@precisa-saude/fhir 0.31.4 → 0.31.6
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{"version":3,"sources":["/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-L4Y4GPKO.cjs","../src/bundle-urls.ts","../src/converter.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACA;ACsBO,IAAM,gBAAA,EAAkB,mCAAA;AAgBxB,IAAM,aAAA,EAAe,CAAC,QAAA,EAAA,GAC3B,CAAA,EAAA;ADpCgC;AACA;AEWc;AAChC,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAK+B;AACf,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAamB;AACT,EAAA;AACA,IAAA;AACG,IAAA;AACD,IAAA;AACV,EAAA;AAC+B,EAAA;AACjC;AAoBE;AAImD,EAAA;AAC3C,IAAA;AACE,IAAA;AACF,IAAA;AACN,IAAA;AACF,EAAA;AAK+C,EAAA;AACpB,IAAA;AAElB,IAAA;AACL,MAAA;AAC+B,QAAA;AACC,QAAA;AACD,QAAA;AAC/B,MAAA;AACF,IAAA;AACF,EAAA;AAUgB,EAAA;AACK,IAAA;AACrB,EAAA;AAE4B,EAAA;AAC9B;AAME;AAI8B,EAAA;AAGhB,EAAA;AACc,EAAA;AACN,EAAA;AAGwB,EAAA;AAClC,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAMI,MAAA;AAEF,QAAA;AACE,UAAA;AACQ,YAAA;AACe,YAAA;AACb,YAAA;AACV,UAAA;AAED,QAAA;AACL,QAAA;AACoB,UAAA;AACG,UAAA;AACb,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACkB,MAAA;AACpB,IAAA;AACmB,IAAA;AACQ,IAAA;AACX,IAAA;AACd,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AAC6B,IAAA;AACf,IAAA;AACN,IAAA;AACC,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AAGmB,EAAA;AACY,IAAA;AACxB,EAAA;AACmB,IAAA;AAChB,MAAA;AACE,MAAA;AACF,MAAA;AACa,MAAA;AACrB,IAAA;AAGuB,IAAA;AACQ,IAAA;AACjC,EAAA;AAEO,EAAA;AACT;AAOE;AAII,EAAA;AACW,EAAA;AACR,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACF,IAAA;AACW,MAAA;AACb,EAAA;AAEO,EAAA;AACK,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AACI,MAAA;AACN,QAAA;AACQ,UAAA;AAAA;AACG,UAAA;AACD,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACM,MAAA;AACR,IAAA;AAES,IAAA;AAIA,IAAA;AAED,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AAEF,IAAA;AACoB,IAAA;AACf,IAAA;AACI,IAAA;AACG,IAAA;AACJ,IAAA;AACc,IAAA;AAC5B,IAAA;AACS,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AACF;AAMkC;AACD,EAAA;AACD,EAAA;AACL,EAAA;AAElB,EAAA;AAED,IAAA;AACE,MAAA;AACwB,QAAA;AACG,QAAA;AACnB,QAAA;AACY,UAAA;AAGA,UAAA;AACF,QAAA;AACI,QAAA;AACG,QAAA;AACzB,MAAA;AAEF,IAAA;AACe,IAAA;AACH,IAAA;AACJ,IAAA;AACN,IAAA;AACJ,MAAA;AACE,QAAA;AAC0B,QAAA;AACZ,QAAA;AAChB,MAAA;AACF,IAAA;AACc,IAAA;AAEZ,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAErB,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAEzB,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AAOE;AAI8B,EAAA;AAGL,EAAA;AACN,IAAA;AACW,MAAA;AAC1B,MAAA;AACO,MAAA;AACT,IAAA;AAEkB,IAAA;AACnB,EAAA;AAKsB,EAAA;AAGE,EAAA;AAGL,EAAA;AAEb,EAAA;AACE,IAAA;AACmB,MAAA;AACA,MAAA;AACrB,MAAA;AACL,IAAA;AACc,IAAA;AACR,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AFhIkC;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA","file":"/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-L4Y4GPKO.cjs","sourcesContent":[null,"/**\n * Endereço das entradas de um Bundle.\n *\n * O `fullUrl` identifica a entrada, e é contra ele que o validador resolve as\n * referências entre os recursos. Um Bundle com `subject.reference` valendo\n * `Patient/abc` só resolve se alguma entrada tiver `fullUrl` terminando em\n * `/Patient/abc`: a referência relativa é lida contra a base do `fullUrl` da\n * entrada, que é como os exemplos da própria HL7 montam Bundle de coleção.\n *\n * Antes o `fullUrl` era `urn:uuid:observation-<laudo>-<código>`, que erra duas\n * vezes. `urn:uuid:` exige a sintaxe de UUID e aquilo não era um UUID, e num\n * Bundle de entradas `urn:uuid:` a referência precisa repetir a URN inteira,\n * então nenhuma das relativas resolvia. Um laudo de 22 marcadores saía com 24\n * erros de URN e 22 referências perdidas.\n */\n/**\n * Recurso que já tem id, e por isso pode ser endereçado numa entrada.\n *\n * No FHIR o `id` é opcional, porque um recurso pode viajar sem identidade\n * própria. Numa entrada de Bundle ele não pode: sem id não há `fullUrl`, e sem\n * `fullUrl` nenhuma referência chega ao recurso. Os conversores daqui sempre\n * atribuem um, e o tipo passa a dizer isso em vez de deixar `undefined` chegar\n * até a montagem da URL.\n */\nexport type Addressable<T> = T & { id: string };\n\n/**\n * Base dos `fullUrl`.\n *\n * Não precisa responder a uma requisição: no FHIR o `fullUrl` é identidade, não\n * endereço de download. Fica sob um domínio nosso para não colidir com a\n * identidade de recurso de outra instituição, que é o risco real de usar\n * `example.org` em dado que sai da máquina.\n */\nexport const BUNDLE_BASE_URL = 'https://precisa-saude.com.br/fhir';\n\n/**\n * Monta o `fullUrl` a partir do próprio recurso.\n *\n * Recebe o recurso em vez do tipo e do id soltos de propósito. O defeito que\n * isto substitui nasceu de montar os dois lados em separado: o `fullUrl` dizia\n * `observation-demo-Hgb` enquanto o recurso tinha id `demo-Hgb`, e ninguém\n * percebeu porque nada obrigava os dois a concordarem.\n *\n * O parâmetro pede o mínimo que a URL consome, e não a união de recursos que\n * este pacote converte. Um Bundle pode carregar qualquer recurso do R4, e quem\n * acrescenta uma entrada de um tipo que não está nessa união (um `Specimen`,\n * por exemplo) precisa do mesmo endereço, senão monta o dele e as duas formas\n * divergem outra vez.\n */\nexport const entryFullUrl = (resource: Addressable<{ resourceType: string }>): string =>\n `${BUNDLE_BASE_URL}/${resource.resourceType}/${resource.id}`;\n","/**\n * FHIR Converter\n *\n * Converts lab results to FHIR R4 DiagnosticReport and Observation resources.\n * See: https://hl7.org/fhir/diagnosticreport.html\n */\n\nimport { codeToLoinc } from './biomarkers';\nimport { type Addressable, entryFullUrl } from './bundle-urls';\nimport { BIOMARKER_CODE_SYSTEM, LOINC_SYSTEM } from './code-systems';\nimport type {\n FHIRBundle,\n FHIRDiagnosticReport,\n FHIRObservation,\n FHIRPatient,\n FHIRQuantity,\n FHIRReferenceRange,\n} from './fhir-types';\nimport type { Flag, LabObservationData, LabReportData, UserProfileData } from './types';\nimport { getDefaultUnit, unitToUCUM } from './units';\n\n// Re-export all types and functions\nexport * from './fhir-types';\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation code\n */\nfunction interpretationCode(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'H'; // High\n case 'L':\n return 'L'; // Low\n default:\n return 'N'; // Normal\n }\n}\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation display\n */\nfunction interpretationDisplay(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'High';\n case 'L':\n return 'Low';\n default:\n return 'Normal';\n }\n}\n\n/**\n * O `coding` do sexo, que vai **dentro** do CodeableConcept do `appliesTo`.\n *\n * O nome diz `CODING` e não `APPLIES_TO` de propósito: isto não é o valor do\n * campo, é uma entrada da lista de codificações dele. O embrulho acontece no\n * uso, em `{ coding: [SEX_CODING[sex]] }`.\n *\n * É o `AdministrativeGender`, e não o v3-ObservationInterpretation nem um\n * sistema nosso: um consumidor que já lê `Patient.gender` compara os dois sem\n * tabela de tradução no meio.\n */\nconst SEX_CODING = {\n female: {\n code: 'female',\n display: 'Female',\n system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender',\n },\n male: { code: 'male', display: 'Male', system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender' },\n} as const;\n\n/**\n * Monta as faixas de referência do `Observation`.\n *\n * Duas mudanças em relação ao que existia, e as duas são sobre não perder o que\n * o laudo imprimiu.\n *\n * **Um limite só já basta.** Antes a faixa só saía com os dois, e um laudo que\n * publica \"inferior a 190 mg/dL\" ou \"superior a 60 mL/min/1,73m²\" perdia o\n * campo inteiro. O R4 trata `low` e `high` como opcionais independentes e\n * documenta o caso de um lado só, e o importador deste mesmo pacote já lia\n * `low?.value` e `high?.value` com acesso opcional: a assimetria era só do\n * escritor. Ver PRE-430.\n *\n * **Mais de uma faixa, anotada.** Laudo com uma coluna de referência por sexo\n * passa a sair com as duas, cada uma com o seu `appliesTo`, em vez de o\n * pipeline escolher uma sem saber de quem é o exame. Ver PRE-424 e PRE-425.\n */\nconst buildReferenceRanges = (\n observation: LabObservationData,\n sourceUnit: string,\n ucumUnit: string,\n): FHIRReferenceRange[] => {\n const quantity = (value: number): FHIRQuantity => ({\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value,\n });\n\n // Devolve lista, e não uma faixa: o caso sem limite nenhum vira lista vazia\n // em vez de `undefined`, e aí os dois caminhos abaixo se compõem com\n // `flatMap` sem ninguém precisar filtrar nada depois.\n const toRanges = (low?: number, high?: number, sex?: 'female' | 'male'): FHIRReferenceRange[] => {\n if (low === undefined && high === undefined) return [];\n\n return [\n {\n ...(sex === undefined ? {} : { appliesTo: [{ coding: [SEX_CODING[sex]] }] }),\n ...(high === undefined ? {} : { high: quantity(high) }),\n ...(low === undefined ? {} : { low: quantity(low) }),\n },\n ];\n };\n\n // A lista anotada tem precedência: quando ela existe, o par simples é o\n // resumo de uma das colunas e repeti-lo publicaria a mesma faixa duas vezes,\n // uma delas sem dizer a quem se aplica.\n //\n // Lista vazia cai no par simples, igual a ausente, e isso é escolha: as duas\n // dizem \"não tenho faixa anotada\", e tratá-las diferente faria um `[]` vindo\n // de um `.filter()` apagar em silêncio a faixa que o chamador também mandou\n // em `referenceMin` e `referenceMax`.\n if (observation.referenceRanges && observation.referenceRanges.length > 0) {\n return observation.referenceRanges.flatMap((r) => toRanges(r.low, r.high, r.appliesTo));\n }\n\n return toRanges(observation.referenceMin, observation.referenceMax);\n};\n\n/**\n * Convert generic lab observation to FHIR Observation\n */\nexport function labObservationToFHIR(\n observation: LabObservationData,\n patientId: string,\n laboratoryName?: string,\n): Addressable<FHIRObservation> {\n const loincCode = codeToLoinc(observation.biomarkerCode);\n // Use default unit if source unit is empty\n const sourceUnit =\n observation.unit || getDefaultUnit(observation.biomarkerCode) || observation.unit;\n const ucumUnit = unitToUCUM(sourceUnit);\n const isQualitative = observation.isQualitative || typeof observation.value === 'string';\n\n // Base observation structure\n const fhirObs: Addressable<FHIRObservation> = {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'laboratory',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n // Sem LOINC, o coding LOINC simplesmente não sai. Antes ia `99999-9`,\n // que não é código LOINC nenhum: publicava sob `http://loinc.org` uma\n // afirmação falsa, e quem consumisse o bundle confiando no system\n // trataria aquilo como código de verdade. Composição corporal, densidade\n // óssea e escore de cálcio não têm LOINC, e o certo é a lacuna explícita.\n coding: [\n ...(loincCode\n ? [\n {\n code: loincCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: LOINC_SYSTEM,\n },\n ]\n : []),\n {\n code: observation.biomarkerCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: BIOMARKER_CODE_SYSTEM,\n },\n ],\n text: observation.biomarkerName,\n },\n effectiveDateTime: observation.collectionDate,\n id: `${observation.reportId}-${observation.biomarkerCode}`,\n interpretation: [\n {\n coding: [\n {\n code: interpretationCode(observation.flag),\n display: interpretationDisplay(observation.flag),\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ],\n performer: laboratoryName ? [{ display: laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'Observation',\n status: 'final',\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n\n // Add value based on type (qualitative = string, quantitative = number)\n if (isQualitative) {\n fhirObs.valueString = String(observation.value);\n } else {\n fhirObs.valueQuantity = {\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value: observation.value as number,\n };\n\n // Reference range only applies to quantitative values\n const referenceRange = buildReferenceRanges(observation, sourceUnit, ucumUnit);\n if (referenceRange.length > 0) fhirObs.referenceRange = referenceRange;\n }\n\n return fhirObs;\n}\n\n/**\n * Convert generic lab report to FHIR DiagnosticReport\n */\nexport function labReportToFHIR(\n report: LabReportData,\n patientId: string,\n observationIds: string[],\n): Addressable<FHIRDiagnosticReport> {\n // Map processing status to FHIR status\n let status: FHIRDiagnosticReport['status'];\n switch (report.processingStatus) {\n case 'complete':\n status = 'final';\n break;\n case 'partial':\n status = 'partial';\n break;\n case 'pending_review':\n status = 'preliminary';\n break;\n default:\n status = 'final';\n }\n\n return {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'LAB',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v2-0074',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n coding: [\n {\n code: '11502-2', // Laboratory report\n display: 'Laboratory report',\n system: 'http://loinc.org',\n },\n ],\n text: 'Laboratory Results',\n },\n conclusion:\n report.overallStatus === 'NORMAL'\n ? 'All results within normal limits'\n : 'One or more abnormal results detected',\n conclusionCode:\n report.overallStatus === 'ANORMAL'\n ? [\n {\n coding: [\n {\n code: 'A',\n display: 'Abnormal',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ]\n : undefined,\n effectiveDateTime: report.collectionDate,\n id: report.reportId,\n issued: report.createdAt,\n performer: report.laboratoryName ? [{ display: report.laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'DiagnosticReport',\n result: observationIds.map((id) => ({ reference: `Observation/${id}` })),\n status,\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n}\n\n/**\n * Convert user profile to FHIR Patient\n * NOTE: CPF is intentionally excluded for privacy (LGPD compliance)\n */\nexport function userProfileToFHIR(profile: UserProfileData): Addressable<FHIRPatient> {\n const nameParts = profile.name.split(' ');\n const given = nameParts.slice(0, -1);\n const family = nameParts[nameParts.length - 1] || '';\n\n return {\n address: profile.address\n ? [\n {\n city: profile.address.city,\n country: profile.address.country || 'BR',\n line: [\n profile.address.street && profile.address.number\n ? `${profile.address.street}, ${profile.address.number}`\n : profile.address.street,\n profile.address.complement,\n ].filter(Boolean) as string[],\n postalCode: profile.address.postalCode,\n state: profile.address.state,\n },\n ]\n : undefined,\n birthDate: profile.birthDate,\n gender: profile.gender,\n id: profile.userId,\n name: [\n {\n family,\n given: given.length > 0 ? given : undefined,\n text: profile.name,\n },\n ],\n resourceType: 'Patient',\n telecom:\n [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ].length > 0\n ? [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ]\n : undefined,\n };\n}\n\n/**\n * Convert complete lab result to FHIR Bundle\n * This is the main function for exporting lab results to FHIR R4 format\n */\nexport function labResultToFHIRBundle(\n report: LabReportData,\n observations: LabObservationData[],\n userProfile: UserProfileData,\n): FHIRBundle {\n const patientId = userProfile.userId;\n\n // Convert observations\n const fhirObservations = observations.map((obs) => {\n const resource = labObservationToFHIR(\n { ...obs, collectionDate: report.collectionDate },\n patientId,\n report.laboratoryName,\n );\n\n return { fullUrl: entryFullUrl(resource), resource };\n });\n\n // Os ids vêm dos recursos já montados, e não de uma segunda montagem da mesma\n // regra. O `DiagnosticReport.result` aponta para eles, e era aqui que a\n // referência se separava do recurso.\n const observationIds = fhirObservations.map((entry) => entry.resource.id);\n\n // Convert report\n const diagnosticReport = labReportToFHIR(report, patientId, observationIds);\n\n // Convert patient\n const fhirPatient = userProfileToFHIR(userProfile);\n\n return {\n entry: [\n { fullUrl: entryFullUrl(fhirPatient), resource: fhirPatient },\n { fullUrl: entryFullUrl(diagnosticReport), resource: diagnosticReport },\n ...fhirObservations,\n ],\n resourceType: 'Bundle',\n type: 'collection',\n };\n}\n"]}
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{"version":3,"sources":["/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-OTVCOSCK.cjs","../src/bundle-urls.ts","../src/converter.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACA;ACsBO,IAAM,gBAAA,EAAkB,mCAAA;AAgBxB,IAAM,aAAA,EAAe,CAAC,QAAA,EAAA,GAC3B,CAAA,EAAA;ADpCgC;AACA;AEWc;AAChC,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAK+B;AACf,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAamB;AACT,EAAA;AACA,IAAA;AACG,IAAA;AACD,IAAA;AACV,EAAA;AAC+B,EAAA;AACjC;AAoBE;AAImD,EAAA;AAC3C,IAAA;AACE,IAAA;AACF,IAAA;AACN,IAAA;AACF,EAAA;AAK+C,EAAA;AACpB,IAAA;AAElB,IAAA;AACL,MAAA;AAC+B,QAAA;AACC,QAAA;AACD,QAAA;AAC/B,MAAA;AACF,IAAA;AACF,EAAA;AAUgB,EAAA;AACK,IAAA;AACrB,EAAA;AAE4B,EAAA;AAC9B;AAME;AAI8B,EAAA;AAGhB,EAAA;AACc,EAAA;AACN,EAAA;AAGwB,EAAA;AAClC,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAMI,MAAA;AAEF,QAAA;AACE,UAAA;AACQ,YAAA;AACe,YAAA;AACb,YAAA;AACV,UAAA;AAED,QAAA;AACL,QAAA;AACoB,UAAA;AACG,UAAA;AACb,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACkB,MAAA;AACpB,IAAA;AACmB,IAAA;AACQ,IAAA;AACX,IAAA;AACd,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AAC6B,IAAA;AACf,IAAA;AACN,IAAA;AACC,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AAGmB,EAAA;AACY,IAAA;AACxB,EAAA;AACmB,IAAA;AAChB,MAAA;AACE,MAAA;AACF,MAAA;AACa,MAAA;AACrB,IAAA;AAGuB,IAAA;AACQ,IAAA;AACjC,EAAA;AAEO,EAAA;AACT;AAOE;AAII,EAAA;AACW,EAAA;AACR,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACF,IAAA;AACW,MAAA;AACb,EAAA;AAEO,EAAA;AACK,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AACI,MAAA;AACN,QAAA;AACQ,UAAA;AAAA;AACG,UAAA;AACD,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACM,MAAA;AACR,IAAA;AAES,IAAA;AAIA,IAAA;AAED,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AAEF,IAAA;AACoB,IAAA;AACf,IAAA;AACI,IAAA;AACG,IAAA;AACJ,IAAA;AACc,IAAA;AAC5B,IAAA;AACS,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AACF;AAMkC;AACD,EAAA;AACD,EAAA;AACL,EAAA;AAElB,EAAA;AAED,IAAA;AACE,MAAA;AACwB,QAAA;AACG,QAAA;AACnB,QAAA;AACY,UAAA;AAGA,UAAA;AACF,QAAA;AACI,QAAA;AACG,QAAA;AACzB,MAAA;AAEF,IAAA;AACe,IAAA;AACH,IAAA;AACJ,IAAA;AACN,IAAA;AACJ,MAAA;AACE,QAAA;AAC0B,QAAA;AACZ,QAAA;AAChB,MAAA;AACF,IAAA;AACc,IAAA;AAEZ,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAErB,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAEzB,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AAOE;AAI8B,EAAA;AAGL,EAAA;AACN,IAAA;AACW,MAAA;AAC1B,MAAA;AACO,MAAA;AACT,IAAA;AAEkB,IAAA;AACnB,EAAA;AAKsB,EAAA;AAGE,EAAA;AAGL,EAAA;AAEb,EAAA;AACE,IAAA;AACmB,MAAA;AACA,MAAA;AACrB,MAAA;AACL,IAAA;AACc,IAAA;AACR,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AFhIkC;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA","file":"/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-OTVCOSCK.cjs","sourcesContent":[null,"/**\n * Endereço das entradas de um Bundle.\n *\n * O `fullUrl` identifica a entrada, e é contra ele que o validador resolve as\n * referências entre os recursos. Um Bundle com `subject.reference` valendo\n * `Patient/abc` só resolve se alguma entrada tiver `fullUrl` terminando em\n * `/Patient/abc`: a referência relativa é lida contra a base do `fullUrl` da\n * entrada, que é como os exemplos da própria HL7 montam Bundle de coleção.\n *\n * Antes o `fullUrl` era `urn:uuid:observation-<laudo>-<código>`, que erra duas\n * vezes. `urn:uuid:` exige a sintaxe de UUID e aquilo não era um UUID, e num\n * Bundle de entradas `urn:uuid:` a referência precisa repetir a URN inteira,\n * então nenhuma das relativas resolvia. Um laudo de 22 marcadores saía com 24\n * erros de URN e 22 referências perdidas.\n */\n/**\n * Recurso que já tem id, e por isso pode ser endereçado numa entrada.\n *\n * No FHIR o `id` é opcional, porque um recurso pode viajar sem identidade\n * própria. Numa entrada de Bundle ele não pode: sem id não há `fullUrl`, e sem\n * `fullUrl` nenhuma referência chega ao recurso. Os conversores daqui sempre\n * atribuem um, e o tipo passa a dizer isso em vez de deixar `undefined` chegar\n * até a montagem da URL.\n */\nexport type Addressable<T> = T & { id: string };\n\n/**\n * Base dos `fullUrl`.\n *\n * Não precisa responder a uma requisição: no FHIR o `fullUrl` é identidade, não\n * endereço de download. Fica sob um domínio nosso para não colidir com a\n * identidade de recurso de outra instituição, que é o risco real de usar\n * `example.org` em dado que sai da máquina.\n */\nexport const BUNDLE_BASE_URL = 'https://precisa-saude.com.br/fhir';\n\n/**\n * Monta o `fullUrl` a partir do próprio recurso.\n *\n * Recebe o recurso em vez do tipo e do id soltos de propósito. O defeito que\n * isto substitui nasceu de montar os dois lados em separado: o `fullUrl` dizia\n * `observation-demo-Hgb` enquanto o recurso tinha id `demo-Hgb`, e ninguém\n * percebeu porque nada obrigava os dois a concordarem.\n *\n * O parâmetro pede o mínimo que a URL consome, e não a união de recursos que\n * este pacote converte. Um Bundle pode carregar qualquer recurso do R4, e quem\n * acrescenta uma entrada de um tipo que não está nessa união (um `Specimen`,\n * por exemplo) precisa do mesmo endereço, senão monta o dele e as duas formas\n * divergem outra vez.\n */\nexport const entryFullUrl = (resource: Addressable<{ resourceType: string }>): string =>\n `${BUNDLE_BASE_URL}/${resource.resourceType}/${resource.id}`;\n","/**\n * FHIR Converter\n *\n * Converts lab results to FHIR R4 DiagnosticReport and Observation resources.\n * See: https://hl7.org/fhir/diagnosticreport.html\n */\n\nimport { codeToLoinc } from './biomarkers';\nimport { type Addressable, entryFullUrl } from './bundle-urls';\nimport { BIOMARKER_CODE_SYSTEM, LOINC_SYSTEM } from './code-systems';\nimport type {\n FHIRBundle,\n FHIRDiagnosticReport,\n FHIRObservation,\n FHIRPatient,\n FHIRQuantity,\n FHIRReferenceRange,\n} from './fhir-types';\nimport type { Flag, LabObservationData, LabReportData, UserProfileData } from './types';\nimport { getDefaultUnit, unitToUCUM } from './units';\n\n// Re-export all types and functions\nexport * from './fhir-types';\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation code\n */\nfunction interpretationCode(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'H'; // High\n case 'L':\n return 'L'; // Low\n default:\n return 'N'; // Normal\n }\n}\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation display\n */\nfunction interpretationDisplay(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'High';\n case 'L':\n return 'Low';\n default:\n return 'Normal';\n }\n}\n\n/**\n * O `coding` do sexo, que vai **dentro** do CodeableConcept do `appliesTo`.\n *\n * O nome diz `CODING` e não `APPLIES_TO` de propósito: isto não é o valor do\n * campo, é uma entrada da lista de codificações dele. O embrulho acontece no\n * uso, em `{ coding: [SEX_CODING[sex]] }`.\n *\n * É o `AdministrativeGender`, e não o v3-ObservationInterpretation nem um\n * sistema nosso: um consumidor que já lê `Patient.gender` compara os dois sem\n * tabela de tradução no meio.\n */\nconst SEX_CODING = {\n female: {\n code: 'female',\n display: 'Female',\n system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender',\n },\n male: { code: 'male', display: 'Male', system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender' },\n} as const;\n\n/**\n * Monta as faixas de referência do `Observation`.\n *\n * Duas mudanças em relação ao que existia, e as duas são sobre não perder o que\n * o laudo imprimiu.\n *\n * **Um limite só já basta.** Antes a faixa só saía com os dois, e um laudo que\n * publica \"inferior a 190 mg/dL\" ou \"superior a 60 mL/min/1,73m²\" perdia o\n * campo inteiro. O R4 trata `low` e `high` como opcionais independentes e\n * documenta o caso de um lado só, e o importador deste mesmo pacote já lia\n * `low?.value` e `high?.value` com acesso opcional: a assimetria era só do\n * escritor. Ver PRE-430.\n *\n * **Mais de uma faixa, anotada.** Laudo com uma coluna de referência por sexo\n * passa a sair com as duas, cada uma com o seu `appliesTo`, em vez de o\n * pipeline escolher uma sem saber de quem é o exame. Ver PRE-424 e PRE-425.\n */\nconst buildReferenceRanges = (\n observation: LabObservationData,\n sourceUnit: string,\n ucumUnit: string,\n): FHIRReferenceRange[] => {\n const quantity = (value: number): FHIRQuantity => ({\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value,\n });\n\n // Devolve lista, e não uma faixa: o caso sem limite nenhum vira lista vazia\n // em vez de `undefined`, e aí os dois caminhos abaixo se compõem com\n // `flatMap` sem ninguém precisar filtrar nada depois.\n const toRanges = (low?: number, high?: number, sex?: 'female' | 'male'): FHIRReferenceRange[] => {\n if (low === undefined && high === undefined) return [];\n\n return [\n {\n ...(sex === undefined ? {} : { appliesTo: [{ coding: [SEX_CODING[sex]] }] }),\n ...(high === undefined ? {} : { high: quantity(high) }),\n ...(low === undefined ? {} : { low: quantity(low) }),\n },\n ];\n };\n\n // A lista anotada tem precedência: quando ela existe, o par simples é o\n // resumo de uma das colunas e repeti-lo publicaria a mesma faixa duas vezes,\n // uma delas sem dizer a quem se aplica.\n //\n // Lista vazia cai no par simples, igual a ausente, e isso é escolha: as duas\n // dizem \"não tenho faixa anotada\", e tratá-las diferente faria um `[]` vindo\n // de um `.filter()` apagar em silêncio a faixa que o chamador também mandou\n // em `referenceMin` e `referenceMax`.\n if (observation.referenceRanges && observation.referenceRanges.length > 0) {\n return observation.referenceRanges.flatMap((r) => toRanges(r.low, r.high, r.appliesTo));\n }\n\n return toRanges(observation.referenceMin, observation.referenceMax);\n};\n\n/**\n * Convert generic lab observation to FHIR Observation\n */\nexport function labObservationToFHIR(\n observation: LabObservationData,\n patientId: string,\n laboratoryName?: string,\n): Addressable<FHIRObservation> {\n const loincCode = codeToLoinc(observation.biomarkerCode);\n // Use default unit if source unit is empty\n const sourceUnit =\n observation.unit || getDefaultUnit(observation.biomarkerCode) || observation.unit;\n const ucumUnit = unitToUCUM(sourceUnit);\n const isQualitative = observation.isQualitative || typeof observation.value === 'string';\n\n // Base observation structure\n const fhirObs: Addressable<FHIRObservation> = {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'laboratory',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n // Sem LOINC, o coding LOINC simplesmente não sai. Antes ia `99999-9`,\n // que não é código LOINC nenhum: publicava sob `http://loinc.org` uma\n // afirmação falsa, e quem consumisse o bundle confiando no system\n // trataria aquilo como código de verdade. Composição corporal, densidade\n // óssea e escore de cálcio não têm LOINC, e o certo é a lacuna explícita.\n coding: [\n ...(loincCode\n ? [\n {\n code: loincCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: LOINC_SYSTEM,\n },\n ]\n : []),\n {\n code: observation.biomarkerCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: BIOMARKER_CODE_SYSTEM,\n },\n ],\n text: observation.biomarkerName,\n },\n effectiveDateTime: observation.collectionDate,\n id: `${observation.reportId}-${observation.biomarkerCode}`,\n interpretation: [\n {\n coding: [\n {\n code: interpretationCode(observation.flag),\n display: interpretationDisplay(observation.flag),\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ],\n performer: laboratoryName ? [{ display: laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'Observation',\n status: 'final',\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n\n // Add value based on type (qualitative = string, quantitative = number)\n if (isQualitative) {\n fhirObs.valueString = String(observation.value);\n } else {\n fhirObs.valueQuantity = {\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value: observation.value as number,\n };\n\n // Reference range only applies to quantitative values\n const referenceRange = buildReferenceRanges(observation, sourceUnit, ucumUnit);\n if (referenceRange.length > 0) fhirObs.referenceRange = referenceRange;\n }\n\n return fhirObs;\n}\n\n/**\n * Convert generic lab report to FHIR DiagnosticReport\n */\nexport function labReportToFHIR(\n report: LabReportData,\n patientId: string,\n observationIds: string[],\n): Addressable<FHIRDiagnosticReport> {\n // Map processing status to FHIR status\n let status: FHIRDiagnosticReport['status'];\n switch (report.processingStatus) {\n case 'complete':\n status = 'final';\n break;\n case 'partial':\n status = 'partial';\n break;\n case 'pending_review':\n status = 'preliminary';\n break;\n default:\n status = 'final';\n }\n\n return {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'LAB',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v2-0074',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n coding: [\n {\n code: '11502-2', // Laboratory report\n display: 'Laboratory report',\n system: 'http://loinc.org',\n },\n ],\n text: 'Laboratory Results',\n },\n conclusion:\n report.overallStatus === 'NORMAL'\n ? 'All results within normal limits'\n : 'One or more abnormal results detected',\n conclusionCode:\n report.overallStatus === 'ANORMAL'\n ? [\n {\n coding: [\n {\n code: 'A',\n display: 'Abnormal',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ]\n : undefined,\n effectiveDateTime: report.collectionDate,\n id: report.reportId,\n issued: report.createdAt,\n performer: report.laboratoryName ? [{ display: report.laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'DiagnosticReport',\n result: observationIds.map((id) => ({ reference: `Observation/${id}` })),\n status,\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n}\n\n/**\n * Convert user profile to FHIR Patient\n * NOTE: CPF is intentionally excluded for privacy (LGPD compliance)\n */\nexport function userProfileToFHIR(profile: UserProfileData): Addressable<FHIRPatient> {\n const nameParts = profile.name.split(' ');\n const given = nameParts.slice(0, -1);\n const family = nameParts[nameParts.length - 1] || '';\n\n return {\n address: profile.address\n ? [\n {\n city: profile.address.city,\n country: profile.address.country || 'BR',\n line: [\n profile.address.street && profile.address.number\n ? `${profile.address.street}, ${profile.address.number}`\n : profile.address.street,\n profile.address.complement,\n ].filter(Boolean) as string[],\n postalCode: profile.address.postalCode,\n state: profile.address.state,\n },\n ]\n : undefined,\n birthDate: profile.birthDate,\n gender: profile.gender,\n id: profile.userId,\n name: [\n {\n family,\n given: given.length > 0 ? given : undefined,\n text: profile.name,\n },\n ],\n resourceType: 'Patient',\n telecom:\n [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ].length > 0\n ? [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ]\n : undefined,\n };\n}\n\n/**\n * Convert complete lab result to FHIR Bundle\n * This is the main function for exporting lab results to FHIR R4 format\n */\nexport function labResultToFHIRBundle(\n report: LabReportData,\n observations: LabObservationData[],\n userProfile: UserProfileData,\n): FHIRBundle {\n const patientId = userProfile.userId;\n\n // Convert observations\n const fhirObservations = observations.map((obs) => {\n const resource = labObservationToFHIR(\n { ...obs, collectionDate: report.collectionDate },\n patientId,\n report.laboratoryName,\n );\n\n return { fullUrl: entryFullUrl(resource), resource };\n });\n\n // Os ids vêm dos recursos já montados, e não de uma segunda montagem da mesma\n // regra. O `DiagnosticReport.result` aponta para eles, e era aqui que a\n // referência se separava do recurso.\n const observationIds = fhirObservations.map((entry) => entry.resource.id);\n\n // Convert report\n const diagnosticReport = labReportToFHIR(report, patientId, observationIds);\n\n // Convert patient\n const fhirPatient = userProfileToFHIR(userProfile);\n\n return {\n entry: [\n { fullUrl: entryFullUrl(fhirPatient), resource: fhirPatient },\n { fullUrl: entryFullUrl(diagnosticReport), resource: diagnosticReport },\n ...fhirObservations,\n ],\n resourceType: 'Bundle',\n type: 'collection',\n };\n}\n"]}
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@@ -8,7 +8,7 @@ var _chunkOR67NJDZcjs = require('./chunk-OR67NJDZ.cjs');
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var
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+
var _chunkMKH4Q735cjs = require('./chunk-MKH4Q735.cjs');
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var _chunk3ILBFLVQcjs = require('./chunk-3ILBFLVQ.cjs');
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@@ -33,11 +33,11 @@ function resolveBiomarkerCode(observation) {
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} else {
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reason = "No code found in observation coding";
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}
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const fromLoinc = loincCode ?
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+
const fromLoinc = loincCode ? _chunkMKH4Q735cjs.loincToCode.call(void 0, loincCode) : void 0;
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if (fromLoinc) return { internalCode: fromLoinc, loincCode, reason };
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if (declaredCode &&
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-
const canonical =
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-
return { internalCode: canonical, loincCode:
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+
if (declaredCode && _chunkMKH4Q735cjs.isValidCode.call(void 0, declaredCode)) {
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39
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+
const canonical = _chunkMKH4Q735cjs.normalizeCode.call(void 0, declaredCode);
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40
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+
return { internalCode: canonical, loincCode: _chunkMKH4Q735cjs.codeToLoinc.call(void 0, canonical), reason };
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}
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return { loincCode, reason };
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}
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@@ -74,7 +74,7 @@ function mapFHIRObservationToInternal(observation, index) {
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skipped: { index, loincCode, reason, resourceType: "Observation" }
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};
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}
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const definition =
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const definition = _chunkMKH4Q735cjs.getDefinitionByCode.call(void 0, internalCode);
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let value;
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let unit = "";
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let isQualitative = false;
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@@ -162,4 +162,4 @@ function processImportBundle(data) {
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exports.MAX_OBSERVATIONS = MAX_OBSERVATIONS; exports.MAX_FILE_SIZE = MAX_FILE_SIZE; exports.extractObservationsFromBundle = extractObservationsFromBundle; exports.mapFHIRObservationToInternal = mapFHIRObservationToInternal; exports.processImportBundle = processImportBundle;
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//# sourceMappingURL=chunk-
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//# sourceMappingURL=chunk-PC4NNGBM.cjs.map
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@@ -1 +1 @@
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Nesse tamanho, 5000 Observations dão 6,0MB\n * compactos ou 13,1MB indentados, e por isso o teto de arquivo é 15MB: cobre\n * as duas formas com folga.\n *\n * Na densidade desse mesmo histórico (16 Observations por laudo), 5000\n * equivalem a cerca de 300 laudos.\n */\nconst MAX_OBSERVATIONS = 5000;\nconst MAX_FILE_SIZE = 15 * 1024 * 1024; // 15MB\n\n/**\n * Resolve o código interno do biomarcador a partir do `code.coding`.\n *\n * LOINC primeiro, que é o vocabulário que arquivos de terceiros usam. Quando\n * não resolve, cai para o coding de códigos internos, presente nos arquivos\n * exportados pela própria plataforma.\n *\n * O fallback cobre dois casos: biomarcadores sem LOINC publicado (composição\n * corporal, densidade óssea, escore de cálcio) e arquivos antigos, exportados\n * quando esses biomarcadores saíam com o placeholder `99999-9`, que não\n * resolve para nada.\n */\nfunction resolveBiomarkerCode(observation: FHIRObservation): {\n internalCode?: string;\n loincCode?: string;\n reason: string;\n} {\n const coding = observation.code?.coding ?? [];\n const loincCode = coding.find((c) => c.system === LOINC_SYSTEM)?.code;\n const declaredCode = coding.find((c) => c.system === BIOMARKER_CODE_SYSTEM)?.code;\n\n const seenCodes = [\n ...(loincCode ? [`LOINC ${loincCode}`] : []),\n ...(declaredCode ? [`biomarker code ${declaredCode}`] : []),\n ];\n\n // Três motivos distintos de descarte, que antes se confundiam num só. Sem\n // essa separação, um arquivo em SNOMED relatava \"nenhum código encontrado\",\n // sugerindo `coding` vazio quando na verdade o código existia e estava num\n // system que não tratamos. Para importação de terceiros, é a diferença entre\n // um diagnóstico acionável e um enigma.\n let reason: string;\n if (seenCodes.length > 0) {\n reason = `Unknown code: ${seenCodes.join(', ')}`;\n } else if (coding.length > 0) {\n const systems = [...new Set(coding.map((c) => c.system ?? '(sem system)'))];\n reason = `No code in a supported system (found: ${systems.join(', ')})`;\n } else {\n reason = 'No code found in observation coding';\n }\n\n const fromLoinc = loincCode ? loincToCode(loincCode) : undefined;\n if (fromLoinc) return { internalCode: fromLoinc, loincCode, reason };\n\n if (declaredCode && isValidCode(declaredCode)) {\n // `isValidCode` aceita alias, mas alias não serve como código armazenado:\n // 49 definições têm um, e tanto `codeToLoinc` quanto as faixas de\n // referência são indexadas só pelo canônico. Sem normalizar, `VLDL_Cholesterol`\n // entraria no lugar de `VLDL` e perderia o LOINC 13458-5 que ele tem.\n // Importar um Bundle é fronteira de dados, que é onde `normalizeCode` deve\n // ser aplicado.\n const canonical = normalizeCode(declaredCode);\n\n // `codeToLoinc` devolve undefined para quem não tem LOINC, que é o caso\n // esperado aqui. O campo fica de fora em vez de receber um valor inventado.\n return { internalCode: canonical, loincCode: codeToLoinc(canonical), reason };\n }\n\n return { loincCode, reason };\n}\n\n/**\n * Extract interpretation flag from Observation\n */\nfunction extractFlag(observation: FHIRObservation): 'H' | 'L' | '' {\n const code = observation.interpretation?.[0]?.coding?.[0]?.code;\n if (code === 'H' || code === 'HH') return 'H';\n if (code === 'L' || code === 'LL') return 'L';\n return '';\n}\n\n/**\n * Extract Observation resources from a FHIR Bundle\n */\nexport function extractObservationsFromBundle(bundle: FHIRBundle): {\n observations: FHIRObservation[];\n skipped: SkippedEntry[];\n} {\n const observations: FHIRObservation[] = [];\n const skipped: SkippedEntry[] = [];\n\n for (let i = 0; i < bundle.entry.length; i++) {\n const entry = bundle.entry[i]!;\n if (!entry.resource) {\n skipped.push({ index: i, reason: 'Entry has no resource' });\n continue;\n }\n\n if (entry.resource.resourceType !== 'Observation') {\n // Non-observation resources are silently skipped (Patient, DiagnosticReport, etc.)\n continue;\n }\n\n if (observations.length >= MAX_OBSERVATIONS) {\n skipped.push({ index: i, reason: `Maximum of ${MAX_OBSERVATIONS} observations exceeded` });\n continue;\n }\n\n observations.push(entry.resource as FHIRObservation);\n }\n\n return { observations, skipped };\n}\n\n/**\n * Map a FHIR Observation to internal format using LOINC→biomarker code lookup\n */\nexport function mapFHIRObservationToInternal(\n observation: FHIRObservation,\n index: number,\n): { observation: ImportedObservation } | { skipped: SkippedEntry } {\n const { internalCode, loincCode, reason } = resolveBiomarkerCode(observation);\n\n if (!internalCode) {\n return {\n skipped: { index, loincCode, reason, resourceType: 'Observation' },\n };\n }\n\n const definition = getDefinitionByCode(internalCode);\n\n // Extract value\n let value: number | string;\n let unit = '';\n let isQualitative = false;\n\n if (observation.valueQuantity?.value !== undefined) {\n value = observation.valueQuantity.value;\n unit = observation.valueQuantity.unit || observation.valueQuantity.code || '';\n } else if (observation.valueString) {\n value = observation.valueString;\n isQualitative = true;\n } else {\n return {\n skipped: {\n index,\n loincCode,\n reason: 'Observation has no value (valueQuantity or valueString)',\n resourceType: 'Observation',\n },\n };\n }\n\n // Extract collection date (effectiveDateTime or effectivePeriod.start)\n const collectionDate = observation.effectiveDateTime || observation.effectivePeriod?.start || '';\n if (!collectionDate) {\n return {\n skipped: {\n index,\n loincCode,\n reason: 'Observation has no effectiveDateTime or effectivePeriod.start',\n resourceType: 'Observation',\n },\n };\n }\n\n // Extract reference ranges\n let referenceMin: number | undefined;\n let referenceMax: number | undefined;\n if (observation.referenceRange?.[0]) {\n referenceMin = observation.referenceRange[0].low?.value;\n referenceMax = observation.referenceRange[0].high?.value;\n }\n\n const imported: ImportedObservation = {\n biomarkerCode: internalCode,\n biomarkerName:\n definition?.names.pt[0] || definition?.names.en[0] || observation.code.text || internalCode,\n collectionDate,\n flag: extractFlag(observation),\n isQualitative,\n loincCode,\n referenceMax,\n referenceMin,\n unit: unit || definition?.unit || '',\n value,\n };\n\n return { observation: imported };\n}\n\n/**\n * Process a complete FHIR Bundle for import\n */\nexport function processImportBundle(data: unknown): FHIRImportResult {\n // Structural validation\n const validationErrors = validateFHIRImportBundle(data);\n if (validationErrors.length > 0) {\n return {\n errors: validationErrors,\n imported: [],\n skipped: [],\n totalProcessed: 0,\n };\n }\n\n const bundle = data as FHIRBundle;\n\n // Extract observations\n const { observations, skipped } = extractObservationsFromBundle(bundle);\n\n // Map each observation to internal format\n const imported: ImportedObservation[] = [];\n const allSkipped: SkippedEntry[] = [...skipped];\n\n for (let i = 0; i < observations.length; i++) {\n const result = mapFHIRObservationToInternal(observations[i]!, i);\n\n if ('observation' in result) {\n imported.push(result.observation);\n } else {\n allSkipped.push(result.skipped);\n }\n }\n\n return {\n errors: [],\n imported,\n skipped: allSkipped,\n totalProcessed: observations.length,\n };\n}\n\nexport { MAX_FILE_SIZE, MAX_OBSERVATIONS };\n"]}
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Nesse tamanho, 5000 Observations dão 6,0MB\n * compactos ou 13,1MB indentados, e por isso o teto de arquivo é 15MB: cobre\n * as duas formas com folga.\n *\n * Na densidade desse mesmo histórico (16 Observations por laudo), 5000\n * equivalem a cerca de 300 laudos.\n */\nconst MAX_OBSERVATIONS = 5000;\nconst MAX_FILE_SIZE = 15 * 1024 * 1024; // 15MB\n\n/**\n * Resolve o código interno do biomarcador a partir do `code.coding`.\n *\n * LOINC primeiro, que é o vocabulário que arquivos de terceiros usam. Quando\n * não resolve, cai para o coding de códigos internos, presente nos arquivos\n * exportados pela própria plataforma.\n *\n * O fallback cobre dois casos: biomarcadores sem LOINC publicado (composição\n * corporal, densidade óssea, escore de cálcio) e arquivos antigos, exportados\n * quando esses biomarcadores saíam com o placeholder `99999-9`, que não\n * resolve para nada.\n */\nfunction resolveBiomarkerCode(observation: FHIRObservation): {\n internalCode?: string;\n loincCode?: string;\n reason: string;\n} {\n const coding = observation.code?.coding ?? [];\n const loincCode = coding.find((c) => c.system === LOINC_SYSTEM)?.code;\n const declaredCode = coding.find((c) => c.system === BIOMARKER_CODE_SYSTEM)?.code;\n\n const seenCodes = [\n ...(loincCode ? [`LOINC ${loincCode}`] : []),\n ...(declaredCode ? [`biomarker code ${declaredCode}`] : []),\n ];\n\n // Três motivos distintos de descarte, que antes se confundiam num só. Sem\n // essa separação, um arquivo em SNOMED relatava \"nenhum código encontrado\",\n // sugerindo `coding` vazio quando na verdade o código existia e estava num\n // system que não tratamos. Para importação de terceiros, é a diferença entre\n // um diagnóstico acionável e um enigma.\n let reason: string;\n if (seenCodes.length > 0) {\n reason = `Unknown code: ${seenCodes.join(', ')}`;\n } else if (coding.length > 0) {\n const systems = [...new Set(coding.map((c) => c.system ?? '(sem system)'))];\n reason = `No code in a supported system (found: ${systems.join(', ')})`;\n } else {\n reason = 'No code found in observation coding';\n }\n\n const fromLoinc = loincCode ? loincToCode(loincCode) : undefined;\n if (fromLoinc) return { internalCode: fromLoinc, loincCode, reason };\n\n if (declaredCode && isValidCode(declaredCode)) {\n // `isValidCode` aceita alias, mas alias não serve como código armazenado:\n // 49 definições têm um, e tanto `codeToLoinc` quanto as faixas de\n // referência são indexadas só pelo canônico. Sem normalizar, `VLDL_Cholesterol`\n // entraria no lugar de `VLDL` e perderia o LOINC 13458-5 que ele tem.\n // Importar um Bundle é fronteira de dados, que é onde `normalizeCode` deve\n // ser aplicado.\n const canonical = normalizeCode(declaredCode);\n\n // `codeToLoinc` devolve undefined para quem não tem LOINC, que é o caso\n // esperado aqui. O campo fica de fora em vez de receber um valor inventado.\n return { internalCode: canonical, loincCode: codeToLoinc(canonical), reason };\n }\n\n return { loincCode, reason };\n}\n\n/**\n * Extract interpretation flag from Observation\n */\nfunction extractFlag(observation: FHIRObservation): 'H' | 'L' | '' {\n const code = observation.interpretation?.[0]?.coding?.[0]?.code;\n if (code === 'H' || code === 'HH') return 'H';\n if (code === 'L' || code === 'LL') return 'L';\n return '';\n}\n\n/**\n * Extract Observation resources from a FHIR Bundle\n */\nexport function extractObservationsFromBundle(bundle: FHIRBundle): {\n observations: FHIRObservation[];\n skipped: SkippedEntry[];\n} {\n const observations: FHIRObservation[] = [];\n const skipped: SkippedEntry[] = [];\n\n for (let i = 0; i < bundle.entry.length; i++) {\n const entry = bundle.entry[i]!;\n if (!entry.resource) {\n skipped.push({ index: i, reason: 'Entry has no resource' });\n continue;\n }\n\n if (entry.resource.resourceType !== 'Observation') {\n // Non-observation resources are silently skipped (Patient, DiagnosticReport, etc.)\n continue;\n }\n\n if (observations.length >= MAX_OBSERVATIONS) {\n skipped.push({ index: i, reason: `Maximum of ${MAX_OBSERVATIONS} observations exceeded` });\n continue;\n }\n\n observations.push(entry.resource as FHIRObservation);\n }\n\n return { observations, skipped };\n}\n\n/**\n * Map a FHIR Observation to internal format using LOINC→biomarker code lookup\n */\nexport function mapFHIRObservationToInternal(\n observation: FHIRObservation,\n index: number,\n): { observation: ImportedObservation } | { skipped: SkippedEntry } {\n const { internalCode, loincCode, reason } = resolveBiomarkerCode(observation);\n\n if (!internalCode) {\n return {\n skipped: { index, loincCode, reason, resourceType: 'Observation' },\n };\n }\n\n const definition = getDefinitionByCode(internalCode);\n\n // Extract value\n let value: number | string;\n let unit = '';\n let isQualitative = false;\n\n if (observation.valueQuantity?.value !== undefined) {\n value = observation.valueQuantity.value;\n unit = observation.valueQuantity.unit || observation.valueQuantity.code || '';\n } else if (observation.valueString) {\n value = observation.valueString;\n isQualitative = true;\n } else {\n return {\n skipped: {\n index,\n loincCode,\n reason: 'Observation has no value (valueQuantity or valueString)',\n resourceType: 'Observation',\n },\n };\n }\n\n // Extract collection date (effectiveDateTime or effectivePeriod.start)\n const collectionDate = observation.effectiveDateTime || observation.effectivePeriod?.start || '';\n if (!collectionDate) {\n return {\n skipped: {\n index,\n loincCode,\n reason: 'Observation has no effectiveDateTime or effectivePeriod.start',\n resourceType: 'Observation',\n },\n };\n }\n\n // Extract reference ranges\n let referenceMin: number | undefined;\n let referenceMax: number | undefined;\n if (observation.referenceRange?.[0]) {\n referenceMin = observation.referenceRange[0].low?.value;\n referenceMax = observation.referenceRange[0].high?.value;\n }\n\n const imported: ImportedObservation = {\n biomarkerCode: internalCode,\n biomarkerName:\n definition?.names.pt[0] || definition?.names.en[0] || observation.code.text || internalCode,\n collectionDate,\n flag: extractFlag(observation),\n isQualitative,\n loincCode,\n referenceMax,\n referenceMin,\n unit: unit || definition?.unit || '',\n value,\n };\n\n return { observation: imported };\n}\n\n/**\n * Process a complete FHIR Bundle for import\n */\nexport function processImportBundle(data: unknown): FHIRImportResult {\n // Structural validation\n const validationErrors = validateFHIRImportBundle(data);\n if (validationErrors.length > 0) {\n return {\n errors: validationErrors,\n imported: [],\n skipped: [],\n totalProcessed: 0,\n };\n }\n\n const bundle = data as FHIRBundle;\n\n // Extract observations\n const { observations, skipped } = extractObservationsFromBundle(bundle);\n\n // Map each observation to internal format\n const imported: ImportedObservation[] = [];\n const allSkipped: SkippedEntry[] = [...skipped];\n\n for (let i = 0; i < observations.length; i++) {\n const result = mapFHIRObservationToInternal(observations[i]!, i);\n\n if ('observation' in result) {\n imported.push(result.observation);\n } else {\n allSkipped.push(result.skipped);\n }\n }\n\n return {\n errors: [],\n imported,\n skipped: allSkipped,\n totalProcessed: observations.length,\n };\n}\n\nexport { MAX_FILE_SIZE, MAX_OBSERVATIONS };\n"]}
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// tabela de tendência. Os dois são o "Total Body Fat %" da mesma data.
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// `FatMass` na citação do percentual.
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2102
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pt: [
|
|
2096
2103
|
"Percentual de Gordura Corporal",
|
|
@@ -2108,7 +2115,10 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
|
|
|
2108
2115
|
code: "FatMass",
|
|
2109
2116
|
loinc: "73708-0",
|
|
2110
2117
|
names: {
|
|
2111
|
-
|
|
2118
|
+
// "Total Fat" é a coluna "Total Fat (lbs)" da tabela de tendência da
|
|
2119
|
+
// densitometria Live Lean, e traz o mesmo número do "Fat Mass" da página
|
|
2120
|
+
// 1 em todas as datas que as duas tabelas imprimem.
|
|
2121
|
+
en: ["Fat Mass", "Total Fat Mass", "Body Fat Mass", "Fat Tissue Mass", "Total Fat"],
|
|
2112
2122
|
pt: ["Massa de Gordura", "Massa Gorda", "Massa de Gordura Total", "Tecido Adiposo"]
|
|
2113
2123
|
},
|
|
2114
2124
|
unit: "kg"
|
|
@@ -2128,7 +2138,18 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
|
|
|
2128
2138
|
category: "composicao-corporal",
|
|
2129
2139
|
code: "LeanMass",
|
|
2130
2140
|
names: {
|
|
2131
|
-
|
|
2141
|
+
// "Total Lean" é a coluna "Total Lean (lbs)" da mesma tabela de
|
|
2142
|
+
// tendência: tecido magro, igual ao "Lean Mass" da página 1, e não a
|
|
2143
|
+
// massa livre de gordura, que soma o mineral ósseo e fica em
|
|
2144
|
+
// `FatFreeMass`.
|
|
2145
|
+
en: [
|
|
2146
|
+
"Lean Mass",
|
|
2147
|
+
"Lean Body Mass",
|
|
2148
|
+
"Lean Tissue Mass",
|
|
2149
|
+
"Total Lean Mass",
|
|
2150
|
+
"LBM",
|
|
2151
|
+
"Total Lean"
|
|
2152
|
+
],
|
|
2132
2153
|
pt: ["Massa Magra", "Massa Corporal Magra", "Tecido Magro", "Massa Magra Total"]
|
|
2133
2154
|
},
|
|
2134
2155
|
unit: "kg"
|
|
@@ -2638,13 +2659,30 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
|
|
|
2638
2659
|
// Regional Body Composition (DEXA)
|
|
2639
2660
|
// Note: No official LOINC codes exist for regional lean/fat mass measurements
|
|
2640
2661
|
// Hidden from UI for now - may be shown in future regional breakdown view
|
|
2662
|
+
//
|
|
2663
|
+
// "Arms Total" e "Legs Total" são a linha dos dois membros somados na tabela
|
|
2664
|
+
// de equilíbrio muscular do laudo da Live Lean (GE Lunar Prodigy). Conferido
|
|
2665
|
+
// em cinco laudos: a massa gorda e a magra dessa linha são a soma do lado
|
|
2666
|
+
// direito com o esquerdo, e são o mesmo número das colunas "Arms Fat" e
|
|
2667
|
+
// "Arms Lean" da tabela de tendência e da linha "Arms" da tabela regional.
|
|
2668
|
+
// O modelo nomeia a linha "Arms Total Fat Mass", e sem o nome ela virava
|
|
2669
|
+
// `UNKNOWN_`, enquanto a mesma medida em outra página ia para `ArmsFatMass`:
|
|
2670
|
+
// a série do gráfico partia em dois códigos. O `codeAliases` cobre o que já
|
|
2671
|
+
// foi gravado assim.
|
|
2672
|
+
//
|
|
2673
|
+
// As outras colunas da mesma linha ficam sem código de propósito. "Fat %" e
|
|
2674
|
+
// "Lean %" são percentual do membro, e "Total Mass" é a massa do membro;
|
|
2675
|
+
// o catálogo não tem código regional para nenhum dos dois. "Right Arm" e
|
|
2676
|
+
// "Left Arm" são um lado só, e "Arms Difference" é direito menos esquerdo.
|
|
2641
2677
|
{
|
|
2642
2678
|
category: "composicao-corporal",
|
|
2643
2679
|
code: "ArmsLeanMass",
|
|
2680
|
+
codeAliases: ["UNKNOWN_Arms_Total_Lean_Mass"],
|
|
2644
2681
|
hidden: true,
|
|
2645
2682
|
names: {
|
|
2646
2683
|
en: [
|
|
2647
2684
|
"Arms Lean Mass",
|
|
2685
|
+
"Arms Total Lean Mass",
|
|
2648
2686
|
"Arms Lean",
|
|
2649
2687
|
"Arms Lean Tissue",
|
|
2650
2688
|
"Arm Lean Mass",
|
|
@@ -2671,10 +2709,12 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
|
|
|
2671
2709
|
{
|
|
2672
2710
|
category: "composicao-corporal",
|
|
2673
2711
|
code: "ArmsFatMass",
|
|
2712
|
+
codeAliases: ["UNKNOWN_Arms_Total_Fat_Mass"],
|
|
2674
2713
|
hidden: true,
|
|
2675
2714
|
names: {
|
|
2676
2715
|
en: [
|
|
2677
2716
|
"Arms Fat Mass",
|
|
2717
|
+
"Arms Total Fat Mass",
|
|
2678
2718
|
"Arms Fat",
|
|
2679
2719
|
"Arms Fat Tissue",
|
|
2680
2720
|
"Arm Fat Mass",
|
|
@@ -2702,10 +2742,12 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
|
|
|
2702
2742
|
{
|
|
2703
2743
|
category: "composicao-corporal",
|
|
2704
2744
|
code: "LegsLeanMass",
|
|
2745
|
+
codeAliases: ["UNKNOWN_Legs_Total_Lean_Mass"],
|
|
2705
2746
|
hidden: true,
|
|
2706
2747
|
names: {
|
|
2707
2748
|
en: [
|
|
2708
2749
|
"Legs Lean Mass",
|
|
2750
|
+
"Legs Total Lean Mass",
|
|
2709
2751
|
"Legs Lean",
|
|
2710
2752
|
"Legs Lean Tissue",
|
|
2711
2753
|
"Leg Lean Mass",
|
|
@@ -2732,10 +2774,12 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
|
|
|
2732
2774
|
{
|
|
2733
2775
|
category: "composicao-corporal",
|
|
2734
2776
|
code: "LegsFatMass",
|
|
2777
|
+
codeAliases: ["UNKNOWN_Legs_Total_Fat_Mass"],
|
|
2735
2778
|
hidden: true,
|
|
2736
2779
|
names: {
|
|
2737
2780
|
en: [
|
|
2738
2781
|
"Legs Fat Mass",
|
|
2782
|
+
"Legs Total Fat Mass",
|
|
2739
2783
|
"Legs Fat",
|
|
2740
2784
|
"Legs Fat Tissue",
|
|
2741
2785
|
"Leg Fat Mass",
|
|
@@ -3421,4 +3465,4 @@ export {
|
|
|
3421
3465
|
getBiomarkersByCategory,
|
|
3422
3466
|
getBiomarkersForCategories
|
|
3423
3467
|
};
|
|
3424
|
-
//# sourceMappingURL=chunk-
|
|
3468
|
+
//# sourceMappingURL=chunk-WDDW2WCY.js.map
|