genoverse 3.2.0

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  1. package/.eslintrc.js +197 -0
  2. package/.github/workflows/test.yml +24 -0
  3. package/LICENSE.TXT +24 -0
  4. package/README.md +11 -0
  5. package/css/controlPanel.css +200 -0
  6. package/css/fileDrop.css +22 -0
  7. package/css/font-awesome.css +3 -0
  8. package/css/fullscreen.css +19 -0
  9. package/css/genoverse.css +466 -0
  10. package/css/karyotype.css +85 -0
  11. package/css/resizer.css +36 -0
  12. package/css/tooltips.css +26 -0
  13. package/css/trackControls.css +111 -0
  14. package/expanded.html +120 -0
  15. package/fontawesome/css/fontawesome.min.css +5 -0
  16. package/fontawesome/css/regular.min.css +5 -0
  17. package/fontawesome/css/solid.min.css +5 -0
  18. package/fontawesome/webfonts/fa-brands-400.ttf +0 -0
  19. package/fontawesome/webfonts/fa-brands-400.woff +0 -0
  20. package/fontawesome/webfonts/fa-brands-400.woff2 +0 -0
  21. package/fontawesome/webfonts/fa-regular-400.ttf +0 -0
  22. package/fontawesome/webfonts/fa-regular-400.woff +0 -0
  23. package/fontawesome/webfonts/fa-regular-400.woff2 +0 -0
  24. package/fontawesome/webfonts/fa-solid-900.ttf +0 -0
  25. package/fontawesome/webfonts/fa-solid-900.woff +0 -0
  26. package/fontawesome/webfonts/fa-solid-900.woff2 +0 -0
  27. package/help.pdf +0 -0
  28. package/i/sort_handle.png +0 -0
  29. package/index.html +68 -0
  30. package/index.js +83 -0
  31. package/jest.config.js +4 -0
  32. package/js/Genoverse.js +1681 -0
  33. package/js/Track/Controller/Sequence.js +17 -0
  34. package/js/Track/Controller/Stranded.js +73 -0
  35. package/js/Track/Controller.js +620 -0
  36. package/js/Track/Model/File/BAM.js +44 -0
  37. package/js/Track/Model/File/BED.js +116 -0
  38. package/js/Track/Model/File/GFF.js +40 -0
  39. package/js/Track/Model/File/VCF.js +101 -0
  40. package/js/Track/Model/File/WIG.js +67 -0
  41. package/js/Track/Model/File.js +36 -0
  42. package/js/Track/Model/Gene/Ensembl.js +22 -0
  43. package/js/Track/Model/Gene.js +5 -0
  44. package/js/Track/Model/Sequence/Ensembl.js +4 -0
  45. package/js/Track/Model/Sequence/Fasta.js +60 -0
  46. package/js/Track/Model/Sequence.js +50 -0
  47. package/js/Track/Model/SequenceVariation.js +41 -0
  48. package/js/Track/Model/Stranded.js +28 -0
  49. package/js/Track/Model/Transcript/Ensembl.js +67 -0
  50. package/js/Track/Model/Transcript.js +5 -0
  51. package/js/Track/Model.js +303 -0
  52. package/js/Track/View/Gene/Ensembl.js +46 -0
  53. package/js/Track/View/Gene.js +6 -0
  54. package/js/Track/View/Sequence/Variation.js +115 -0
  55. package/js/Track/View/Sequence.js +63 -0
  56. package/js/Track/View/Transcript/Ensembl.js +12 -0
  57. package/js/Track/View/Transcript.js +28 -0
  58. package/js/Track/View.js +566 -0
  59. package/js/Track/library/Chromosome.js +145 -0
  60. package/js/Track/library/File/BAM.js +30 -0
  61. package/js/Track/library/File/BED.js +24 -0
  62. package/js/Track/library/File/BIGBED.js +47 -0
  63. package/js/Track/library/File/BIGWIG.js +52 -0
  64. package/js/Track/library/File/GFF.js +9 -0
  65. package/js/Track/library/File/VCF.js +71 -0
  66. package/js/Track/library/File/WIG.js +5 -0
  67. package/js/Track/library/File.js +10 -0
  68. package/js/Track/library/Gene.js +37 -0
  69. package/js/Track/library/Graph/Bar.js +235 -0
  70. package/js/Track/library/Graph/Line.js +296 -0
  71. package/js/Track/library/Graph.js +355 -0
  72. package/js/Track/library/HighlightRegion.js +292 -0
  73. package/js/Track/library/Legend.js +224 -0
  74. package/js/Track/library/Scalebar.js +227 -0
  75. package/js/Track/library/Scaleline.js +91 -0
  76. package/js/Track/library/Static.js +78 -0
  77. package/js/Track/library/dbSNP.js +142 -0
  78. package/js/Track.js +632 -0
  79. package/js/genomes/grch37.js +990 -0
  80. package/js/genomes/grch38.js +990 -0
  81. package/js/genoverse.min.js +2 -0
  82. package/js/genoverse.min.js.map +1 -0
  83. package/js/lib/BWReader.js +578 -0
  84. package/js/lib/Base.js +145 -0
  85. package/js/lib/VCFReader.js +286 -0
  86. package/js/lib/dalliance/js/bam.js +494 -0
  87. package/js/lib/dalliance/js/bin.js +185 -0
  88. package/js/lib/dalliance/js/das.js +749 -0
  89. package/js/lib/dalliance/js/utils.js +370 -0
  90. package/js/lib/dalliance-lib.js +3594 -0
  91. package/js/lib/dalliance-lib.min.js +68 -0
  92. package/js/lib/jDataView.js +2 -0
  93. package/js/lib/jParser.js +192 -0
  94. package/js/lib/jquery-ui.js +8 -0
  95. package/js/lib/jquery.js +2 -0
  96. package/js/lib/jquery.mousehold.js +53 -0
  97. package/js/lib/jquery.mousewheel.js +84 -0
  98. package/js/lib/jquery.tipsy.js +258 -0
  99. package/js/lib/rtree.js +1 -0
  100. package/js/plugins/controlPanel.js +395 -0
  101. package/js/plugins/fileDrop.js +62 -0
  102. package/js/plugins/focusRegion.js +12 -0
  103. package/js/plugins/fullscreen.js +77 -0
  104. package/js/plugins/karyotype.js +210 -0
  105. package/js/plugins/resizer.js +45 -0
  106. package/js/plugins/tooltips.js +94 -0
  107. package/js/plugins/trackControls.js +143 -0
  108. package/package.json +43 -0
  109. package/test/View/__snapshots__/render-bar-graph.test.js.snap +111 -0
  110. package/test/View/__snapshots__/render-blocks.test.js.snap +105 -0
  111. package/test/View/__snapshots__/render-chromosome.test.js.snap +5 -0
  112. package/test/View/__snapshots__/render-highlights.test.js.snap +73 -0
  113. package/test/View/__snapshots__/render-insert-variants.test.js.snap +9 -0
  114. package/test/View/__snapshots__/render-labels.test.js.snap +241 -0
  115. package/test/View/__snapshots__/render-legends.test.js.snap +13 -0
  116. package/test/View/__snapshots__/render-line-graph.test.js.snap +349 -0
  117. package/test/View/__snapshots__/render-scalebar.test.js.snap +49 -0
  118. package/test/View/__snapshots__/render-scaleline.test.js.snap +31 -0
  119. package/test/View/__snapshots__/render-sequence.test.js.snap +23 -0
  120. package/test/View/__snapshots__/render-stranded.test.js.snap +5 -0
  121. package/test/View/__snapshots__/render-transcripts.test.js.snap +193 -0
  122. package/test/View/render-bar-graph.test.js +87 -0
  123. package/test/View/render-blocks.test.js +171 -0
  124. package/test/View/render-chromosome.test.js +40 -0
  125. package/test/View/render-highlights.test.js +67 -0
  126. package/test/View/render-insert-variants.test.js +11 -0
  127. package/test/View/render-labels.test.js +266 -0
  128. package/test/View/render-legends.test.js +31 -0
  129. package/test/View/render-line-graph.test.js +169 -0
  130. package/test/View/render-scalebar.test.js +36 -0
  131. package/test/View/render-scaleline.test.js +28 -0
  132. package/test/View/render-sequence.test.js +49 -0
  133. package/test/View/render-stranded.test.js +10 -0
  134. package/test/View/render-transcripts.test.js +165 -0
  135. package/test/create-and-destroy.test.js +63 -0
  136. package/test/track-ordering.test.js +514 -0
  137. package/test/track_config/__snapshots__/config-settings.test.js.snap +23 -0
  138. package/test/track_config/config-settings.test.js +321 -0
  139. package/test/track_config/zoom-level-settings.test.js +98 -0
  140. package/test/utils.js +80 -0
  141. package/utils/createGenome.js +52 -0
  142. package/utils/devServer.js +36 -0
  143. package/utils/expandedTemplate.html +46 -0
  144. package/utils/git-hooks/post-commit +9 -0
  145. package/utils/git-hooks/pre-commit +7 -0
  146. package/utils/git-hooks/setup +6 -0
  147. package/utils/makeExpanded.js +19 -0
  148. package/webpack.config.js +39 -0
package/js/genomes/grch37.js ADDED
@@ -0,0 +1,990 @@
1
+ Genoverse.Genomes.grch37 = {
2
+ '1': {
3
+ 'size' : 249250621,
4
+ 'bands' : [
5
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 121500001, 'end': 125000000, 'type': 'acen' },
6
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 120600001, 'end': 121500000, 'type': 'gneg' },
7
+ { 'id': 'p12', 'start': 117800001, 'end': 120600000, 'type': 'gpos50' },
8
+ { 'id': 'p13.1', 'start': 116100001, 'end': 117800000, 'type': 'gneg' },
9
+ { 'id': 'p13.2', 'start': 111800001, 'end': 116100000, 'type': 'gpos50' },
10
+ { 'id': 'p13.3', 'start': 107200001, 'end': 111800000, 'type': 'gneg' },
11
+ { 'id': 'p21.1', 'start': 102200001, 'end': 107200000, 'type': 'gpos100' },
12
+ { 'id': 'p21.2', 'start': 99700001, 'end': 102200000, 'type': 'gneg' },
13
+ { 'id': 'p21.3', 'start': 94700001, 'end': 99700000, 'type': 'gpos75' },
14
+ { 'id': 'p22.1', 'start': 92000001, 'end': 94700000, 'type': 'gneg' },
15
+ { 'id': 'p22.2', 'start': 88400001, 'end': 92000000, 'type': 'gpos75' },
16
+ { 'id': 'p22.3', 'start': 84900001, 'end': 88400000, 'type': 'gneg' },
17
+ { 'id': 'p31.1', 'start': 69700001, 'end': 84900000, 'type': 'gpos100' },
18
+ { 'id': 'p31.2', 'start': 68900001, 'end': 69700000, 'type': 'gneg' },
19
+ { 'id': 'p31.3', 'start': 61300001, 'end': 68900000, 'type': 'gpos50' },
20
+ { 'id': 'p32.1', 'start': 59000001, 'end': 61300000, 'type': 'gneg' },
21
+ { 'id': 'p32.2', 'start': 56100001, 'end': 59000000, 'type': 'gpos50' },
22
+ { 'id': 'p32.3', 'start': 50700001, 'end': 56100000, 'type': 'gneg' },
23
+ { 'id': 'p33', 'start': 46800001, 'end': 50700000, 'type': 'gpos75' },
24
+ { 'id': 'p34.1', 'start': 44100001, 'end': 46800000, 'type': 'gneg' },
25
+ { 'id': 'p34.2', 'start': 40100001, 'end': 44100000, 'type': 'gpos25' },
26
+ { 'id': 'p34.3', 'start': 34600001, 'end': 40100000, 'type': 'gneg' },
27
+ { 'id': 'p35.1', 'start': 32400001, 'end': 34600000, 'type': 'gpos25' },
28
+ { 'id': 'p35.2', 'start': 30200001, 'end': 32400000, 'type': 'gneg' },
29
+ { 'id': 'p35.3', 'start': 28000001, 'end': 30200000, 'type': 'gpos25' },
30
+ { 'id': 'p36.11', 'start': 23900001, 'end': 28000000, 'type': 'gneg' },
31
+ { 'id': 'p36.12', 'start': 20400001, 'end': 23900000, 'type': 'gpos25' },
32
+ { 'id': 'p36.13', 'start': 16200001, 'end': 20400000, 'type': 'gneg' },
33
+ { 'id': 'p36.21', 'start': 12700001, 'end': 16200000, 'type': 'gpos50' },
34
+ { 'id': 'p36.22', 'start': 9200001, 'end': 12700000, 'type': 'gneg' },
35
+ { 'id': 'p36.23', 'start': 7200001, 'end': 9200000, 'type': 'gpos25' },
36
+ { 'id': 'p36.31', 'start': 5400001, 'end': 7200000, 'type': 'gneg' },
37
+ { 'id': 'p36.32', 'start': 2300001, 'end': 5400000, 'type': 'gpos25' },
38
+ { 'id': 'p36.33', 'start': 1, 'end': 2300000, 'type': 'gneg' },
39
+ { 'id': 'q11', 'start': 125000001, 'end': 128900000, 'type': 'acen' },
40
+ { 'id': 'q12', 'start': 128900001, 'end': 142600000, 'type': 'gvar' },
41
+ { 'id': 'q21.1', 'start': 142600001, 'end': 147000000, 'type': 'gneg' },
42
+ { 'id': 'q21.2', 'start': 147000001, 'end': 150300000, 'type': 'gpos50' },
43
+ { 'id': 'q21.3', 'start': 150300001, 'end': 155000000, 'type': 'gneg' },
44
+ { 'id': 'q22', 'start': 155000001, 'end': 156500000, 'type': 'gpos50' },
45
+ { 'id': 'q23.1', 'start': 156500001, 'end': 159100000, 'type': 'gneg' },
46
+ { 'id': 'q23.2', 'start': 159100001, 'end': 160500000, 'type': 'gpos50' },
47
+ { 'id': 'q23.3', 'start': 160500001, 'end': 165500000, 'type': 'gneg' },
48
+ { 'id': 'q24.1', 'start': 165500001, 'end': 167200000, 'type': 'gpos50' },
49
+ { 'id': 'q24.2', 'start': 167200001, 'end': 170900000, 'type': 'gneg' },
50
+ { 'id': 'q24.3', 'start': 170900001, 'end': 172900000, 'type': 'gpos75' },
51
+ { 'id': 'q25.1', 'start': 172900001, 'end': 176000000, 'type': 'gneg' },
52
+ { 'id': 'q25.2', 'start': 176000001, 'end': 180300000, 'type': 'gpos50' },
53
+ { 'id': 'q25.3', 'start': 180300001, 'end': 185800000, 'type': 'gneg' },
54
+ { 'id': 'q31.1', 'start': 185800001, 'end': 190800000, 'type': 'gpos100' },
55
+ { 'id': 'q31.2', 'start': 190800001, 'end': 193800000, 'type': 'gneg' },
56
+ { 'id': 'q31.3', 'start': 193800001, 'end': 198700000, 'type': 'gpos100' },
57
+ { 'id': 'q32.1', 'start': 198700001, 'end': 207200000, 'type': 'gneg' },
58
+ { 'id': 'q32.2', 'start': 207200001, 'end': 211500000, 'type': 'gpos25' },
59
+ { 'id': 'q32.3', 'start': 211500001, 'end': 214500000, 'type': 'gneg' },
60
+ { 'id': 'q41', 'start': 214500001, 'end': 224100000, 'type': 'gpos100' },
61
+ { 'id': 'q42.11', 'start': 224100001, 'end': 224600000, 'type': 'gneg' },
62
+ { 'id': 'q42.12', 'start': 224600001, 'end': 227000000, 'type': 'gpos25' },
63
+ { 'id': 'q42.13', 'start': 227000001, 'end': 230700000, 'type': 'gneg' },
64
+ { 'id': 'q42.2', 'start': 230700001, 'end': 234700000, 'type': 'gpos50' },
65
+ { 'id': 'q42.3', 'start': 234700001, 'end': 236600000, 'type': 'gneg' },
66
+ { 'id': 'q43', 'start': 236600001, 'end': 243700000, 'type': 'gpos75' },
67
+ { 'id': 'q44', 'start': 243700001, 'end': 249250621, 'type': 'gneg' }
68
+ ]
69
+ },
70
+ '2': {
71
+ 'size' : 243199373,
72
+ 'bands' : [
73
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 90500001, 'end': 93300000, 'type': 'acen' },
74
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 83300001, 'end': 90500000, 'type': 'gneg' },
75
+ { 'id': 'p12', 'start': 75000001, 'end': 83300000, 'type': 'gpos100' },
76
+ { 'id': 'p13.1', 'start': 73500001, 'end': 75000000, 'type': 'gneg' },
77
+ { 'id': 'p13.2', 'start': 71500001, 'end': 73500000, 'type': 'gpos50' },
78
+ { 'id': 'p13.3', 'start': 68600001, 'end': 71500000, 'type': 'gneg' },
79
+ { 'id': 'p14', 'start': 64100001, 'end': 68600000, 'type': 'gpos50' },
80
+ { 'id': 'p15', 'start': 61300001, 'end': 64100000, 'type': 'gneg' },
81
+ { 'id': 'p16.1', 'start': 55000001, 'end': 61300000, 'type': 'gpos100' },
82
+ { 'id': 'p16.2', 'start': 52900001, 'end': 55000000, 'type': 'gneg' },
83
+ { 'id': 'p16.3', 'start': 47800001, 'end': 52900000, 'type': 'gpos100' },
84
+ { 'id': 'p21', 'start': 41800001, 'end': 47800000, 'type': 'gneg' },
85
+ { 'id': 'p22.1', 'start': 38600001, 'end': 41800000, 'type': 'gpos50' },
86
+ { 'id': 'p22.2', 'start': 36600001, 'end': 38600000, 'type': 'gneg' },
87
+ { 'id': 'p22.3', 'start': 32100001, 'end': 36600000, 'type': 'gpos75' },
88
+ { 'id': 'p23.1', 'start': 30000001, 'end': 32100000, 'type': 'gneg' },
89
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90
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91
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92
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93
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94
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100
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101
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120
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121
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122
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+ { 'id': 'q34', 'start': 209000001, 'end': 215300000, 'type': 'gpos100' },
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+ { 'id': 'q35', 'start': 215300001, 'end': 221500000, 'type': 'gneg' },
129
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136
+ },
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+ '3': {
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+ 'size' : 198022430,
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+ { 'id': 'q29', 'start': 192300001, 'end': 198022430, 'type': 'gneg' }
202
+ ]
203
+ },
204
+ '4': {
205
+ 'size' : 191154276,
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210
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240
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242
+ { 'id': 'q31.22', 'start': 146800001, 'end': 148500000, 'type': 'gneg' },
243
+ { 'id': 'q31.23', 'start': 148500001, 'end': 151100000, 'type': 'gpos25' },
244
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245
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246
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248
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249
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250
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252
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254
+ ]
255
+ },
256
+ '5': {
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+ 'size' : 180915260,
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259
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260
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300
+ { 'id': 'q34', 'start': 159900001, 'end': 168500000, 'type': 'gpos100' },
301
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304
+ ]
305
+ },
306
+ '6': {
307
+ 'size' : 171115067,
308
+ 'bands' : [
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321
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341
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342
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343
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344
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345
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349
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351
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352
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356
+ { 'id': 'q27', 'start': 164500001, 'end': 171115067, 'type': 'gneg' }
357
+ ]
358
+ },
359
+ '7': {
360
+ 'size' : 159138663,
361
+ 'bands' : [
362
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363
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364
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366
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+ { 'id': 'p13', 'start': 43300001, 'end': 45400000, 'type': 'gneg' },
368
+ { 'id': 'p14.1', 'start': 37200001, 'end': 43300000, 'type': 'gpos75' },
369
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370
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371
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372
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375
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392
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394
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395
+ { 'id': 'q31.32', 'start': 121100001, 'end': 123800000, 'type': 'gneg' },
396
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397
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398
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399
+ { 'id': 'q32.3', 'start': 130400001, 'end': 132600000, 'type': 'gneg' },
400
+ { 'id': 'q33', 'start': 132600001, 'end': 138200000, 'type': 'gpos50' },
401
+ { 'id': 'q34', 'start': 138200001, 'end': 143100000, 'type': 'gneg' },
402
+ { 'id': 'q35', 'start': 143100001, 'end': 147900000, 'type': 'gpos75' },
403
+ { 'id': 'q36.1', 'start': 147900001, 'end': 152600000, 'type': 'gneg' },
404
+ { 'id': 'q36.2', 'start': 152600001, 'end': 155100000, 'type': 'gpos25' },
405
+ { 'id': 'q36.3', 'start': 155100001, 'end': 159138663, 'type': 'gneg' }
406
+ ]
407
+ },
408
+ '8': {
409
+ 'size' : 146364022,
410
+ 'bands' : [
411
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 43100001, 'end': 45600000, 'type': 'acen' },
412
+ { 'id': 'p11.21', 'start': 39700001, 'end': 43100000, 'type': 'gneg' },
413
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416
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417
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420
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424
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451
+ ]
452
+ },
453
+ '9': {
454
+ 'size' : 141213431,
455
+ 'bands' : [
456
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 47300001, 'end': 49000000, 'type': 'acen' },
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484
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493
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495
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496
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497
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498
+ { 'id': 'q34.3', 'start': 137400001, 'end': 141213431, 'type': 'gneg' }
499
+ ]
500
+ },
501
+ '10': {
502
+ 'size' : 135534747,
503
+ 'bands' : [
504
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 38000001, 'end': 40200000, 'type': 'acen' },
505
+ { 'id': 'p11.21', 'start': 34400001, 'end': 38000000, 'type': 'gneg' },
506
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507
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508
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509
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510
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511
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512
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516
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517
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519
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520
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521
+ { 'id': 'q11.23', 'start': 49900001, 'end': 52900000, 'type': 'gneg' },
522
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524
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525
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545
+ { 'id': 'q26.3', 'start': 130600001, 'end': 135534747, 'type': 'gneg' }
546
+ ]
547
+ },
548
+ '11': {
549
+ 'size' : 135006516,
550
+ 'bands' : [
551
+ { 'id': 'p11.11', 'start': 51600001, 'end': 53700000, 'type': 'acen' },
552
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553
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554
+ { 'id': 'p12', 'start': 36400001, 'end': 43500000, 'type': 'gpos100' },
555
+ { 'id': 'p13', 'start': 31000001, 'end': 36400000, 'type': 'gneg' },
556
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557
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559
+ { 'id': 'p15.1', 'start': 16200001, 'end': 21700000, 'type': 'gneg' },
560
+ { 'id': 'p15.2', 'start': 12700001, 'end': 16200000, 'type': 'gpos50' },
561
+ { 'id': 'p15.3', 'start': 10700001, 'end': 12700000, 'type': 'gneg' },
562
+ { 'id': 'p15.4', 'start': 2800001, 'end': 10700000, 'type': 'gpos50' },
563
+ { 'id': 'p15.5', 'start': 1, 'end': 2800000, 'type': 'gneg' },
564
+ { 'id': 'q11', 'start': 53700001, 'end': 55700000, 'type': 'acen' },
565
+ { 'id': 'q12.1', 'start': 55700001, 'end': 59900000, 'type': 'gpos75' },
566
+ { 'id': 'q12.2', 'start': 59900001, 'end': 61700000, 'type': 'gneg' },
567
+ { 'id': 'q12.3', 'start': 61700001, 'end': 63400000, 'type': 'gpos25' },
568
+ { 'id': 'q13.1', 'start': 63400001, 'end': 65900000, 'type': 'gneg' },
569
+ { 'id': 'q13.2', 'start': 65900001, 'end': 68400000, 'type': 'gpos25' },
570
+ { 'id': 'q13.3', 'start': 68400001, 'end': 70400000, 'type': 'gneg' },
571
+ { 'id': 'q13.4', 'start': 70400001, 'end': 75200000, 'type': 'gpos50' },
572
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573
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574
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575
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576
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577
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578
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579
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580
+ { 'id': 'q23.1', 'start': 110400001, 'end': 112500000, 'type': 'gneg' },
581
+ { 'id': 'q23.2', 'start': 112500001, 'end': 114500000, 'type': 'gpos50' },
582
+ { 'id': 'q23.3', 'start': 114500001, 'end': 121200000, 'type': 'gneg' },
583
+ { 'id': 'q24.1', 'start': 121200001, 'end': 123900000, 'type': 'gpos50' },
584
+ { 'id': 'q24.2', 'start': 123900001, 'end': 127800000, 'type': 'gneg' },
585
+ { 'id': 'q24.3', 'start': 127800001, 'end': 130800000, 'type': 'gpos50' },
586
+ { 'id': 'q25', 'start': 130800001, 'end': 135006516, 'type': 'gneg' }
587
+ ]
588
+ },
589
+ '12': {
590
+ 'size' : 133851895,
591
+ 'bands' : [
592
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 33300001, 'end': 35800000, 'type': 'acen' },
593
+ { 'id': 'p11.21', 'start': 30700001, 'end': 33300000, 'type': 'gneg' },
594
+ { 'id': 'p11.22', 'start': 27800001, 'end': 30700000, 'type': 'gpos50' },
595
+ { 'id': 'p11.23', 'start': 26500001, 'end': 27800000, 'type': 'gneg' },
596
+ { 'id': 'p12.1', 'start': 21300001, 'end': 26500000, 'type': 'gpos100' },
597
+ { 'id': 'p12.2', 'start': 20000001, 'end': 21300000, 'type': 'gneg' },
598
+ { 'id': 'p12.3', 'start': 14800001, 'end': 20000000, 'type': 'gpos100' },
599
+ { 'id': 'p13.1', 'start': 12800001, 'end': 14800000, 'type': 'gneg' },
600
+ { 'id': 'p13.2', 'start': 10100001, 'end': 12800000, 'type': 'gpos75' },
601
+ { 'id': 'p13.31', 'start': 5400001, 'end': 10100000, 'type': 'gneg' },
602
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603
+ { 'id': 'p13.33', 'start': 1, 'end': 3300000, 'type': 'gneg' },
604
+ { 'id': 'q11', 'start': 35800001, 'end': 38200000, 'type': 'acen' },
605
+ { 'id': 'q12', 'start': 38200001, 'end': 46400000, 'type': 'gpos100' },
606
+ { 'id': 'q13.11', 'start': 46400001, 'end': 49100000, 'type': 'gneg' },
607
+ { 'id': 'q13.12', 'start': 49100001, 'end': 51500000, 'type': 'gpos25' },
608
+ { 'id': 'q13.13', 'start': 51500001, 'end': 54900000, 'type': 'gneg' },
609
+ { 'id': 'q13.2', 'start': 54900001, 'end': 56600000, 'type': 'gpos25' },
610
+ { 'id': 'q13.3', 'start': 56600001, 'end': 58100000, 'type': 'gneg' },
611
+ { 'id': 'q14.1', 'start': 58100001, 'end': 63100000, 'type': 'gpos75' },
612
+ { 'id': 'q14.2', 'start': 63100001, 'end': 65100000, 'type': 'gneg' },
613
+ { 'id': 'q14.3', 'start': 65100001, 'end': 67700000, 'type': 'gpos50' },
614
+ { 'id': 'q15', 'start': 67700001, 'end': 71500000, 'type': 'gneg' },
615
+ { 'id': 'q21.1', 'start': 71500001, 'end': 75700000, 'type': 'gpos75' },
616
+ { 'id': 'q21.2', 'start': 75700001, 'end': 80300000, 'type': 'gneg' },
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+ { 'id': 'q21.31', 'start': 80300001, 'end': 86700000, 'type': 'gpos100' },
618
+ { 'id': 'q21.32', 'start': 86700001, 'end': 89000000, 'type': 'gneg' },
619
+ { 'id': 'q21.33', 'start': 89000001, 'end': 92600000, 'type': 'gpos100' },
620
+ { 'id': 'q22', 'start': 92600001, 'end': 96200000, 'type': 'gneg' },
621
+ { 'id': 'q23.1', 'start': 96200001, 'end': 101600000, 'type': 'gpos75' },
622
+ { 'id': 'q23.2', 'start': 101600001, 'end': 103800000, 'type': 'gneg' },
623
+ { 'id': 'q23.3', 'start': 103800001, 'end': 109000000, 'type': 'gpos50' },
624
+ { 'id': 'q24.11', 'start': 109000001, 'end': 111700000, 'type': 'gneg' },
625
+ { 'id': 'q24.12', 'start': 111700001, 'end': 112300000, 'type': 'gpos25' },
626
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627
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628
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629
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630
+ { 'id': 'q24.31', 'start': 120700001, 'end': 125900000, 'type': 'gneg' },
631
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632
+ { 'id': 'q24.33', 'start': 129300001, 'end': 133851895, 'type': 'gneg' }
633
+ ]
634
+ },
635
+ '13': {
636
+ 'size' : 115169878,
637
+ 'bands' : [
638
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 16300001, 'end': 17900000, 'type': 'acen' },
639
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 10000001, 'end': 16300000, 'type': 'gvar' },
640
+ { 'id': 'p12', 'start': 4500001, 'end': 10000000, 'type': 'stalk' },
641
+ { 'id': 'p13', 'start': 1, 'end': 4500000, 'type': 'gvar' },
642
+ { 'id': 'q11', 'start': 17900001, 'end': 19500000, 'type': 'acen' },
643
+ { 'id': 'q12.11', 'start': 19500001, 'end': 23300000, 'type': 'gneg' },
644
+ { 'id': 'q12.12', 'start': 23300001, 'end': 25500000, 'type': 'gpos25' },
645
+ { 'id': 'q12.13', 'start': 25500001, 'end': 27800000, 'type': 'gneg' },
646
+ { 'id': 'q12.2', 'start': 27800001, 'end': 28900000, 'type': 'gpos25' },
647
+ { 'id': 'q12.3', 'start': 28900001, 'end': 32200000, 'type': 'gneg' },
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649
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650
+ { 'id': 'q13.3', 'start': 35500001, 'end': 40100000, 'type': 'gpos75' },
651
+ { 'id': 'q14.11', 'start': 40100001, 'end': 45200000, 'type': 'gneg' },
652
+ { 'id': 'q14.12', 'start': 45200001, 'end': 45800000, 'type': 'gpos25' },
653
+ { 'id': 'q14.13', 'start': 45800001, 'end': 47300000, 'type': 'gneg' },
654
+ { 'id': 'q14.2', 'start': 47300001, 'end': 50900000, 'type': 'gpos50' },
655
+ { 'id': 'q14.3', 'start': 50900001, 'end': 55300000, 'type': 'gneg' },
656
+ { 'id': 'q21.1', 'start': 55300001, 'end': 59600000, 'type': 'gpos100' },
657
+ { 'id': 'q21.2', 'start': 59600001, 'end': 62300000, 'type': 'gneg' },
658
+ { 'id': 'q21.31', 'start': 62300001, 'end': 65700000, 'type': 'gpos75' },
659
+ { 'id': 'q21.32', 'start': 65700001, 'end': 68600000, 'type': 'gneg' },
660
+ { 'id': 'q21.33', 'start': 68600001, 'end': 73300000, 'type': 'gpos100' },
661
+ { 'id': 'q22.1', 'start': 73300001, 'end': 75400000, 'type': 'gneg' },
662
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663
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664
+ { 'id': 'q31.1', 'start': 79000001, 'end': 87700000, 'type': 'gpos100' },
665
+ { 'id': 'q31.2', 'start': 87700001, 'end': 90000000, 'type': 'gneg' },
666
+ { 'id': 'q31.3', 'start': 90000001, 'end': 95000000, 'type': 'gpos100' },
667
+ { 'id': 'q32.1', 'start': 95000001, 'end': 98200000, 'type': 'gneg' },
668
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669
+ { 'id': 'q32.3', 'start': 99300001, 'end': 101700000, 'type': 'gneg' },
670
+ { 'id': 'q33.1', 'start': 101700001, 'end': 104800000, 'type': 'gpos100' },
671
+ { 'id': 'q33.2', 'start': 104800001, 'end': 107000000, 'type': 'gneg' },
672
+ { 'id': 'q33.3', 'start': 107000001, 'end': 110300000, 'type': 'gpos100' },
673
+ { 'id': 'q34', 'start': 110300001, 'end': 115169878, 'type': 'gneg' }
674
+ ]
675
+ },
676
+ '14': {
677
+ 'size' : 107349540,
678
+ 'bands' : [
679
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 16100001, 'end': 17600000, 'type': 'acen' },
680
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 8100001, 'end': 16100000, 'type': 'gvar' },
681
+ { 'id': 'p12', 'start': 3700001, 'end': 8100000, 'type': 'stalk' },
682
+ { 'id': 'p13', 'start': 1, 'end': 3700000, 'type': 'gvar' },
683
+ { 'id': 'q11.1', 'start': 17600001, 'end': 19100000, 'type': 'acen' },
684
+ { 'id': 'q11.2', 'start': 19100001, 'end': 24600000, 'type': 'gneg' },
685
+ { 'id': 'q12', 'start': 24600001, 'end': 33300000, 'type': 'gpos100' },
686
+ { 'id': 'q13.1', 'start': 33300001, 'end': 35300000, 'type': 'gneg' },
687
+ { 'id': 'q13.2', 'start': 35300001, 'end': 36600000, 'type': 'gpos50' },
688
+ { 'id': 'q13.3', 'start': 36600001, 'end': 37800000, 'type': 'gneg' },
689
+ { 'id': 'q21.1', 'start': 37800001, 'end': 43500000, 'type': 'gpos100' },
690
+ { 'id': 'q21.2', 'start': 43500001, 'end': 47200000, 'type': 'gneg' },
691
+ { 'id': 'q21.3', 'start': 47200001, 'end': 50900000, 'type': 'gpos100' },
692
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696
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701
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702
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704
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705
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706
+ { 'id': 'q32.13', 'start': 94700001, 'end': 96300000, 'type': 'gneg' },
707
+ { 'id': 'q32.2', 'start': 96300001, 'end': 101400000, 'type': 'gpos50' },
708
+ { 'id': 'q32.31', 'start': 101400001, 'end': 103200000, 'type': 'gneg' },
709
+ { 'id': 'q32.32', 'start': 103200001, 'end': 104000000, 'type': 'gpos50' },
710
+ { 'id': 'q32.33', 'start': 104000001, 'end': 107349540, 'type': 'gneg' }
711
+ ]
712
+ },
713
+ '15': {
714
+ 'size' : 102531392,
715
+ 'bands' : [
716
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 15800001, 'end': 19000000, 'type': 'acen' },
717
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 8700001, 'end': 15800000, 'type': 'gvar' },
718
+ { 'id': 'p12', 'start': 3900001, 'end': 8700000, 'type': 'stalk' },
719
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720
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721
+ { 'id': 'q11.2', 'start': 20700001, 'end': 25700000, 'type': 'gneg' },
722
+ { 'id': 'q12', 'start': 25700001, 'end': 28100000, 'type': 'gpos50' },
723
+ { 'id': 'q13.1', 'start': 28100001, 'end': 30300000, 'type': 'gneg' },
724
+ { 'id': 'q13.2', 'start': 30300001, 'end': 31200000, 'type': 'gpos50' },
725
+ { 'id': 'q13.3', 'start': 31200001, 'end': 33600000, 'type': 'gneg' },
726
+ { 'id': 'q14', 'start': 33600001, 'end': 40100000, 'type': 'gpos75' },
727
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728
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729
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730
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731
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732
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733
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735
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742
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745
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746
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747
+ { 'id': 'q26.3', 'start': 98500001, 'end': 102531392, 'type': 'gneg' }
748
+ ]
749
+ },
750
+ '16': {
751
+ 'size' : 90354753,
752
+ 'bands' : [
753
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 34600001, 'end': 36600000, 'type': 'acen' },
754
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 28100001, 'end': 34600000, 'type': 'gneg' },
755
+ { 'id': 'p12.1', 'start': 24200001, 'end': 28100000, 'type': 'gpos50' },
756
+ { 'id': 'p12.2', 'start': 21200001, 'end': 24200000, 'type': 'gneg' },
757
+ { 'id': 'p12.3', 'start': 16800001, 'end': 21200000, 'type': 'gpos50' },
758
+ { 'id': 'p13.11', 'start': 14800001, 'end': 16800000, 'type': 'gneg' },
759
+ { 'id': 'p13.12', 'start': 12600001, 'end': 14800000, 'type': 'gpos50' },
760
+ { 'id': 'p13.13', 'start': 10500001, 'end': 12600000, 'type': 'gneg' },
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+ { 'id': 'p13.2', 'start': 7900001, 'end': 10500000, 'type': 'gpos50' },
762
+ { 'id': 'p13.3', 'start': 1, 'end': 7900000, 'type': 'gneg' },
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764
+ { 'id': 'q11.2', 'start': 38600001, 'end': 47000000, 'type': 'gvar' },
765
+ { 'id': 'q12.1', 'start': 47000001, 'end': 52600000, 'type': 'gneg' },
766
+ { 'id': 'q12.2', 'start': 52600001, 'end': 56700000, 'type': 'gpos50' },
767
+ { 'id': 'q13', 'start': 56700001, 'end': 57400000, 'type': 'gneg' },
768
+ { 'id': 'q21', 'start': 57400001, 'end': 66700000, 'type': 'gpos100' },
769
+ { 'id': 'q22.1', 'start': 66700001, 'end': 70800000, 'type': 'gneg' },
770
+ { 'id': 'q22.2', 'start': 70800001, 'end': 72900000, 'type': 'gpos50' },
771
+ { 'id': 'q22.3', 'start': 72900001, 'end': 74100000, 'type': 'gneg' },
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+ { 'id': 'q23.1', 'start': 74100001, 'end': 79200000, 'type': 'gpos75' },
773
+ { 'id': 'q23.2', 'start': 79200001, 'end': 81700000, 'type': 'gneg' },
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+ { 'id': 'q23.3', 'start': 81700001, 'end': 84200000, 'type': 'gpos50' },
775
+ { 'id': 'q24.1', 'start': 84200001, 'end': 87100000, 'type': 'gneg' },
776
+ { 'id': 'q24.2', 'start': 87100001, 'end': 88700000, 'type': 'gpos25' },
777
+ { 'id': 'q24.3', 'start': 88700001, 'end': 90354753, 'type': 'gneg' }
778
+ ]
779
+ },
780
+ '17': {
781
+ 'size' : 81195210,
782
+ 'bands' : [
783
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 22200001, 'end': 24000000, 'type': 'acen' },
784
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 16000001, 'end': 22200000, 'type': 'gneg' },
785
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786
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787
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788
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790
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791
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794
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795
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796
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797
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798
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799
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800
+ { 'id': 'q23.3', 'start': 61100001, 'end': 62600000, 'type': 'gneg' },
801
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802
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803
+ { 'id': 'q24.3', 'start': 67100001, 'end': 70900000, 'type': 'gpos75' },
804
+ { 'id': 'q25.1', 'start': 70900001, 'end': 74800000, 'type': 'gneg' },
805
+ { 'id': 'q25.2', 'start': 74800001, 'end': 75300000, 'type': 'gpos25' },
806
+ { 'id': 'q25.3', 'start': 75300001, 'end': 81195210, 'type': 'gneg' }
807
+ ]
808
+ },
809
+ '18': {
810
+ 'size' : 78077248,
811
+ 'bands' : [
812
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 15400001, 'end': 17200000, 'type': 'acen' },
813
+ { 'id': 'p11.21', 'start': 10900001, 'end': 15400000, 'type': 'gneg' },
814
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815
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816
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817
+ { 'id': 'p11.32', 'start': 1, 'end': 2900000, 'type': 'gneg' },
818
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819
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820
+ { 'id': 'q12.1', 'start': 25000001, 'end': 32700000, 'type': 'gpos100' },
821
+ { 'id': 'q12.2', 'start': 32700001, 'end': 37200000, 'type': 'gneg' },
822
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823
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824
+ { 'id': 'q21.2', 'start': 48200001, 'end': 53800000, 'type': 'gpos75' },
825
+ { 'id': 'q21.31', 'start': 53800001, 'end': 56200000, 'type': 'gneg' },
826
+ { 'id': 'q21.32', 'start': 56200001, 'end': 59000000, 'type': 'gpos50' },
827
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828
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829
+ { 'id': 'q22.2', 'start': 66800001, 'end': 68700000, 'type': 'gneg' },
830
+ { 'id': 'q22.3', 'start': 68700001, 'end': 73100000, 'type': 'gpos25' },
831
+ { 'id': 'q23', 'start': 73100001, 'end': 78077248, 'type': 'gneg' }
832
+ ]
833
+ },
834
+ '19': {
835
+ 'size' : 59128983,
836
+ 'bands' : [
837
+ { 'id': 'p11', 'start': 24400001, 'end': 26500000, 'type': 'acen' },
838
+ { 'id': 'p12', 'start': 20000001, 'end': 24400000, 'type': 'gvar' },
839
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840
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841
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842
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843
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844
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845
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846
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847
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848
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849
+ { 'id': 'q13.2', 'start': 38700001, 'end': 43400000, 'type': 'gpos25' },
850
+ { 'id': 'q13.31', 'start': 43400001, 'end': 45200000, 'type': 'gneg' },
851
+ { 'id': 'q13.32', 'start': 45200001, 'end': 48000000, 'type': 'gpos25' },
852
+ { 'id': 'q13.33', 'start': 48000001, 'end': 51400000, 'type': 'gneg' },
853
+ { 'id': 'q13.41', 'start': 51400001, 'end': 53600000, 'type': 'gpos25' },
854
+ { 'id': 'q13.42', 'start': 53600001, 'end': 56300000, 'type': 'gneg' },
855
+ { 'id': 'q13.43', 'start': 56300001, 'end': 59128983, 'type': 'gpos25' }
856
+ ]
857
+ },
858
+ '20': {
859
+ 'size' : 63025520,
860
+ 'bands' : [
861
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 25600001, 'end': 27500000, 'type': 'acen' },
862
+ { 'id': 'p11.21', 'start': 22300001, 'end': 25600000, 'type': 'gneg' },
863
+ { 'id': 'p11.22', 'start': 21300001, 'end': 22300000, 'type': 'gpos25' },
864
+ { 'id': 'p11.23', 'start': 17900001, 'end': 21300000, 'type': 'gneg' },
865
+ { 'id': 'p12.1', 'start': 12100001, 'end': 17900000, 'type': 'gpos75' },
866
+ { 'id': 'p12.2', 'start': 9200001, 'end': 12100000, 'type': 'gneg' },
867
+ { 'id': 'p12.3', 'start': 5100001, 'end': 9200000, 'type': 'gpos75' },
868
+ { 'id': 'p13', 'start': 1, 'end': 5100000, 'type': 'gneg' },
869
+ { 'id': 'q11.1', 'start': 27500001, 'end': 29400000, 'type': 'acen' },
870
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871
+ { 'id': 'q11.22', 'start': 32100001, 'end': 34400000, 'type': 'gpos25' },
872
+ { 'id': 'q11.23', 'start': 34400001, 'end': 37600000, 'type': 'gneg' },
873
+ { 'id': 'q12', 'start': 37600001, 'end': 41700000, 'type': 'gpos75' },
874
+ { 'id': 'q13.11', 'start': 41700001, 'end': 42100000, 'type': 'gneg' },
875
+ { 'id': 'q13.12', 'start': 42100001, 'end': 46400000, 'type': 'gpos25' },
876
+ { 'id': 'q13.13', 'start': 46400001, 'end': 49800000, 'type': 'gneg' },
877
+ { 'id': 'q13.2', 'start': 49800001, 'end': 55000000, 'type': 'gpos75' },
878
+ { 'id': 'q13.31', 'start': 55000001, 'end': 56500000, 'type': 'gneg' },
879
+ { 'id': 'q13.32', 'start': 56500001, 'end': 58400000, 'type': 'gpos50' },
880
+ { 'id': 'q13.33', 'start': 58400001, 'end': 63025520, 'type': 'gneg' }
881
+ ]
882
+ },
883
+ '21': {
884
+ 'size' : 48129895,
885
+ 'bands' : [
886
+ { 'id': 'p11.1', 'start': 10900001, 'end': 13200000, 'type': 'acen' },
887
+ { 'id': 'p11.2', 'start': 6800001, 'end': 10900000, 'type': 'gvar' },
888
+ { 'id': 'p12', 'start': 2800001, 'end': 6800000, 'type': 'stalk' },
889
+ { 'id': 'p13', 'start': 1, 'end': 2800000, 'type': 'gvar' },
890
+ { 'id': 'q11.1', 'start': 13200001, 'end': 14300000, 'type': 'acen' },
891
+ { 'id': 'q11.2', 'start': 14300001, 'end': 16400000, 'type': 'gneg' },
892
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893
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