@vitessce/all 3.3.4 → 3.3.5

package/dist/index.js

@@ -1,4 +1,4 @@
-import { f, P, h, d, V, z } from "./index-24371612.js";
+import { f, P, h, d, V, z } from "./index-69ad551a.js";
 import "react";
 import "@vitessce/vit-s";
 import "react-dom";

package/dist/{jpeg-202c0f86.js → jpeg-486c496f.js}

@@ -1,4 +1,4 @@
-import { B as BaseDecoder } from "./index-24371612.js";
+import { B as BaseDecoder } from "./index-69ad551a.js";
 import "react";
 import "@vitessce/vit-s";
 import "react-dom";

package/dist/{lerc-0781f828.js → lerc-d44258ea.js}

@@ -1,5 +1,5 @@
 import { i as inflate_1 } from "./pako.esm-68f84e2a.js";
-import { g as getDefaultExportFromCjs, B as BaseDecoder, L as LercParameters, a as LercAddCompression } from "./index-24371612.js";
+import { g as getDefaultExportFromCjs, B as BaseDecoder, L as LercParameters, a as LercAddCompression } from "./index-69ad551a.js";
 import "react";
 import "@vitessce/vit-s";
 import "react-dom";

package/dist/{lzw-8763809b.js → lzw-bec7c4c2.js}

@@ -1,4 +1,4 @@
-import { B as BaseDecoder } from "./index-24371612.js";
+import { B as BaseDecoder } from "./index-69ad551a.js";
 import "react";
 import "@vitessce/vit-s";
 import "react-dom";

package/dist/{packbits-6e02a3aa.js → packbits-fb191a07.js}

@@ -1,4 +1,4 @@
-import { B as BaseDecoder } from "./index-24371612.js";
+import { B as BaseDecoder } from "./index-69ad551a.js";
 import "react";
 import "@vitessce/vit-s";
 import "react-dom";

package/dist/{raw-5973239b.js → raw-344c6603.js}

@@ -1,4 +1,4 @@
-import { B as BaseDecoder } from "./index-24371612.js";
+import { B as BaseDecoder } from "./index-69ad551a.js";
 import "react";
 import "@vitessce/vit-s";
 import "react-dom";

package/dist/{webimage-7cd32a88.js → webimage-ca45fc32.js}

@@ -1,4 +1,4 @@
-import { B as BaseDecoder } from "./index-24371612.js";
+import { B as BaseDecoder } from "./index-69ad551a.js";
 import "react";
 import "@vitessce/vit-s";
 import "react-dom";

package/dist-tsc/base-plugins.d.ts.map

@@ -1 +1 @@
-{"version":3,"file":"base-plugins.d.ts","sourceRoot":"","sources":["../src/base-plugins.ts"],"names":[],"mappings":"AASA,OAAO,EACL,cAAc,EACd,mBAAmB,EACnB,cAAc,EACd,sBAAsB,EACvB,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAC3B,OAAO,KAAK,EACV,UAAU,EACV,UAAU,EACX,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAC3B,OAAO,EACL,CAAC,EAwCF,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAmH3B,eAAO,MAAM,aAAa,kBAiBzB,CAAC;AAEF,eAAO,MAAM,aAAa,wDA+DzB,CAAC;AAEF,eAAO,MAAM,kBAAkB;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;OAe9B,CAAC;AAIF,eAAO,MAAM,qBAAqB;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4WAmLjC,CAAC"}
+{"version":3,"file":"base-plugins.d.ts","sourceRoot":"","sources":["../src/base-plugins.ts"],"names":[],"mappings":"AASA,OAAO,EACL,cAAc,EACd,mBAAmB,EACnB,cAAc,EACd,sBAAsB,EACvB,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAC3B,OAAO,KAAK,EACV,UAAU,EACV,UAAU,EACX,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAC3B,OAAO,EACL,CAAC,EAyCF,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAoH3B,eAAO,MAAM,aAAa,kBAiBzB,CAAC;AAEF,eAAO,MAAM,aAAa,wDAgEzB,CAAC;AAEF,eAAO,MAAM,kBAAkB;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;OAe9B,CAAC;AAIF,eAAO,MAAM,qBAAqB;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4WAmLjC,CAAC"}

package/dist-tsc/base-plugins.js

@@ -1,6 +1,6 @@
 import { FileType, DataType, ViewType, CoordinationType, COMPONENT_COORDINATION_TYPES, } from '@vitessce/constants-internal';
 import { PluginFileType, PluginJointFileType, PluginViewType, PluginCoordinationType, } from '@vitessce/plugins';
-import { z, obsEmbeddingCsvSchema, obsSetsCsvSchema, obsSpotsCsvSchema, obsPointsCsvSchema, obsLocationsCsvSchema, obsLabelsCsvSchema, featureLabelsCsvSchema, obsSetsAnndataSchema, obsEmbeddingAnndataSchema, obsSpotsAnndataSchema, obsPointsAnndataSchema, obsLocationsAnndataSchema, obsLabelsAnndataSchema, obsFeatureMatrixAnndataSchema, obsSegmentationsAnndataSchema, featureLabelsAnndataSchema, rasterJsonSchema, anndataZarrSchema, spatialdataZarrSchema, anndataCellsZarrSchema, anndataCellSetsZarrSchema, anndataExpressionMatrixZarrSchema, cellsJsonSchema, imageOmeZarrSchema, imageOmeTiffSchema, imageSpatialdataSchema, obsSegmentationsOmeTiffSchema, obsSegmentationsOmeZarrSchema, obsSegmentationsSpatialdataSchema, obsFeatureMatrixSpatialdataSchema, obsSpotsSpatialdataSchema, obsSetsSpatialdataSchema, obsSetPath, rgbArray, obsSetsSchema, imageLayerObj, cellsLayerObj, neighborhoodsLayerObj, moleculesLayerObj, } from '@vitessce/schemas';
+import { z, obsEmbeddingCsvSchema, obsSetsCsvSchema, obsSpotsCsvSchema, obsPointsCsvSchema, obsLocationsCsvSchema, obsLabelsCsvSchema, featureLabelsCsvSchema, obsSetsAnndataSchema, obsEmbeddingAnndataSchema, obsSpotsAnndataSchema, obsPointsAnndataSchema, obsLocationsAnndataSchema, obsLabelsAnndataSchema, obsFeatureMatrixAnndataSchema, obsFeatureColumnsAnndataSchema, obsSegmentationsAnndataSchema, featureLabelsAnndataSchema, rasterJsonSchema, anndataZarrSchema, spatialdataZarrSchema, anndataCellsZarrSchema, anndataCellSetsZarrSchema, anndataExpressionMatrixZarrSchema, cellsJsonSchema, imageOmeZarrSchema, imageOmeTiffSchema, imageSpatialdataSchema, obsSegmentationsOmeTiffSchema, obsSegmentationsOmeZarrSchema, obsSegmentationsSpatialdataSchema, obsFeatureMatrixSpatialdataSchema, obsSpotsSpatialdataSchema, obsSetsSpatialdataSchema, obsSetPath, rgbArray, obsSetsSchema, imageLayerObj, cellsLayerObj, neighborhoodsLayerObj, moleculesLayerObj, } from '@vitessce/schemas';
 // Register view type plugins
 import { DescriptionSubscriber } from '@vitessce/description';
 import { ObsSetsManagerSubscriber } from '@vitessce/obs-sets-manager';
@@ -26,7 +26,7 @@ JsonSource, JsonLoader, ObsSegmentationsJsonLoader, ObsSetsJsonLoader,
 RasterJsonAsImageLoader, RasterJsonAsObsSegmentationsLoader, ClustersJsonAsObsFeatureMatrixLoader, GenesJsonAsObsFeatureMatrixLoader, CellsJsonAsObsLabelsLoader, CellsJsonAsObsEmbeddingLoader, CellsJsonAsObsLocationsLoader, CellsJsonAsObsSegmentationsLoader, MoleculesJsonAsObsLocationsLoader, MoleculesJsonAsObsLabelsLoader, } from '@vitessce/json';
 import { 
 // AnnData
-AnnDataSource, ObsFeatureMatrixAnndataLoader, ObsEmbeddingAnndataLoader, ObsSpotsAnndataLoader, ObsPointsAnndataLoader, ObsLocationsAnndataLoader, ObsSegmentationsAnndataLoader, ObsSetsAnndataLoader, ObsLabelsAnndataLoader, FeatureLabelsAnndataLoader, 
+AnnDataSource, ObsFeatureMatrixAnndataLoader, ObsFeatureColumnsAnndataLoader, ObsEmbeddingAnndataLoader, ObsSpotsAnndataLoader, ObsPointsAnndataLoader, ObsLocationsAnndataLoader, ObsSegmentationsAnndataLoader, ObsSetsAnndataLoader, ObsLabelsAnndataLoader, FeatureLabelsAnndataLoader, 
 // MuData
 MuDataSource, 
 // OME
@@ -85,6 +85,7 @@ export const baseFileTypes = [
     makeFileType(FileType.OBS_LOCATIONS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_LOCATIONS, ObsLocationsAnndataLoader, AnnDataSource, obsLocationsAnndataSchema),
     makeFileType(FileType.OBS_LABELS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_LABELS, ObsLabelsAnndataLoader, AnnDataSource, obsLabelsAnndataSchema),
     makeFileType(FileType.OBS_FEATURE_MATRIX_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_FEATURE_MATRIX, ObsFeatureMatrixAnndataLoader, AnnDataSource, obsFeatureMatrixAnndataSchema),
+    makeFileType(FileType.OBS_FEATURE_COLUMNS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_FEATURE_MATRIX, ObsFeatureColumnsAnndataLoader, AnnDataSource, obsFeatureColumnsAnndataSchema),
     makeFileType(FileType.OBS_SEGMENTATIONS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_SEGMENTATIONS, ObsSegmentationsAnndataLoader, AnnDataSource, obsSegmentationsAnndataSchema),
     makeFileType(FileType.FEATURE_LABELS_ANNDATA_ZARR, DataType.FEATURE_LABELS, FeatureLabelsAnndataLoader, AnnDataSource, featureLabelsAnndataSchema),
     // All MuData file types

package/package.json

@@ -1,6 +1,6 @@
 {
   "name": "@vitessce/all",
-  "version": "3.3.4",
+  "version": "3.3.5",
   "author": "Gehlenborg Lab",
   "homepage": "http://vitessce.io",
   "repository": {
@@ -18,27 +18,27 @@
   "dependencies": {
     "@material-ui/core": "~4.12.3",
     "zod": "^3.21.4",
-    "@vitessce/constants-internal": "3.3.4",
-    "@vitessce/feature-list": "3.3.4",
-    "@vitessce/description": "3.3.4",
-    "@vitessce/csv": "3.3.4",
-    "@vitessce/genomic-profiles": "3.3.4",
-    "@vitessce/layer-controller": "3.3.4",
-    "@vitessce/heatmap": "3.3.4",
-    "@vitessce/layer-controller-beta": "3.3.4",
-    "@vitessce/json": "3.3.4",
-    "@vitessce/ome-tiff": "3.3.4",
-    "@vitessce/obs-sets-manager": "3.3.4",
-    "@vitessce/scatterplot-embedding": "3.3.4",
-    "@vitessce/scatterplot-gating": "3.3.4",
-    "@vitessce/plugins": "3.3.4",
-    "@vitessce/spatial": "3.3.4",
-    "@vitessce/schemas": "3.3.4",
-    "@vitessce/statistical-plots": "3.3.4",
-    "@vitessce/status": "3.3.4",
-    "@vitessce/spatial-beta": "3.3.4",
-    "@vitessce/vit-s": "3.3.4",
-    "@vitessce/zarr": "3.3.4"
+    "@vitessce/csv": "3.3.5",
+    "@vitessce/constants-internal": "3.3.5",
+    "@vitessce/description": "3.3.5",
+    "@vitessce/genomic-profiles": "3.3.5",
+    "@vitessce/heatmap": "3.3.5",
+    "@vitessce/feature-list": "3.3.5",
+    "@vitessce/json": "3.3.5",
+    "@vitessce/obs-sets-manager": "3.3.5",
+    "@vitessce/layer-controller-beta": "3.3.5",
+    "@vitessce/layer-controller": "3.3.5",
+    "@vitessce/plugins": "3.3.5",
+    "@vitessce/ome-tiff": "3.3.5",
+    "@vitessce/scatterplot-embedding": "3.3.5",
+    "@vitessce/scatterplot-gating": "3.3.5",
+    "@vitessce/schemas": "3.3.5",
+    "@vitessce/spatial-beta": "3.3.5",
+    "@vitessce/statistical-plots": "3.3.5",
+    "@vitessce/spatial": "3.3.5",
+    "@vitessce/status": "3.3.5",
+    "@vitessce/vit-s": "3.3.5",
+    "@vitessce/zarr": "3.3.5"
   },
   "devDependencies": {
     "@types/react": "^18.0.28",

package/src/base-plugins.ts

@@ -33,6 +33,7 @@ import {
   obsLocationsAnndataSchema,
   obsLabelsAnndataSchema,
   obsFeatureMatrixAnndataSchema,
+  obsFeatureColumnsAnndataSchema,
   obsSegmentationsAnndataSchema,
   featureLabelsAnndataSchema,
   rasterJsonSchema,
@@ -114,6 +115,7 @@ import {
   // AnnData
   AnnDataSource,
   ObsFeatureMatrixAnndataLoader,
+  ObsFeatureColumnsAnndataLoader,
   ObsEmbeddingAnndataLoader,
   ObsSpotsAnndataLoader,
   ObsPointsAnndataLoader,
@@ -213,6 +215,7 @@ export const baseFileTypes = [
   makeFileType(FileType.OBS_LOCATIONS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_LOCATIONS, ObsLocationsAnndataLoader, AnnDataSource, obsLocationsAnndataSchema),
   makeFileType(FileType.OBS_LABELS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_LABELS, ObsLabelsAnndataLoader, AnnDataSource, obsLabelsAnndataSchema),
   makeFileType(FileType.OBS_FEATURE_MATRIX_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_FEATURE_MATRIX, ObsFeatureMatrixAnndataLoader, AnnDataSource, obsFeatureMatrixAnndataSchema),
+  makeFileType(FileType.OBS_FEATURE_COLUMNS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_FEATURE_MATRIX, ObsFeatureColumnsAnndataLoader, AnnDataSource, obsFeatureColumnsAnndataSchema),
   makeFileType(FileType.OBS_SEGMENTATIONS_ANNDATA_ZARR, DataType.OBS_SEGMENTATIONS, ObsSegmentationsAnndataLoader, AnnDataSource, obsSegmentationsAnndataSchema),
   makeFileType(FileType.FEATURE_LABELS_ANNDATA_ZARR, DataType.FEATURE_LABELS, FeatureLabelsAnndataLoader, AnnDataSource, featureLabelsAnndataSchema),
   // All MuData file types