phasegate 0.91.0 → 0.107.0

package/CHANGELOG.md

@@ -7,6 +7,175 @@ and this project adheres to [Semantic Versioning](https://semver.org/spec/v2.0.0
 
 ## [Unreleased]
 
+## [0.100.0] - 2026-04-23
+
+### Added
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+- **ISSUE-014 Wave 6: preset 選定ガイド + `migrate` CLI + 呼称分離 + v0.86.0 未満警告** — Wave 5.5 までの実装を user 導線と docs に接続し ISSUE-014 を CLOSE する。
+  - **`docs/guide/preset-selection.md` 新設**: 7 preset（clean / strict-ddd / onion / hexagonal / layered / flat / custom）の早見表 + 選択フローチャート + 設定例 + override / custom の書式 + v2 → v3 移行手順。
+  - **README.md**: Presets 節を「Defense preset（`project.preset`）」「Architecture preset（`architecture.preset`）」の 2 テーブルに分け、preset-selection.md への導線を追加 + 呼称分離の補足。
+  - **CLAUDE.md**: 「防御プリセット（CI strict/lenient）」と「アーキプリセット（clean/onion/hex...）」の呼称分離ガイドを追記。issue / PR / チャットで「preset」とだけ書かず必ず種類を明示するルール化。
+  - **retrofit-adoption.md**: Step 1 に architecture preset 選定節を追加、`npx phasegate migrate --schema v3` の導線。
+  - **`phasegate migrate --schema v3` CLI 新設** (`scripts/harness/config-foundation/`): `MigrateSchemaUseCase` + `MigrateSchemaCommandHandler` + `main.ts` の switch-case `migrate` + ヘルプ追記。`phasegate.config.json` を読んで `architecture` キーが無ければ `{ preset: "clean" }` を追記して v3 化（idempotent）。
+  - **v0.86.0 未満警告**: `LoadResolvedConfigUseCase` が source document の `architecture` 有無で `schemaVersion: 'v2' | 'v3'` を判定して output DTO に追加。`main.ts` の `loadResolvedConfig()` が v2 検出時に `npx phasegate migrate --schema v3` の案内を **一度だけ** stderr に出力（同一プロセスで多重 load されても重複警告しない）。
+
+### Tests
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+- 新規 `scripts/harness/__tests__/unit/config-foundation/migrate-schema-use-case.test.ts` で 6 テスト: v2→v3 変換 / v3 no-op / array document で InvalidConfigShapeError / null document / 未対応 targetVersion / configPath 透過。
+- 新規 `scripts/harness/__tests__/integration/config-foundation/migrate-schema-use-case.test.ts` で 2 テスト: tmp dir round-trip（v2 config → 永続化検証 / v3 config → mtime 不変で no-op 確認）。
+- 既存 `load-resolved-config-use-case.test.ts` と `load-config-facade.test.ts` の toEqual 期待値に `schemaVersion: 'v2'` を追加。
+- 全 3387 tests green（3368 unit/integration + 19 forks、+8 新規）、`npx phasegate lint` violations 0（1301 ファイル scan）。
+
+### Notes
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+- これにより ISSUE-014（アーキテクチャスタイルの config 対応）は Wave 1〜6 完走 → **CLOSED**。v0.86.0〜v0.99.0 の 14 バージョンで段階的に構築: Wave 1 設計文書 → Wave 2 VO 注入 → Wave 3 schema v3 → Wave 4 flat preset + biome-ast-engine 配線 → Wave 5 pipeline 全体に spec 配線 → Wave 5.5 3 preset dogfood integration test → Wave 6 guide + migrate CLI + 警告。
+- `phasegate migrate --schema v3` は破壊的変更ではなく additive（既存フィールドは保持、`architecture` だけ追加）。本リポジトリ自身は Wave 3 時点で dogfood 済のため migrate 対象外。
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+## [0.99.0] - 2026-04-23
+
+### Added
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+- **ISSUE-014 Wave 5.5: 3 preset（onion / hexagonal / layered）dogfood を vitest integration test で自動化** — Wave 5 で pipeline 配線は完成したが、外部 PJ 相当の end-to-end 検証は pre-tool-use-hook の `/tmp/**/src/domain/**` blocking で deferred していた。本 Wave では `/tmp/` への Claude Write を諦め、**テストランタイムの `fs.writeFileSync`（hook 対象外）で `os.tmpdir()` に fixture 展開する方針**に切り替えて解消。
+  - `scripts/harness/__tests__/integration/biome-ast-engine/preset-dogfood.integration.test.ts` を新設（`@story ISSUE-014`）。
+  - 各 preset につき「許容方向 import → violation 0 件」と「違反方向 import → `no-layer-violation` で検出」の 2 テスト × 3 preset = 計 6 テストを `createBiomeAstEngineModule(rootDir, { architecture })` 経由で `ExecuteLintUseCase.execute({ targets: ['src'], includeBiomeNative: false })` を呼び出して検証。
+  - 検証内容: onion（interface→domain 許容 / domain→interface 検出）、hexagonal（adapters→core 許容 / core→adapters 検出）、layered（presentation→business→data 許容 / data→presentation 検出）。
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+### Tests
+
+- 新規 `preset-dogfood.integration.test.ts` で 6 テスト追加（3354 → 3360）。
+- 全 3379 tests green（3360 unit/integration + 19 forks）、`npx phasegate lint` violations 0（1297 ファイル scan）。
+
+### Notes
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+- 本 Wave は当初「`/tmp/phasegate-dogfood-*/` に実際のディレクトリを切って `npx phasegate lint` を走らせる外部検証」を想定していたが、pre-tool-use-hook が Claude の Write 経路で `/tmp/**/src/domain/**` を Full-mode 必須カテゴリと判定して blocking するため実行不能。hook の scope を narrow する修正は independent の refactoring スコープになるため、本 Wave では integration test ベースでの dogfood に切替（Claude が関与しない Node.js ランタイム書き込みは hook 対象外）。CLI 経由で phasegate.config.json を読み込む経路の検証は Wave 6 の `migrate` CLI テストで補完予定。
+- ISSUE-014 は Wave 5.5 まで完了。残り Wave 6（ガイド追記 + `migrate` CLI + 呼称分離）で CLOSE 予定。
+
+## [0.98.0] - 2026-04-23
+
+### Added
+
+- **ISSUE-014 Wave 5: `no-layer-violation` への `architecture.allowedDependencies` 注入 + pipeline 全体への spec 配線** — Wave 4 で flat preset 配線を作った後の、非 clean preset（onion / hexagonal / layered / strict-ddd / custom）を実際に lint 判定へ反映する改修。
+  - `ResolveEnabledRulesUseCase` 出力に `architectureSpec: ArchitectureSpec` を追加（DTO + mapper 拡張）。config-foundation の `preset / layers / allowedDependencies` を `freezeArchitectureSpec` で ArchitectureSpec に変換して下流へ伝播。
+  - `LintRunner.run(params)` の params に optional `architecture` を追加。`no-layer-violation` rule 内の `LayerBoundary.standardMatrix()` ハードコード呼び出しを `LayerBoundary.standardMatrix(architecture)` に置換（未指定時は `CLEAN_PRESET_SPEC` で後方互換）。
+  - `SourceModuleSnapshot.create(props, spec?)` で `@layer` tag の正規化が spec 経由になり、`core` / `interface` / `ports` 等の非 clean 層名が LayerName として認識可能に。
+  - `SourceModuleAnalyzerPort.analyzeMany(files, architecture?)` + `TypeScriptSourceModuleAnalyzerAdapter` + `source-module-snapshot-mapper.toSourceModuleSnapshot(raw, architecture?)` の 3 箇所に spec 伝播。
+  - `AnalyzeImportGraphUseCase` 入力 DTO に `architecture?` を追加、`ExecuteLintUseCase` が `resolvedRules.architectureSpec` を analyze/lintRunner の両方へ配線。
+
+### Tests
+
+- 新規 `lint-runner.test.ts` に onion preset 2 件（`domain → interface` 違反検出 / `interface → domain` 許容）を追加 — architecture 注入経路を end-to-end で検証。
+- 新規 `source-module-snapshot.test.ts` に hexagonal spec 正規化 2 件（`core` 値が LayerName として通る / spec 省略時は clean default で `null` に落ちる）を追加。
+- 新規 `resolve-enabled-rules-usecase.test.ts` に onion architecture の architectureSpec 透過 1 件を追加。
+- 既存 `analyze-import-graph-usecase.test.ts` / `execute-lint-usecase.test.ts` の mock 期待値を新シグネチャに更新。
+- 全 3373 tests green（3354 unit + 19 forks、+5）、`npx phasegate lint` violations 0。
+
+### Notes
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+- 「外部 dogfood（`/tmp/phasegate-dogfood-onion` 等の 3 preset）」は pre-tool-use-hook が `/tmp/**/src/domain/**` への書き込みを quick-mode 外カテゴリとして blocking するため Wave 5.5 に延期。コード経路は unit test で end-to-end 検証済み。
+- Wave 6（ガイド追記 + `migrate` CLI + v0.86.0 境界警告）は本 Wave の範囲外。
+
+## [0.97.0] - 2026-04-23
+
+### Added
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+- **ISSUE-014 Wave 4: `flat` preset auto-disable + user override 優先度 + architecture 配線** — Wave 3 で config-foundation がエクスポートした `architecture` を biome-ast-engine の L1 rule pipeline に接続した初回。
+  - `RuleConfigProviderPort` に `getArchitecture()` を追加し、`preset / layers / allowedDependencies` を供給。
+  - `HarnessConfigProviderAdapter` が architecture を保持・返却。未注入時は clean default に fallback。
+  - `createBiomeAstEngineModule` の `BiomeAstEngineModuleOptions` に `architecture?` を追加。
+  - `ResolveEnabledRulesUseCase` が `preset === 'flat'` 時に `require-unit-comment / require-layer-comment / no-layer-violation / enforce-folder-structure` を自動 `off` 扱い。**user 明示設定（rules or overrideRules）が存在する rule は preset 既定より優先**。
+  - `main.ts` が `resolvedConfig.architecture` を抽出し `createBiomeAstEngineModule` に渡す配線を追加。
+  - flat preset は `@layer` タグが残っていても L1-001/002/003/004 が skipped なので違反を発火しない（option A: 残存 tag は ignore）。
+
+### Tests
+
+- `unit/biome-ast-engine/resolve-enabled-rules-usecase.test.ts` に 4 件追加（flat preset 未指定時の 4 rule skipped / user `error` 明示優先 / user overrideRules `off` 明示 / clean preset は既定で auto-disable されない）。
+
+### Notes
+
+- Wave 5（`onion / hexagonal / layered / strict-ddd / custom` の実体活用 + dogfood）と Wave 6（ガイド追記 + migrate CLI）は別 Wave に送り、Wave 4 は flat 有効化のみに絞る。
+- 現状 `no-layer-violation` rule は `LayerBoundary.standardMatrix()` をハードコード呼び出し中（`LintRunner`）。Wave 5 で architecture.allowedDependencies を注入する改修を予定。
+
+## [0.96.0] - 2026-04-23
+
+### Added
+
+- **ISSUE-014 Wave 3: schema v3 + config-foundation による architecture preset のロード基盤** — Wave 2 で VO に注入口を用意した後の、config レイヤーでの実体化フェーズ。biome-ast-engine 側の配線は Wave 4 以降で担当する。
+  - 新規 `scripts/harness/config-foundation/infrastructure/schemas/harness-config-v3.schema.json` — v2 schema に `architecture` セクション（`preset` 必須、`custom` 時は `layers` + `allowedDependencies` 必須の `allOf/if/then`）を optional で追加。
+  - 新規 `domain/value-objects/architecture-config.ts` — `ArchitecturePresetId` / `ArchitectureConfigSource` / `ArchitectureConfigDocument` / `freezeArchitectureDocument` / `isArchitecturePresetId`。
+  - 新規 `domain/value-objects/architecture-preset-catalog.ts` — `clean / strict-ddd / onion / hexagonal / layered / flat` の 6 preset 定義（`custom` は source 側で明示）。
+  - 新規 `domain/services/architecture-resolution-service.ts` — preset 展開 + 明示 override マージ + semantic validation（C1 自己参照欠落は auto-fill + warn、C2 キー不整合は error、C3 値不整合は error、C4 layer 欠落は `{self}` auto-fill + warn、C5 循環依存は warn）+ layerDetection precedence（byPath=false+byTag=false は error）。
+  - `AjvConfigSchemaValidator` に構造検出（`architecture` キー有無）を追加し、v2/v3 schema を自動選択。
+  - `HarnessConfigResolvedDocument` に optional `architecture` を追加。`LoadResolvedConfigUseCase` が architecture を常時 resolve し、v2 config は `{ preset: "clean" }` 既定を synthesize。
+- **phasegate レポ自身の `phasegate.config.json` に `architecture: { preset: "clean" }` dogfood 明示追記** — Wave 2 から移送された項目。v3 schema + loader が揃った本 Wave で初めて安全に追記可能。
+
+### Changed
+
+- 既存 `load-resolved-config-use-case.test.ts` の `createMinimalResolvedDocument()` に clean デフォルトの architecture セクションを追加（新契約への追従）。
+
+### Tests
+
+- 新規 `unit/config-foundation/architecture-resolution-service.test.ts` — 17 件。7 preset 展開 / custom explicit 必須 / preset+override merge / C1〜C5 semantic validation / layerDetection precedence / metadataTags override。
+- 新規 `integration/config-foundation/ajv-config-schema-validator-v3.test.ts` — 5 件。v2 document / v3 document / 未知 preset / custom without layers のケース。
+- 全 3345 tests green（3323 → +22）、`npx phasegate lint` violations 0。
+
+## [0.95.0] - 2026-04-23
+
+### Changed
+
+- **ISSUE-014 Wave 2: `LayerName` / `LayerBoundary` VO を `ArchitectureSpec` 注入形式に改修** — Clean Architecture 固定値（`domain / application / infrastructure / presentation` と依存行列）を VO 内部から分離し、`ArchitectureSpec` 型 + `CLEAN_PRESET_SPEC` 定数として `scripts/harness/biome-ast-engine/domain/value-objects/architecture-spec.ts` に抽出。`LayerName.fromString` / `tryFromString` / `LayerBoundary.standardMatrix` が任意の spec を受け付けるようになった（default は `CLEAN_PRESET_SPEC` で既存挙動を維持）。
+- `LayerNameValue` を `string` に緩和（外部参照が無い前提での型緩和）、`canDependOn` はインスタンスが保持する spec の `allowedDependencies` を参照する形式へ変更。
+- 新規テスト 12 件追加（`architecture-spec.test.ts` 4 件 + `layer-name.test.ts` に onion preset 注入ケース 5 件 + `layer-boundary.test.ts` に onion 3×3 matrix ケース 3 件）。全 3323 テスト green、`npx phasegate lint` violations 0。
+
+### Plan re-sync
+
+- Wave 2 計画の小さな穴を是正: 当初「`phasegate.config.json` に `architecture: { preset: "clean" }` を dogfood 明示追記」を Wave 2 に含めていたが、現行 schema v2 が root レベルで `additionalProperties: false` を指定しているため `architecture` キー追加は validation error になる。v3 schema + loader が提供される Wave 3 まで dogfood 更新を**移送**。`wave1_schema_proposal.md` §4 と `issue_description.md` の Wave 表を同期更新。
+
+## [0.94.0] - 2026-04-23
+
+### Changed
+
+- **ISSUE-014 Wave 1 計画の再同期** — レビュー補修で追加された制約を Wave 分割計画に取り込み漏れがないか検証。以下 3 件を追加反映:
+  - Wave 3 に「§1.2 preset + 明示 override 解決ロジック」を明示追加（semantic validation とは別軸）
+  - Wave 6 に「防御プリセット / アーキプリセットの呼称分離ガイド」を明示追加（レビュー穴 #3 の plan 反映漏れ）
+  - 推定工数を再計算: Wave 3 は 1d → **1.5d**（preset override + semantic validation C1〜C5 + precedence を盛り込んだため）。合計 4.5d → **5d**
+- `wave1_schema_proposal.md` §4 の Wave 分割表と `issue_description.md` 推奨実装順表を同期更新
+
+## [0.93.0] - 2026-04-23
+
+### Changed
+
+- **ISSUE-014 Wave 1 レビュー補修** — v0.92.0 で起票した設計文書を批判的レビューにより 12 項目修正。詳細は v0.92.0 の "Review / Hardening" セクション参照（修正差分は v0.93.0 リリースで統合）。実装コード変更なし、設計文書のみ。
+
+## [0.92.0] - 2026-04-23
+
+### Added
+
+- **ISSUE-014 Wave 1: アーキテクチャ preset 化の設計着地** — PhaseGate を Clean Architecture 固定から preset 選択式に拡張するための Wave 1（設計・文書作成）を完了。実装コードは含まない。
+  - `docs/ADR/ADR-015-architecture-preset.md` を Accepted 状態で起票。preset **7 種**（`clean` / `strict-ddd` / `onion` / `hexagonal` / `layered` / `flat` / `custom`）を採択し、`flat` 時の L1-001〜004 自動無効化、`metadataTags` での `@layer` / `@unit` タグ差し替え、schema v3 への下位互換マイグレーション戦略を決定。
+  - `docs/inception/issues/ISSUE-014/wave1_schema_proposal.md` を追加。`architecture` セクションの JSON Schema 断片、各 preset の層・`allowedDependencies` 定義、Wave 2〜6 の実装順序（推定 4.5d）を明文化。
+  - `docs/inception/issues/ISSUE-014/issue_description.md` の状態を `IN PROGRESS` に更新し、Wave 2 以降の入り口を記述。
+
+### Review / Hardening（批判的レビューによる穴補修）
+
+Wave 1 成果物を批判的にレビューし、以下の穴を修正:
+
+- **カウント誤り**: `preset 6 種` → **7 種** に修正（`clean` + `strict-ddd` + `onion` + `hexagonal` + `layered` + `flat` + `custom`）
+- **schema 識別機構**: loader が v2 / v3 を判別する手段を構造検出（`architecture` キーの有無）に決定。明示的な `$schemaVersion` フィールドは追加しない方針を ADR-015 / §1.0 に明記
+- **`project.preset` vs `architecture.preset` の直交性**: 既存 `project.preset`（防御プリセット）と新設 `architecture.preset`（アーキプリセット）の概念を ADR-015 で分離説明。CLI メッセージ・ドキュメントで区別呼称する方針を Wave 6 ガイドに委譲
+- **semantic validation 穴**: `custom` preset の JSON Schema では validate できない制約（C1: 層名の自己参照、C2/C3: allowedDependencies キー/値の `layers` 配列整合、C4: 全 layer カバレッジ、C5: 循環依存警告）を §1.3 に列挙、Wave 3 実装に委譲
+- **preset override 規則**: `preset` + 明示 `layers` / `allowedDependencies` 併記時のルール（明示値 override、partial override 許容）を §1.2 に追加
+- **`layerDetection` precedence**: `byPath` / `byTag` の全組み合わせ（4 通り）の挙動を §3.4 の表に明示。`byPath: false, byTag: false` は schema error に
+- **`flat` preset の残存 `@layer` tag 扱い**: 案 A（無視）/ B（warn）/ C（error）を列挙、Wave 4 で案 A 採用を推奨
+- **preset vs user 個別設定の優先度**: `flat` preset が L1-001〜004 を無効化する場面で user の明示 `layers.L1.rules["L1-001"]: "error"` が上書きする規則を §2.8 に追加
+- **ADR-005 矛盾の解消**: PhaseGate 自身が `clean` preset を名乗ることと ADR-005（Hexagonal 採用）の両立を「`domain` が Hexagonal の `core` に相当する」という哲学的整合で ADR-015 に明記
+- **ADR-014 境界警告**: v0.86.0 未満から upgrade する user への「暗黙デフォルト変更」警告を Wave 6 ガイド + migrate CLI に入れる方針を明記
+- **`@story` タグのスコープ定義**: test ファイルで使われる `@story` タグが本 Wave の `metadataTags` で扱われない理由（traceability-model 管轄）を §3.3 に追加
+- **Wave 受け入れ基準の再設計**: 物理的な成果物存在と user レビュー完了を分離。物理 [x] / レビュー [ ] で Wave 1 完了判定の厳密性を確保
+
+### Scope notes
+
+- Wave 1 は **設計・文書のみ**。`scripts/harness/` 配下のコード改修は含まず、既存テストへの影響なし。`LayerName` / `LayerBoundary` の config 注入改修は Wave 2、schema v3 実装は Wave 3、dogfood 検証は Wave 4〜5、ガイド追記は Wave 6 で順次実施予定。
+
 ## [0.91.0] - 2026-04-23
 
 ### Fixed

package/README.ja.md

@@ -56,7 +56,7 @@ npm install --save-dev phasegate
 npx phasegate init --name <プロジェクト名> --preset standard
 ```
 
-`.claude/skills/` に28スキルを展開し、設計原則ドキュメント（`docs/principles/*.md`・`docs/folder_management_rules.md`）を配置し、`phasegate.config.json` を生成します。
+`skills/` に28スキルを展開し、`.claude/skills` / `.codex/skills` などの agent 向け導線を作成し、設計原則ドキュメント（`docs/principles/*.md`・`docs/folder_management_rules.md`）を配置し、`phasegate.config.json` を生成します。
 
 `--preset` で初期構成を選択できます: `minimal`（プロトタイプ）/ `standard`（推奨）/ `strict`（本番）
 
@@ -606,15 +606,17 @@ Phasegate は [OpenAI Codex CLI](https://developers.openai.com/codex/cli) でも
 ### セットアップ（2 ステップ）
 
 ```bash
-# 1. Codex 向けに初期化（.codex/hooks.json を自動配置）
+# 1. Codex 向けにプロジェクトを初期化（.codex/hooks.json や .codex/skills など project 内ファイルを作成）
 npx phasegate init --name my-project --agent codex --with-husky
 
-# 2. Codex hooks フィーチャーフラグを有効化
+# 2. Codex CLI 側の feature flag を手動で有効化
 codex features enable codex_hooks
 ```
 
 Claude + Codex 両対応プロジェクトは `--agent both` を指定してください。
 
+`init` が担当するのは project 内のセットアップです。`codex_hooks` の有効化は Codex 本体のユーザー設定なので、明示的に手動実行します。
+
 ### カバレッジと既知の制約
 
 Codex のネイティブ `apply_patch` ツールは内部の `ApplyPatchHandler` 経由で実行され hook を発火しません（[openai/codex#16732](https://github.com/openai/codex/issues/16732)）。このため pre-edit hard block は Bash 経由の書き込みに限定され、ネイティブ `apply_patch` の違反は **pre-commit (L2)** で commit 時にブロックされます。
@@ -786,16 +788,22 @@ your-project/
 │   │   └── {unit}/{US-XXX}/     # Level 2/3（Unit・ストーリー単位）
 │   └── ADR/
 ├── src/                          # 実装コード（@unit/@layer 必須）
-└── .claude/
-    ├── settings.json             # Hooks 設定
-    └── skills/                   # npx phasegate init で展開
+├── .claude/
+│   ├── settings.json             # Hooks 設定
+│   └── skills/                   # ../skills への symlink
+├── .codex/
+│   ├── hooks.json               # Codex hooks 設定
+│   └── skills/                  # ../skills への symlink（Codex有効時）
+└── skills/                      # npx phasegate init で再生成可能
 ```
 
 ### 推奨 .gitignore
 
 ```
 node_modules/
-.claude/skills/    # npx phasegate init で再生成可能
+skills/            # npx phasegate init で再生成可能
+.claude/skills/    # skills/ への symlink
+.codex/skills/     # skills/ への symlink
 dist/
 reports/
 ```

package/README.md

@@ -49,7 +49,7 @@ npm install --save-dev phasegate
 npx phasegate init --name my-project
 ```
 
-This deploys 28 skills, design principles docs (`docs/principles/*.md`, `docs/folder_management_rules.md`), and generates `phasegate.config.json`.
+This deploys 28 skills to `skills/`, creates agent-specific links such as `.claude/skills` or `.codex/skills`, installs design principles docs (`docs/principles/*.md`, `docs/folder_management_rules.md`), and generates `phasegate.config.json`.
 
 Optional: add `--with-husky` to also install a `.husky/pre-commit` hook that runs L2 validators.
 
@@ -155,7 +155,9 @@ Skills cover the full **AIDLC (AI-Driven Development Life Cycle)**, enforcing ph
 
 ### Presets
 
-`project.preset` -- overall layer strictness:
+Phasegate has two orthogonal preset families — defense and architecture. See the note at the end of this section for naming conventions.
+
+**Defense preset** (`project.preset`) -- overall layer strictness:
 
 | Preset | Layers | Coverage | Use Case |
 |---|---|---|---|
@@ -163,6 +165,22 @@ Skills cover the full **AIDLC (AI-Driven Development Life Cycle)**, enforcing ph
 | `standard` | L1 - L3 | 90% | Production development (default) |
 | `strict` | L1 - L4 | 95% | Mission-critical systems |
 
+**Architecture preset** (`architecture.preset`) -- layer names and dependency directions used by L1-003 / L1-004:
+
+| Preset | Layers | Use Case |
+|---|---|---|
+| `clean` (default) | `domain / application / infrastructure / presentation` | Clean Architecture / AIDLC full harness |
+| `strict-ddd` | `clean` layers + stricter cycle detection | DDD-focused new projects |
+| `onion` | `domain / application / interface` | Onion Architecture |
+| `hexagonal` | `core / ports / adapters` | Hexagonal / Ports-and-Adapters |
+| `layered` | `presentation / business / data` | Classic 3-tier layered |
+| `flat` | No layers | Small scripts / CLI tools / retrofit start |
+| `custom` | User-defined `layers` + `allowedDependencies` | Any other shape |
+
+For selection guidance and config examples see [Preset Selection Guide](docs/guide/preset-selection.md).
+
+> **Naming convention**: "defense preset" refers to CI strictness (`strict` / `standard` / `minimal`). "architecture preset" refers to layer topology (`clean` / `onion` / `hexagonal` / `layered` / `flat` / `strict-ddd` / `custom`). They are set independently.
+
 `phaseDependencies.preset` -- phase-gate shape and storyReflection defaults (independent of `project.preset`):
 
 | Preset | Phase 3 gates | storyReflection default | Use Case |
@@ -274,15 +292,17 @@ Phasegate also integrates with [OpenAI Codex CLI](https://developers.openai.com/
 ### Quick setup
 
 ```bash
-# 1. Initialize with Codex agent support (auto-deploys .codex/hooks.json)
+# 1. Initialize the project for Codex (creates project-local files such as .codex/hooks.json and .codex/skills)
 npx phasegate init --name my-project --agent codex --with-husky
 
-# 2. Enable Codex hooks feature flag
+# 2. Enable the Codex CLI feature flag manually on your machine
 codex features enable codex_hooks
 ```
 
 For dual-agent projects (Claude + Codex), use `--agent both`.
 
+`init` sets up files inside the project. The Codex CLI user-level setting (`codex_hooks`) remains an explicit manual step.
+
 ### Coverage and known limitation
 
 Because Codex's native `apply_patch` tool is routed through an internal `ApplyPatchHandler` and does not emit hook events ([openai/codex#16732](https://github.com/openai/codex/issues/16732)), pre-edit hard-block coverage is limited to Bash-based writes. Native `apply_patch` violations are caught at commit time by the pre-commit layer.

package/docs/ADR/ADR-015-architecture-preset.md

@@ -0,0 +1,183 @@
+# ADR-015: アーキテクチャスタイルを preset 化し、PhaseGate を複数アーキに対応させる
+
+## Status
+
+Accepted — 2026-04-23
+
+## Context
+
+PhaseGate は「AI 非依存の品質防御ツールキット」を標榜するが、L1 層（Biome AST rule）の依存方向検査は Clean Architecture 4 層（`domain / application / infrastructure / presentation`）を前提として**ハードコード**されている。
+
+### ハードコードの実体（ISSUE-014 発見契機）
+
+**`scripts/harness/biome-ast-engine/domain/value-objects/layer-name.ts:6`**:
+
+```typescript
+export type LayerNameValue = 'domain' | 'application' | 'infrastructure' | 'presentation';
+```
+
+**同ファイル:15-20**（ADR-014 適用後）:
+
+```typescript
+const ALLOWED_DEPENDENCIES = {
+  domain:         ['domain'],
+  application:    ['application', 'domain'],
+  infrastructure: ['infrastructure', 'application', 'domain'],
+  presentation:   ['presentation', 'application', 'domain'],
+};
+```
+
+層名・依存方向のいずれもコード内固定で、`phasegate.config.json` から変更する手段がない。
+
+### 影響範囲
+
+| 導入対象 PJ | 発生する摩擦 |
+|---|---|
+| Onion（`domain / application / interface`） | `@layer interface` で `InvalidLayerNameError` |
+| Hexagonal（`core / ports / adapters`） | 層名が全て未知、L1-001/L1-002 全件違反 |
+| MVC / N-tier（`controller / service / repository`） | L1-003/L1-004 が無意味に発火 |
+| Flat スクリプト・CLI ツール | `@layer` 強制が過剰 |
+| 既存 PJ への retrofit（ISSUE-007） | baseline で grandfather できるが、新規ファイルに Clean 形状を強制 |
+
+「AI 非依存」という標語は達成済みだが、「Clean Architecture 前提」という暗黙制約が残存しており、PhaseGate の採用範囲を狭めている。
+
+### 関連する先行決定
+
+- **ADR-005** — Hexagonal Architecture の採用。PhaseGate 自身の構造的選択としては維持
+- **ADR-014** — `presentation → domain` を Robert C. Martin 版 Clean Architecture 解釈で許容。本 ADR と整合（`clean` preset の既定挙動として組み込み）
+
+## Decision
+
+`phasegate.config.json` に `architecture` セクションを新設し、**アーキテクチャスタイルを preset ベースで選択可能**にする。
+
+### schema v3 概要
+
+```json
+{
+  "architecture": {
+    "preset": "clean",
+    "layers": ["domain", "application", "infrastructure", "presentation"],
+    "allowedDependencies": {
+      "domain":         ["domain"],
+      "application":    ["application", "domain"],
+      "infrastructure": ["infrastructure", "application", "domain"],
+      "presentation":   ["presentation", "application", "domain"]
+    },
+    "metadataTags": {
+      "layer": "@layer",
+      "unit":  "@unit"
+    },
+    "layerDetection": {
+      "byPath": true,
+      "byTag":  true
+    }
+  }
+}
+```
+
+`preset` を指定すれば層構成と依存規則がプリセットから注入され、`custom` 選択時のみ `layers` / `allowedDependencies` のユーザー定義が必須となる。
+
+詳細なスキーマ案と各 preset の層・依存定義は [`docs/inception/issues/ISSUE-014/wave1_schema_proposal.md`](../inception/issues/ISSUE-014/wave1_schema_proposal.md) を参照。
+
+### 採用する preset（7 種）
+
+| `preset` | 層構成 | 想定用途 |
+|---|---|---|
+| `clean`（default） | domain / application / infrastructure / presentation | 大規模 BE、DDD 採用 PJ（PhaseGate 自身の構造、ADR-014 準拠） |
+| `strict-ddd` | 同上（依存ルールのみ厳格） | Presentation → Domain 直接依存を禁じたい PJ（ADR-014 opt-out） |
+| `onion` | domain / application / interface | Onion Architecture PJ |
+| `hexagonal` | core / ports / adapters | Ports & Adapters 採用 PJ |
+| `layered` | controller / service / repository | MVC / N-tier PJ |
+| `flat` | (層なし) | 小規模スクリプト、CLI ツール、プロトタイプ |
+| `custom` | ユーザー定義 | 独自アーキ |
+
+### `project.preset` との関係（直交）
+
+既存 schema v2 には `project.preset: "minimal" | "standard" | "strict"` が存在するが、本 ADR で追加する `architecture.preset` とは**完全に直交**する概念である:
+
+| 既存 `project.preset` | 新設 `architecture.preset` |
+|---|---|
+| L0〜L4 レイヤー**各防御段**の有効化プリセット（どの validator を使うか） | 依存方向検査の**アーキスタイル**プリセット（どの層構成を採るか） |
+| 例: `strict` = L0-L4 全有効 | 例: `clean` = 4 層 Clean Architecture |
+
+両者は独立に選択可能で、例えば `project.preset: "minimal"` + `architecture.preset: "hexagonal"` の組み合わせは有効。混同を避けるため、ドキュメント・CLI メッセージでは「防御プリセット / アーキプリセット」と区別して呼称する方針とする（Wave 6 のガイドで徹底）。
+
+### ADR-005（Hexagonal 採用）との関係
+
+ADR-005 では「PhaseGate は Hexagonal Architecture を採用する」と記録したが、実際のコードは `domain / application / infrastructure / presentation` の 4 層構成で、これは Clean Architecture の一般的な命名。**本 ADR は ADR-005 を否定しない**：Hexagonal の「core を外部詳細から隔離する」哲学は 4 層構成でも成立し、PhaseGate の `domain` は Hexagonal の `core` に相当する。preset 名としては命名が近い `clean` を選ぶことで、ADR-005 の哲学を維持しつつ preset カテゴリにフィットさせる。外部 PJ が真に 3 層 Hexagonal（`core / ports / adapters`）で記述したい場合は `hexagonal` preset を選べる。
+
+### preset + 明示 layers 併記時の解決規則
+
+- **`preset: "custom"` 以外 + 明示 `layers` / `allowedDependencies`**: **ユーザー明示値が preset 既定を override** する（partial override も許容）。`preset` は「出発点」として扱われ、明示フィールドで上書きできるが、整合性は引き続き schema v3 の semantic validation で検査される
+- **`preset: "custom"`**: `layers` と `allowedDependencies` は必須入力。schema validation で required として強制
+
+### ADR-014 暗黙デフォルト変更との連続性
+
+v0.86.0（ADR-014 適用）以降、`ALLOWED_DEPENDENCIES.presentation` に `'domain'` が追加され、既定挙動として `presentation → domain` が許容化された。本 ADR はこの挙動を `clean` preset の既定として**そのまま引き継ぐ**。v0.85.0 以前の厳格 DDD 挙動を継続したい導入 PJ は、v0.92.0 以降明示的に `architecture.preset: "strict-ddd"` を指定する必要がある点を Wave 6 ガイドで警告する。
+
+### `flat` preset の挙動
+
+層関連 L1 rule を自動で無効化し、汎用 rule のみ残す:
+
+| rule | flat での挙動 |
+|---|---|
+| L1-001 require-unit-comment | 自動無効化 |
+| L1-002 require-layer-comment | 自動無効化 |
+| L1-003 no-layer-violation | 自動無効化 |
+| L1-004 enforce-folder-structure | 自動無効化 |
+| L1-005 no-any-abuse | 有効維持 |
+| L1-006 no-ghost-file | 有効維持 |
+| L1-007 no-comment-flood | 有効維持 |
+| L1-008 no-code-duplication | 有効維持 |
+
+### メタデータタグの可変化
+
+`@layer` / `@unit` というタグ名自体も `metadataTags` で差し替え可能とする。これにより、社内規約で `@tier` / `@module` 等を使う PJ にも対応できる。
+
+### 下位互換戦略
+
+- **schema v2 → v3 識別**: 設定ファイルに明示的な `$schemaVersion` フィールドは**追加しない**（既存 config の無害変更を避ける）。代わりに**構造検出**を採用し、`architecture` キーが存在すれば v3 ロード、存在しなければ v2 互換モード（`preset: "clean"` を暗黙適用）とする。Wave 3 で loader に `detectSchemaVersion()` を実装
+- **自動マイグレーション**: `architecture` セクション未指定時は `preset: "clean"` 相当のデフォルトが自動適用される（挙動不変）。ただし v0.86.0 未満から upgrade する user は ADR-014 の既定変更で暗黙に presentation→domain が許容されるため、明示的な変更通知を CHANGELOG / Wave 6 ガイドで提示
+- **Phase 毎 rollout**: Wave 2〜6 で段階的に `LayerName` / `LayerBoundary` / schema validator を移行。各 Wave 独立にリリース可能
+- **PhaseGate レポ自身**: `preset: "clean"` を明示設定（ドッグフード）。既存の Hexagonal 哲学（ADR-005）は `domain` 層を `core` とみなすことで整合
+
+## Consequences
+
+### ポジティブ
+
+- Onion / Hexagonal / MVC / 小規模スクリプトなど、Clean 以外のアーキを採用する PJ への導入障壁が消滅
+- retrofit-adoption（ISSUE-007）の延長で「既存アーキを尊重しつつ PhaseGate を被せる」ユースケースが成立
+- メタデータタグ可変化で社内規約と衝突せず導入可能
+- ADR-014（`presentation → domain` 許容）の厳格派向け opt-out が `strict-ddd` preset として提供可能になる（Philosophical tension の解消）
+
+### ネガティブ / トレードオフ
+
+- **実装負荷**: `LayerName` / `LayerBoundary` / `biome-ast-engine` 配下の全 rule が config 注入を受けるため、影響範囲は広い（推定 ~4d、Wave 分割で管理）
+- **preset の選定判断コスト**: 導入 PJ 側が「どの preset を選ぶか」を初回に判断する必要がある
+  - **緩和策**: README / retrofit-adoption.md に preset 選定フローチャートを追加（Wave 6）
+- **フレームワーク固有構造（Django apps/, Rails MVC 等）の自動検出は非対応**: 層名とパス対応は `architecture.layers` で宣言ベース
+  - **判断**: 自動検出は phasegate の「明示的な品質防御」哲学と整合しない。宣言を強制する方が誤検出が少ない
+
+### スコープ外（本 ADR で扱わない）
+
+- フレームワーク固有の自動層推論（Django / Rails / NestJS 等）
+- ランタイム強制（依存方向違反の実行時 throw）— lint 時のみ
+- 既存コードの層名リネーム自動変換ツール（`@layer domain` → `@tier core` 等）
+- DDD 戦術パターン（Aggregate / Repository / UseCase 命名規約）の preset 化 — 別 issue
+
+## Migration
+
+schema v3 移行の詳細は Wave 2 で `config-foundation` の migration script として実装する。本 ADR 時点での移行方針:
+
+1. `architecture` セクション未指定 → `preset: "clean"` を暗黙適用（既存挙動維持）
+2. `architecture.preset` のみ指定 → preset から layers / allowedDependencies を展開
+3. `architecture.preset: "custom"` → `layers` と `allowedDependencies` を必須入力として validate
+
+## 関連
+
+- **ADR-005** — Hexagonal Architecture 採用（PhaseGate 自身の構造として維持、他 PJ には preset 化で選択肢提供）
+- **ADR-014** — `presentation → domain` 許容。`clean` preset の既定挙動として組み込み、`strict-ddd` で opt-out 提供
+- **ISSUE-014** — 本 ADR を駆動する issue。Wave 分割実装（Wave 1: 本 ADR + schema 設計, Wave 2: LayerName 注入, Wave 3: schema v3 実装, Wave 4: dogfood, Wave 5: custom/ドキュメント）
+- **ISSUE-007 retrofit-adoption** — 既存 PJ への phasegate 導入。本 ADR により Clean 以外でも受け入れ可能になり、retrofit の適用範囲が拡大
+- **`scripts/harness/biome-ast-engine/domain/value-objects/layer-name.ts:6,15-20`** — 現状のハードコード実体、Wave 2 の改修対象
+- **`scripts/harness/config-foundation/infrastructure/schemas/harness-config-v2.schema.json`** — schema v3 の拡張対象、Wave 3 で改修

package/docs/guide/codex-integration.md

@@ -7,15 +7,20 @@ Phasegate supports [OpenAI Codex CLI](https://developers.openai.com/codex/cli) t
 ### Quick setup (recommended)
 
 ```bash
-# 1. Initialize with Codex agent support
+# 1. Initialize the project for Codex
 npx phasegate init --name my-project --agent codex --with-husky
 
-# 2. Enable Codex hooks feature flag
+# 2. Enable the Codex CLI feature flag manually
 codex features enable codex_hooks
 ```
 
 For dual-agent projects (Claude + Codex), use `--agent both`.
 
+Responsibility split:
+
+- `phasegate init --agent codex` sets up **project-local artifacts** such as `phasegate.config.json`, `skills/`, `.codex/hooks.json`, and `.codex/skills`
+- `codex features enable codex_hooks` updates the **Codex CLI user environment** and is intentionally left as a manual step
+
 ### Manual setup
 
 Alternatively, set up Codex integration manually:

package/docs/guide/installation.md

@@ -36,7 +36,13 @@ npm install
 npx phasegate init --name <project-name>
 ```
 
-This deploys 28 skills to `.claude/skills/` and generates `phasegate.config.json`.
+This deploys 28 skills to `skills/`, creates the agent-facing skill links (for example `.claude/skills/` or `.codex/skills/`), and generates `phasegate.config.json`.
+
+For Codex, project initialization stops at the project boundary. After `npx phasegate init --agent codex`, enable the Codex CLI feature flag manually:
+
+```bash
+codex features enable codex_hooks
+```
 
 ### 2. Copy design principle documents
 
@@ -69,7 +75,9 @@ npx phasegate update-skills
 
 ```
 node_modules/
-.claude/skills/    # regenerated by npx phasegate init
+skills/            # regenerated by npx phasegate init
+.claude/skills/    # symlink to ../skills when Claude is enabled
+.codex/skills/     # symlink to ../skills when Codex is enabled
 dist/
 reports/
 .harness/