@precisa-saude/fhir 0.37.2 → 0.38.0

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* Agrupamento de categorias clínicas em 10 grupos de alto nível.\n *\n * `BiomarkerDefinition.category` armazena 20 sub-categorias (granularidade\n * fina, ex: `tireoide`, `pancreas`). Este módulo agrupa essas\n * sub-categorias em 10 buckets clínicos amplos para apresentação no\n * site, na API pública e em material de divulgação.\n *\n * As sub-categorias permanecem como fonte da verdade nos dados; este\n * agrupamento é uma camada derivada.\n */\n\nexport type CategoryGroup =\n | 'cardiovascular'\n | 'metabolico-endocrino'\n | 'renal-eletrolitico'\n | 'hepatico-biliar'\n | 'hematologico'\n | 'imunologico'\n | 'oncologico'\n | 'nutricional-ambiental'\n | 'saude-reprodutiva'\n | 'composicao-envelhecimento';\n\nexport interface CategoryGroupInfo {\n /** Rótulo em inglês */\n en: string;\n /** Rótulo em português */\n pt: string;\n /** Slug (kebab-case, sem acento) */\n slug: CategoryGroup;\n /** Sub-categorias da fonte agrupadas neste bucket */\n subcategories: readonly string[];\n}\n\nexport const CATEGORY_GROUPS: Record<CategoryGroup, CategoryGroupInfo> = {\n cardiovascular: {\n en: 'Cardiovascular',\n pt: 'Cardiovascular',\n slug: 'cardiovascular',\n subcategories: ['coracao'],\n },\n 'composicao-envelhecimento': {\n en: 'Body Composition & Aging',\n pt: 'Composição Corporal e Envelhecimento',\n slug: 'composicao-envelhecimento',\n subcategories: ['composicao-corporal', 'densidade-ossea', 'estresse-envelhecimento'],\n },\n hematologico: {\n en: 'Hematology',\n pt: 'Hematológico',\n slug: 'hematologico',\n subcategories: ['sangue'],\n },\n 'hepatico-biliar': {\n en: 'Hepatic & Biliary',\n pt: 'Hepático e Biliar',\n slug: 'hepatico-biliar',\n subcategories: ['figado'],\n },\n imunologico: {\n en: 'Immunology',\n pt: 'Imunológico',\n slug: 'imunologico',\n subcategories: ['autoimunidade', 'regulacao-imunologica'],\n },\n 'metabolico-endocrino': {\n en: 'Metabolic & Endocrine',\n pt: 'Metabólico e Endócrino',\n slug: 'metabolico-endocrino',\n subcategories: ['metabolico', 'pancreas', 'hormonios', 'tireoide'],\n },\n 'nutricional-ambiental': {\n en: 'Nutrition & Environmental Exposure',\n pt: 'Nutricional e Exposição Ambiental',\n slug: 'nutricional-ambiental',\n subcategories: ['nutrientes', 'toxinas-ambientais'],\n },\n oncologico: {\n en: 'Oncology',\n pt: 'Oncológico',\n slug: 'oncologico',\n subcategories: ['marcadores-tumorais'],\n },\n 'renal-eletrolitico': {\n en: 'Renal & Electrolytes',\n pt: 'Renal e Eletrolítico',\n slug: 'renal-eletrolitico',\n subcategories: ['rins', 'urina', 'eletrolitos'],\n },\n 'saude-reprodutiva': {\n en: 'Reproductive Health',\n pt: 'Saúde Reprodutiva',\n slug: 'saude-reprodutiva',\n subcategories: ['saude-feminina', 'saude-masculina'],\n },\n};\n\nconst SUBCATEGORY_TO_GROUP = new Map<string, CategoryGroup>();\nfor (const group of Object.values(CATEGORY_GROUPS)) {\n for (const sub of group.subcategories) {\n SUBCATEGORY_TO_GROUP.set(sub, group.slug);\n }\n}\n\n/**\n * Resolve a sub-categoria (granular) para o grupo de alto nível (10 buckets).\n */\nexport function getCategoryGroup(subcategory: string): CategoryGroup | undefined {\n return SUBCATEGORY_TO_GROUP.get(subcategory);\n}\n\n/**\n * Lista todas as sub-categorias mapeadas em algum grupo.\n */\nexport function listMappedSubcategories(): readonly string[] {\n return [...SUBCATEGORY_TO_GROUP.keys()];\n}\n","/**\n * FHIR Intervention Converter\n *\n * Converts interventions (medication, supplement, diet, exercise, sleep)\n * to FHIR R4 MedicationStatement and Observation resources.\n */\n\nimport { type Addressable, entryFullUrl } from './bundle-urls';\nimport { userProfileToFHIR } from './converter';\nimport type { FHIRBundle, FHIRMedicationStatement, FHIRObservation } from './fhir-types';\nimport type { InterventionData, UserProfileData } from './types';\n\n/**\n * Determine MedicationStatement/Observation status based on end date\n */\nfunction interventionStatus(endDate?: string): 'active' | 'completed' {\n if (!endDate) return 'active';\n return new Date(endDate) < new Date() ? 'completed' : 'active';\n}\n\n/**\n * LOINC-like codes for lifestyle observation types\n */\nconst LIFESTYLE_CODES: Record<string, { code: string; display: string }> = {\n diet: { code: '81259-4', display: 'Diet' },\n exercise: { code: '73985-4', display: 'Exercise activity' },\n sleep: { code: '93832-4', display: 'Sleep duration' },\n};\n\n/**\n * Convert medication/supplement intervention to FHIR MedicationStatement\n */\nexport function interventionToFHIRMedicationStatement(\n intervention: InterventionData,\n patientId: string,\n): Addressable<FHIRMedicationStatement> {\n const statement: Addressable<FHIRMedicationStatement> = {\n category: {\n coding: [\n {\n code: 'patientspecified',\n display: 'Patient Specified',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/medication-statement-category',\n },\n ],\n },\n dateAsserted: intervention.startDate,\n effectivePeriod: {\n end: intervention.endDate,\n start: intervention.startDate,\n },\n id: `intervention-${intervention.interventionId}`,\n medicationCodeableConcept: {\n text: intervention.name,\n },\n resourceType: 'MedicationStatement',\n status: interventionStatus(intervention.endDate),\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n\n if (intervention.notes) {\n statement.note = [{ text: intervention.notes }];\n }\n\n return statement;\n}\n\n/**\n * Convert diet/exercise/sleep intervention to FHIR Observation (social-history)\n */\nexport function interventionToFHIRObservation(\n intervention: InterventionData,\n patientId: string,\n): Addressable<FHIRObservation> {\n const lifestyleCode = LIFESTYLE_CODES[intervention.type];\n\n const observation: Addressable<FHIRObservation> = {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'social-history',\n display: 'Social History',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n coding: lifestyleCode\n ? [\n {\n code: lifestyleCode.code,\n display: lifestyleCode.display,\n system: 'http://loinc.org',\n },\n ]\n : [],\n text: intervention.name,\n },\n effectivePeriod: {\n end: intervention.endDate,\n start: intervention.startDate,\n },\n id: `intervention-${intervention.interventionId}`,\n resourceType: 'Observation',\n status: 'final',\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n valueString: intervention.name,\n };\n\n if (intervention.notes) {\n observation.note = [{ text: intervention.notes }];\n }\n\n return observation;\n}\n\n/**\n * Convert all interventions to a FHIR Bundle\n */\nexport function interventionsToFHIRBundle(\n interventions: InterventionData[],\n userProfile: UserProfileData,\n): FHIRBundle {\n const patientId = userProfile.userId;\n const fhirPatient = userProfileToFHIR(userProfile);\n\n const entries = interventions.map((intervention) => {\n const isMedication = intervention.type === 'medication' || intervention.type === 'supplement';\n const resource = isMedication\n ? interventionToFHIRMedicationStatement(intervention, patientId)\n : interventionToFHIRObservation(intervention, patientId);\n\n return { fullUrl: entryFullUrl(resource), resource };\n });\n\n return {\n entry: [{ fullUrl: entryFullUrl(fhirPatient), resource: fhirPatient }, ...entries],\n resourceType: 'Bundle',\n type: 'collection',\n };\n}\n","/**\n * Structured zone data for DEXA body composition and bone density charts.\n *\n * Body fat zones derived from Gallagher et al. Am J Clin Nutr 2000;72:694-701 (PMID: 10966886)\n * and ACSM Guidelines for Exercise Testing, 11th Ed (2021).\n *\n * T-Score zones from WHO criteria (Kanis JA, Osteoporos Int, PMID: 7696835).\n */\n\nexport interface BodyFatZone {\n ageMax: number;\n ageMin: number;\n color: string;\n fatPctMax: number;\n fatPctMin: number;\n label: string;\n sex: 'F' | 'M';\n}\n\ninterface AgeBracket {\n ageMax: number;\n ageMin: number;\n label: string;\n}\n\nconst AGE_BRACKETS: AgeBracket[] = [\n { ageMax: 25, ageMin: 18, label: '18-25' },\n { ageMax: 35, ageMin: 26, label: '26-35' },\n { ageMax: 45, ageMin: 36, label: '36-45' },\n { ageMax: 55, ageMin: 46, label: '46-55' },\n { ageMax: 99, ageMin: 56, label: '56+' },\n];\n\n// Zone boundaries per age bracket for men: [essential, athletic, fitness, average, obese]\n// Each value is the upper bound of the zone\nconst MALE_ZONES: number[][] = [\n [5, 10, 20, 25, 40],\n [5, 11, 21, 26, 40],\n [5, 12, 22, 27, 40],\n [5, 13, 23, 28, 40],\n [5, 14, 24, 29, 40],\n];\n\nconst FEMALE_ZONES: number[][] = [\n [13, 18, 28, 32, 45],\n [13, 18, 29, 33, 45],\n [13, 19, 30, 34, 45],\n [13, 20, 31, 35, 45],\n [13, 20, 32, 36, 45],\n];\n\ninterface ZoneDefinition {\n color: string;\n label: string;\n}\n\nconst ZONE_DEFS: ZoneDefinition[] = [\n { color: '#3b82f6', label: 'Essencial' },\n { color: '#06b6d4', label: 'Atlético' },\n { color: '#22c55e', label: 'Fitness' },\n { color: '#eab308', label: 'Média' },\n { color: '#ef4444', label: 'Obeso' },\n];\n\nfunction buildZones(sex: 'F' | 'M', zoneData: number[][]): BodyFatZone[] {\n const zones: BodyFatZone[] = [];\n for (let i = 0; i < AGE_BRACKETS.length; i++) {\n const bracket = AGE_BRACKETS[i]!;\n const b = zoneData[i]!;\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[0]!.color,\n fatPctMax: b[0]!,\n fatPctMin: 0,\n label: ZONE_DEFS[0]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[1]!.color,\n fatPctMax: b[1]!,\n fatPctMin: b[0]!,\n label: ZONE_DEFS[1]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[2]!.color,\n fatPctMax: b[2]!,\n fatPctMin: b[1]!,\n label: ZONE_DEFS[2]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[3]!.color,\n fatPctMax: b[3]!,\n fatPctMin: b[2]!,\n label: ZONE_DEFS[3]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[4]!.color,\n fatPctMax: b[4]!,\n fatPctMin: b[3]!,\n label: ZONE_DEFS[4]!.label,\n sex,\n });\n }\n return zones;\n}\n\nexport const BODY_FAT_ZONES: BodyFatZone[] = [\n ...buildZones('M', MALE_ZONES),\n ...buildZones('F', FEMALE_ZONES),\n];\n\nexport { AGE_BRACKETS, ZONE_DEFS };\n\nexport interface TScoreZone {\n color: string;\n label: string;\n max: number;\n min: number;\n}\n\nexport const T_SCORE_ZONES: TScoreZone[] = [\n { color: '#22c55e', label: 'Normal', max: 4, min: -1.0 },\n { color: '#eab308', label: 'Osteopenia', max: -1.0, min: -2.5 },\n { color: '#ef4444', label: 'Osteoporose', max: -2.5, min: -5 },\n];\n","/**\n * Screening Intervals Configuration\n *\n * Defines recommended screening intervals for different biomarker categories\n * based on clinical guidelines and best practices.\n */\n\n/**\n * Screening interval in months\n */\nexport type ScreeningIntervalMonths = 3 | 6 | 12;\n\n/**\n * Biomarker category with its recommended screening interval\n */\nexport interface CategoryScreeningInterval {\n category: string;\n intervalMonths: ScreeningIntervalMonths;\n nameEn: string;\n namePt: string;\n}\n\n/**\n * Screening interval configuration for each category\n *\n * Categories are grouped by their recommended screening intervals:\n * - 3 months: Body composition and bone density (frequently changing metrics)\n * - 6 months: Metabolic panel and nutrients (moderate change rate)\n * - 12 months: Standard blood panels (stable long-term markers)\n */\nexport const CATEGORY_SCREENING_INTERVALS: CategoryScreeningInterval[] = [\n // 3-month intervals - Body composition (frequently changing)\n {\n category: 'composicao-corporal',\n intervalMonths: 3,\n nameEn: 'Body Composition',\n namePt: 'Composição Corporal',\n },\n {\n category: 'densidade-ossea',\n intervalMonths: 3,\n nameEn: 'Bone Density',\n namePt: 'Densidade Óssea',\n },\n\n // 6-month intervals - Metabolic and nutrients\n {\n category: 'metabolico',\n intervalMonths: 6,\n nameEn: 'Metabolic Panel',\n namePt: 'Painel Metabólico',\n },\n {\n category: 'nutrientes',\n intervalMonths: 6,\n nameEn: 'Nutrients',\n namePt: 'Nutrientes',\n },\n {\n category: 'pancreas',\n intervalMonths: 6,\n nameEn: 'Pancreas',\n namePt: 'Pâncreas',\n },\n\n // 12-month intervals - Standard blood panels\n {\n category: 'coracao',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Heart Health',\n namePt: 'Saúde Cardiovascular',\n },\n {\n category: 'tireoide',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Thyroid',\n namePt: 'Tireoide',\n },\n {\n category: 'sangue',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Blood Count',\n namePt: 'Hemograma',\n },\n {\n category: 'figado',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Liver Function',\n namePt: 'Função Hepática',\n },\n {\n category: 'rins',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Kidney Function',\n namePt: 'Função Renal',\n },\n {\n category: 'saude-feminina',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: \"Women's Health\",\n namePt: 'Saúde Feminina',\n },\n {\n category: 'saude-masculina',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: \"Men's Health\",\n namePt: 'Saúde Masculina',\n },\n {\n category: 'eletrolitos',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Electrolytes',\n namePt: 'Eletrólitos',\n },\n {\n category: 'estresse-envelhecimento',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Stress & Aging',\n namePt: 'Estresse e Envelhecimento',\n },\n {\n category: 'autoimunidade',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Autoimmunity',\n namePt: 'Autoimunidade',\n },\n {\n category: 'regulacao-imunologica',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Immune Regulation',\n namePt: 'Regulação Imunológica',\n },\n {\n category: 'toxinas-ambientais',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Environmental Toxins',\n namePt: 'Toxinas Ambientais',\n },\n {\n category: 'urina',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Urinalysis',\n namePt: 'Urina',\n },\n];\n\n/**\n * Get screening interval for a category\n */\nexport const getScreeningInterval = (category: string): CategoryScreeningInterval | undefined => {\n return CATEGORY_SCREENING_INTERVALS.find((c) => c.category === category);\n};\n\n/**\n * Get all categories with a specific interval\n */\nexport const getCategoriesByInterval = (\n intervalMonths: ScreeningIntervalMonths,\n): CategoryScreeningInterval[] => {\n return CATEGORY_SCREENING_INTERVALS.filter((c) => c.intervalMonths === intervalMonths);\n};\n\n/**\n * Calculate next screening date based on last test date and category\n */\nexport const calculateNextScreeningDate = (lastTestDate: Date, category: string): Date | null => {\n const interval = getScreeningInterval(category);\n if (!interval) return null;\n\n const nextDate = new Date(lastTestDate);\n nextDate.setMonth(nextDate.getMonth() + interval.intervalMonths);\n return nextDate;\n};\n\n/**\n * Check if a category is due for screening\n */\nexport const isScreeningDue = (\n lastTestDate: Date,\n category: string,\n referenceDate: Date = new Date(),\n): boolean => {\n const nextDate = calculateNextScreeningDate(lastTestDate, category);\n if (!nextDate) return false;\n return referenceDate >= nextDate;\n};\n\n/**\n * Get categories that are due for screening based on last test dates\n */\nexport const getDueCategories = (\n lastTestDates: Record<string, Date>,\n referenceDate: Date = new Date(),\n): CategoryScreeningInterval[] => {\n return CATEGORY_SCREENING_INTERVALS.filter((interval) => {\n const lastDate = lastTestDates[interval.category];\n if (!lastDate) return true; // Never tested = due\n return isScreeningDue(lastDate, interval.category, referenceDate);\n });\n};\n\n/**\n * Get days until next screening for a category\n */\nexport const getDaysUntilScreening = (\n lastTestDate: Date,\n category: string,\n referenceDate: Date = new Date(),\n): number | null => {\n const nextDate = calculateNextScreeningDate(lastTestDate, category);\n if (!nextDate) return null;\n\n const diffTime = nextDate.getTime() - referenceDate.getTime();\n return Math.ceil(diffTime / (1000 * 60 * 60 * 24));\n};\n","/**\n * Portuguese pluralization utility using native Intl.PluralRules\n * Provides automatic pluralization for common words used in the app\n */\n\nconst pluralRules = new Intl.PluralRules('pt-BR');\n\n/**\n * Dictionary of Portuguese words with their plural forms\n * Key is the singular form, value is the plural form\n */\nconst dictionary: Record<string, string> = {\n // Common nouns\n arquivo: 'arquivos',\n biomarcador: 'biomarcadores',\n // Past participles (masculine)\n cadastrado: 'cadastrados',\n // Past participles (feminine)\n concluída: 'concluídas',\n confirmado: 'confirmados',\n convertido: 'convertidos',\n convidado: 'convidados',\n convite: 'convites',\n disponível: 'disponíveis',\n documento: 'documentos',\n enviado: 'enviados',\n exame: 'exames',\n excluída: 'excluídas',\n\n excluído: 'excluídos',\n // Verbs (3rd person)\n falhou: 'falharam',\n falta: 'faltam',\n ignorado: 'ignorados',\n item: 'itens',\n outro: 'outros',\n página: 'páginas',\n pendente: 'pendentes',\n registro: 'registros',\n removido: 'removidos',\n\n resultado: 'resultados',\n revisão: 'revisões',\n\n revogado: 'revogados',\n usuário: 'usuários',\n};\n\n/**\n * Get the plural form of a word from the dictionary\n * Falls back to adding 's' if word is not in dictionary\n */\nconst getPluralForm = (singular: string): string => {\n return dictionary[singular] ?? `${singular}s`;\n};\n\n/**\n * Returns the correct singular or plural form based on count\n * Uses Intl.PluralRules for proper locale-aware pluralization\n *\n * @example\n * plural(1, 'usuário') // 'usuário'\n * plural(3, 'usuário') // 'usuários'\n * plural(0, 'registro') // 'registros'\n */\nexport const plural = (count: number, word: string): string => {\n const rule = pluralRules.select(count);\n return rule === 'one' ? word : getPluralForm(word);\n};\n\n/**\n * Returns count with the correct singular or plural form\n *\n * @example\n * pluralCount(1, 'usuário') // '1 usuário'\n * pluralCount(3, 'usuário') // '3 usuários'\n */\nexport const pluralCount = (count: number, word: string): string => {\n return `${count} ${plural(count, word)}`;\n};\n\n/**\n * Returns the correct form for compound phrases (noun + adjective)\n * Both words are pluralized together\n *\n * @example\n * pluralPhrase(1, 'usuário', 'cadastrado') // 'usuário cadastrado'\n * pluralPhrase(3, 'usuário', 'cadastrado') // 'usuários cadastrados'\n * pluralPhrase(2, 'revisão', 'excluída') // 'revisões excluídas'\n */\nexport const pluralPhrase = (count: number, noun: string, adjective: string): string => {\n const rule = pluralRules.select(count);\n if (rule === 'one') {\n return `${noun} ${adjective}`;\n }\n return `${getPluralForm(noun)} ${getPluralForm(adjective)}`;\n};\n\n/**\n * Returns count with the correct compound phrase form\n *\n * @example\n * pluralPhraseCount(1, 'usuário', 'cadastrado') // '1 usuário cadastrado'\n * pluralPhraseCount(3, 'convite', 'enviado') // '3 convites enviados'\n */\nexport const pluralPhraseCount = (count: number, noun: string, adjective: string): string => {\n return `${count} ${pluralPhrase(count, noun, adjective)}`;\n};\n","/**\n * Helpers para identificadores brasileiros — CPF e CNS\n *\n * Validação, formatação e conversão para FHIR Identifier.\n * Algoritmos de validação baseados nas especificações oficiais:\n * - CPF: Receita Federal (mod-11, dois dígitos verificadores)\n * - CNS: Ministério da Saúde (mod-11 para definitivos, soma ponderada para provisórios)\n */\n\nimport type { FHIRIdentifier } from './fhir-types';\n\nconst CPF_SYSTEM = 'http://rnds.saude.gov.br/fhir/r4/NamingSystem/cpf';\nconst CNS_SYSTEM = 'http://rnds.saude.gov.br/fhir/r4/NamingSystem/cns';\n\n/**\n * Remove caracteres não-numéricos de uma string.\n */\nfunction digitsOnly(value: string): string {\n return value.replace(/\\D/g, '');\n}\n\n/**\n * Valida um CPF brasileiro usando algoritmo mod-11.\n *\n * @param cpf — CPF com ou sem formatação (ex: \"123.456.789-09\" ou \"12345678909\")\n * @returns true se o CPF é estruturalmente válido\n */\nexport function validateCPF(cpf: string): boolean {\n const digits = digitsOnly(cpf);\n\n if (digits.length !== 11) return false;\n\n // Rejeitar sequências de dígitos iguais (ex: 111.111.111-11)\n if (/^(\\d)\\1{10}$/.test(digits)) return false;\n\n // Primeiro dígito verificador\n let sum = 0;\n for (let i = 0; i < 9; i++) {\n sum += Number(digits[i]) * (10 - i);\n }\n let remainder = (sum * 10) % 11;\n if (remainder === 10) remainder = 0;\n if (remainder !== Number(digits[9])) return false;\n\n // Segundo dígito verificador\n sum = 0;\n for (let i = 0; i < 10; i++) {\n sum += Number(digits[i]) * (11 - i);\n }\n remainder = (sum * 10) % 11;\n if (remainder === 10) remainder = 0;\n if (remainder !== Number(digits[10])) return false;\n\n return true;\n}\n\n/**\n * Valida um CNS (Cartão Nacional de Saúde) brasileiro.\n *\n * CNS definitivos começam com 1 ou 2 (mod-11).\n * CNS provisórios começam com 7, 8 ou 9 (soma ponderada mod-11 = 0).\n *\n * @param cns — CNS com 15 dígitos\n * @returns true se o CNS é estruturalmente válido\n */\nexport function validateCNS(cns: string): boolean {\n const digits = digitsOnly(cns);\n\n if (digits.length !== 15) return false;\n\n const firstDigit = digits[0]!;\n\n // CNS deve começar com 1, 2 (definitivo) ou 7, 8, 9 (provisório)\n if (!['1', '2', '7', '8', '9'].includes(firstDigit)) return false;\n\n // Ambos os tipos usam soma ponderada mod-11 = 0\n let sum = 0;\n for (let i = 0; i < 15; i++) {\n sum += Number(digits[i]) * (15 - i);\n }\n return sum % 11 === 0;\n}\n\n/**\n * Formata um CPF como XXX.XXX.XXX-XX.\n *\n * @param cpf — CPF com 11 dígitos (com ou sem formatação)\n * @returns CPF formatado ou a string original se inválido\n */\nexport function formatCPF(cpf: string): string {\n const digits = digitsOnly(cpf);\n if (digits.length !== 11) return cpf;\n return `${digits.slice(0, 3)}.${digits.slice(3, 6)}.${digits.slice(6, 9)}-${digits.slice(9)}`;\n}\n\n/**\n * Formata um CNS como XXX XXXX XXXX XXXX.\n *\n * @param cns — CNS com 15 dígitos\n * @returns CNS formatado ou a string original se inválido\n */\nexport function formatCNS(cns: string): string {\n const digits = digitsOnly(cns);\n if (digits.length !== 15) return cns;\n return `${digits.slice(0, 3)} ${digits.slice(3, 7)} ${digits.slice(7, 11)} ${digits.slice(11)}`;\n}\n\n/**\n * Converte um CPF para um FHIR Identifier.\n *\n * @param cpf — CPF com 11 dígitos (com ou sem formatação)\n * @returns FHIR Identifier com sistema RNDS para CPF\n * @throws Error se o CPF for inválido\n */\nexport function cpfToFHIRIdentifier(cpf: string): FHIRIdentifier {\n if (!validateCPF(cpf)) {\n throw new Error('CPF inválido');\n }\n return {\n system: CPF_SYSTEM,\n use: 'official',\n value: digitsOnly(cpf),\n };\n}\n\n/**\n * Converte um CNS para um FHIR Identifier.\n *\n * @param cns — CNS com 15 dígitos\n * @returns FHIR Identifier com sistema RNDS para CNS\n * @throws Error se o CNS for inválido\n */\nexport function cnsToFHIRIdentifier(cns: string): FHIRIdentifier {\n if (!validateCNS(cns)) {\n throw new Error('CNS inválido');\n }\n return {\n system: CNS_SYSTEM,\n use: 'official',\n value: digitsOnly(cns),\n };\n}\n","/**\n * URLs das extensões do IG do fhir-brasil.\n *\n * Quem emite a extensão e quem a lê precisam concordar literalmente na URL: um\n * consumidor procura a extensão pelo `url`, e uma grafia divergente faz o dado\n * sumir sem erro. O teste confere cada uma contra o `Id:` do FSH em\n * `ig/input/fsh/extensions/`, então extensão nova no IG sem constante aqui, ou\n * o inverso, reprova.\n */\n\n/** Canonical do IG, como está no `sushi-config.yaml`. */\nexport const IG_CANONICAL = 'https://fhir-brasil.dev.br/ig';\n\nconst structureDefinition = (id: string): string => `${IG_CANONICAL}/StructureDefinition/${id}`;\n\n/**\n * Extensões do IG, pela URL.\n *\n * As que têm partes (`extractionSource`, `extractionConfidence`, `asPrinted`)\n * levam as partes em `extension[]` aninhado, cada uma com `url` relativo: o\n * nome da parte, como `page` ou `reading`. Ver o FSH de cada uma.\n */\nexport const FHIR_BRASIL_EXTENSIONS = {\n /** `Observation`: valor e faixa como impressos, quando a Observation traz outros. */\n asPrinted: structureDefinition('as-printed'),\n /** `Observation`: extraída de PDF via OCR. */\n derivedFromOCR: structureDefinition('derived-from-ocr'),\n /** `Observation`: confiança na leitura e na interpretação, de 0 a 1. */\n extractionConfidence: structureDefinition('extraction-confidence'),\n /** `Observation`: páginas, trecho citado e caixa do trecho no documento. */\n extractionSource: structureDefinition('extraction-source'),\n /** `DiagnosticReport`: lido da tabela de histórico de outro laudo. */\n reprintedIn: structureDefinition('reprinted-in'),\n /** `Observation`: lido do documento, mas substituído por outro valor do mesmo laudo. */\n superseded: structureDefinition('superseded'),\n /** `Observation`: unidade impressa ao lado de um resultado em texto. */\n textValueUnit: structureDefinition('text-value-unit'),\n} as const;\n","/**\n * Código do tipo de amostra a partir do material impresso no laudo.\n *\n * O perfil `BRAmostraBiologica-1.0` da RNDS vincula `Specimen.type` ao ValueSet\n * `BRTipoAmostra-1.0` com força `required`, exige `type.coding` (1..1) e proíbe\n * `type.text` (0..0). Um `Specimen` só com o texto do laudo não passa, e é o que\n * a extração produzia.\n *\n * O ValueSet tem 63 códigos, e quase todos são de vigilância respiratória vindos\n * do GAL: swab nasofaríngeo, lavado brônquico, fragmento de órgão. Para laudo de\n * rotina sobram seis, e esses seis cobrem o que um painel de sangue e urina\n * imprime.\n *\n * Não há código para fezes no ValueSet. Isso não afeta a extração, cujo catálogo\n * não tem nenhum biomarcador de origem fecal: um parasitológico não vira\n * `Observation`, então não chega a pedir `Specimen`.\n *\n * @see https://rnds-fhir.saude.gov.br/StructureDefinition-BRAmostraBiologica-1.0.html\n * @see https://rnds-fhir.saude.gov.br/ValueSet-BRTipoAmostra-1.0.html\n */\nimport type { FHIRCoding } from './fhir-types';\n\n/** ValueSet ao qual `Specimen.type` está vinculado no `BRAmostraBiologica`. */\nexport const BR_TIPO_AMOSTRA_VALUESET = 'https://rnds-fhir.saude.gov.br/ValueSet/BRTipoAmostra-1.0';\n\n/**\n * CodeSystem dos códigos que este módulo emite.\n *\n * O ValueSet também inclui o `BRTipoAmostraGAL`, que traz \"Sangue\" e \"Sangue com\n * EDTA\" soltos. Ficaram de fora porque a URL canônica daquele CodeSystem não foi\n * confirmada na fonte, e código de terminologia não se deduz de slug. Material\n * assim cai no caminho de não mapeado até alguém abrir o IG e confirmar.\n */\nexport const HL7_SPECIMEN_TYPE_SYSTEM = 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v2-0487';\n\n/**\n * Os `display` são cópia literal do ValueSet, com a caixa dele.\n *\n * A chave é o texto já normalizado, e por enquanto é só o próprio display. Não\n * há sinônimo inventado aqui: a extração copia o material verbatim do laudo, e a\n * lista de variações que os laboratórios de fato imprimem ainda não foi medida\n * (a captura de material entrou em produção em 05/09/2026). Variação real\n * observada entra depois, com o laudo que a produziu.\n */\nconst CODINGS: ReadonlyArray<{ code: string; display: string }> = [\n { code: 'SER', display: 'Soro' },\n { code: 'PLAS', display: 'Plasma' },\n { code: 'WB', display: 'Sangue Total' },\n { code: 'UR', display: 'Urina' },\n { code: 'CSF', display: 'Líquor' },\n { code: 'SAL', display: 'Saliva' },\n];\n\n/**\n * Caixa, acento e espaço sobrando não distinguem material.\n *\n * Só isso. Não separa `camelCase` nem troca barra por espaço, ao contrário do\n * normalizador de nomes de biomarcador: \"Soro/Plasma\" impresso numa linha só é\n * ambíguo de verdade, e escolher um dos dois seria inferência. Sem casar, ele\n * segue o caminho do não mapeado.\n *\n * Os caracteres invisíveis saem antes, e a divisão entre as duas regras é a do\n * próprio Unicode: `\\p{Cf}` são os de formatação, que não ocupam espaço e por\n * isso são apagados, e `\\s` são os de espaço, que são colapsados. A camada de\n * texto de PDF emite os dois tipos, e um U+200B no meio de \"Soro\" derruba o\n * casamento sem deixar rastro na tela.\n *\n * Vale a categoria em vez da lista porque a lista nunca fecha. Enumerando, o\n * hífen opcional (U+00AD) tinha ficado de fora, e ele aparece justamente onde\n * um nome composto como \"Sangue Total\" quebra de linha.\n */\nconst INVISIBLE = /\\p{Cf}/gu;\n\nconst normalize = (text: string): string =>\n text\n .replace(INVISIBLE, '')\n .normalize('NFD')\n .replace(/[\\u0300-\\u036f]/g, '')\n .toLowerCase()\n .replace(/\\s+/g, ' ')\n .trim();\n\nconst BY_NORMALIZED_TEXT = new Map(\n CODINGS.map(({ code, display }) => [\n normalize(display),\n { code, display, system: HL7_SPECIMEN_TYPE_SYSTEM } satisfies FHIRCoding,\n ]),\n);\n\n/**\n * Coding do ValueSet para o material impresso, ou `undefined` sem casar.\n *\n * `undefined` é resposta legítima e não erro: o laudo pode trazer um material\n * fora do ValueSet, ou uma grafia que ninguém viu ainda. Quem chama decide o que\n * fazer, e a decisão que não existe é preencher com um código aproximado.\n */\nexport const specimenTypeCoding = (text: string): FHIRCoding | undefined =>\n BY_NORMALIZED_TEXT.get(normalize(text));\n","/**\n * Registro de decisão de cada mapeamento LOINC do catálogo.\n *\n * O catálogo em `biomarkers.ts` guarda a conclusão (o código). Este arquivo\n * guarda por que aquele código e não outro: o que o laudo mostrou, o que\n * decidiu, os irmãos descartados e quem revisou. É o diff que uma revisão de\n * mapeamento lê.\n *\n * A maioria das entradas é `nameOnly`: o código foi escolhido pelo nome do\n * exame, sem registro de unidade, método, material ou bula, e ninguém revisou\n * de fora. É o registro honesto do que existe, e não justificativa inventada.\n * As entradas com evidência vieram dos comentários em `biomarkers.ts` que já\n * documentavam a troca. `reviewer` fica vazio até uma revisão independente.\n *\n * `loinc` repete o código do catálogo de propósito: trocar o código em\n * `biomarkers.ts` sem tocar aqui falha em `mapping-decisions.test.ts`, e a\n * troca chega à revisão com o registro ao lado.\n *\n * Sem import em runtime: o `scripts/verify-loinc.ts` lê este arquivo direto com\n * o type stripping do Node, que não resolve import sem extensão. A ficha que\n * junta registro, catálogo e eixos fica em `mapping-sheet.ts`.\n */\n/** O que o laudo mostrou e pesou na escolha do código. */\nexport type MappingEvidence = 'assay-insert' | 'method-line' | 'name' | 'specimen' | 'unit';\n\nexport interface RejectedSibling {\n loinc: string;\n reason: string;\n}\n\nexport interface MappingDecision {\n evidence: MappingEvidence[];\n /** O código escolhido. Tem que ser o `loinc` do biomarcador no catálogo. */\n loinc: string;\n /** Versão do LOINC em que a revisão conferiu o código. */\n loincVersion?: string;\n note?: string;\n reviewedAt?: string;\n reviewer?: string;\n /** Qual evidência decidiu. Está sempre em `evidence`. */\n settledBy: MappingEvidence;\n siblingsRejected: RejectedSibling[];\n}\n\n/**\n * Por que uma entrada não tem LOINC.\n *\n * - `no-concept`: procurado, e o LOINC não tem o conceito.\n * - `ambiguous`: há candidatos, e nenhum é a mesma grandeza.\n * - `pending-review`: ninguém registrou a busca.\n * - `not-lab`: fora do escopo de exame laboratorial.\n */\nexport type NoLoincReason = 'ambiguous' | 'no-concept' | 'not-lab' | 'pending-review';\n\nexport interface NoLoincDecision {\n note: string;\n reason: NoLoincReason;\n}\n\n/** Escolhido pelo nome, sem outra evidência registrada nem revisão. */\nfunction nameOnly(loinc: string): MappingDecision {\n return { evidence: ['name'], loinc, settledBy: 'name', siblingsRejected: [] };\n}\n\nexport const MAPPING_DECISIONS: Record<string, MappingDecision> = {\n AA_EPA_Ratio: nameOnly('90909-3'),\n ABO_Group: nameOnly('883-9'),\n Adiponectin: nameOnly('47828-9'),\n AFP: nameOnly('1834-1'),\n Albumin: nameOnly('1751-7'),\n Albumin_Creatinine_Ratio: nameOnly('9318-7'),\n Albumin_Globulin_Ratio: nameOnly('1759-0'),\n AlkalinePhosphatase: nameOnly('6768-6'),\n ALT: nameOnly('1742-6'),\n AMH: nameOnly('38476-8'),\n Amylase: nameOnly('1798-8'),\n ANA_Screen: nameOnly('8061-4'),\n AntiThyroglobulin: nameOnly('8098-6'),\n AntiTPO: nameOnly('8099-4'),\n ApoA1: nameOnly('1869-7'),\n ApoB: nameOnly('1884-6'),\n APOE_Genotype: nameOnly('21619-2'),\n Appearance_Urine: nameOnly('5767-9'),\n AST: nameOnly('1920-8'),\n Bacteria_Urine: {\n loinc: '5769-5',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '630-4',\n reason:\n 'urocultura, que identifica a espécie (nominal), e não a contagem do sedimento em /HPF',\n },\n ],\n },\n Basophils: nameOnly('706-2'),\n Basophils_Abs: nameOnly('704-7'),\n BetaHCG: nameOnly('19080-1'),\n BetaHydroxybutyrate: {\n loinc: '6873-4',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '53060-0',\n reason: 'butirilcarnitina (C4) em líquido amniótico: analito e material errados',\n },\n ],\n },\n Bilirubin_Urine: nameOnly('5770-3'),\n BilirubinDirect: nameOnly('1968-7'),\n BilirubinIndirect: nameOnly('1971-1'),\n BilirubinTotal: nameOnly('1975-2'),\n Blood_Urine: nameOnly('5794-3'),\n BMI: nameOnly('39156-5'),\n BNP: nameOnly('30934-4'),\n BodyFatPct: nameOnly('41982-0'),\n BodyWaterPct: nameOnly('101684-9'),\n BUN_Creatinine_Ratio: nameOnly('3097-3'),\n C3: nameOnly('4485-9'),\n C4: nameOnly('4498-2'),\n CA125: nameOnly('10334-1'),\n CA153: nameOnly('6875-9'),\n CA199: nameOnly('24108-3'),\n Calcium: nameOnly('17861-6'),\n CalfCircumference: nameOnly('107112-5'),\n CEA: nameOnly('2039-6'),\n Chloride: nameOnly('2075-0'),\n Cholesterol: nameOnly('2093-3'),\n Cholesterol_HDL_Ratio: nameOnly('9830-1'),\n CK: nameOnly('2157-6'),\n CO2: nameOnly('2028-9'),\n Color_Urine: nameOnly('5778-6'),\n Cortisol: nameOnly('2143-6'),\n Creatinine: nameOnly('2160-0'),\n Creatinine_Urine: nameOnly('2161-8'),\n CRP: nameOnly('1988-5'),\n CystatinC: nameOnly('33863-2'),\n DDimer: {\n loinc: '48065-7',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '48066-5',\n reason: 'DDU, que vale cerca de metade do FEU que a faixa do catálogo pressupõe',\n },\n ],\n note: 'Laudo que imprime só \"ng/mL\" não diz a convenção; o FEU é o que a faixa pressupõe.',\n },\n DHEAS: nameOnly('2191-5'),\n DHT: nameOnly('1848-1'),\n eAG: nameOnly('27353-2'),\n eGFR: nameOnly('98979-8'),\n Eosinophils: nameOnly('713-8'),\n Eosinophils_Abs: nameOnly('711-2'),\n EPADPADHA: {\n loinc: '90911-9',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '90908-5',\n reason:\n 'interpretação ordinal do mesmo valor (risco alto, moderado, baixo), e não o número',\n },\n ],\n },\n ESR: nameOnly('30341-2'),\n Estradiol: nameOnly('2243-4'),\n FatMass: nameOnly('73708-0'),\n Ferritin: nameOnly('2276-4'),\n Fibrinogen: nameOnly('3255-7'),\n Folate: nameOnly('2284-8'),\n FSH: nameOnly('15067-2'),\n GGT: nameOnly('2324-2'),\n Gliadin_Deamidated_IgA: nameOnly('63453-5'),\n Gliadin_Deamidated_IgG: nameOnly('63459-2'),\n Globulin: nameOnly('2336-6'),\n Glucose: {\n loinc: '2345-7',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '1558-6',\n reason: 'afirma jejum (Glucose^post CFst), e a grafia \"Glicose\" não declara jejum',\n },\n ],\n },\n Glucose_Fasting: {\n loinc: '1558-6',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [{ loinc: '2345-7', reason: 'não afirma jejum, e a grafia declara' }],\n },\n Glucose_Urine: nameOnly('5792-7'),\n HbA1c: nameOnly('4548-4'),\n Hct: nameOnly('4544-3'),\n HDL: nameOnly('2085-9'),\n HDL_Large: nameOnly('43729-3'),\n Hgb: nameOnly('718-7'),\n HOMA_IR: nameOnly('47214-2'),\n Homocysteine: nameOnly('13965-9'),\n HyalineCasts_Urine: nameOnly('5796-8'),\n IgA: nameOnly('2458-8'),\n IgE_E1_CatDander: nameOnly('6833-8'),\n IgE_GX1_Grasses: nameOnly('30189-5'),\n IgE_Total: nameOnly('19113-0'),\n IgG: nameOnly('2465-3'),\n IgM: nameOnly('2472-9'),\n INR: nameOnly('6301-6'),\n Insulin: nameOnly('20448-7'),\n Iron: nameOnly('2498-4'),\n Ketones_Urine: nameOnly('5797-6'),\n LDH: nameOnly('14804-9'),\n LDL: {\n loinc: '2089-1',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Código sem método. A linha de método do laudo escolhe a variante (13457-7, 18262-6, 96259-7).',\n },\n LDL_Medium: nameOnly('96735-6'),\n LDL_ParticleNumber: nameOnly('54434-6'),\n LDL_Pattern: nameOnly('35505-7'),\n LDL_Peak_Size: nameOnly('17782-4'),\n LDL_Small: nameOnly('43727-7'),\n Lead: nameOnly('77307-7'),\n Leptin: nameOnly('21365-2'),\n LeukocyteEsterase_Urine: nameOnly('5799-2'),\n Leukocytes_Urine: nameOnly('5821-4'),\n LH: nameOnly('10501-5'),\n Lipase: nameOnly('3040-3'),\n Lipoprotein_a: {\n loinc: '43583-4',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '10835-7',\n reason:\n 'massa/volume (mg/dL), incompatível com o nmol/L declarado; a SBC 2025 recomenda ensaio independente de isoforma em nmol/L',\n },\n ],\n },\n Lymphocytes: nameOnly('736-9'),\n Lymphocytes_Abs: nameOnly('731-0'),\n Magnesium: nameOnly('19123-9'),\n Magnesium_RBC: nameOnly('26746-8'),\n MCH: nameOnly('785-6'),\n MCHC: nameOnly('786-4'),\n MCV: nameOnly('787-2'),\n Mercury: nameOnly('5685-3'),\n Microalbumin_Urine: nameOnly('14957-5'),\n MMA: nameOnly('13964-2'),\n Monocytes: nameOnly('5905-5'),\n Monocytes_Abs: nameOnly('742-7'),\n MPV: nameOnly('32623-1'),\n MuscleMass: nameOnly('73964-9'),\n Neutrophils: nameOnly('770-8'),\n Neutrophils_Abs: nameOnly('751-8'),\n Nitrite_Urine: nameOnly('5802-4'),\n NonHDL_Cholesterol: nameOnly('43396-1'),\n NTproBNP: nameOnly('33762-6'),\n Omega3_DHA: {\n loinc: '90914-3',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega3_DPA: {\n loinc: '90913-5',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega3_EPA: {\n loinc: '90912-7',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega3_Total: {\n loinc: '99620-7',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Moles/volume em RBC.lysate, e o laudo imprime %: não há código de fração para o total.',\n },\n Omega6_AA: {\n loinc: '90916-8',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega6_LA: {\n loinc: '90917-6',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega6_Omega3_Ratio: nameOnly('90910-1'),\n Omega6_Total: {\n loinc: '99621-5',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '35177-5',\n reason:\n 'ácidos graxos poli-insaturados totais, ômega-3 e ômega-6 somados: outro componente',\n },\n ],\n note: 'Moles/volume em RBC.lysate, e o laudo imprime %: não há código de fração para o total.',\n },\n pH_Urine: nameOnly('5803-2'),\n PhaseAngle: {\n loinc: '107160-4',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Único código de ângulo de fase; declara razão e o aparelho imprime graus.',\n },\n Platelets: nameOnly('777-3'),\n Potassium: nameOnly('2823-3'),\n Progesterone: nameOnly('2839-9'),\n Prolactin: nameOnly('2842-3'),\n Protein_Urine: nameOnly('5804-0'),\n ProthrombinTime: nameOnly('5902-2'),\n PSA: nameOnly('2857-1'),\n PSA_Free: nameOnly('10886-0'),\n PSA_FreeRatio: nameOnly('12841-3'),\n PTH: nameOnly('2731-8'),\n RBC: nameOnly('789-8'),\n RBC_Urine: {\n loinc: '13945-1',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n { loinc: '5808-1', reason: 'o mesmo exame em #/volume (por mL), e o laudo imprime /HPF' },\n ],\n },\n RDW: nameOnly('788-0'),\n Reticulocytes: nameOnly('4679-7'),\n Rh_Type: nameOnly('10331-7'),\n RheumatoidFactor: nameOnly('11572-5'),\n Selenium: nameOnly('5724-0'),\n SHBG: nameOnly('13967-5'),\n SkinfoldAbdominal: nameOnly('8355-0'),\n SkinfoldThigh: nameOnly('8353-5'),\n SkinfoldTriceps: nameOnly('8354-3'),\n Sodium: nameOnly('2951-2'),\n SpecificGravity_Urine: nameOnly('5811-5'),\n SquamousEpithelial_Urine: nameOnly('11277-1'),\n T3Free: nameOnly('3051-0'),\n T4Free: nameOnly('3024-7'),\n T4Total: nameOnly('3026-2'),\n Testosterone: nameOnly('2986-8'),\n TestosteroneFree: nameOnly('2991-8'),\n Thyroglobulin: nameOnly('3013-0'),\n TIBC: nameOnly('2500-7'),\n TotalBodyWater: {\n loinc: '101683-1',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Único código de água corporal total; é massa (kg) e o aparelho imprime litros, o mesmo número para água.',\n },\n TotalMass: nameOnly('29463-7'),\n TotalProtein: nameOnly('2885-2'),\n TransferrinSaturation: nameOnly('2502-3'),\n Triglycerides: nameOnly('2571-8'),\n TroponinI: {\n loinc: '49563-0',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: '49563-0 afirma o ensaio de alta sensibilidade; troponina I convencional pede 10839-9, sem método.',\n },\n TroponinT: {\n loinc: '6598-7',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: '6598-7 não afirma método e cobre o ensaio convencional e o ultrassensível; o código hs entra como variante por método.',\n },\n TSH: nameOnly('3016-3'),\n tTG_IgA: nameOnly('31017-7'),\n tTG_IgG: nameOnly('32998-7'),\n Urea: nameOnly('3091-6'),\n Urea_Creatinine_Ratio: {\n loinc: '56997-0',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n note: 'separado de BUN_Creatinine_Ratio em out/2026: o laudo brasileiro dosa ureia (3091-6), e a razão impressa é ureia/creatinina',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '3097-3',\n reason:\n 'nitrogênio ureico (BUN)/creatinina: outro componente, valor cerca de 2,14 vezes menor e faixa da convenção BUN',\n },\n ],\n },\n UricAcid: nameOnly('3084-1'),\n Urobilinogen_Urine: nameOnly('20405-7'),\n VitaminA: nameOnly('2923-1'),\n VitaminB12: nameOnly('2132-9'),\n VitaminC: nameOnly('1903-4'),\n VitaminD: {\n loinc: '62292-8',\n evidence: ['name', 'assay-insert'],\n settledBy: 'assay-insert',\n siblingsRejected: [\n { loinc: '1989-3', reason: 'só a fração D3; os imunoensaios reportam D2 + D3' },\n ],\n },\n VLDL: nameOnly('13458-5'),\n WaistCircumference: nameOnly('8280-0'),\n WBC: nameOnly('6690-2'),\n Zinc: {\n loinc: '5763-8',\n evidence: ['name', 'specimen'],\n settledBy: 'specimen',\n siblingsRejected: [\n { loinc: '8245-3', reason: 'sangue total, outro material com faixa própria' },\n ],\n },\n};\n\nexport const NO_LOINC_DECISIONS: Record<string, NoLoincDecision> = {\n AndroidFatPct: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n AndroidGynoidRatio: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n AorticValveCalcium: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n ArmsFatMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n ArmsLeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n BMC: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n BMD_Total: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem densitometria por sítio, não corpo inteiro.',\n },\n BasalMetabolicRate: {\n reason: 'ambiguous',\n note: 'Candidatos são índice (50042-1) ou RMR medido ou previsto (82278-3, 82286-6), e o aparelho estima TMB.',\n },\n CAC: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_LAD: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_LCX: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_LMA: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_Percentile: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_RCA: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n ConicityIndex: { reason: 'no-concept', note: 'Índice derivado, sem conceito próprio.' },\n ECWToTBWRatio: { reason: 'no-concept', note: 'Razão derivada, sem conceito próprio.' },\n Estrone: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Em soro só há a fração não conjugada (2261-6); não há estrona total.',\n },\n ExtracellularWater: { reason: 'no-concept', note: '\"extracellular water\" não devolve código.' },\n FatFreeMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n GynoidFatPct: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n IntracellularWater: { reason: 'no-concept', note: '\"intracellular water\" não devolve código.' },\n LeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Massa magra não é massa muscular (73964-9); não há LOINC para massa magra.',\n },\n LegsFatMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n LegsLeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n MuscleMassIndex: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Índice derivado de massa muscular total; os cortes publicados são sobre massa apendicular.',\n },\n ResidualMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Conceito de fracionamento antropométrico, sem código.',\n },\n SkinfoldChest: { reason: 'no-concept', note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.' },\n SkinfoldMidaxillary: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.',\n },\n SkinfoldSubscapular: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.',\n },\n SkinfoldSuprailiac: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.',\n },\n TScore_Total: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem densitometria por sítio, não corpo inteiro.',\n },\n TrunkFatMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n TrunkLeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n VATMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n VATVolume: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n VisceralFatLevel: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Índice de 1 a 20; 73707-2 é área, outra grandeza.',\n },\n WaistToHeightRatio: { reason: 'no-concept', note: '\"waist to height\" não devolve código.' },\n ZScore_Total: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem densitometria por sítio, não corpo inteiro.',\n },\n};\n\nexport function getMappingDecision(code: string): MappingDecision | undefined {\n return MAPPING_DECISIONS[code];\n}\n\nexport function getNoLoincDecision(code: string): NoLoincDecision | undefined {\n return NO_LOINC_DECISIONS[code];\n}\n","/**\n * A ficha de um mapeamento LOINC no formato da planilha de um mapeador: nome\n * local, unidade, material, método, candidatos com os eixos, escolhido,\n * rejeitados, grupos, revisor e versão. É o que `fhir-bio decision` imprime.\n */\nimport { type BiomarkerDefinition, getDefinitionByCode, getDefinitionByLoinc } from './biomarkers';\nimport { getLoincEntry, type LoincEntry } from './loinc-axes';\nimport {\n getMappingDecision,\n getNoLoincDecision,\n type MappingDecision,\n type NoLoincDecision,\n} from './mapping-decisions';\n\n/** Um código candidato com os eixos que o snapshot guarda dele. */\nexport interface MappingCandidate {\n axes?: LoincEntry;\n loinc: string;\n role: 'chosen' | 'method-variant' | 'rejected';\n /** Pista impressa da variante, ou o motivo da rejeição. */\n why?: string;\n}\n\n/** A ficha de um mapeamento, no formato da planilha de um mapeador. */\nexport interface MappingSheet {\n candidates: MappingCandidate[];\n code: string;\n decision?: MappingDecision;\n /** LOINC Groups do código escolhido. */\n groups: Record<string, string>;\n localNames: string[];\n method: string | null;\n noLoinc?: NoLoincDecision;\n specimen: string | null;\n unit?: string;\n}\n\n/** Aceita o código interno ou qualquer LOINC que resolva para o biomarcador. */\nexport function getMappingSheet(codeOrLoinc: string): MappingSheet | undefined {\n const def: BiomarkerDefinition | undefined =\n getDefinitionByCode(codeOrLoinc) ?? getDefinitionByLoinc(codeOrLoinc);\n if (!def) return undefined;\n\n const decision = getMappingDecision(def.code);\n const chosen = def.loinc ? getLoincEntry(def.loinc) : undefined;\n const candidates: MappingCandidate[] = [];\n if (def.loinc) candidates.push({ axes: chosen, loinc: def.loinc, role: 'chosen' });\n for (const v of def.methodVariants ?? []) {\n const cues = [...v.cues.pt, ...v.cues.en];\n candidates.push({\n axes: getLoincEntry(v.loinc),\n loinc: v.loinc,\n role: 'method-variant',\n why: cues.length ? cues.join('; ') : undefined,\n });\n }\n for (const s of decision?.siblingsRejected ?? []) {\n candidates.push({\n axes: getLoincEntry(s.loinc),\n loinc: s.loinc,\n role: 'rejected',\n why: s.reason,\n });\n }\n\n return {\n candidates,\n code: def.code,\n decision,\n groups: chosen?.groups ?? {},\n localNames: def.names.pt,\n method: chosen?.method ?? null,\n noLoinc: getNoLoincDecision(def.code),\n specimen: chosen?.system ?? null,\n unit: def.unit,\n };\n}\n","/**\n * Material impresso contra o sistema LOINC do código.\n *\n * O laudo imprime o material de cada exame (\"Material: Urina de 24 horas\",\n * \"Material: Soro\"), e o código LOINC carrega o dele no eixo System. Quando os\n * dois discordam, o código está errado para aquele resultado: \"Sódio\" numa\n * seção de urina casa pelo nome com o sódio sérico, e sair com o código de soro\n * afirma uma grandeza que o laboratório não mediu.\n *\n * A comparação é por classe, sangue ou urina, e não por código de material. O\n * `specimenTypeCoding` não casa \"Urina de 24 horas\", de propósito, porque não\n * inventa sinônimo para codificar `Specimen.type`. Para barrar um código basta\n * saber que é urina, e a primeira palavra diz isso sem afirmar mais nada.\n *\n * Material que não começa por uma palavra conhecida, e sistema fora das duas\n * classes (antropometria, `Bld/Tiss`), não barram nada: sem classe dos dois\n * lados não há conflito a afirmar.\n */\nimport { getLoincEntry } from './loinc-axes';\n\nexport type SpecimenClass = 'blood' | 'urine';\n\n/** Palavra inicial do material impresso, já sem acento e em minúsculas. */\nconst CLASSE_DO_MATERIAL: Record<string, SpecimenClass> = {\n plasma: 'blood',\n sangue: 'blood',\n soro: 'blood',\n urina: 'urine',\n};\n\n/** Sistemas do LOINC por classe. `Bld/Tiss` fica de fora: não é só sangue. */\nconst CLASSE_DO_SISTEMA: Record<string, SpecimenClass> = {\n Bld: 'blood',\n BldV: 'blood',\n Plas: 'blood',\n PPP: 'blood',\n RBC: 'blood',\n 'RBC.lysate': 'blood',\n Ser: 'blood',\n 'Ser/Plas': 'blood',\n 'Ser/Plas/Bld': 'blood',\n Urine: 'urine',\n 'Urine sed': 'urine',\n};\n\nconst primeiraPalavra = (texto: string): string =>\n texto\n .replace(/\\p{Cf}/gu, '')\n .normalize('NFD')\n .replace(/[̀-ͯ]/g, '')\n .toLowerCase()\n .trim()\n .split(/[^a-z]+/)[0] ?? '';\n\n/** Classe do material impresso, ou `undefined` quando a palavra inicial não diz. */\nexport function specimenClassOf(material: string): SpecimenClass | undefined {\n return CLASSE_DO_MATERIAL[primeiraPalavra(material)];\n}\n\n/** Classe do eixo System do código, ou `undefined` fora do snapshot ou das duas classes. */\nexport function loincSpecimenClass(loinc: string): SpecimenClass | undefined {\n const system = getLoincEntry(loinc)?.system;\n return system ? CLASSE_DO_SISTEMA[system] : undefined;\n}\n\nexport interface SpecimenMismatch {\n /** Classe do eixo System do código. */\n code: SpecimenClass;\n loinc: string;\n /** Classe do material impresso. */\n material: SpecimenClass;\n reason: 'specimen-mismatch';\n system: string;\n}\n\n/**\n * O conflito entre o material impresso e o código, ou `null` sem conflito\n * afirmável. Quem chama decide o que fazer com o resultado, e a decisão que não\n * existe é trocar o código por um palpite: conflito é lacuna, e sai como tal.\n */\nexport function specimenMismatch(material: string, loinc: string): SpecimenMismatch | null {\n const doMaterial = specimenClassOf(material);\n const doCodigo = loincSpecimenClass(loinc);\n if (!doMaterial || !doCodigo || doMaterial === doCodigo) return null;\n return {\n code: doCodigo,\n loinc,\n material: doMaterial,\n reason: 'specimen-mismatch',\n system: getLoincEntry(loinc)?.system ?? '',\n };\n}\n"]}
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+ 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* Agrupamento de categorias clínicas em 10 grupos de alto nível.\n *\n * `BiomarkerDefinition.category` armazena 20 sub-categorias (granularidade\n * fina, ex: `tireoide`, `pancreas`). Este módulo agrupa essas\n * sub-categorias em 10 buckets clínicos amplos para apresentação no\n * site, na API pública e em material de divulgação.\n *\n * As sub-categorias permanecem como fonte da verdade nos dados; este\n * agrupamento é uma camada derivada.\n */\n\nexport type CategoryGroup =\n | 'cardiovascular'\n | 'metabolico-endocrino'\n | 'renal-eletrolitico'\n | 'hepatico-biliar'\n | 'hematologico'\n | 'imunologico'\n | 'oncologico'\n | 'nutricional-ambiental'\n | 'saude-reprodutiva'\n | 'composicao-envelhecimento';\n\nexport interface CategoryGroupInfo {\n /** Rótulo em inglês */\n en: string;\n /** Rótulo em português */\n pt: string;\n /** Slug (kebab-case, sem acento) */\n slug: CategoryGroup;\n /** Sub-categorias da fonte agrupadas neste bucket */\n subcategories: readonly string[];\n}\n\nexport const CATEGORY_GROUPS: Record<CategoryGroup, CategoryGroupInfo> = {\n cardiovascular: {\n en: 'Cardiovascular',\n pt: 'Cardiovascular',\n slug: 'cardiovascular',\n subcategories: ['coracao'],\n },\n 'composicao-envelhecimento': {\n en: 'Body Composition & Aging',\n pt: 'Composição Corporal e Envelhecimento',\n slug: 'composicao-envelhecimento',\n subcategories: ['composicao-corporal', 'densidade-ossea', 'estresse-envelhecimento'],\n },\n hematologico: {\n en: 'Hematology',\n pt: 'Hematológico',\n slug: 'hematologico',\n subcategories: ['sangue'],\n },\n 'hepatico-biliar': {\n en: 'Hepatic & Biliary',\n pt: 'Hepático e Biliar',\n slug: 'hepatico-biliar',\n subcategories: ['figado'],\n },\n imunologico: {\n en: 'Immunology',\n pt: 'Imunológico',\n slug: 'imunologico',\n subcategories: ['autoimunidade', 'regulacao-imunologica'],\n },\n 'metabolico-endocrino': {\n en: 'Metabolic & Endocrine',\n pt: 'Metabólico e Endócrino',\n slug: 'metabolico-endocrino',\n subcategories: ['metabolico', 'pancreas', 'hormonios', 'tireoide'],\n },\n 'nutricional-ambiental': {\n en: 'Nutrition & Environmental Exposure',\n pt: 'Nutricional e Exposição Ambiental',\n slug: 'nutricional-ambiental',\n subcategories: ['nutrientes', 'toxinas-ambientais'],\n },\n oncologico: {\n en: 'Oncology',\n pt: 'Oncológico',\n slug: 'oncologico',\n subcategories: ['marcadores-tumorais'],\n },\n 'renal-eletrolitico': {\n en: 'Renal & Electrolytes',\n pt: 'Renal e Eletrolítico',\n slug: 'renal-eletrolitico',\n subcategories: ['rins', 'urina', 'eletrolitos'],\n },\n 'saude-reprodutiva': {\n en: 'Reproductive Health',\n pt: 'Saúde Reprodutiva',\n slug: 'saude-reprodutiva',\n subcategories: ['saude-feminina', 'saude-masculina'],\n },\n};\n\nconst SUBCATEGORY_TO_GROUP = new Map<string, CategoryGroup>();\nfor (const group of Object.values(CATEGORY_GROUPS)) {\n for (const sub of group.subcategories) {\n SUBCATEGORY_TO_GROUP.set(sub, group.slug);\n }\n}\n\n/**\n * Resolve a sub-categoria (granular) para o grupo de alto nível (10 buckets).\n */\nexport function getCategoryGroup(subcategory: string): CategoryGroup | undefined {\n return SUBCATEGORY_TO_GROUP.get(subcategory);\n}\n\n/**\n * Lista todas as sub-categorias mapeadas em algum grupo.\n */\nexport function listMappedSubcategories(): readonly string[] {\n return [...SUBCATEGORY_TO_GROUP.keys()];\n}\n","/**\n * FHIR Intervention Converter\n *\n * Converts interventions (medication, supplement, diet, exercise, sleep)\n * to FHIR R4 MedicationStatement and Observation resources.\n */\n\nimport { type Addressable, entryFullUrl } from './bundle-urls';\nimport { userProfileToFHIR } from './converter';\nimport type { FHIRBundle, FHIRMedicationStatement, FHIRObservation } from './fhir-types';\nimport type { InterventionData, UserProfileData } from './types';\n\n/**\n * Determine MedicationStatement/Observation status based on end date\n */\nfunction interventionStatus(endDate?: string): 'active' | 'completed' {\n if (!endDate) return 'active';\n return new Date(endDate) < new Date() ? 'completed' : 'active';\n}\n\n/**\n * LOINC-like codes for lifestyle observation types\n */\nconst LIFESTYLE_CODES: Record<string, { code: string; display: string }> = {\n diet: { code: '81259-4', display: 'Diet' },\n exercise: { code: '73985-4', display: 'Exercise activity' },\n sleep: { code: '93832-4', display: 'Sleep duration' },\n};\n\n/**\n * Convert medication/supplement intervention to FHIR MedicationStatement\n */\nexport function interventionToFHIRMedicationStatement(\n intervention: InterventionData,\n patientId: string,\n): Addressable<FHIRMedicationStatement> {\n const statement: Addressable<FHIRMedicationStatement> = {\n category: {\n coding: [\n {\n code: 'patientspecified',\n display: 'Patient Specified',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/medication-statement-category',\n },\n ],\n },\n dateAsserted: intervention.startDate,\n effectivePeriod: {\n end: intervention.endDate,\n start: intervention.startDate,\n },\n id: `intervention-${intervention.interventionId}`,\n medicationCodeableConcept: {\n text: intervention.name,\n },\n resourceType: 'MedicationStatement',\n status: interventionStatus(intervention.endDate),\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n\n if (intervention.notes) {\n statement.note = [{ text: intervention.notes }];\n }\n\n return statement;\n}\n\n/**\n * Convert diet/exercise/sleep intervention to FHIR Observation (social-history)\n */\nexport function interventionToFHIRObservation(\n intervention: InterventionData,\n patientId: string,\n): Addressable<FHIRObservation> {\n const lifestyleCode = LIFESTYLE_CODES[intervention.type];\n\n const observation: Addressable<FHIRObservation> = {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'social-history',\n display: 'Social History',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n coding: lifestyleCode\n ? [\n {\n code: lifestyleCode.code,\n display: lifestyleCode.display,\n system: 'http://loinc.org',\n },\n ]\n : [],\n text: intervention.name,\n },\n effectivePeriod: {\n end: intervention.endDate,\n start: intervention.startDate,\n },\n id: `intervention-${intervention.interventionId}`,\n resourceType: 'Observation',\n status: 'final',\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n valueString: intervention.name,\n };\n\n if (intervention.notes) {\n observation.note = [{ text: intervention.notes }];\n }\n\n return observation;\n}\n\n/**\n * Convert all interventions to a FHIR Bundle\n */\nexport function interventionsToFHIRBundle(\n interventions: InterventionData[],\n userProfile: UserProfileData,\n): FHIRBundle {\n const patientId = userProfile.userId;\n const fhirPatient = userProfileToFHIR(userProfile);\n\n const entries = interventions.map((intervention) => {\n const isMedication = intervention.type === 'medication' || intervention.type === 'supplement';\n const resource = isMedication\n ? interventionToFHIRMedicationStatement(intervention, patientId)\n : interventionToFHIRObservation(intervention, patientId);\n\n return { fullUrl: entryFullUrl(resource), resource };\n });\n\n return {\n entry: [{ fullUrl: entryFullUrl(fhirPatient), resource: fhirPatient }, ...entries],\n resourceType: 'Bundle',\n type: 'collection',\n };\n}\n","/**\n * Structured zone data for DEXA body composition and bone density charts.\n *\n * Body fat zones derived from Gallagher et al. Am J Clin Nutr 2000;72:694-701 (PMID: 10966886)\n * and ACSM Guidelines for Exercise Testing, 11th Ed (2021).\n *\n * T-Score zones from WHO criteria (Kanis JA, Osteoporos Int, PMID: 7696835).\n */\n\nexport interface BodyFatZone {\n ageMax: number;\n ageMin: number;\n color: string;\n fatPctMax: number;\n fatPctMin: number;\n label: string;\n sex: 'F' | 'M';\n}\n\ninterface AgeBracket {\n ageMax: number;\n ageMin: number;\n label: string;\n}\n\nconst AGE_BRACKETS: AgeBracket[] = [\n { ageMax: 25, ageMin: 18, label: '18-25' },\n { ageMax: 35, ageMin: 26, label: '26-35' },\n { ageMax: 45, ageMin: 36, label: '36-45' },\n { ageMax: 55, ageMin: 46, label: '46-55' },\n { ageMax: 99, ageMin: 56, label: '56+' },\n];\n\n// Zone boundaries per age bracket for men: [essential, athletic, fitness, average, obese]\n// Each value is the upper bound of the zone\nconst MALE_ZONES: number[][] = [\n [5, 10, 20, 25, 40],\n [5, 11, 21, 26, 40],\n [5, 12, 22, 27, 40],\n [5, 13, 23, 28, 40],\n [5, 14, 24, 29, 40],\n];\n\nconst FEMALE_ZONES: number[][] = [\n [13, 18, 28, 32, 45],\n [13, 18, 29, 33, 45],\n [13, 19, 30, 34, 45],\n [13, 20, 31, 35, 45],\n [13, 20, 32, 36, 45],\n];\n\ninterface ZoneDefinition {\n color: string;\n label: string;\n}\n\nconst ZONE_DEFS: ZoneDefinition[] = [\n { color: '#3b82f6', label: 'Essencial' },\n { color: '#06b6d4', label: 'Atlético' },\n { color: '#22c55e', label: 'Fitness' },\n { color: '#eab308', label: 'Média' },\n { color: '#ef4444', label: 'Obeso' },\n];\n\nfunction buildZones(sex: 'F' | 'M', zoneData: number[][]): BodyFatZone[] {\n const zones: BodyFatZone[] = [];\n for (let i = 0; i < AGE_BRACKETS.length; i++) {\n const bracket = AGE_BRACKETS[i]!;\n const b = zoneData[i]!;\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[0]!.color,\n fatPctMax: b[0]!,\n fatPctMin: 0,\n label: ZONE_DEFS[0]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[1]!.color,\n fatPctMax: b[1]!,\n fatPctMin: b[0]!,\n label: ZONE_DEFS[1]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[2]!.color,\n fatPctMax: b[2]!,\n fatPctMin: b[1]!,\n label: ZONE_DEFS[2]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[3]!.color,\n fatPctMax: b[3]!,\n fatPctMin: b[2]!,\n label: ZONE_DEFS[3]!.label,\n sex,\n });\n zones.push({\n ...bracket,\n color: ZONE_DEFS[4]!.color,\n fatPctMax: b[4]!,\n fatPctMin: b[3]!,\n label: ZONE_DEFS[4]!.label,\n sex,\n });\n }\n return zones;\n}\n\nexport const BODY_FAT_ZONES: BodyFatZone[] = [\n ...buildZones('M', MALE_ZONES),\n ...buildZones('F', FEMALE_ZONES),\n];\n\nexport { AGE_BRACKETS, ZONE_DEFS };\n\nexport interface TScoreZone {\n color: string;\n label: string;\n max: number;\n min: number;\n}\n\nexport const T_SCORE_ZONES: TScoreZone[] = [\n { color: '#22c55e', label: 'Normal', max: 4, min: -1.0 },\n { color: '#eab308', label: 'Osteopenia', max: -1.0, min: -2.5 },\n { color: '#ef4444', label: 'Osteoporose', max: -2.5, min: -5 },\n];\n","/**\n * Screening Intervals Configuration\n *\n * Defines recommended screening intervals for different biomarker categories\n * based on clinical guidelines and best practices.\n */\n\n/**\n * Screening interval in months\n */\nexport type ScreeningIntervalMonths = 3 | 6 | 12;\n\n/**\n * Biomarker category with its recommended screening interval\n */\nexport interface CategoryScreeningInterval {\n category: string;\n intervalMonths: ScreeningIntervalMonths;\n nameEn: string;\n namePt: string;\n}\n\n/**\n * Screening interval configuration for each category\n *\n * Categories are grouped by their recommended screening intervals:\n * - 3 months: Body composition and bone density (frequently changing metrics)\n * - 6 months: Metabolic panel and nutrients (moderate change rate)\n * - 12 months: Standard blood panels (stable long-term markers)\n */\nexport const CATEGORY_SCREENING_INTERVALS: CategoryScreeningInterval[] = [\n // 3-month intervals - Body composition (frequently changing)\n {\n category: 'composicao-corporal',\n intervalMonths: 3,\n nameEn: 'Body Composition',\n namePt: 'Composição Corporal',\n },\n {\n category: 'densidade-ossea',\n intervalMonths: 3,\n nameEn: 'Bone Density',\n namePt: 'Densidade Óssea',\n },\n\n // 6-month intervals - Metabolic and nutrients\n {\n category: 'metabolico',\n intervalMonths: 6,\n nameEn: 'Metabolic Panel',\n namePt: 'Painel Metabólico',\n },\n {\n category: 'nutrientes',\n intervalMonths: 6,\n nameEn: 'Nutrients',\n namePt: 'Nutrientes',\n },\n {\n category: 'pancreas',\n intervalMonths: 6,\n nameEn: 'Pancreas',\n namePt: 'Pâncreas',\n },\n\n // 12-month intervals - Standard blood panels\n {\n category: 'coracao',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Heart Health',\n namePt: 'Saúde Cardiovascular',\n },\n {\n category: 'tireoide',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Thyroid',\n namePt: 'Tireoide',\n },\n {\n category: 'sangue',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Blood Count',\n namePt: 'Hemograma',\n },\n {\n category: 'figado',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Liver Function',\n namePt: 'Função Hepática',\n },\n {\n category: 'rins',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Kidney Function',\n namePt: 'Função Renal',\n },\n {\n category: 'saude-feminina',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: \"Women's Health\",\n namePt: 'Saúde Feminina',\n },\n {\n category: 'saude-masculina',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: \"Men's Health\",\n namePt: 'Saúde Masculina',\n },\n {\n category: 'eletrolitos',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Electrolytes',\n namePt: 'Eletrólitos',\n },\n {\n category: 'estresse-envelhecimento',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Stress & Aging',\n namePt: 'Estresse e Envelhecimento',\n },\n {\n category: 'autoimunidade',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Autoimmunity',\n namePt: 'Autoimunidade',\n },\n {\n category: 'regulacao-imunologica',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Immune Regulation',\n namePt: 'Regulação Imunológica',\n },\n {\n category: 'toxinas-ambientais',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Environmental Toxins',\n namePt: 'Toxinas Ambientais',\n },\n {\n category: 'urina',\n intervalMonths: 12,\n nameEn: 'Urinalysis',\n namePt: 'Urina',\n },\n];\n\n/**\n * Get screening interval for a category\n */\nexport const getScreeningInterval = (category: string): CategoryScreeningInterval | undefined => {\n return CATEGORY_SCREENING_INTERVALS.find((c) => c.category === category);\n};\n\n/**\n * Get all categories with a specific interval\n */\nexport const getCategoriesByInterval = (\n intervalMonths: ScreeningIntervalMonths,\n): CategoryScreeningInterval[] => {\n return CATEGORY_SCREENING_INTERVALS.filter((c) => c.intervalMonths === intervalMonths);\n};\n\n/**\n * Calculate next screening date based on last test date and category\n */\nexport const calculateNextScreeningDate = (lastTestDate: Date, category: string): Date | null => {\n const interval = getScreeningInterval(category);\n if (!interval) return null;\n\n const nextDate = new Date(lastTestDate);\n nextDate.setMonth(nextDate.getMonth() + interval.intervalMonths);\n return nextDate;\n};\n\n/**\n * Check if a category is due for screening\n */\nexport const isScreeningDue = (\n lastTestDate: Date,\n category: string,\n referenceDate: Date = new Date(),\n): boolean => {\n const nextDate = calculateNextScreeningDate(lastTestDate, category);\n if (!nextDate) return false;\n return referenceDate >= nextDate;\n};\n\n/**\n * Get categories that are due for screening based on last test dates\n */\nexport const getDueCategories = (\n lastTestDates: Record<string, Date>,\n referenceDate: Date = new Date(),\n): CategoryScreeningInterval[] => {\n return CATEGORY_SCREENING_INTERVALS.filter((interval) => {\n const lastDate = lastTestDates[interval.category];\n if (!lastDate) return true; // Never tested = due\n return isScreeningDue(lastDate, interval.category, referenceDate);\n });\n};\n\n/**\n * Get days until next screening for a category\n */\nexport const getDaysUntilScreening = (\n lastTestDate: Date,\n category: string,\n referenceDate: Date = new Date(),\n): number | null => {\n const nextDate = calculateNextScreeningDate(lastTestDate, category);\n if (!nextDate) return null;\n\n const diffTime = nextDate.getTime() - referenceDate.getTime();\n return Math.ceil(diffTime / (1000 * 60 * 60 * 24));\n};\n","/**\n * Portuguese pluralization utility using native Intl.PluralRules\n * Provides automatic pluralization for common words used in the app\n */\n\nconst pluralRules = new Intl.PluralRules('pt-BR');\n\n/**\n * Dictionary of Portuguese words with their plural forms\n * Key is the singular form, value is the plural form\n */\nconst dictionary: Record<string, string> = {\n // Common nouns\n arquivo: 'arquivos',\n biomarcador: 'biomarcadores',\n // Past participles (masculine)\n cadastrado: 'cadastrados',\n // Past participles (feminine)\n concluída: 'concluídas',\n confirmado: 'confirmados',\n convertido: 'convertidos',\n convidado: 'convidados',\n convite: 'convites',\n disponível: 'disponíveis',\n documento: 'documentos',\n enviado: 'enviados',\n exame: 'exames',\n excluída: 'excluídas',\n\n excluído: 'excluídos',\n // Verbs (3rd person)\n falhou: 'falharam',\n falta: 'faltam',\n ignorado: 'ignorados',\n item: 'itens',\n outro: 'outros',\n página: 'páginas',\n pendente: 'pendentes',\n registro: 'registros',\n removido: 'removidos',\n\n resultado: 'resultados',\n revisão: 'revisões',\n\n revogado: 'revogados',\n usuário: 'usuários',\n};\n\n/**\n * Get the plural form of a word from the dictionary\n * Falls back to adding 's' if word is not in dictionary\n */\nconst getPluralForm = (singular: string): string => {\n return dictionary[singular] ?? `${singular}s`;\n};\n\n/**\n * Returns the correct singular or plural form based on count\n * Uses Intl.PluralRules for proper locale-aware pluralization\n *\n * @example\n * plural(1, 'usuário') // 'usuário'\n * plural(3, 'usuário') // 'usuários'\n * plural(0, 'registro') // 'registros'\n */\nexport const plural = (count: number, word: string): string => {\n const rule = pluralRules.select(count);\n return rule === 'one' ? word : getPluralForm(word);\n};\n\n/**\n * Returns count with the correct singular or plural form\n *\n * @example\n * pluralCount(1, 'usuário') // '1 usuário'\n * pluralCount(3, 'usuário') // '3 usuários'\n */\nexport const pluralCount = (count: number, word: string): string => {\n return `${count} ${plural(count, word)}`;\n};\n\n/**\n * Returns the correct form for compound phrases (noun + adjective)\n * Both words are pluralized together\n *\n * @example\n * pluralPhrase(1, 'usuário', 'cadastrado') // 'usuário cadastrado'\n * pluralPhrase(3, 'usuário', 'cadastrado') // 'usuários cadastrados'\n * pluralPhrase(2, 'revisão', 'excluída') // 'revisões excluídas'\n */\nexport const pluralPhrase = (count: number, noun: string, adjective: string): string => {\n const rule = pluralRules.select(count);\n if (rule === 'one') {\n return `${noun} ${adjective}`;\n }\n return `${getPluralForm(noun)} ${getPluralForm(adjective)}`;\n};\n\n/**\n * Returns count with the correct compound phrase form\n *\n * @example\n * pluralPhraseCount(1, 'usuário', 'cadastrado') // '1 usuário cadastrado'\n * pluralPhraseCount(3, 'convite', 'enviado') // '3 convites enviados'\n */\nexport const pluralPhraseCount = (count: number, noun: string, adjective: string): string => {\n return `${count} ${pluralPhrase(count, noun, adjective)}`;\n};\n","/**\n * Helpers para identificadores brasileiros — CPF e CNS\n *\n * Validação, formatação e conversão para FHIR Identifier.\n * Algoritmos de validação baseados nas especificações oficiais:\n * - CPF: Receita Federal (mod-11, dois dígitos verificadores)\n * - CNS: Ministério da Saúde (mod-11 para definitivos, soma ponderada para provisórios)\n */\n\nimport type { FHIRIdentifier } from './fhir-types';\n\nconst CPF_SYSTEM = 'http://rnds.saude.gov.br/fhir/r4/NamingSystem/cpf';\nconst CNS_SYSTEM = 'http://rnds.saude.gov.br/fhir/r4/NamingSystem/cns';\n\n/**\n * Remove caracteres não-numéricos de uma string.\n */\nfunction digitsOnly(value: string): string {\n return value.replace(/\\D/g, '');\n}\n\n/**\n * Valida um CPF brasileiro usando algoritmo mod-11.\n *\n * @param cpf — CPF com ou sem formatação (ex: \"123.456.789-09\" ou \"12345678909\")\n * @returns true se o CPF é estruturalmente válido\n */\nexport function validateCPF(cpf: string): boolean {\n const digits = digitsOnly(cpf);\n\n if (digits.length !== 11) return false;\n\n // Rejeitar sequências de dígitos iguais (ex: 111.111.111-11)\n if (/^(\\d)\\1{10}$/.test(digits)) return false;\n\n // Primeiro dígito verificador\n let sum = 0;\n for (let i = 0; i < 9; i++) {\n sum += Number(digits[i]) * (10 - i);\n }\n let remainder = (sum * 10) % 11;\n if (remainder === 10) remainder = 0;\n if (remainder !== Number(digits[9])) return false;\n\n // Segundo dígito verificador\n sum = 0;\n for (let i = 0; i < 10; i++) {\n sum += Number(digits[i]) * (11 - i);\n }\n remainder = (sum * 10) % 11;\n if (remainder === 10) remainder = 0;\n if (remainder !== Number(digits[10])) return false;\n\n return true;\n}\n\n/**\n * Valida um CNS (Cartão Nacional de Saúde) brasileiro.\n *\n * CNS definitivos começam com 1 ou 2 (mod-11).\n * CNS provisórios começam com 7, 8 ou 9 (soma ponderada mod-11 = 0).\n *\n * @param cns — CNS com 15 dígitos\n * @returns true se o CNS é estruturalmente válido\n */\nexport function validateCNS(cns: string): boolean {\n const digits = digitsOnly(cns);\n\n if (digits.length !== 15) return false;\n\n const firstDigit = digits[0]!;\n\n // CNS deve começar com 1, 2 (definitivo) ou 7, 8, 9 (provisório)\n if (!['1', '2', '7', '8', '9'].includes(firstDigit)) return false;\n\n // Ambos os tipos usam soma ponderada mod-11 = 0\n let sum = 0;\n for (let i = 0; i < 15; i++) {\n sum += Number(digits[i]) * (15 - i);\n }\n return sum % 11 === 0;\n}\n\n/**\n * Formata um CPF como XXX.XXX.XXX-XX.\n *\n * @param cpf — CPF com 11 dígitos (com ou sem formatação)\n * @returns CPF formatado ou a string original se inválido\n */\nexport function formatCPF(cpf: string): string {\n const digits = digitsOnly(cpf);\n if (digits.length !== 11) return cpf;\n return `${digits.slice(0, 3)}.${digits.slice(3, 6)}.${digits.slice(6, 9)}-${digits.slice(9)}`;\n}\n\n/**\n * Formata um CNS como XXX XXXX XXXX XXXX.\n *\n * @param cns — CNS com 15 dígitos\n * @returns CNS formatado ou a string original se inválido\n */\nexport function formatCNS(cns: string): string {\n const digits = digitsOnly(cns);\n if (digits.length !== 15) return cns;\n return `${digits.slice(0, 3)} ${digits.slice(3, 7)} ${digits.slice(7, 11)} ${digits.slice(11)}`;\n}\n\n/**\n * Converte um CPF para um FHIR Identifier.\n *\n * @param cpf — CPF com 11 dígitos (com ou sem formatação)\n * @returns FHIR Identifier com sistema RNDS para CPF\n * @throws Error se o CPF for inválido\n */\nexport function cpfToFHIRIdentifier(cpf: string): FHIRIdentifier {\n if (!validateCPF(cpf)) {\n throw new Error('CPF inválido');\n }\n return {\n system: CPF_SYSTEM,\n use: 'official',\n value: digitsOnly(cpf),\n };\n}\n\n/**\n * Converte um CNS para um FHIR Identifier.\n *\n * @param cns — CNS com 15 dígitos\n * @returns FHIR Identifier com sistema RNDS para CNS\n * @throws Error se o CNS for inválido\n */\nexport function cnsToFHIRIdentifier(cns: string): FHIRIdentifier {\n if (!validateCNS(cns)) {\n throw new Error('CNS inválido');\n }\n return {\n system: CNS_SYSTEM,\n use: 'official',\n value: digitsOnly(cns),\n };\n}\n","/**\n * URLs das extensões do IG do fhir-brasil.\n *\n * Quem emite a extensão e quem a lê precisam concordar literalmente na URL: um\n * consumidor procura a extensão pelo `url`, e uma grafia divergente faz o dado\n * sumir sem erro. O teste confere cada uma contra o `Id:` do FSH em\n * `ig/input/fsh/extensions/`, então extensão nova no IG sem constante aqui, ou\n * o inverso, reprova.\n */\n\n/** Canonical do IG, como está no `sushi-config.yaml`. */\nexport const IG_CANONICAL = 'https://fhir-brasil.dev.br/ig';\n\nconst structureDefinition = (id: string): string => `${IG_CANONICAL}/StructureDefinition/${id}`;\n\n/**\n * Extensões do IG, pela URL.\n *\n * As que têm partes (`extractionSource`, `extractionConfidence`, `asPrinted`)\n * levam as partes em `extension[]` aninhado, cada uma com `url` relativo: o\n * nome da parte, como `page` ou `reading`. Ver o FSH de cada uma.\n */\nexport const FHIR_BRASIL_EXTENSIONS = {\n /** `Observation`: valor e faixa como impressos, quando a Observation traz outros. */\n asPrinted: structureDefinition('as-printed'),\n /** `Observation`: extraída de PDF via OCR. */\n derivedFromOCR: structureDefinition('derived-from-ocr'),\n /** `Observation`: confiança na leitura e na interpretação, de 0 a 1. */\n extractionConfidence: structureDefinition('extraction-confidence'),\n /** `Observation`: páginas, trecho citado e caixa do trecho no documento. */\n extractionSource: structureDefinition('extraction-source'),\n /** `DiagnosticReport`: lido da tabela de histórico de outro laudo. */\n reprintedIn: structureDefinition('reprinted-in'),\n /** `Observation`: lido do documento, mas substituído por outro valor do mesmo laudo. */\n superseded: structureDefinition('superseded'),\n /** `Observation`: unidade impressa ao lado de um resultado em texto. */\n textValueUnit: structureDefinition('text-value-unit'),\n} as const;\n","/**\n * Código do tipo de amostra a partir do material impresso no laudo.\n *\n * O perfil `BRAmostraBiologica-1.0` da RNDS vincula `Specimen.type` ao ValueSet\n * `BRTipoAmostra-1.0` com força `required`, exige `type.coding` (1..1) e proíbe\n * `type.text` (0..0). Um `Specimen` só com o texto do laudo não passa, e é o que\n * a extração produzia.\n *\n * O ValueSet tem 63 códigos, e quase todos são de vigilância respiratória vindos\n * do GAL: swab nasofaríngeo, lavado brônquico, fragmento de órgão. Para laudo de\n * rotina sobram seis, e esses seis cobrem o que um painel de sangue e urina\n * imprime.\n *\n * Não há código para fezes no ValueSet. Isso não afeta a extração, cujo catálogo\n * não tem nenhum biomarcador de origem fecal: um parasitológico não vira\n * `Observation`, então não chega a pedir `Specimen`.\n *\n * @see https://rnds-fhir.saude.gov.br/StructureDefinition-BRAmostraBiologica-1.0.html\n * @see https://rnds-fhir.saude.gov.br/ValueSet-BRTipoAmostra-1.0.html\n */\nimport type { FHIRCoding } from './fhir-types';\n\n/** ValueSet ao qual `Specimen.type` está vinculado no `BRAmostraBiologica`. */\nexport const BR_TIPO_AMOSTRA_VALUESET = 'https://rnds-fhir.saude.gov.br/ValueSet/BRTipoAmostra-1.0';\n\n/**\n * CodeSystem dos códigos que este módulo emite.\n *\n * O ValueSet também inclui o `BRTipoAmostraGAL`, que traz \"Sangue\" e \"Sangue com\n * EDTA\" soltos. Ficaram de fora porque a URL canônica daquele CodeSystem não foi\n * confirmada na fonte, e código de terminologia não se deduz de slug. Material\n * assim cai no caminho de não mapeado até alguém abrir o IG e confirmar.\n */\nexport const HL7_SPECIMEN_TYPE_SYSTEM = 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v2-0487';\n\n/**\n * Os `display` são cópia literal do ValueSet, com a caixa dele.\n *\n * A chave é o texto já normalizado, e por enquanto é só o próprio display. Não\n * há sinônimo inventado aqui: a extração copia o material verbatim do laudo, e a\n * lista de variações que os laboratórios de fato imprimem ainda não foi medida\n * (a captura de material entrou em produção em 05/09/2026). Variação real\n * observada entra depois, com o laudo que a produziu.\n */\nconst CODINGS: ReadonlyArray<{ code: string; display: string }> = [\n { code: 'SER', display: 'Soro' },\n { code: 'PLAS', display: 'Plasma' },\n { code: 'WB', display: 'Sangue Total' },\n { code: 'UR', display: 'Urina' },\n { code: 'CSF', display: 'Líquor' },\n { code: 'SAL', display: 'Saliva' },\n];\n\n/**\n * Caixa, acento e espaço sobrando não distinguem material.\n *\n * Só isso. Não separa `camelCase` nem troca barra por espaço, ao contrário do\n * normalizador de nomes de biomarcador: \"Soro/Plasma\" impresso numa linha só é\n * ambíguo de verdade, e escolher um dos dois seria inferência. Sem casar, ele\n * segue o caminho do não mapeado.\n *\n * Os caracteres invisíveis saem antes, e a divisão entre as duas regras é a do\n * próprio Unicode: `\\p{Cf}` são os de formatação, que não ocupam espaço e por\n * isso são apagados, e `\\s` são os de espaço, que são colapsados. A camada de\n * texto de PDF emite os dois tipos, e um U+200B no meio de \"Soro\" derruba o\n * casamento sem deixar rastro na tela.\n *\n * Vale a categoria em vez da lista porque a lista nunca fecha. Enumerando, o\n * hífen opcional (U+00AD) tinha ficado de fora, e ele aparece justamente onde\n * um nome composto como \"Sangue Total\" quebra de linha.\n */\nconst INVISIBLE = /\\p{Cf}/gu;\n\nconst normalize = (text: string): string =>\n text\n .replace(INVISIBLE, '')\n .normalize('NFD')\n .replace(/[\\u0300-\\u036f]/g, '')\n .toLowerCase()\n .replace(/\\s+/g, ' ')\n .trim();\n\nconst BY_NORMALIZED_TEXT = new Map(\n CODINGS.map(({ code, display }) => [\n normalize(display),\n { code, display, system: HL7_SPECIMEN_TYPE_SYSTEM } satisfies FHIRCoding,\n ]),\n);\n\n/**\n * Coding do ValueSet para o material impresso, ou `undefined` sem casar.\n *\n * `undefined` é resposta legítima e não erro: o laudo pode trazer um material\n * fora do ValueSet, ou uma grafia que ninguém viu ainda. Quem chama decide o que\n * fazer, e a decisão que não existe é preencher com um código aproximado.\n */\nexport const specimenTypeCoding = (text: string): FHIRCoding | undefined =>\n BY_NORMALIZED_TEXT.get(normalize(text));\n","/**\n * Registro de decisão de cada mapeamento LOINC do catálogo.\n *\n * O catálogo em `biomarkers.ts` guarda a conclusão (o código). Este arquivo\n * guarda por que aquele código e não outro: o que o laudo mostrou, o que\n * decidiu, os irmãos descartados e quem revisou. É o diff que uma revisão de\n * mapeamento lê.\n *\n * A maioria das entradas é `nameOnly`: o código foi escolhido pelo nome do\n * exame, sem registro de unidade, método, material ou bula, e ninguém revisou\n * de fora. É o registro honesto do que existe, e não justificativa inventada.\n * As entradas com evidência vieram dos comentários em `biomarkers.ts` que já\n * documentavam a troca. `reviewer` fica vazio até uma revisão independente.\n *\n * `loinc` repete o código do catálogo de propósito: trocar o código em\n * `biomarkers.ts` sem tocar aqui falha em `mapping-decisions.test.ts`, e a\n * troca chega à revisão com o registro ao lado.\n *\n * Sem import em runtime: o `scripts/verify-loinc.ts` lê este arquivo direto com\n * o type stripping do Node, que não resolve import sem extensão. A ficha que\n * junta registro, catálogo e eixos fica em `mapping-sheet.ts`.\n */\n/** O que o laudo mostrou e pesou na escolha do código. */\nexport type MappingEvidence = 'assay-insert' | 'method-line' | 'name' | 'specimen' | 'unit';\n\nexport interface RejectedSibling {\n loinc: string;\n reason: string;\n}\n\nexport interface MappingDecision {\n evidence: MappingEvidence[];\n /** O código escolhido. Tem que ser o `loinc` do biomarcador no catálogo. */\n loinc: string;\n /** Versão do LOINC em que a revisão conferiu o código. */\n loincVersion?: string;\n note?: string;\n reviewedAt?: string;\n reviewer?: string;\n /** Qual evidência decidiu. Está sempre em `evidence`. */\n settledBy: MappingEvidence;\n siblingsRejected: RejectedSibling[];\n}\n\n/**\n * Por que uma entrada não tem LOINC.\n *\n * - `no-concept`: procurado, e o LOINC não tem o conceito.\n * - `ambiguous`: há candidatos, e nenhum é a mesma grandeza.\n * - `pending-review`: ninguém registrou a busca.\n * - `not-lab`: fora do escopo de exame laboratorial.\n */\nexport type NoLoincReason = 'ambiguous' | 'no-concept' | 'not-lab' | 'pending-review';\n\nexport interface NoLoincDecision {\n note: string;\n reason: NoLoincReason;\n}\n\n/** Escolhido pelo nome, sem outra evidência registrada nem revisão. */\nfunction nameOnly(loinc: string): MappingDecision {\n return { evidence: ['name'], loinc, settledBy: 'name', siblingsRejected: [] };\n}\n\nexport const MAPPING_DECISIONS: Record<string, MappingDecision> = {\n AA_EPA_Ratio: nameOnly('90909-3'),\n ABO_Group: nameOnly('883-9'),\n Adiponectin: nameOnly('47828-9'),\n AFP: nameOnly('1834-1'),\n Albumin: nameOnly('1751-7'),\n Albumin_Creatinine_Ratio: nameOnly('9318-7'),\n Albumin_Globulin_Ratio: nameOnly('1759-0'),\n AlkalinePhosphatase: nameOnly('6768-6'),\n ALT: nameOnly('1742-6'),\n AMH: nameOnly('38476-8'),\n Amylase: nameOnly('1798-8'),\n ANA_Screen: nameOnly('8061-4'),\n AntiThyroglobulin: nameOnly('8098-6'),\n AntiTPO: nameOnly('8099-4'),\n ApoA1: nameOnly('1869-7'),\n ApoB: nameOnly('1884-6'),\n APOE_Genotype: nameOnly('21619-2'),\n Appearance_Urine: nameOnly('5767-9'),\n AST: nameOnly('1920-8'),\n Bacteria_Urine: {\n loinc: '5769-5',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '630-4',\n reason:\n 'urocultura, que identifica a espécie (nominal), e não a contagem do sedimento em /HPF',\n },\n ],\n },\n Basophils: nameOnly('706-2'),\n Basophils_Abs: nameOnly('704-7'),\n BetaHCG: nameOnly('19080-1'),\n BetaHydroxybutyrate: {\n loinc: '6873-4',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '53060-0',\n reason: 'butirilcarnitina (C4) em líquido amniótico: analito e material errados',\n },\n ],\n },\n Bilirubin_Urine: nameOnly('5770-3'),\n BilirubinDirect: nameOnly('1968-7'),\n BilirubinIndirect: nameOnly('1971-1'),\n BilirubinTotal: nameOnly('1975-2'),\n Blood_Urine: nameOnly('5794-3'),\n BMI: nameOnly('39156-5'),\n BNP: nameOnly('30934-4'),\n BodyFatPct: nameOnly('41982-0'),\n BodyWaterPct: nameOnly('101684-9'),\n BUN: {\n loinc: '3094-0',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'name',\n note: 'criado em out/2026 para o BUN dos laudos americanos (Quest imprime \"UREA NITROGEN (BUN)\" em mg/dL); a ureia dos laudos brasileiros segue em Urea',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '3091-6',\n reason:\n 'ureia: outro componente (a molécula inteira, não só o nitrogênio), valor cerca de 2,14 vezes maior que o BUN',\n },\n ],\n },\n BUN_Creatinine_Ratio: nameOnly('3097-3'),\n C3: nameOnly('4485-9'),\n C4: nameOnly('4498-2'),\n CA125: nameOnly('10334-1'),\n CA153: nameOnly('6875-9'),\n CA199: nameOnly('24108-3'),\n Calcium: nameOnly('17861-6'),\n CalfCircumference: nameOnly('107112-5'),\n CEA: nameOnly('2039-6'),\n Chloride: nameOnly('2075-0'),\n Cholesterol: nameOnly('2093-3'),\n Cholesterol_HDL_Ratio: nameOnly('9830-1'),\n CK: nameOnly('2157-6'),\n CO2: nameOnly('2028-9'),\n Color_Urine: nameOnly('5778-6'),\n Cortisol: nameOnly('2143-6'),\n Creatinine: nameOnly('2160-0'),\n Creatinine_Urine: nameOnly('2161-8'),\n CRP: nameOnly('1988-5'),\n CystatinC: nameOnly('33863-2'),\n DDimer: {\n loinc: '48065-7',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '48066-5',\n reason: 'DDU, que vale cerca de metade do FEU que a faixa do catálogo pressupõe',\n },\n ],\n note: 'Laudo que imprime só \"ng/mL\" não diz a convenção; o FEU é o que a faixa pressupõe.',\n },\n DHEAS: nameOnly('2191-5'),\n DHT: nameOnly('1848-1'),\n eAG: nameOnly('27353-2'),\n eGFR: nameOnly('98979-8'),\n Eosinophils: nameOnly('713-8'),\n Eosinophils_Abs: nameOnly('711-2'),\n EPADPADHA: {\n loinc: '90911-9',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '90908-5',\n reason:\n 'interpretação ordinal do mesmo valor (risco alto, moderado, baixo), e não o número',\n },\n ],\n },\n ESR: nameOnly('30341-2'),\n Estradiol: nameOnly('2243-4'),\n FatMass: nameOnly('73708-0'),\n Ferritin: nameOnly('2276-4'),\n Fibrinogen: nameOnly('3255-7'),\n Folate: nameOnly('2284-8'),\n FSH: nameOnly('15067-2'),\n GGT: nameOnly('2324-2'),\n Gliadin_Deamidated_IgA: nameOnly('63453-5'),\n Gliadin_Deamidated_IgG: nameOnly('63459-2'),\n Globulin: nameOnly('2336-6'),\n Glucose: {\n loinc: '2345-7',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '1558-6',\n reason: 'afirma jejum (Glucose^post CFst), e a grafia \"Glicose\" não declara jejum',\n },\n ],\n },\n Glucose_Fasting: {\n loinc: '1558-6',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [{ loinc: '2345-7', reason: 'não afirma jejum, e a grafia declara' }],\n },\n Glucose_Urine: nameOnly('5792-7'),\n HbA1c: nameOnly('4548-4'),\n Hct: nameOnly('4544-3'),\n HDL: nameOnly('2085-9'),\n HDL_Large: nameOnly('43729-3'),\n Hgb: nameOnly('718-7'),\n HOMA_IR: nameOnly('47214-2'),\n Homocysteine: nameOnly('13965-9'),\n HyalineCasts_Urine: nameOnly('5796-8'),\n IgA: nameOnly('2458-8'),\n IgE_E1_CatDander: nameOnly('6833-8'),\n IgE_GX1_Grasses: nameOnly('30189-5'),\n IgE_Total: nameOnly('19113-0'),\n IgG: nameOnly('2465-3'),\n IgM: nameOnly('2472-9'),\n INR: nameOnly('6301-6'),\n Insulin: nameOnly('20448-7'),\n Iron: nameOnly('2498-4'),\n Ketones_Urine: nameOnly('5797-6'),\n LDH: nameOnly('14804-9'),\n LDL: {\n loinc: '2089-1',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Código sem método. A linha de método do laudo escolhe a variante (13457-7, 18262-6, 96259-7).',\n },\n LDL_Medium: nameOnly('96735-6'),\n LDL_ParticleNumber: nameOnly('54434-6'),\n LDL_Pattern: nameOnly('35505-7'),\n LDL_Peak_Size: nameOnly('17782-4'),\n LDL_Small: nameOnly('43727-7'),\n Lead: nameOnly('77307-7'),\n Leptin: nameOnly('21365-2'),\n LeukocyteEsterase_Urine: nameOnly('5799-2'),\n Leukocytes_Urine: nameOnly('5821-4'),\n LH: nameOnly('10501-5'),\n Lipase: nameOnly('3040-3'),\n Lipoprotein_a: {\n loinc: '43583-4',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '10835-7',\n reason:\n 'massa/volume (mg/dL), incompatível com o nmol/L declarado; a SBC 2025 recomenda ensaio independente de isoforma em nmol/L',\n },\n ],\n },\n Lymphocytes: nameOnly('736-9'),\n Lymphocytes_Abs: nameOnly('731-0'),\n Magnesium: nameOnly('19123-9'),\n Magnesium_RBC: nameOnly('26746-8'),\n MCH: nameOnly('785-6'),\n MCHC: nameOnly('786-4'),\n MCV: nameOnly('787-2'),\n Mercury: nameOnly('5685-3'),\n Microalbumin_Urine: nameOnly('14957-5'),\n MMA: nameOnly('13964-2'),\n Monocytes: nameOnly('5905-5'),\n Monocytes_Abs: nameOnly('742-7'),\n MPV: nameOnly('32623-1'),\n MuscleMass: nameOnly('73964-9'),\n Neutrophils: nameOnly('770-8'),\n Neutrophils_Abs: nameOnly('751-8'),\n Nitrite_Urine: nameOnly('5802-4'),\n NonHDL_Cholesterol: nameOnly('43396-1'),\n NTproBNP: nameOnly('33762-6'),\n Omega3_DHA: {\n loinc: '90914-3',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega3_DPA: {\n loinc: '90913-5',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega3_EPA: {\n loinc: '90912-7',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega3_Total: {\n loinc: '99620-7',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Moles/volume em RBC.lysate, e o laudo imprime %: não há código de fração para o total.',\n },\n Omega6_AA: {\n loinc: '90916-8',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega6_LA: {\n loinc: '90917-6',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Fração do total de ácidos graxos (painel 90918-4), que é o % impresso.',\n },\n Omega6_Omega3_Ratio: nameOnly('90910-1'),\n Omega6_Total: {\n loinc: '99621-5',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '35177-5',\n reason:\n 'ácidos graxos poli-insaturados totais, ômega-3 e ômega-6 somados: outro componente',\n },\n ],\n note: 'Moles/volume em RBC.lysate, e o laudo imprime %: não há código de fração para o total.',\n },\n pH_Urine: nameOnly('5803-2'),\n PhaseAngle: {\n loinc: '107160-4',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Único código de ângulo de fase; declara razão e o aparelho imprime graus.',\n },\n Platelets: nameOnly('777-3'),\n Potassium: nameOnly('2823-3'),\n Progesterone: nameOnly('2839-9'),\n Prolactin: nameOnly('2842-3'),\n Protein_Urine: nameOnly('5804-0'),\n ProthrombinTime: nameOnly('5902-2'),\n PSA: nameOnly('2857-1'),\n PSA_Free: nameOnly('10886-0'),\n PSA_FreeRatio: nameOnly('12841-3'),\n PTH: nameOnly('2731-8'),\n RBC: nameOnly('789-8'),\n RBC_Urine: {\n loinc: '13945-1',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [\n { loinc: '5808-1', reason: 'o mesmo exame em #/volume (por mL), e o laudo imprime /HPF' },\n ],\n },\n RDW: nameOnly('788-0'),\n Reticulocytes: nameOnly('4679-7'),\n Rh_Type: nameOnly('10331-7'),\n RheumatoidFactor: nameOnly('11572-5'),\n Selenium: nameOnly('5724-0'),\n SHBG: nameOnly('13967-5'),\n SkinfoldAbdominal: nameOnly('8355-0'),\n SkinfoldThigh: nameOnly('8353-5'),\n SkinfoldTriceps: nameOnly('8354-3'),\n Sodium: nameOnly('2951-2'),\n SpecificGravity_Urine: nameOnly('5811-5'),\n SquamousEpithelial_Urine: nameOnly('11277-1'),\n T3Free: nameOnly('3051-0'),\n T4Free: nameOnly('3024-7'),\n T4Total: nameOnly('3026-2'),\n Testosterone: nameOnly('2986-8'),\n TestosteroneFree: nameOnly('2991-8'),\n Thyroglobulin: nameOnly('3013-0'),\n TIBC: nameOnly('2500-7'),\n TotalBodyWater: {\n loinc: '101683-1',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: 'Único código de água corporal total; é massa (kg) e o aparelho imprime litros, o mesmo número para água.',\n },\n TotalMass: nameOnly('29463-7'),\n TotalProtein: nameOnly('2885-2'),\n TransferrinSaturation: nameOnly('2502-3'),\n Triglycerides: nameOnly('2571-8'),\n TroponinI: {\n loinc: '49563-0',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'unit',\n siblingsRejected: [],\n note: '49563-0 afirma o ensaio de alta sensibilidade; troponina I convencional pede 10839-9, sem método.',\n },\n TroponinT: {\n loinc: '6598-7',\n evidence: ['name', 'unit'],\n settledBy: 'name',\n siblingsRejected: [],\n note: '6598-7 não afirma método e cobre o ensaio convencional e o ultrassensível; o código hs entra como variante por método.',\n },\n TSH: nameOnly('3016-3'),\n tTG_IgA: nameOnly('31017-7'),\n tTG_IgG: nameOnly('32998-7'),\n Urea: nameOnly('3091-6'),\n Urea_Creatinine_Ratio: {\n loinc: '56997-0',\n evidence: ['name'],\n settledBy: 'name',\n note: 'separado de BUN_Creatinine_Ratio em out/2026: o laudo brasileiro dosa ureia (3091-6), e a razão impressa é ureia/creatinina',\n siblingsRejected: [\n {\n loinc: '3097-3',\n reason:\n 'nitrogênio ureico (BUN)/creatinina: outro componente, valor cerca de 2,14 vezes menor e faixa da convenção BUN',\n },\n ],\n },\n UricAcid: nameOnly('3084-1'),\n Urobilinogen_Urine: nameOnly('20405-7'),\n VitaminA: nameOnly('2923-1'),\n VitaminB12: nameOnly('2132-9'),\n VitaminC: nameOnly('1903-4'),\n VitaminD: {\n loinc: '62292-8',\n evidence: ['name', 'assay-insert'],\n settledBy: 'assay-insert',\n siblingsRejected: [\n { loinc: '1989-3', reason: 'só a fração D3; os imunoensaios reportam D2 + D3' },\n ],\n },\n VLDL: nameOnly('13458-5'),\n WaistCircumference: nameOnly('8280-0'),\n WBC: nameOnly('6690-2'),\n Zinc: {\n loinc: '5763-8',\n evidence: ['name', 'specimen'],\n settledBy: 'specimen',\n siblingsRejected: [\n { loinc: '8245-3', reason: 'sangue total, outro material com faixa própria' },\n ],\n },\n};\n\nexport const NO_LOINC_DECISIONS: Record<string, NoLoincDecision> = {\n AndroidFatPct: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n AndroidGynoidRatio: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n AorticValveCalcium: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n ArmsFatMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n ArmsLeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n BMC: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n BMD_Total: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem densitometria por sítio, não corpo inteiro.',\n },\n BasalMetabolicRate: {\n reason: 'ambiguous',\n note: 'Candidatos são índice (50042-1) ou RMR medido ou previsto (82278-3, 82286-6), e o aparelho estima TMB.',\n },\n CAC: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_LAD: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_LCX: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_LMA: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_Percentile: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n CAC_RCA: {\n reason: 'pending-review',\n note: 'Escore de cálcio por tomografia; nenhuma busca registrada.',\n },\n ConicityIndex: { reason: 'no-concept', note: 'Índice derivado, sem conceito próprio.' },\n ECWToTBWRatio: { reason: 'no-concept', note: 'Razão derivada, sem conceito próprio.' },\n Estrone: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Em soro só há a fração não conjugada (2261-6); não há estrona total.',\n },\n ExtracellularWater: { reason: 'no-concept', note: '\"extracellular water\" não devolve código.' },\n FatFreeMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n GynoidFatPct: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n IntracellularWater: { reason: 'no-concept', note: '\"intracellular water\" não devolve código.' },\n LeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Massa magra não é massa muscular (73964-9); não há LOINC para massa magra.',\n },\n LegsFatMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n LegsLeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n MuscleMassIndex: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Índice derivado de massa muscular total; os cortes publicados são sobre massa apendicular.',\n },\n ResidualMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Conceito de fracionamento antropométrico, sem código.',\n },\n SkinfoldChest: { reason: 'no-concept', note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.' },\n SkinfoldMidaxillary: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.',\n },\n SkinfoldSubscapular: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.',\n },\n SkinfoldSuprailiac: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem dobra de tríceps, coxa e cintura.',\n },\n TScore_Total: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem densitometria por sítio, não corpo inteiro.',\n },\n TrunkFatMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n TrunkLeanMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n VATMass: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n VATVolume: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'DEXA: o LOINC não tem o conceito para corpo inteiro ou região.',\n },\n VisceralFatLevel: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'Índice de 1 a 20; 73707-2 é área, outra grandeza.',\n },\n WaistToHeightRatio: { reason: 'no-concept', note: '\"waist to height\" não devolve código.' },\n ZScore_Total: {\n reason: 'no-concept',\n note: 'O LOINC só tem densitometria por sítio, não corpo inteiro.',\n },\n};\n\nexport function getMappingDecision(code: string): MappingDecision | undefined {\n return MAPPING_DECISIONS[code];\n}\n\nexport function getNoLoincDecision(code: string): NoLoincDecision | undefined {\n return NO_LOINC_DECISIONS[code];\n}\n","/**\n * A ficha de um mapeamento LOINC no formato da planilha de um mapeador: nome\n * local, unidade, material, método, candidatos com os eixos, escolhido,\n * rejeitados, grupos, revisor e versão. É o que `fhir-bio decision` imprime.\n */\nimport { type BiomarkerDefinition, getDefinitionByCode, getDefinitionByLoinc } from './biomarkers';\nimport { getLoincEntry, type LoincEntry } from './loinc-axes';\nimport {\n getMappingDecision,\n getNoLoincDecision,\n type MappingDecision,\n type NoLoincDecision,\n} from './mapping-decisions';\n\n/** Um código candidato com os eixos que o snapshot guarda dele. */\nexport interface MappingCandidate {\n axes?: LoincEntry;\n loinc: string;\n role: 'chosen' | 'method-variant' | 'rejected';\n /** Pista impressa da variante, ou o motivo da rejeição. */\n why?: string;\n}\n\n/** A ficha de um mapeamento, no formato da planilha de um mapeador. */\nexport interface MappingSheet {\n candidates: MappingCandidate[];\n code: string;\n decision?: MappingDecision;\n /** LOINC Groups do código escolhido. */\n groups: Record<string, string>;\n localNames: string[];\n method: string | null;\n noLoinc?: NoLoincDecision;\n specimen: string | null;\n unit?: string;\n}\n\n/** Aceita o código interno ou qualquer LOINC que resolva para o biomarcador. */\nexport function getMappingSheet(codeOrLoinc: string): MappingSheet | undefined {\n const def: BiomarkerDefinition | undefined =\n getDefinitionByCode(codeOrLoinc) ?? getDefinitionByLoinc(codeOrLoinc);\n if (!def) return undefined;\n\n const decision = getMappingDecision(def.code);\n const chosen = def.loinc ? getLoincEntry(def.loinc) : undefined;\n const candidates: MappingCandidate[] = [];\n if (def.loinc) candidates.push({ axes: chosen, loinc: def.loinc, role: 'chosen' });\n for (const v of def.methodVariants ?? []) {\n const cues = [...v.cues.pt, ...v.cues.en];\n candidates.push({\n axes: getLoincEntry(v.loinc),\n loinc: v.loinc,\n role: 'method-variant',\n why: cues.length ? cues.join('; ') : undefined,\n });\n }\n for (const s of decision?.siblingsRejected ?? []) {\n candidates.push({\n axes: getLoincEntry(s.loinc),\n loinc: s.loinc,\n role: 'rejected',\n why: s.reason,\n });\n }\n\n return {\n candidates,\n code: def.code,\n decision,\n groups: chosen?.groups ?? {},\n localNames: def.names.pt,\n method: chosen?.method ?? null,\n noLoinc: getNoLoincDecision(def.code),\n specimen: chosen?.system ?? null,\n unit: def.unit,\n };\n}\n","/**\n * Material impresso contra o sistema LOINC do código.\n *\n * O laudo imprime o material de cada exame (\"Material: Urina de 24 horas\",\n * \"Material: Soro\"), e o código LOINC carrega o dele no eixo System. Quando os\n * dois discordam, o código está errado para aquele resultado: \"Sódio\" numa\n * seção de urina casa pelo nome com o sódio sérico, e sair com o código de soro\n * afirma uma grandeza que o laboratório não mediu.\n *\n * A comparação é por classe, sangue ou urina, e não por código de material. O\n * `specimenTypeCoding` não casa \"Urina de 24 horas\", de propósito, porque não\n * inventa sinônimo para codificar `Specimen.type`. Para barrar um código basta\n * saber que é urina, e a primeira palavra diz isso sem afirmar mais nada.\n *\n * Material que não começa por uma palavra conhecida, e sistema fora das duas\n * classes (antropometria, `Bld/Tiss`), não barram nada: sem classe dos dois\n * lados não há conflito a afirmar.\n */\nimport { getLoincEntry } from './loinc-axes';\n\nexport type SpecimenClass = 'blood' | 'urine';\n\n/** Palavra inicial do material impresso, já sem acento e em minúsculas. */\nconst CLASSE_DO_MATERIAL: Record<string, SpecimenClass> = {\n plasma: 'blood',\n sangue: 'blood',\n soro: 'blood',\n urina: 'urine',\n};\n\n/** Sistemas do LOINC por classe. `Bld/Tiss` fica de fora: não é só sangue. */\nconst CLASSE_DO_SISTEMA: Record<string, SpecimenClass> = {\n Bld: 'blood',\n BldV: 'blood',\n Plas: 'blood',\n PPP: 'blood',\n RBC: 'blood',\n 'RBC.lysate': 'blood',\n Ser: 'blood',\n 'Ser/Plas': 'blood',\n 'Ser/Plas/Bld': 'blood',\n Urine: 'urine',\n 'Urine sed': 'urine',\n};\n\nconst primeiraPalavra = (texto: string): string =>\n texto\n .replace(/\\p{Cf}/gu, '')\n .normalize('NFD')\n .replace(/[̀-ͯ]/g, '')\n .toLowerCase()\n .trim()\n .split(/[^a-z]+/)[0] ?? '';\n\n/** Classe do material impresso, ou `undefined` quando a palavra inicial não diz. */\nexport function specimenClassOf(material: string): SpecimenClass | undefined {\n return CLASSE_DO_MATERIAL[primeiraPalavra(material)];\n}\n\n/** Classe do eixo System do código, ou `undefined` fora do snapshot ou das duas classes. */\nexport function loincSpecimenClass(loinc: string): SpecimenClass | undefined {\n const system = getLoincEntry(loinc)?.system;\n return system ? CLASSE_DO_SISTEMA[system] : undefined;\n}\n\nexport interface SpecimenMismatch {\n /** Classe do eixo System do código. */\n code: SpecimenClass;\n loinc: string;\n /** Classe do material impresso. */\n material: SpecimenClass;\n reason: 'specimen-mismatch';\n system: string;\n}\n\n/**\n * O conflito entre o material impresso e o código, ou `null` sem conflito\n * afirmável. Quem chama decide o que fazer com o resultado, e a decisão que não\n * existe é trocar o código por um palpite: conflito é lacuna, e sai como tal.\n */\nexport function specimenMismatch(material: string, loinc: string): SpecimenMismatch | null {\n const doMaterial = specimenClassOf(material);\n const doCodigo = loincSpecimenClass(loinc);\n if (!doMaterial || !doCodigo || doMaterial === doCodigo) return null;\n return {\n code: doCodigo,\n loinc,\n material: doMaterial,\n reason: 'specimen-mismatch',\n system: getLoincEntry(loinc)?.system ?? '',\n };\n}\n"]}
package/dist/index.js CHANGED
@@ -7,19 +7,19 @@ import {
7
7
  labReportToFHIR,
8
8
  labResultToFHIRBundle,
9
9
  userProfileToFHIR
10
- } from "./chunk-JMWPX43H.js";
10
+ } from "./chunk-I7RF7YWM.js";
11
11
  import {
12
12
  MAX_FILE_SIZE,
13
13
  MAX_OBSERVATIONS,
14
14
  extractObservationsFromBundle,
15
15
  mapFHIRObservationToInternal,
16
16
  processImportBundle
17
- } from "./chunk-VOBVUACD.js";
17
+ } from "./chunk-5HDQCJWQ.js";
18
18
  import {
19
19
  validateFHIRDiagnosticReport,
20
20
  validateFHIRImportBundle,
21
21
  validateFHIRObservation
22
- } from "./chunk-CVMOQDM2.js";
22
+ } from "./chunk-DE7ZCFMA.js";
23
23
  import {
24
24
  BIOMARKER_CODE_SYSTEM,
25
25
  LOINC_SYSTEM
@@ -33,7 +33,7 @@ import {
33
33
  getRangeDirection,
34
34
  getReferenceRange,
35
35
  referenceRangeMeaning
36
- } from "./chunk-O7SK2YUU.js";
36
+ } from "./chunk-EVWEFMOY.js";
37
37
  import {
38
38
  SOURCE_REGISTRY,
39
39
  extractSourceKey
@@ -49,7 +49,7 @@ import {
49
49
  isUcumCode,
50
50
  resolveUcum,
51
51
  unitToUCUM
52
- } from "./chunk-CZLX33DZ.js";
52
+ } from "./chunk-I6SPJDZ2.js";
53
53
  import {
54
54
  BIOMARKER_DEFINITIONS,
55
55
  CAC_INDICATOR_CODES,
@@ -83,7 +83,7 @@ import {
83
83
  normalizeCode,
84
84
  toBiomarkerTests,
85
85
  validateLoincNameMatch
86
- } from "./chunk-YCJUGK6D.js";
86
+ } from "./chunk-JFJY7ZR6.js";
87
87
 
88
88
  // src/category-groups.ts
89
89
  var CATEGORY_GROUPS = {
@@ -714,6 +714,18 @@ var MAPPING_DECISIONS = {
714
714
  BNP: nameOnly("30934-4"),
715
715
  BodyFatPct: nameOnly("41982-0"),
716
716
  BodyWaterPct: nameOnly("101684-9"),
717
+ BUN: {
718
+ loinc: "3094-0",
719
+ evidence: ["name", "unit"],
720
+ settledBy: "name",
721
+ note: 'criado em out/2026 para o BUN dos laudos americanos (Quest imprime "UREA NITROGEN (BUN)" em mg/dL); a ureia dos laudos brasileiros segue em Urea',
722
+ siblingsRejected: [
723
+ {
724
+ loinc: "3091-6",
725
+ reason: "ureia: outro componente (a mol\xE9cula inteira, n\xE3o s\xF3 o nitrog\xEAnio), valor cerca de 2,14 vezes maior que o BUN"
726
+ }
727
+ ]
728
+ },
717
729
  BUN_Creatinine_Ratio: nameOnly("3097-3"),
718
730
  C3: nameOnly("4485-9"),
719
731
  C4: nameOnly("4498-2"),