dsh-molbio-panel 0.1.9 → 0.1.11
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- package/README.md +13 -6
- package/index.mjs +1 -1
- package/lib/client.js +1124 -81
- package/package.json +1 -1
package/README.md
CHANGED
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@@ -1,10 +1,14 @@
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# dsh-molbio-panel
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-
DSH Web GUI 的**浏览器内 Molbio 面板**：右侧栏的一个 tab
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-
选中当场画出来——`.dna` / `.gb` / `.gbk` 出质粒图谱，`.fa` / `.fasta`
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3
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+
DSH Web GUI 的**浏览器内 Molbio 面板**：右侧栏的一个 tab，列出当前会话工作区的序列与结构文件，
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4
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+
选中当场画出来——`.dna` / `.gb` / `.gbk` 出质粒图谱，`.fa` / `.fasta` 出序列标识图，
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+
`.pdb` / `.ent` / `.cif` / `.mmcif` / `.sdf` / `.mol` 出可旋转的 3D
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+
ball-and-stick / space-filling 原子模型。
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解析与渲染在浏览器里跑的是 [`dsh-molbio-tools`](https://github.com/lovy2004/dsh-molbio-tools)
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-
的**同一份源码**（`lib/genbank/snapgene/plasmid/msa/logo
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+
的**同一份源码**（`lib/genbank/snapgene/plasmid/msa/logo` 与 `structure-preview` /
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+
`structure-render`）——
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+
不落盘 SVG、不弹系统查看器、
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不经过工具调用。
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## 为什么是单独的包
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@@ -12,12 +16,12 @@ DSH Web GUI 的**浏览器内 Molbio 面板**：右侧栏的一个 tab，列出
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面板必须走 **bundle 渠道**（`dsh.client` 双面包）：preset 渠道挂不了客户端 UI
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（详见 `dsh-molbio-tools` 仓库的 `docs/client-pipeline-exploration.md`）。
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-
而 `dsh-molbio-tools` 的宿主半边会注册 **
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+
而 `dsh-molbio-tools` 的宿主半边会注册 **64 个工具**——把它挂进一个共享的 Web profile，
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等于给**该 profile 的每个会话**都塞进这些工具。所以面板单独成包：
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| 包 | 宿主半边 | 用途 |
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| --- | --- | --- |
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-
| `dsh-molbio-tools` |
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+
| `dsh-molbio-tools` | 64 个 molbio 工具 | 分子生物学专用 profile / preset |
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| `dsh-molbio-panel` | **不注册任何工具**（空实现） | 只想在共享 profile 里加一个面板 |
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宿主半边刻意保持空：客户端扫描按 **Loader 条目**取包清单，条目只要能加载，浏览器半就能
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@@ -37,7 +41,10 @@ dsh plugin --profile <profile> add D:\path\to\packages\molbio-panel # 本地
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1. 打开右侧栏（会话头部角落的按钮），从引导页选 **Molbio**。
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2. 左栏列出工作区里可打开的文件（质粒文件排在前面）。
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3. 点一个 `.dna` / `.gb` → 右侧出图谱 + 特征表（Feature / Type / Start / End / Strand）；
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-
点一个 `.fasta`（≥2 条序列）→ 出序列标识图（信息量 bits
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+
点一个 `.fasta`（≥2 条序列）→ 出序列标识图（信息量 bits，小样本校正默认开）；
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+
点一个 `.pdb` / `.cif` / `.sdf` / `.mol` → 出可旋转的 3D 模型（ball-and-stick 或
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+
space-filling；拖拽旋转、滚轮缩放、双击复位）。它是真实原子模型的预览，
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+
不含分子表面/静电势，也不做测量；V3000 不支持。
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## 限制
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package/index.mjs
CHANGED
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@@ -2,7 +2,7 @@
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2
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* dsh-molbio-panel — host half.
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3
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*
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* This package exists so the browser panel can be installed WITHOUT dragging
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-
* the
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5
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+
* the molbio toolset into every session of a profile. It is a `dsh.client`
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6
6
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* dual-face package: the host half below, and the browser half built from the
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7
7
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* `dsh-molbio-tools` sources into `lib/client.js`.
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8
8
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