codeine 0.1.0__py3-none-any.whl

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codeine/translation/data/tables.json ADDED
@@ -0,0 +1,2252 @@
1
+ {
2
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3
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4
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5
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6
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135
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184
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329
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336
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+ "TGA"
338
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339
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341
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342
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354
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355
+ "ATC": "I",
356
+ "ATG": "M",
357
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358
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359
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362
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363
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364
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367
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402
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408
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409
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410
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411
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412
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414
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416
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417
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418
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419
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420
+ "TAA",
421
+ "TAG"
422
+ ]
423
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426
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432
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443
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444
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445
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446
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447
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448
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449
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450
+ "CGA": "R",
451
+ "CGC": "R",
452
+ "CGG": "R",
453
+ "CGT": "R",
454
+ "CTA": "L",
455
+ "CTC": "L",
456
+ "CTG": "L",
457
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+ "GAT": "D",
462
+ "GCA": "A",
463
+ "GCC": "A",
464
+ "GCG": "A",
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+ "GCT": "A",
466
+ "GGA": "G",
467
+ "GGC": "G",
468
+ "GGG": "G",
469
+ "GGT": "G",
470
+ "GTA": "V",
471
+ "GTC": "V",
472
+ "GTG": "V",
473
+ "GTT": "V",
474
+ "TAA": "Y",
475
+ "TAC": "Y",
476
+ "TAG": "*",
477
+ "TAT": "Y",
478
+ "TCA": "S",
479
+ "TCC": "S",
480
+ "TCG": "S",
481
+ "TCT": "S",
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483
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484
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485
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491
+ "id": 14,
492
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+ "Alternative Flatworm Mitochondrial",
495
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496
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+ "TAG"
502
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+ "15": {
505
+ "codon_to_aa": {
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+ "AAC": "N",
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+ "AGA": "R",
515
+ "AGC": "S",
516
+ "AGG": "R",
517
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1482
+ "id": 29,
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+ "GGC": "G",
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+ "GGG": "G",
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+ "GGT": "G",
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+ "GTA": "V",
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+ "GTC": "V",
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+ "GTG": "V",
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+ "GTT": "V",
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+ "TAA": "*",
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+ "TAC": "Y",
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1562
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1578
+ "30": {
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+ "codon_to_aa": {
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+ ]
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1994
+ "GTG"
1995
+ ],
1996
+ "stop_codons": [
1997
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+ "TAG"
1999
+ ]
2000
+ },
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2003
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2004
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2005
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2006
+ "AAT": "N",
2007
+ "ACA": "T",
2008
+ "ACC": "T",
2009
+ "ACG": "T",
2010
+ "ACT": "T",
2011
+ "AGA": "S",
2012
+ "AGC": "S",
2013
+ "AGG": "S",
2014
+ "AGT": "S",
2015
+ "ATA": "M",
2016
+ "ATC": "I",
2017
+ "ATG": "M",
2018
+ "ATT": "I",
2019
+ "CAA": "Q",
2020
+ "CAC": "H",
2021
+ "CAG": "Q",
2022
+ "CAT": "H",
2023
+ "CCA": "P",
2024
+ "CCC": "P",
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+ "CCG": "P",
2026
+ "CCT": "P",
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+ "CGA": "R",
2028
+ "CGC": "R",
2029
+ "CGG": "R",
2030
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2031
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2032
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2038
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2039
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2041
+ "GCG": "A",
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2043
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2044
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2054
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2058
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2060
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2061
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2062
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2063
+ "TTA": "L",
2064
+ "TTC": "F",
2065
+ "TTG": "L",
2066
+ "TTT": "F"
2067
+ },
2068
+ "id": 5,
2069
+ "name": "Invertebrate Mitochondrial",
2070
+ "names": [
2071
+ "Invertebrate Mitochondrial",
2072
+ "SGC4"
2073
+ ],
2074
+ "start_codons": [
2075
+ "TTG",
2076
+ "ATT",
2077
+ "ATC",
2078
+ "ATA",
2079
+ "ATG",
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+ "GTG"
2081
+ ],
2082
+ "stop_codons": [
2083
+ "TAA",
2084
+ "TAG"
2085
+ ]
2086
+ },
2087
+ "6": {
2088
+ "codon_to_aa": {
2089
+ "AAA": "K",
2090
+ "AAC": "N",
2091
+ "AAG": "K",
2092
+ "AAT": "N",
2093
+ "ACA": "T",
2094
+ "ACC": "T",
2095
+ "ACG": "T",
2096
+ "ACT": "T",
2097
+ "AGA": "R",
2098
+ "AGC": "S",
2099
+ "AGG": "R",
2100
+ "AGT": "S",
2101
+ "ATA": "I",
2102
+ "ATC": "I",
2103
+ "ATG": "M",
2104
+ "ATT": "I",
2105
+ "CAA": "Q",
2106
+ "CAC": "H",
2107
+ "CAG": "Q",
2108
+ "CAT": "H",
2109
+ "CCA": "P",
2110
+ "CCC": "P",
2111
+ "CCG": "P",
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