niwrap-freesurfer 0.6.1__py3-none-any.whl → 0.6.3__py3-none-any.whl

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  1. niwrap_freesurfer/freesurfer/analyzeto4dfp.py +1 -1
  2. niwrap_freesurfer/freesurfer/anatomi_cuts_utils.py +1 -1
  3. niwrap_freesurfer/freesurfer/annot2std.py +1 -1
  4. niwrap_freesurfer/freesurfer/ants_denoise_image_fs.py +1 -1
  5. niwrap_freesurfer/freesurfer/ants_n4_bias_field_correction_fs.py +1 -1
  6. niwrap_freesurfer/freesurfer/aparc2feat.py +1 -1
  7. niwrap_freesurfer/freesurfer/aparc_stats_aseg.py +1 -1
  8. niwrap_freesurfer/freesurfer/aparcstats2table.py +1 -1
  9. niwrap_freesurfer/freesurfer/aparcstatsdiff.py +1 -1
  10. niwrap_freesurfer/freesurfer/apas2aseg.py +1 -1
  11. niwrap_freesurfer/freesurfer/apply_morph.py +1 -1
  12. niwrap_freesurfer/freesurfer/aseg2feat.py +1 -1
  13. niwrap_freesurfer/freesurfer/asegstats2table.py +1 -1
  14. niwrap_freesurfer/freesurfer/asegstatsdiff.py +1 -1
  15. niwrap_freesurfer/freesurfer/avi2talxfm.py +1 -1
  16. niwrap_freesurfer/freesurfer/bblabel.py +1 -1
  17. niwrap_freesurfer/freesurfer/bbmask.py +1 -1
  18. niwrap_freesurfer/freesurfer/bbregister.py +1 -1
  19. niwrap_freesurfer/freesurfer/bedpostx_mgh.py +1 -1
  20. niwrap_freesurfer/freesurfer/beta2sxa.py +1 -1
  21. niwrap_freesurfer/freesurfer/biasfield.py +1 -1
  22. niwrap_freesurfer/freesurfer/bmedits2surf.py +1 -1
  23. niwrap_freesurfer/freesurfer/brec.py +1 -1
  24. niwrap_freesurfer/freesurfer/browse_minc_header_tcl.py +1 -1
  25. niwrap_freesurfer/freesurfer/bugr.py +1 -1
  26. niwrap_freesurfer/freesurfer/build_desikan_killiany_gcs_csh.py +1 -1
  27. niwrap_freesurfer/freesurfer/cblumwmgyri.py +1 -1
  28. niwrap_freesurfer/freesurfer/check_mcr_sh.py +1 -1
  29. niwrap_freesurfer/freesurfer/check_recons_sh.py +1 -1
  30. niwrap_freesurfer/freesurfer/check_subject.py +1 -1
  31. niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_interrater_variability_csh.py +1 -1
  32. niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_label_volumes_csh.py +2 -2
  33. niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_vox2vox.py +1 -1
  34. niwrap_freesurfer/freesurfer/conf2hires.py +1 -1
  35. niwrap_freesurfer/freesurfer/connected_components.py +1 -1
  36. niwrap_freesurfer/freesurfer/cor_to_minc.py +1 -1
  37. niwrap_freesurfer/freesurfer/cp_dicom.py +1 -1
  38. niwrap_freesurfer/freesurfer/create_morph.py +1 -1
  39. niwrap_freesurfer/freesurfer/csvprint.py +1 -1
  40. niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdir_info_mgh.py +1 -1
  41. niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdjpeg_fs.py +1 -1
  42. niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdrle_fs.py +1 -1
  43. niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmsplit.py +1 -1
  44. niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmunpack.py +1 -1
  45. niwrap_freesurfer/freesurfer/deface_subject.py +1 -1
  46. niwrap_freesurfer/freesurfer/defect2seg.py +1 -1
  47. niwrap_freesurfer/freesurfer/defect_seg.py +1 -1
  48. niwrap_freesurfer/freesurfer/dicom_rename.py +1 -1
  49. niwrap_freesurfer/freesurfer/diffusion_utils.py +1 -1
  50. niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_ac_sh.py +1 -1
  51. niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_anatomi_cuts.py +1 -1
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  55. niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_forrest.py +1 -1
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  57. niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_group_by_endpoints.py +1 -1
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  73. niwrap_freesurfer/freesurfer/export_gcam.py +1 -1
  74. niwrap_freesurfer/freesurfer/extract_seg_waveform.py +1 -1
  75. niwrap_freesurfer/freesurfer/exvivo_hemi_proc.py +1 -1
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  77. niwrap_freesurfer/freesurfer/feat2surf.py +1 -1
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  83. niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject_rh.py +1 -1
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  89. niwrap_freesurfer/freesurfer/freeview.py +1 -1
  90. niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_check_version.py +1 -1
  91. niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_install_mcr.py +1 -1
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  93. niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_print_help.py +1 -1
  94. niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_run_from_mcr.py +1 -1
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  107. niwrap_freesurfer/freesurfer/fslregister.py +1 -1
  108. niwrap_freesurfer/freesurfer/fspalm.py +1 -1
  109. niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_coreg.py +1 -1
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  111. niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_import.py +1 -1
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  197. niwrap_freesurfer/freesurfer/mergeseg.py +1 -1
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  201. niwrap_freesurfer/freesurfer/mkima_index_tcl.py +1 -1
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  203. niwrap_freesurfer/freesurfer/mksubjdirs.py +1 -1
  204. niwrap_freesurfer/freesurfer/mksurfatlas.py +1 -1
  205. niwrap_freesurfer/freesurfer/mkxsubjreg.py +1 -1
  206. niwrap_freesurfer/freesurfer/mmppsp.py +1 -1
  207. niwrap_freesurfer/freesurfer/mni152reg.py +1 -1
  208. niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_only_subject.py +1 -1
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  213. niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_subject.py +1 -1
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  224. niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_annotation2label.py +1 -1
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  486. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_nudge.py +1 -1
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  529. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_topo_fixer.py +1 -1
  530. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transform.py +1 -1
  531. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_translate_annotation.py +1 -1
  532. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transmantle_dysplasia_paths.py +1 -1
  533. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask.py +1 -1
  534. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_novtk.py +1 -1
  535. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_vtk.py +1 -1
  536. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volsmooth.py +1 -1
  537. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volume.py +1 -1
  538. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_warp.py +1 -1
  539. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_watershed.py +1 -1
  540. niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_wm_volume.py +1 -1
  541. niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_paint.py +1 -1
  542. niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_write.py +1 -1
  543. niwrap_freesurfer/freesurfer/ms_refine_subject.py +1 -1
  544. niwrap_freesurfer/freesurfer/nmovie_qt.py +1 -1
  545. niwrap_freesurfer/freesurfer/oct_register_mosaic.py +1 -1
  546. niwrap_freesurfer/freesurfer/optseq2.py +1 -1
  547. niwrap_freesurfer/freesurfer/orient_las.py +1 -1
  548. niwrap_freesurfer/freesurfer/parc_atlas_jackknife_test.py +1 -1
  549. niwrap_freesurfer/freesurfer/pctsurfcon.py +1 -1
  550. niwrap_freesurfer/freesurfer/plot_structure_stats_tcl.py +1 -1
  551. niwrap_freesurfer/freesurfer/pointset2label.py +1 -1
  552. niwrap_freesurfer/freesurfer/polyorder.py +1 -1
  553. niwrap_freesurfer/freesurfer/post_recon_all.py +1 -1
  554. niwrap_freesurfer/freesurfer/predict_v1_sh.py +1 -1
  555. niwrap_freesurfer/freesurfer/print_unique_labels_csh.py +1 -1
  556. niwrap_freesurfer/freesurfer/qatools_py.py +1 -1
  557. niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_brainstem_structures_sh.py +1 -1
  558. niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_hasubregions_sh.py +1 -1
  559. niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_thalamic_nuclei_sh.py +1 -1
  560. niwrap_freesurfer/freesurfer/rbbr.py +1 -1
  561. niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_base_init.py +1 -1
  562. niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config.py +1 -1
  563. niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config2csh.py +1 -1
  564. niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_fix_ento.py +1 -1
  565. niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_long_tp_init.py +1 -1
  566. niwrap_freesurfer/freesurfer/rcbf_prep.py +1 -1
  567. niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all.py +1 -1
  568. niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_clinical_sh.py +1 -1
  569. niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_exvivo.py +1 -1
  570. niwrap_freesurfer/freesurfer/reconbatchjobs.py +1 -1
  571. niwrap_freesurfer/freesurfer/reg2subject.py +1 -1
  572. niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_feat2anat.py +1 -1
  573. niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_mni305_2mm.py +1 -1
  574. niwrap_freesurfer/freesurfer/regdat2xfm.py +1 -1
  575. niwrap_freesurfer/freesurfer/register_child.py +1 -1
  576. niwrap_freesurfer/freesurfer/register_csh.py +1 -1
  577. niwrap_freesurfer/freesurfer/register_elderly_subject.py +1 -1
  578. niwrap_freesurfer/freesurfer/register_subject.py +1 -1
  579. niwrap_freesurfer/freesurfer/register_subject_flash.py +1 -1
  580. niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject.py +1 -1
  581. niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_lh.py +1 -1
  582. niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_rh.py +1 -1
  583. niwrap_freesurfer/freesurfer/remove_talairach.py +1 -1
  584. niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_subject_keep_editting.py +1 -1
  585. niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_t1_subject.py +1 -1
  586. niwrap_freesurfer/freesurfer/reregister_subject_mixed.py +1 -1
  587. niwrap_freesurfer/freesurfer/rtview.py +1 -1
  588. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_mris_preproc.py +1 -1
  589. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_qdec_glm.py +1 -1
  590. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg.py +1 -1
  591. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg_long.py +1 -1
  592. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subfields_t1_longitudinal_sh.py +1 -1
  593. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_sh.py +1 -1
  594. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +1 -1
  595. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +1 -1
  596. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +1 -1
  597. niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_thalamic_nuclei_sh.py +1 -1
  598. niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg.py +1 -1
  599. niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg2recon.py +1 -1
  600. niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg_long.py +1 -1
  601. niwrap_freesurfer/freesurfer/samsegmesh2surf.py +1 -1
  602. niwrap_freesurfer/freesurfer/sbtiv.py +1 -1
  603. niwrap_freesurfer/freesurfer/seg2filled.py +1 -1
  604. niwrap_freesurfer/freesurfer/seg2recon.py +1 -1
  605. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_bs_sh.py +1 -1
  606. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_long_sh.py +1 -1
  607. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_sh.py +1 -1
  608. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t2_sh.py +1 -1
  609. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_monkey.py +1 -1
  610. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subfields_t1_longitudinal.py +1 -1
  611. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject.py +1 -1
  612. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal.py +1 -1
  613. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal2.py +1 -1
  614. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_old_skull_strip.py +1 -1
  615. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_sc.py +1 -1
  616. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml.py +1 -1
  617. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml.py +1 -1
  618. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml.py +1 -1
  619. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subregions.py +1 -1
  620. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei.py +1 -1
  621. niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei_sh.py +1 -1
  622. niwrap_freesurfer/freesurfer/segpons.py +1 -1
  623. niwrap_freesurfer/freesurfer/setlabelstat.py +1 -1
  624. niwrap_freesurfer/freesurfer/sfa2fieldsign.py +1 -1
  625. niwrap_freesurfer/freesurfer/slicedelay.py +1 -1
  626. niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject.py +1 -1
  627. niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_lh.py +1 -1
  628. niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_rh.py +1 -1
  629. niwrap_freesurfer/freesurfer/spline3_test.py +1 -1
  630. niwrap_freesurfer/freesurfer/spm_t_to_b.py +1 -1
  631. niwrap_freesurfer/freesurfer/spmregister.py +1 -1
  632. niwrap_freesurfer/freesurfer/sratio.py +1 -1
  633. niwrap_freesurfer/freesurfer/stat_normalize.py +1 -1
  634. niwrap_freesurfer/freesurfer/stattablediff.py +1 -1
  635. niwrap_freesurfer/freesurfer/stem2fname.py +1 -1
  636. niwrap_freesurfer/freesurfer/surf2vol.py +1 -1
  637. niwrap_freesurfer/freesurfer/surfreg.py +1 -1
  638. niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_preprocess.py +1 -1
  639. niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_process.py +1 -1
  640. niwrap_freesurfer/freesurfer/t4img_4dfp.py +1 -1
  641. niwrap_freesurfer/freesurfer/t4imgs_4dfp.py +1 -1
  642. niwrap_freesurfer/freesurfer/table2map.py +1 -1
  643. niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_compare.py +1 -1
  644. niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_qc_azs.py +1 -1
  645. niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach.py +1 -1
  646. niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach2.py +1 -1
  647. niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_afd.py +1 -1
  648. niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_avi.py +1 -1
  649. niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_mgh.py +1 -1
  650. niwrap_freesurfer/freesurfer/talsegprob.py +1 -1
  651. niwrap_freesurfer/freesurfer/test_orientation_planes_from_parcellation.py +1 -1
  652. niwrap_freesurfer/freesurfer/test_recon_all_csh.py +1 -1
  653. niwrap_freesurfer/freesurfer/test_tutorials_sh.py +1 -1
  654. niwrap_freesurfer/freesurfer/thickdiffmap.py +1 -1
  655. niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmedit.py +1 -1
  656. niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmeditfv.py +1 -1
  657. niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2.py +1 -1
  658. niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2_cmdl.py +1 -1
  659. niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregisterfv.py +1 -1
  660. niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurfer.py +1 -1
  661. niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurferfv.py +1 -1
  662. niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_all.py +1 -1
  663. niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_paths.py +1 -1
  664. niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_preproc.py +1 -1
  665. niwrap_freesurfer/freesurfer/tractstats2table.py +1 -1
  666. niwrap_freesurfer/freesurfer/train_gcs_atlas.py +1 -1
  667. niwrap_freesurfer/freesurfer/tridec.py +1 -1
  668. niwrap_freesurfer/freesurfer/trk_tools.py +1 -1
  669. niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima1_tcl.py +1 -1
  670. niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima_tcl.py +1 -1
  671. niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_mnc_tcl.py +1 -1
  672. niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir.py +1 -1
  673. niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir2.py +1 -1
  674. niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackmincdir.py +1 -1
  675. niwrap_freesurfer/freesurfer/unpacksdcmdir.py +1 -1
  676. niwrap_freesurfer/freesurfer/update_needed.py +1 -1
  677. niwrap_freesurfer/freesurfer/v_3dvolreg_afni.py +1 -1
  678. niwrap_freesurfer/freesurfer/v_4dfptoanalyze.py +1 -1
  679. niwrap_freesurfer/freesurfer/ventfix.py +1 -1
  680. niwrap_freesurfer/freesurfer/vertexvol.py +1 -1
  681. niwrap_freesurfer/freesurfer/vno_match_check.py +1 -1
  682. niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2segavg.py +1 -1
  683. niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2subfield.py +1 -1
  684. niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2symsurf.py +1 -1
  685. niwrap_freesurfer/freesurfer/vsm_smooth.py +1 -1
  686. niwrap_freesurfer/freesurfer/wfilemask.py +1 -1
  687. niwrap_freesurfer/freesurfer/wm_anat_snr.py +1 -1
  688. niwrap_freesurfer/freesurfer/wmedits2surf.py +1 -1
  689. niwrap_freesurfer/freesurfer/wmsaseg.py +1 -1
  690. niwrap_freesurfer/freesurfer/xcerebralseg.py +1 -1
  691. niwrap_freesurfer/freesurfer/xcorr.py +1 -1
  692. niwrap_freesurfer/freesurfer/xfmrot.py +1 -1
  693. niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemi_tal.py +1 -1
  694. niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemireg.py +1 -1
  695. niwrap_freesurfer/freesurfer/xsanatreg.py +1 -1
  696. niwrap_freesurfer/freesurfer/zero_lt_4dfp.py +1 -1
  697. {niwrap_freesurfer-0.6.1.dist-info → niwrap_freesurfer-0.6.3.dist-info}/METADATA +1 -1
  698. niwrap_freesurfer-0.6.3.dist-info/RECORD +700 -0
  699. niwrap_freesurfer-0.6.1.dist-info/RECORD +0 -700
  700. {niwrap_freesurfer-0.6.1.dist-info → niwrap_freesurfer-0.6.3.dist-info}/WHEEL +0 -0
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multiscale_stats.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_MULTISCALE_STATS_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisMultiscaleStatsParameters = typing.TypedDict('MrisMultiscaleStatsParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_multiscale_stats"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_multiscale_stats"],
18
18
  "output_subject": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "surf": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_niters2fwhm.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_NITERS2FWHM_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisNiters2fwhmParameters = typing.TypedDict('MrisNiters2fwhmParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_niters2fwhm"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_niters2fwhm"],
18
18
  "subject": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "surf": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_nudge.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_NUDGE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisNudgeParameters = typing.TypedDict('MrisNudgeParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_nudge"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_nudge"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "input_volume": InputPathType,
20
20
  "vertex": int,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_parcellate_connectivity.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_PARCELLATE_CONNECTIVITY_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisParcellateConnectivityParameters = typing.TypedDict('MrisParcellateConnectivityParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_parcellate_connectivity"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_parcellate_connectivity"],
18
18
  "smooth_iterations": typing.NotRequired[float | None],
19
19
  "input_surface": InputPathType,
20
20
  "input_correlations": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_place_surface.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_PLACE_SURFACE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisPlaceSurfaceParameters = typing.TypedDict('MrisPlaceSurfaceParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_place_surface"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_place_surface"],
18
18
  "output_surface": str,
19
19
  "input_surface": str,
20
20
  "autodetect_gray_white_stats": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_pmake.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_PMAKE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisPmakeParameters = typing.TypedDict('MrisPmakeParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_pmake"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_pmake"],
18
18
  "options_file": typing.NotRequired[str | None],
19
19
  "working_dir": typing.NotRequired[str | None],
20
20
  "listen_mode": bool,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_preproc.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_PREPROC_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisPreprocParameters = typing.TypedDict('MrisPreprocParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_preproc"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_preproc"],
18
18
  "outfile": str,
19
19
  "target_subject": str,
20
20
  "hemi": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_profile_clustering.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_PROFILE_CLUSTERING_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisProfileClusteringParameters = typing.TypedDict('MrisProfileClusteringParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_profileClustering"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_profileClustering"],
18
18
  "input_file": InputPathType,
19
19
  "output_file": str,
20
20
  "other_options": typing.NotRequired[str | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_refine_surfaces.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REFINE_SURFACES_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRefineSurfacesParameters = typing.TypedDict('MrisRefineSurfacesParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_refine_surfaces"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_refine_surfaces"],
18
18
  "subject_name": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "hires_volume": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REGISTER_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRegisterParameters = typing.TypedDict('MrisRegisterParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_register"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_register"],
18
18
  "surf_fname": InputPathType,
19
19
  "target": InputPathType,
20
20
  "out_fname": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_label_map.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REGISTER_LABEL_MAP_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRegisterLabelMapParameters = typing.TypedDict('MrisRegisterLabelMapParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_register_label_map"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_register_label_map"],
18
18
  "subjects_list": str,
19
19
  "target_subject": str,
20
20
  "prior": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_label.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REGISTER_TO_LABEL_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRegisterToLabelParameters = typing.TypedDict('MrisRegisterToLabelParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_register_to_label"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_register_to_label"],
18
18
  "surface": InputPathType,
19
19
  "regfile": InputPathType,
20
20
  "mri_reg": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_volume.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REGISTER_TO_VOLUME_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRegisterToVolumeParameters = typing.TypedDict('MrisRegisterToVolumeParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_register_to_volume"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_register_to_volume"],
18
18
  "surface": str,
19
19
  "pial": str,
20
20
  "pial_only": typing.NotRequired[str | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remesh.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REMESH_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRemeshParameters = typing.TypedDict('MrisRemeshParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_remesh"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_remesh"],
18
18
  "input": InputPathType,
19
19
  "output": str,
20
20
  "edge_length": typing.NotRequired[float | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_intersection.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REMOVE_INTERSECTION_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRemoveIntersectionParameters = typing.TypedDict('MrisRemoveIntersectionParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_remove_intersection"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_remove_intersection"],
18
18
  "surface_in_file": InputPathType,
19
19
  "corrected_surface_out_file": str,
20
20
  "fill_holes": bool,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_negative_vertices.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REMOVE_NEGATIVE_VERTICES_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRemoveNegativeVerticesParameters = typing.TypedDict('MrisRemoveNegativeVerticesParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_remove_negative_vertices"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_remove_negative_vertices"],
18
18
  "surface_file": InputPathType,
19
19
  "patch_file": InputPathType,
20
20
  "output_patch": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_variance.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REMOVE_VARIANCE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRemoveVarianceParameters = typing.TypedDict('MrisRemoveVarianceParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_remove_variance"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_remove_variance"],
18
18
  "input_surface_file": InputPathType,
19
19
  "curvature_file": InputPathType,
20
20
  "curvature_file_to_remove": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reposition_surface.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REPOSITION_SURFACE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRepositionSurfaceParameters = typing.TypedDict('MrisRepositionSurfaceParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_reposition_surface"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_reposition_surface"],
18
18
  "surf": InputPathType,
19
19
  "volume": InputPathType,
20
20
  "points": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_resample.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_RESAMPLE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisResampleParameters = typing.TypedDict('MrisResampleParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_resample"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_resample"],
18
18
  "atlas_reg": InputPathType,
19
19
  "subject_reg": InputPathType,
20
20
  "subject_surf": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rescale.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_RESCALE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRescaleParameters = typing.TypedDict('MrisRescaleParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_rescale"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_rescale"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "output_surface": str,
20
20
  })
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reverse.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_REVERSE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisReverseParameters = typing.TypedDict('MrisReverseParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_reverse"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_reverse"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "output_surface": str,
20
20
  })
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_label.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_RF_LABEL_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRfLabelParameters = typing.TypedDict('MrisRfLabelParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_rf_label"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_rf_label"],
18
18
  "subject": str,
19
19
  "rf_classifier": str,
20
20
  "output_name": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_train.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_RF_TRAIN_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRfTrainParameters = typing.TypedDict('MrisRfTrainParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_rf_train"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_rf_train"],
18
18
  "subjects": list[str],
19
19
  "output_name": str,
20
20
  "hemi": typing.NotRequired[str | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rotate.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_ROTATE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisRotateParameters = typing.TypedDict('MrisRotateParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_rotate"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_rotate"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "alpha_deg": float,
20
20
  "beta_deg": float,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_label.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SAMPLE_LABEL_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSampleLabelParameters = typing.TypedDict('MrisSampleLabelParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_sample_label"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_sample_label"],
18
18
  "input_label_file": InputPathType,
19
19
  "input_surface_file": InputPathType,
20
20
  "output_label_file": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_parc.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SAMPLE_PARC_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSampleParcParameters = typing.TypedDict('MrisSampleParcParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_sample_parc"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_sample_parc"],
18
18
  "subject_name": str,
19
19
  "hemisphere": str,
20
20
  "parc_name": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_seg2annot.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SEG2ANNOT_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSeg2annotParameters = typing.TypedDict('MrisSeg2annotParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_seg2annot"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_seg2annot"],
18
18
  "surfseg": InputPathType,
19
19
  "colortable": typing.NotRequired[InputPathType | None],
20
20
  "auto_ctab": typing.NotRequired[str | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SEGMENT_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSegmentParameters = typing.TypedDict('MrisSegmentParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_segment"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_segment"],
18
18
  "subjects": list[str],
19
19
  "output_subject": str,
20
20
  "output_file": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment_vals.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SEGMENT_VALS_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSegmentValsParameters = typing.TypedDict('MrisSegmentValsParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_segment_vals"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_segment_vals"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "input_curv_file": InputPathType,
20
20
  "output_curv_file": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segmentation_stats.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SEGMENTATION_STATS_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSegmentationStatsParameters = typing.TypedDict('MrisSegmentationStatsParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_segmentation_stats"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_segmentation_stats"],
18
18
  "overlay_name": str,
19
19
  "segmentation_label_name": str,
20
20
  "subjects": list[str],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_shrinkwrap.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SHRINKWRAP_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisShrinkwrapParameters = typing.TypedDict('MrisShrinkwrapParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_shrinkwrap"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_shrinkwrap"],
18
18
  "volume": InputPathType,
19
19
  "output_name": str,
20
20
  "threshold": typing.NotRequired[float | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_simulate_atrophy.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SIMULATE_ATROPHY_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSimulateAtrophyParameters = typing.TypedDict('MrisSimulateAtrophyParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_simulate_atrophy"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_simulate_atrophy"],
18
18
  "subject": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "label": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_skeletonize.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SKELETONIZE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSkeletonizeParameters = typing.TypedDict('MrisSkeletonizeParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_skeletonize"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_skeletonize"],
18
18
  "surface": str,
19
19
  "surfvals": str,
20
20
  "mask": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SMOOTH_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSmoothParameters = typing.TypedDict('MrisSmoothParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_smooth"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_smooth"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "output_surface": str,
20
20
  "average_iters": typing.NotRequired[float | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth_intracortical.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SMOOTH_INTRACORTICAL_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSmoothIntracorticalParameters = typing.TypedDict('MrisSmoothIntracorticalParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_smooth_intracortical"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_smooth_intracortical"],
18
18
  "surf_dir": str,
19
19
  "surf_name": str,
20
20
  "overlay_dir": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sphere.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SPHERE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSphereParameters = typing.TypedDict('MrisSphereParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_sphere"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_sphere"],
18
18
  "surface_file": InputPathType,
19
19
  "patch_file": InputPathType,
20
20
  "output_patch": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_spherical_average.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SPHERICAL_AVERAGE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSphericalAverageParameters = typing.TypedDict('MrisSphericalAverageParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_spherical_average"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_spherical_average"],
18
18
  "which": typing.Literal["coords", "label", "vals", "curv", "area"],
19
19
  "fname": str,
20
20
  "hemi": typing.Literal["lh", "rh"],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surf2vtk.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SURF2VTK_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSurf2vtkParameters = typing.TypedDict('MrisSurf2vtkParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_surf2vtk"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_surf2vtk"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "output_surface": str,
20
20
  })
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_stats.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SURFACE_STATS_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSurfaceStatsParameters = typing.TypedDict('MrisSurfaceStatsParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_surface_stats"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_surface_stats"],
18
18
  "nsmooth": typing.NotRequired[float | None],
19
19
  "surf_name": InputPathType,
20
20
  "mask_name": typing.NotRequired[InputPathType | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_to_vol_distances.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_SURFACE_TO_VOL_DISTANCES_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisSurfaceToVolDistancesParameters = typing.TypedDict('MrisSurfaceToVolDistancesParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_surface_to_vol_distances"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_surface_to_vol_distances"],
18
18
  "average_subject": str,
19
19
  "hemisphere": str,
20
20
  "subjects": list[str],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_talairach.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_TALAIRACH_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisTalairachParameters = typing.TypedDict('MrisTalairachParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_talairach"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_talairach"],
18
18
  "input_image": InputPathType,
19
19
  })
20
20
 
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_target_pos.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_TARGET_POS_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisTargetPosParameters = typing.TypedDict('MrisTargetPosParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_target_pos"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_target_pos"],
18
18
  "input_volume": InputPathType,
19
19
  "input_surface": InputPathType,
20
20
  "output_surface": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_THICKNESS_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisThicknessParameters = typing.TypedDict('MrisThicknessParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_thickness"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_thickness"],
18
18
  "subject_name": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "thickness_file": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_comparison.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_THICKNESS_COMPARISON_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisThicknessComparisonParameters = typing.TypedDict('MrisThicknessComparisonParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_thickness_comparison"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_thickness_comparison"],
18
18
  "subject": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "thickness_file": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_diff.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_THICKNESS_DIFF_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisThicknessDiffParameters = typing.TypedDict('MrisThicknessDiffParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_thickness_diff"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_thickness_diff"],
18
18
  "src_type": typing.NotRequired[str | None],
19
19
  "trg_type": typing.NotRequired[str | None],
20
20
  "out_file": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_topo_fixer.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_TOPO_FIXER_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisTopoFixerParameters = typing.TypedDict('MrisTopoFixerParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_topo_fixer"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_topo_fixer"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "output_surface": str,
20
20
  })
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transform.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_TRANSFORM_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisTransformParameters = typing.TypedDict('MrisTransformParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_transform"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_transform"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "transform": InputPathType,
20
20
  "output_surface": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_translate_annotation.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_TRANSLATE_ANNOTATION_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisTranslateAnnotationParameters = typing.TypedDict('MrisTranslateAnnotationParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_translate_annotation"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_translate_annotation"],
18
18
  "subject": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "in_annot": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transmantle_dysplasia_paths.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_TRANSMANTLE_DYSPLASIA_PATHS_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisTransmantleDysplasiaPathsParameters = typing.TypedDict('MrisTransmantleDysplasiaPathsParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_transmantle_dysplasia_paths"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_transmantle_dysplasia_paths"],
18
18
  "surface": InputPathType,
19
19
  "aseg_volume": InputPathType,
20
20
  "intensity_volume": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_VOLMASK_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisVolmaskParameters = typing.TypedDict('MrisVolmaskParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_volmask"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_volmask"],
18
18
  "cap_distance": typing.NotRequired[float | None],
19
19
  "label_background": typing.NotRequired[float | None],
20
20
  "label_left_white": typing.NotRequired[float | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_novtk.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_VOLMASK_NOVTK_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisVolmaskNovtkParameters = typing.TypedDict('MrisVolmaskNovtkParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_volmask_novtk"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_volmask_novtk"],
18
18
  "io": str,
19
19
  "cap_distance": typing.NotRequired[float | None],
20
20
  "label_background": typing.NotRequired[float | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_vtk.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_VOLMASK_VTK_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisVolmaskVtkParameters = typing.TypedDict('MrisVolmaskVtkParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_volmask_vtk"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_volmask_vtk"],
18
18
  "cap_distance": typing.NotRequired[float | None],
19
19
  "label_background": typing.NotRequired[float | None],
20
20
  "label_left_white": typing.NotRequired[float | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volsmooth.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_VOLSMOOTH_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisVolsmoothParameters = typing.TypedDict('MrisVolsmoothParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_volsmooth"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_volsmooth"],
18
18
  "input_volume": InputPathType,
19
19
  "output_volume": str,
20
20
  "registration": InputPathType,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volume.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_VOLUME_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisVolumeParameters = typing.TypedDict('MrisVolumeParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_volume"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_volume"],
18
18
  "surface_file": InputPathType,
19
19
  "verbose_flag": bool,
20
20
  })
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_warp.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_WARP_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisWarpParameters = typing.TypedDict('MrisWarpParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_warp"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_warp"],
18
18
  "deformvol": typing.NotRequired[str | None],
19
19
  "m3z": typing.NotRequired[str | None],
20
20
  "regfile": typing.NotRequired[str | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_watershed.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_WATERSHED_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisWatershedParameters = typing.TypedDict('MrisWatershedParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_watershed"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_watershed"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "input_gradient_field": InputPathType,
20
20
  "output_annotation": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_wm_volume.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRIS_WM_VOLUME_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrisWmVolumeParameters = typing.TypedDict('MrisWmVolumeParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mris_wm_volume"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mris_wm_volume"],
18
18
  "subject": str,
19
19
  "hemi": str,
20
20
  "subjects_dir": typing.NotRequired[str | None],
niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_paint.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRISP_PAINT_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrispPaintParameters = typing.TypedDict('MrispPaintParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mrisp_paint"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mrisp_paint"],
18
18
  "template_file": InputPathType,
19
19
  "input_surface": InputPathType,
20
20
  "output_name": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_write.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MRISP_WRITE_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MrispWriteParameters = typing.TypedDict('MrispWriteParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["mrisp_write"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["mrisp_write"],
18
18
  "input_surface": InputPathType,
19
19
  "overlay_filename": InputPathType,
20
20
  "output_name": str,
niwrap_freesurfer/freesurfer/ms_refine_subject.py CHANGED
@@ -14,7 +14,7 @@ MS_REFINE_SUBJECT_METADATA = Metadata(
14
14
 
15
15
 
16
16
  MsRefineSubjectParameters = typing.TypedDict('MsRefineSubjectParameters', {
17
- "__STYX_TYPE__": typing.Literal["ms_refine_subject"],
17
+ "__STYXTYPE__": typing.Literal["ms_refine_subject"],
18
18
  "subjects_dir": str,
19
19
  })
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