niwrap-freesurfer 0.5.0__py3-none-any.whl

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  1. niwrap_freesurfer/freesurfer/__init__.py +726 -0
  2. niwrap_freesurfer/freesurfer/analyzeto4dfp.py +234 -0
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  252. niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_change_map.py +228 -0
  253. niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_distances.py +194 -0
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/cor_to_minc.py,sha256=XZC66SZaqhxLLr6m195KA8gXZXc3kTLz-5gsb3iy33I,4254
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40
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41
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42
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdir_info_mgh.py,sha256=3Mapn1XdD-vvy-k5CG6yA1GHQ45d6Qp7ooS4gfn2WNA,5674
43
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdjpeg_fs.py,sha256=M-ppYYvsKmWC8IK78kuLNQ0ZnSfznP16Mt8YfDqzX_U,18970
44
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdrle_fs.py,sha256=lYywTUtVXkLlP9NG9tBRTmGpRINEbNiRq1kLFEngCv0,15339
45
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmsplit.py,sha256=W1KbVOi2OfHickUAmAtvO8XduFkKrSX96TAzaVXwRZg,6933
46
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmunpack.py,sha256=5zj8Z6-0segAY1Q9Nvvc_7mCcZss_yxmauKoF06GTaQ,18777
47
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/deface_subject.py,sha256=2LEMr_wnqWMYmN4uPbULJpw5kSS8wbyZ62pO16Lkw3M,5268
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/defect2seg.py,sha256=Ctj7YZKcwOscquml_M7ZPjF_kCG0DNdb1fxjc887s54,7402
49
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/defect_seg.py,sha256=VSk5UM0oCbLP5jdLa_c6YFkBvIsuixOfQvbGB3SdizU,5863
50
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dicom_rename.py,sha256=f5pLHhKtpUTlOk4wcRzAg090God2PwXBkHChBtDKOTI,4642
51
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/diffusion_utils.py,sha256=NgQR96v3XYb3XAjPXtVgTwvph1MWZb5bedoEEO3_7MM,4156
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_ac_sh.py,sha256=uPptA6u60qRbVzlXp53B24KdBxeij068U2Zd4dT89N4,4012
53
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54
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_bset.py,sha256=N9Zug2AYII7l6JJ41yS-7iDVsfpDiC9tx9qrM1Mc1Z0,8545
55
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_colored_fa.py,sha256=iuDMJN8rssb22pqya80zTHbL6hvIRvZABqEd3nCz3kM,4567
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61
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62
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63
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66
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86
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87
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172
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242
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259
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gdfglm.py,sha256=eO45X2ymYjUaaxp1OucjKeeuk3vET9Ps4ZRV2kq2a9E,3772
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352
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353
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354
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355
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356
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_path2label.py,sha256=FnTtzL4_6FtGMz3lPnBjqgGfGcGrvSl6cRuupK1FrdY,8716
358
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_polv.py,sha256=5rXUVlxUsCg1YKpOWupinXL1-MIVdfcNk6r9oYu4Imw,4966
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_pretess.py,sha256=BsIvmWe4iqSzY0XUn-ECyh0xmkH8W1NQoDgH7tWt0dM,6838
360
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362
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_reorient_lr_csh.py,sha256=7Mj1o5r_lQlurcXXBiLYrd-gLl-k-BzBQJ5OjTeXRYU,6456
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_long_train.py,sha256=Wgm1wnErv-n3omR8e-JSz1zIQ0cL5hY4t7VLjUMX51w,7709
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373
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374
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375
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472
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473
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474
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490
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491
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492
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493
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494
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multimodal_surface_placement.py,sha256=PbOf373nc4sH3DfBQqEtDbfMlxBiABaZ3KAFS-Ll1v8,9676
495
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multiscale_stats.py,sha256=eYTyLrYch51PY6gua0EVaXlvasZkMSreFjSAgiywELw,5854
496
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_niters2fwhm.py,sha256=IaD9NHtQqFKBBcsMjhIww8qczP1xE0y-Utf7HicL8Yc,6205
497
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498
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499
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500
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501
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_preproc.py,sha256=4pCnkoo71-ZU1cmmAjCRYtADsM2lJ142eD0kI4zwWVQ,24953
502
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_profile_clustering.py,sha256=Nznj1XZ2Z2If7Xip7VSYgdd-K6ljdv8q8lL6ijynBzc,5346
503
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_refine_surfaces.py,sha256=pm3E38CUCLhSdcPVhn67Z9qgMvTLt59GCUJDNSMt2cU,7278
504
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register.py,sha256=GAUuDubrE0A8x1J-iKQl9tJKbO2lC04QUc3cPAvVQpI,32362
505
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_label_map.py,sha256=Riqqjf92jNT-6wUYiImekG4mNCimKf6b1ga2ROgewbY,7528
506
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_label.py,sha256=rHYdunrQPM_B6TOROVlHKkOHcptSOS6Rrrwok4QtlyM,8853
507
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_volume.py,sha256=wnIIKzSaBPlvsHvXJK8wzNKrfNtHbKCcA1r7u57GSnw,14996
508
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remesh.py,sha256=2rwkcdmELliGmSBZto690mTSqEQJhN1uaTnFRHLErOQ,6788
509
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_intersection.py,sha256=yqGHL8FJUvpM4N0TnOLrQoCPmOhWQJSLNYAuourffHs,6669
510
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_negative_vertices.py,sha256=K6ex-s8OBTIG5la_iGooVr4jV89AjDYt5-1ZEpCyVVQ,5297
511
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_variance.py,sha256=VildQR5qZvMTu5GdKEM3HFfgDz1JXsmTPC9iMwALAow,5896
512
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reposition_surface.py,sha256=GegKw_Ey1SdMaEu06DmQ20G6gEKK9CSJ2aWGKgWKPV8,6582
513
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_resample.py,sha256=YwvEMfRDLDUdrhXMPuTsmuA3QephbUQeTop8pNd8w_4,6687
514
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rescale.py,sha256=VhlxvlcnyNIXR2hyvwWZvSIKl-Y9a5QSajLsitraQhg,4514
515
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reverse.py,sha256=eQWULyztDOm0L6muYwkDEVOpYlZ4AghrKYpdrPwB5E4,4432
516
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_label.py,sha256=IxhyVb18l5LhGA9DjjvK-GVisoyk_2PT3bPUZJZBPzQ,5311
517
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_train.py,sha256=gWUAVTAd1u70-NIzXRfAwmzJD93IOOFrfLUk3uOUqxU,5142
518
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rotate.py,sha256=RDbhbDKDlgEfEa1x4mD6mgr8SAYL8NZ9fXOmqsqnM8U,6287
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_label.py,sha256=emX1kz1s-sJ6_EtWpBgokj3C4IV-7wkqC8AfrUWTT54,5021
520
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_parc.py,sha256=fOtvuo14B0pYhwXq1UOLCXPWeDWCf7p8qceidqlX03M,13558
521
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_seg2annot.py,sha256=_j_btBmgumx9vfYsOyLyYU19nR1muXgyhEYBJIAA26M,8084
522
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment.py,sha256=A0EfsJ0ISNfZevdjUX1FprdFQTt_o-eHi3ArhTrMW14,4609
523
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment_vals.py,sha256=s_PvkBjagQuumez7eoHRwJL7juWLm2ynr24zjzA8IVc,6008
524
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segmentation_stats.py,sha256=wHO9DNRkuIJFf3xpoUPSvUMM1bekt_aA8wxILBsdKkA,5352
525
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_shrinkwrap.py,sha256=7Y0U7xI-kbswLPuEJF4wuE-pMd5sk1HY6onMfnkuHfc,5443
526
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_simulate_atrophy.py,sha256=eVKbXzpphHZOlcL_e8FSG2RURhto1hzyQAGObqjCYiI,6376
527
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_skeletonize.py,sha256=gvRpfapx4hlgQGWUH6jaPoyRRJ_iqv-BpXchBaV8vF0,10454
528
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth.py,sha256=psQJRrC3DsA9D9IroPwvDxpLFaFk98NxJuGywv2Pbz0,9507
529
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth_intracortical.py,sha256=Afy5BTk-8mCOIPuW_vx30Ee1D9JWNA_ItOEoXVGbQFc,9347
530
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sphere.py,sha256=8oNCW__WGmDRWzwDF3Mu-fKiEGQ-21I-55I-VsPWkN4,4660
531
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_spherical_average.py,sha256=wnTJ6RQAllhCkYfJXWynrqYSJVkw7f9qHTWNfPV1XLA,6383
532
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surf2vtk.py,sha256=NiwBx49X_DX9ky3invORMPJFBGJjKKj-7YuJgEYe5z0,4548
533
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_stats.py,sha256=uDpmzM1D8-RTJJShpL_IUf3oMfyqo_6uUt7WkXmqsws,10912
534
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_to_vol_distances.py,sha256=kgHcAtN94-b9pC-xNEb3hS_0VJr1OYiyZ0HrfBGP_VQ,5631
535
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_talairach.py,sha256=MXHpSKZ7gd_Pd97OD6AtD-lhs0q19ALtGydOLlTYTrU,4032
536
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_target_pos.py,sha256=OeSocNb49zoOQn5KT-vJFT-8fLQcsyEYvm6cLga4wkc,8764
537
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness.py,sha256=dGDCsni0lgkUjrpyjcZE6Fs3SYqyOR6xvAOgde8zb_A,7131
538
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_comparison.py,sha256=EZPHobIAaTr0M2-B3qpxYQijkFY8h9qSjq4SPJxJy08,5523
539
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_diff.py,sha256=limUJwJDBVP0DOnfAv76HQKvbYHFoX-t8ETOJGH0KHw,9857
540
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_topo_fixer.py,sha256=55pqK4SbwauFEIsDovghH50lh4wV-kYq7Gqvgmc9Vbs,4653
541
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transform.py,sha256=lqO6LMt94EfXUfAL-wxrCt-Tsb9RdsnQyVS5uc343tw,6721
542
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_translate_annotation.py,sha256=DwGLZKBoafcTupjQ6J1irEq-13YA15Y_yqAQ-O516Ys,5677
543
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transmantle_dysplasia_paths.py,sha256=txUJvRk6u0X2JuM-cEdw9-Nl8z4balX5OH5LZaQWK08,6945
544
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask.py,sha256=S9OKDBQs7JlszTCcX6YFyHbTDYK-itZVfrN_aHS8BM0,13000
545
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_novtk.py,sha256=1vv7gtuVPMDAUe8P7nyqrUqzr7ktK5t3_lsQMfKAJaU,12507
546
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_vtk.py,sha256=7EAY1AcTojGuPlsGCoVYd5Y_gjrwH5S_X4_xg8lMvi4,13745
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548
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_watershed.py,sha256=iBrt7_j4McHQzgFfgqCSr05BEnEfkDzDzKBkGGdi5So,6253
551
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_wm_volume.py,sha256=8brGBLABFeGKeQO2iIsg-DG2RpvjdglrBbuHvI9wZPI,5963
552
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_paint.py,sha256=WcQkmfNtruHW02sJQDgeRuF1FjzCUTJEoPXA6_Fl6Jg,11189
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_write.py,sha256=hjaFK8bXu5KYm2ZX_Aj7d2-t5B4tDFgVcj8rcYsszAA,9161
554
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/ms_refine_subject.py,sha256=GQ4lJ5sk6EW31NKfoW3lVY0FyCyvxfqERoxCd18moRs,4071
555
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/nmovie_qt.py,sha256=cZPZCZATvQZoRtYNJ0_aMNUiFhMCjpZ-FBMitRxK4Nc,3903
556
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/oct_register_mosaic.py,sha256=svStHn09UDKLKed2_K5C8FwqgKT49RQPsOAw7uZkT5I,6034
557
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/optseq2.py,sha256=1mh9iNe8io824drQS89mzFgL6svUOd7zvwaZw7Rysjw,18898
558
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/orient_las.py,sha256=5iowqwc7Zl5ZO9XcYkmQ3sgsI1KSjtLSt8B5vJBa8yA,4816
559
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/parc_atlas_jackknife_test.py,sha256=_JO1Ew9rhPXR6rOxFbLiXeV5Ccy65yNmUNeNsGF5So0,8959
560
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/pctsurfcon.py,sha256=JBaXIAyj_oA0-4ZBSLyr1ERrTseqZbRoKOnseW22Aos,8344
561
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/plot_structure_stats_tcl.py,sha256=KJrD0CuZbqeqVRUw7IF9LZJOMr99aOqhARLgu-sN0T0,4711
562
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/pointset2label.py,sha256=Kv03CPC8_mwjBSpszG7m2HedBaYa1N_q7lHzBiax-Ss,5566
563
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564
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565
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/predict_v1_sh.py,sha256=okqybODhDW5P4Cexisfh49wy20jKfx5sYWp2cDEO96w,5822
566
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/print_unique_labels_csh.py,sha256=CpnhM-uC5JLI3CIILmydfQ-RyDbb2qKBWvENl-omFsY,4871
567
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/qatools_py.py,sha256=Tn39kFrtbrSrVIeMhvnfP8ti03qJG2hR_YKdaN44xG8,6935
568
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_brainstem_structures_sh.py,sha256=IfqAu3Kpvu6MFsCnvXUjx39lCC5ZUen13aunC_Cxwa4,5709
569
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_hasubregions_sh.py,sha256=Mpy9-xoH8JthZD0-LBf0496iq7a7H-8yaBgt4AmUSGE,5705
570
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_thalamic_nuclei_sh.py,sha256=NXFR3Zsrh3c6YbIBEavf9ReXxIUcU66eV3r-ikoJQig,5438
571
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rbbr.py,sha256=bJcz9Wo4s9a79pEuZYiqCT6wdLMi7Gv3azYVv-0Ioxo,11369
572
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_base_init.py,sha256=tNgKQUcHjsVjArYexEU5kiD7DkcSoiLq5I-3GOYVm9U,4920
573
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config.py,sha256=eKt_yaHesOEoafsaluclXsoxEqDEppJPjZHC8sEVB3k,5164
574
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config2csh.py,sha256=mYhc0jdbgoqlO3Bn1sjB0JFJ-nWhAkx4NSPBzXZUsNo,4056
575
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_fix_ento.py,sha256=NlVElvXPTFr3Bc9jPFmvyMqr4Urn8RAxrx0EGE2UBQI,6414
576
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_long_tp_init.py,sha256=h-h8Yb_Gkg3-4Auxa11g0SqCuTxQYy0Chvjekf_v9ro,6141
577
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rcbf_prep.py,sha256=-24C7bzBDKw1l5k8o5XnlS530wWQhrXpWarshtAWP-E,6998
578
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all.py,sha256=7tNBHq_dPKtuR9PyvCBMu8nlXny3pn44vjXRt6GGTMg,30133
579
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_clinical_sh.py,sha256=FOJn4Ayro1919lC8av5iPd8GxCiFz-W95MLWVZupVsI,5601
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_exvivo.py,sha256=Lsbw4An-qqUjeDjIP1jYdpo6_2BE4VxZAb5QvsJ5x5M,4869
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582
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_feat2anat.py,sha256=tHXAe1StMcXwD-D8U2Ok2zFzXrIAv6BB-cTeDAOYhYk,11033
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_mni305_2mm.py,sha256=H8niVfbEZe9r87jEYKvtoF1T7GJp1q78EfWrqYrvtDI,4796
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/regdat2xfm.py,sha256=hhVFfWebiEMaWFkX-X87_H6v_m7ng5wytyfIFLU5oMo,4178
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592
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_lh.py,sha256=nsOwpfCySvKf1vPUbZ3j9VHlpTp25GUFM5PyHIvoG9Q,4410
593
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_rh.py,sha256=UVmo-RahGtnJQ0PXNCIhjTzntdZE2ngQzUykpd8Yjyc,4933
594
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/remove_talairach.py,sha256=jgG3fkKd-WvDgxwYI09G2RbloLErfSOKdufPCxi4RkQ,4795
595
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_subject_keep_editting.py,sha256=L5iuyklMRUCocFYrnFTaTuyZoJhTGrBqUvOa_Zy01VE,4620
596
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_t1_subject.py,sha256=CcEtXssMWOY3mGvkjn1pWZVWUXspJZ3dCMlkB89Za_M,4305
597
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/reregister_subject_mixed.py,sha256=c1mrqEHqJA-6bAAvmm0OjI8dNsjNX0-Jeh1lERMpPiY,5804
598
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/rtview.py,sha256=sCIJVhAZtYE5QuyCGlxaKqgyZHDgTMuqP9ihGqI2dbE,8197
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+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_mris_preproc.py,sha256=D7tOjCXbHOTyMjleRl6hU3ivdifSmRqvZfpix97mKk8,4645
600
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_qdec_glm.py,sha256=W6EIRmuX80zUyYPAMcngAcomRhD4ctIkfLvikijwpyI,3935
601
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg.py,sha256=1XvbrVk1SCkQ5EVdXZCjKREdvvq29l735ovBlI9Faoo,18717
602
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg_long.py,sha256=8-RWSWi6lFQsJQbnQpW1m4tPaJpcofIo1Hz7Bjq__38,14347
603
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subfields_t1_longitudinal_sh.py,sha256=6dFvDhdRPcqdrnrfMdYjg0t_AKEH9LX1yVJUqX6mKP4,5505
604
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_sh.py,sha256=44h8dqOWxDEStE3VUF3TRG0N8D_6FTd60xyn1iDtg4s,5049
605
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml_sh.py,sha256=xPm5s7H-Uqb7zJOdUoqfBnboojHIFZWXNN_uXL0S1Ho,5756
606
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py,sha256=HvX1nljQM5UTVa9H6ddBR5hsfO-aDjouyIKRPck-Apo,5954
607
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py,sha256=WmDOlauvwZLq6AXXjnNzI2tlPRFcqNtAvYMTito6JRM,6132
608
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_thalamic_nuclei_sh.py,sha256=4rwf4eeEUKZufnm4Mw--4KpDAMJVZNhM5_IjmwE3gF0,4907
609
+ niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg.py,sha256=L2nVCveNqOgIzvpn8Dw3f4L7UjNvr7e7FZ6zJQ8i-wQ,25223
610
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611
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