sillyspec 3.26.10 → 3.26.13

package/src/stages/doctor.js

@@ -1,371 +1,386 @@
-// SillySpec Doctor — 项目自检阶段
-// 检查项通过 prompt 中的 bash 命令执行，此文件仅定义步骤结构
-
-
-export const definition = {
-  name: 'doctor',
-  title: '项目自检',
-  description: '检查 SillySpec 配置、构建环境和外部依赖',
-  auxiliary: true,
-  steps: [
-    {
-      name: 'SillySpec 内部检查',
-      prompt: `运行 SillySpec 内部检查。逐项执行以下命令并汇总结果：
-
-> ⚠️ Windows 兼容：下列 sqlite3 查询依赖外部 sqlite3 CLI（Windows 默认没有）。若某条 sqlite3 失败，改用 sillyspec 自身命令替代——sillyspec progress show 查看当前变更与各阶段状态（等价于查 changes/stages 表），sillyspec doctor --json 查看 db 健康与活跃变更列表。
-
-### 1. 目录结构完整性
-\`\`\`bash
-# 检查 .sillyspec/ 及子目录
-for d in .sillyspec .sillyspec/projects .sillyspec/docs .sillyspec/changes .sillyspec/.runtime; do
-  [ -d "$d" ] && echo "✅ $d" || echo "❌ $d"
-done
-# 检查 sillyspec.db（SQLite 权威状态源）
-DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
-[ -f "$DB_FILE" ] && echo "✅ sillyspec.db 存在" || echo "❌ sillyspec.db 不存在"
-# 用 sillyspec 自身命令验证 db 可读（fallback 不依赖外部 sqlite3 CLI，兼容 Windows）
-sqlite3 "$DB_FILE" "SELECT count(*) FROM project" 2>/dev/null && echo "✅ sillyspec.db 可查询" || (sillyspec progress show >/dev/null 2>&1 && echo "✅ sillyspec.db 可查询（经 sillyspec 命令）" || echo "⚠️ sillyspec.db 不可查询")
-\`\`\`
-
-### 2. 项目配置检查
-\`\`\`bash
-ls .sillyspec/projects/*.yaml 2>/dev/null
-# 对每个 yaml 文件，检查 name 和 path 字段，验证 path 存在
-for f in .sillyspec/projects/*.yaml; do
-  [ -f "$f" ] || continue
-  name=$(grep '^name:' "$f" | head -1 | sed 's/^name:[[:space:]]*//')
-  p=$(grep '^path:' "$f" | head -1 | sed 's/^path:[[:space:]]*//')
-  [ -z "$name" ] && echo "⚠️ $(basename $f) — 缺少 name"
-  [ -z "$p" ] && echo "⚠️ $(basename $f) — 缺少 path"
-  [ -n "$p" ] && [ ! -d "$p" ] && echo "❌ $(basename $f) — path 不存在: $p"
-  [ -n "$name" ] && [ -n "$p" ] && [ -d "$p" ] && echo "✅ $(basename $f) — $name ($p)"
-done
-\`\`\`
-
-### 3. 进度数据一致性
-\`\`\`bash
-# 从 sillyspec.db 读取活跃变更并检查目录存在性
-DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
-if [ ! -f "$DB_FILE" ]; then echo "⚠️ sillyspec.db 不存在"; exit 0; fi
-ACTIVE_CHANGE=$(sqlite3 "$DB_FILE" "SELECT name FROM changes WHERE status='active' ORDER BY last_active DESC LIMIT 1" 2>/dev/null)
-if [ -z "$ACTIVE_CHANGE" ]; then echo "ℹ️ 无当前变更"; exit 0; fi
-echo "当前变更: $ACTIVE_CHANGE"
-DIR=".sillyspec/changes/$ACTIVE_CHANGE"
-[ -d "$DIR" ] && echo "✅ 变更目录存在: $ACTIVE_CHANGE" || echo "❌ 变更目录不存在: $ACTIVE_CHANGE"
-# 检查各阶段状态
-sqlite3 -header -column "$DB_FILE" "SELECT stage, status FROM stages s JOIN changes c ON s.change_id=c.id WHERE c.name='$ACTIVE_CHANGE' ORDER BY s.stage" 2>/dev/null || echo "⚠️ 无法查询阶段数据"
-\`\`\`
-
-### 4. 孤儿文件检查
-\`\`\`bash
-DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
-if [ ! -f "$DB_FILE" ]; then echo "⚠️ sillyspec.db 不存在"; exit 0; fi
-node -e "
-const fs = require('fs');
-const dir = '.sillyspec/changes';
-const subs = fs.existsSync(dir) ? fs.readdirSync(dir).filter(f => { try { return fs.statSync(dir+'/'+f).isDirectory(); } catch { return false; } }) : [];
-const { execSync } = require('child_process');
-let known;
-try { const rows = execSync('sqlite3 -json \".sillyspec/.runtime/sillyspec.db\" \"SELECT name FROM changes WHERE status=\\\"active\\\"\"', {encoding:'utf8'}).trim(); known = new Set(JSON.parse(rows).map(r => r.name)); } catch { known = new Set(); }
-subs.forEach(s => {
-  console.log(known.has(s) ? '✅ ' + s + ' — 已关联' : '⚠️ ' + s + ' — 孤儿目录（可清理）');
-});
-// 反向检查（multi-agent-review Q1）：DB active 且匹配 quick-<hex> 但无目录 → 僵尸 quick 会话
-// （quick 收尾未注销，active 行累积污染 listChanges/doctor）。新代码已修收尾，此项清理历史残留。
-const QUICK_RE = /^quick-[0-9a-f]{8}$/;
-const zombieQuick = [...known].filter(n => QUICK_RE.test(n) && !subs.includes(n));
-if (zombieQuick.length > 0) {
-  console.log('⚠️ 检测到 ' + zombieQuick.length + ' 个僵尸 quick 会话（DB active 但无目录）:');
-  zombieQuick.forEach(n => console.log('   - ' + n));
-}
-"
-\`\`\`
-
-### 5. 配置文件检查
-\`\`\`bash
-# 检查 local.yaml 和 scan 总览文档
-for f in .sillyspec/projects/*.yaml; do
-  [ -f "$f" ] || continue
-  name=$(grep '^name:' "$f" | head -1 | sed 's/^name:[[:space:]]*//')
-  p=$(grep '^path:' "$f" | head -1 | sed 's/^path:[[:space:]]*//')
-  [ -z "$p" ] && continue
-  local_yaml="$p/.sillyspec/local.yaml"
-  arch_md=".sillyspec/docs/$name/scan/ARCHITECTURE.md"
-  [ -f "$local_yaml" ] && echo "✅ local.yaml ($name)" || echo "⚠️ local.yaml ($name) — 不存在"
-  if [ -f "$local_yaml" ]; then
-    grep -q 'test:' "$local_yaml" && echo "  ✅ test 命令已配置" || echo "  ⚠️ 缺少 test 命令"
-  fi
-  [ -f "$arch_md" ] && echo "✅ scan/ARCHITECTURE.md ($name)" || echo "⚠️ scan/ARCHITECTURE.md ($name) — 不存在（运行 sillyspec run scan）"
-done
-\`\`\`
-
-### 6. Worktree 隔离环境检查
-\`\`\`bash
-# 检测当前目录是否在 submodule 中
-SUPERPROJECT=$(git rev-parse --show-superproject-working-tree 2>/dev/null)
-if [ -n "$SUPERPROJECT" ]; then
-  echo "⚠️ 当前目录在 git submodule 内，worktree 隔离不可用"
-else
-  echo "✅ 不在 submodule 中"
-fi
-
-# 检测是否已在 linked worktree 中
-GIT_DIR=$(cd "$(git rev-parse --git-dir)" 2>/dev/null && pwd -P)
-GIT_COMMON=$(cd "$(git rev-parse --git-common-dir)" 2>/dev/null && pwd -P)
-if [ "$GIT_DIR" != "$GIT_COMMON" ] && [ -z "$SUPERPROJECT" ]; then
-  echo "✅ 已在 linked worktree 中"
-else
-  echo "ℹ️ 在主仓库中（非 worktree）"
-fi
-
-# 检查 worktree 存储目录是否被 .gitignore 忽略
-WT_DIR='.sillyspec/.runtime/worktrees'
-if git check-ignore -q "$WT_DIR" 2>/dev/null; then
-  echo "✅ worktree 目录已被 .gitignore 忽略 ($WT_DIR)"
-else
-  echo "❌ worktree 目录未被 .gitignore 忽略 ($WT_DIR) — worktree 创建将被阻断"
-  echo "   修复: 在 .gitignore 中添加 $WT_DIR/"
-fi
-
-# 检查 DB 中的 isolation 状态
-DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
-if [ -f "$DB_FILE" ]; then
-  echo ""
-  echo "isolation 状态（来自 sillyspec.db）:"
-  sqlite3 -header -column "$DB_FILE" "SELECT name, isolation_status AS status, isolation_mode AS mode, isolation_reason AS reason FROM changes WHERE status='active'" 2>/dev/null || echo "⚠️ 查询 isolation 失败"
-else
-  echo ""
-  echo "ℹ️ sillyspec.db 不存在（尚未初始化）"
-fi
-\`\`\`\n
-### 输出
-汇总所有检查结果，按以下格式：
-\`\`\`
-## SillySpec 内部
-✅/⚠️/❌ 各项状态
-\`\`\`
-
-### 注意
-- 不要编造路径或结果，严格基于命令输出
-- 如果 .sillyspec/ 不存在，直接输出 ❌ 并跳过后续检查`,
-      outputHint: 'SillySpec 内部检查结果',
-      optional: false
-    },
-    {
-      name: '构建环境检查',
-      prompt: `检查项目构建环境。先探测项目使用的构建工具，再逐项检查可用性。
-
-### 1. 探测构建工具
-\`\`\`bash
-# 确定项目路径（使用 sillyspec.db 中的项目路径或当前目录）
-PROJECT_DIR=$(sqlite3 -json '.sillyspec/.runtime/sillyspec.db' "SELECT name FROM project WHERE id=1" 2>/dev/null | node -e "const r=JSON.parse(require('fs').readFileSync(0,'utf8'));console.log(r.length>0&&r[0].name?r[0].name:'.')" 2>/dev/null || node -e "
-const fs=require('fs');
-try{const files=fs.readdirSync('.sillyspec/projects').filter(f=>f.endsWith('.yaml'));
-if(files.length>0){const c=fs.readFileSync('.sillyspec/projects/'+files[0],'utf8');const m=c.match(/^path:\\s*(.+)/m);console.log(m?m[1].trim():'.')}else console.log('.')
-}catch{console.log('.')}
-" 2>/dev/null)
-echo "项目目录: $PROJECT_DIR"
-
-# 探测构建工具
-for f in pom.xml build.gradle package.json requirements.txt pyproject.toml go.mod Cargo.toml; do
-  [ -f "$PROJECT_DIR/$f" ] && echo "检测到: $f"
-done
-cat .sillyspec/docs/*/scan/ARCHITECTURE.md 2>/dev/null | head -30 || echo "（无 scan/ARCHITECTURE.md）"
-\`\`\`
-
-### 2. 构建工具可用性
-根据上面检测到的工具，运行对应检查（未检测到的跳过）：
-
-**Maven 项目：**
-\`\`\`bash
-timeout 10 mvn -v 2>/dev/null | head -1 && echo "✅ Maven 可用" || echo "❌ Maven 不可用"
-[ -f ~/.m2/settings.xml ] && echo "✅ Maven settings.xml 存在" || echo "⚠️ Maven settings.xml 不存在"
-timeout 10 java -version 2>&1 | head -1
-\`\`\`
-
-**Gradle 项目：**
-\`\`\`bash
-timeout 10 gradle -v 2>/dev/null | head -1 && echo "✅ Gradle 可用" || echo "❌ Gradle 不可用"
-\`\`\`
-
-**Node.js 项目：**
-\`\`\`bash
-timeout 5 node -v 2>/dev/null && echo "✅ Node.js 可用" || echo "❌ Node.js 不可用"
-timeout 5 npm -v 2>/dev/null && echo "✅ npm 可用" || echo "❌ npm 不可用"
-timeout 5 pnpm -v 2>/dev/null && echo "✅ pnpm 可用" || echo "ℹ️ pnpm 未安装"
-# 检查 registry
-npm config get registry 2>/dev/null
-\`\`\`
-
-**Python 项目：**
-\`\`\`bash
-timeout 5 python3 --version 2>/dev/null && echo "✅ Python3 可用" || echo "❌ Python3 不可用"
-timeout 5 pip3 --version 2>/dev/null && echo "✅ pip3 可用" || echo "❌ pip3 不可用"
-\`\`\`
-
-### 3. Maven 私服检查（仅 Maven 项目）
-\`\`\`bash
-# 从 settings.xml 提取仓库地址
-if [ -f ~/.m2/settings.xml ]; then
-  grep -oP 'https?://[^<"]+:[0-9]+' ~/.m2/settings.xml 2>/dev/null | sort -u | while read url; do
-    timeout 5 curl -s -o /dev/null -w "%{http_code}" "$url" 2>/dev/null
-    echo " — $url"
-  done
-fi
-# 从 pom.xml 提取
-if [ -f "$PROJECT_DIR/pom.xml" ]; then
-  grep -oP 'https?://[^<"]+:[0-9]+' "$PROJECT_DIR/pom.xml" 2>/dev/null | sort -u | while read url; do
-    code=$(timeout 5 curl -s -o /dev/null -w "%{http_code}" "$url" 2>/dev/null)
-    [ "$code" = "000" ] && echo "❌ 私服不可达: $url（超时）" || echo "✅ 私服可达 ($code): $url"
-  done
-fi
-\`\`\`
-
-### 4. 运行时环境
-\`\`\`bash
-timeout 5 node -v 2>/dev/null && echo "Node.js: $(node -v)" || echo "❌ Node.js 未安装"
-timeout 5 git --version 2>/dev/null && echo "Git: $(git --version)" || echo "❌ Git 未安装"
-timeout 10 git remote -v 2>/dev/null | head -2
-timeout 5 git ls-remote --heads origin 2>/dev/null >/dev/null && echo "✅ Git remote 可达" || echo "⚠️ Git remote 不可达"
-timeout 5 java -version 2>&1 | head -1
-timeout 5 python3 --version 2>/dev/null
-\`\`\`
-
-### 输出
-汇总所有检查结果：
-\`\`\`
-## 构建环境
-✅/⚠️/❌ 各项状态
-\`\`\`
-
-### 注意
-- 未检测到的构建工具直接跳过，不要报错
-- timeout 超时的命令视为不可用
-- 不编造结果`,
-      outputHint: '构建环境检查结果',
-      optional: false
-    },
-    {
-      name: '外部依赖检查',
-      prompt: `检查外部依赖工具是否可用。
-
-### 1. Context7 MCP
-\`\`\`bash
-# 检查 MCP 配置
-for f in ~/.config/claude/claude_desktop_config.json ~/.cursor/mcp.json ~/.openclaw/mcp.json; do
-  [ -f "$f" ] && echo "MCP 配置文件: $f" && grep -i context7 "$f" 2>/dev/null && echo "✅ Context7 已配置" || true
-done
-# 也检查 sillyspec 自身的 setup
-node -e "
-try{const m=require(require('path').join(require('os').homedir(),'.sillyspec','config.json'));console.log('✅ sillyspec config 存在')}catch{console.log('ℹ️ 无 sillyspec 全局配置')}
-" 2>/dev/null
-\`\`\`
-
-### 2. grep.app
-\`\`\`bash
-timeout 5 curl -s -o /dev/null -w "%{http_code}" https://grep.app 2>/dev/null | grep -q "200" && echo "✅ grep.app 可达" || echo "⚠️ grep.app 不可达"
-\`\`\`
-
-### 3. 其他 AI 工具（可选）
-\`\`\`bash
-# 检查常用 AI/开发工具
-timeout 5 which gh 2>/dev/null && echo "✅ GitHub CLI 可用" || echo "ℹ️ GitHub CLI 未安装"
-timeout 5 which docker 2>/dev/null && echo "✅ Docker 可用" || echo "ℹ️ Docker 未安装"
-\`\`\`
-
-### 输出
-\`\`\`
-## 外部依赖
-✅/⚠️/❌ 各项状态
-\`\`\`
-
-### 注意
-- 不编造结果
-- 工具未安装用 ℹ️ 标记（非错误），不可达用 ⚠️`,
-      outputHint: '外部依赖检查结果',
-      optional: false
-    },
-    {
-      name: '模块文档健康检查',
-      prompt: `检查模块索引和卡片文档的健康状态。
-
-### 操作
-1. 运行 \`sillyspec modules status\` 查看模块索引概览
-2. 读取 \`.sillyspec/docs/<project>/modules/_module-map.yaml\`
-3. 对每个模块，检查：
-   - module_id 是否有对应的卡片文件（modules/<module-id>.md）
-   - 卡片文件是否有有效的 frontmatter（schema_version, doc_type, module_id）
-   - 人工备注标记是否配对（MANUAL_NOTES_START 和 MANUAL_NOTES_END 必须成对出现）
-   - needs_review 为 true 的模块列表
-4. 汇总结果
-
-### 输出格式
-\`\`\`
-📋 模块文档健康检查
-✅ _module-map.yaml — 存在，N 个模块
-⚠️  auth-service — needs_review=true，原因：...
-❌ payment-service — 卡片文件缺失
-✅ 所有模块人工备注标记配对正常
-\`\`\`
-
-### 注意
-- 如果 _module-map.yaml 不存在，输出"模块索引未生成，建议运行 scan"
-`,
-      outputHint: '模块文档健康状态',
-      optional: false
-    },
-    {
-      name: '汇总报告',
-      prompt: `汇总前四步的所有检查结果，生成最终的自检报告。
-
-### 输出格式
-\`\`\`
-🔍 SillySpec Doctor — 项目自检报告
-
-## SillySpec 内部
-✅ .sillyspec/ 目录结构 — 正常
-✅ projects/*.yaml — N 个项目已注册
-⚠️  local.yaml (xxx) — 缺少 test 命令
-❌ sillyspec.db 阶段状态 — brainstorm 标记完成但 design.md 不存在
-
-## 构建环境
-✅ Node.js v23.4.0 — 可用
-✅ npm 10.x — 可用
-✅ Java 17.0.2 — 可用
-❌ Maven 私服 (10.0.0.1:8081) — 不可达（超时）
-
-## 外部依赖
-✅ Context7 MCP — 已配置
-⚠️  grep.app — 不可达
-\`\`\`
-
-### 要求
-- 基于前 3 步的实际输出汇总，不要编造
-- 每类问题归入对应分区
-- 全部通过给出 🎉
-- 如果有 ❌ 或 ⚠️，在末尾逐项给出修复建议
-
-### 修复建议模板
-根据问题类型给出具体可操作的修复命令：
-
-**常见问题及修复：**
-- CLI 未安装 → \`npm install -g sillyspec\`
-- 缺少 local.yaml → \`sillyspec local detect\` 重新生成，或手动创建
-- local.yaml 缺少 test 命令 → 补充对应命令
-- 缺少 scan 文档（ARCHITECTURE.md 等）→ \`sillyspec run scan\` 重新扫描
-- sillyspec.db 状态不一致 → \`sillyspec run <阶段> --reset\` 重置对应阶段
-- 孤儿目录 → 确认后 \`rm -rf .sillyspec/changes/<目录名>\`
-- Maven 私服不可达 → 检查 VPN、settings.xml 配置、私服状态
-- Git remote 不可达 → 检查网络、SSH key 或凭证
-- 工具未安装 → 给出安装命令（如 \`brew install maven\`）
-
-每条建议格式：
-\`\`\`
-💡 修复：<问题描述>
-   <具体命令或操作>
-\`\`\``,
-      outputHint: '完整自检报告',
-      optional: false
-    }
-  ]
-}
+// SillySpec Doctor — 项目自检阶段
+// 检查项通过 prompt 中的 bash 命令执行，此文件仅定义步骤结构
+
+
+export const definition = {
+  name: 'doctor',
+  title: '项目自检',
+  description: '检查 SillySpec 配置、构建环境和外部依赖',
+  auxiliary: true,
+  steps: [
+    {
+      name: 'SillySpec 内部检查',
+      prompt: `运行 SillySpec 内部检查。逐项执行以下命令并汇总结果：
+
+> ✅ Windows 兼容（SS-1，2026-08-20）：db 查询已全部改走 node:sqlite（node≥22.13 内置），不再依赖外部 sqlite3 CLI。若 node 脚本失败，改用 sillyspec 自身命令替代——sillyspec progress show 查看当前变更与各阶段状态，sillyspec doctor --json 查看 db 健康与活跃变更列表。
+
+### 1. 目录结构完整性
+\`\`\`bash
+# 检查 .sillyspec/ 及子目录
+for d in .sillyspec .sillyspec/projects .sillyspec/docs .sillyspec/changes .sillyspec/.runtime; do
+  [ -d "$d" ] && echo "✅ $d" || echo "❌ $d"
+done
+# 检查 sillyspec.db（SQLite 权威状态源）
+DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
+[ -f "$DB_FILE" ] && echo "✅ sillyspec.db 存在" || echo "❌ sillyspec.db 不存在"
+# 用 sillyspec 自身命令验证 db 可读（fallback 不依赖外部 sqlite3 CLI，兼容 Windows）
+sqlite3 "$DB_FILE" "SELECT count(*) FROM project" 2>/dev/null && echo "✅ sillyspec.db 可查询" || (sillyspec progress show >/dev/null 2>&1 && echo "✅ sillyspec.db 可查询（经 sillyspec 命令）" || echo "⚠️ sillyspec.db 不可查询")
+\`\`\`
+
+### 2. 项目配置检查
+\`\`\`bash
+ls .sillyspec/projects/*.yaml 2>/dev/null
+# 对每个 yaml 文件，检查 name 和 path 字段，验证 path 存在
+for f in .sillyspec/projects/*.yaml; do
+  [ -f "$f" ] || continue
+  name=$(grep '^name:' "$f" | head -1 | sed 's/^name:[[:space:]]*//')
+  p=$(grep '^path:' "$f" | head -1 | sed 's/^path:[[:space:]]*//')
+  [ -z "$name" ] && echo "⚠️ $(basename $f) — 缺少 name"
+  [ -z "$p" ] && echo "⚠️ $(basename $f) — 缺少 path"
+  [ -n "$p" ] && [ ! -d "$p" ] && echo "❌ $(basename $f) — path 不存在: $p"
+  [ -n "$name" ] && [ -n "$p" ] && [ -d "$p" ] && echo "✅ $(basename $f) — $name ($p)"
+done
+\`\`\`
+
+### 3. 进度数据一致性
+\`\`\`bash
+# 从 sillyspec.db 读取活跃变更并检查目录存在性（node:sqlite 主路径，Windows 无 sqlite3 CLI）
+DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
+if [ ! -f "$DB_FILE" ]; then echo "⚠️ sillyspec.db 不存在"; exit 0; fi
+node --input-type=module -e "
+import { DatabaseSync } from 'node:sqlite';
+import { existsSync } from 'node:fs';
+const db = new DatabaseSync(process.argv[1], { readOnly: true });
+const row = db.prepare(\\"SELECT name FROM changes WHERE status='active' ORDER BY last_active DESC LIMIT 1\\").get();
+if (!row) { console.log('ℹ️ 无当前变更'); process.exit(0); }
+console.log('当前变更: ' + row.name);
+const dir = '.sillyspec/changes/' + row.name;
+console.log(existsSync(dir) ? '✅ 变更目录存在: ' + row.name : '❌ 变更目录不存在: ' + row.name);
+const stages = db.prepare('SELECT s.stage AS stage, s.status AS status FROM stages s JOIN changes c ON s.change_id=c.id WHERE c.name=? ORDER BY s.stage').all(row.name);
+if (stages.length === 0) console.log('⚠️ 无阶段数据'); else for (const s of stages) console.log('  ' + s.stage + ': ' + s.status);
+db.close();
+" "$DB_FILE" 2>/dev/null || echo "⚠️ 无法查询阶段数据"
+\`\`\`
+
+### 4. 孤儿文件检查
+\`\`\`bash
+DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
+if [ ! -f "$DB_FILE" ]; then echo "⚠️ sillyspec.db 不存在"; exit 0; fi
+node -e "
+const fs = require('fs');
+const { DatabaseSync } = require('node:sqlite');
+const dir = '.sillyspec/changes';
+const subs = fs.existsSync(dir) ? fs.readdirSync(dir).filter(f => { try { return fs.statSync(dir+'/'+f).isDirectory() && f !== 'archive'; } catch { return false; } }) : [];
+let known;
+try { const db = new DatabaseSync('.sillyspec/.runtime/sillyspec.db', { readOnly: true }); known = new Set(db.prepare(\"SELECT name FROM changes WHERE status='active'\").all().map(r => r.name)); db.close(); } catch (e) { console.log('⚠️ db 读取失败: ' + e.message + '（跳过孤儿判定，不做任何清理建议）'); known = null; }
+if (known) subs.forEach(s => {
+  console.log(known.has(s) ? '✅ ' + s + ' — 已关联' : '⚠️ ' + s + ' — 孤儿目录（先 dump 取证再手工归位，勿直接 rm）');
+});
+subs.forEach(s => {
+  console.log(known.has(s) ? '✅ ' + s + ' — 已关联' : '⚠️ ' + s + ' — 孤儿目录（可清理）');
+});
+// 反向检查（multi-agent-review Q1）：DB active 且匹配 quick-<hex> 但无目录 → 僵尸 quick 会话
+// （quick 收尾未注销，active 行累积污染 listChanges/doctor）。新代码已修收尾，此项清理历史残留。
+const QUICK_RE = /^quick-[0-9a-f]{8}$/;
+const zombieQuick = [...known].filter(n => QUICK_RE.test(n) && !subs.includes(n));
+if (zombieQuick.length > 0) {
+  console.log('⚠️ 检测到 ' + zombieQuick.length + ' 个僵尸 quick 会话（DB active 但无目录）:');
+  zombieQuick.forEach(n => console.log('   - ' + n));
+}
+"
+\`\`\`
+
+### 5. 配置文件检查
+\`\`\`bash
+# 检查 local.yaml 和 scan 总览文档
+for f in .sillyspec/projects/*.yaml; do
+  [ -f "$f" ] || continue
+  name=$(grep '^name:' "$f" | head -1 | sed 's/^name:[[:space:]]*//')
+  p=$(grep '^path:' "$f" | head -1 | sed 's/^path:[[:space:]]*//')
+  [ -z "$p" ] && continue
+  local_yaml="$p/.sillyspec/local.yaml"
+  arch_md=".sillyspec/docs/$name/scan/ARCHITECTURE.md"
+  [ -f "$local_yaml" ] && echo "✅ local.yaml ($name)" || echo "⚠️ local.yaml ($name) — 不存在"
+  if [ -f "$local_yaml" ]; then
+    grep -q 'test:' "$local_yaml" && echo "  ✅ test 命令已配置" || echo "  ⚠️ 缺少 test 命令"
+  fi
+  [ -f "$arch_md" ] && echo "✅ scan/ARCHITECTURE.md ($name)" || echo "⚠️ scan/ARCHITECTURE.md ($name) — 不存在（运行 sillyspec run scan）"
+done
+\`\`\`
+
+### 6. Worktree 隔离环境检查
+\`\`\`bash
+# 检测当前目录是否在 submodule 中
+SUPERPROJECT=$(git rev-parse --show-superproject-working-tree 2>/dev/null)
+if [ -n "$SUPERPROJECT" ]; then
+  echo "⚠️ 当前目录在 git submodule 内，worktree 隔离不可用"
+else
+  echo "✅ 不在 submodule 中"
+fi
+
+# 检测是否已在 linked worktree 中
+GIT_DIR=$(cd "$(git rev-parse --git-dir)" 2>/dev/null && pwd -P)
+GIT_COMMON=$(cd "$(git rev-parse --git-common-dir)" 2>/dev/null && pwd -P)
+if [ "$GIT_DIR" != "$GIT_COMMON" ] && [ -z "$SUPERPROJECT" ]; then
+  echo "✅ 已在 linked worktree 中"
+else
+  echo "ℹ️ 在主仓库中（非 worktree）"
+fi
+
+# 检查 worktree 存储目录是否被 .gitignore 忽略
+WT_DIR='.sillyspec/.runtime/worktrees'
+if git check-ignore -q "$WT_DIR" 2>/dev/null; then
+  echo "✅ worktree 目录已被 .gitignore 忽略 ($WT_DIR)"
+else
+  echo "❌ worktree 目录未被 .gitignore 忽略 ($WT_DIR) — worktree 创建将被阻断"
+  echo "   修复: 在 .gitignore 中添加 $WT_DIR/"
+fi
+
+# 检查 DB 中的 isolation 状态
+DB_FILE='.sillyspec/.runtime/sillyspec.db'
+if [ -f "$DB_FILE" ]; then
+  echo ""
+  echo "isolation 状态（来自 sillyspec.db）:"
+  node -e "
+const { DatabaseSync } = require('node:sqlite');
+const db = new DatabaseSync(process.argv[1], { readOnly: true });
+const rows = db.prepare(\"SELECT name, isolation_status AS status, isolation_mode AS mode, isolation_reason AS reason FROM changes WHERE status='active'\").all();
+for (const r of rows) console.log('  ' + r.name + ' | ' + r.status + ' | ' + r.mode + ' | ' + (r.reason || ''));
+db.close();
+" "$DB_FILE" 2>/dev/null || echo "⚠️ 查询 isolation 失败"
+else
+  echo ""
+  echo "ℹ️ sillyspec.db 不存在（尚未初始化）"
+fi
+\`\`\`\n
+### 输出
+汇总所有检查结果，按以下格式：
+\`\`\`
+## SillySpec 内部
+✅/⚠️/❌ 各项状态
+\`\`\`
+
+### 注意
+- 不要编造路径或结果，严格基于命令输出
+- 如果 .sillyspec/ 不存在，直接输出 ❌ 并跳过后续检查`,
+      outputHint: 'SillySpec 内部检查结果',
+      optional: false
+    },
+    {
+      name: '构建环境检查',
+      prompt: `检查项目构建环境。先探测项目使用的构建工具，再逐项检查可用性。
+
+### 1. 探测构建工具
+\`\`\`bash
+# 确定项目路径（使用 sillyspec.db 中的项目路径或当前目录）
+PROJECT_DIR=$(sqlite3 -json '.sillyspec/.runtime/sillyspec.db' "SELECT name FROM project WHERE id=1" 2>/dev/null | node -e "const r=JSON.parse(require('fs').readFileSync(0,'utf8'));console.log(r.length>0&&r[0].name?r[0].name:'.')" 2>/dev/null || node -e "
+const fs=require('fs');
+try{const files=fs.readdirSync('.sillyspec/projects').filter(f=>f.endsWith('.yaml'));
+if(files.length>0){const c=fs.readFileSync('.sillyspec/projects/'+files[0],'utf8');const m=c.match(/^path:\\s*(.+)/m);console.log(m?m[1].trim():'.')}else console.log('.')
+}catch{console.log('.')}
+" 2>/dev/null)
+echo "项目目录: $PROJECT_DIR"
+
+# 探测构建工具
+for f in pom.xml build.gradle package.json requirements.txt pyproject.toml go.mod Cargo.toml; do
+  [ -f "$PROJECT_DIR/$f" ] && echo "检测到: $f"
+done
+cat .sillyspec/docs/*/scan/ARCHITECTURE.md 2>/dev/null | head -30 || echo "（无 scan/ARCHITECTURE.md）"
+\`\`\`
+
+### 2. 构建工具可用性
+根据上面检测到的工具，运行对应检查（未检测到的跳过）：
+
+**Maven 项目：**
+\`\`\`bash
+timeout 10 mvn -v 2>/dev/null | head -1 && echo "✅ Maven 可用" || echo "❌ Maven 不可用"
+[ -f ~/.m2/settings.xml ] && echo "✅ Maven settings.xml 存在" || echo "⚠️ Maven settings.xml 不存在"
+timeout 10 java -version 2>&1 | head -1
+\`\`\`
+
+**Gradle 项目：**
+\`\`\`bash
+timeout 10 gradle -v 2>/dev/null | head -1 && echo "✅ Gradle 可用" || echo "❌ Gradle 不可用"
+\`\`\`
+
+**Node.js 项目：**
+\`\`\`bash
+timeout 5 node -v 2>/dev/null && echo "✅ Node.js 可用" || echo "❌ Node.js 不可用"
+timeout 5 npm -v 2>/dev/null && echo "✅ npm 可用" || echo "❌ npm 不可用"
+timeout 5 pnpm -v 2>/dev/null && echo "✅ pnpm 可用" || echo "ℹ️ pnpm 未安装"
+# 检查 registry
+npm config get registry 2>/dev/null
+\`\`\`
+
+**Python 项目：**
+\`\`\`bash
+timeout 5 python3 --version 2>/dev/null && echo "✅ Python3 可用" || echo "❌ Python3 不可用"
+timeout 5 pip3 --version 2>/dev/null && echo "✅ pip3 可用" || echo "❌ pip3 不可用"
+\`\`\`
+
+### 3. Maven 私服检查（仅 Maven 项目）
+\`\`\`bash
+# 从 settings.xml 提取仓库地址
+if [ -f ~/.m2/settings.xml ]; then
+  grep -oP 'https?://[^<"]+:[0-9]+' ~/.m2/settings.xml 2>/dev/null | sort -u | while read url; do
+    timeout 5 curl -s -o /dev/null -w "%{http_code}" "$url" 2>/dev/null
+    echo " — $url"
+  done
+fi
+# 从 pom.xml 提取
+if [ -f "$PROJECT_DIR/pom.xml" ]; then
+  grep -oP 'https?://[^<"]+:[0-9]+' "$PROJECT_DIR/pom.xml" 2>/dev/null | sort -u | while read url; do
+    code=$(timeout 5 curl -s -o /dev/null -w "%{http_code}" "$url" 2>/dev/null)
+    [ "$code" = "000" ] && echo "❌ 私服不可达: $url（超时）" || echo "✅ 私服可达 ($code): $url"
+  done
+fi
+\`\`\`
+
+### 4. 运行时环境
+\`\`\`bash
+timeout 5 node -v 2>/dev/null && echo "Node.js: $(node -v)" || echo "❌ Node.js 未安装"
+timeout 5 git --version 2>/dev/null && echo "Git: $(git --version)" || echo "❌ Git 未安装"
+timeout 10 git remote -v 2>/dev/null | head -2
+timeout 5 git ls-remote --heads origin 2>/dev/null >/dev/null && echo "✅ Git remote 可达" || echo "⚠️ Git remote 不可达"
+timeout 5 java -version 2>&1 | head -1
+timeout 5 python3 --version 2>/dev/null
+\`\`\`
+
+### 输出
+汇总所有检查结果：
+\`\`\`
+## 构建环境
+✅/⚠️/❌ 各项状态
+\`\`\`
+
+### 注意
+- 未检测到的构建工具直接跳过，不要报错
+- timeout 超时的命令视为不可用
+- 不编造结果`,
+      outputHint: '构建环境检查结果',
+      optional: false
+    },
+    {
+      name: '外部依赖检查',
+      prompt: `检查外部依赖工具是否可用。
+
+### 1. Context7 MCP
+\`\`\`bash
+# 检查 MCP 配置
+for f in ~/.config/claude/claude_desktop_config.json ~/.cursor/mcp.json ~/.openclaw/mcp.json; do
+  [ -f "$f" ] && echo "MCP 配置文件: $f" && grep -i context7 "$f" 2>/dev/null && echo "✅ Context7 已配置" || true
+done
+# 也检查 sillyspec 自身的 setup
+node -e "
+try{const m=require(require('path').join(require('os').homedir(),'.sillyspec','config.json'));console.log('✅ sillyspec config 存在')}catch{console.log('ℹ️ 无 sillyspec 全局配置')}
+" 2>/dev/null
+\`\`\`
+
+### 2. grep.app
+\`\`\`bash
+timeout 5 curl -s -o /dev/null -w "%{http_code}" https://grep.app 2>/dev/null | grep -q "200" && echo "✅ grep.app 可达" || echo "⚠️ grep.app 不可达"
+\`\`\`
+
+### 3. 其他 AI 工具（可选）
+\`\`\`bash
+# 检查常用 AI/开发工具
+timeout 5 which gh 2>/dev/null && echo "✅ GitHub CLI 可用" || echo "ℹ️ GitHub CLI 未安装"
+timeout 5 which docker 2>/dev/null && echo "✅ Docker 可用" || echo "ℹ️ Docker 未安装"
+\`\`\`
+
+### 输出
+\`\`\`
+## 外部依赖
+✅/⚠️/❌ 各项状态
+\`\`\`
+
+### 注意
+- 不编造结果
+- 工具未安装用 ℹ️ 标记（非错误），不可达用 ⚠️`,
+      outputHint: '外部依赖检查结果',
+      optional: false
+    },
+    {
+      name: '模块文档健康检查',
+      prompt: `检查模块索引和卡片文档的健康状态。
+
+### 操作
+1. 运行 \`sillyspec modules status\` 查看模块索引概览
+2. 读取 \`.sillyspec/docs/<project>/modules/_module-map.yaml\`
+3. 对每个模块，检查：
+   - module_id 是否有对应的卡片文件（modules/<module-id>.md）
+   - 卡片文件是否有有效的 frontmatter（schema_version, doc_type, module_id）
+   - 人工备注标记是否配对（MANUAL_NOTES_START 和 MANUAL_NOTES_END 必须成对出现）
+   - needs_review 为 true 的模块列表
+4. 汇总结果
+
+### 输出格式
+\`\`\`
+📋 模块文档健康检查
+✅ _module-map.yaml — 存在，N 个模块
+⚠️  auth-service — needs_review=true，原因：...
+❌ payment-service — 卡片文件缺失
+✅ 所有模块人工备注标记配对正常
+\`\`\`
+
+### 注意
+- 如果 _module-map.yaml 不存在，输出"模块索引未生成，建议运行 scan"
+`,
+      outputHint: '模块文档健康状态',
+      optional: false
+    },
+    {
+      name: '汇总报告',
+      prompt: `汇总前四步的所有检查结果，生成最终的自检报告。
+
+### 输出格式
+\`\`\`
+🔍 SillySpec Doctor — 项目自检报告
+
+## SillySpec 内部
+✅ .sillyspec/ 目录结构 — 正常
+✅ projects/*.yaml — N 个项目已注册
+⚠️  local.yaml (xxx) — 缺少 test 命令
+❌ sillyspec.db 阶段状态 — brainstorm 标记完成但 design.md 不存在
+
+## 构建环境
+✅ Node.js v23.4.0 — 可用
+✅ npm 10.x — 可用
+✅ Java 17.0.2 — 可用
+❌ Maven 私服 (10.0.0.1:8081) — 不可达（超时）
+
+## 外部依赖
+✅ Context7 MCP — 已配置
+⚠️  grep.app — 不可达
+\`\`\`
+
+### 要求
+- 基于前 3 步的实际输出汇总，不要编造
+- 每类问题归入对应分区
+- 全部通过给出 🎉
+- 如果有 ❌ 或 ⚠️，在末尾逐项给出修复建议
+
+### 修复建议模板
+根据问题类型给出具体可操作的修复命令：
+
+**常见问题及修复：**
+- CLI 未安装 → \`npm install -g sillyspec\`
+- 缺少 local.yaml → \`sillyspec local detect\` 重新生成，或手动创建
+- local.yaml 缺少 test 命令 → 补充对应命令
+- 缺少 scan 文档（ARCHITECTURE.md 等）→ \`sillyspec run scan\` 重新扫描
+- sillyspec.db 状态不一致 → \`sillyspec run <阶段> --reset\` 重置对应阶段
+- 孤儿目录 → 确认后 \`rm -rf .sillyspec/changes/<目录名>\`
+- Maven 私服不可达 → 检查 VPN、settings.xml 配置、私服状态
+- Git remote 不可达 → 检查网络、SSH key 或凭证
+- 工具未安装 → 给出安装命令（如 \`brew install maven\`）
+
+每条建议格式：
+\`\`\`
+💡 修复：<问题描述>
+   <具体命令或操作>
+\`\`\``,
+      outputHint: '完整自检报告',
+      optional: false
+    }
+  ]
+}