gwaslab 3.6.0__py3-none-any.whl → 3.6.1__py3-none-any.whl

gwaslab/g_version.py

@@ -15,8 +15,8 @@ def _get_version():
 def gwaslab_info():
     # version meta information
     dic={
-   "version":"3.6.0",
-   "release_date":"20250504"
+   "version":"3.6.1",
+   "release_date":"20250506"
     }
     return dic   
 

gwaslab/util_in_meta.py

@@ -7,7 +7,6 @@ from gwaslab.g_Log import Log
 from gwaslab.io_to_pickle import load_data_from_pickle
 from gwaslab.g_Sumstats import Sumstats
 import gc
-import statsmodels.api as sm
 
 def meta_analyze(sumstats_list,
                  random_effects=False, 

gwaslab/util_in_meta_polars.py

@@ -6,9 +6,7 @@ from scipy.stats import norm
 from gwaslab.g_Log import Log
 from gwaslab.io_to_pickle import load_data_from_pickle
 from gwaslab.g_Sumstats import Sumstats
-import gc
 import polars as pl
-import statsmodels.api as sm
 ########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################
 ########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################
 ########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################

{gwaslab-3.6.0.dist-info → gwaslab-3.6.1.dist-info}/METADATA

@@ -1,6 +1,6 @@
 Metadata-Version: 2.4
 Name: gwaslab
-Version: 3.6.0
+Version: 3.6.1
 Summary: A collection of handy tools for GWAS SumStats
 Author-email: Yunye <yunye@gwaslab.com>
 Project-URL: Homepage, https://cloufield.github.io/gwaslab/
@@ -25,6 +25,7 @@ Requires-Dist: scikit-allel>=1.3.5
 Requires-Dist: pyensembl==2.2.3
 Requires-Dist: gtfparse==1.3.0
 Requires-Dist: h5py>=3.10.0
+Requires-Dist: pyarrow
 Dynamic: license-file
 
 # GWASLab

{gwaslab-3.6.0.dist-info → gwaslab-3.6.1.dist-info}/RECORD

@@ -18,7 +18,7 @@ gwaslab/g_meta.py,sha256=pXtSsQfFPv2UJmOxKMmLtcsp_Ku_H73YP7PnlfMd0sg,6472
 gwaslab/g_meta_update.py,sha256=dWgz4kcq9bvsXycCjfhoYtcJHlEP4HRdYoQ8KFqMyTQ,2490
 gwaslab/g_vchange_status.py,sha256=w3zsYYOcCaI3PTeboonvkQjudzUAfVIgATzRdiPViZs,1939
 gwaslab/g_vchange_status_polars.py,sha256=kxyGQCur0ibVFBCyZghA-XNf_kLDXKK-l7VC-Om2IdA,1839
-gwaslab/g_version.py,sha256=o8J0x9TeG_k6wUFeFHrx1HQA4JK3mxYQakjlpBACIX8,1889
+gwaslab/g_version.py,sha256=U5RKVaP711pSTX5OzNta51b7Np64kCdo7Gg09AFfD-o,1889
 gwaslab/hm_casting.py,sha256=xoq1E4Tp5VC4aLWfq9-_AfiQzb1WZAHrnZG33W4sCOE,14178
 gwaslab/hm_casting_polars.py,sha256=_3ZeMg3mRsa7vHpxObFErOledpaydhC_PxStcwlYO2c,8371
 gwaslab/hm_harmonize_sumstats.py,sha256=2MeWnWmMHpLWjUMTVqExpg_3mE1VIaBsh6Mz3ffJCMc,84761
@@ -78,8 +78,8 @@ gwaslab/util_in_filter_value.py,sha256=dr1ZiTsMoYZKznQtucHBFW2mVYOv9OTESb24vXNcS
 gwaslab/util_in_get_density.py,sha256=kpKXH69acMkeYVG5vs-VbJC3COhmuLBfYco-wuOxgjc,3934
 gwaslab/util_in_get_sig.py,sha256=jOMdDu1iWq5-qs8crHLNvn4t12VHSGQp0kG-ce2l3pQ,42441
 gwaslab/util_in_merge.py,sha256=KB5VKRTUUZ1XGYUxgCP_l3cWYanjthMdwiZ_DincCZQ,2020
-gwaslab/util_in_meta.py,sha256=3OxpnigfaShV7995-1HCbGCwdIjSbsDhC2X7hnT28jo,18712
-gwaslab/util_in_meta_polars.py,sha256=i_2DGSDX8KlR3gtuDPXw88a_rbGYWIb58J1MGDMbJx8,8426
+gwaslab/util_in_meta.py,sha256=_oEWvOvj6DG28sljstS0SYl8sm7oP-5pspGRvqbnipA,18683
+gwaslab/util_in_meta_polars.py,sha256=WgAelsxtvheHA-Jq1sbxh02nDhyTFHxBpP3G-iSRREY,8387
 gwaslab/util_in_snphwe.py,sha256=-KpIDx6vn_nah6H55IkV2OyjXQVXV13XyBL069WE1wM,1751
 gwaslab/viz_aux_annotate_plot.py,sha256=IyGhqFQofrVW9A8UxJ5oNVH96czQ-2_i4s1lVvf2hww,25696
 gwaslab/viz_aux_chromatin.py,sha256=aWZaXOSvGyZY7wQcoFDaqHRYCSHZbi_K4Q70HruN9ts,4125
@@ -111,9 +111,9 @@ gwaslab/data/hapmap3_SNPs/hapmap3_db150_hg19.snplist.gz,sha256=qD9RsC5S2h6l-OdpW
 gwaslab/data/hapmap3_SNPs/hapmap3_db151_hg38.snplist.gz,sha256=Y8ZT2FIAhbhlgCJdE9qQVAiwnV_fcsPt72usBa7RSBM,10225828
 gwaslab/data/high_ld/high_ld_hla_hg19.bed.gz,sha256=R7IkssKu0L4WwkU9SrS84xCMdrkkKL0gnTNO_OKbG0Y,219
 gwaslab/data/high_ld/high_ld_hla_hg38.bed.gz,sha256=76CIU0pibDJ72Y6UY-TbIKE9gEPwTELAaIbCXyjm80Q,470
-gwaslab-3.6.0.dist-info/licenses/LICENSE,sha256=OXLcl0T2SZ8Pmy2_dmlvKuetivmyPd5m1q-Gyd-zaYY,35149
-gwaslab-3.6.0.dist-info/licenses/LICENSE_before_v3.4.39,sha256=GhLOU_1UDEKeOacYhsRN_m9u-eIuVTazSndZPeNcTZA,1066
-gwaslab-3.6.0.dist-info/METADATA,sha256=1zEw4VZiB6U6BVKjPqj2NkOSZtq1K9Q6WhpUcVlwigk,7020
-gwaslab-3.6.0.dist-info/WHEEL,sha256=GHB6lJx2juba1wDgXDNlMTyM13ckjBMKf-OnwgKOCtA,91
-gwaslab-3.6.0.dist-info/top_level.txt,sha256=PyY6hWtrALpv2MAN3kjkIAzJNmmBTH5a2risz9KwH08,8
-gwaslab-3.6.0.dist-info/RECORD,,
+gwaslab-3.6.1.dist-info/licenses/LICENSE,sha256=OXLcl0T2SZ8Pmy2_dmlvKuetivmyPd5m1q-Gyd-zaYY,35149
+gwaslab-3.6.1.dist-info/licenses/LICENSE_before_v3.4.39,sha256=GhLOU_1UDEKeOacYhsRN_m9u-eIuVTazSndZPeNcTZA,1066
+gwaslab-3.6.1.dist-info/METADATA,sha256=HE25IdF4FRLHwtbRzZoaERNZHJxhGLR1wUzTu2DSNwU,7043
+gwaslab-3.6.1.dist-info/WHEEL,sha256=0CuiUZ_p9E4cD6NyLD6UG80LBXYyiSYZOKDm5lp32xk,91
+gwaslab-3.6.1.dist-info/top_level.txt,sha256=PyY6hWtrALpv2MAN3kjkIAzJNmmBTH5a2risz9KwH08,8
+gwaslab-3.6.1.dist-info/RECORD,,

{gwaslab-3.6.0.dist-info → gwaslab-3.6.1.dist-info}/WHEEL

@@ -1,5 +1,5 @@
 Wheel-Version: 1.0
-Generator: setuptools (80.3.0)
+Generator: setuptools (80.3.1)
 Root-Is-Purelib: true
 Tag: py3-none-any