@precisa-saude/fhir 0.31.3 → 0.31.5

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@@ -30,7 +30,7 @@
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30
 
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31
 
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32
 
33
- var _chunkR5S7URXWcjs = require('./chunk-R5S7URXW.cjs');
33
+ var _chunkQOXTLPQ2cjs = require('./chunk-QOXTLPQ2.cjs');
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34
 
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35
 
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36
 
@@ -63,5 +63,5 @@ var _chunkR5S7URXWcjs = require('./chunk-R5S7URXW.cjs');
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63
 
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64
 
65
65
 
66
- exports.BIOMARKER_DEFINITIONS = _chunkR5S7URXWcjs.BIOMARKER_DEFINITIONS; exports.CAC_INDICATOR_CODES = _chunkR5S7URXWcjs.CAC_INDICATOR_CODES; exports.DEXA_CATEGORIES = _chunkR5S7URXWcjs.DEXA_CATEGORIES; exports.DEXA_INDICATOR_CODES = _chunkR5S7URXWcjs.DEXA_INDICATOR_CODES; exports.codeToLoinc = _chunkR5S7URXWcjs.codeToLoinc; exports.filterVisibleBiomarkers = _chunkR5S7URXWcjs.filterVisibleBiomarkers; exports.findCodeByName = _chunkR5S7URXWcjs.findCodeByName; exports.generateCacFullReference = _chunkR5S7URXWcjs.generateCacFullReference; exports.generateDexaFullReference = _chunkR5S7URXWcjs.generateDexaFullReference; exports.generateFilteredLLMReference = _chunkR5S7URXWcjs.generateFilteredLLMReference; exports.generateLLMReference = _chunkR5S7URXWcjs.generateLLMReference; exports.getAllCodes = _chunkR5S7URXWcjs.getAllCodes; exports.getAllDefinitions = _chunkR5S7URXWcjs.getAllDefinitions; exports.getAllLoincCodes = _chunkR5S7URXWcjs.getAllLoincCodes; exports.getAllSearchPatterns = _chunkR5S7URXWcjs.getAllSearchPatterns; exports.getBiomarkersByCategory = _chunkR5S7URXWcjs.getBiomarkersByCategory; exports.getBiomarkersForCategories = _chunkR5S7URXWcjs.getBiomarkersForCategories; exports.getDefinitionByCode = _chunkR5S7URXWcjs.getDefinitionByCode; exports.getDefinitionByLoinc = _chunkR5S7URXWcjs.getDefinitionByLoinc; exports.getDefinitionsBySex = _chunkR5S7URXWcjs.getDefinitionsBySex; exports.getSexForCode = _chunkR5S7URXWcjs.getSexForCode; exports.getVisibleDefinitions = _chunkR5S7URXWcjs.getVisibleDefinitions; exports.isBiomarkerVisible = _chunkR5S7URXWcjs.isBiomarkerVisible; exports.isCacDocument = _chunkR5S7URXWcjs.isCacDocument; exports.isDexaDocument = _chunkR5S7URXWcjs.isDexaDocument; exports.isValidCode = _chunkR5S7URXWcjs.isValidCode; exports.isValidLoinc = _chunkR5S7URXWcjs.isValidLoinc; exports.loincToCode = _chunkR5S7URXWcjs.loincToCode; exports.normalizeCode = _chunkR5S7URXWcjs.normalizeCode; exports.toBiomarkerTests = _chunkR5S7URXWcjs.toBiomarkerTests; exports.validateLoincNameMatch = _chunkR5S7URXWcjs.validateLoincNameMatch;
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+ exports.BIOMARKER_DEFINITIONS = _chunkQOXTLPQ2cjs.BIOMARKER_DEFINITIONS; exports.CAC_INDICATOR_CODES = _chunkQOXTLPQ2cjs.CAC_INDICATOR_CODES; exports.DEXA_CATEGORIES = _chunkQOXTLPQ2cjs.DEXA_CATEGORIES; exports.DEXA_INDICATOR_CODES = _chunkQOXTLPQ2cjs.DEXA_INDICATOR_CODES; exports.codeToLoinc = _chunkQOXTLPQ2cjs.codeToLoinc; exports.filterVisibleBiomarkers = _chunkQOXTLPQ2cjs.filterVisibleBiomarkers; exports.findCodeByName = _chunkQOXTLPQ2cjs.findCodeByName; exports.generateCacFullReference = _chunkQOXTLPQ2cjs.generateCacFullReference; exports.generateDexaFullReference = _chunkQOXTLPQ2cjs.generateDexaFullReference; exports.generateFilteredLLMReference = _chunkQOXTLPQ2cjs.generateFilteredLLMReference; exports.generateLLMReference = _chunkQOXTLPQ2cjs.generateLLMReference; exports.getAllCodes = _chunkQOXTLPQ2cjs.getAllCodes; exports.getAllDefinitions = _chunkQOXTLPQ2cjs.getAllDefinitions; exports.getAllLoincCodes = _chunkQOXTLPQ2cjs.getAllLoincCodes; exports.getAllSearchPatterns = _chunkQOXTLPQ2cjs.getAllSearchPatterns; exports.getBiomarkersByCategory = _chunkQOXTLPQ2cjs.getBiomarkersByCategory; exports.getBiomarkersForCategories = _chunkQOXTLPQ2cjs.getBiomarkersForCategories; exports.getDefinitionByCode = _chunkQOXTLPQ2cjs.getDefinitionByCode; exports.getDefinitionByLoinc = _chunkQOXTLPQ2cjs.getDefinitionByLoinc; exports.getDefinitionsBySex = _chunkQOXTLPQ2cjs.getDefinitionsBySex; exports.getSexForCode = _chunkQOXTLPQ2cjs.getSexForCode; exports.getVisibleDefinitions = _chunkQOXTLPQ2cjs.getVisibleDefinitions; exports.isBiomarkerVisible = _chunkQOXTLPQ2cjs.isBiomarkerVisible; exports.isCacDocument = _chunkQOXTLPQ2cjs.isCacDocument; exports.isDexaDocument = _chunkQOXTLPQ2cjs.isDexaDocument; exports.isValidCode = _chunkQOXTLPQ2cjs.isValidCode; exports.isValidLoinc = _chunkQOXTLPQ2cjs.isValidLoinc; exports.loincToCode = _chunkQOXTLPQ2cjs.loincToCode; exports.normalizeCode = _chunkQOXTLPQ2cjs.normalizeCode; exports.toBiomarkerTests = _chunkQOXTLPQ2cjs.toBiomarkerTests; exports.validateLoincNameMatch = _chunkQOXTLPQ2cjs.validateLoincNameMatch;
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  //# sourceMappingURL=biomarkers.cjs.map
@@ -30,7 +30,7 @@ import {
30
30
  normalizeCode,
31
31
  toBiomarkerTests,
32
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  validateLoincNameMatch
33
- } from "./chunk-L4KJ3QWU.js";
33
+ } from "./chunk-PK5DQMPC.js";
34
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  export {
35
35
  BIOMARKER_DEFINITIONS,
36
36
  CAC_INDICATOR_CODES,
@@ -4,7 +4,7 @@ import {
4
4
  } from "./chunk-A6HR4XDK.js";
5
5
  import {
6
6
  codeToLoinc
7
- } from "./chunk-L4KJ3QWU.js";
7
+ } from "./chunk-PK5DQMPC.js";
8
8
  import {
9
9
  getDefaultUnit,
10
10
  unitToUCUM
@@ -271,4 +271,4 @@ export {
271
271
  userProfileToFHIR,
272
272
  labResultToFHIRBundle
273
273
  };
274
- //# sourceMappingURL=chunk-BXHJ3JAC.js.map
274
+ //# sourceMappingURL=chunk-6OG25HIE.js.map
@@ -4,7 +4,7 @@
4
4
  var _chunkOR67NJDZcjs = require('./chunk-OR67NJDZ.cjs');
5
5
 
6
6
 
7
- var _chunkR5S7URXWcjs = require('./chunk-R5S7URXW.cjs');
7
+ var _chunkQOXTLPQ2cjs = require('./chunk-QOXTLPQ2.cjs');
8
8
 
9
9
 
10
10
 
@@ -68,7 +68,7 @@ var buildReferenceRanges = (observation, sourceUnit, ucumUnit) => {
68
68
  return toRanges(observation.referenceMin, observation.referenceMax);
69
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  };
70
70
  function labObservationToFHIR(observation, patientId, laboratoryName) {
71
- const loincCode = _chunkR5S7URXWcjs.codeToLoinc.call(void 0, observation.biomarkerCode);
71
+ const loincCode = _chunkQOXTLPQ2cjs.codeToLoinc.call(void 0, observation.biomarkerCode);
72
72
  const sourceUnit = observation.unit || _chunkAZTZYOAVcjs.getDefaultUnit.call(void 0, observation.biomarkerCode) || observation.unit;
73
73
  const ucumUnit = _chunkAZTZYOAVcjs.unitToUCUM.call(void 0, sourceUnit);
74
74
  const isQualitative = observation.isQualitative || typeof observation.value === "string";
@@ -271,4 +271,4 @@ function labResultToFHIRBundle(report, observations, userProfile) {
271
271
 
272
272
 
273
273
  exports.BUNDLE_BASE_URL = BUNDLE_BASE_URL; exports.entryFullUrl = entryFullUrl; exports.labObservationToFHIR = labObservationToFHIR; exports.labReportToFHIR = labReportToFHIR; exports.userProfileToFHIR = userProfileToFHIR; exports.labResultToFHIRBundle = labResultToFHIRBundle;
274
- //# sourceMappingURL=chunk-PS4LXHHO.cjs.map
274
+ //# sourceMappingURL=chunk-EXOKBY6D.cjs.map
@@ -1 +1 @@
1
- {"version":3,"sources":["/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-PS4LXHHO.cjs","../src/bundle-urls.ts","../src/converter.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACA;ACsBO,IAAM,gBAAA,EAAkB,mCAAA;AAgBxB,IAAM,aAAA,EAAe,CAAC,QAAA,EAAA,GAC3B,CAAA,EAAA;ADpCgC;AACA;AEWc;AAChC,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAK+B;AACf,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAamB;AACT,EAAA;AACA,IAAA;AACG,IAAA;AACD,IAAA;AACV,EAAA;AAC+B,EAAA;AACjC;AAoBE;AAImD,EAAA;AAC3C,IAAA;AACE,IAAA;AACF,IAAA;AACN,IAAA;AACF,EAAA;AAK+C,EAAA;AACpB,IAAA;AAElB,IAAA;AACL,MAAA;AAC+B,QAAA;AACC,QAAA;AACD,QAAA;AAC/B,MAAA;AACF,IAAA;AACF,EAAA;AAUgB,EAAA;AACK,IAAA;AACrB,EAAA;AAE4B,EAAA;AAC9B;AAME;AAI8B,EAAA;AAGhB,EAAA;AACc,EAAA;AACN,EAAA;AAGwB,EAAA;AAClC,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAMI,MAAA;AAEF,QAAA;AACE,UAAA;AACQ,YAAA;AACe,YAAA;AACb,YAAA;AACV,UAAA;AAED,QAAA;AACL,QAAA;AACoB,UAAA;AACG,UAAA;AACb,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACkB,MAAA;AACpB,IAAA;AACmB,IAAA;AACQ,IAAA;AACX,IAAA;AACd,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AAC6B,IAAA;AACf,IAAA;AACN,IAAA;AACC,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AAGmB,EAAA;AACY,IAAA;AACxB,EAAA;AACmB,IAAA;AAChB,MAAA;AACE,MAAA;AACF,MAAA;AACa,MAAA;AACrB,IAAA;AAGuB,IAAA;AACQ,IAAA;AACjC,EAAA;AAEO,EAAA;AACT;AAOE;AAII,EAAA;AACW,EAAA;AACR,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACF,IAAA;AACW,MAAA;AACb,EAAA;AAEO,EAAA;AACK,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AACI,MAAA;AACN,QAAA;AACQ,UAAA;AAAA;AACG,UAAA;AACD,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACM,MAAA;AACR,IAAA;AAES,IAAA;AAIA,IAAA;AAED,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AAEF,IAAA;AACoB,IAAA;AACf,IAAA;AACI,IAAA;AACG,IAAA;AACJ,IAAA;AACc,IAAA;AAC5B,IAAA;AACS,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AACF;AAMkC;AACD,EAAA;AACD,EAAA;AACL,EAAA;AAElB,EAAA;AAED,IAAA;AACE,MAAA;AACwB,QAAA;AACG,QAAA;AACnB,QAAA;AACY,UAAA;AAGA,UAAA;AACF,QAAA;AACI,QAAA;AACG,QAAA;AACzB,MAAA;AAEF,IAAA;AACe,IAAA;AACH,IAAA;AACJ,IAAA;AACN,IAAA;AACJ,MAAA;AACE,QAAA;AAC0B,QAAA;AACZ,QAAA;AAChB,MAAA;AACF,IAAA;AACc,IAAA;AAEZ,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAErB,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAEzB,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AAOE;AAI8B,EAAA;AAGL,EAAA;AACN,IAAA;AACW,MAAA;AAC1B,MAAA;AACO,MAAA;AACT,IAAA;AAEkB,IAAA;AACnB,EAAA;AAKsB,EAAA;AAGE,EAAA;AAGL,EAAA;AAEb,EAAA;AACE,IAAA;AACmB,MAAA;AACA,MAAA;AACrB,MAAA;AACL,IAAA;AACc,IAAA;AACR,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AFhIkC;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA","file":"/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-PS4LXHHO.cjs","sourcesContent":[null,"/**\n * Endereço das entradas de um Bundle.\n *\n * O `fullUrl` identifica a entrada, e é contra ele que o validador resolve as\n * referências entre os recursos. Um Bundle com `subject.reference` valendo\n * `Patient/abc` só resolve se alguma entrada tiver `fullUrl` terminando em\n * `/Patient/abc`: a referência relativa é lida contra a base do `fullUrl` da\n * entrada, que é como os exemplos da própria HL7 montam Bundle de coleção.\n *\n * Antes o `fullUrl` era `urn:uuid:observation-<laudo>-<código>`, que erra duas\n * vezes. `urn:uuid:` exige a sintaxe de UUID e aquilo não era um UUID, e num\n * Bundle de entradas `urn:uuid:` a referência precisa repetir a URN inteira,\n * então nenhuma das relativas resolvia. Um laudo de 22 marcadores saía com 24\n * erros de URN e 22 referências perdidas.\n */\n/**\n * Recurso que já tem id, e por isso pode ser endereçado numa entrada.\n *\n * No FHIR o `id` é opcional, porque um recurso pode viajar sem identidade\n * própria. Numa entrada de Bundle ele não pode: sem id não há `fullUrl`, e sem\n * `fullUrl` nenhuma referência chega ao recurso. Os conversores daqui sempre\n * atribuem um, e o tipo passa a dizer isso em vez de deixar `undefined` chegar\n * até a montagem da URL.\n */\nexport type Addressable<T> = T & { id: string };\n\n/**\n * Base dos `fullUrl`.\n *\n * Não precisa responder a uma requisição: no FHIR o `fullUrl` é identidade, não\n * endereço de download. Fica sob um domínio nosso para não colidir com a\n * identidade de recurso de outra instituição, que é o risco real de usar\n * `example.org` em dado que sai da máquina.\n */\nexport const BUNDLE_BASE_URL = 'https://precisa-saude.com.br/fhir';\n\n/**\n * Monta o `fullUrl` a partir do próprio recurso.\n *\n * Recebe o recurso em vez do tipo e do id soltos de propósito. O defeito que\n * isto substitui nasceu de montar os dois lados em separado: o `fullUrl` dizia\n * `observation-demo-Hgb` enquanto o recurso tinha id `demo-Hgb`, e ninguém\n * percebeu porque nada obrigava os dois a concordarem.\n *\n * O parâmetro pede o mínimo que a URL consome, e não a união de recursos que\n * este pacote converte. Um Bundle pode carregar qualquer recurso do R4, e quem\n * acrescenta uma entrada de um tipo que não está nessa união (um `Specimen`,\n * por exemplo) precisa do mesmo endereço, senão monta o dele e as duas formas\n * divergem outra vez.\n */\nexport const entryFullUrl = (resource: Addressable<{ resourceType: string }>): string =>\n `${BUNDLE_BASE_URL}/${resource.resourceType}/${resource.id}`;\n","/**\n * FHIR Converter\n *\n * Converts lab results to FHIR R4 DiagnosticReport and Observation resources.\n * See: https://hl7.org/fhir/diagnosticreport.html\n */\n\nimport { codeToLoinc } from './biomarkers';\nimport { type Addressable, entryFullUrl } from './bundle-urls';\nimport { BIOMARKER_CODE_SYSTEM, LOINC_SYSTEM } from './code-systems';\nimport type {\n FHIRBundle,\n FHIRDiagnosticReport,\n FHIRObservation,\n FHIRPatient,\n FHIRQuantity,\n FHIRReferenceRange,\n} from './fhir-types';\nimport type { Flag, LabObservationData, LabReportData, UserProfileData } from './types';\nimport { getDefaultUnit, unitToUCUM } from './units';\n\n// Re-export all types and functions\nexport * from './fhir-types';\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation code\n */\nfunction interpretationCode(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'H'; // High\n case 'L':\n return 'L'; // Low\n default:\n return 'N'; // Normal\n }\n}\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation display\n */\nfunction interpretationDisplay(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'High';\n case 'L':\n return 'Low';\n default:\n return 'Normal';\n }\n}\n\n/**\n * O `coding` do sexo, que vai **dentro** do CodeableConcept do `appliesTo`.\n *\n * O nome diz `CODING` e não `APPLIES_TO` de propósito: isto não é o valor do\n * campo, é uma entrada da lista de codificações dele. O embrulho acontece no\n * uso, em `{ coding: [SEX_CODING[sex]] }`.\n *\n * É o `AdministrativeGender`, e não o v3-ObservationInterpretation nem um\n * sistema nosso: um consumidor que já lê `Patient.gender` compara os dois sem\n * tabela de tradução no meio.\n */\nconst SEX_CODING = {\n female: {\n code: 'female',\n display: 'Female',\n system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender',\n },\n male: { code: 'male', display: 'Male', system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender' },\n} as const;\n\n/**\n * Monta as faixas de referência do `Observation`.\n *\n * Duas mudanças em relação ao que existia, e as duas são sobre não perder o que\n * o laudo imprimiu.\n *\n * **Um limite só já basta.** Antes a faixa só saía com os dois, e um laudo que\n * publica \"inferior a 190 mg/dL\" ou \"superior a 60 mL/min/1,73m²\" perdia o\n * campo inteiro. O R4 trata `low` e `high` como opcionais independentes e\n * documenta o caso de um lado só, e o importador deste mesmo pacote já lia\n * `low?.value` e `high?.value` com acesso opcional: a assimetria era só do\n * escritor. Ver PRE-430.\n *\n * **Mais de uma faixa, anotada.** Laudo com uma coluna de referência por sexo\n * passa a sair com as duas, cada uma com o seu `appliesTo`, em vez de o\n * pipeline escolher uma sem saber de quem é o exame. Ver PRE-424 e PRE-425.\n */\nconst buildReferenceRanges = (\n observation: LabObservationData,\n sourceUnit: string,\n ucumUnit: string,\n): FHIRReferenceRange[] => {\n const quantity = (value: number): FHIRQuantity => ({\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value,\n });\n\n // Devolve lista, e não uma faixa: o caso sem limite nenhum vira lista vazia\n // em vez de `undefined`, e aí os dois caminhos abaixo se compõem com\n // `flatMap` sem ninguém precisar filtrar nada depois.\n const toRanges = (low?: number, high?: number, sex?: 'female' | 'male'): FHIRReferenceRange[] => {\n if (low === undefined && high === undefined) return [];\n\n return [\n {\n ...(sex === undefined ? {} : { appliesTo: [{ coding: [SEX_CODING[sex]] }] }),\n ...(high === undefined ? {} : { high: quantity(high) }),\n ...(low === undefined ? {} : { low: quantity(low) }),\n },\n ];\n };\n\n // A lista anotada tem precedência: quando ela existe, o par simples é o\n // resumo de uma das colunas e repeti-lo publicaria a mesma faixa duas vezes,\n // uma delas sem dizer a quem se aplica.\n //\n // Lista vazia cai no par simples, igual a ausente, e isso é escolha: as duas\n // dizem \"não tenho faixa anotada\", e tratá-las diferente faria um `[]` vindo\n // de um `.filter()` apagar em silêncio a faixa que o chamador também mandou\n // em `referenceMin` e `referenceMax`.\n if (observation.referenceRanges && observation.referenceRanges.length > 0) {\n return observation.referenceRanges.flatMap((r) => toRanges(r.low, r.high, r.appliesTo));\n }\n\n return toRanges(observation.referenceMin, observation.referenceMax);\n};\n\n/**\n * Convert generic lab observation to FHIR Observation\n */\nexport function labObservationToFHIR(\n observation: LabObservationData,\n patientId: string,\n laboratoryName?: string,\n): Addressable<FHIRObservation> {\n const loincCode = codeToLoinc(observation.biomarkerCode);\n // Use default unit if source unit is empty\n const sourceUnit =\n observation.unit || getDefaultUnit(observation.biomarkerCode) || observation.unit;\n const ucumUnit = unitToUCUM(sourceUnit);\n const isQualitative = observation.isQualitative || typeof observation.value === 'string';\n\n // Base observation structure\n const fhirObs: Addressable<FHIRObservation> = {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'laboratory',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n // Sem LOINC, o coding LOINC simplesmente não sai. Antes ia `99999-9`,\n // que não é código LOINC nenhum: publicava sob `http://loinc.org` uma\n // afirmação falsa, e quem consumisse o bundle confiando no system\n // trataria aquilo como código de verdade. Composição corporal, densidade\n // óssea e escore de cálcio não têm LOINC, e o certo é a lacuna explícita.\n coding: [\n ...(loincCode\n ? [\n {\n code: loincCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: LOINC_SYSTEM,\n },\n ]\n : []),\n {\n code: observation.biomarkerCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: BIOMARKER_CODE_SYSTEM,\n },\n ],\n text: observation.biomarkerName,\n },\n effectiveDateTime: observation.collectionDate,\n id: `${observation.reportId}-${observation.biomarkerCode}`,\n interpretation: [\n {\n coding: [\n {\n code: interpretationCode(observation.flag),\n display: interpretationDisplay(observation.flag),\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ],\n performer: laboratoryName ? [{ display: laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'Observation',\n status: 'final',\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n\n // Add value based on type (qualitative = string, quantitative = number)\n if (isQualitative) {\n fhirObs.valueString = String(observation.value);\n } else {\n fhirObs.valueQuantity = {\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value: observation.value as number,\n };\n\n // Reference range only applies to quantitative values\n const referenceRange = buildReferenceRanges(observation, sourceUnit, ucumUnit);\n if (referenceRange.length > 0) fhirObs.referenceRange = referenceRange;\n }\n\n return fhirObs;\n}\n\n/**\n * Convert generic lab report to FHIR DiagnosticReport\n */\nexport function labReportToFHIR(\n report: LabReportData,\n patientId: string,\n observationIds: string[],\n): Addressable<FHIRDiagnosticReport> {\n // Map processing status to FHIR status\n let status: FHIRDiagnosticReport['status'];\n switch (report.processingStatus) {\n case 'complete':\n status = 'final';\n break;\n case 'partial':\n status = 'partial';\n break;\n case 'pending_review':\n status = 'preliminary';\n break;\n default:\n status = 'final';\n }\n\n return {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'LAB',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v2-0074',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n coding: [\n {\n code: '11502-2', // Laboratory report\n display: 'Laboratory report',\n system: 'http://loinc.org',\n },\n ],\n text: 'Laboratory Results',\n },\n conclusion:\n report.overallStatus === 'NORMAL'\n ? 'All results within normal limits'\n : 'One or more abnormal results detected',\n conclusionCode:\n report.overallStatus === 'ANORMAL'\n ? [\n {\n coding: [\n {\n code: 'A',\n display: 'Abnormal',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ]\n : undefined,\n effectiveDateTime: report.collectionDate,\n id: report.reportId,\n issued: report.createdAt,\n performer: report.laboratoryName ? [{ display: report.laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'DiagnosticReport',\n result: observationIds.map((id) => ({ reference: `Observation/${id}` })),\n status,\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n}\n\n/**\n * Convert user profile to FHIR Patient\n * NOTE: CPF is intentionally excluded for privacy (LGPD compliance)\n */\nexport function userProfileToFHIR(profile: UserProfileData): Addressable<FHIRPatient> {\n const nameParts = profile.name.split(' ');\n const given = nameParts.slice(0, -1);\n const family = nameParts[nameParts.length - 1] || '';\n\n return {\n address: profile.address\n ? [\n {\n city: profile.address.city,\n country: profile.address.country || 'BR',\n line: [\n profile.address.street && profile.address.number\n ? `${profile.address.street}, ${profile.address.number}`\n : profile.address.street,\n profile.address.complement,\n ].filter(Boolean) as string[],\n postalCode: profile.address.postalCode,\n state: profile.address.state,\n },\n ]\n : undefined,\n birthDate: profile.birthDate,\n gender: profile.gender,\n id: profile.userId,\n name: [\n {\n family,\n given: given.length > 0 ? given : undefined,\n text: profile.name,\n },\n ],\n resourceType: 'Patient',\n telecom:\n [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ].length > 0\n ? [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ]\n : undefined,\n };\n}\n\n/**\n * Convert complete lab result to FHIR Bundle\n * This is the main function for exporting lab results to FHIR R4 format\n */\nexport function labResultToFHIRBundle(\n report: LabReportData,\n observations: LabObservationData[],\n userProfile: UserProfileData,\n): FHIRBundle {\n const patientId = userProfile.userId;\n\n // Convert observations\n const fhirObservations = observations.map((obs) => {\n const resource = labObservationToFHIR(\n { ...obs, collectionDate: report.collectionDate },\n patientId,\n report.laboratoryName,\n );\n\n return { fullUrl: entryFullUrl(resource), resource };\n });\n\n // Os ids vêm dos recursos já montados, e não de uma segunda montagem da mesma\n // regra. O `DiagnosticReport.result` aponta para eles, e era aqui que a\n // referência se separava do recurso.\n const observationIds = fhirObservations.map((entry) => entry.resource.id);\n\n // Convert report\n const diagnosticReport = labReportToFHIR(report, patientId, observationIds);\n\n // Convert patient\n const fhirPatient = userProfileToFHIR(userProfile);\n\n return {\n entry: [\n { fullUrl: entryFullUrl(fhirPatient), resource: fhirPatient },\n { fullUrl: entryFullUrl(diagnosticReport), resource: diagnosticReport },\n ...fhirObservations,\n ],\n resourceType: 'Bundle',\n type: 'collection',\n };\n}\n"]}
1
+ {"version":3,"sources":["/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-EXOKBY6D.cjs","../src/bundle-urls.ts","../src/converter.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACE;AACA;AACF,wDAA6B;AAC7B;AACA;ACsBO,IAAM,gBAAA,EAAkB,mCAAA;AAgBxB,IAAM,aAAA,EAAe,CAAC,QAAA,EAAA,GAC3B,CAAA,EAAA;ADpCgC;AACA;AEWc;AAChC,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAK+B;AACf,EAAA;AACP,IAAA;AACI,MAAA;AACJ,IAAA;AACI,MAAA;AACT,IAAA;AACS,MAAA;AACX,EAAA;AACF;AAamB;AACT,EAAA;AACA,IAAA;AACG,IAAA;AACD,IAAA;AACV,EAAA;AAC+B,EAAA;AACjC;AAoBE;AAImD,EAAA;AAC3C,IAAA;AACE,IAAA;AACF,IAAA;AACN,IAAA;AACF,EAAA;AAK+C,EAAA;AACpB,IAAA;AAElB,IAAA;AACL,MAAA;AAC+B,QAAA;AACC,QAAA;AACD,QAAA;AAC/B,MAAA;AACF,IAAA;AACF,EAAA;AAUgB,EAAA;AACK,IAAA;AACrB,EAAA;AAE4B,EAAA;AAC9B;AAME;AAI8B,EAAA;AAGhB,EAAA;AACc,EAAA;AACN,EAAA;AAGwB,EAAA;AAClC,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAAA;AAMI,MAAA;AAEF,QAAA;AACE,UAAA;AACQ,YAAA;AACe,YAAA;AACb,YAAA;AACV,UAAA;AAED,QAAA;AACL,QAAA;AACoB,UAAA;AACG,UAAA;AACb,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACkB,MAAA;AACpB,IAAA;AACmB,IAAA;AACQ,IAAA;AACX,IAAA;AACd,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AAC6B,IAAA;AACf,IAAA;AACN,IAAA;AACC,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AAGmB,EAAA;AACY,IAAA;AACxB,EAAA;AACmB,IAAA;AAChB,MAAA;AACE,MAAA;AACF,MAAA;AACa,MAAA;AACrB,IAAA;AAGuB,IAAA;AACQ,IAAA;AACjC,EAAA;AAEO,EAAA;AACT;AAOE;AAII,EAAA;AACW,EAAA;AACR,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACG,IAAA;AACM,MAAA;AACT,MAAA;AACF,IAAA;AACW,MAAA;AACb,EAAA;AAEO,EAAA;AACK,IAAA;AACR,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AACF,IAAA;AACM,IAAA;AACI,MAAA;AACN,QAAA;AACQ,UAAA;AAAA;AACG,UAAA;AACD,UAAA;AACV,QAAA;AACF,MAAA;AACM,MAAA;AACR,IAAA;AAES,IAAA;AAIA,IAAA;AAED,MAAA;AACU,QAAA;AACN,UAAA;AACQ,YAAA;AACG,YAAA;AACD,YAAA;AACV,UAAA;AACF,QAAA;AACF,MAAA;AAEF,IAAA;AACoB,IAAA;AACf,IAAA;AACI,IAAA;AACG,IAAA;AACJ,IAAA;AACc,IAAA;AAC5B,IAAA;AACS,IAAA;AACe,MAAA;AACxB,IAAA;AACF,EAAA;AACF;AAMkC;AACD,EAAA;AACD,EAAA;AACL,EAAA;AAElB,EAAA;AAED,IAAA;AACE,MAAA;AACwB,QAAA;AACG,QAAA;AACnB,QAAA;AACY,UAAA;AAGA,UAAA;AACF,QAAA;AACI,QAAA;AACG,QAAA;AACzB,MAAA;AAEF,IAAA;AACe,IAAA;AACH,IAAA;AACJ,IAAA;AACN,IAAA;AACJ,MAAA;AACE,QAAA;AAC0B,QAAA;AACZ,QAAA;AAChB,MAAA;AACF,IAAA;AACc,IAAA;AAEZ,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAErB,IAAA;AACyB,MAAA;AACA,MAAA;AAEzB,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AAOE;AAI8B,EAAA;AAGL,EAAA;AACN,IAAA;AACW,MAAA;AAC1B,MAAA;AACO,MAAA;AACT,IAAA;AAEkB,IAAA;AACnB,EAAA;AAKsB,EAAA;AAGE,EAAA;AAGL,EAAA;AAEb,EAAA;AACE,IAAA;AACmB,MAAA;AACA,MAAA;AACrB,MAAA;AACL,IAAA;AACc,IAAA;AACR,IAAA;AACR,EAAA;AACF;AFhIkC;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA;AACA","file":"/home/runner/work/fhir-brasil/fhir-brasil/packages/core/dist/chunk-EXOKBY6D.cjs","sourcesContent":[null,"/**\n * Endereço das entradas de um Bundle.\n *\n * O `fullUrl` identifica a entrada, e é contra ele que o validador resolve as\n * referências entre os recursos. Um Bundle com `subject.reference` valendo\n * `Patient/abc` só resolve se alguma entrada tiver `fullUrl` terminando em\n * `/Patient/abc`: a referência relativa é lida contra a base do `fullUrl` da\n * entrada, que é como os exemplos da própria HL7 montam Bundle de coleção.\n *\n * Antes o `fullUrl` era `urn:uuid:observation-<laudo>-<código>`, que erra duas\n * vezes. `urn:uuid:` exige a sintaxe de UUID e aquilo não era um UUID, e num\n * Bundle de entradas `urn:uuid:` a referência precisa repetir a URN inteira,\n * então nenhuma das relativas resolvia. Um laudo de 22 marcadores saía com 24\n * erros de URN e 22 referências perdidas.\n */\n/**\n * Recurso que já tem id, e por isso pode ser endereçado numa entrada.\n *\n * No FHIR o `id` é opcional, porque um recurso pode viajar sem identidade\n * própria. Numa entrada de Bundle ele não pode: sem id não há `fullUrl`, e sem\n * `fullUrl` nenhuma referência chega ao recurso. Os conversores daqui sempre\n * atribuem um, e o tipo passa a dizer isso em vez de deixar `undefined` chegar\n * até a montagem da URL.\n */\nexport type Addressable<T> = T & { id: string };\n\n/**\n * Base dos `fullUrl`.\n *\n * Não precisa responder a uma requisição: no FHIR o `fullUrl` é identidade, não\n * endereço de download. Fica sob um domínio nosso para não colidir com a\n * identidade de recurso de outra instituição, que é o risco real de usar\n * `example.org` em dado que sai da máquina.\n */\nexport const BUNDLE_BASE_URL = 'https://precisa-saude.com.br/fhir';\n\n/**\n * Monta o `fullUrl` a partir do próprio recurso.\n *\n * Recebe o recurso em vez do tipo e do id soltos de propósito. O defeito que\n * isto substitui nasceu de montar os dois lados em separado: o `fullUrl` dizia\n * `observation-demo-Hgb` enquanto o recurso tinha id `demo-Hgb`, e ninguém\n * percebeu porque nada obrigava os dois a concordarem.\n *\n * O parâmetro pede o mínimo que a URL consome, e não a união de recursos que\n * este pacote converte. Um Bundle pode carregar qualquer recurso do R4, e quem\n * acrescenta uma entrada de um tipo que não está nessa união (um `Specimen`,\n * por exemplo) precisa do mesmo endereço, senão monta o dele e as duas formas\n * divergem outra vez.\n */\nexport const entryFullUrl = (resource: Addressable<{ resourceType: string }>): string =>\n `${BUNDLE_BASE_URL}/${resource.resourceType}/${resource.id}`;\n","/**\n * FHIR Converter\n *\n * Converts lab results to FHIR R4 DiagnosticReport and Observation resources.\n * See: https://hl7.org/fhir/diagnosticreport.html\n */\n\nimport { codeToLoinc } from './biomarkers';\nimport { type Addressable, entryFullUrl } from './bundle-urls';\nimport { BIOMARKER_CODE_SYSTEM, LOINC_SYSTEM } from './code-systems';\nimport type {\n FHIRBundle,\n FHIRDiagnosticReport,\n FHIRObservation,\n FHIRPatient,\n FHIRQuantity,\n FHIRReferenceRange,\n} from './fhir-types';\nimport type { Flag, LabObservationData, LabReportData, UserProfileData } from './types';\nimport { getDefaultUnit, unitToUCUM } from './units';\n\n// Re-export all types and functions\nexport * from './fhir-types';\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation code\n */\nfunction interpretationCode(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'H'; // High\n case 'L':\n return 'L'; // Low\n default:\n return 'N'; // Normal\n }\n}\n\n/**\n * Convert Flag to FHIR interpretation display\n */\nfunction interpretationDisplay(flag: Flag): string {\n switch (flag) {\n case 'H':\n return 'High';\n case 'L':\n return 'Low';\n default:\n return 'Normal';\n }\n}\n\n/**\n * O `coding` do sexo, que vai **dentro** do CodeableConcept do `appliesTo`.\n *\n * O nome diz `CODING` e não `APPLIES_TO` de propósito: isto não é o valor do\n * campo, é uma entrada da lista de codificações dele. O embrulho acontece no\n * uso, em `{ coding: [SEX_CODING[sex]] }`.\n *\n * É o `AdministrativeGender`, e não o v3-ObservationInterpretation nem um\n * sistema nosso: um consumidor que já lê `Patient.gender` compara os dois sem\n * tabela de tradução no meio.\n */\nconst SEX_CODING = {\n female: {\n code: 'female',\n display: 'Female',\n system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender',\n },\n male: { code: 'male', display: 'Male', system: 'http://hl7.org/fhir/administrative-gender' },\n} as const;\n\n/**\n * Monta as faixas de referência do `Observation`.\n *\n * Duas mudanças em relação ao que existia, e as duas são sobre não perder o que\n * o laudo imprimiu.\n *\n * **Um limite só já basta.** Antes a faixa só saía com os dois, e um laudo que\n * publica \"inferior a 190 mg/dL\" ou \"superior a 60 mL/min/1,73m²\" perdia o\n * campo inteiro. O R4 trata `low` e `high` como opcionais independentes e\n * documenta o caso de um lado só, e o importador deste mesmo pacote já lia\n * `low?.value` e `high?.value` com acesso opcional: a assimetria era só do\n * escritor. Ver PRE-430.\n *\n * **Mais de uma faixa, anotada.** Laudo com uma coluna de referência por sexo\n * passa a sair com as duas, cada uma com o seu `appliesTo`, em vez de o\n * pipeline escolher uma sem saber de quem é o exame. Ver PRE-424 e PRE-425.\n */\nconst buildReferenceRanges = (\n observation: LabObservationData,\n sourceUnit: string,\n ucumUnit: string,\n): FHIRReferenceRange[] => {\n const quantity = (value: number): FHIRQuantity => ({\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value,\n });\n\n // Devolve lista, e não uma faixa: o caso sem limite nenhum vira lista vazia\n // em vez de `undefined`, e aí os dois caminhos abaixo se compõem com\n // `flatMap` sem ninguém precisar filtrar nada depois.\n const toRanges = (low?: number, high?: number, sex?: 'female' | 'male'): FHIRReferenceRange[] => {\n if (low === undefined && high === undefined) return [];\n\n return [\n {\n ...(sex === undefined ? {} : { appliesTo: [{ coding: [SEX_CODING[sex]] }] }),\n ...(high === undefined ? {} : { high: quantity(high) }),\n ...(low === undefined ? {} : { low: quantity(low) }),\n },\n ];\n };\n\n // A lista anotada tem precedência: quando ela existe, o par simples é o\n // resumo de uma das colunas e repeti-lo publicaria a mesma faixa duas vezes,\n // uma delas sem dizer a quem se aplica.\n //\n // Lista vazia cai no par simples, igual a ausente, e isso é escolha: as duas\n // dizem \"não tenho faixa anotada\", e tratá-las diferente faria um `[]` vindo\n // de um `.filter()` apagar em silêncio a faixa que o chamador também mandou\n // em `referenceMin` e `referenceMax`.\n if (observation.referenceRanges && observation.referenceRanges.length > 0) {\n return observation.referenceRanges.flatMap((r) => toRanges(r.low, r.high, r.appliesTo));\n }\n\n return toRanges(observation.referenceMin, observation.referenceMax);\n};\n\n/**\n * Convert generic lab observation to FHIR Observation\n */\nexport function labObservationToFHIR(\n observation: LabObservationData,\n patientId: string,\n laboratoryName?: string,\n): Addressable<FHIRObservation> {\n const loincCode = codeToLoinc(observation.biomarkerCode);\n // Use default unit if source unit is empty\n const sourceUnit =\n observation.unit || getDefaultUnit(observation.biomarkerCode) || observation.unit;\n const ucumUnit = unitToUCUM(sourceUnit);\n const isQualitative = observation.isQualitative || typeof observation.value === 'string';\n\n // Base observation structure\n const fhirObs: Addressable<FHIRObservation> = {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'laboratory',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n // Sem LOINC, o coding LOINC simplesmente não sai. Antes ia `99999-9`,\n // que não é código LOINC nenhum: publicava sob `http://loinc.org` uma\n // afirmação falsa, e quem consumisse o bundle confiando no system\n // trataria aquilo como código de verdade. Composição corporal, densidade\n // óssea e escore de cálcio não têm LOINC, e o certo é a lacuna explícita.\n coding: [\n ...(loincCode\n ? [\n {\n code: loincCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: LOINC_SYSTEM,\n },\n ]\n : []),\n {\n code: observation.biomarkerCode,\n display: observation.biomarkerName,\n system: BIOMARKER_CODE_SYSTEM,\n },\n ],\n text: observation.biomarkerName,\n },\n effectiveDateTime: observation.collectionDate,\n id: `${observation.reportId}-${observation.biomarkerCode}`,\n interpretation: [\n {\n coding: [\n {\n code: interpretationCode(observation.flag),\n display: interpretationDisplay(observation.flag),\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ],\n performer: laboratoryName ? [{ display: laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'Observation',\n status: 'final',\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n\n // Add value based on type (qualitative = string, quantitative = number)\n if (isQualitative) {\n fhirObs.valueString = String(observation.value);\n } else {\n fhirObs.valueQuantity = {\n code: ucumUnit,\n system: 'http://unitsofmeasure.org',\n unit: sourceUnit,\n value: observation.value as number,\n };\n\n // Reference range only applies to quantitative values\n const referenceRange = buildReferenceRanges(observation, sourceUnit, ucumUnit);\n if (referenceRange.length > 0) fhirObs.referenceRange = referenceRange;\n }\n\n return fhirObs;\n}\n\n/**\n * Convert generic lab report to FHIR DiagnosticReport\n */\nexport function labReportToFHIR(\n report: LabReportData,\n patientId: string,\n observationIds: string[],\n): Addressable<FHIRDiagnosticReport> {\n // Map processing status to FHIR status\n let status: FHIRDiagnosticReport['status'];\n switch (report.processingStatus) {\n case 'complete':\n status = 'final';\n break;\n case 'partial':\n status = 'partial';\n break;\n case 'pending_review':\n status = 'preliminary';\n break;\n default:\n status = 'final';\n }\n\n return {\n category: [\n {\n coding: [\n {\n code: 'LAB',\n display: 'Laboratory',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v2-0074',\n },\n ],\n },\n ],\n code: {\n coding: [\n {\n code: '11502-2', // Laboratory report\n display: 'Laboratory report',\n system: 'http://loinc.org',\n },\n ],\n text: 'Laboratory Results',\n },\n conclusion:\n report.overallStatus === 'NORMAL'\n ? 'All results within normal limits'\n : 'One or more abnormal results detected',\n conclusionCode:\n report.overallStatus === 'ANORMAL'\n ? [\n {\n coding: [\n {\n code: 'A',\n display: 'Abnormal',\n system: 'http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-ObservationInterpretation',\n },\n ],\n },\n ]\n : undefined,\n effectiveDateTime: report.collectionDate,\n id: report.reportId,\n issued: report.createdAt,\n performer: report.laboratoryName ? [{ display: report.laboratoryName }] : undefined,\n resourceType: 'DiagnosticReport',\n result: observationIds.map((id) => ({ reference: `Observation/${id}` })),\n status,\n subject: {\n reference: `Patient/${patientId}`,\n },\n };\n}\n\n/**\n * Convert user profile to FHIR Patient\n * NOTE: CPF is intentionally excluded for privacy (LGPD compliance)\n */\nexport function userProfileToFHIR(profile: UserProfileData): Addressable<FHIRPatient> {\n const nameParts = profile.name.split(' ');\n const given = nameParts.slice(0, -1);\n const family = nameParts[nameParts.length - 1] || '';\n\n return {\n address: profile.address\n ? [\n {\n city: profile.address.city,\n country: profile.address.country || 'BR',\n line: [\n profile.address.street && profile.address.number\n ? `${profile.address.street}, ${profile.address.number}`\n : profile.address.street,\n profile.address.complement,\n ].filter(Boolean) as string[],\n postalCode: profile.address.postalCode,\n state: profile.address.state,\n },\n ]\n : undefined,\n birthDate: profile.birthDate,\n gender: profile.gender,\n id: profile.userId,\n name: [\n {\n family,\n given: given.length > 0 ? given : undefined,\n text: profile.name,\n },\n ],\n resourceType: 'Patient',\n telecom:\n [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ].length > 0\n ? [\n ...(profile.email ? [{ system: 'email' as const, value: profile.email }] : []),\n ...(profile.phone ? [{ system: 'phone' as const, value: profile.phone }] : []),\n ]\n : undefined,\n };\n}\n\n/**\n * Convert complete lab result to FHIR Bundle\n * This is the main function for exporting lab results to FHIR R4 format\n */\nexport function labResultToFHIRBundle(\n report: LabReportData,\n observations: LabObservationData[],\n userProfile: UserProfileData,\n): FHIRBundle {\n const patientId = userProfile.userId;\n\n // Convert observations\n const fhirObservations = observations.map((obs) => {\n const resource = labObservationToFHIR(\n { ...obs, collectionDate: report.collectionDate },\n patientId,\n report.laboratoryName,\n );\n\n return { fullUrl: entryFullUrl(resource), resource };\n });\n\n // Os ids vêm dos recursos já montados, e não de uma segunda montagem da mesma\n // regra. O `DiagnosticReport.result` aponta para eles, e era aqui que a\n // referência se separava do recurso.\n const observationIds = fhirObservations.map((entry) => entry.resource.id);\n\n // Convert report\n const diagnosticReport = labReportToFHIR(report, patientId, observationIds);\n\n // Convert patient\n const fhirPatient = userProfileToFHIR(userProfile);\n\n return {\n entry: [\n { fullUrl: entryFullUrl(fhirPatient), resource: fhirPatient },\n { fullUrl: entryFullUrl(diagnosticReport), resource: diagnosticReport },\n ...fhirObservations,\n ],\n resourceType: 'Bundle',\n type: 'collection',\n };\n}\n"]}
@@ -2638,13 +2638,30 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
2638
2638
  // Regional Body Composition (DEXA)
2639
2639
  // Note: No official LOINC codes exist for regional lean/fat mass measurements
2640
2640
  // Hidden from UI for now - may be shown in future regional breakdown view
2641
+ //
2642
+ // "Arms Total" e "Legs Total" são a linha dos dois membros somados na tabela
2643
+ // de equilíbrio muscular do laudo da Live Lean (GE Lunar Prodigy). Conferido
2644
+ // em cinco laudos: a massa gorda e a magra dessa linha são a soma do lado
2645
+ // direito com o esquerdo, e são o mesmo número das colunas "Arms Fat" e
2646
+ // "Arms Lean" da tabela de tendência e da linha "Arms" da tabela regional.
2647
+ // O modelo nomeia a linha "Arms Total Fat Mass", e sem o nome ela virava
2648
+ // `UNKNOWN_`, enquanto a mesma medida em outra página ia para `ArmsFatMass`:
2649
+ // a série do gráfico partia em dois códigos. O `codeAliases` cobre o que já
2650
+ // foi gravado assim.
2651
+ //
2652
+ // As outras colunas da mesma linha ficam sem código de propósito. "Fat %" e
2653
+ // "Lean %" são percentual do membro, e "Total Mass" é a massa do membro;
2654
+ // o catálogo não tem código regional para nenhum dos dois. "Right Arm" e
2655
+ // "Left Arm" são um lado só, e "Arms Difference" é direito menos esquerdo.
2641
2656
  {
2642
2657
  category: "composicao-corporal",
2643
2658
  code: "ArmsLeanMass",
2659
+ codeAliases: ["UNKNOWN_Arms_Total_Lean_Mass"],
2644
2660
  hidden: true,
2645
2661
  names: {
2646
2662
  en: [
2647
2663
  "Arms Lean Mass",
2664
+ "Arms Total Lean Mass",
2648
2665
  "Arms Lean",
2649
2666
  "Arms Lean Tissue",
2650
2667
  "Arm Lean Mass",
@@ -2671,10 +2688,12 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
2671
2688
  {
2672
2689
  category: "composicao-corporal",
2673
2690
  code: "ArmsFatMass",
2691
+ codeAliases: ["UNKNOWN_Arms_Total_Fat_Mass"],
2674
2692
  hidden: true,
2675
2693
  names: {
2676
2694
  en: [
2677
2695
  "Arms Fat Mass",
2696
+ "Arms Total Fat Mass",
2678
2697
  "Arms Fat",
2679
2698
  "Arms Fat Tissue",
2680
2699
  "Arm Fat Mass",
@@ -2702,10 +2721,12 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
2702
2721
  {
2703
2722
  category: "composicao-corporal",
2704
2723
  code: "LegsLeanMass",
2724
+ codeAliases: ["UNKNOWN_Legs_Total_Lean_Mass"],
2705
2725
  hidden: true,
2706
2726
  names: {
2707
2727
  en: [
2708
2728
  "Legs Lean Mass",
2729
+ "Legs Total Lean Mass",
2709
2730
  "Legs Lean",
2710
2731
  "Legs Lean Tissue",
2711
2732
  "Leg Lean Mass",
@@ -2732,10 +2753,12 @@ var BIOMARKER_DEFINITIONS = [
2732
2753
  {
2733
2754
  category: "composicao-corporal",
2734
2755
  code: "LegsFatMass",
2756
+ codeAliases: ["UNKNOWN_Legs_Total_Fat_Mass"],
2735
2757
  hidden: true,
2736
2758
  names: {
2737
2759
  en: [
2738
2760
  "Legs Fat Mass",
2761
+ "Legs Total Fat Mass",
2739
2762
  "Legs Fat",
2740
2763
  "Legs Fat Tissue",
2741
2764
  "Leg Fat Mass",
@@ -3314,10 +3337,17 @@ function isCacDocument(matchedCodes) {
3314
3337
  function normalizeText(text) {
3315
3338
  return text.replace(/[_\-/]/g, " ").replace(/([a-z])([A-Z])/g, "$1 $2").replace(/([A-Z]+)([A-Z][a-z])/g, "$1 $2").normalize("NFD").replace(/[\u0300-\u036f]/g, "").toLowerCase().replace(/\s+/g, " ").trim();
3316
3339
  }
3340
+ function foldText(text) {
3341
+ return text.normalize("NFD").replace(/[\u0300-\u036f]/g, "").toLowerCase().replace(/[_\-/,]/g, " ").replace(/\s+/g, " ").trim();
3342
+ }
3317
3343
  var normalizedNameToCodeMap = /* @__PURE__ */ new Map();
3344
+ var foldedNameToCodeMap = /* @__PURE__ */ new Map();
3318
3345
  for (const def of BIOMARKER_DEFINITIONS) {
3319
3346
  for (const name of [...def.names.en, ...def.names.pt]) {
3320
3347
  normalizedNameToCodeMap.set(normalizeText(name), def.code);
3348
+ const folded = foldText(name);
3349
+ const owner = foldedNameToCodeMap.get(folded);
3350
+ foldedNameToCodeMap.set(folded, owner === void 0 || owner === def.code ? def.code : null);
3321
3351
  }
3322
3352
  }
3323
3353
  function findCodeByName(name) {
@@ -3328,8 +3358,11 @@ function findCodeByName(name) {
3328
3358
  if (canonical) {
3329
3359
  return canonical;
3330
3360
  }
3331
- const normalized = normalizeText(name);
3332
- return normalizedNameToCodeMap.get(normalized);
3361
+ const normalized = normalizedNameToCodeMap.get(normalizeText(name));
3362
+ if (normalized) {
3363
+ return normalized;
3364
+ }
3365
+ return foldedNameToCodeMap.get(foldText(name)) ?? void 0;
3333
3366
  }
3334
3367
  function validateLoincNameMatch(loinc, name) {
3335
3368
  const loincCode = loincToCode(loinc);
@@ -3411,4 +3444,4 @@ export {
3411
3444
  getBiomarkersByCategory,
3412
3445
  getBiomarkersForCategories
3413
3446
  };
3414
- //# sourceMappingURL=chunk-L4KJ3QWU.js.map
3447
+ //# sourceMappingURL=chunk-PK5DQMPC.js.map