auto-opt 0.0.1__py3-none-any.whl

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Files changed (99) hide show
  1. auto_opt/__init__.py +0 -0
  2. auto_opt/data/__init__.py +0 -0
  3. auto_opt/data/collate_function.py +20 -0
  4. auto_opt/data/data_key.py +7 -0
  5. auto_opt/data/dataset.py +849 -0
  6. auto_opt/data/eval_type.py +30 -0
  7. auto_opt/data/feat_ext.py +49 -0
  8. auto_opt/data/feat_norm.py +70 -0
  9. auto_opt/data/multi_input_dataset.py +44 -0
  10. auto_opt/data/task_type.py +83 -0
  11. auto_opt/data/torch_kernel_pca.py +31 -0
  12. auto_opt/data/torch_kernel_poly.py +30 -0
  13. auto_opt/data/torch_max_abs_scaler.py +22 -0
  14. auto_opt/data/torch_min_max_scaler.py +24 -0
  15. auto_opt/data/torch_pca.py +27 -0
  16. auto_opt/data/torch_poly_feat.py +27 -0
  17. auto_opt/data/torch_robust_scaler.py +35 -0
  18. auto_opt/data/torch_standard_scaler.py +24 -0
  19. auto_opt/data/torch_truncated_svd.py +23 -0
  20. auto_opt/model/__init__.py +0 -0
  21. auto_opt/model/activation.py +135 -0
  22. auto_opt/model/bag_neural_model.py +551 -0
  23. auto_opt/model/bag_neural_trainer.py +456 -0
  24. auto_opt/model/bnn_guide.py +53 -0
  25. auto_opt/model/bnn_mlp_model_node.py +89 -0
  26. auto_opt/model/bnn_model.py +129 -0
  27. auto_opt/model/bnn_model_graph.py +281 -0
  28. auto_opt/model/bnn_torch_model.py +214 -0
  29. auto_opt/model/bnn_trainer.py +642 -0
  30. auto_opt/model/drop_neural_model_node.py +166 -0
  31. auto_opt/model/exit_neural_model_node.py +151 -0
  32. auto_opt/model/ftt_neural_model_node.py +211 -0
  33. auto_opt/model/ftt_torch_module.py +80 -0
  34. auto_opt/model/gbr_model.py +104 -0
  35. auto_opt/model/generable.py +13 -0
  36. auto_opt/model/gh.py +181 -0
  37. auto_opt/model/graph_neural_model_node.py +180 -0
  38. auto_opt/model/gte_neural_model_node.py +134 -0
  39. auto_opt/model/gtn_neural_model_node.py +120 -0
  40. auto_opt/model/gtv_neural_model_node.py +166 -0
  41. auto_opt/model/in_out_type.py +35 -0
  42. auto_opt/model/input_neural_model_node.py +312 -0
  43. auto_opt/model/layer_type.py +121 -0
  44. auto_opt/model/mlp_neural_model_node.py +183 -0
  45. auto_opt/model/model.py +42 -0
  46. auto_opt/model/moe_neural_model_node.py +194 -0
  47. auto_opt/model/moe_torch_module.py +47 -0
  48. auto_opt/model/neural_loss.py +96 -0
  49. auto_opt/model/neural_model.py +369 -0
  50. auto_opt/model/neural_model_graph.py +606 -0
  51. auto_opt/model/neural_model_node.py +174 -0
  52. auto_opt/model/neural_optimizer.py +58 -0
  53. auto_opt/model/neural_trainer.py +1044 -0
  54. auto_opt/model/nmg.py +630 -0
  55. auto_opt/model/normalization.py +29 -0
  56. auto_opt/model/npdh.py +133 -0
  57. auto_opt/model/res_net_neural_model_node.py +176 -0
  58. auto_opt/model/res_net_torch_module.py +29 -0
  59. auto_opt/model/rf_reg_model.py +100 -0
  60. auto_opt/model/sklearn_model_trainer.py +404 -0
  61. auto_opt/model/torch_model.py +357 -0
  62. auto_opt/model/trainer.py +44 -0
  63. auto_opt/opt/__init__.py +0 -0
  64. auto_opt/opt/bayes_opt.py +285 -0
  65. auto_opt/opt/bayes_optimizable.py +6 -0
  66. auto_opt/opt/bayes_options.py +37 -0
  67. auto_opt/opt/cat_constr.py +40 -0
  68. auto_opt/opt/change_type.py +58 -0
  69. auto_opt/opt/complex_constr_float.py +67 -0
  70. auto_opt/opt/complex_constr_int.py +69 -0
  71. auto_opt/opt/constr_type.py +38 -0
  72. auto_opt/opt/feat_ext_constr.py +318 -0
  73. auto_opt/opt/float_constr.py +118 -0
  74. auto_opt/opt/full_diff_pipeline.py +62 -0
  75. auto_opt/opt/gen_hill_climb_opt.py +195 -0
  76. auto_opt/opt/gen_hill_climb_options.py +52 -0
  77. auto_opt/opt/gen_sec_opt.py +7 -0
  78. auto_opt/opt/gen_strat.py +8 -0
  79. auto_opt/opt/hill_climb_opt.py +112 -0
  80. auto_opt/opt/hill_climb_options.py +34 -0
  81. auto_opt/opt/int_constr.py +121 -0
  82. auto_opt/opt/optimizer.py +62 -0
  83. auto_opt/opt/options.py +39 -0
  84. auto_opt/para/bag_neural_para_eng.py +397 -0
  85. auto_opt/para/bnn_para_eng.py +401 -0
  86. auto_opt/para/neural_para_eng.py +397 -0
  87. auto_opt/para/para_eng.py +133 -0
  88. auto_opt/para/para_eng_gen.py +44 -0
  89. auto_opt/para/para_type.py +8 -0
  90. auto_opt/para/sklearn_para_eng.py +199 -0
  91. auto_opt/param/param_holder.py +688 -0
  92. auto_opt/splits/train_val.py +98 -0
  93. auto_opt/splits/train_val_test.py +143 -0
  94. auto_opt/viz/bag_viz.py +75 -0
  95. auto_opt-0.0.1.dist-info/METADATA +76 -0
  96. auto_opt-0.0.1.dist-info/RECORD +99 -0
  97. auto_opt-0.0.1.dist-info/WHEEL +5 -0
  98. auto_opt-0.0.1.dist-info/licenses/LICENSE.txt +21 -0
  99. auto_opt-0.0.1.dist-info/top_level.txt +1 -0
auto_opt/__init__.py ADDED
File without changes
auto_opt/data/__init__.py ADDED
File without changes
auto_opt/data/collate_function.py ADDED
@@ -0,0 +1,20 @@
1
+ import torch
2
+ import torch_geometric as pyg
3
+
4
+
5
+ def custom_collate_fn(batch:list) -> dict:
6
+ # creating labels
7
+ labels = torch.stack([item["labels"] for item in batch])
8
+ # stacking tabular inputs normally
9
+ tabular_inputs = {}
10
+ for key in batch[0]["tabular_inputs"]:
11
+ tabular_inputs[key] = torch.stack([item["tabular_inputs"][key] for item in batch])
12
+ # batch graph inputs using pytroch geometric
13
+ graph_inputs = {}
14
+ for key in batch[0]["graph_inputs"]:
15
+ graph_inputs[key] = pyg.data.Batch.from_data_list([item["graph_inputs"][key] for item in batch])
16
+ return {
17
+ "labels": labels,
18
+ "tabular_inputs": tabular_inputs,
19
+ "graph_inputs": graph_inputs
20
+ }
auto_opt/data/data_key.py ADDED
@@ -0,0 +1,7 @@
1
+ from enum import Enum
2
+
3
+
4
+ class DataKey(Enum):
5
+ VAL = 0
6
+ TEST = 1
7
+ ALL = 2