openbabel-ruby 3.1.1.2-x86_64-linux

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  764. metadata +812 -0
data/lib/openbabel/3.4.0/data/3.1.1/mmffbndk.par ADDED
@@ -0,0 +1,68 @@
1
+ *
2
+ * Copyright (c) Merck and Co., Inc., 1994
3
+ * All Rights Reserved
4
+ *
5
+ * MMFF BOND LENGTH, FORCE CONSTANT DEFAULT-RULE PARAMETERS
6
+ * C94 = Fitted to ab-initio derived core MMFF94 force constants
7
+ * E94 = Based on Herschberg/Laurie parameterization of Badger's rule
8
+ *
9
+ * species r0-ref kb-ref Source
10
+ 1 6 1.084 5.15 C94
11
+ 1 7 1.001 7.35 C94
12
+ 1 8 0.947 9.10 C94
13
+ 1 9 0.92 10.6 E94
14
+ 1 14 1.48 2.3 E94
15
+ 1 15 1.415 2.95 C94
16
+ 1 16 1.326 4.30 C94
17
+ 1 17 1.28 4.3 E94
18
+ 1 35 1.41 4.2 E94
19
+ 1 53 1.60 2.7 E94
20
+ 6 6 1.512 3.80 C94
21
+ 6 7 1.439 4.55 C94
22
+ 6 8 1.393 5.40 C94
23
+ 6 9 1.353 6.20 C94
24
+ 6 14 1.86 2.6 E94
25
+ 6 15 1.84 2.7 E94
26
+ 6 16 1.812 2.85 C94
27
+ 6 17 1.781 2.75 C94
28
+ 6 35 1.94 2.6 E94
29
+ 6 53 2.16 1.4 E94
30
+ 7 7 1.283 6.00 C94
31
+ 7 8 1.333 5.90 C94
32
+ 7 9 1.36 5.9 E94
33
+ 7 14 1.74 3.7 E94
34
+ 7 15 1.65 4.8 E94
35
+ 7 16 1.674 3.75 C94
36
+ 7 17 1.75 3.5 E94
37
+ 7 35 1.90 2.9 E94
38
+ 7 53 2.10 1.6 E94
39
+ 8 8 1.48 3.6 E94
40
+ 8 9 1.42 4.6 E94
41
+ 8 14 1.63 5.2 E94
42
+ 8 15 1.66 4.7 E94
43
+ 8 16 1.470 9.90 C94
44
+ 8 17 1.70 4.1 E94
45
+ 8 35 1.85 3.4 E94
46
+ 8 53 2.05 1.6 E94
47
+ 9 14 1.57 6.4 E94
48
+ 9 15 1.54 7.1 E94
49
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+ 14 14 2.32 1.3 E94
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55
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+ 15 16 2.10 2.4 E94
58
+ 15 17 2.03 3.0 E94
59
+ 15 35 2.21 2.0 E94
60
+ 15 53 2.47 1.4 E94
61
+ 16 16 2.052 2.50 C94
62
+ 16 17 2.04 2.9 E94
63
+ 16 35 2.24 1.9 E94
64
+ 16 53 2.40 1.7 E94
65
+ 17 17 1.99 3.5 E94
66
+ 35 35 2.28 2.4 E94
67
+ 53 53 2.67 1.6 E94
68
+ $
data/lib/openbabel/3.4.0/data/3.1.1/mmffbond.par ADDED
@@ -0,0 +1,507 @@
1
+ *
2
+ * Copyright (c) Merck and Co., Inc., 1994
3
+ * All Rights Reserved
4
+ *
5
+ * MMFF BOND PARAMETERS- Rev: 26-OCT-94 Source: MMFF94
6
+ * C94 = CORE MMFF94 parameter - obtained from ab initio data
7
+ * X94 = EXTD MMFF94 parameter - fit to additional ab initio data
8
+ * E94 = r0 from fit to X-ray data, kb from empirical rule
9
+ * #C94 = r0 lies between C94 and E94 values, kb from empirical rule
10
+ * #X94 = r0 lies between X94 and E94 values, kb from empirical rule
11
+ * #E94 = r0 and k both from empirical rules
12
+ *
13
+ * types kb r0 Source
14
+ 0 1 1 4.258 1.508 C94
15
+ 0 1 2 4.539 1.482 C94
16
+ 0 1 3 4.190 1.492 C94
17
+ 0 1 4 4.707 1.459 X94
18
+ 0 1 5 4.766 1.093 C94
19
+ 0 1 6 5.047 1.418 C94
20
+ 0 1 8 5.084 1.451 C94
21
+ 0 1 9 4.763 1.458 C94
22
+ 0 1 10 4.664 1.436 C94
23
+ 0 1 11 6.011 1.360 #C94
24
+ 0 1 12 2.974 1.773 C94
25
+ 0 1 13 2.529 1.949 E94
26
+ 0 1 14 1.706 2.090 E94
27
+ 0 1 15 2.893 1.805 C94
28
+ 0 1 17 2.841 1.813 X94
29
+ 0 1 18 3.258 1.772 X94
30
+ 0 1 19 2.866 1.830 #X94
31
+ 0 1 20 4.650 1.504 C94
32
+ 0 1 22 4.286 1.482 E94
33
+ 0 1 25 2.980 1.810 #X94
34
+ 0 1 26 2.790 1.830 #X94
35
+ 0 1 34 3.844 1.480 #C94
36
+ 0 1 35 7.915 1.307 X94
37
+ 0 1 37 4.957 1.486 C94
38
+ 0 1 39 6.114 1.445 C94
39
+ 0 1 40 4.922 1.446 C94
40
+ 0 1 41 3.830 1.510 #C94
41
+ 0 1 43 3.971 1.472 X94
42
+ 0 1 45 3.844 1.480 X94
43
+ 0 1 46 3.813 1.482 X94
44
+ 0 1 54 4.267 1.461 C94
45
+ 0 1 55 4.646 1.454 C94
46
+ 0 1 56 4.166 1.453 C94
47
+ 0 1 57 4.669 1.461 E94
48
+ 0 1 58 4.329 1.451 E94
49
+ 0 1 61 4.845 1.424 X94
50
+ 0 1 62 4.456 1.444 X94
51
+ 0 1 63 4.481 1.471 E94
52
+ 0 1 64 4.518 1.469 E94
53
+ 0 1 67 4.188 1.459 E94
54
+ 0 1 68 4.217 1.479 C94
55
+ 0 1 72 2.956 1.801 X94
56
+ 0 1 73 2.608 1.839 X94
57
+ 0 1 75 2.547 1.858 E94
58
+ 0 1 78 4.593 1.465 E94
59
+ 0 1 80 4.373 1.477 E94
60
+ 0 1 81 4.512 1.441 E94
61
+ 0 2 2 9.505 1.333 C94
62
+ 1 2 2 5.310 1.430 #C94
63
+ 1 2 3 4.565 1.468 C94
64
+ 0 2 4 9.538 1.297 E94
65
+ 1 2 4 5.657 1.415 E94
66
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67
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70
+ 0 2 11 6.283 1.350 #X94
71
+ 0 2 12 3.390 1.720 #X94
72
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+ 0 2 15 3.896 1.720 E94
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78
+ 0 2 20 4.593 1.465 E94
79
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81
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+ 0 2 35 10.343 1.250 #X94
84
+ 1 2 37 5.007 1.449 C94
85
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+ 0 2 40 6.110 1.370 #C94
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+ 0 2 41 3.746 1.505 C94
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+ 0 2 45 4.725 1.430 #X94
90
+ 0 2 46 7.466 1.325 E94
91
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+ 0 2 62 7.105 1.336 X94
94
+ 1 2 63 6.030 1.400 E94
95
+ 1 2 64 5.754 1.411 E94
96
+ 1 2 67 4.685 1.432 E94
97
+ 0 2 72 4.179 1.700 #X94
98
+ 1 2 81 6.357 1.361 E94
99
+ 1 3 3 4.418 1.489 C94
100
+ 1 3 4 5.135 1.438 E94
101
+ 0 3 5 4.650 1.101 C94
102
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+ 0 3 7 12.950 1.222 C94
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107
+ 0 3 11 6.570 1.340 E94
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+ 0 3 16 4.735 1.665 E94
111
+ 0 3 17 2.888 1.808 E94
112
+ 0 3 18 3.394 1.760 E94
113
+ 0 3 20 3.298 1.530 C94
114
+ 0 3 22 4.593 1.465 E94
115
+ 0 3 25 3.164 1.792 E94
116
+ 1 3 30 4.481 1.471 E94
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118
+ 1 3 37 4.488 1.457 C94
119
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120
+ 0 3 40 6.110 1.370 #C94
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132
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412
+ 1 37 64 5.265 1.432 E94
413
+ 1 37 67 4.725 1.430 E94
414
+ 0 37 69 5.396 1.352 C94
415
+ 0 37 78 6.719 1.375 E94
416
+ 0 37 81 3.987 1.471 E94
417
+ 1 37 81 4.531 1.440 E94
418
+ 0 38 38 5.002 1.246 C94
419
+ 0 38 63 7.299 1.330 E94
420
+ 0 38 64 6.978 1.340 E94
421
+ 0 38 69 5.036 1.321 E94
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423
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425
+ 0 39 63 6.301 1.364 C94
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+ 0 39 78 6.137 1.369 E94
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506
+ 0 80 81 8.237 1.335 C94
507
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