ruby-em_algorithm 0.0.2

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
Files changed (78) hide show
  1. data/Gemfile +6 -0
  2. data/Gemfile.lock +30 -0
  3. data/README.md +44 -0
  4. data/Rakefile +7 -0
  5. data/example/.ex1.rb.swp +0 -0
  6. data/example/.ex2.rb.swp +0 -0
  7. data/example/.ex3-tmp.rb.swp +0 -0
  8. data/example/.ex3.rb.swp +0 -0
  9. data/example/data/2dim-gmm-new.txt +1267 -0
  10. data/example/data/2dim-gmm-simple.txt +676 -0
  11. data/example/data/2dim-gmm-test.txt +6565 -0
  12. data/example/data/2dim-gmm-test2.txt +2782 -0
  13. data/example/data/2dim-gmm-test3.csv +1641 -0
  14. data/example/data/2dim-gmm-test3.txt +2782 -0
  15. data/example/data/2dim-gmm-test4.csv +868 -0
  16. data/example/data/2dim-gmm-test4.txt +4924 -0
  17. data/example/data/2dim-gmm-without_weight-small.txt +2401 -0
  18. data/example/data/2dim-gmm-without_weight.txt +18001 -0
  19. data/example/data/2dim-gmm.txt +1267 -0
  20. data/example/data/gmm-new.txt +10001 -0
  21. data/example/data/gmm-simple.txt +676 -0
  22. data/example/data/gmm.txt +10001 -0
  23. data/example/data/old-gmm.txt +10000 -0
  24. data/example/ex1.rb +20 -0
  25. data/example/ex1.rb~ +20 -0
  26. data/example/ex2.rb +33 -0
  27. data/example/ex2.rb~ +33 -0
  28. data/example/ex3-tmp.rb +23 -0
  29. data/example/ex3-tmp.rb~ +25 -0
  30. data/example/ex3.rb +43 -0
  31. data/example/ex3.rb~ +43 -0
  32. data/example/tools/.2dim.rb.swp +0 -0
  33. data/example/tools/2dim.rb +69 -0
  34. data/example/tools/2dim.rb~ +69 -0
  35. data/example/tools/boxmuller.rb +28 -0
  36. data/example/tools/boxmuller.rb~ +28 -0
  37. data/example/tools/conv_from_yaml.rb +8 -0
  38. data/example/tools/conv_from_yaml_to_csv.rb +8 -0
  39. data/example/tools/conv_to_yaml.rb +17 -0
  40. data/example/tools/ellipsoid.gnuplot +63 -0
  41. data/example/tools/ellipsoid.gnuplot~ +64 -0
  42. data/example/tools/histogram.rb +19 -0
  43. data/example/tools/histogram2d.rb +20 -0
  44. data/example/tools/histogram2d.rb~ +18 -0
  45. data/example/tools/kmeans.rb +34 -0
  46. data/example/tools/mean.rb +19 -0
  47. data/example/tools/table.data +4618 -0
  48. data/example/tools/tmp.txt +69632 -0
  49. data/example/tools/xmeans.R +608 -0
  50. data/example/tools/xmeans.rb +35 -0
  51. data/lib/em_algorithm/.base.rb.swp +0 -0
  52. data/lib/em_algorithm/base.rb +116 -0
  53. data/lib/em_algorithm/base.rb~ +116 -0
  54. data/lib/em_algorithm/convergence/.chi_square.rb.swp +0 -0
  55. data/lib/em_algorithm/convergence/.likelihood.rb.swp +0 -0
  56. data/lib/em_algorithm/convergence/check_method.rb +4 -0
  57. data/lib/em_algorithm/convergence/check_method.rb~ +0 -0
  58. data/lib/em_algorithm/convergence/chi_square.rb +40 -0
  59. data/lib/em_algorithm/convergence/chi_square.rb~ +40 -0
  60. data/lib/em_algorithm/convergence/likelihood.rb +35 -0
  61. data/lib/em_algorithm/convergence/likelihood.rb~ +35 -0
  62. data/lib/em_algorithm/models/.gaussian.rb.swp +0 -0
  63. data/lib/em_algorithm/models/.md_gaussian.rb.swp +0 -0
  64. data/lib/em_algorithm/models/.mixture.rb.swp +0 -0
  65. data/lib/em_algorithm/models/.model.rb.swp +0 -0
  66. data/lib/em_algorithm/models/gaussian.rb +47 -0
  67. data/lib/em_algorithm/models/gaussian.rb~ +47 -0
  68. data/lib/em_algorithm/models/md_gaussian.rb +67 -0
  69. data/lib/em_algorithm/models/md_gaussian.rb~ +67 -0
  70. data/lib/em_algorithm/models/mixture.rb +122 -0
  71. data/lib/em_algorithm/models/mixture.rb~ +122 -0
  72. data/lib/em_algorithm/models/model.rb +19 -0
  73. data/lib/em_algorithm/models/model.rb~ +19 -0
  74. data/lib/ruby-em_algorithm.rb +3 -0
  75. data/lib/ruby-em_algorithm/version.rb +3 -0
  76. data/ruby-em_algorithm.gemspec +21 -0
  77. data/spec/spec_helper.rb +9 -0
  78. metadata +178 -0
@@ -0,0 +1,676 @@
1
+ ---
2
+ - - 8
3
+ - 12
4
+ - 0.00016666666666666666
5
+ - - 8
6
+ - 16
7
+ - 0.00016666666666666666
8
+ - - 9
9
+ - 15
10
+ - 0.0003333333333333333
11
+ - - 9
12
+ - 17
13
+ - 0.0003333333333333333
14
+ - - 9
15
+ - 21
16
+ - 0.00016666666666666666
17
+ - - 10
18
+ - 13
19
+ - 0.0003333333333333333
20
+ - - 10
21
+ - 15
22
+ - 0.0005
23
+ - - 10
24
+ - 16
25
+ - 0.0006666666666666666
26
+ - - 10
27
+ - 17
28
+ - 0.00016666666666666666
29
+ - - 10
30
+ - 18
31
+ - 0.00016666666666666666
32
+ - - 10
33
+ - 19
34
+ - 0.0006666666666666666
35
+ - - 10
36
+ - 20
37
+ - 0.0005
38
+ - - 10
39
+ - 21
40
+ - 0.0003333333333333333
41
+ - - 11
42
+ - 11
43
+ - 0.00016666666666666666
44
+ - - 11
45
+ - 14
46
+ - 0.0006666666666666666
47
+ - - 11
48
+ - 15
49
+ - 0.001
50
+ - - 11
51
+ - 16
52
+ - 0.0006666666666666666
53
+ - - 11
54
+ - 17
55
+ - 0.001
56
+ - - 11
57
+ - 18
58
+ - 0.0013333333333333333
59
+ - - 11
60
+ - 19
61
+ - 0.0008333333333333334
62
+ - - 11
63
+ - 20
64
+ - 0.001
65
+ - - 11
66
+ - 21
67
+ - 0.00016666666666666666
68
+ - - 11
69
+ - 22
70
+ - 0.00016666666666666666
71
+ - - 11
72
+ - 24
73
+ - 0.00016666666666666666
74
+ - - 12
75
+ - 12
76
+ - 0.0005
77
+ - - 12
78
+ - 13
79
+ - 0.0006666666666666666
80
+ - - 12
81
+ - 14
82
+ - 0.0008333333333333334
83
+ - - 12
84
+ - 15
85
+ - 0.002
86
+ - - 12
87
+ - 16
88
+ - 0.0033333333333333335
89
+ - - 12
90
+ - 17
91
+ - 0.0035
92
+ - - 12
93
+ - 18
94
+ - 0.0031666666666666666
95
+ - - 12
96
+ - 19
97
+ - 0.0016666666666666668
98
+ - - 12
99
+ - 20
100
+ - 0.0011666666666666668
101
+ - - 12
102
+ - 21
103
+ - 0.0011666666666666668
104
+ - - 12
105
+ - 22
106
+ - 0.0003333333333333333
107
+ - - 12
108
+ - 23
109
+ - 0.00016666666666666666
110
+ - - 13
111
+ - 10
112
+ - 0.00016666666666666666
113
+ - - 13
114
+ - 11
115
+ - 0.0006666666666666666
116
+ - - 13
117
+ - 12
118
+ - 0.0015
119
+ - - 13
120
+ - 13
121
+ - 0.0018333333333333333
122
+ - - 13
123
+ - 14
124
+ - 0.0033333333333333335
125
+ - - 13
126
+ - 15
127
+ - 0.005166666666666667
128
+ - - 13
129
+ - 16
130
+ - 0.007
131
+ - - 13
132
+ - 17
133
+ - 0.008666666666666666
134
+ - - 13
135
+ - 18
136
+ - 0.007166666666666667
137
+ - - 13
138
+ - 19
139
+ - 0.005333333333333333
140
+ - - 13
141
+ - 20
142
+ - 0.0021666666666666666
143
+ - - 13
144
+ - 21
145
+ - 0.003
146
+ - - 13
147
+ - 22
148
+ - 0.001
149
+ - - 13
150
+ - 23
151
+ - 0.0003333333333333333
152
+ - - 14
153
+ - 10
154
+ - 0.0005
155
+ - - 14
156
+ - 11
157
+ - 0.0005
158
+ - - 14
159
+ - 12
160
+ - 0.0008333333333333334
161
+ - - 14
162
+ - 13
163
+ - 0.0035
164
+ - - 14
165
+ - 14
166
+ - 0.005166666666666667
167
+ - - 14
168
+ - 15
169
+ - 0.008833333333333334
170
+ - - 14
171
+ - 16
172
+ - 0.012833333333333334
173
+ - - 14
174
+ - 17
175
+ - 0.0125
176
+ - - 14
177
+ - 18
178
+ - 0.009333333333333334
179
+ - - 14
180
+ - 19
181
+ - 0.009
182
+ - - 14
183
+ - 20
184
+ - 0.006333333333333333
185
+ - - 14
186
+ - 21
187
+ - 0.0028333333333333335
188
+ - - 14
189
+ - 22
190
+ - 0.0013333333333333333
191
+ - - 14
192
+ - 23
193
+ - 0.0003333333333333333
194
+ - - 14
195
+ - 24
196
+ - 0.0003333333333333333
197
+ - - 15
198
+ - 9
199
+ - 0.00016666666666666666
200
+ - - 15
201
+ - 10
202
+ - 0.0003333333333333333
203
+ - - 15
204
+ - 11
205
+ - 0.0013333333333333333
206
+ - - 15
207
+ - 12
208
+ - 0.0023333333333333335
209
+ - - 15
210
+ - 13
211
+ - 0.005
212
+ - - 15
213
+ - 14
214
+ - 0.009666666666666667
215
+ - - 15
216
+ - 15
217
+ - 0.013333333333333334
218
+ - - 15
219
+ - 16
220
+ - 0.017166666666666667
221
+ - - 15
222
+ - 17
223
+ - 0.02
224
+ - - 15
225
+ - 18
226
+ - 0.015833333333333335
227
+ - - 15
228
+ - 19
229
+ - 0.015833333333333335
230
+ - - 15
231
+ - 20
232
+ - 0.007833333333333333
233
+ - - 15
234
+ - 21
235
+ - 0.004833333333333334
236
+ - - 15
237
+ - 22
238
+ - 0.0035
239
+ - - 15
240
+ - 23
241
+ - 0.0006666666666666666
242
+ - - 15
243
+ - 24
244
+ - 0.0003333333333333333
245
+ - - 15
246
+ - 25
247
+ - 0.00016666666666666666
248
+ - - 16
249
+ - 9
250
+ - 0.0005
251
+ - - 16
252
+ - 10
253
+ - 0.0003333333333333333
254
+ - - 16
255
+ - 11
256
+ - 0.0011666666666666668
257
+ - - 16
258
+ - 12
259
+ - 0.0021666666666666666
260
+ - - 16
261
+ - 13
262
+ - 0.006833333333333334
263
+ - - 16
264
+ - 14
265
+ - 0.011166666666666667
266
+ - - 16
267
+ - 15
268
+ - 0.015833333333333335
269
+ - - 16
270
+ - 16
271
+ - 0.020666666666666667
272
+ - - 16
273
+ - 17
274
+ - 0.0245
275
+ - - 16
276
+ - 18
277
+ - 0.0225
278
+ - - 16
279
+ - 19
280
+ - 0.01633333333333333
281
+ - - 16
282
+ - 20
283
+ - 0.012833333333333334
284
+ - - 16
285
+ - 21
286
+ - 0.007
287
+ - - 16
288
+ - 22
289
+ - 0.0028333333333333335
290
+ - - 16
291
+ - 23
292
+ - 0.001
293
+ - - 16
294
+ - 24
295
+ - 0.0006666666666666666
296
+ - - 16
297
+ - 26
298
+ - 0.00016666666666666666
299
+ - - 17
300
+ - 9
301
+ - 0.0003333333333333333
302
+ - - 17
303
+ - 10
304
+ - 0.00016666666666666666
305
+ - - 17
306
+ - 11
307
+ - 0.001
308
+ - - 17
309
+ - 12
310
+ - 0.0036666666666666666
311
+ - - 17
312
+ - 13
313
+ - 0.007666666666666666
314
+ - - 17
315
+ - 14
316
+ - 0.012
317
+ - - 17
318
+ - 15
319
+ - 0.017
320
+ - - 17
321
+ - 16
322
+ - 0.023833333333333335
323
+ - - 17
324
+ - 17
325
+ - 0.0225
326
+ - - 17
327
+ - 18
328
+ - 0.0225
329
+ - - 17
330
+ - 19
331
+ - 0.018833333333333334
332
+ - - 17
333
+ - 20
334
+ - 0.010833333333333334
335
+ - - 17
336
+ - 21
337
+ - 0.004833333333333334
338
+ - - 17
339
+ - 22
340
+ - 0.004166666666666667
341
+ - - 17
342
+ - 23
343
+ - 0.0016666666666666668
344
+ - - 17
345
+ - 24
346
+ - 0.00016666666666666666
347
+ - - 17
348
+ - 26
349
+ - 0.00016666666666666666
350
+ - - 18
351
+ - 8
352
+ - 0.0003333333333333333
353
+ - - 18
354
+ - 11
355
+ - 0.0008333333333333334
356
+ - - 18
357
+ - 12
358
+ - 0.0045
359
+ - - 18
360
+ - 13
361
+ - 0.005666666666666667
362
+ - - 18
363
+ - 14
364
+ - 0.009833333333333333
365
+ - - 18
366
+ - 15
367
+ - 0.019
368
+ - - 18
369
+ - 16
370
+ - 0.024833333333333332
371
+ - - 18
372
+ - 17
373
+ - 0.025166666666666667
374
+ - - 18
375
+ - 18
376
+ - 0.021833333333333333
377
+ - - 18
378
+ - 19
379
+ - 0.016166666666666666
380
+ - - 18
381
+ - 20
382
+ - 0.015
383
+ - - 18
384
+ - 21
385
+ - 0.007166666666666667
386
+ - - 18
387
+ - 22
388
+ - 0.0023333333333333335
389
+ - - 18
390
+ - 23
391
+ - 0.001
392
+ - - 18
393
+ - 24
394
+ - 0.00016666666666666666
395
+ - - 18
396
+ - 25
397
+ - 0.00016666666666666666
398
+ - - 19
399
+ - 10
400
+ - 0.00016666666666666666
401
+ - - 19
402
+ - 11
403
+ - 0.0011666666666666668
404
+ - - 19
405
+ - 12
406
+ - 0.0031666666666666666
407
+ - - 19
408
+ - 13
409
+ - 0.005666666666666667
410
+ - - 19
411
+ - 14
412
+ - 0.009166666666666667
413
+ - - 19
414
+ - 15
415
+ - 0.014833333333333334
416
+ - - 19
417
+ - 16
418
+ - 0.017166666666666667
419
+ - - 19
420
+ - 17
421
+ - 0.0175
422
+ - - 19
423
+ - 18
424
+ - 0.016833333333333332
425
+ - - 19
426
+ - 19
427
+ - 0.0115
428
+ - - 19
429
+ - 20
430
+ - 0.009666666666666667
431
+ - - 19
432
+ - 21
433
+ - 0.006166666666666667
434
+ - - 19
435
+ - 22
436
+ - 0.0018333333333333333
437
+ - - 19
438
+ - 23
439
+ - 0.0006666666666666666
440
+ - - 19
441
+ - 24
442
+ - 0.0003333333333333333
443
+ - - 19
444
+ - 25
445
+ - 0.00016666666666666666
446
+ - - 20
447
+ - 6
448
+ - 0.00016666666666666666
449
+ - - 20
450
+ - 8
451
+ - 0.00016666666666666666
452
+ - - 20
453
+ - 9
454
+ - 0.00016666666666666666
455
+ - - 20
456
+ - 11
457
+ - 0.0006666666666666666
458
+ - - 20
459
+ - 12
460
+ - 0.0015
461
+ - - 20
462
+ - 13
463
+ - 0.0033333333333333335
464
+ - - 20
465
+ - 14
466
+ - 0.006333333333333333
467
+ - - 20
468
+ - 15
469
+ - 0.008333333333333333
470
+ - - 20
471
+ - 16
472
+ - 0.012
473
+ - - 20
474
+ - 17
475
+ - 0.011833333333333333
476
+ - - 20
477
+ - 18
478
+ - 0.010833333333333334
479
+ - - 20
480
+ - 19
481
+ - 0.0065
482
+ - - 20
483
+ - 20
484
+ - 0.007666666666666666
485
+ - - 20
486
+ - 21
487
+ - 0.0035
488
+ - - 20
489
+ - 22
490
+ - 0.0015
491
+ - - 20
492
+ - 23
493
+ - 0.0006666666666666666
494
+ - - 20
495
+ - 24
496
+ - 0.0006666666666666666
497
+ - - 21
498
+ - 8
499
+ - 0.00016666666666666666
500
+ - - 21
501
+ - 10
502
+ - 0.00016666666666666666
503
+ - - 21
504
+ - 11
505
+ - 0.0003333333333333333
506
+ - - 21
507
+ - 12
508
+ - 0.0008333333333333334
509
+ - - 21
510
+ - 13
511
+ - 0.002
512
+ - - 21
513
+ - 14
514
+ - 0.0036666666666666666
515
+ - - 21
516
+ - 15
517
+ - 0.007333333333333333
518
+ - - 21
519
+ - 16
520
+ - 0.006833333333333334
521
+ - - 21
522
+ - 17
523
+ - 0.008
524
+ - - 21
525
+ - 18
526
+ - 0.007666666666666666
527
+ - - 21
528
+ - 19
529
+ - 0.005833333333333334
530
+ - - 21
531
+ - 20
532
+ - 0.0033333333333333335
533
+ - - 21
534
+ - 21
535
+ - 0.0018333333333333333
536
+ - - 21
537
+ - 22
538
+ - 0.0015
539
+ - - 21
540
+ - 23
541
+ - 0.0008333333333333334
542
+ - - 21
543
+ - 24
544
+ - 0.0003333333333333333
545
+ - - 22
546
+ - 10
547
+ - 0.00016666666666666666
548
+ - - 22
549
+ - 11
550
+ - 0.00016666666666666666
551
+ - - 22
552
+ - 12
553
+ - 0.0003333333333333333
554
+ - - 22
555
+ - 13
556
+ - 0.0013333333333333333
557
+ - - 22
558
+ - 14
559
+ - 0.0018333333333333333
560
+ - - 22
561
+ - 15
562
+ - 0.0021666666666666666
563
+ - - 22
564
+ - 16
565
+ - 0.003
566
+ - - 22
567
+ - 17
568
+ - 0.003
569
+ - - 22
570
+ - 18
571
+ - 0.003833333333333333
572
+ - - 22
573
+ - 19
574
+ - 0.002
575
+ - - 22
576
+ - 20
577
+ - 0.0013333333333333333
578
+ - - 22
579
+ - 21
580
+ - 0.0016666666666666668
581
+ - - 22
582
+ - 22
583
+ - 0.00016666666666666666
584
+ - - 22
585
+ - 23
586
+ - 0.0003333333333333333
587
+ - - 22
588
+ - 25
589
+ - 0.00016666666666666666
590
+ - - 23
591
+ - 11
592
+ - 0.0003333333333333333
593
+ - - 23
594
+ - 12
595
+ - 0.00016666666666666666
596
+ - - 23
597
+ - 13
598
+ - 0.0003333333333333333
599
+ - - 23
600
+ - 14
601
+ - 0.0003333333333333333
602
+ - - 23
603
+ - 15
604
+ - 0.0008333333333333334
605
+ - - 23
606
+ - 16
607
+ - 0.0008333333333333334
608
+ - - 23
609
+ - 17
610
+ - 0.0015
611
+ - - 23
612
+ - 18
613
+ - 0.002
614
+ - - 23
615
+ - 19
616
+ - 0.001
617
+ - - 23
618
+ - 20
619
+ - 0.0006666666666666666
620
+ - - 23
621
+ - 21
622
+ - 0.0003333333333333333
623
+ - - 24
624
+ - 11
625
+ - 0.00016666666666666666
626
+ - - 24
627
+ - 13
628
+ - 0.0003333333333333333
629
+ - - 24
630
+ - 14
631
+ - 0.00016666666666666666
632
+ - - 24
633
+ - 15
634
+ - 0.00016666666666666666
635
+ - - 24
636
+ - 16
637
+ - 0.0006666666666666666
638
+ - - 24
639
+ - 17
640
+ - 0.0008333333333333334
641
+ - - 24
642
+ - 18
643
+ - 0.001
644
+ - - 24
645
+ - 19
646
+ - 0.0003333333333333333
647
+ - - 24
648
+ - 20
649
+ - 0.0005
650
+ - - 24
651
+ - 21
652
+ - 0.00016666666666666666
653
+ - - 24
654
+ - 22
655
+ - 0.00016666666666666666
656
+ - - 24
657
+ - 23
658
+ - 0.00016666666666666666
659
+ - - 25
660
+ - 15
661
+ - 0.00016666666666666666
662
+ - - 25
663
+ - 16
664
+ - 0.00016666666666666666
665
+ - - 25
666
+ - 17
667
+ - 0.00016666666666666666
668
+ - - 25
669
+ - 18
670
+ - 0.0003333333333333333
671
+ - - 25
672
+ - 20
673
+ - 0.00016666666666666666
674
+ - - 26
675
+ - 16
676
+ - 0.00016666666666666666