aisp 0.1.0__py3-none-any.whl → 0.1.2__py3-none-any.whl

{aisp-0.1.0.dist-info → aisp-0.1.2.dist-info}/METADATA

@@ -1,8 +1,11 @@
 Metadata-Version: 2.1
 Name: aisp
-Version: 0.1.0
+Version: 0.1.2
 Summary: Package with techniques of artificial immune systems.
+Home-page: https://github.com/AIS-Package/aisp
+Author: João Paulo da Silva Barros
 Author-email: João Paulo da Silva Barros <jpsilvabarr@gmail.com>
+Maintainer: Alison Zille Lopes
 Maintainer-email: Alison Zille Lopes <alisonzille@gmail.com>
 License: LGPL-3.0 license
 Project-URL: Homepage, https://ais-package.github.io/
@@ -21,9 +24,9 @@ Classifier: Programming Language :: Python :: 3.11
 Requires-Python: >=3.8.10
 Description-Content-Type: text/markdown
 License-File: LICENSE
-Requires-Dist: numpy (>=1.23.0)
+Requires-Dist: numpy (>=1.22.4)
 Requires-Dist: scipy (>=1.8.1)
-Requires-Dist: tqdm (==4.64.1)
+Requires-Dist: tqdm (>=4.64.1)
 
 <div align = center> 
 
@@ -72,7 +75,7 @@ Requires-Dist: tqdm (==4.64.1)
 
 #### Introduction
 
-The **AISP** is a python package that implements artificial immune systems techniques, distributed under the GNU Lesser General Public License v3.0 (GPLv3).
+The **AISP** is a python package that implements artificial immune systems techniques, distributed under the GNU Lesser General Public License v3.0 (LGPLv3).
 
 The package started in **2022** as a research package at the Federal Institute of Northern Minas Gerais - Salinas campus (**IFNMG - Salinas**).
 
@@ -102,7 +105,7 @@ The module requires installation of [python 3.8.10](https://www.python.org/downl
 
 |    Packages   |     Version   |
 |:-------------:|:-------------:|
-|    numpy      |    ≥ 1.23.0   |
+|    numpy      |    ≥ 1.22.4   |
 |    scipy      |    ≥ 1.8.1    |
 |    tqdm       |    ≥ 4.64.1   |
 
@@ -182,7 +185,7 @@ Below are some examples that use a database for classification with the [Jupyter
 
 #### Introdução
 
-O **AISP** é um pacote python que implementa as técnicas dos sistemas imunológicos artificiais, distribuído sob a licença GNU Lesser General Public License v3.0 (GPLv3).
+O **AISP** é um pacote python que implementa as técnicas dos sistemas imunológicos artificiais, distribuído sob a licença GNU Lesser General Public License v3.0 (LGPLv3).
 
 O pacote teve início no ano de **2022** como um pacote de pesquisa no instituto federal do norte de minas gerais - campus salinas (**IFNMG - Salinas**).
 
@@ -211,7 +214,7 @@ O módulo requer a instalação do [python 3.8.10](https://www.python.org/downlo
 
 |    Pacotes    |     Versão    |
 |:-------------:|:-------------:|
-|    numpy      |    ≥ 1.23.0   |
+|    numpy      |    ≥ 1.22.4   |
 |    scipy      |    ≥ 1.8.1    |
 |    tqdm       |    ≥ 4.64.1   |
 

aisp-0.1.2.dist-info/RECORD

@@ -0,0 +1,5 @@
+aisp-0.1.2.dist-info/LICENSE,sha256=fTqV5eBpeAZO0_jit8j4Ref9ikBSlHJ8xwj5TLg7gFk,7817
+aisp-0.1.2.dist-info/METADATA,sha256=xFBao7vEWR_R05xAj8nfa0f3QiuYkzPRRaY5ngIjFW8,8232
+aisp-0.1.2.dist-info/WHEEL,sha256=pkctZYzUS4AYVn6dJ-7367OJZivF2e8RA9b_ZBjif18,92
+aisp-0.1.2.dist-info/top_level.txt,sha256=AbpHGcgLb-kRsJGnwFEktk7uzpZOCcBY74-YBdrKVGs,1
+aisp-0.1.2.dist-info/RECORD,,

aisp-0.1.2.dist-info/top_level.txt

@@ -0,0 +1 @@
+

aisp/NSA/__init__.py

@@ -1,4 +0,0 @@
-from ._negativeSelection import RNSA, BNSA
-
-__author__ = 'João Paulo da Silva Barros'
-__all__ = ['RNSA', 'BNSA']

aisp/NSA/_negativeSelection.py

@@ -1,1068 +0,0 @@
-import numpy as np
-import numpy.typing as npt
-from tqdm import tqdm
-from typing import Literal
-from collections import namedtuple
-from scipy.spatial.distance import hamming
-
-from aisp._base import Base
-
-
-class RNSA(Base):
-    """
-    The ``RNSA`` (Real-Valued Negative Selection Algorithm) class is for classification and identification purposes.
-    of anomalies through the self and not self method.
-
-    Attributes:
-    ---
-        * N (``int``): Number of detectors.
-        * r (``float``): Radius of the detector.
-        * r_s (``float``): rₛ Radius of the ``X`` own samples.
-        * k (``int``): K number of near neighbors to calculate the average distance of the detectors.
-        * metric (``str``): Way to calculate the distance: ``'euclidean', 'minkowski', or 'manhattan'``.
-        * max_discards (``int``): This parameter indicates the maximum number of consecutive detector discards, 
-            aimed at preventing a possible infinite loop in case a radius is defined that cannot generate non-self 
-            detectors.
-        * seed (``int``): Seed for the random generation of detector values.
-        * algorithm(``str``), Set the algorithm version:
-
-                * ``'default-NSA'``: Default algorithm with fixed radius.
-                * ``'V-detector'``: This algorithm uses a variable radius for anomaly detection in feature spaces.
-
-            Defaults to ``'default-NSA'``.
-
-        * cell_bounds (``bool``): If set to ``True``, this option limits the generation of detectors to 
-            the space within the plane between 0 and 1. 
-        * detectors (``dict``): This variable stores a list of detectors by class.
-        * classes (``npt.NDArray``): list of output classes.
-        
-    ---
-
-    A classe ``RNSA`` (Algoritmo de Seleção Negativa de Valor Real) tem a finalidade de classificação e identificação 
-    de anomalias através do método self e not self . 
-
-    Attributes:
-    ---
-        * N (``int``): Quantidade de detectores.
-        * r (``float``): Raio do detector.
-        * r_s (``float``): O valor de ``rₛ`` é o raio das amostras próprias da matriz ``X``.
-        * k (``int``):  K quantidade de vizinhos próximos para calcular a média da distância dos detectores.
-        * metric (``str``): Forma de calcular a distância: ``'euclidiana', 'minkowski', or 'manhattan'``.
-        * max_discards (``int``): Este parâmetro indica o número máximo de descartes de detectores em sequência, 
-            que tem como objetivo evitar um possível loop infinito caso seja definido um raio que não seja possível 
-            gerar detectores do não-próprio.
-        * seed (``int``): Semente para a geração randômica dos valores dos detectores.
-        * algorithm (``str``), Definir a versão do algoritmo:
-
-                * ``'default-NSA'``: Algoritmo padrão com raio fixo.
-                * ``'V-detector'``: Este algoritmo utiliza um raio variável para a detecção de anomalias em espaços 
-                    de características. 
-
-            Defaults to ``'default-NSA'``.
-
-        * cell_bounds (``bool``):  Se definido como ``True``, esta opção limita a geração dos detectores ao espaço 
-            do plano compreendido entre 0 e 1.
-       
-        
-        * detectors (``dict``): Essa variável armazena uma lista com detectores por classes.
-        * classes (``npt.NDArray``): lista com as classes de saída.
-    """
-    def __init__(
-        self, 
-        N: int = 100, 
-        r: float = 0.05, 
-        r_s: float = 0.0001, 
-        k: int = 1, 
-        metric: Literal['manhattan', 'minkowski', 'euclidean'] = 'euclidean', 
-        max_discards: int = 100, 
-        seed: int = None, 
-        algorithm: Literal['default-NSA', 'V-detector'] ='default-NSA', 
-        cell_bounds: bool = False
-    ):
-        """
-        Negative Selection class constructor (``RNSA``).
-
-        Details:
-        ---
-            This method initializes the ``detectors``, ``classes``, ``k``, ``metric``, ``N``, ``r``, ``r_S``, 
-            ``max_discards``, ``seed`` and ``algorithm`` attributes.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * N (``int``): Number of detectors. Defaults to ``100``.
-            * r (``float``): Radius of the detector. Defaults to ``0.05``.
-            * r_s (``float``): rₛ Radius of the ``X`` own samples. Defaults to ``0.0001``.
-            * k (``int``): Number of neighbors near the randomly generated detectors to perform the
-            distance average calculation. Defaults to ``1``.
-            * metric (``str``): Way to calculate the distance between the detector and the sample:
-
-                * ``'Euclidean'`` ➜ The calculation of the distance is given by the expression: √( (x₁ – x₂)² + (y₁ – y₂)² + ... + (yn – yn)²).
-                * ``'minkowski'`` ➜ The calculation of the distance is given by the expression: ( |X₁ – Y₁|p + |X₂ – Y₂|p + ... + |Xn – Yn|p) ¹/ₚ, In this project ``p == 2``.
-                * ``'manhattan'`` ➜ The calculation of the distance is given by the expression: ( |x₁ – x₂| + |y₁ – y₂| + ... + |yn – yn|) .
-
-            Defaults to ``'euclidean'``.
-
-            * max_discards (``int``): This parameter indicates the maximum number of consecutive detector discards, aimed at preventing a 
-            possible infinite loop in case a radius is defined that cannot generate non-self detectors. Defaults to ``100``.
-            * seed (``int``): Seed for the random generation of values in the detectors. Defaults to ``None``.
-
-            * algorithm(``str``), Set the algorithm version:
-
-                * ``'default-NSA'``: Default algorithm with fixed radius.
-                * ``'V-detector'``: This algorithm is based on the article "[Real-Valued Negative Selection Algorithm with Variable-Sized Detectors](https://doi.org/10.1007/978-3-540-24854-5_30)", by Ji, Z., Dasgupta, D. (2004), and uses a variable radius for anomaly detection in feature spaces.
-
-            Defaults to ``'default-NSA'``.
-
-            
-            * cell_bounds (``bool``): If set to ``True``, this option limits the generation of detectors to the space within 
-            the plane between 0 and 1. This means that any detector whose radius exceeds this limit is discarded, 
-            this variable is only used in the ``V-detector`` algorithm. Defaults to ``False``.
-
-        ---
-
-        Construtor da classe de Seleção negativa (``RNSA``).
-
-        Details:
-        ---
-            Este método inicializa os atributos ``detectors``, ``classes``, ``k``, ``metric``, ``N``, ``r`` e ``seed``.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * N (``int``): Quantidade de detectores. Defaults to ``100``.
-            * r (``float``): Raio do detector. Defaults to ``0.05``.
-            * r_s (``float``): O valor de ``rₛ`` é o raio das amostras próprias da matriz ``X``. Defaults to ``0.0001``.
-            * k (``int``): Quantidade de vizinhos próximos dos detectores gerados aleatoriamente para efetuar o 
-            cálculo da média da distância. Defaults to ``1``.
-            * metric (``str``): Forma para se calcular a distância entre o detector e a amostra: 
-
-                * ``'euclidiana'`` ➜ O cálculo da distância dá-se pela expressão: √( (x₁ – x₂)² + (y₁ – y₂)² + ... + (yn – yn)²).
-                * ``'minkowski'``  ➜ O cálculo da distância dá-se pela expressão: ( |X₁ – Y₁|p + |X₂ – Y₂|p + ... + |Xn – Yn|p) ¹/ₚ, Neste projeto ``p == 2``.
-                * ``'manhattan'``  ➜ O cálculo da distância dá-se pela expressão: ( |x₁ – x₂| + |y₁ – y₂| + ... + |yn – yn|).
-
-            Defaults to ``'euclidean'``.
-
-            * max_discards (``int``): Este parâmetro indica o número máximo de descartes de detectores em sequência, que tem como objetivo evitar um 
-            possível loop infinito caso seja definido um raio que não seja possível gerar detectores do não-próprio. Defaults to ``100``.
-            * seed (``int``): Semente para a geração randômica dos valores nos detectores. Defaults to ``None``.
-            * algorithm (``str``), Definir a versão do algoritmo:
-
-                * ``'default-NSA'``: Algoritmo padrão com raio fixo.
-                * ``'V-detector'``: Este algoritmo é baseado no artigo "[Real-Valued Negative Selection Algorithm with Variable-Sized Detectors](https://doi.org/10.1007/978-3-540-24854-5_30)", de autoria de Ji, Z., Dasgupta, D. (2004), e utiliza um raio variável para a detecção de anomalias em espaços de características. 
-
-            Defaults to ``'default-NSA'``.
-
-            * cell_bounds (``bool``):  Se definido como ``True``, esta opção limita a geração dos detectores ao espaço do plano 
-            compreendido entre 0 e 1. Isso significa que qualquer detector cujo raio ultrapasse esse limite é descartado, 
-            e esta variável é usada exclusivamente no algoritmo ``V-detector``.
-        """
-        
-        if metric == 'manhattan' or metric == 'minkowski' or metric == 'euclidean':
-            self.metric = metric
-        else:
-            self.metric = 'euclidean'
-
-        if seed is not None and isinstance(seed, int):
-            np.random.seed(seed)
-            self.seed: int = seed
-        else:
-            self.seed = None
-
-        if k < 1:
-            self.k: int = 1
-        else:
-            self.k: int = k
-
-        if N < 1:
-            self.N: int = 100
-        else:
-            self.N: int = N
-
-        if r < 0:
-            self.r: float = 0.05
-        else:
-            self.r: float = r
-        
-        if r_s > 0:
-            self.r_s: float = r_s
-        else:
-            self.r_s: float = 0
-
-        if algorithm == 'V-detector':
-            self._Detector = namedtuple("Detector", "position radius")
-            self._algorithm: str = algorithm
-        else:
-            self._Detector = namedtuple("Detector", "position")
-            self._algorithm: str = 'default-NSA'
-            
-        self._cell_bounds: bool = cell_bounds 
-        self.max_discards: int = max_discards
-        self.detectors: dict = None
-        self.classes: npt.NDArray = None
-
-    def fit(self, X: npt.NDArray, y: npt.NDArray, verbose: bool = True):
-        """
-        The function ``fit(...)``, performs the training according to ``X`` and ``y``, using the method
-        negative selection method(``NegativeSelect``).
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Training array, containing the samples and their characteristics,
-            [``N samples`` (rows)][``N features`` (columns)].
-            * y (``npt.NDArray``): Array of target classes of ``X`` with [``N samples`` (lines)].
-            * verbose (``bool``): Feedback from detector generation to the user.
-        returns:
-        ---
-            (``self``): Returns the instance itself.
-
-        ----
-
-        A função ``fit(...)``, realiza o treinamento de acordo com ``X`` e ``y``, usando o método 
-        de seleção negativa(``NegativeSelect``).
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Array de treinamento, contendo as amostras é suas características, 
-            [``N amostras`` (linhas)][``N características`` (colunas)].
-            * y (``npt.NDArray``):  Array com as classes alvos de ``X`` com [``N amostras`` (linhas)].
-            * verbose (``bool``): Feedback da geração de detectores para o usuário.
-        Returns:
-        ---
-            (``self``): Retorna a própria instância.
-        """
-        if not isinstance(X,  (np.ndarray)):
-            if isinstance(X,  (list)):
-                X = np.array(X)
-            else:
-                raise TypeError("X is not an ndarray.")
-        elif not isinstance(y, (np.ndarray)):
-            if isinstance(y, (list)):
-                y = np.array(y)
-            else:
-                raise TypeError("y is not an ndarray.")
-        if X.shape[0] != y.shape[0]:
-            raise TypeError(
-                "X does not have the same amount of sample for the output classes in y.")
-        
-        # Identificando as classes possíveis, dentro do array de saídas ``y``.
-        self.classes = np.unique(y)
-        # Dict que armazenará os detectores com as classes como key.
-        list_detectors_by_class = dict()
-        # Separa as classes para o treinamento.
-        sample_index = self.__slice_index_list_by_class(y)
-        # Barra de progresso para a geração de todos os detectores.
-        if verbose:
-            progress = tqdm(total=int(self.N * (len(self.classes))),
-                            bar_format='{desc} ┇{bar}┇ {n}/{total} detectors', postfix='\n')
-        for _class_ in self.classes:
-            # Inicia o conjunto vazio que conterá os detectores válidos.
-            valid_detectors_set = []
-            discard_count = 0
-            # Informando em qual classe o algoritmo está para a barra de progresso.
-            if verbose:
-                progress.set_description_str(
-                    f'Generating the detectors for the {_class_} class:')
-            while len(valid_detectors_set) < self.N:
-                # Gera um vetor candidato a detector aleatoriamente com valores entre 0 e 1.
-                vector_x = np.random.random_sample(size=X.shape[1])
-                # Verifica a validade do detector para o não-próprio com relação às amostras da classe.
-                valid_detector = self.__checks_valid_detector(
-                    X=X, vector_x=vector_x, samples_index_class=sample_index[_class_])
-                
-                # Se o detector for válido, adicione a lista dos válidos.
-                if self._algorithm == 'V-detector' and valid_detector != False:
-                    discard_count = 0
-                    valid_detectors_set.append(
-                        self._Detector(vector_x, valid_detector[1]))
-                    if verbose:
-                        progress.update(1)
-                elif valid_detector:
-                    discard_count = 0
-                    valid_detectors_set.append(self._Detector(vector_x))
-                    if verbose:
-                        progress.update(1)
-                else:
-                    discard_count += 1
-                    if discard_count == self.max_discards:
-                        raise Exception('An error has been identified:\n'+
-                        f'the maximum number of discards of detectors for the {_class_} class has been reached.\n'+
-                        'It is recommended to check the defined radius and consider reducing its value.')
-                    
-            # Adicionar detectores, com as classes como chave na dict.
-            list_detectors_by_class[_class_] = valid_detectors_set
-        # Informar a finalização da geração dos detectores para as classes.
-        if verbose:
-            progress.set_description(
-                f'\033[92m✔ Non-self detectors for classes ({", ".join(map(str, self.classes))}) successfully generated\033[0m')
-        # Armazena os detectores encontrados no atributo, para os detectores da classe.
-        self.detectors = list_detectors_by_class
-        return self
-
-    def predict(self, X: npt.NDArray) -> npt.NDArray:
-        """
-        Function to perform the prediction of classes based on detectors
-        created after training.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Array with input samples with [``N samples`` (Lines)] and
-            [``N characteristics``(Columns)]
-
-        returns:
-        ---
-            * C – (``npt.NDArray``): an ndarray of the form ``C`` [``N samples``],
-            containing the predicted classes for ``X``.
-            * ``None``: If there are no detectors for the prediction.
-
-        ---
-
-        Função para efetuar a previsão das classes com base nos detectores 
-        criados após o treinamento.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Array com as amostras de entradas com [``N amostras`` (Linhas)] e 
-            [``N características``(Colunas)]
-
-        Returns:
-        ---
-            * C – (``npt.NDArray``): um ndarray de forma ``C`` [``N amostras``], 
-            contendo as classes previstas para ``X``.
-            * ``None``: Se não existir detectores para a previsão.
-        """
-        # se não houver detectores retorna None.
-        if self.detectors is None:
-            return None
-        elif not isinstance(X,  (np.ndarray, list)):
-            raise TypeError("X is not an ndarray or list")
-        elif len(self.detectors[self.classes[0]][0].position) != len(X[0]):
-            raise Exception('X does not have {} features to make the prediction'.format(
-                len(self.detectors[self.classes[0]][0])))
-
-        # Inicia um array vazio.
-        C = np.empty(shape=(0))
-        # Para cada linha de amostra em X.
-        for line in X:
-            class_found: bool
-            _class_ = self.__compare_sample_to_detectors(line)
-            if _class_ is None:
-                class_found = False
-            else:
-                C = np.append(C, [_class_])
-                class_found = True
-
-            # Se possuir apenas uma classe e não classificar a amostra define a saída como não-própria.
-            if not class_found and len(self.classes) == 1:
-                C = np.append(C, ['non-self'])
-            # Se não identificar a classe com os detectores, coloca a classe com a maior distância da média dos seus detectores.
-            elif not class_found:
-                average_distance = dict()
-                for _class_ in self.classes:
-                    detectores = list(
-                        map(lambda x: x.position, self.detectors[_class_]))
-                    average_distance[_class_] = self.__distance(
-                        np.average(detectores, axis=0), line)
-                C = np.append(
-                    C, [max(average_distance, key=average_distance.get)])
-        return C
-
-    def __checks_valid_detector(self, X: npt.NDArray = None, vector_x: npt.NDArray = None, samples_index_class: npt.NDArray = None):
-        """
-        Function to check if the detector has a valid non-proper ``r`` radius for the class.
-
-        Parameters:
-        ---
-        * X (``npt.NDArray``): Array ``X`` with the samples.
-        * vector_x (``npt.NDArray``): Randomly generated vector x candidate detector with values ​​between [0, 1].
-        * samples_index_class (``npt.NDArray``): Sample positions of a class in ``X``.
-
-        returns:
-        ---
-            * Validity (``bool``): Returns whether the detector is valid or not.
-
-        ---
-
-        Função para verificar se o detector possui raio ``r`` válido do não-próprio para a classe.
-
-        Parameters:
-        ---
-        * X (``npt.NDArray``): Array ``X`` com as amostras.
-        * vector_x (``npt.NDArray``): Vetor x candidato a detector gerado aleatoriamente com valores entre [0, 1].
-        * samples_index_class (``npt.NDArray``): Posições das amostras de uma classe em ``X``.
-
-        Returns:
-        ---
-            * Validade (``bool``): Retorna se o detector é válido ou não.
-
-        """
-        # Se um ou mais array de entrada possuir zero dados, retorna falso.
-        if np.size(samples_index_class) == 0 or np.size(X) == 0 or np.size(vector_x) == 0:
-            return False
-        # se self.k > 1  utiliza os k vizinhos mais próximos (knn), se não verifica o detector sem considerar os knn,.
-        if self.k > 1:
-            # Iniciar a lista dos knn vazia.
-            knn_list = np.empty(shape=(0))
-            for i in samples_index_class:
-                # Calcula a distância entre os dois vetores e adiciona a lista dos knn, se a distância for menor que a maior da lista.
-                knn_list = self.__compare_KnearestNeighbors_List(
-                    knn_list, self.__distance(X[i], vector_x))
-            # Se a média das distâncias na lista dos knn, for menor que o raio, retorna verdadeiro.
-            distance_mean = np.mean(knn_list)
-            if self._algorithm == 'V-detector':
-                return self.__detector_is_valid_to_Vdetector(distance_mean, vector_x)
-            elif distance_mean > (self.r + self.r_s):
-                return True  # Detector é valido!
-        else:
-            distance = None
-            for i in samples_index_class:
-                if self._algorithm == 'V-detector':
-                    if distance == None:
-                        distance = self.__distance(X[i], vector_x)
-                    elif distance > self.__distance(X[i], vector_x):
-                        distance = self.__distance(X[i], vector_x)
-                else:
-                    # Calcula a distância entre os vetores, se menor ou igual ao raio + raio da amostra define a validade do detector como falso.
-                    if (self.r + self.r_s) >= self.__distance(X[i], vector_x):
-                        return False  # Detector não é valido!
-            if self._algorithm == 'V-detector':
-                return self.__detector_is_valid_to_Vdetector(distance, vector_x)
-            return True  # Detector é valido!
-
-        return False  # Detector não é valido!
-
-    def __compare_KnearestNeighbors_List(self, knn: npt.NDArray, distance: float) -> npt.NDArray:
-        """
-        Compares the k-nearest neighbor distance at position ``k-1`` in the list ``knn``,
-        if the distance of the new sample is less, replace it and sort in ascending order.
-
-
-        Parameters:
-        ---
-            knn (npt.NDArray): List of k-nearest neighbor distances.
-            distance (float): Distance to check.
-
-        returns:
-        ---
-            npt.NDArray: Updated and sorted nearest neighbor list.
-
-        ---
-
-        Compara a distância do k-vizinho mais próximo na posição ``k-1``da lista ``knn``, 
-        se a distância da nova amostra for menor, substitui ela e ordena em ordem crescente.
-
-
-        Parameters:
-        ---
-            knn (npt.NDArray): Lista de distâncias dos k-vizinhos mais próximos.
-            distance (float): Distância a ser verificada. 
-
-        Returns:
-        ---
-            npt.NDArray: Lista de vizinhos mais próximos atualizada e ordenada.
-        """
-        # Se a quantidade de distâncias em knn, for menor que k, adiciona a distância.
-        if (len(knn) < self.k):
-            knn = np.append(knn, distance)
-            knn.sort()
-        else:
-            # Se não, adicione a distância, se a nova distancia for menor que a maior distância da lista.
-            if (knn[self.k - 1] > distance):
-                knn[self.k - 1] = distance
-                knn.sort()
-
-        return knn
-
-    def __compare_sample_to_detectors(self, line: npt.NDArray):
-        """
-        Function to compare a sample with the detectors, verifying if the sample is proper.
-
-        Details:
-        ---
-        In this function, when there is class ambiguity, it returns the class that has the greatest 
-        average distance between the detectors.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * line: vector with N-features
-
-        returns:
-        ---
-            * Returns the predicted class with the detectors or None if the sample does not qualify for any class.
-
-        ---
-
-        Função para comparar uma amostra com os detectores, verificando se a amostra é própria.
-
-        Details:
-        ---
-        Nesta função, quando possui ambiguidade de classes, retorna a classe que possuir a média de distância 
-        maior entre os detectores.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * line: vetor com N-características
-
-        Returns:
-        ---
-            * Retorna a classe prevista com os detectores ou None se a amostra não se qualificar a nenhuma classe.
-        """
-
-        # Lista para armazenar as classes e a distância média entre os detectores e a amostra.
-        possible_classes = []
-        for _class_ in self.classes:
-            # Variável para identificar, se a classe foi encontrada com os detectores.
-            class_found: bool = True
-            sum_distance = 0  # Variável para fazer o somatório das distâncias.
-            for detector in self.detectors[_class_]:
-                # Calcula a distância entre a amostra e os detectores.
-                distance = self.__distance(detector.position, line)
-                # Soma as distâncias para calcular a média.
-                sum_distance += distance
-                if self._algorithm == 'V-detector':
-                    if distance <= detector.radius:
-                        class_found = False
-                        break
-                elif distance <= self.r:
-                    class_found = False
-                    break
-
-            # Se a amostra passar por todos os detectores de uma classe, adiciona a classe como possivel previsão.
-            if class_found:
-                possible_classes.append([_class_, sum_distance/self.N])
-        # Se classificar como pertencentes a apenas uma classe, retorna a classe.
-        if len(possible_classes) == 1:
-            return possible_classes[0][0]
-        # Se, pertencer a mais de uma classe, retorna a classe com a distância média mais distante.
-        elif len(possible_classes) > 1:
-            return max(possible_classes, key=lambda x: x[1])[0]
-        else:  # Se não, retorna None
-            return None
-
-    def __distance(self, u: npt.NDArray, v: npt.NDArray):
-        """
-        Function to calculate the distance between two points by the chosen ``metric``.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * u (``npt.NDArray``): Coordinates of the first point.
-            * v (``npt.NDArray``): Coordinates of the second point.
-
-        returns:
-        ---
-            * Distance (``double``) between the two points.
-
-        ---
-
-        Função para calcular a distância entre dois pontos pela ``metric`` escolhida.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * u (``npt.NDArray``): Coordenadas do primeiro ponto.
-            * v (``npt.NDArray``): Coordenadas do segundo ponto.
-
-        Returns:
-        ---
-            * Distância (``double``) entre os dois pontos.
-        """
-        return super().distance(u, v)
-
-    def __detector_is_valid_to_Vdetector(self, distance: float, vector_x: npt.NDArray):
-        """
-        Check if the distance between the detector and the samples, minus the radius of the samples, 
-        is greater than the minimum radius.
-
-        Parameters:
-        ---
-        distance (``float``): minimum distance calculated between all samples.
-        vector_x (``numpy.ndarray``): randomly generated candidate detector vector x with values between 0 and 1.
-        Returns:
-        ---
-        * ``False``: if the calculated radius is smaller than the minimum distance or exceeds the edge of the space, 
-        if this option is enabled.
-        * ``True`` and the distance minus the radius of the samples, if the radius is valid.`
-
-        ----
-
-        Verifique se a distância entre o detector e as amostras, descontando o raio das amostras, é maior do que o raio mínimo.
-
-        Parameters:
-        ---
-        distance (``float``): distância mínima calculada entre todas as amostras.
-        vector_x (``numpy.ndarray``): vetor x candidato do detector gerado aleatoriamente, com valores entre 0 e 1.
-        
-        Returns:
-        ---
-
-        * ``False``: caso o raio calculado seja menor do que a distância mínima ou ultrapasse a borda do espaço, 
-        caso essa opção esteja habilitada.
-        * ``True`` e a distância menos o raio das amostras, caso o raio seja válido.
-        """
-        new_detector_r = float(distance - self.r_s)
-        if self.r >= new_detector_r:
-            return False  # Detector não é valido!
-        else:
-            # se _cell_bounds igual a True, considera o detector esta dentro do limite do plano.
-            if self._cell_bounds:
-                for p in vector_x:
-                    if (p - new_detector_r) < 0 or (p + new_detector_r) > 1:
-                        return False
-            return True, new_detector_r
-
-    def __slice_index_list_by_class(self, y: npt.NDArray) -> dict:
-        """
-        The function ``__slice_index_list_by_class(...)``, separates the indices of the lines according to the output class,
-        to loop through the sample array, only in positions where the output is the class being trained.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * y (npt.NDArray): Receives a ``y``[``N sample``] array with the output classes of the ``X`` sample array.
-
-        returns:
-        ---
-            * dict: A dictionary with the list of array positions(``y``), with the classes as key.
-
-        ---
-
-        A função ``__slice_index_list_by_class(...)``, separa os índices das linhas conforme a classe de saída, 
-        para percorrer o array de amostra, apenas nas posições que a saída for a classe que está sendo treinada.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * y (npt.NDArray): Recebe um array ``y``[``N amostra``] com as classes de saida do array de amostra ``X``.
-
-        Returns:
-        ---
-            * dict: Um dicionário com a lista de posições do array(``y``), com as classes como chave.
-        """
-        return super().slice_index_list_by_class(y)
- 
-    def score(self, X: npt.NDArray, y: list) -> float:
-        """
-        Score function calculates forecast accuracy.
-
-        Details:
-        ---
-        This function performs the prediction of X and checks how many elements are equal between vector y and y_predicted. 
-        This function was added for compatibility with some scikit-learn functions.
-
-        Parameters:
-        -----------
-
-        X: np.ndarray
-            Feature set with shape (n_samples, n_features).
-        y: np.ndarray
-            True values with shape (n_samples,).
-
-        Returns:
-        -------
-
-        accuracy: float
-            The accuracy of the model.
-
-        ---
-
-        Função score calcular a acurácia da previsão.
-
-        Details:
-        ---
-        Esta função realiza a previsão de X e verifica quantos elementos são iguais entre o vetor y e y_previsto. 
-        Essa função foi adicionada para oferecer compatibilidade com algumas funções do scikit-learn.
-
-        Parameters:
-        ---
-
-        * X : np.ndarray
-            Conjunto de características com shape (n_samples, n_features).
-        * y : np.ndarray
-            Valores verdadeiros com shape (n_samples,).
-
-        returns:
-        ---
-
-        accuracy : float
-            A acurácia do modelo.
-        """
-        return super().score(X, y)
-
-    def get_params(self, deep: bool = True) -> dict:
-        return {
-            'N': self.N,
-            'r': self.r,
-            'k': self.k,
-            'metric': self.metric,
-            'seed': self.seed,
-            'algorithm': self._algorithm,
-            'r_s': self.r_s,
-            'cell_bounds': self._cell_bounds
-        }
-
-class BNSA(Base):
-    """
-    The ``BNSA`` (Binary Negative Selection Algorithm) class is for classification and identification purposes.
-    of anomalies through the self and not self method.
-
-    Attributes:
-    ---
-        
-        * N (``int``): Number of detectors.
-        * aff_thresh (``float``): The variable represents the percentage of similarity between the T cell and the own samples.
-        * max_discards (``int``): This parameter indicates the maximum number of detector discards in sequence, which aims to avoid a
-        possible infinite loop if a radius is defined that it is not possible to generate non-self detectors.
-        * seed (``int``): Seed for the random generation of values in the detectors.
-        
-        * detectors (``dict``): This variable stores a list of detectors by class.
-        * classes (``npt.NDArray``): list of output classes.
-        
-
-    ---
-
-    A classe ``BNSA`` (Algoritmo de Seleção Negativa Binária) tem a finalidade de classificação e identificação 
-    de anomalias através do método self e not self . 
-
-    Attributes:
-    ---
-        * N (``int``): Quantidade de detectores. Defaults to ``100``.
-        * aff_thresh (``float``): A variável representa a porcentagem de similaridade entre a célula T e as amostras próprias. 
-        O valor padrão é de 10% (0,1), enquanto que o valor de 1,0 representa 100% de similaridade.
-        * max_discards (``int``): Este parâmetro indica o número máximo de descartes de detectores em sequência, que tem como objetivo evitar um 
-        possível loop infinito caso seja definido um raio que não seja possível gerar detectores do não-próprio. Defaults to ``100``.
-        * seed (``int``): Semente para a geração randômica dos valores nos detectores. Defaults to ``None``.
-
-        * detectors (``dict``): Essa variável armazena uma lista com detectores por classes.
-        * classes (``npt.NDArray``): lista com as classes de saída.
-
-    """
-    def __init__(
-        self, 
-        N: int = 100, 
-        aff_thresh: float = 0.1, 
-        max_discards: int = 100, 
-        seed: int = None
-    ):
-        """
-        Constructor of the Negative Selection class (``BNSA``).
-        
-         Details:
-         ---
-             This method initializes the ``detectors``, ``classes``, ``N``, ``t`` and ``seed`` attributes.
-
-         Parameters:
-         ---
-             * N (``int``): Number of detectors. Defaults to ``100``.
-             * aff_thresh (``float``): The variable represents the percentage of similarity between the T cell and the own samples.
-             The default value is 10% (0.1), while a value of 1.0 represents 100% similarity.
-             * max_discards (``int``): This parameter indicates the maximum number of detector discards in sequence, which aims to avoid a
-             possible infinite loop if a radius is defined that it is not possible to generate non-self detectors. Defaults to ``100``.
-             * seed (``int``): Seed for the random generation of values in the detectors. Defaults to ``None``.
-
-        ---
-
-        Construtor da classe de Seleção negativa (``BNSA``).
-        
-        Details:
-        ---
-            Este método inicializa os atributos ``detectors``, ``classes``, ``N``, ``t`` e ``seed``.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * N (``int``): Quantidade de detectores. Defaults to ``100``.
-            * aff_thresh (``float``): A variável representa a porcentagem de similaridade entre a célula T e as amostras próprias. 
-            O valor padrão é de 10% (0,1), enquanto que o valor de 1,0 representa 100% de similaridade.
-            * max_discards (``int``): Este parâmetro indica o número máximo de descartes de detectores em sequência, que tem como objetivo evitar um 
-            possível loop infinito caso seja definido um raio que não seja possível gerar detectores do não-próprio. Defaults to ``100``.
-            * seed (``int``): Semente para a geração randômica dos valores nos detectores. Defaults to ``None``.
-        """
-        if N > 0:
-            self.N: int = N
-        else:
-            self.N: int = 100
-
-        if aff_thresh > 0 and aff_thresh < 1:
-            self.aff_thresh: float = aff_thresh
-        else:
-            self.aff_thresh: float = 0.1
-        if max_discards > 0:
-            self.max_discards: int = max_discards
-        else:
-            self.max_discards: int = 0
-            
-        if seed is not None and isinstance(seed, int):
-            np.random.seed(seed)
-            self.seed: int = seed
-        else:
-            self.seed = None
-        self.classes: npt.NDArray = None
-        self.detectors: npt.NDArray = None
-
-    def fit(self, X: npt.NDArray, y: npt.NDArray, verbose: bool = True):
-        """
-        The function ``fit(...)``, performs the training according to ``X`` and ``y``, using the method
-        negative selection method(``NegativeSelect``).
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Training array, containing the samples and their characteristics,
-            [``N samples`` (rows)][``N features`` (columns)].
-            * y (``npt.NDArray``): Array of target classes of ``X`` with [``N samples`` (lines)].
-            * verbose (``bool``): Feedback from detector generation to the user.
-        returns:
-        ---
-            (``self``): Returns the instance itself.
-
-        ----
-
-        A função ``fit(...)``, realiza o treinamento de acordo com ``X`` e ``y``, usando o método 
-        de seleção negativa(``NegativeSelect``).
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Array de treinamento, contendo as amostras é suas características, 
-            [``N amostras`` (linhas)][``N características`` (colunas)].
-            * y (``npt.NDArray``):  Array com as classes alvos de ``X`` com [``N amostras`` (linhas)].
-            * verbose (``bool``): Feedback da geração de detectores para o usuário.
-        Returns:
-        ---
-            (``self``): Retorna a própria instância.
-        """
-        if not isinstance(X,  (np.ndarray)):
-            if isinstance(X,  (list)):
-                X = np.array(X)
-            else:
-                raise TypeError("X is not an ndarray.")
-        elif not isinstance(y, (np.ndarray)):
-            if isinstance(y, (list)):
-                y = np.array(y)
-            else:
-                raise TypeError("y is not an ndarray.")
-        if X.shape[0] != y.shape[0]:
-            raise TypeError(
-                "X does not have the same amount of sample for the output classes in y.")
-        elif not np.isin(X, [0, 1]).all():
-            raise Exception(
-                "The array X contains values that are not composed only of 0 and 1.")
-
-        if X.dtype != bool:
-            X = X.astype(bool)
-
-        self.classes = np.unique(y)
-        # Dict que armazenará os detectores com as classes como key.
-        list_detectors_by_class = dict()
-        # Separa as classes para o treinamento.
-        sample_index: dict = self.__slice_index_list_by_class(y)
-        # Barra de progresso para a geração de todos os detectores.
-        if verbose:
-            progress = tqdm(total=int(self.N * (len(self.classes))),
-                            bar_format='{desc} ┇{bar}┇ {n}/{total} detectors', postfix='\n')
-        
-        for _class_ in self.classes:
-            # Inicia o conjunto vazio que conterá os detectores válidos.
-            valid_detectors_set: list = []
-            discard_count: int = 0
-            # Informando em qual classe o algoritmo está para a barra de progresso.
-            if verbose:
-                progress.set_description_str(
-                    f'Generating the detectors for the {_class_} class:')
-            while len(valid_detectors_set) < self.N:
-                
-                is_valid_detector: bool = True
-                # Gera um vetor candidato a detector aleatoriamente com valores 0 e 1.
-                vector_x = np.random.randint(0, 2, X.shape[1], dtype=bool)
-                for i in sample_index[_class_]:
-                    # Verifica a validade do detector para o não-próprio com relação às amostras da classe.
-                    if hamming(X[i], vector_x) <= self.aff_thresh:
-                        is_valid_detector = False
-                        break
-                # Se o detector for válido, adicione a lista dos válidos.
-                if is_valid_detector:
-                    discard_count = 0
-                    valid_detectors_set.append(vector_x)
-                    if verbose:
-                        progress.update(1)
-                else:
-                    discard_count += 1
-                    if discard_count == self.max_discards:
-                        raise Exception('An error has been identified:\n'+
-                        f'the maximum number of discards of detectors for the {_class_} class has been reached.\n'+
-                        'It is recommended to check the defined radius and consider reducing its value.')
-                    
-            # Adicionar detectores, com as classes como chave na dict.
-            list_detectors_by_class[_class_] = valid_detectors_set
-
-        # Informar a finalização da geração dos detectores para as classes.
-        if verbose:
-            progress.set_description(
-                f'\033[92m✔ Non-self detectors for classes ({", ".join(map(str, self.classes))}) successfully generated\033[0m')
-        # Armazena os detectores encontrados no atributo, para os detectores da classe.
-        self.detectors = list_detectors_by_class
-        return self
-
-    def predict(self, X: npt.NDArray) -> npt.NDArray:
-        """
-        Function to perform the prediction of classes based on detectors
-        created after training.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Array with input samples with [``N samples`` (Lines)] and
-            [``N characteristics``(Columns)]
-
-        returns:
-        ---
-            * C – (``npt.NDArray``): an ndarray of the form ``C`` [``N samples``],
-            containing the predicted classes for ``X``.
-            * ``None``: If there are no detectors for the prediction.
-
-        ---
-
-        Função para efetuar a previsão das classes com base nos detectores 
-        criados após o treinamento.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * X (``npt.NDArray``): Array com as amostras de entradas com [``N amostras`` (Linhas)] e 
-            [``N características``(Colunas)]
-
-        Returns:
-        ---
-            * C – (``npt.NDArray``): um ndarray de forma ``C`` [``N amostras``], 
-            contendo as classes previstas para ``X``.
-            * ``None``: Se não existir detectores para a previsão.
-        """
-        if not isinstance(X,  (np.ndarray)):
-            if isinstance(X,  (list)):
-                X = np.array(X)
-            else:
-                raise TypeError("X is not an ndarray.")
-        
-        if not np.isin(X, [0, 1]).all():
-            raise Exception(
-                "The array X contains values that are not composed only of 0 and 1.")
-
-        if X.dtype != bool:
-            X = X.astype(bool)
-            
-         # Inicia um array vazio.
-        C = np.empty(shape=(0))
-        # Para cada linha de amostra em X.
-        for line in X:
-            class_found: bool = True
-            # Lista para armazenar as possíveis classes às quais a amostra se adequou ao self na comparação com os detectores non-self.
-            possible_classes: list = [] 
-            for _class_ in self.classes:
-                # Lista para armzenar as taxas de similaridade entre a amostra e os detectores.
-                similarity_list: list = []
-                for detector in self.detectors[_class_]:
-                    similarity = hamming(line, detector)
-                    if similarity <= self.aff_thresh:
-                        class_found = False
-                        break
-                    else:
-                        similarity_list.append(similarity)
-                # Se a amostra passar por todos os detectores de uma classe, adiciona a classe como possivel previsão e sua media de similaridade.
-                if class_found:
-                    possible_classes.append([_class_, min(similarity_list)])
-        
-            # Se, pertencer a uma ou mais classes, adiciona a classe com a distância média mais distante.
-            if len(possible_classes) > 0 :
-                C = np.append(C, [max(possible_classes, key=lambda x: x[1])[0]])
-                class_found = True
-            else:
-                class_found = False
-
-            # Se possuir apenas uma classe e não classificar a amostra define a saída como não-própria.
-            if not class_found and len(self.classes) == 1:
-                C = np.append(C, ['non-self'])
-            # Se não identificar a classe com os detectores, coloca a classe com a maior distância da média dos seus detectores.
-            elif not class_found:
-                class_differences = []
-                for _class_ in self.classes:
-                    differences = []
-                    for detector in self.detectors[_class_]:
-                        differences.append(hamming(line, detector))
-                    class_differences.append(min(differences))
-                C = np.append(C, [self.classes[class_differences.index(max(class_differences))]])
- 
-        return C
-
-    def __slice_index_list_by_class(self, y: npt.NDArray) -> dict:
-        """
-        The function ``__slice_index_list_by_class(...)``, separates the indices of the lines according to the output class,
-        to loop through the sample array, only in positions where the output is the class being trained.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * y (npt.NDArray): Receives a ``y``[``N sample``] array with the output classes of the ``X`` sample array.
-
-        returns:
-        ---
-            * dict: A dictionary with the list of array positions(``y``), with the classes as key.
-
-        ---
-
-        A função ``__slice_index_list_by_class(...)``, separa os índices das linhas conforme a classe de saída, 
-        para percorrer o array de amostra, apenas nas posições que a saída for a classe que está sendo treinada.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * y (npt.NDArray): Recebe um array ``y``[``N amostra``] com as classes de saida do array de amostra ``X``.
-
-        Returns:
-        ---
-            * dict: Um dicionário com a lista de posições do array(``y``), com as classes como chave.
-        """
-        return super().slice_index_list_by_class(y)
-
-    def score(self, X: npt.NDArray, y: list) -> float:
-        """
-        Score function calculates forecast accuracy.
-
-        Details:
-        ---
-        This function performs the prediction of X and checks how many elements are equal between vector y and y_predicted. 
-        This function was added for compatibility with some scikit-learn functions.
-
-        Parameters:
-        -----------
-
-        X: np.ndarray
-            Feature set with shape (n_samples, n_features).
-        y: np.ndarray
-            True values with shape (n_samples,).
-
-        Returns:
-        -------
-
-        accuracy: float
-            The accuracy of the model.
-
-        ---
-
-        Função score calcular a acurácia da previsão.
-
-        Details:
-        ---
-        Esta função realiza a previsão de X e verifica quantos elementos são iguais entre o vetor y e y_previsto. 
-        Essa função foi adicionada para oferecer compatibilidade com algumas funções do scikit-learn.
-
-        Parameters:
-        ---
-
-        * X : np.ndarray
-            Conjunto de características com shape (n_samples, n_features).
-        * y : np.ndarray
-            Valores verdadeiros com shape (n_samples,).
-
-        returns:
-        ---
-
-        accuracy : float
-            A acurácia do modelo.
-        """
-        return super().score(X, y)
-
-    def get_params(self, deep: bool = True) -> dict:
-        return {
-            'N': self.N,
-            'aff_thresh': self.aff_thresh,
-            'max_discards': self.max_discards,
-            'seed': self.seed,
-        }

aisp/_base.py

@@ -1,157 +0,0 @@
-import numpy as np
-import numpy.typing as npt
-from scipy.spatial.distance import euclidean, cityblock, minkowski
-
-class Base:
-    """
-    The base class contains functions that are used by more than one class in the package, 
-    and therefore are considered essential for the overall functioning of the system.
-
-    ---
-
-    A classe base contém funções que são utilizadas por mais de uma classe do pacote, 
-    e por isso são consideradas essenciais para o funcionamento geral do sistema.
-    """
-    def __init__(self, metric: str = 'euclidean'):
-        """
-        Parameters:
-        ---
-        * metric (``str``): Way to calculate the distance between the detector and the sample:
-
-                * ``'Euclidean'`` ➜ The calculation of the distance is given by the expression: √( (x₁ – x₂)² + (y₁ – y₂)² + ... + (yn – yn)²).
-                * ``'minkowski'`` ➜ The calculation of the distance is given by the expression: ( |X₁ – Y₁|p + |X₂ – Y₂|p + ... + |Xn – Yn|p) ¹/ₚ , In this project ``p == 2``.
-                * ``'manhattan'`` ➜ The calculation of the distance is given by the expression: ( |x₁ – x₂| + |y₁ – y₂| + ... + |yn – yn|) .
-        
-        ---
-
-        Parameters:
-        ---
-        * metric (``str``): Forma para se calcular a distância entre o detector e a amostra: 
-
-                * ``'euclidiana'`` ➜ O cálculo da distância dá-se pela expressão: √( (x₁ – x₂)² + (y₁ – y₂)² + ... + (yn – yn)²).
-                * ``'minkowski'``  ➜ O cálculo da distância dá-se pela expressão: ( |X₁ – Y₁|p + |X₂ – Y₂|p + ... + |Xn – Yn|p) ¹/ₚ , Neste projeto ``p == 2``.
-                * ``'manhattan'``  ➜ O cálculo da distância dá-se pela expressão: ( |x₁ – x₂| + |y₁ – y₂| + ... + |yn – yn|).
-
-            Defaults to ``'euclidean'``.
-        """
-        if metric == 'manhattan' or metric == 'minkowski' or metric == 'euclidean':
-            self.metric = metric
-        else:
-            self.metric = 'euclidean'
-
-    def distance(self, u: npt.NDArray, v: npt.NDArray):
-        """
-        Function to calculate the distance between two points by the chosen ``metric``.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * u (``npt.NDArray``): Coordinates of the first point.
-            * v (``npt.NDArray``): Coordinates of the second point.
-
-        returns:
-        ---
-            * Distance (``double``) between the two points.
-
-        ---
-
-        Função para calcular a distância entre dois pontos pela ``metric`` escolhida.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * u (``npt.NDArray``): Coordenadas do primeiro ponto.
-            * v (``npt.NDArray``): Coordenadas do segundo ponto.
-
-        Returns:
-        ---
-            * Distância (``double``) entre os dois pontos.
-        """
-        if self.metric == 'manhattan':
-            return cityblock(u, v)
-        elif self.metric == 'minkowski':
-            return minkowski(u, v, 2)
-        else:
-            return euclidean(u, v)
-        
-    def slice_index_list_by_class(self, y: npt.NDArray) -> dict:
-        """
-        The function ``__slice_index_list_by_class(...)``, separates the indices of the lines according to the output class,
-        to loop through the sample array, only in positions where the output is the class being trained.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * y (npt.NDArray): Receives a ``y``[``N sample``] array with the output classes of the ``X`` sample array.
-
-        returns:
-        ---
-            * dict: A dictionary with the list of array positions(``y``), with the classes as key.
-
-        ---
-
-        A função ``__slice_index_list_by_class(...)``, separa os índices das linhas conforme a classe de saída, 
-        para percorrer o array de amostra, apenas nas posições que a saída for a classe que está sendo treinada.
-
-        Parameters:
-        ---
-            * y (npt.NDArray): Recebe um array ``y``[``N amostra``] com as classes de saida do array de amostra ``X``.
-
-        Returns:
-        ---
-            * dict: Um dicionário com a lista de posições do array(``y``), com as classes como chave.
-        """
-        positionSamples = dict()
-        for _class_ in self.classes:
-            # Pega as posições das amostras por classes a partir do y.
-            positionSamples[_class_] = list(np.where(y == _class_)[0])
-
-        return positionSamples
-    
-    def score(self, X: npt.NDArray, y: list) -> float:
-        """
-        Score function calculates forecast accuracy.
-
-        Details:
-        ---
-        This function performs the prediction of X and checks how many elements are equal between vector y and y_predicted. 
-        This function was added for compatibility with some scikit-learn functions.
-
-        Parameters:
-        -----------
-
-        X: np.ndarray
-            Feature set with shape (n_samples, n_features).
-        y: np.ndarray
-            True values with shape (n_samples,).
-
-        Returns:
-        -------
-
-        accuracy: float
-            The accuracy of the model.
-
-        ---
-
-        Função score calcular a acurácia da previsão.
-
-        Details:
-        ---
-        Esta função realiza a previsão de X e verifica quantos elementos são iguais entre o vetor y e y_previsto. 
-        Essa função foi adicionada para oferecer compatibilidade com algumas funções do scikit-learn.
-
-        Parameters:
-        ---
-
-        * X : np.ndarray
-            Conjunto de características com shape (n_samples, n_features).
-        * y : np.ndarray
-            Valores verdadeiros com shape (n_samples,).
-
-        returns:
-        ---
-
-        accuracy : float
-            A acurácia do modelo.
-        """
-        if len(y) == 0:
-            return 0
-        y_pred = self.predict(X)
-        return np.sum(y == y_pred)/len(y)

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