(groups):
+                break
+
+            groups = new_groups
+            new_groups = {}
+
+        # 3 按数量从多到少排序
+        new_groups = {}
+        for label, items in sorted(groups.items(), key=lambda x: -len(x[1])):
+            new_groups[label] = items  # 暂用第一个出现的作为代表
+
+        self.groups = new_groups
+        return self.groups