@galaxy-tool-util/schema 1.13.1 → 1.14.0
This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
- package/dist/index.d.ts +4 -2
- package/dist/index.d.ts.map +1 -1
- package/dist/index.js +4 -2
- package/dist/index.js.map +1 -1
- package/dist/test-format/tests.schema.generated.d.ts +47 -0
- package/dist/test-format/tests.schema.generated.d.ts.map +1 -1
- package/dist/test-format/tests.schema.generated.js +62 -0
- package/dist/test-format/tests.schema.generated.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/draft-checks.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/draft-checks.js +105 -59
- package/dist/workflow/draft-checks.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/index.d.ts +4 -2
- package/dist/workflow/index.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/index.js +4 -2
- package/dist/workflow/index.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/layout-properties.d.ts +10 -0
- package/dist/workflow/layout-properties.d.ts.map +1 -0
- package/dist/workflow/layout-properties.js +112 -0
- package/dist/workflow/layout-properties.js.map +1 -0
- package/dist/workflow/layout.d.ts +84 -0
- package/dist/workflow/layout.d.ts.map +1 -0
- package/dist/workflow/layout.js +356 -0
- package/dist/workflow/layout.js.map +1 -0
- package/dist/workflow/lint-rules.d.ts +6 -0
- package/dist/workflow/lint-rules.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/lint-rules.js +6 -0
- package/dist/workflow/lint-rules.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/lint.d.ts +1 -1
- package/dist/workflow/lint.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/lint.js +83 -15
- package/dist/workflow/lint.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/lint_profiles.yml +1 -0
- package/dist/workflow/normalized/expanded.d.ts +12 -0
- package/dist/workflow/normalized/expanded.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/expanded.js +42 -1
- package/dist/workflow/normalized/expanded.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/index.d.ts +2 -2
- package/dist/workflow/normalized/index.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/index.js +2 -2
- package/dist/workflow/normalized/index.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/labels.d.ts +7 -0
- package/dist/workflow/normalized/labels.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/labels.js +11 -0
- package/dist/workflow/normalized/labels.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/toFormat2.d.ts +1 -0
- package/dist/workflow/normalized/toFormat2.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/toFormat2.js +4 -12
- package/dist/workflow/normalized/toFormat2.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/toNative.d.ts +16 -1
- package/dist/workflow/normalized/toNative.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/normalized/toNative.js +23 -6
- package/dist/workflow/normalized/toNative.js.map +1 -1
- package/dist/workflow/semantic-validators.d.ts +9 -0
- package/dist/workflow/semantic-validators.d.ts.map +1 -1
- package/dist/workflow/semantic-validators.js +27 -14
- package/dist/workflow/semantic-validators.js.map +1 -1
- package/package.json +1 -1
package/dist/index.d.ts
CHANGED
|
@@ -103,7 +103,9 @@ expandedFormat2,
|
|
|
103
103
|
/** Normalize + async expand external subworkflow refs in a native workflow. */
|
|
104
104
|
expandedNative,
|
|
105
105
|
/** Check whether a string is a TRS (Tool Registry Service) URL. */
|
|
106
|
-
isTrsUrl,
|
|
106
|
+
isTrsUrl,
|
|
107
|
+
/** Build the GA4GH TRS GALAXY descriptor URL for a TRS tool version URL. */
|
|
108
|
+
trsDescriptorUrl, MAX_EXPANSION_DEPTH, type ExpandedFormat2Workflow, type ExpandedFormat2Step, type ExpandedNativeWorkflow, type ExpandedNativeStep, type RefResolver, type ExpansionOptions,
|
|
107
109
|
/** Convert native workflow to normalized Format2. */
|
|
108
110
|
toFormat2,
|
|
109
111
|
/** Convert Format2 workflow to normalized native. */
|
|
@@ -179,7 +181,7 @@ lintBestPracticesFormat2,
|
|
|
179
181
|
/** Lint best practices for a native Galaxy workflow. */
|
|
180
182
|
lintBestPracticesNative, type LintLevel, type LintResult, type LinterRef, type EmitOptions,
|
|
181
183
|
/** Lint rule classes (one per rule id). */
|
|
182
|
-
NativeStepKeyNotInteger,
|
|
184
|
+
NativeStepKeyNotInteger, StepLabelNotUnique,
|
|
183
185
|
/** Lint profile catalog loader — parses `lint_profiles.yml`. */
|
|
184
186
|
parseLintProfiles, lintProfilesById, rulesForProfile, iwcRuleIds, LINT_PROFILES_FILENAME, IWC_PROFILE_NAMES, type LintProfile,
|
|
185
187
|
/** Strict encoding check — reject JSON-string tool_state (native) or tool_state field misuse (format2). */
|
package/dist/index.d.ts.map
CHANGED
|
@@ -1 +1 @@
|
|
|
1
|
-
{"version":3,"file":"index.d.ts","sourceRoot":"","sources":["../src/index.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;;;;;GAKG;AAEH,OAAO;AACL,0FAA0F;AAC1F,gBAAgB,EAChB,KAAK,mBAAmB;AACxB,4CAA4C;AAC5C,qBAAqB;AACrB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB;AACrB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB,GACtB,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAE3B,OAAO;AACL,2CAA2C;AAC3C,KAAK,wBAAwB;AAC7B,2EAA2E;AAC3E,KAAK,kBAAkB;AACvB,4DAA4D;AAC5D,KAAK,oBAAoB;AACzB,yEAAyE;AACzE,KAAK,uBAAuB;AAC5B,6DAA6D;AAC7D,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,4BAA4B,EACjC,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,yBAAyB,EAC9B,KAAK,uBAAuB,EAC5B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,yBAAyB;AAC9B,sDAAsD;AACtD,KAAK,eAAe;AACpB,iEAAiE;AACjE,KAAK,UAAU;AACf,4DAA4D;AAC5D,KAAK,eAAe;AACpB,wEAAwE;AACxE,KAAK,cAAc,GACpB,MAAM,0BAA0B,CAAC;AAElC,OAAO;AACL,uFAAuF;AACvF,iBAAiB,EACjB,cAAc,EACd,cAAc,EACd,aAAa,EACb,kBAAkB,GACnB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO,EACL,UAAU,EACV,WAAW,EACX,QAAQ,EACR,QAAQ,EACR,WAAW,EACX,OAAO,EACP,QAAQ,EACR,4BAA4B,EAC5B,qCAAqC,EACrC,uCAAuC,EACvC,UAAU,EACV,iBAAiB,EACjB,6BAA6B,EAC7B,oBAAoB,EACpB,cAAc,EACd,iBAAiB,EACjB,eAAe,EACf,iBAAiB,EACjB,gBAAgB,GACjB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO;AACL,+DAA+D;AAC/D,IAAI,IAAI,OAAO;AACf,6BAA6B;AAC7B,WAAW,IAAI,cAAc;AAC7B,2BAA2B;AAC3B,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,QAAQ,IAAI,WAAW,EACvB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,cAAc,IAAI,iBAAiB,EACnC,QAAQ,IAAI,WAAW;AACvB,oEAAoE;AACpE,iBAAiB,GAClB,MAAM,gBAAgB,CAAC;AAExB,OAAO,EACL,KAAK,cAAc;AACnB,6EAA6E;AAC7E,oBAAoB,EACpB,KAAK,mBAAmB;AACxB,2GAA2G;AAC3G,yBAAyB;AACzB,+HAA+H;AAC/H,6BAA6B,EAC7B,KAAK,iBAAiB;AACtB,mGAAmG;AACnG,uBAAuB,EACvB,KAAK,oBAAoB;AACzB,oDAAoD;AACpD,0BAA0B;AAC1B,mFAAmF;AACnF,iBAAiB;AACjB,+EAA+E;AAC/E,eAAe;AACf,wEAAwE;AACxE,gBAAgB,EAChB,+BAA+B,EAC/B,2BAA2B,EAC3B,4BAA4B,EAC5B,6BAA6B,EAC7B,gCAAgC,EAChC,iCAAiC,EACjC,wBAAwB;AACxB,8FAA8F;AAC9F,mBAAmB,EACnB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,yBAAyB,EAC9B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,sBAAsB,EAC3B,KAAK,uBAAuB,EAC5B,KAAK,0BAA0B,EAC/B,KAAK,2BAA2B;AAChC,wFAAwF;AACxF,gBAAgB,EAChB,8BAA8B,EAC9B,0BAA0B,EAC1B,mBAAmB,EACnB,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,aAAa;AAClB,iEAAiE;AACjE,0BAA0B;AAC1B,oEAAoE;AACpE,oBAAoB;AACpB,4EAA4E;AAC5E,8BAA8B;AAC9B,oFAAoF;AACpF,uBAAuB;AACvB,kHAAkH;AAClH,qBAAqB;AACrB,+DAA+D;AAC/D,eAAe;AACf,sEAAsE;AACtE,gBAAgB;AAChB,wEAAwE;AACxE,SAAS,EACT,KAAK,kBAAkB;AACvB,iEAAiE;AACjE,aAAa,EACb,gBAAgB;AAChB,6CAA6C;AAC7C,mBAAmB;AACnB,qEAAqE;AACrE,eAAe;AACf,6DAA6D;AAC7D,mBAAmB;AACnB,gFAAgF;AAChF,eAAe;AACf,+EAA+E;AAC/E,cAAc;AACd,mEAAmE;AACnE,QAAQ,
|
|
1
|
+
{"version":3,"file":"index.d.ts","sourceRoot":"","sources":["../src/index.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;;;;;GAKG;AAEH,OAAO;AACL,0FAA0F;AAC1F,gBAAgB,EAChB,KAAK,mBAAmB;AACxB,4CAA4C;AAC5C,qBAAqB;AACrB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB;AACrB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB,GACtB,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAE3B,OAAO;AACL,2CAA2C;AAC3C,KAAK,wBAAwB;AAC7B,2EAA2E;AAC3E,KAAK,kBAAkB;AACvB,4DAA4D;AAC5D,KAAK,oBAAoB;AACzB,yEAAyE;AACzE,KAAK,uBAAuB;AAC5B,6DAA6D;AAC7D,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,4BAA4B,EACjC,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,yBAAyB,EAC9B,KAAK,uBAAuB,EAC5B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,yBAAyB;AAC9B,sDAAsD;AACtD,KAAK,eAAe;AACpB,iEAAiE;AACjE,KAAK,UAAU;AACf,4DAA4D;AAC5D,KAAK,eAAe;AACpB,wEAAwE;AACxE,KAAK,cAAc,GACpB,MAAM,0BAA0B,CAAC;AAElC,OAAO;AACL,uFAAuF;AACvF,iBAAiB,EACjB,cAAc,EACd,cAAc,EACd,aAAa,EACb,kBAAkB,GACnB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO,EACL,UAAU,EACV,WAAW,EACX,QAAQ,EACR,QAAQ,EACR,WAAW,EACX,OAAO,EACP,QAAQ,EACR,4BAA4B,EAC5B,qCAAqC,EACrC,uCAAuC,EACvC,UAAU,EACV,iBAAiB,EACjB,6BAA6B,EAC7B,oBAAoB,EACpB,cAAc,EACd,iBAAiB,EACjB,eAAe,EACf,iBAAiB,EACjB,gBAAgB,GACjB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO;AACL,+DAA+D;AAC/D,IAAI,IAAI,OAAO;AACf,6BAA6B;AAC7B,WAAW,IAAI,cAAc;AAC7B,2BAA2B;AAC3B,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,QAAQ,IAAI,WAAW,EACvB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,cAAc,IAAI,iBAAiB,EACnC,QAAQ,IAAI,WAAW;AACvB,oEAAoE;AACpE,iBAAiB,GAClB,MAAM,gBAAgB,CAAC;AAExB,OAAO,EACL,KAAK,cAAc;AACnB,6EAA6E;AAC7E,oBAAoB,EACpB,KAAK,mBAAmB;AACxB,2GAA2G;AAC3G,yBAAyB;AACzB,+HAA+H;AAC/H,6BAA6B,EAC7B,KAAK,iBAAiB;AACtB,mGAAmG;AACnG,uBAAuB,EACvB,KAAK,oBAAoB;AACzB,oDAAoD;AACpD,0BAA0B;AAC1B,mFAAmF;AACnF,iBAAiB;AACjB,+EAA+E;AAC/E,eAAe;AACf,wEAAwE;AACxE,gBAAgB,EAChB,+BAA+B,EAC/B,2BAA2B,EAC3B,4BAA4B,EAC5B,6BAA6B,EAC7B,gCAAgC,EAChC,iCAAiC,EACjC,wBAAwB;AACxB,8FAA8F;AAC9F,mBAAmB,EACnB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,yBAAyB,EAC9B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,sBAAsB,EAC3B,KAAK,uBAAuB,EAC5B,KAAK,0BAA0B,EAC/B,KAAK,2BAA2B;AAChC,wFAAwF;AACxF,gBAAgB,EAChB,8BAA8B,EAC9B,0BAA0B,EAC1B,mBAAmB,EACnB,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,aAAa;AAClB,iEAAiE;AACjE,0BAA0B;AAC1B,oEAAoE;AACpE,oBAAoB;AACpB,4EAA4E;AAC5E,8BAA8B;AAC9B,oFAAoF;AACpF,uBAAuB;AACvB,kHAAkH;AAClH,qBAAqB;AACrB,+DAA+D;AAC/D,eAAe;AACf,sEAAsE;AACtE,gBAAgB;AAChB,wEAAwE;AACxE,SAAS,EACT,KAAK,kBAAkB;AACvB,iEAAiE;AACjE,aAAa,EACb,gBAAgB;AAChB,6CAA6C;AAC7C,mBAAmB;AACnB,qEAAqE;AACrE,eAAe;AACf,6DAA6D;AAC7D,mBAAmB;AACnB,gFAAgF;AAChF,eAAe;AACf,+EAA+E;AAC/E,cAAc;AACd,mEAAmE;AACnE,QAAQ;AACR,4EAA4E;AAC5E,gBAAgB,EAChB,mBAAmB,EACnB,KAAK,uBAAuB,EAC5B,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,sBAAsB,EAC3B,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,WAAW,EAChB,KAAK,gBAAgB;AACrB,qDAAqD;AACrD,SAAS;AACT,qDAAqD;AACrD,QAAQ;AACR,0EAA0E;AAC1E,iBAAiB;AACjB,0EAA0E;AAC1E,gBAAgB,EAChB,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,0BAA0B,EAC/B,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,kBAAkB;AACvB,+EAA+E;AAC/E,sBAAsB,EACtB,kBAAkB,EAClB,KAAK,cAAc,EACnB,KAAK,kBAAkB;AACvB,4EAA4E;AAC5E,2BAA2B,EAC3B,uBAAuB,EACvB,wBAAwB;AACxB,6EAA6E;AAC7E,8BAA8B,EAC9B,KAAK,eAAe;AACpB,kFAAkF;AAClF,eAAe,EACf,KAAK,qBAAqB;AAC1B,yFAAyF;AACzF,iBAAiB,EACjB,KAAK,eAAe,EACpB,KAAK,sBAAsB,EAC3B,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,qBAAqB;AAC1B,6EAA6E;AAC7E,aAAa,EACb,KAAK,4BAA4B,EACjC,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,wBAAwB;AAC7B,8EAA8E;AAC9E,aAAa,EACb,KAAK,mBAAmB,EACxB,iBAAiB,EACjB,KAAK,cAAc;AACnB,oGAAoG;AACpG,KAAK,cAAc,EACnB,iBAAiB;AACjB,0DAA0D;AAC1D,iBAAiB,EACjB,KAAK,gBAAgB;AACrB,sFAAsF;AACtF,cAAc,EACd,KAAK,aAAa,EAClB,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,aAAa,EAClB,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,iBAAiB;AACtB,sEAAsE;AACtE,UAAU,EACV,UAAU,EACV,YAAY,EACZ,gBAAgB,EAChB,YAAY,EACZ,oBAAoB,EACpB,KAAK,UAAU;AACf,6EAA6E;AAC7E,YAAY,EACZ,KAAK,cAAc;AACnB,oEAAoE;AACpE,qBAAqB,EACrB,WAAW,EACX,WAAW,EACX,cAAc;AACd,yDAAyD;AACzD,eAAe;AACf,iFAAiF;AACjF,WAAW;AACX,0GAA0G;AAC1G,aAAa;AACb,+FAA+F;AAC/F,aAAa,EACb,KAAK,cAAc;AACnB,2FAA2F;AAC3F,qBAAqB;AACrB,6FAA6F;AAC7F,mBAAmB;AACnB,mEAAmE;AACnE,aAAa,EACb,KAAK,YAAY,EACjB,KAAK,kBAAkB;AACvB,8FAA8F;AAC9F,kBAAkB,EAClB,qBAAqB,EACrB,KAAK,UAAU,EACf,KAAK,WAAW,EAChB,KAAK,aAAa,EAClB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,aAAa;AAClB,2GAA2G;AAC3G,eAAe,EACf,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,qBAAqB;AAC1B,2GAA2G;AAC3G,0BAA0B,EAC1B,KAAK,gCAAgC,EACrC,KAAK,SAAS,EACd,KAAK,QAAQ,EACb,KAAK,YAAY,EACjB,KAAK,OAAO,EACZ,KAAK,OAAO,EACZ,KAAK,WAAW,EAChB,KAAK,yBAAyB,EAC9B,KAAK,qBAAqB;AAC1B,qFAAqF;AACrF,iBAAiB,EACjB,KAAK,wBAAwB;AAC7B,uFAAuF;AACvF,aAAa;AACb,6EAA6E;AAC7E,WAAW;AACX,0EAA0E;AAC1E,WAAW;AACX,+CAA+C;AAC/C,MAAM,EACN,WAAW,EACX,UAAU;AACV,kDAAkD;AAClD,UAAU;AACV,yDAAyD;AACzD,WAAW;AACX,8CAA8C;AAC9C,YAAY;AACZ,yDAAyD;AACzD,wBAAwB;AACxB,wDAAwD;AACxD,uBAAuB,EACvB,KAAK,SAAS,EACd,KAAK,UAAU,EACf,KAAK,SAAS,EACd,KAAK,WAAW;AAChB,2CAA2C;AAC3C,uBAAuB,EACvB,kBAAkB;AAClB,gEAAgE;AAChE,iBAAiB,EACjB,gBAAgB,EAChB,eAAe,EACf,UAAU,EACV,sBAAsB,EACtB,iBAAiB,EACjB,KAAK,WAAW;AAChB,2GAA2G;AAC3G,sBAAsB,EACtB,uBAAuB,EACvB,mBAAmB;AACnB,kFAAkF;AAClF,oBAAoB;AACpB,uGAAuG;AACvG,SAAS;AACT,0EAA0E;AAC1E,eAAe,EACf,qBAAqB,EACrB,cAAc,EACd,oBAAoB,EACpB,mBAAmB,EAEnB,KAAK,UAAU,EACf,aAAa,EACb,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,eAAe,EACpB,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,gBAAgB,EACrB,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,0BAA0B,EAC/B,KAAK,aAAa,EAClB,KAAK,aAAa,EAClB,KAAK,sBAAsB,EAC3B,KAAK,gBAAgB,EACrB,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,+BAA+B,EACpC,KAAK,iBAAiB,EACtB,KAAK,2BAA2B,EAChC,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,sBAAsB,EAC3B,KAAK,yBAAyB,EAC9B,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,QAAQ,EACb,KAAK,YAAY,EACjB,KAAK,cAAc,EACnB,KAAK,QAAQ,EACb,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,YAAY,EACjB,KAAK,UAAU,EACf,KAAK,eAAe,EACpB,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,yBAAyB,EAC9B,KAAK,qBAAqB,EAC1B,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,gBAAgB,EACrB,KAAK,cAAc,EACnB,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,YAAY,EACjB,KAAK,aAAa,EAClB,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,mBAAmB,EACxB,KAAK,aAAa,EAClB,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,cAAc,EACnB,KAAK,eAAe,EACpB,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,gBAAgB,EACrB,KAAK,sBAAsB,EAC3B,KAAK,kBAAkB,EACvB,KAAK,eAAe,EACpB,KAAK,mBAAmB,EACxB,iBAAiB,EACjB,kBAAkB,EAClB,iBAAiB,EACjB,UAAU,EACV,eAAe,EACf,2BAA2B,EAC3B,qBAAqB,EACrB,sBAAsB,EACtB,gCAAgC,EAChC,6BAA6B,EAC7B,6BAA6B,EAC7B,uBAAuB,EACvB,wBAAwB,EACxB,yBAAyB,EACzB,mBAAmB,EACnB,oBAAoB,EACpB,yBAAyB,EACzB,qBAAqB,EACrB,2BAA2B,EAC3B,uBAAuB,EACvB,wBAAwB,EACxB,KAAK,oBAAoB,GAC1B,MAAM,qBAAqB,CAAC;AAE7B,OAAO,EAAE,kBAAkB,EAAE,KAAK,mBAAmB,EAAE,MAAM,2BAA2B,CAAC;AAEzF,OAAO;AACL,yEAAyE;AACzE,iBAAiB;AACjB,0FAA0F;AAC1F,WAAW,EACX,KAAK,oBAAoB;AACzB,yDAAyD;AACzD,KAAK,aAAa;AAClB,0DAA0D;AAC1D,KAAK,cAAc;AACnB,uFAAuF;AACvF,KAAK,gBAAgB;AACrB,8DAA8D;AAC9D,KAAK,aAAa;AAClB,wEAAwE;AACxE,qBAAqB;AACrB,yEAAyE;AACzE,sBAAsB;AACtB,0EAA0E;AAC1E,oBAAoB,EACpB,qBAAqB;AACrB,iFAAiF;AACjF,mBAAmB,EACnB,oBAAoB;AACpB,6GAA6G;AAC7G,gBAAgB;AAChB,mFAAmF;AACnF,QAAQ;AACR,sFAAsF;AACtF,yBAAyB,GAC1B,MAAM,wBAAwB,CAAC;AAEhC,OAAO;AACL,kEAAkE;AAClE,sBAAsB;AACtB,8EAA8E;AAC9E,oBAAoB;AACpB,2FAA2F;AAC3F,iBAAiB,EACjB,KAAK,wBAAwB,EAC7B,KAAK,6BAA6B,GACnC,MAAM,6BAA6B,CAAC;AAErC,OAAO;AACL,mFAAmF;AACnF,eAAe;AACf,2FAA2F;AAC3F,aAAa,EACb,KAAK,oBAAoB,EACzB,KAAK,sBAAsB;AAC3B,sFAAsF;AACtF,qBAAqB;AACrB,qEAAqE;AACrE,WAAW;AACX,yEAAyE;AACzE,kBAAkB;AAClB,2EAA2E;AAC3E,eAAe,EACf,cAAc,EACd,KAAK,WAAW,EAChB,KAAK,UAAU,EACf,KAAK,SAAS,GACf,MAAM,4BAA4B,CAAC"}
|
package/dist/index.js
CHANGED
|
@@ -84,7 +84,9 @@ expandedFormat2,
|
|
|
84
84
|
/** Normalize + async expand external subworkflow refs in a native workflow. */
|
|
85
85
|
expandedNative,
|
|
86
86
|
/** Check whether a string is a TRS (Tool Registry Service) URL. */
|
|
87
|
-
isTrsUrl,
|
|
87
|
+
isTrsUrl,
|
|
88
|
+
/** Build the GA4GH TRS GALAXY descriptor URL for a TRS tool version URL. */
|
|
89
|
+
trsDescriptorUrl, MAX_EXPANSION_DEPTH,
|
|
88
90
|
/** Convert native workflow to normalized Format2. */
|
|
89
91
|
toFormat2,
|
|
90
92
|
/** Convert Format2 workflow to normalized native. */
|
|
@@ -158,7 +160,7 @@ lintBestPracticesFormat2,
|
|
|
158
160
|
/** Lint best practices for a native Galaxy workflow. */
|
|
159
161
|
lintBestPracticesNative,
|
|
160
162
|
/** Lint rule classes (one per rule id). */
|
|
161
|
-
NativeStepKeyNotInteger,
|
|
163
|
+
NativeStepKeyNotInteger, StepLabelNotUnique,
|
|
162
164
|
/** Lint profile catalog loader — parses `lint_profiles.yml`. */
|
|
163
165
|
parseLintProfiles, lintProfilesById, rulesForProfile, iwcRuleIds, LINT_PROFILES_FILENAME, IWC_PROFILE_NAMES,
|
|
164
166
|
/** Strict encoding check — reject JSON-string tool_state (native) or tool_state field misuse (format2). */
|
package/dist/index.js.map
CHANGED
|
@@ -1 +1 @@
|
|
|
1
|
-
{"version":3,"file":"index.js","sourceRoot":"","sources":["../src/index.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;;;;;GAKG;AAEH,OAAO;AACL,0FAA0F;AAC1F,gBAAgB;AAEhB,4CAA4C;AAC5C,qBAAqB;AACrB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB;AACrB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB,GACtB,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAoC3B,OAAO;AACL,uFAAuF;AACvF,iBAAiB,EACjB,cAAc,EACd,cAAc,EACd,aAAa,EACb,kBAAkB,GACnB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO,EACL,UAAU,EACV,WAAW,EACX,QAAQ,EACR,QAAQ,EACR,WAAW,EACX,OAAO,EACP,QAAQ,EACR,4BAA4B,EAC5B,qCAAqC,EACrC,uCAAuC,EACvC,UAAU,EACV,iBAAiB,EACjB,6BAA6B,EAC7B,oBAAoB,EACpB,cAAc,EACd,iBAAiB,EACjB,eAAe,EACf,iBAAiB,EACjB,gBAAgB,GACjB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO;AACL,+DAA+D;AAC/D,IAAI,IAAI,OAAO;AACf,6BAA6B;AAC7B,WAAW,IAAI,cAAc;AAC7B,2BAA2B;AAC3B,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,QAAQ,IAAI,WAAW,EACvB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,cAAc,IAAI,iBAAiB,EACnC,QAAQ,IAAI,WAAW;AACvB,oEAAoE;AACpE,iBAAiB,GAClB,MAAM,gBAAgB,CAAC;AAExB,OAAO;AAEL,6EAA6E;AAC7E,oBAAoB;AAEpB,2GAA2G;AAC3G,yBAAyB;AACzB,+HAA+H;AAC/H,6BAA6B;AAE7B,mGAAmG;AACnG,uBAAuB;AAEvB,oDAAoD;AACpD,0BAA0B;AAC1B,mFAAmF;AACnF,iBAAiB;AACjB,+EAA+E;AAC/E,eAAe;AACf,wEAAwE;AACxE,gBAAgB,EAChB,+BAA+B,EAC/B,2BAA2B,EAC3B,4BAA4B,EAC5B,6BAA6B,EAC7B,gCAAgC,EAChC,iCAAiC,EACjC,wBAAwB;AACxB,8FAA8F;AAC9F,mBAAmB;AAQnB,wFAAwF;AACxF,gBAAgB,EAChB,8BAA8B,EAC9B,0BAA0B,EAC1B,mBAAmB;AAInB,iEAAiE;AACjE,0BAA0B;AAC1B,oEAAoE;AACpE,oBAAoB;AACpB,4EAA4E;AAC5E,8BAA8B;AAC9B,oFAAoF;AACpF,uBAAuB;AACvB,kHAAkH;AAClH,qBAAqB;AACrB,+DAA+D;AAC/D,eAAe;AACf,sEAAsE;AACtE,gBAAgB;AAChB,wEAAwE;AACxE,SAAS;AAET,iEAAiE;AACjE,aAAa,EACb,gBAAgB;AAChB,6CAA6C;AAC7C,mBAAmB;AACnB,qEAAqE;AACrE,eAAe;AACf,6DAA6D;AAC7D,mBAAmB;AACnB,gFAAgF;AAChF,eAAe;AACf,+EAA+E;AAC/E,cAAc;AACd,mEAAmE;AACnE,QAAQ,
|
|
1
|
+
{"version":3,"file":"index.js","sourceRoot":"","sources":["../src/index.ts"],"names":[],"mappings":"AAAA;;;;;GAKG;AAEH,OAAO;AACL,0FAA0F;AAC1F,gBAAgB;AAEhB,4CAA4C;AAC5C,qBAAqB;AACrB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,wEAAwE;AACxE,yBAAyB;AACzB,6DAA6D;AAC7D,wBAAwB;AACxB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB;AACrB,gEAAgE;AAChE,qBAAqB,GACtB,MAAM,mBAAmB,CAAC;AAoC3B,OAAO;AACL,uFAAuF;AACvF,iBAAiB,EACjB,cAAc,EACd,cAAc,EACd,aAAa,EACb,kBAAkB,GACnB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO,EACL,UAAU,EACV,WAAW,EACX,QAAQ,EACR,QAAQ,EACR,WAAW,EACX,OAAO,EACP,QAAQ,EACR,4BAA4B,EAC5B,qCAAqC,EACrC,uCAAuC,EACvC,UAAU,EACV,iBAAiB,EACjB,6BAA6B,EAC7B,oBAAoB,EACpB,cAAc,EACd,iBAAiB,EACjB,eAAe,EACf,iBAAiB,EACjB,gBAAgB,GACjB,MAAM,yBAAyB,CAAC;AAEjC,OAAO;AACL,+DAA+D;AAC/D,IAAI,IAAI,OAAO;AACf,6BAA6B;AAC7B,WAAW,IAAI,cAAc;AAC7B,2BAA2B;AAC3B,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,QAAQ,IAAI,WAAW,EACvB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,SAAS,IAAI,YAAY,EACzB,cAAc,IAAI,iBAAiB,EACnC,QAAQ,IAAI,WAAW;AACvB,oEAAoE;AACpE,iBAAiB,GAClB,MAAM,gBAAgB,CAAC;AAExB,OAAO;AAEL,6EAA6E;AAC7E,oBAAoB;AAEpB,2GAA2G;AAC3G,yBAAyB;AACzB,+HAA+H;AAC/H,6BAA6B;AAE7B,mGAAmG;AACnG,uBAAuB;AAEvB,oDAAoD;AACpD,0BAA0B;AAC1B,mFAAmF;AACnF,iBAAiB;AACjB,+EAA+E;AAC/E,eAAe;AACf,wEAAwE;AACxE,gBAAgB,EAChB,+BAA+B,EAC/B,2BAA2B,EAC3B,4BAA4B,EAC5B,6BAA6B,EAC7B,gCAAgC,EAChC,iCAAiC,EACjC,wBAAwB;AACxB,8FAA8F;AAC9F,mBAAmB;AAQnB,wFAAwF;AACxF,gBAAgB,EAChB,8BAA8B,EAC9B,0BAA0B,EAC1B,mBAAmB;AAInB,iEAAiE;AACjE,0BAA0B;AAC1B,oEAAoE;AACpE,oBAAoB;AACpB,4EAA4E;AAC5E,8BAA8B;AAC9B,oFAAoF;AACpF,uBAAuB;AACvB,kHAAkH;AAClH,qBAAqB;AACrB,+DAA+D;AAC/D,eAAe;AACf,sEAAsE;AACtE,gBAAgB;AAChB,wEAAwE;AACxE,SAAS;AAET,iEAAiE;AACjE,aAAa,EACb,gBAAgB;AAChB,6CAA6C;AAC7C,mBAAmB;AACnB,qEAAqE;AACrE,eAAe;AACf,6DAA6D;AAC7D,mBAAmB;AACnB,gFAAgF;AAChF,eAAe;AACf,+EAA+E;AAC/E,cAAc;AACd,mEAAmE;AACnE,QAAQ;AACR,4EAA4E;AAC5E,gBAAgB,EAChB,mBAAmB;AAOnB,qDAAqD;AACrD,SAAS;AACT,qDAAqD;AACrD,QAAQ;AACR,0EAA0E;AAC1E,iBAAiB;AACjB,0EAA0E;AAC1E,gBAAgB;AAMhB,+EAA+E;AAC/E,sBAAsB,EACtB,kBAAkB;AAGlB,4EAA4E;AAC5E,2BAA2B,EAC3B,uBAAuB,EACvB,wBAAwB;AACxB,6EAA6E;AAC7E,8BAA8B;AAE9B,kFAAkF;AAClF,eAAe;AAEf,yFAAyF;AACzF,iBAAiB;AAMjB,6EAA6E;AAC7E,aAAa;AAIb,8EAA8E;AAC9E,aAAa,EAEb,iBAAiB,EAIjB,iBAAiB;AACjB,0DAA0D;AAC1D,iBAAiB;AAEjB,sFAAsF;AACtF,cAAc;AAUd,sEAAsE;AACtE,UAAU,EACV,UAAU,EACV,YAAY,EACZ,gBAAgB,EAChB,YAAY,EACZ,oBAAoB;AAEpB,6EAA6E;AAC7E,YAAY;AAEZ,oEAAoE;AACpE,qBAAqB,EACrB,WAAW,EACX,WAAW,EACX,cAAc;AACd,yDAAyD;AACzD,eAAe;AACf,iFAAiF;AACjF,WAAW;AACX,0GAA0G;AAC1G,aAAa;AACb,+FAA+F;AAC/F,aAAa;AAEb,2FAA2F;AAC3F,qBAAqB;AACrB,6FAA6F;AAC7F,mBAAmB;AACnB,mEAAmE;AACnE,aAAa;AAGb,8FAA8F;AAC9F,kBAAkB,EAClB,qBAAqB;AAMrB,2GAA2G;AAC3G,eAAe;AAGf,2GAA2G;AAC3G,0BAA0B;AAU1B,qFAAqF;AACrF,iBAAiB;AAEjB,uFAAuF;AACvF,aAAa;AACb,6EAA6E;AAC7E,WAAW;AACX,0EAA0E;AAC1E,WAAW;AACX,+CAA+C;AAC/C,MAAM,EACN,WAAW,EACX,UAAU;AACV,kDAAkD;AAClD,UAAU;AACV,yDAAyD;AACzD,WAAW;AACX,8CAA8C;AAC9C,YAAY;AACZ,yDAAyD;AACzD,wBAAwB;AACxB,wDAAwD;AACxD,uBAAuB;AAKvB,2CAA2C;AAC3C,uBAAuB,EACvB,kBAAkB;AAClB,gEAAgE;AAChE,iBAAiB,EACjB,gBAAgB,EAChB,eAAe,EACf,UAAU,EACV,sBAAsB,EACtB,iBAAiB;AAEjB,2GAA2G;AAC3G,sBAAsB,EACtB,uBAAuB,EACvB,mBAAmB;AACnB,kFAAkF;AAClF,oBAAoB;AACpB,uGAAuG;AACvG,SAAS;AACT,0EAA0E;AAC1E,eAAe,EACf,qBAAqB,EACrB,cAAc,EACd,oBAAoB,EACpB,mBAAmB,EAGnB,aAAa,EAiDb,iBAAiB,EACjB,kBAAkB,EAClB,iBAAiB,EACjB,UAAU,EACV,eAAe,EACf,2BAA2B,EAC3B,qBAAqB,EACrB,sBAAsB,EACtB,gCAAgC,EAChC,6BAA6B,EAC7B,6BAA6B,EAC7B,uBAAuB,EACvB,wBAAwB,EACxB,yBAAyB,EACzB,mBAAmB,EACnB,oBAAoB,EACpB,yBAAyB,EACzB,qBAAqB,EACrB,2BAA2B,EAC3B,uBAAuB,EACvB,wBAAwB,GAEzB,MAAM,qBAAqB,CAAC;AAE7B,OAAO,EAAE,kBAAkB,EAA4B,MAAM,2BAA2B,CAAC;AAEzF,OAAO;AACL,yEAAyE;AACzE,iBAAiB;AACjB,0FAA0F;AAC1F,WAAW;AAUX,wEAAwE;AACxE,qBAAqB;AACrB,yEAAyE;AACzE,sBAAsB;AACtB,0EAA0E;AAC1E,oBAAoB,EACpB,qBAAqB;AACrB,iFAAiF;AACjF,mBAAmB,EACnB,oBAAoB;AACpB,6GAA6G;AAC7G,gBAAgB;AAChB,mFAAmF;AACnF,QAAQ;AACR,sFAAsF;AACtF,yBAAyB,GAC1B,MAAM,wBAAwB,CAAC;AAEhC,OAAO;AACL,kEAAkE;AAClE,sBAAsB;AACtB,8EAA8E;AAC9E,oBAAoB;AACpB,2FAA2F;AAC3F,iBAAiB,GAGlB,MAAM,6BAA6B,CAAC;AAErC,OAAO;AACL,mFAAmF;AACnF,eAAe;AACf,2FAA2F;AAC3F,aAAa;AAGb,sFAAsF;AACtF,qBAAqB;AACrB,qEAAqE;AACrE,WAAW;AACX,yEAAyE;AACzE,kBAAkB;AAClB,2EAA2E;AAC3E,eAAe,EACf,cAAc,GAIf,MAAM,4BAA4B,CAAC"}
|
|
@@ -843,6 +843,15 @@ export declare const testsSchema: {
|
|
|
843
843
|
readonly default: "Collection";
|
|
844
844
|
readonly title: "Class";
|
|
845
845
|
};
|
|
846
|
+
readonly count: {
|
|
847
|
+
readonly anyOf: readonly [{
|
|
848
|
+
readonly type: "integer";
|
|
849
|
+
}, {
|
|
850
|
+
readonly type: "null";
|
|
851
|
+
}];
|
|
852
|
+
readonly default: null;
|
|
853
|
+
readonly title: "Count";
|
|
854
|
+
};
|
|
846
855
|
readonly element_tests: {
|
|
847
856
|
readonly anyOf: readonly [{
|
|
848
857
|
readonly additionalProperties: {
|
|
@@ -895,6 +904,24 @@ export declare const testsSchema: {
|
|
|
895
904
|
readonly default: null;
|
|
896
905
|
readonly title: "Elements";
|
|
897
906
|
};
|
|
907
|
+
readonly max: {
|
|
908
|
+
readonly anyOf: readonly [{
|
|
909
|
+
readonly type: "integer";
|
|
910
|
+
}, {
|
|
911
|
+
readonly type: "null";
|
|
912
|
+
}];
|
|
913
|
+
readonly default: null;
|
|
914
|
+
readonly title: "Maximum Count";
|
|
915
|
+
};
|
|
916
|
+
readonly min: {
|
|
917
|
+
readonly anyOf: readonly [{
|
|
918
|
+
readonly type: "integer";
|
|
919
|
+
}, {
|
|
920
|
+
readonly type: "null";
|
|
921
|
+
}];
|
|
922
|
+
readonly default: null;
|
|
923
|
+
readonly title: "Minimum Count";
|
|
924
|
+
};
|
|
898
925
|
};
|
|
899
926
|
readonly title: "TestCollectionCollectionElementAssertions";
|
|
900
927
|
readonly type: "object";
|
|
@@ -1047,6 +1074,16 @@ export declare const testsSchema: {
|
|
|
1047
1074
|
readonly description: "Applies only if `compare` is `diff`, `re_match` or `re_match_multiline`. Sorts the lines of the history data set before comparison; for `diff` and `re_match` the local file is also sorted. Useful for non-deterministic output.";
|
|
1048
1075
|
readonly title: "Sort";
|
|
1049
1076
|
};
|
|
1077
|
+
readonly visible: {
|
|
1078
|
+
readonly anyOf: readonly [{
|
|
1079
|
+
readonly type: "boolean";
|
|
1080
|
+
}, {
|
|
1081
|
+
readonly type: "null";
|
|
1082
|
+
}];
|
|
1083
|
+
readonly default: null;
|
|
1084
|
+
readonly description: "If specified, this value is checked against whether the corresponding output is shown in the history. Use to test outputs a tool or workflow is expected to hide, for instance via a `HideDatasetAction` post job action.";
|
|
1085
|
+
readonly title: "Visible";
|
|
1086
|
+
};
|
|
1050
1087
|
};
|
|
1051
1088
|
readonly title: "TestCollectionDatasetElementAssertions";
|
|
1052
1089
|
readonly type: "object";
|
|
@@ -1295,6 +1332,16 @@ export declare const testsSchema: {
|
|
|
1295
1332
|
readonly description: "Applies only if `compare` is `diff`, `re_match` or `re_match_multiline`. Sorts the lines of the history data set before comparison; for `diff` and `re_match` the local file is also sorted. Useful for non-deterministic output.";
|
|
1296
1333
|
readonly title: "Sort";
|
|
1297
1334
|
};
|
|
1335
|
+
readonly visible: {
|
|
1336
|
+
readonly anyOf: readonly [{
|
|
1337
|
+
readonly type: "boolean";
|
|
1338
|
+
}, {
|
|
1339
|
+
readonly type: "null";
|
|
1340
|
+
}];
|
|
1341
|
+
readonly default: null;
|
|
1342
|
+
readonly description: "If specified, this value is checked against whether the corresponding output is shown in the history. Use to test outputs a tool or workflow is expected to hide, for instance via a `HideDatasetAction` post job action.";
|
|
1343
|
+
readonly title: "Visible";
|
|
1344
|
+
};
|
|
1298
1345
|
};
|
|
1299
1346
|
readonly title: "TestDataOutputAssertions";
|
|
1300
1347
|
readonly type: "object";
|
|
@@ -1 +1 @@
|
|
|
1
|
-
{"version":3,"file":"tests.schema.generated.d.ts","sourceRoot":"","sources":["../../src/test-format/tests.schema.generated.ts"],"names":[],"mappings":"AAEA,eAAO,MAAM,WAAW
|
|
1
|
+
{"version":3,"file":"tests.schema.generated.d.ts","sourceRoot":"","sources":["../../src/test-format/tests.schema.generated.ts"],"names":[],"mappings":"AAEA,eAAO,MAAM,WAAW;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;CAwrOd,CAAC"}
|
|
@@ -1081,6 +1081,18 @@ export const testsSchema = {
|
|
|
1081
1081
|
default: "Collection",
|
|
1082
1082
|
title: "Class",
|
|
1083
1083
|
},
|
|
1084
|
+
count: {
|
|
1085
|
+
anyOf: [
|
|
1086
|
+
{
|
|
1087
|
+
type: "integer",
|
|
1088
|
+
},
|
|
1089
|
+
{
|
|
1090
|
+
type: "null",
|
|
1091
|
+
},
|
|
1092
|
+
],
|
|
1093
|
+
default: null,
|
|
1094
|
+
title: "Count",
|
|
1095
|
+
},
|
|
1084
1096
|
element_tests: {
|
|
1085
1097
|
anyOf: [
|
|
1086
1098
|
{
|
|
@@ -1139,6 +1151,30 @@ export const testsSchema = {
|
|
|
1139
1151
|
default: null,
|
|
1140
1152
|
title: "Elements",
|
|
1141
1153
|
},
|
|
1154
|
+
max: {
|
|
1155
|
+
anyOf: [
|
|
1156
|
+
{
|
|
1157
|
+
type: "integer",
|
|
1158
|
+
},
|
|
1159
|
+
{
|
|
1160
|
+
type: "null",
|
|
1161
|
+
},
|
|
1162
|
+
],
|
|
1163
|
+
default: null,
|
|
1164
|
+
title: "Maximum Count",
|
|
1165
|
+
},
|
|
1166
|
+
min: {
|
|
1167
|
+
anyOf: [
|
|
1168
|
+
{
|
|
1169
|
+
type: "integer",
|
|
1170
|
+
},
|
|
1171
|
+
{
|
|
1172
|
+
type: "null",
|
|
1173
|
+
},
|
|
1174
|
+
],
|
|
1175
|
+
default: null,
|
|
1176
|
+
title: "Minimum Count",
|
|
1177
|
+
},
|
|
1142
1178
|
},
|
|
1143
1179
|
title: "TestCollectionCollectionElementAssertions",
|
|
1144
1180
|
type: "object",
|
|
@@ -1334,6 +1370,19 @@ export const testsSchema = {
|
|
|
1334
1370
|
description: "Applies only if `compare` is `diff`, `re_match` or `re_match_multiline`. Sorts the lines of the history data set before comparison; for `diff` and `re_match` the local file is also sorted. Useful for non-deterministic output.",
|
|
1335
1371
|
title: "Sort",
|
|
1336
1372
|
},
|
|
1373
|
+
visible: {
|
|
1374
|
+
anyOf: [
|
|
1375
|
+
{
|
|
1376
|
+
type: "boolean",
|
|
1377
|
+
},
|
|
1378
|
+
{
|
|
1379
|
+
type: "null",
|
|
1380
|
+
},
|
|
1381
|
+
],
|
|
1382
|
+
default: null,
|
|
1383
|
+
description: "If specified, this value is checked against whether the corresponding output is shown in the history. Use to test outputs a tool or workflow is expected to hide, for instance via a `HideDatasetAction` post job action.",
|
|
1384
|
+
title: "Visible",
|
|
1385
|
+
},
|
|
1337
1386
|
},
|
|
1338
1387
|
title: "TestCollectionDatasetElementAssertions",
|
|
1339
1388
|
type: "object",
|
|
@@ -1643,6 +1692,19 @@ export const testsSchema = {
|
|
|
1643
1692
|
description: "Applies only if `compare` is `diff`, `re_match` or `re_match_multiline`. Sorts the lines of the history data set before comparison; for `diff` and `re_match` the local file is also sorted. Useful for non-deterministic output.",
|
|
1644
1693
|
title: "Sort",
|
|
1645
1694
|
},
|
|
1695
|
+
visible: {
|
|
1696
|
+
anyOf: [
|
|
1697
|
+
{
|
|
1698
|
+
type: "boolean",
|
|
1699
|
+
},
|
|
1700
|
+
{
|
|
1701
|
+
type: "null",
|
|
1702
|
+
},
|
|
1703
|
+
],
|
|
1704
|
+
default: null,
|
|
1705
|
+
description: "If specified, this value is checked against whether the corresponding output is shown in the history. Use to test outputs a tool or workflow is expected to hide, for instance via a `HideDatasetAction` post job action.",
|
|
1706
|
+
title: "Visible",
|
|
1707
|
+
},
|
|
1646
1708
|
},
|
|
1647
1709
|
title: "TestDataOutputAssertions",
|
|
1648
1710
|
type: "object",
|