ruby-em_algorithm 0.0.2

Sign up to get free protection for your applications and to get access to all the features.
Files changed (78) hide show
  1. data/Gemfile +6 -0
  2. data/Gemfile.lock +30 -0
  3. data/README.md +44 -0
  4. data/Rakefile +7 -0
  5. data/example/.ex1.rb.swp +0 -0
  6. data/example/.ex2.rb.swp +0 -0
  7. data/example/.ex3-tmp.rb.swp +0 -0
  8. data/example/.ex3.rb.swp +0 -0
  9. data/example/data/2dim-gmm-new.txt +1267 -0
  10. data/example/data/2dim-gmm-simple.txt +676 -0
  11. data/example/data/2dim-gmm-test.txt +6565 -0
  12. data/example/data/2dim-gmm-test2.txt +2782 -0
  13. data/example/data/2dim-gmm-test3.csv +1641 -0
  14. data/example/data/2dim-gmm-test3.txt +2782 -0
  15. data/example/data/2dim-gmm-test4.csv +868 -0
  16. data/example/data/2dim-gmm-test4.txt +4924 -0
  17. data/example/data/2dim-gmm-without_weight-small.txt +2401 -0
  18. data/example/data/2dim-gmm-without_weight.txt +18001 -0
  19. data/example/data/2dim-gmm.txt +1267 -0
  20. data/example/data/gmm-new.txt +10001 -0
  21. data/example/data/gmm-simple.txt +676 -0
  22. data/example/data/gmm.txt +10001 -0
  23. data/example/data/old-gmm.txt +10000 -0
  24. data/example/ex1.rb +20 -0
  25. data/example/ex1.rb~ +20 -0
  26. data/example/ex2.rb +33 -0
  27. data/example/ex2.rb~ +33 -0
  28. data/example/ex3-tmp.rb +23 -0
  29. data/example/ex3-tmp.rb~ +25 -0
  30. data/example/ex3.rb +43 -0
  31. data/example/ex3.rb~ +43 -0
  32. data/example/tools/.2dim.rb.swp +0 -0
  33. data/example/tools/2dim.rb +69 -0
  34. data/example/tools/2dim.rb~ +69 -0
  35. data/example/tools/boxmuller.rb +28 -0
  36. data/example/tools/boxmuller.rb~ +28 -0
  37. data/example/tools/conv_from_yaml.rb +8 -0
  38. data/example/tools/conv_from_yaml_to_csv.rb +8 -0
  39. data/example/tools/conv_to_yaml.rb +17 -0
  40. data/example/tools/ellipsoid.gnuplot +63 -0
  41. data/example/tools/ellipsoid.gnuplot~ +64 -0
  42. data/example/tools/histogram.rb +19 -0
  43. data/example/tools/histogram2d.rb +20 -0
  44. data/example/tools/histogram2d.rb~ +18 -0
  45. data/example/tools/kmeans.rb +34 -0
  46. data/example/tools/mean.rb +19 -0
  47. data/example/tools/table.data +4618 -0
  48. data/example/tools/tmp.txt +69632 -0
  49. data/example/tools/xmeans.R +608 -0
  50. data/example/tools/xmeans.rb +35 -0
  51. data/lib/em_algorithm/.base.rb.swp +0 -0
  52. data/lib/em_algorithm/base.rb +116 -0
  53. data/lib/em_algorithm/base.rb~ +116 -0
  54. data/lib/em_algorithm/convergence/.chi_square.rb.swp +0 -0
  55. data/lib/em_algorithm/convergence/.likelihood.rb.swp +0 -0
  56. data/lib/em_algorithm/convergence/check_method.rb +4 -0
  57. data/lib/em_algorithm/convergence/check_method.rb~ +0 -0
  58. data/lib/em_algorithm/convergence/chi_square.rb +40 -0
  59. data/lib/em_algorithm/convergence/chi_square.rb~ +40 -0
  60. data/lib/em_algorithm/convergence/likelihood.rb +35 -0
  61. data/lib/em_algorithm/convergence/likelihood.rb~ +35 -0
  62. data/lib/em_algorithm/models/.gaussian.rb.swp +0 -0
  63. data/lib/em_algorithm/models/.md_gaussian.rb.swp +0 -0
  64. data/lib/em_algorithm/models/.mixture.rb.swp +0 -0
  65. data/lib/em_algorithm/models/.model.rb.swp +0 -0
  66. data/lib/em_algorithm/models/gaussian.rb +47 -0
  67. data/lib/em_algorithm/models/gaussian.rb~ +47 -0
  68. data/lib/em_algorithm/models/md_gaussian.rb +67 -0
  69. data/lib/em_algorithm/models/md_gaussian.rb~ +67 -0
  70. data/lib/em_algorithm/models/mixture.rb +122 -0
  71. data/lib/em_algorithm/models/mixture.rb~ +122 -0
  72. data/lib/em_algorithm/models/model.rb +19 -0
  73. data/lib/em_algorithm/models/model.rb~ +19 -0
  74. data/lib/ruby-em_algorithm.rb +3 -0
  75. data/lib/ruby-em_algorithm/version.rb +3 -0
  76. data/ruby-em_algorithm.gemspec +21 -0
  77. data/spec/spec_helper.rb +9 -0
  78. metadata +178 -0
@@ -0,0 +1,676 @@
1
+ ---
2
+ - - 8
3
+ - 12
4
+ - 0.00016666666666666666
5
+ - - 8
6
+ - 16
7
+ - 0.00016666666666666666
8
+ - - 9
9
+ - 15
10
+ - 0.0003333333333333333
11
+ - - 9
12
+ - 17
13
+ - 0.0003333333333333333
14
+ - - 9
15
+ - 21
16
+ - 0.00016666666666666666
17
+ - - 10
18
+ - 13
19
+ - 0.0003333333333333333
20
+ - - 10
21
+ - 15
22
+ - 0.0005
23
+ - - 10
24
+ - 16
25
+ - 0.0006666666666666666
26
+ - - 10
27
+ - 17
28
+ - 0.00016666666666666666
29
+ - - 10
30
+ - 18
31
+ - 0.00016666666666666666
32
+ - - 10
33
+ - 19
34
+ - 0.0006666666666666666
35
+ - - 10
36
+ - 20
37
+ - 0.0005
38
+ - - 10
39
+ - 21
40
+ - 0.0003333333333333333
41
+ - - 11
42
+ - 11
43
+ - 0.00016666666666666666
44
+ - - 11
45
+ - 14
46
+ - 0.0006666666666666666
47
+ - - 11
48
+ - 15
49
+ - 0.001
50
+ - - 11
51
+ - 16
52
+ - 0.0006666666666666666
53
+ - - 11
54
+ - 17
55
+ - 0.001
56
+ - - 11
57
+ - 18
58
+ - 0.0013333333333333333
59
+ - - 11
60
+ - 19
61
+ - 0.0008333333333333334
62
+ - - 11
63
+ - 20
64
+ - 0.001
65
+ - - 11
66
+ - 21
67
+ - 0.00016666666666666666
68
+ - - 11
69
+ - 22
70
+ - 0.00016666666666666666
71
+ - - 11
72
+ - 24
73
+ - 0.00016666666666666666
74
+ - - 12
75
+ - 12
76
+ - 0.0005
77
+ - - 12
78
+ - 13
79
+ - 0.0006666666666666666
80
+ - - 12
81
+ - 14
82
+ - 0.0008333333333333334
83
+ - - 12
84
+ - 15
85
+ - 0.002
86
+ - - 12
87
+ - 16
88
+ - 0.0033333333333333335
89
+ - - 12
90
+ - 17
91
+ - 0.0035
92
+ - - 12
93
+ - 18
94
+ - 0.0031666666666666666
95
+ - - 12
96
+ - 19
97
+ - 0.0016666666666666668
98
+ - - 12
99
+ - 20
100
+ - 0.0011666666666666668
101
+ - - 12
102
+ - 21
103
+ - 0.0011666666666666668
104
+ - - 12
105
+ - 22
106
+ - 0.0003333333333333333
107
+ - - 12
108
+ - 23
109
+ - 0.00016666666666666666
110
+ - - 13
111
+ - 10
112
+ - 0.00016666666666666666
113
+ - - 13
114
+ - 11
115
+ - 0.0006666666666666666
116
+ - - 13
117
+ - 12
118
+ - 0.0015
119
+ - - 13
120
+ - 13
121
+ - 0.0018333333333333333
122
+ - - 13
123
+ - 14
124
+ - 0.0033333333333333335
125
+ - - 13
126
+ - 15
127
+ - 0.005166666666666667
128
+ - - 13
129
+ - 16
130
+ - 0.007
131
+ - - 13
132
+ - 17
133
+ - 0.008666666666666666
134
+ - - 13
135
+ - 18
136
+ - 0.007166666666666667
137
+ - - 13
138
+ - 19
139
+ - 0.005333333333333333
140
+ - - 13
141
+ - 20
142
+ - 0.0021666666666666666
143
+ - - 13
144
+ - 21
145
+ - 0.003
146
+ - - 13
147
+ - 22
148
+ - 0.001
149
+ - - 13
150
+ - 23
151
+ - 0.0003333333333333333
152
+ - - 14
153
+ - 10
154
+ - 0.0005
155
+ - - 14
156
+ - 11
157
+ - 0.0005
158
+ - - 14
159
+ - 12
160
+ - 0.0008333333333333334
161
+ - - 14
162
+ - 13
163
+ - 0.0035
164
+ - - 14
165
+ - 14
166
+ - 0.005166666666666667
167
+ - - 14
168
+ - 15
169
+ - 0.008833333333333334
170
+ - - 14
171
+ - 16
172
+ - 0.012833333333333334
173
+ - - 14
174
+ - 17
175
+ - 0.0125
176
+ - - 14
177
+ - 18
178
+ - 0.009333333333333334
179
+ - - 14
180
+ - 19
181
+ - 0.009
182
+ - - 14
183
+ - 20
184
+ - 0.006333333333333333
185
+ - - 14
186
+ - 21
187
+ - 0.0028333333333333335
188
+ - - 14
189
+ - 22
190
+ - 0.0013333333333333333
191
+ - - 14
192
+ - 23
193
+ - 0.0003333333333333333
194
+ - - 14
195
+ - 24
196
+ - 0.0003333333333333333
197
+ - - 15
198
+ - 9
199
+ - 0.00016666666666666666
200
+ - - 15
201
+ - 10
202
+ - 0.0003333333333333333
203
+ - - 15
204
+ - 11
205
+ - 0.0013333333333333333
206
+ - - 15
207
+ - 12
208
+ - 0.0023333333333333335
209
+ - - 15
210
+ - 13
211
+ - 0.005
212
+ - - 15
213
+ - 14
214
+ - 0.009666666666666667
215
+ - - 15
216
+ - 15
217
+ - 0.013333333333333334
218
+ - - 15
219
+ - 16
220
+ - 0.017166666666666667
221
+ - - 15
222
+ - 17
223
+ - 0.02
224
+ - - 15
225
+ - 18
226
+ - 0.015833333333333335
227
+ - - 15
228
+ - 19
229
+ - 0.015833333333333335
230
+ - - 15
231
+ - 20
232
+ - 0.007833333333333333
233
+ - - 15
234
+ - 21
235
+ - 0.004833333333333334
236
+ - - 15
237
+ - 22
238
+ - 0.0035
239
+ - - 15
240
+ - 23
241
+ - 0.0006666666666666666
242
+ - - 15
243
+ - 24
244
+ - 0.0003333333333333333
245
+ - - 15
246
+ - 25
247
+ - 0.00016666666666666666
248
+ - - 16
249
+ - 9
250
+ - 0.0005
251
+ - - 16
252
+ - 10
253
+ - 0.0003333333333333333
254
+ - - 16
255
+ - 11
256
+ - 0.0011666666666666668
257
+ - - 16
258
+ - 12
259
+ - 0.0021666666666666666
260
+ - - 16
261
+ - 13
262
+ - 0.006833333333333334
263
+ - - 16
264
+ - 14
265
+ - 0.011166666666666667
266
+ - - 16
267
+ - 15
268
+ - 0.015833333333333335
269
+ - - 16
270
+ - 16
271
+ - 0.020666666666666667
272
+ - - 16
273
+ - 17
274
+ - 0.0245
275
+ - - 16
276
+ - 18
277
+ - 0.0225
278
+ - - 16
279
+ - 19
280
+ - 0.01633333333333333
281
+ - - 16
282
+ - 20
283
+ - 0.012833333333333334
284
+ - - 16
285
+ - 21
286
+ - 0.007
287
+ - - 16
288
+ - 22
289
+ - 0.0028333333333333335
290
+ - - 16
291
+ - 23
292
+ - 0.001
293
+ - - 16
294
+ - 24
295
+ - 0.0006666666666666666
296
+ - - 16
297
+ - 26
298
+ - 0.00016666666666666666
299
+ - - 17
300
+ - 9
301
+ - 0.0003333333333333333
302
+ - - 17
303
+ - 10
304
+ - 0.00016666666666666666
305
+ - - 17
306
+ - 11
307
+ - 0.001
308
+ - - 17
309
+ - 12
310
+ - 0.0036666666666666666
311
+ - - 17
312
+ - 13
313
+ - 0.007666666666666666
314
+ - - 17
315
+ - 14
316
+ - 0.012
317
+ - - 17
318
+ - 15
319
+ - 0.017
320
+ - - 17
321
+ - 16
322
+ - 0.023833333333333335
323
+ - - 17
324
+ - 17
325
+ - 0.0225
326
+ - - 17
327
+ - 18
328
+ - 0.0225
329
+ - - 17
330
+ - 19
331
+ - 0.018833333333333334
332
+ - - 17
333
+ - 20
334
+ - 0.010833333333333334
335
+ - - 17
336
+ - 21
337
+ - 0.004833333333333334
338
+ - - 17
339
+ - 22
340
+ - 0.004166666666666667
341
+ - - 17
342
+ - 23
343
+ - 0.0016666666666666668
344
+ - - 17
345
+ - 24
346
+ - 0.00016666666666666666
347
+ - - 17
348
+ - 26
349
+ - 0.00016666666666666666
350
+ - - 18
351
+ - 8
352
+ - 0.0003333333333333333
353
+ - - 18
354
+ - 11
355
+ - 0.0008333333333333334
356
+ - - 18
357
+ - 12
358
+ - 0.0045
359
+ - - 18
360
+ - 13
361
+ - 0.005666666666666667
362
+ - - 18
363
+ - 14
364
+ - 0.009833333333333333
365
+ - - 18
366
+ - 15
367
+ - 0.019
368
+ - - 18
369
+ - 16
370
+ - 0.024833333333333332
371
+ - - 18
372
+ - 17
373
+ - 0.025166666666666667
374
+ - - 18
375
+ - 18
376
+ - 0.021833333333333333
377
+ - - 18
378
+ - 19
379
+ - 0.016166666666666666
380
+ - - 18
381
+ - 20
382
+ - 0.015
383
+ - - 18
384
+ - 21
385
+ - 0.007166666666666667
386
+ - - 18
387
+ - 22
388
+ - 0.0023333333333333335
389
+ - - 18
390
+ - 23
391
+ - 0.001
392
+ - - 18
393
+ - 24
394
+ - 0.00016666666666666666
395
+ - - 18
396
+ - 25
397
+ - 0.00016666666666666666
398
+ - - 19
399
+ - 10
400
+ - 0.00016666666666666666
401
+ - - 19
402
+ - 11
403
+ - 0.0011666666666666668
404
+ - - 19
405
+ - 12
406
+ - 0.0031666666666666666
407
+ - - 19
408
+ - 13
409
+ - 0.005666666666666667
410
+ - - 19
411
+ - 14
412
+ - 0.009166666666666667
413
+ - - 19
414
+ - 15
415
+ - 0.014833333333333334
416
+ - - 19
417
+ - 16
418
+ - 0.017166666666666667
419
+ - - 19
420
+ - 17
421
+ - 0.0175
422
+ - - 19
423
+ - 18
424
+ - 0.016833333333333332
425
+ - - 19
426
+ - 19
427
+ - 0.0115
428
+ - - 19
429
+ - 20
430
+ - 0.009666666666666667
431
+ - - 19
432
+ - 21
433
+ - 0.006166666666666667
434
+ - - 19
435
+ - 22
436
+ - 0.0018333333333333333
437
+ - - 19
438
+ - 23
439
+ - 0.0006666666666666666
440
+ - - 19
441
+ - 24
442
+ - 0.0003333333333333333
443
+ - - 19
444
+ - 25
445
+ - 0.00016666666666666666
446
+ - - 20
447
+ - 6
448
+ - 0.00016666666666666666
449
+ - - 20
450
+ - 8
451
+ - 0.00016666666666666666
452
+ - - 20
453
+ - 9
454
+ - 0.00016666666666666666
455
+ - - 20
456
+ - 11
457
+ - 0.0006666666666666666
458
+ - - 20
459
+ - 12
460
+ - 0.0015
461
+ - - 20
462
+ - 13
463
+ - 0.0033333333333333335
464
+ - - 20
465
+ - 14
466
+ - 0.006333333333333333
467
+ - - 20
468
+ - 15
469
+ - 0.008333333333333333
470
+ - - 20
471
+ - 16
472
+ - 0.012
473
+ - - 20
474
+ - 17
475
+ - 0.011833333333333333
476
+ - - 20
477
+ - 18
478
+ - 0.010833333333333334
479
+ - - 20
480
+ - 19
481
+ - 0.0065
482
+ - - 20
483
+ - 20
484
+ - 0.007666666666666666
485
+ - - 20
486
+ - 21
487
+ - 0.0035
488
+ - - 20
489
+ - 22
490
+ - 0.0015
491
+ - - 20
492
+ - 23
493
+ - 0.0006666666666666666
494
+ - - 20
495
+ - 24
496
+ - 0.0006666666666666666
497
+ - - 21
498
+ - 8
499
+ - 0.00016666666666666666
500
+ - - 21
501
+ - 10
502
+ - 0.00016666666666666666
503
+ - - 21
504
+ - 11
505
+ - 0.0003333333333333333
506
+ - - 21
507
+ - 12
508
+ - 0.0008333333333333334
509
+ - - 21
510
+ - 13
511
+ - 0.002
512
+ - - 21
513
+ - 14
514
+ - 0.0036666666666666666
515
+ - - 21
516
+ - 15
517
+ - 0.007333333333333333
518
+ - - 21
519
+ - 16
520
+ - 0.006833333333333334
521
+ - - 21
522
+ - 17
523
+ - 0.008
524
+ - - 21
525
+ - 18
526
+ - 0.007666666666666666
527
+ - - 21
528
+ - 19
529
+ - 0.005833333333333334
530
+ - - 21
531
+ - 20
532
+ - 0.0033333333333333335
533
+ - - 21
534
+ - 21
535
+ - 0.0018333333333333333
536
+ - - 21
537
+ - 22
538
+ - 0.0015
539
+ - - 21
540
+ - 23
541
+ - 0.0008333333333333334
542
+ - - 21
543
+ - 24
544
+ - 0.0003333333333333333
545
+ - - 22
546
+ - 10
547
+ - 0.00016666666666666666
548
+ - - 22
549
+ - 11
550
+ - 0.00016666666666666666
551
+ - - 22
552
+ - 12
553
+ - 0.0003333333333333333
554
+ - - 22
555
+ - 13
556
+ - 0.0013333333333333333
557
+ - - 22
558
+ - 14
559
+ - 0.0018333333333333333
560
+ - - 22
561
+ - 15
562
+ - 0.0021666666666666666
563
+ - - 22
564
+ - 16
565
+ - 0.003
566
+ - - 22
567
+ - 17
568
+ - 0.003
569
+ - - 22
570
+ - 18
571
+ - 0.003833333333333333
572
+ - - 22
573
+ - 19
574
+ - 0.002
575
+ - - 22
576
+ - 20
577
+ - 0.0013333333333333333
578
+ - - 22
579
+ - 21
580
+ - 0.0016666666666666668
581
+ - - 22
582
+ - 22
583
+ - 0.00016666666666666666
584
+ - - 22
585
+ - 23
586
+ - 0.0003333333333333333
587
+ - - 22
588
+ - 25
589
+ - 0.00016666666666666666
590
+ - - 23
591
+ - 11
592
+ - 0.0003333333333333333
593
+ - - 23
594
+ - 12
595
+ - 0.00016666666666666666
596
+ - - 23
597
+ - 13
598
+ - 0.0003333333333333333
599
+ - - 23
600
+ - 14
601
+ - 0.0003333333333333333
602
+ - - 23
603
+ - 15
604
+ - 0.0008333333333333334
605
+ - - 23
606
+ - 16
607
+ - 0.0008333333333333334
608
+ - - 23
609
+ - 17
610
+ - 0.0015
611
+ - - 23
612
+ - 18
613
+ - 0.002
614
+ - - 23
615
+ - 19
616
+ - 0.001
617
+ - - 23
618
+ - 20
619
+ - 0.0006666666666666666
620
+ - - 23
621
+ - 21
622
+ - 0.0003333333333333333
623
+ - - 24
624
+ - 11
625
+ - 0.00016666666666666666
626
+ - - 24
627
+ - 13
628
+ - 0.0003333333333333333
629
+ - - 24
630
+ - 14
631
+ - 0.00016666666666666666
632
+ - - 24
633
+ - 15
634
+ - 0.00016666666666666666
635
+ - - 24
636
+ - 16
637
+ - 0.0006666666666666666
638
+ - - 24
639
+ - 17
640
+ - 0.0008333333333333334
641
+ - - 24
642
+ - 18
643
+ - 0.001
644
+ - - 24
645
+ - 19
646
+ - 0.0003333333333333333
647
+ - - 24
648
+ - 20
649
+ - 0.0005
650
+ - - 24
651
+ - 21
652
+ - 0.00016666666666666666
653
+ - - 24
654
+ - 22
655
+ - 0.00016666666666666666
656
+ - - 24
657
+ - 23
658
+ - 0.00016666666666666666
659
+ - - 25
660
+ - 15
661
+ - 0.00016666666666666666
662
+ - - 25
663
+ - 16
664
+ - 0.00016666666666666666
665
+ - - 25
666
+ - 17
667
+ - 0.00016666666666666666
668
+ - - 25
669
+ - 18
670
+ - 0.0003333333333333333
671
+ - - 25
672
+ - 20
673
+ - 0.00016666666666666666
674
+ - - 26
675
+ - 16
676
+ - 0.00016666666666666666