@datagrok/bio 2.21.11 → 2.22.0

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  1. package/CHANGELOG.md +6 -0
  2. package/dist/package-test.js +3 -3
  3. package/dist/package-test.js.map +1 -1
  4. package/dist/package.js +6 -6
  5. package/dist/package.js.map +1 -1
  6. package/package.json +3 -3
  7. package/src/package.ts +5 -6
  8. package/src/utils/seq-helper/seq-handler.ts +1 -1
  9. package/src/viewers/web-logo-viewer.ts +1 -1
  10. package/src/widgets/composition-analysis-widget.ts +1 -38
  11. package/src/widgets/sequence-scrolling-widget.ts +492 -89
  12. package/test-console-output-1.log +315 -327
  13. package/test-record-1.mp4 +0 -0
  14. package/src/package.js +0 -529
package/test-record-1.mp4 CHANGED
Binary file
package/src/package.js DELETED
@@ -1,529 +0,0 @@
1
- "use strict";
2
- exports.__esModule = true;
3
- exports.sequenceAlignment = exports._package = void 0;
4
- /* Do not change these import lines to match external modules in webpack configuration */
5
- var grok = require("datagrok-api/grok");
6
- var ui = require("datagrok-api/ui");
7
- var DG = require("datagrok-api/dg");
8
- exports._package = new DG.Package();
9
- var Cell = /** @class */ (function () {
10
- function Cell() {
11
- this.value = 0;
12
- this.parentI = 0;
13
- this.parentJ = 0;
14
- }
15
- return Cell;
16
- }());
17
- ;
18
- var Aligned = /** @class */ (function () {
19
- function Aligned(seq1_, seq2_, score_) {
20
- this.seq1 = seq1_;
21
- this.seq2 = seq2_;
22
- this.score = score_;
23
- }
24
- return Aligned;
25
- }());
26
- ;
27
- var SequenceAlignment = /** @class */ (function () {
28
- function SequenceAlignment(seq1_, seq2_, gap_, alignGrid_) {
29
- if (alignGrid_ === void 0) { alignGrid_ = ""; }
30
- this.connections = {};
31
- this.BLOSUM45 = [[5, -2, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -2, -1, -1, -1, -1, -2, -1, 1, 0, -2, -2, 0, -1, -1, 0, -5],
32
- [-2, 7, 0, -1, -3, 1, 0, -2, 0, -3, -2, 3, -1, -2, -2, -1, -1, -2, -1, -2, -1, 0, -1, -5],
33
- [-1, 0, 6, 2, -2, 0, 0, 0, 1, -2, -3, 0, -2, -2, -2, 1, 0, -4, -2, -3, 4, 0, -1, -5],
34
- [-2, -1, 2, 7, -3, 0, 2, -1, 0, -4, -3, 0, -3, -4, -1, 0, -1, -4, -2, -3, 5, 1, -1, -5],
35
- [-1, -3, -2, -3, 12, -3, -3, -3, -3, -3, -2, -3, -2, -2, -4, -1, -1, -5, -3, -1, -2, -3, -2, -5],
36
- [-1, 1, 0, 0, -3, 6, 2, -2, 1, -2, -2, 1, 0, -4, -1, 0, -1, -2, -1, -3, 0, 4, -1, -5],
37
- [-1, 0, 0, 2, -3, 2, 6, -2, 0, -3, -2, 1, -2, -3, 0, 0, -1, -3, -2, -3, 1, 4, -1, -5],
38
- [0, -2, 0, -1, -3, -2, -2, 7, -2, -4, -3, -2, -2, -3, -2, 0, -2, -2, -3, -3, -1, -2, -1, -5],
39
- [-2, 0, 1, 0, -3, 1, 0, -2, 10, -3, -2, -1, 0, -2, -2, -1, -2, -3, 2, -3, 0, 0, -1, -5],
40
- [-1, -3, -2, -4, -3, -2, -3, -4, -3, 5, 2, -3, 2, 0, -2, -2, -1, -2, 0, 3, -3, -3, -1, -5],
41
- [-1, -2, -3, -3, -2, -2, -2, -3, -2, 2, 5, -3, 2, 1, -3, -3, -1, -2, 0, 1, -3, -2, -1, -5],
42
- [-1, 3, 0, 0, -3, 1, 1, -2, -1, -3, -3, 5, -1, -3, -1, -1, -1, -2, -1, -2, 0, 1, -1, -5],
43
- [-1, -1, -2, -3, -2, 0, -2, -2, 0, 2, 2, -1, 6, 0, -2, -2, -1, -2, 0, 1, -2, -1, -1, -5],
44
- [-2, -2, -2, -4, -2, -4, -3, -3, -2, 0, 1, -3, 0, 8, -3, -2, -1, 1, 3, 0, -3, -3, -1, -5],
45
- [-1, -2, -2, -1, -4, -1, 0, -2, -2, -2, -3, -1, -2, -3, 9, -1, -1, -3, -3, -3, -2, -1, -1, -5],
46
- [1, -1, 1, 0, -1, 0, 0, 0, -1, -2, -3, -1, -2, -2, -1, 4, 2, -4, -2, -1, 0, 0, 0, -5],
47
- [0, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 2, 5, -3, -1, 0, 0, -1, 0, -5],
48
- [-2, -2, -4, -4, -5, -2, -3, -2, -3, -2, -2, -2, -2, 1, -3, -4, -3, 15, 3, -3, -4, -2, -2, -5],
49
- [-2, -1, -2, -2, -3, -1, -2, -3, 2, 0, 0, -1, 0, 3, -3, -2, -1, 3, 8, -1, -2, -2, -1, -5],
50
- [0, -2, -3, -3, -1, -3, -3, -3, -3, 3, 1, -2, 1, 0, -3, -1, 0, -3, -1, 5, -3, -3, -1, -5],
51
- [-1, -1, 4, 5, -2, 0, 1, -1, 0, -3, -3, 0, -2, -3, -2, 0, 0, -4, -2, -3, 4, 2, -1, -5],
52
- [-1, 0, 0, 1, -3, 4, 4, -2, 0, -3, -2, 1, -1, -3, -1, 0, -1, -2, -2, -3, 2, 4, -1, -5],
53
- [0, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, 0, 0, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -5],
54
- [-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1]];
55
- this.BLOSUM50 = [[5, -2, -1, -2, -1, -1, -1, 0, -2, -1, -2, -1, -1, -3, -1, 1, 0, -3, -2, 0, -2, -1, -1, -5],
56
- [-2, 7, -1, -2, -4, 1, 0, -3, 0, -4, -3, 3, -2, -3, -3, -1, -1, -3, -1, -3, -1, 0, -1, -5],
57
- [-1, -1, 7, 2, -2, 0, 0, 0, 1, -3, -4, 0, -2, -4, -2, 1, 0, -4, -2, -3, 4, 0, -1, -5],
58
- [-2, -2, 2, 8, -4, 0, 2, -1, -1, -4, -4, -1, -4, -5, -1, 0, -1, -5, -3, -4, 5, 1, -1, -5],
59
- [-1, -4, -2, -4, 13, -3, -3, -3, -3, -2, -2, -3, -2, -2, -4, -1, -1, -5, -3, -1, -3, -3, -2, -5],
60
- [-1, 1, 0, 0, -3, 7, 2, -2, 1, -3, -2, 2, 0, -4, -1, 0, -1, -1, -1, -3, 0, 4, -1, -5],
61
- [-1, 0, 0, 2, -3, 2, 6, -3, 0, -4, -3, 1, -2, -3, -1, -1, -1, -3, -2, -3, 1, 5, -1, -5],
62
- [0, -3, 0, -1, -3, -2, -3, 8, -2, -4, -4, -2, -3, -4, -2, 0, -2, -3, -3, -4, -1, -2, -2, -5],
63
- [-2, 0, 1, -1, -3, 1, 0, -2, 10, -4, -3, 0, -1, -1, -2, -1, -2, -3, 2, -4, 0, 0, -1, -5],
64
- [-1, -4, -3, -4, -2, -3, -4, -4, -4, 5, 2, -3, 2, 0, -3, -3, -1, -3, -1, 4, -4, -3, -1, -5],
65
- [-2, -3, -4, -4, -2, -2, -3, -4, -3, 2, 5, -3, 3, 1, -4, -3, -1, -2, -1, 1, -4, -3, -1, -5],
66
- [-1, 3, 0, -1, -3, 2, 1, -2, 0, -3, -3, 6, -2, -4, -1, 0, -1, -3, -2, -3, 0, 1, -1, -5],
67
- [-1, -2, -2, -4, -2, 0, -2, -3, -1, 2, 3, -2, 7, 0, -3, -2, -1, -1, 0, 1, -3, -1, -1, -5],
68
- [-3, -3, -4, -5, -2, -4, -3, -4, -1, 0, 1, -4, 0, 8, -4, -3, -2, 1, 4, -1, -4, -4, -2, -5],
69
- [-1, -3, -2, -1, -4, -1, -1, -2, -2, -3, -4, -1, -3, -4, 10, -1, -1, -4, -3, -3, -2, -1, -2, -5],
70
- [1, -1, 1, 0, -1, 0, -1, 0, -1, -3, -3, 0, -2, -3, -1, 5, 2, -4, -2, -2, 0, 0, -1, -5],
71
- [0, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -1, -1, -2, -1, 2, 5, -3, -2, 0, 0, -1, 0, -5],
72
- [-3, -3, -4, -5, -5, -1, -3, -3, -3, -3, -2, -3, -1, 1, -4, -4, -3, 15, 2, -3, -5, -2, -3, -5],
73
- [-2, -1, -2, -3, -3, -1, -2, -3, 2, -1, -1, -2, 0, 4, -3, -2, -2, 2, 8, -1, -3, -2, -1, -5],
74
- [0, -3, -3, -4, -1, -3, -3, -4, -4, 4, 1, -3, 1, -1, -3, -2, 0, -3, -1, 5, -4, -3, -1, -5],
75
- [-2, -1, 4, 5, -3, 0, 1, -1, 0, -4, -4, 0, -3, -4, -2, 0, 0, -5, -3, -4, 5, 2, -1, -5],
76
- [-1, 0, 0, 1, -3, 4, 5, -2, 0, -3, -3, 1, -1, -4, -1, 0, -1, -2, -2, -3, 2, 5, -1, -5],
77
- [-1, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, 0, -3, -1, -1, -1, -1, -1, -5],
78
- [-5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, -5, 1]];
79
- this.BLOSUM62 = [[4, -1, -2, -2, 0, -1, -1, 0, -2, -1, -1, -1, -1, -2, -1, 1, 0, -3, -2, 0, -2, -1, 0, -4],
80
- [-1, 5, 0, -2, -3, 1, 0, -2, 0, -3, -2, 2, -1, -3, -2, -1, -1, -3, -2, -3, -1, 0, -1, -4],
81
- [-2, 0, 6, 1, -3, 0, 0, 0, 1, -3, -3, 0, -2, -3, -2, 1, 0, -4, -2, -3, 3, 0, -1, -4],
82
- [-2, -2, 1, 6, -3, 0, 2, -1, -1, -3, -4, -1, -3, -3, -1, 0, -1, -4, -3, -3, 4, 1, -1, -4],
83
- [0, -3, -3, -3, 9, -3, -4, -3, -3, -1, -1, -3, -1, -2, -3, -1, -1, -2, -2, -1, -3, -3, -2, -4],
84
- [-1, 1, 0, 0, -3, 5, 2, -2, 0, -3, -2, 1, 0, -3, -1, 0, -1, -2, -1, -2, 0, 3, -1, -4],
85
- [-1, 0, 0, 2, -4, 2, 5, -2, 0, -3, -3, 1, -2, -3, -1, 0, -1, -3, -2, -2, 1, 4, -1, -4],
86
- [0, -2, 0, -1, -3, -2, -2, 6, -2, -4, -4, -2, -3, -3, -2, 0, -2, -2, -3, -3, -1, -2, -1, -4],
87
- [-2, 0, 1, -1, -3, 0, 0, -2, 8, -3, -3, -1, -2, -1, -2, -1, -2, -2, 2, -3, 0, 0, -1, -4],
88
- [-1, -3, -3, -3, -1, -3, -3, -4, -3, 4, 2, -3, 1, 0, -3, -2, -1, -3, -1, 3, -3, -3, -1, -4],
89
- [-1, -2, -3, -4, -1, -2, -3, -4, -3, 2, 4, -2, 2, 0, -3, -2, -1, -2, -1, 1, -4, -3, -1, -4],
90
- [-1, 2, 0, -1, -3, 1, 1, -2, -1, -3, -2, 5, -1, -3, -1, 0, -1, -3, -2, -2, 0, 1, -1, -4],
91
- [-1, -1, -2, -3, -1, 0, -2, -3, -2, 1, 2, -1, 5, 0, -2, -1, -1, -1, -1, 1, -3, -1, -1, -4],
92
- [-2, -3, -3, -3, -2, -3, -3, -3, -1, 0, 0, -3, 0, 6, -4, -2, -2, 1, 3, -1, -3, -3, -1, -4],
93
- [-1, -2, -2, -1, -3, -1, -1, -2, -2, -3, -3, -1, -2, -4, 7, -1, -1, -4, -3, -2, -2, -1, -2, -4],
94
- [1, -1, 1, 0, -1, 0, 0, 0, -1, -2, -2, 0, -1, -2, -1, 4, 1, -3, -2, -2, 0, 0, 0, -4],
95
- [0, -1, 0, -1, -1, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -1, -1, -2, -1, 1, 5, -2, -2, 0, -1, -1, 0, -4],
96
- [-3, -3, -4, -4, -2, -2, -3, -2, -2, -3, -2, -3, -1, 1, -4, -3, -2, 11, 2, -3, -4, -3, -2, -4],
97
- [-2, -2, -2, -3, -2, -1, -2, -3, 2, -1, -1, -2, -1, 3, -3, -2, -2, 2, 7, -1, -3, -2, -1, -4],
98
- [0, -3, -3, -3, -1, -2, -2, -3, -3, 3, 1, -2, 1, -1, -2, -2, 0, -3, -1, 4, -3, -2, -1, -4],
99
- [-2, -1, 3, 4, -3, 0, 1, -1, 0, -3, -4, 0, -3, -3, -2, 0, -1, -4, -3, -3, 4, 1, -1, -4],
100
- [-1, 0, 0, 1, -3, 3, 4, -2, 0, -3, -3, 1, -1, -3, -1, 0, -1, -3, -2, -2, 1, 4, -1, -4],
101
- [0, -1, -1, -1, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -2, 0, 0, -2, -1, -1, -1, -1, -1, -4],
102
- [-4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, -4, 1]];
103
- this.BLOSUM80 = [[7, -3, -3, -3, -1, -2, -2, 0, -3, -3, -3, -1, -2, -4, -1, 2, 0, -5, -4, -1, -3, -2, -1, -8],
104
- [-3, 9, -1, -3, -6, 1, -1, -4, 0, -5, -4, 3, -3, -5, -3, -2, -2, -5, -4, -4, -2, 0, -2, -8],
105
- [-3, -1, 9, 2, -5, 0, -1, -1, 1, -6, -6, 0, -4, -6, -4, 1, 0, -7, -4, -5, 5, -1, -2, -8],
106
- [-3, -3, 2, 10, -7, -1, 2, -3, -2, -7, -7, -2, -6, -6, -3, -1, -2, -8, -6, -6, 6, 1, -3, -8],
107
- [-1, -6, -5, -7, 13, -5, -7, -6, -7, -2, -3, -6, -3, -4, -6, -2, -2, -5, -5, -2, -6, -7, -4, -8],
108
- [-2, 1, 0, -1, -5, 9, 3, -4, 1, -5, -4, 2, -1, -5, -3, -1, -1, -4, -3, -4, -1, 5, -2, -8],
109
- [-2, -1, -1, 2, -7, 3, 8, -4, 0, -6, -6, 1, -4, -6, -2, -1, -2, -6, -5, -4, 1, 6, -2, -8],
110
- [0, -4, -1, -3, -6, -4, -4, 9, -4, -7, -7, -3, -5, -6, -5, -1, -3, -6, -6, -6, -2, -4, -3, -8],
111
- [-3, 0, 1, -2, -7, 1, 0, -4, 12, -6, -5, -1, -4, -2, -4, -2, -3, -4, 3, -5, -1, 0, -2, -8],
112
- [-3, -5, -6, -7, -2, -5, -6, -7, -6, 7, 2, -5, 2, -1, -5, -4, -2, -5, -3, 4, -6, -6, -2, -8],
113
- [-3, -4, -6, -7, -3, -4, -6, -7, -5, 2, 6, -4, 3, 0, -5, -4, -3, -4, -2, 1, -7, -5, -2, -8],
114
- [-1, 3, 0, -2, -6, 2, 1, -3, -1, -5, -4, 8, -3, -5, -2, -1, -1, -6, -4, -4, -1, 1, -2, -8],
115
- [-2, -3, -4, -6, -3, -1, -4, -5, -4, 2, 3, -3, 9, 0, -4, -3, -1, -3, -3, 1, -5, -3, -2, -8],
116
- [-4, -5, -6, -6, -4, -5, -6, -6, -2, -1, 0, -5, 0, 10, -6, -4, -4, 0, 4, -2, -6, -6, -3, -8],
117
- [-1, -3, -4, -3, -6, -3, -2, -5, -4, -5, -5, -2, -4, -6, 12, -2, -3, -7, -6, -4, -4, -2, -3, -8],
118
- [2, -2, 1, -1, -2, -1, -1, -1, -2, -4, -4, -1, -3, -4, -2, 7, 2, -6, -3, -3, 0, -1, -1, -8],
119
- [0, -2, 0, -2, -2, -1, -2, -3, -3, -2, -3, -1, -1, -4, -3, 2, 8, -5, -3, 0, -1, -2, -1, -8],
120
- [-5, -5, -7, -8, -5, -4, -6, -6, -4, -5, -4, -6, -3, 0, -7, -6, -5, 16, 3, -5, -8, -5, -5, -8],
121
- [-4, -4, -4, -6, -5, -3, -5, -6, 3, -3, -2, -4, -3, 4, -6, -3, -3, 3, 11, -3, -5, -4, -3, -8],
122
- [-1, -4, -5, -6, -2, -4, -4, -6, -5, 4, 1, -4, 1, -2, -4, -3, 0, -5, -3, 7, -6, -4, -2, -8],
123
- [-3, -2, 5, 6, -6, -1, 1, -2, -1, -6, -7, -1, -5, -6, -4, 0, -1, -8, -5, -6, 6, 0, -3, -8],
124
- [-2, 0, -1, 1, -7, 5, 6, -4, 0, -6, -5, 1, -3, -6, -2, -1, -2, -5, -4, -4, 0, 6, -1, -8],
125
- [-1, -2, -2, -3, -4, -2, -2, -3, -2, -2, -2, -2, -2, -3, -3, -1, -1, -5, -3, -2, -3, -1, -2, -8],
126
- [-8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1]];
127
- this.BLOSUM90 = [[5, -2, -2, -3, -1, -1, -1, 0, -2, -2, -2, -1, -2, -3, -1, 1, 0, -4, -3, -1, -2, -1, -1, -6],
128
- [-2, 6, -1, -3, -5, 1, -1, -3, 0, -4, -3, 2, -2, -4, -3, -1, -2, -4, -3, -3, -2, 0, -2, -6],
129
- [-2, -1, 7, 1, -4, 0, -1, -1, 0, -4, -4, 0, -3, -4, -3, 0, 0, -5, -3, -4, 4, -1, -2, -6],
130
- [-3, -3, 1, 7, -5, -1, 1, -2, -2, -5, -5, -1, -4, -5, -3, -1, -2, -6, -4, -5, 4, 0, -2, -6],
131
- [-1, -5, -4, -5, 9, -4, -6, -4, -5, -2, -2, -4, -2, -3, -4, -2, -2, -4, -4, -2, -4, -5, -3, -6],
132
- [-1, 1, 0, -1, -4, 7, 2, -3, 1, -4, -3, 1, 0, -4, -2, -1, -1, -3, -3, -3, -1, 4, -1, -6],
133
- [-1, -1, -1, 1, -6, 2, 6, -3, -1, -4, -4, 0, -3, -5, -2, -1, -1, -5, -4, -3, 0, 4, -2, -6],
134
- [0, -3, -1, -2, -4, -3, -3, 6, -3, -5, -5, -2, -4, -5, -3, -1, -3, -4, -5, -5, -2, -3, -2, -6],
135
- [-2, 0, 0, -2, -5, 1, -1, -3, 8, -4, -4, -1, -3, -2, -3, -2, -2, -3, 1, -4, -1, 0, -2, -6],
136
- [-2, -4, -4, -5, -2, -4, -4, -5, -4, 5, 1, -4, 1, -1, -4, -3, -1, -4, -2, 3, -5, -4, -2, -6],
137
- [-2, -3, -4, -5, -2, -3, -4, -5, -4, 1, 5, -3, 2, 0, -4, -3, -2, -3, -2, 0, -5, -4, -2, -6],
138
- [-1, 2, 0, -1, -4, 1, 0, -2, -1, -4, -3, 6, -2, -4, -2, -1, -1, -5, -3, -3, -1, 1, -1, -6],
139
- [-2, -2, -3, -4, -2, 0, -3, -4, -3, 1, 2, -2, 7, -1, -3, -2, -1, -2, -2, 0, -4, -2, -1, -6],
140
- [-3, -4, -4, -5, -3, -4, -5, -5, -2, -1, 0, -4, -1, 7, -4, -3, -3, 0, 3, -2, -4, -4, -2, -6],
141
- [-1, -3, -3, -3, -4, -2, -2, -3, -3, -4, -4, -2, -3, -4, 8, -2, -2, -5, -4, -3, -3, -2, -2, -6],
142
- [1, -1, 0, -1, -2, -1, -1, -1, -2, -3, -3, -1, -2, -3, -2, 5, 1, -4, -3, -2, 0, -1, -1, -6],
143
- [0, -2, 0, -2, -2, -1, -1, -3, -2, -1, -2, -1, -1, -3, -2, 1, 6, -4, -2, -1, -1, -1, -1, -6],
144
- [-4, -4, -5, -6, -4, -3, -5, -4, -3, -4, -3, -5, -2, 0, -5, -4, -4, 11, 2, -3, -6, -4, -3, -6],
145
- [-3, -3, -3, -4, -4, -3, -4, -5, 1, -2, -2, -3, -2, 3, -4, -3, -2, 2, 8, -3, -4, -3, -2, -6],
146
- [-1, -3, -4, -5, -2, -3, -3, -5, -4, 3, 0, -3, 0, -2, -3, -2, -1, -3, -3, 5, -4, -3, -2, -6],
147
- [-2, -2, 4, 4, -4, -1, 0, -2, -1, -5, -5, -1, -4, -4, -3, 0, -1, -6, -4, -4, 4, 0, -2, -6],
148
- [-1, 0, -1, 0, -5, 4, 4, -3, 0, -4, -4, 1, -2, -4, -2, -1, -1, -4, -3, -3, 0, 4, -1, -6],
149
- [-1, -2, -2, -2, -3, -1, -2, -2, -2, -2, -2, -1, -1, -2, -2, -1, -1, -3, -2, -2, -2, -1, -2, -6],
150
- [-6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, -6, 1]];
151
- this.NUCLEOTIDES = [[1, -1, -1, -1],
152
- [-1, 1, -1, -1],
153
- [-1, -1, 1, -1],
154
- [-1, -1, -1, 1]];
155
- this.PAM30 = [[6, -7, -4, -3, -6, -4, -2, -2, -7, -5, -6, -7, -5, -8, -2, 0, -1, -13, -8, -2, -3, -3, -3, -17],
156
- [-7, 8, -6, -10, -8, -2, -9, -9, -2, -5, -8, 0, -4, -9, -4, -3, -6, -2, -10, -8, -7, -4, -6, -17],
157
- [-4, -6, 8, 2, -11, -3, -2, -3, 0, -5, -7, -1, -9, -9, -6, 0, -2, -8, -4, -8, 6, -3, -3, -17],
158
- [-3, -10, 2, 8, -14, -2, 2, -3, -4, -7, -12, -4, -11, -15, -8, -4, -5, -15, -11, -8, 6, 1, -5, -17],
159
- [-6, -8, -11, -14, 10, -14, -14, -9, -7, -6, -15, -14, -13, -13, -8, -3, -8, -15, -4, -6, -12, -14, -9, -17],
160
- [-4, -2, -3, -2, -14, 8, 1, -7, 1, -8, -5, -3, -4, -13, -3, -5, -5, -13, -12, -7, -3, 6, -5, -17],
161
- [-2, -9, -2, 2, -14, 1, 8, -4, -5, -5, -9, -4, -7, -14, -5, -4, -6, -17, -8, -6, 1, 6, -5, -17],
162
- [-2, -9, -3, -3, -9, -7, -4, 6, -9, -11, -10, -7, -8, -9, -6, -2, -6, -15, -14, -5, -3, -5, -5, -17],
163
- [-7, -2, 0, -4, -7, 1, -5, -9, 9, -9, -6, -6, -10, -6, -4, -6, -7, -7, -3, -6, -1, -1, -5, -17],
164
- [-5, -5, -5, -7, -6, -8, -5, -11, -9, 8, -1, -6, -1, -2, -8, -7, -2, -14, -6, 2, -6, -6, -5, -17],
165
- [-6, -8, -7, -12, -15, -5, -9, -10, -6, -1, 7, -8, 1, -3, -7, -8, -7, -6, -7, -2, -9, -7, -6, -17],
166
- [-7, 0, -1, -4, -14, -3, -4, -7, -6, -6, -8, 7, -2, -14, -6, -4, -3, -12, -9, -9, -2, -4, -5, -17],
167
- [-5, -4, -9, -11, -13, -4, -7, -8, -10, -1, 1, -2, 11, -4, -8, -5, -4, -13, -11, -1, -10, -5, -5, -17],
168
- [-8, -9, -9, -15, -13, -13, -14, -9, -6, -2, -3, -14, -4, 9, -10, -6, -9, -4, 2, -8, -10, -13, -8, -17],
169
- [-2, -4, -6, -8, -8, -3, -5, -6, -4, -8, -7, -6, -8, -10, 8, -2, -4, -14, -13, -6, -7, -4, -5, -17],
170
- [0, -3, 0, -4, -3, -5, -4, -2, -6, -7, -8, -4, -5, -6, -2, 6, 0, -5, -7, -6, -1, -5, -3, -17],
171
- [-1, -6, -2, -5, -8, -5, -6, -6, -7, -2, -7, -3, -4, -9, -4, 0, 7, -13, -6, -3, -3, -6, -4, -17],
172
- [-13, -2, -8, -15, -15, -13, -17, -15, -7, -14, -6, -12, -13, -4, -14, -5, -13, 13, -5, -15, -10, -14, -11, -17],
173
- [-8, -10, -4, -11, -4, -12, -8, -14, -3, -6, -7, -9, -11, 2, -13, -7, -6, -5, 10, -7, -6, -9, -7, -17],
174
- [-2, -8, -8, -8, -6, -7, -6, -5, -6, 2, -2, -9, -1, -8, -6, -6, -3, -15, -7, 7, -8, -6, -5, -17],
175
- [-3, -7, 6, 6, -12, -3, 1, -3, -1, -6, -9, -2, -10, -10, -7, -1, -3, -10, -6, -8, 6, 0, -5, -17],
176
- [-3, -4, -3, 1, -14, 6, 6, -5, -1, -6, -7, -4, -5, -13, -4, -5, -6, -14, -9, -6, 0, 6, -5, -17],
177
- [-3, -6, -3, -5, -9, -5, -5, -5, -5, -5, -6, -5, -5, -8, -5, -3, -4, -11, -7, -5, -5, -5, -5, -17],
178
- [-17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, -17, 1]];
179
- this.PAM70 = [[5, -4, -2, -1, -4, -2, -1, 0, -4, -2, -4, -4, -3, -6, 0, 1, 1, -9, -5, -1, -1, -1, -2, -11],
180
- [-4, 8, -3, -6, -5, 0, -5, -6, 0, -3, -6, 2, -2, -7, -2, -1, -4, 0, -7, -5, -4, -2, -3, -11],
181
- [-2, -3, 6, 3, -7, -1, 0, -1, 1, -3, -5, 0, -5, -6, -3, 1, 0, -6, -3, -5, 5, -1, -2, -11],
182
- [-1, -6, 3, 6, -9, 0, 3, -1, -1, -5, -8, -2, -7, -10, -4, -1, -2, -10, -7, -5, 5, 2, -3, -11],
183
- [-4, -5, -7, -9, 9, -9, -9, -6, -5, -4, -10, -9, -9, -8, -5, -1, -5, -11, -2, -4, -8, -9, -6, -11],
184
- [-2, 0, -1, 0, -9, 7, 2, -4, 2, -5, -3, -1, -2, -9, -1, -3, -3, -8, -8, -4, -1, 5, -2, -11],
185
- [-1, -5, 0, 3, -9, 2, 6, -2, -2, -4, -6, -2, -4, -9, -3, -2, -3, -11, -6, -4, 2, 5, -3, -11],
186
- [0, -6, -1, -1, -6, -4, -2, 6, -6, -6, -7, -5, -6, -7, -3, 0, -3, -10, -9, -3, -1, -3, -3, -11],
187
- [-4, 0, 1, -1, -5, 2, -2, -6, 8, -6, -4, -3, -6, -4, -2, -3, -4, -5, -1, -4, 0, 1, -3, -11],
188
- [-2, -3, -3, -5, -4, -5, -4, -6, -6, 7, 1, -4, 1, 0, -5, -4, -1, -9, -4, 3, -4, -4, -3, -11],
189
- [-4, -6, -5, -8, -10, -3, -6, -7, -4, 1, 6, -5, 2, -1, -5, -6, -4, -4, -4, 0, -6, -4, -4, -11],
190
- [-4, 2, 0, -2, -9, -1, -2, -5, -3, -4, -5, 6, 0, -9, -4, -2, -1, -7, -7, -6, -1, -2, -3, -11],
191
- [-3, -2, -5, -7, -9, -2, -4, -6, -6, 1, 2, 0, 10, -2, -5, -3, -2, -8, -7, 0, -6, -3, -3, -11],
192
- [-6, -7, -6, -10, -8, -9, -9, -7, -4, 0, -1, -9, -2, 8, -7, -4, -6, -2, 4, -5, -7, -9, -5, -11],
193
- [0, -2, -3, -4, -5, -1, -3, -3, -2, -5, -5, -4, -5, -7, 7, 0, -2, -9, -9, -3, -4, -2, -3, -11],
194
- [1, -1, 1, -1, -1, -3, -2, 0, -3, -4, -6, -2, -3, -4, 0, 5, 2, -3, -5, -3, 0, -2, -1, -11],
195
- [1, -4, 0, -2, -5, -3, -3, -3, -4, -1, -4, -1, -2, -6, -2, 2, 6, -8, -4, -1, -1, -3, -2, -11],
196
- [-9, 0, -6, -10, -11, -8, -11, -10, -5, -9, -4, -7, -8, -2, -9, -3, -8, 13, -3, -10, -7, -10, -7, -11],
197
- [-5, -7, -3, -7, -2, -8, -6, -9, -1, -4, -4, -7, -7, 4, -9, -5, -4, -3, 9, -5, -4, -7, -5, -11],
198
- [-1, -5, -5, -5, -4, -4, -4, -3, -4, 3, 0, -6, 0, -5, -3, -3, -1, -10, -5, 6, -5, -4, -2, -11],
199
- [-1, -4, 5, 5, -8, -1, 2, -1, 0, -4, -6, -1, -6, -7, -4, 0, -1, -7, -4, -5, 5, 1, -2, -11],
200
- [-1, -2, -1, 2, -9, 5, 5, -3, 1, -4, -4, -2, -3, -9, -2, -2, -3, -10, -7, -4, 1, 5, -3, -11],
201
- [-2, -3, -2, -3, -6, -2, -3, -3, -3, -3, -4, -3, -3, -5, -3, -1, -2, -7, -5, -2, -2, -3, -3, -11],
202
- [-11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, -11, 1]];
203
- this.PAM250 = [[2, -2, 0, 0, -2, 0, 0, 1, -1, -1, -2, -1, -1, -3, 1, 1, 1, -6, -3, 0, 0, 0, 0, -8],
204
- [-2, 6, 0, -1, -4, 1, -1, -3, 2, -2, -3, 3, 0, -4, 0, 0, -1, 2, -4, -2, -1, 0, -1, -8],
205
- [0, 0, 2, 2, -4, 1, 1, 0, 2, -2, -3, 1, -2, -3, 0, 1, 0, -4, -2, -2, 2, 1, 0, -8],
206
- [0, -1, 2, 4, -5, 2, 3, 1, 1, -2, -4, 0, -3, -6, -1, 0, 0, -7, -4, -2, 3, 3, -1, -8],
207
- [-2, -4, -4, -5, 12, -5, -5, -3, -3, -2, -6, -5, -5, -4, -3, 0, -2, -8, 0, -2, -4, -5, -3, -8],
208
- [0, 1, 1, 2, -5, 4, 2, -1, 3, -2, -2, 1, -1, -5, 0, -1, -1, -5, -4, -2, 1, 3, -1, -8],
209
- [0, -1, 1, 3, -5, 2, 4, 0, 1, -2, -3, 0, -2, -5, -1, 0, 0, -7, -4, -2, 3, 3, -1, -8],
210
- [1, -3, 0, 1, -3, -1, 0, 5, -2, -3, -4, -2, -3, -5, 0, 1, 0, -7, -5, -1, 0, 0, -1, -8],
211
- [-1, 2, 2, 1, -3, 3, 1, -2, 6, -2, -2, 0, -2, -2, 0, -1, -1, -3, 0, -2, 1, 2, -1, -8],
212
- [-1, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -3, -2, 5, 2, -2, 2, 1, -2, -1, 0, -5, -1, 4, -2, -2, -1, -8],
213
- [-2, -3, -3, -4, -6, -2, -3, -4, -2, 2, 6, -3, 4, 2, -3, -3, -2, -2, -1, 2, -3, -3, -1, -8],
214
- [-1, 3, 1, 0, -5, 1, 0, -2, 0, -2, -3, 5, 0, -5, -1, 0, 0, -3, -4, -2, 1, 0, -1, -8],
215
- [-1, 0, -2, -3, -5, -1, -2, -3, -2, 2, 4, 0, 6, 0, -2, -2, -1, -4, -2, 2, -2, -2, -1, -8],
216
- [-3, -4, -3, -6, -4, -5, -5, -5, -2, 1, 2, -5, 0, 9, -5, -3, -3, 0, 7, -1, -4, -5, -2, -8],
217
- [1, 0, 0, -1, -3, 0, -1, 0, 0, -2, -3, -1, -2, -5, 6, 1, 0, -6, -5, -1, -1, 0, -1, -8],
218
- [1, 0, 1, 0, 0, -1, 0, 1, -1, -1, -3, 0, -2, -3, 1, 2, 1, -2, -3, -1, 0, 0, 0, -8],
219
- [1, -1, 0, 0, -2, -1, 0, 0, -1, 0, -2, 0, -1, -3, 0, 1, 3, -5, -3, 0, 0, -1, 0, -8],
220
- [-6, 2, -4, -7, -8, -5, -7, -7, -3, -5, -2, -3, -4, 0, -6, -2, -5, 17, 0, -6, -5, -6, -4, -8],
221
- [-3, -4, -2, -4, 0, -4, -4, -5, 0, -1, -1, -4, -2, 7, -5, -3, -3, 0, 10, -2, -3, -4, -2, -8],
222
- [0, -2, -2, -2, -2, -2, -2, -1, -2, 4, 2, -2, 2, -1, -1, -1, 0, -6, -2, 4, -2, -2, -1, -8],
223
- [0, -1, 2, 3, -4, 1, 3, 0, 1, -2, -3, 1, -2, -4, -1, 0, 0, -5, -3, -2, 3, 2, -1, -8],
224
- [0, 0, 1, 3, -5, 3, 3, 0, 2, -2, -3, 0, -2, -5, 0, 0, -1, -6, -4, -2, 2, 3, -1, -8],
225
- [0, -1, 0, -1, -3, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -2, -1, 0, 0, -4, -2, -1, -1, -1, -1, -8],
226
- [-8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, -8, 1]];
227
- this.SCHNEIDER = [[11.6, -2.7, 9.7, -1.7, -2.7, -6.4, -3.9, -5.6, 5.1, -5.0, 3.6, -4.2, -6.3, -13.0, -7.1, -11.5, 0.4, -6.0, -1.9, -5.3, -8.5, -11.2, -8.9, -10.8, 2.1, 0.0, 1.4, 0.2, -10.2, -13.5, -13.0, -12.5, -2.6, -8.5, -5.0, -8.1, -6.3, -9.9, -7.5, -9.0, -7.1, -10.2, -8.2, -9.2, -8.2, -12.5, -11.1, -11.4, -50.0, -14.8, -50.0, -13.8, -7.3, -10.1, -8.4, -9.1, -50.0, -13.0, -13.5, -12.4, -10.7, -18.1, -11.8, -17.2,],
228
- [-2.7, 13.0, -3.3, 10.9, -3.5, -0.4, -3.3, -1.8, -5.4, 4.6, -5.5, 3.0, -10.2, -7.9, -9.9, -9.6, -5.0, 0.5, -5.5, -1.0, -10.3, -8.1, -9.4, -9.6, -8.1, -5.0, -7.3, -6.3, -13.4, -11.3, -14.4, -12.9, -6.3, 0.8, -6.4, -1.1, -7.4, -5.0, -6.2, -6.5, -5.6, -1.6, -4.7, -3.0, -10.8, -8.7, -11.9, -10.0, -50.0, -6.2, -50.0, -7.5, -6.3, -4.3, -6.2, -5.4, -50.0, -7.0, -16.3, -8.2, -13.2, -12.3, -13.1, -13.3,],
229
- [9.7, -3.3, 11.6, -2.8, -4.5, -6.7, -3.1, -6.9, 3.3, -5.5, 4.8, -5.1, -8.9, -13.2, -5.7, -12.6, -1.5, -6.1, -0.6, -6.1, -10.0, -11.8, -8.6, -11.9, 1.2, 0.5, 2.2, 0.1, -11.8, -14.0, -11.9, -13.4, -4.9, -9.1, -3.4, -8.9, -8.0, -10.0, -7.2, -10.0, -9.1, -10.2, -7.1, -9.9, -10.1, -13.0, -10.6, -12.7, -50.0, -14.9, -50.0, -14.4, -8.9, -10.8, -8.9, -10.4, -50.0, -13.1, -11.8, -13.0, -12.4, -19.4, -11.5, -17.8,],
230
- [-1.7, 10.9, -2.8, 12.9, -2.7, -2.2, -2.8, 0.2, -4.8, 2.9, -5.2, 5.2, -9.1, -9.5, -9.0, -7.0, -4.0, -1.0, -5.0, 1.0, -9.0, -8.8, -8.9, -7.7, -7.0, -6.8, -7.1, -4.3, -12.4, -12.9, -13.9, -10.0, -4.9, -0.7, -5.6, 1.4, -6.0, -6.5, -6.2, -4.8, -5.1, -3.2, -5.0, -1.2, -9.8, -9.9, -11.3, -8.2, -50.0, -7.6, -50.0, -5.1, -5.5, -5.8, -5.9, -4.2, -50.0, -8.3, -15.5, -5.9, -11.6, -14.2, -12.0, -11.6,],
231
- [-2.7, -3.5, -4.5, -2.7, 11.7, 9.0, 10.6, 9.6, -3.2, -0.7, -5.1, -0.4, 0.7, -4.6, -0.4, -3.6, -4.8, -8.9, -6.5, -7.8, -1.4, -4.1, -2.9, -3.3, -8.0, -9.1, -8.0, -8.2, -6.0, -9.3, -7.7, -8.5, -6.4, -10.1, -7.5, -8.6, 2.8, -0.7, 0.9, 0.1, -5.9, -7.3, -6.5, -6.5, -0.4, -3.9, -2.6, -3.1, -50.0, -14.6, -50.0, -12.6, 2.9, 0.1, 1.8, 1.0, -50.0, -9.2, -13.6, -7.7, -4.8, -12.2, -6.2, -11.0,],
232
- [-6.4, -0.4, -6.7, -2.2, 9.0, 12.3, 9.8, 9.6, -7.1, 2.4, -7.2, 0.3, -2.9, -1.2, -3.0, -3.3, -7.6, -6.7, -8.1, -7.9, -4.9, -1.9, -4.5, -3.8, -9.5, -7.8, -9.3, -8.9, -9.4, -7.1, -9.0, -9.0, -9.4, -7.5, -9.3, -9.2, -0.7, 2.6, 0.2, -0.1, -8.0, -4.6, -7.7, -6.1, -3.6, -1.0, -4.1, -3.1, -50.0, -11.6, -50.0, -11.6, 0.2, 2.3, 0.4, 0.5, -50.0, -6.5, -15.3, -7.8, -8.4, -9.5, -8.3, -11.1,],
233
- [-3.9, -3.3, -3.1, -2.8, 10.6, 9.8, 12.2, 9.8, -4.9, 0.1, -3.6, -0.2, -1.7, -4.1, 0.9, -3.5, -5.9, -8.9, -5.6, -8.5, -3.9, -3.9, -2.2, -4.5, -7.3, -7.5, -6.4, -8.5, -7.1, -8.2, -6.7, -7.8, -7.9, -9.1, -7.1, -9.4, 0.9, -0.2, 2.5, -0.3, -6.9, -6.5, -5.5, -6.8, -1.7, -3.4, -1.7, -2.8, -50.0, -13.0, -50.0, -11.5, 1.5, 0.7, 2.7, 0.6, -50.0, -8.9, -12.1, -7.4, -6.1, -11.5, -5.4, -10.4,],
234
- [-5.6, -1.8, -6.9, 0.2, 9.6, 9.6, 9.8, 11.6, -6.6, 0.9, -7.2, 2.5, -2.3, -3.4, -2.3, -0.6, -6.5, -8.2, -8.0, -6.3, -3.7, -3.5, -3.9, -1.6, -9.9, -8.9, -9.6, -7.0, -8.6, -8.9, -8.8, -6.8, -8.6, -8.2, -8.8, -6.8, 0.3, 0.1, 0.2, 2.4, -7.4, -6.2, -6.9, -4.4, -2.9, -2.9, -3.5, -0.9, -50.0, -12.2, -50.0, -10.1, 1.2, 0.6, 1.2, 2.4, -50.0, -7.6, -16.1, -5.8, -7.2, -10.8, -7.4, -9.0,],
235
- [5.1, -5.4, 3.3, -4.8, -3.2, -7.1, -4.9, -6.6, 13.3, -2.8, 11.2, -1.9, -5.7, -12.5, -7.2, -11.6, -0.7, -4.8, -3.1, -4.3, -10.0, -11.6, -8.8, -11.7, 10.5, 7.7, 9.1, 8.5, -9.8, -12.7, -11.7, -11.8, -6.3, -11.4, -8.8, -11.0, -7.5, -10.3, -8.3, -9.9, -1.9, -6.7, -4.1, -6.4, -7.9, -12.5, -11.4, -11.7, -50.0, -14.0, -50.0, -13.2, -8.5, -10.4, -9.1, -9.6, -50.0, -9.8, -7.7, -8.8, -10.3, -17.9, -11.8, -16.0,],
236
- [-5.0, 4.6, -5.5, 2.9, -0.7, 2.4, 0.1, 0.9, -2.8, 12.8, -2.6, 11.0, -8.4, -6.3, -8.3, -7.7, -6.1, -2.9, -6.5, -4.2, -8.5, -5.9, -7.5, -7.7, -5.5, -2.4, -5.5, -4.1, -12.9, -10.3, -12.7, -11.3, -7.4, -3.1, -7.4, -4.9, -4.4, -1.8, -3.5, -3.5, -1.6, 3.0, -0.8, 0.9, -8.4, -6.3, -9.6, -7.3, -50.0, -9.0, -50.0, -9.7, -2.3, -0.2, -1.2, -1.5, -50.0, -0.7, -13.3, -2.0, -11.8, -11.9, -12.3, -12.7,],
237
- [3.6, -5.5, 4.8, -5.2, -5.1, -7.2, -3.6, -7.2, 11.2, -2.6, 13.4, -2.1, -7.7, -12.5, -5.3, -11.9, -2.2, -4.4, -1.9, -4.8, -10.2, -11.5, -8.1, -12.0, 9.3, 8.2, 10.0, 8.0, -10.8, -11.9, -10.7, -12.4, -8.2, -11.8, -6.9, -11.5, -8.4, -9.9, -7.1, -10.6, -4.7, -6.8, -1.2, -7.0, -9.8, -11.6, -9.6, -12.1, -50.0, -14.1, -50.0, -12.7, -10.0, -10.8, -8.8, -10.5, -50.0, -9.2, -4.2, -9.3, -11.0, -18.2, -11.1, -16.1,],
238
- [-4.2, 3.0, -5.1, 5.2, -0.4, 0.3, -0.2, 2.5, -1.9, 11.0, -2.1, 13.2, -7.6, -8.5, -8.0, -5.3, -5.6, -4.5, -6.8, -2.4, -7.8, -7.9, -7.9, -6.2, -5.7, -5.1, -5.4, -2.1, -12.4, -12.3, -13.1, -10.1, -6.6, -4.4, -6.9, -2.6, -3.6, -3.8, -3.7, -2.0, -1.4, 0.8, -0.9, 3.0, -8.2, -8.1, -9.2, -5.8, -50.0, -10.1, -50.0, -7.4, -1.7, -2.0, -1.5, -0.5, -50.0, -2.1, -12.6, -0.4, -11.6, -13.9, -11.4, -11.1,],
239
- [-6.3, -10.2, -8.9, -9.1, 0.7, -2.9, -1.7, -2.3, -5.7, -8.4, -7.7, -7.6, 13.2, 9.6, 3.5, 9.7, -8.7, -12.4, -10.7, -10.7, -7.8, -10.2, -8.8, -9.6, -9.5, -11.9, -10.9, -10.5, 2.3, -0.4, -0.2, -0.3, -9.7, -15.5, -11.4, -13.7, -3.0, -6.4, -4.1, -5.4, -9.6, -11.9, -10.5, -11.8, 6.2, 3.3, 3.7, 3.6, -50.0, -13.6, -50.0, -11.9, -5.6, -8.8, -7.2, -8.9, -50.0, -12.4, -14.1, -11.6, 2.8, -6.4, 0.5, -5.2,],
240
- [-13.0, -7.9, -13.2, -9.5, -4.6, -1.2, -4.1, -3.4, -12.5, -6.3, -12.5, -8.5, 9.6, 12.7, 0.2, 10.5, -12.4, -11.6, -13.2, -12.0, -12.4, -10.1, -11.6, -12.0, -15.1, -13.1, -14.3, -13.4, -1.4, 1.4, -1.6, -0.5, -14.9, -14.3, -15.2, -16.8, -7.7, -4.7, -6.3, -6.6, -14.6, -10.8, -12.8, -13.0, 2.3, 6.0, 2.5, 3.6, -50.0, -11.2, -50.0, -11.9, -10.5, -9.2, -10.5, -10.5, -50.0, -10.3, -16.2, -11.3, -1.7, -3.7, -2.5, -5.4,],
241
- [-7.1, -9.9, -5.7, -9.0, -0.4, -3.0, 0.9, -2.3, -7.2, -8.3, -5.3, -8.0, 3.5, 0.2, 14.3, 1.0, -7.3, -11.2, -6.9, -9.7, -8.5, -10.2, -7.7, -9.8, -10.0, -10.4, -8.4, -10.2, 1.0, -0.6, 1.7, -0.5, -11.1, -14.8, -9.7, -14.5, -3.7, -5.8, -3.1, -5.6, -10.4, -11.5, -8.2, -11.1, 0.6, -1.6, 1.6, -1.1, -50.0, -12.4, -50.0, -11.5, -5.5, -8.0, -4.9, -7.2, -50.0, -12.4, -10.3, -11.6, 0.7, -6.8, 2.4, -6.0,],
242
- [-11.5, -9.6, -12.6, -7.0, -3.6, -3.3, -3.5, -0.6, -11.6, -7.7, -11.9, -5.3, 9.7, 10.5, 1.0, 12.6, -12.0, -12.2, -12.5, -9.7, -11.1, -11.2, -11.9, -9.4, -12.9, -14.3, -14.0, -11.9, -1.0, -0.4, -1.6, 1.2, -13.9, -15.4, -13.7, -12.6, -6.2, -6.7, -6.3, -4.4, -13.0, -12.2, -13.0, -10.4, 2.9, 3.8, 2.5, 5.8, -50.0, -12.5, -50.0, -10.2, -9.6, -9.7, -9.6, -8.3, -50.0, -11.6, -15.4, -9.4, -1.1, -5.4, -1.6, -3.3,],
243
- [0.4, -5.0, -1.5, -4.0, -4.8, -7.6, -5.9, -6.5, -0.7, -6.1, -2.2, -5.6, -8.7, -12.4, -7.3, -12.0, 12.8, 2.3, 10.2, 3.0, 0.0, -3.4, -0.7, -3.2, 2.5, -0.8, 0.9, 0.2, -3.0, -7.2, -5.7, -6.1, -0.2, -6.6, -1.8, -6.0, -5.3, -8.2, -5.7, -7.6, -6.7, -9.6, -7.5, -9.3, -7.1, -10.5, -9.6, -9.4, -50.0, -8.1, -50.0, -7.2, -4.3, -6.8, -5.7, -6.3, -50.0, -9.5, -9.6, -8.9, -6.2, -12.8, -6.8, -11.8,],
244
- [-6.0, 0.5, -6.1, -1.0, -8.9, -6.7, -8.9, -8.2, -4.8, -2.9, -4.4, -4.5, -12.4, -11.6, -11.2, -12.2, 2.3, 14.6, 1.9, 12.9, -5.5, -2.6, -4.1, -4.7, -1.2, 3.0, -1.1, 1.6, -8.0, -4.7, -8.7, -6.0, -8.2, -4.7, -7.8, -6.7, -10.0, -8.3, -8.9, -9.9, -10.8, -7.1, -10.0, -9.2, -11.6, -10.1, -12.3, -11.9, -50.0, 2.2, -50.0, 0.9, -7.9, -5.9, -7.4, -6.9, -50.0, -4.6, -11.6, -5.6, -9.7, -5.9, -9.9, -7.3,],
245
- [-1.9, -5.5, -0.6, -5.0, -6.5, -8.1, -5.6, -8.0, -3.1, -6.5, -1.9, -6.8, -10.7, -13.2, -6.9, -12.5, 10.2, 1.9, 11.9, 2.1, -2.3, -4.1, -0.5, -4.6, -0.1, -0.9, 2.4, -0.8, -5.1, -6.9, -4.8, -6.7, -2.3, -7.1, -0.8, -7.2, -7.2, -8.0, -5.6, -8.5, -9.4, -9.7, -7.2, -9.8, -9.2, -11.1, -9.5, -10.7, -50.0, -8.7, -50.0, -8.6, -6.1, -7.5, -5.5, -7.7, -50.0, -10.4, -7.7, -10.0, -7.3, -13.6, -6.4, -13.3,],
246
- [-5.3, -1.0, -6.1, 1.0, -7.8, -7.9, -8.5, -6.3, -4.3, -4.2, -4.8, -2.4, -10.7, -12.0, -9.7, -9.7, 3.0, 12.9, 2.1, 14.7, -4.9, -3.8, -4.0, -2.4, -1.0, 0.8, -1.3, 3.4, -7.6, -5.7, -8.1, -3.5, -6.8, -5.8, -7.2, -4.2, -8.9, -10.2, -8.4, -8.2, -9.9, -8.4, -9.7, -6.4, -11.1, -11.1, -11.8, -10.0, -50.0, 0.4, -50.0, 2.6, -7.2, -7.0, -7.4, -5.1, -50.0, -5.7, -9.8, -3.2, -8.4, -7.4, -8.9, -5.9,],
247
- [-8.5, -10.3, -10.0, -9.0, -1.4, -4.9, -3.9, -3.7, -10.0, -8.5, -10.2, -7.8, -7.8, -12.4, -8.5, -11.1, 0.0, -5.5, -2.3, -4.9, 12.6, 10.0, 11.1, 10.5, -6.0, -8.3, -6.9, -7.5, -2.2, -7.4, -5.3, -5.9, -8.9, -12.5, -9.4, -11.6, -0.7, -3.9, -2.3, -3.0, -9.1, -9.8, -9.2, -9.5, -5.6, -9.0, -8.0, -8.5, -50.0, -15.3, -50.0, -14.1, 2.3, -1.4, 0.3, -0.5, -50.0, -13.6, -14.3, -11.5, -5.3, -13.7, -6.1, -12.7,],
248
- [-11.2, -8.1, -11.8, -8.8, -4.1, -1.9, -3.9, -3.5, -11.6, -5.9, -11.5, -7.9, -10.2, -10.1, -10.2, -11.2, -3.4, -2.6, -4.1, -3.8, 10.0, 13.1, 10.7, 10.6, -8.1, -5.2, -8.0, -6.7, -6.1, -3.7, -7.5, -5.6, -11.1, -10.3, -10.6, -11.9, -3.2, -1.0, -2.2, -2.8, -10.5, -8.1, -9.4, -9.5, -8.3, -6.9, -9.4, -8.8, -50.0, -11.3, -50.0, -12.8, -0.6, 2.2, -0.3, 0.1, -50.0, -10.1, -17.5, -11.1, -8.6, -9.9, -8.6, -11.9,],
249
- [-8.9, -9.4, -8.6, -8.9, -2.9, -4.5, -2.2, -3.9, -8.8, -7.5, -8.1, -7.9, -8.8, -11.6, -7.7, -11.9, -0.7, -4.1, -0.5, -4.0, 11.1, 10.7, 13.2, 10.4, -5.7, -5.8, -3.5, -6.1, -3.6, -6.5, -3.3, -5.5, -9.4, -11.0, -8.7, -11.2, -1.8, -2.7, 0.7, -3.0, -9.1, -8.2, -7.3, -9.4, -7.2, -8.2, -7.2, -8.2, -50.0, -13.2, -50.0, -13.3, 0.5, -0.9, 1.8, -0.6, -50.0, -11.4, -11.1, -10.5, -6.1, -12.9, -5.0, -11.9,],
250
- [-10.8, -9.6, -11.9, -7.7, -3.3, -3.8, -4.5, -1.6, -11.7, -7.7, -12.0, -6.2, -9.6, -12.0, -9.8, -9.4, -3.2, -4.7, -4.6, -2.4, 10.5, 10.6, 10.4, 12.6, -8.2, -7.9, -9.0, -4.7, -6.1, -6.0, -7.5, -2.9, -10.9, -12.2, -11.2, -10.9, -2.4, -2.9, -2.7, -0.9, -10.4, -9.7, -10.2, -8.0, -8.4, -9.1, -9.3, -6.5, -50.0, -13.3, -50.0, -11.0, -0.0, -0.4, -0.4, 2.3, -50.0, -10.9, -17.2, -8.3, -8.3, -12.7, -7.8, -9.3,],
251
- [2.1, -8.1, 1.2, -7.0, -8.0, -9.5, -7.3, -9.9, 10.5, -5.5, 9.3, -5.7, -9.5, -15.1, -10.0, -12.9, 2.5, -1.2, -0.1, -1.0, -6.0, -8.1, -5.7, -8.2, 13.8, 11.3, 11.8, 12.1, -6.0, -9.1, -9.0, -9.5, -8.9, -13.4, -10.0, -13.1, -9.9, -11.7, -9.8, -12.8, -5.9, -9.4, -6.5, -8.1, -10.7, -14.0, -13.3, -13.9, -50.0, -11.9, -50.0, -9.7, -8.9, -10.8, -9.0, -11.1, -50.0, -6.5, -5.3, -6.3, -10.5, -16.2, -10.4, -15.2,],
252
- [0.0, -5.0, 0.5, -6.8, -9.1, -7.8, -7.5, -8.9, 7.7, -2.4, 8.2, -5.1, -11.9, -13.1, -10.4, -14.3, -0.8, 3.0, -0.9, 0.8, -8.3, -5.2, -5.8, -7.9, 11.3, 15.0, 11.2, 12.8, -9.7, -5.3, -9.2, -7.8, -11.7, -10.6, -10.1, -12.2, -11.7, -8.8, -8.9, -11.8, -9.3, -5.0, -8.0, -8.2, -13.6, -11.4, -12.8, -13.0, -50.0, -7.2, -50.0, -8.4, -11.0, -7.7, -8.7, -10.2, -50.0, -1.5, -7.1, -4.9, -11.2, -11.6, -11.6, -15.0,],
253
- [1.4, -7.3, 2.2, -7.1, -8.0, -9.3, -6.4, -9.6, 9.1, -5.5, 10.0, -5.4, -10.9, -14.3, -8.4, -14.0, 0.9, -1.1, 2.4, -1.3, -6.9, -8.0, -3.5, -9.0, 11.8, 11.2, 13.4, 11.4, -7.3, -8.8, -6.5, -8.5, -10.0, -12.5, -7.8, -12.5, -9.6, -11.0, -7.1, -10.7, -7.9, -8.0, -4.3, -9.4, -11.4, -12.3, -10.9, -12.9, -50.0, -11.8, -50.0, -11.2, -9.4, -9.8, -7.3, -10.5, -50.0, -6.2, -2.2, -6.7, -9.8, -15.2, -8.5, -14.9,],
254
- [0.2, -6.3, 0.1, -4.3, -8.2, -8.9, -8.5, -7.0, 8.5, -4.1, 8.0, -2.1, -10.5, -13.4, -10.2, -11.9, 0.2, 1.6, -0.8, 3.4, -7.5, -6.7, -6.1, -4.7, 12.1, 12.8, 11.4, 14.7, -8.7, -7.4, -9.4, -5.3, -9.9, -11.8, -10.5, -10.3, -9.9, -10.1, -9.3, -9.3, -8.1, -7.2, -8.0, -5.2, -12.0, -12.1, -12.6, -10.9, -50.0, -7.9, -50.0, -5.3, -9.3, -8.8, -8.9, -7.0, -50.0, -3.6, -7.1, -1.2, -10.2, -12.7, -9.9, -11.0,],
255
- [-10.2, -13.4, -11.8, -12.4, -6.0, -9.4, -7.1, -8.6, -9.8, -12.9, -10.8, -12.4, 2.3, -1.4, 1.0, -1.0, -3.0, -8.0, -5.1, -7.6, -2.2, -6.1, -3.6, -6.1, -6.0, -9.7, -7.3, -8.7, 11.2, 7.9, 8.9, 8.1, -12.1, -17.4, -13.2, -16.8, -6.3, -9.5, -7.5, -8.8, -12.7, -15.2, -13.1, -14.2, 0.0, -3.1, -1.8, -3.1, -50.0, -10.7, -50.0, -9.3, -4.6, -8.9, -5.9, -8.3, -50.0, -12.8, -9.6, -10.6, 9.5, -3.2, 8.2, -2.8,],
256
- [-13.5, -11.3, -14.0, -12.9, -9.3, -7.1, -8.2, -8.9, -12.7, -10.3, -11.9, -12.3, -0.4, 1.4, -0.6, -0.4, -7.2, -4.7, -6.9, -5.7, -7.4, -3.7, -6.5, -6.0, -9.1, -5.3, -8.8, -7.4, 7.9, 11.9, 7.8, 9.3, -15.2, -15.1, -14.6, -17.2, -9.7, -7.3, -8.2, -9.2, -15.0, -12.8, -14.1, -14.9, -2.8, 0.2, -2.9, -2.3, -50.0, -7.4, -50.0, -8.7, -9.4, -7.3, -9.4, -9.4, -50.0, -8.0, -11.9, -9.7, 6.5, 0.5, 6.4, -1.8,],
257
- [-13.0, -14.4, -11.9, -13.9, -7.7, -9.0, -6.7, -8.8, -11.7, -12.7, -10.7, -13.1, -0.2, -1.6, 1.7, -1.6, -5.7, -8.7, -4.8, -8.1, -5.3, -7.5, -3.3, -7.5, -9.0, -9.2, -6.5, -9.4, 8.9, 7.8, 10.1, 7.8, -14.3, -17.7, -13.0, -17.8, -8.0, -9.4, -6.2, -9.2, -15.1, -14.9, -12.2, -14.9, -1.8, -3.2, -0.8, -3.2, -50.0, -10.8, -50.0, -9.9, -7.3, -9.6, -6.4, -9.4, -50.0, -12.3, -8.7, -11.3, 7.6, -3.3, 8.7, -2.9,],
258
- [-12.5, -12.9, -13.4, -10.0, -8.5, -9.0, -7.8, -6.8, -11.8, -11.3, -12.4, -10.1, -0.3, -0.5, -0.5, 1.2, -6.1, -6.0, -6.7, -3.5, -5.9, -5.6, -5.5, -2.9, -9.5, -7.8, -8.5, -5.3, 8.1, 9.3, 7.8, 11.8, -14.4, -15.7, -14.5, -14.6, -8.4, -8.7, -7.9, -7.1, -14.3, -13.8, -13.8, -12.3, -2.4, -2.2, -2.9, -0.2, -50.0, -8.9, -50.0, -7.1, -8.1, -9.1, -8.7, -6.6, -50.0, -9.7, -11.4, -8.0, 6.8, -1.8, 6.9, 0.4,],
259
- [-2.6, -6.3, -4.9, -4.9, -6.4, -9.4, -7.9, -8.6, -6.3, -7.4, -8.2, -6.6, -9.7, -14.9, -11.1, -13.9, -0.2, -8.2, -2.3, -6.8, -8.9, -11.1, -9.4, -10.9, -8.9, -11.7, -10.0, -9.9, -12.1, -15.2, -14.3, -14.4, 11.1, 2.9, 9.2, 3.5, -3.0, -7.0, -4.3, -6.2, -2.2, -6.6, -3.7, -5.7, -6.0, -10.4, -8.6, -9.5, -50.0, -15.5, -50.0, -13.9, -7.8, -10.5, -8.7, -9.6, -50.0, -16.5, -17.1, -14.8, -12.1, -18.9, -12.4, -17.4,],
260
- [-8.5, 0.8, -9.1, -0.7, -10.1, -7.5, -9.1, -8.2, -11.4, -3.1, -11.8, -4.4, -15.5, -14.3, -14.8, -15.4, -6.6, -4.7, -7.1, -5.8, -12.5, -10.3, -11.0, -12.2, -13.4, -10.6, -12.5, -11.8, -17.4, -15.1, -17.7, -15.7, 2.9, 12.5, 3.1, 10.3, -7.7, -5.2, -6.2, -7.3, -5.4, -1.7, -5.4, -3.7, -11.6, -9.1, -13.0, -10.8, -50.0, -10.3, -50.0, -11.2, -9.8, -8.3, -9.1, -9.7, -50.0, -12.7, -20.6, -13.1, -16.0, -16.6, -17.0, -18.4,],
261
- [-5.0, -6.4, -3.4, -5.6, -7.5, -9.3, -7.1, -8.8, -8.8, -7.4, -6.9, -6.9, -11.4, -15.2, -9.7, -13.7, -1.8, -7.8, -0.8, -7.2, -9.4, -10.6, -8.7, -11.2, -10.0, -10.1, -7.8, -10.5, -13.2, -14.6, -13.0, -14.5, 9.2, 3.1, 10.8, 3.0, -4.5, -6.7, -2.7, -6.7, -5.0, -6.8, -2.5, -6.7, -7.5, -10.4, -7.4, -10.2, -50.0, -15.5, -50.0, -14.2, -8.9, -10.2, -8.5, -10.0, -50.0, -15.6, -15.3, -15.5, -13.0, -18.8, -12.6, -18.3,],
262
- [-8.1, -1.1, -8.9, 1.4, -8.6, -9.2, -9.4, -6.8, -11.0, -4.9, -11.5, -2.6, -13.7, -16.8, -14.5, -12.6, -6.0, -6.7, -7.2, -4.2, -11.6, -11.9, -11.2, -10.9, -13.1, -12.2, -12.5, -10.3, -16.8, -17.2, -17.8, -14.6, 3.5, 10.3, 3.0, 12.4, -6.9, -7.5, -6.8, -4.9, -5.4, -4.2, -5.4, -1.3, -10.8, -11.5, -12.4, -8.2, -50.0, -12.5, -50.0, -8.9, -9.2, -10.0, -9.4, -7.9, -50.0, -14.3, -19.9, -11.4, -16.2, -19.2, -15.8, -15.9,],
263
- [-6.3, -7.4, -8.0, -6.0, 2.8, -0.7, 0.9, 0.3, -7.5, -4.4, -8.4, -3.6, -3.0, -7.7, -3.7, -6.2, -5.3, -10.0, -7.2, -8.9, -0.7, -3.2, -1.8, -2.4, -9.9, -11.7, -9.6, -9.9, -6.3, -9.7, -8.0, -8.4, -3.0, -7.7, -4.5, -6.9, 11.3, 8.2, 9.4, 9.1, -1.0, -3.3, -1.8, -2.4, 1.5, -2.1, -0.4, -1.1, -50.0, -14.5, -50.0, -12.9, 2.8, -0.0, 1.4, 0.7, -50.0, -8.7, -14.1, -7.5, -5.2, -12.5, -6.5, -10.7,],
264
- [-9.9, -5.0, -10.0, -6.5, -0.7, 2.6, -0.2, 0.1, -10.3, -1.8, -9.9, -3.8, -6.4, -4.7, -5.8, -6.7, -8.2, -8.3, -8.0, -10.2, -3.9, -1.0, -2.7, -2.9, -11.7, -8.8, -11.0, -10.1, -9.5, -7.3, -9.4, -8.7, -7.0, -5.2, -6.7, -7.5, 8.2, 11.6, 8.8, 9.1, -3.7, -0.9, -3.1, -3.0, -2.0, 1.2, -2.3, -1.3, -50.0, -12.1, -50.0, -12.6, 0.1, 2.5, 0.7, 0.6, -50.0, -6.0, -14.8, -7.5, -8.6, -9.4, -8.5, -11.2,],
265
- [-7.5, -6.2, -7.2, -6.2, 0.9, 0.2, 2.5, 0.2, -8.3, -3.5, -7.1, -3.7, -4.1, -6.3, -3.1, -6.3, -5.7, -8.9, -5.6, -8.4, -2.3, -2.2, 0.7, -2.7, -9.8, -8.9, -7.1, -9.3, -7.5, -8.2, -6.2, -7.9, -4.3, -6.2, -2.7, -6.8, 9.4, 8.8, 12.1, 8.8, -2.1, -2.0, 0.1, -2.4, 0.0, -1.1, 1.3, -0.8, -50.0, -11.9, -50.0, -12.6, 1.2, 0.7, 3.5, 0.8, -50.0, -7.1, -12.4, -7.1, -7.1, -10.6, -5.0, -10.6,],
266
- [-9.0, -6.5, -10.0, -4.8, 0.1, -0.1, -0.3, 2.4, -9.9, -3.5, -10.6, -2.0, -5.4, -6.6, -5.6, -4.4, -7.6, -9.9, -8.5, -8.2, -3.0, -2.8, -3.0, -0.9, -12.8, -11.8, -10.7, -9.3, -8.8, -9.2, -9.2, -7.1, -6.2, -7.3, -6.7, -4.9, 9.1, 9.1, 8.8, 11.2, -3.1, -3.0, -3.3, -1.0, -1.1, -1.4, -2.0, 1.2, -50.0, -12.8, -50.0, -10.9, 0.8, 0.5, 0.7, 2.3, -50.0, -7.5, -16.5, -5.9, -7.8, -11.1, -7.8, -9.0,],
267
- [-7.1, -5.6, -9.1, -5.1, -5.9, -8.0, -6.9, -7.4, -1.9, -1.6, -4.7, -1.4, -9.6, -14.6, -10.4, -13.0, -6.7, -10.8, -9.4, -9.9, -9.1, -10.5, -9.1, -10.4, -5.9, -9.3, -7.9, -8.1, -12.7, -15.0, -15.1, -14.3, -2.2, -5.4, -5.0, -5.4, -1.0, -3.7, -2.1, -3.1, 12.8, 9.6, 11.1, 10.1, -4.8, -9.4, -8.1, -8.6, -50.0, -18.3, -50.0, -15.4, -5.9, -7.5, -6.6, -7.1, -50.0, -9.5, -11.7, -8.4, -12.5, -17.3, -13.2, -15.4,],
268
- [-10.2, -1.6, -10.2, -3.2, -7.3, -4.6, -6.5, -6.2, -6.7, 3.0, -6.8, 0.8, -11.9, -10.8, -11.5, -12.2, -9.6, -7.1, -9.7, -8.4, -9.8, -8.1, -8.2, -9.7, -9.4, -5.0, -8.0, -7.2, -15.2, -12.8, -14.9, -13.8, -6.6, -1.7, -6.8, -4.2, -3.3, -0.9, -2.0, -3.0, 9.6, 12.8, 9.7, 10.5, -8.5, -5.6, -9.3, -7.8, -50.0, -12.7, -50.0, -13.8, -6.8, -5.1, -5.3, -6.5, -50.0, -4.1, -12.8, -5.8, -14.4, -14.1, -13.6, -14.8,],
269
- [-8.2, -4.7, -7.1, -5.0, -6.5, -7.7, -5.5, -6.9, -4.1, -0.8, -1.2, -0.9, -10.5, -12.8, -8.2, -13.0, -7.5, -10.0, -7.2, -9.7, -9.2, -9.4, -7.3, -10.2, -6.5, -8.0, -4.3, -8.0, -13.1, -14.1, -12.2, -13.8, -3.7, -5.4, -2.5, -5.4, -1.8, -3.1, 0.1, -3.3, 11.1, 9.7, 12.9, 9.8, -5.5, -8.1, -5.4, -7.8, -50.0, -16.4, -50.0, -14.8, -5.9, -7.1, -4.7, -7.2, -50.0, -8.4, -6.4, -8.1, -12.1, -16.2, -10.3, -15.8,],
270
- [-9.2, -3.0, -9.9, -1.2, -6.5, -6.1, -6.8, -4.4, -6.4, 0.9, -7.0, 3.0, -11.8, -13.0, -11.1, -10.4, -9.3, -9.2, -9.8, -6.4, -9.5, -9.5, -9.4, -8.0, -8.1, -8.2, -9.4, -5.2, -14.2, -14.9, -14.9, -12.3, -5.7, -3.7, -6.7, -1.3, -2.4, -3.0, -2.4, -1.0, 10.1, 10.5, 9.8, 13.1, -7.2, -8.0, -8.4, -5.0, -50.0, -14.7, -50.0, -11.4, -6.3, -6.7, -5.8, -5.0, -50.0, -6.1, -13.4, -3.6, -13.0, -16.0, -13.7, -13.3,],
271
- [-8.2, -10.8, -10.1, -9.8, -0.4, -3.6, -1.7, -2.9, -7.9, -8.4, -9.8, -8.2, 6.2, 2.3, 0.6, 2.9, -7.1, -11.6, -9.2, -11.1, -5.6, -8.3, -7.2, -8.4, -10.7, -13.6, -11.4, -12.0, 0.0, -2.8, -1.8, -2.4, -6.0, -11.6, -7.5, -10.8, 1.5, -2.0, 0.0, -1.1, -4.8, -8.5, -5.5, -7.2, 11.9, 8.6, 10.0, 9.0, -50.0, -14.2, -50.0, -12.8, -4.1, -7.4, -5.7, -6.5, -50.0, -11.0, -14.3, -9.9, 1.4, -7.9, -0.7, -6.8,],
272
- [-12.5, -8.7, -13.0, -9.9, -3.9, -1.0, -3.4, -2.9, -12.5, -6.3, -11.6, -8.1, 3.3, 6.0, -1.6, 3.8, -10.5, -10.1, -11.1, -11.1, -9.0, -6.9, -8.2, -9.1, -14.0, -11.4, -12.3, -12.1, -3.1, 0.2, -3.2, -2.2, -10.4, -9.1, -10.4, -11.5, -2.1, 1.2, -1.1, -1.4, -9.4, -5.6, -8.1, -8.0, 8.6, 12.4, 8.6, 9.5, -50.0, -10.4, -50.0, -11.6, -7.2, -5.7, -7.5, -7.4, -50.0, -8.6, -15.7, -9.7, -3.0, -3.7, -3.2, -5.9,],
273
- [-11.1, -11.9, -10.6, -11.3, -2.6, -4.1, -1.7, -3.5, -11.4, -9.6, -9.6, -9.2, 3.7, 2.5, 1.6, 2.5, -9.6, -12.3, -9.5, -11.8, -8.0, -9.4, -7.2, -9.3, -13.3, -12.8, -10.9, -12.6, -1.8, -2.9, -0.8, -2.9, -8.6, -13.0, -7.4, -12.4, -0.4, -2.3, 1.3, -2.0, -8.1, -9.3, -5.4, -8.4, 10.0, 8.6, 11.4, 8.9, -50.0, -13.7, -50.0, -13.2, -6.1, -8.1, -5.5, -7.5, -50.0, -11.3, -12.7, -10.1, -1.6, -7.8, -0.3, -7.2,],
274
- [-11.4, -10.0, -12.7, -8.2, -3.1, -3.1, -2.8, -0.9, -11.7, -7.3, -12.1, -5.8, 3.6, 3.6, -1.1, 5.8, -9.4, -11.9, -10.7, -10.0, -8.5, -8.8, -8.2, -6.5, -13.9, -13.0, -12.9, -10.9, -3.1, -2.3, -3.2, -0.2, -9.5, -10.8, -10.2, -8.2, -1.1, -1.3, -0.8, 1.2, -8.6, -7.8, -7.8, -5.0, 9.0, 9.5, 8.9, 12.0, -50.0, -13.0, -50.0, -10.3, -6.2, -7.0, -7.1, -5.4, -50.0, -9.3, -14.0, -8.2, -2.4, -6.3, -2.4, -3.9,],
275
- [-50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, 33.3, -50.0, 30.6, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, 29.2, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0,],
276
- [-14.8, -6.2, -14.9, -7.6, -14.6, -11.6, -13.0, -12.2, -14.0, -9.0, -14.1, -10.1, -13.6, -11.2, -12.4, -12.5, -8.1, 2.2, -8.7, 0.4, -15.3, -11.3, -13.2, -13.3, -11.9, -7.2, -11.8, -7.9, -10.7, -7.4, -10.8, -8.9, -15.5, -10.3, -15.5, -12.5, -14.5, -12.1, -11.9, -12.8, -18.3, -12.7, -16.4, -14.7, -14.2, -10.4, -13.7, -13.0, -50.0, 15.1, -50.0, 13.3, -9.9, -5.8, -8.9, -7.6, -50.0, -1.5, -7.8, -3.0, -8.1, 3.6, -9.4, 2.0,],
277
- [-50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, 30.6, -50.0, 35.2, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, 28.5, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0,],
278
- [-13.8, -7.5, -14.4, -5.1, -12.6, -11.6, -11.5, -10.1, -13.2, -9.7, -12.7, -7.4, -11.9, -11.9, -11.5, -10.2, -7.2, 0.9, -8.6, 2.6, -14.1, -12.8, -13.3, -11.0, -9.7, -8.4, -11.2, -5.3, -9.3, -8.7, -9.9, -7.1, -13.9, -11.2, -14.2, -8.9, -12.9, -12.6, -12.6, -10.9, -15.4, -13.8, -14.8, -11.4, -12.8, -11.6, -13.2, -10.3, -50.0, 13.3, -50.0, 15.2, -8.6, -7.0, -8.4, -4.8, -50.0, -3.0, -7.1, -0.1, -7.3, 2.3, -8.7, 3.9,],
279
- [-7.3, -6.3, -8.9, -5.5, 2.9, 0.2, 1.5, 1.2, -8.5, -2.3, -10.0, -1.7, -5.6, -10.5, -5.5, -9.6, -4.3, -7.9, -6.1, -7.2, 2.3, -0.6, 0.5, -0.0, -8.9, -11.0, -9.4, -9.3, -4.6, -9.4, -7.3, -8.1, -7.8, -9.8, -8.9, -9.2, 2.8, 0.1, 1.2, 0.8, -5.9, -6.8, -5.9, -6.3, -4.1, -7.2, -6.1, -6.2, -50.0, -9.9, -50.0, -8.6, 12.5, 9.4, 11.0, 9.8, -50.0, -4.8, -8.7, -3.5, -0.0, -8.6, -2.1, -7.0,],
280
- [-10.1, -4.3, -10.8, -5.8, 0.1, 2.3, 0.7, 0.6, -10.4, -0.2, -10.8, -2.0, -8.8, -9.2, -8.0, -9.7, -6.8, -5.9, -7.5, -7.0, -1.4, 2.2, -0.9, -0.4, -10.8, -7.7, -9.8, -8.8, -8.9, -7.3, -9.6, -9.1, -10.5, -8.3, -10.2, -10.0, -0.0, 2.5, 0.7, 0.5, -7.5, -5.1, -7.1, -6.7, -7.4, -5.7, -8.1, -7.0, -50.0, -5.8, -50.0, -7.0, 9.4, 12.7, 10.1, 10.0, -50.0, -1.5, -11.3, -3.3, -5.4, -4.2, -5.6, -6.8,],
281
- [-8.4, -6.2, -8.9, -5.9, 1.8, 0.4, 2.7, 1.2, -9.1, -1.2, -8.8, -1.5, -7.2, -10.5, -4.9, -9.6, -5.7, -7.4, -5.5, -7.4, 0.3, -0.3, 1.8, -0.4, -9.0, -8.7, -7.3, -8.9, -5.9, -9.4, -6.4, -8.7, -8.7, -9.1, -8.5, -9.4, 1.4, 0.7, 3.5, 0.7, -6.6, -5.3, -4.7, -5.8, -5.7, -7.5, -5.5, -7.1, -50.0, -8.9, -50.0, -8.4, 11.0, 10.1, 13.2, 10.2, -50.0, -4.2, -6.1, -3.6, -3.5, -8.4, -1.2, -6.8,],
282
- [-9.1, -5.4, -10.4, -4.2, 1.0, 0.5, 0.6, 2.4, -9.6, -1.5, -10.5, -0.5, -8.9, -10.5, -7.2, -8.3, -6.3, -6.9, -7.7, -5.1, -0.5, 0.1, -0.6, 2.3, -11.1, -10.2, -10.5, -7.0, -8.3, -9.4, -9.4, -6.6, -9.6, -9.7, -10.0, -7.9, 0.7, 0.6, 0.8, 2.3, -7.1, -6.5, -7.2, -5.0, -6.5, -7.4, -7.5, -5.4, -50.0, -7.6, -50.0, -4.8, 9.8, 10.0, 10.2, 12.1, -50.0, -3.1, -11.4, -0.7, -4.6, -6.6, -4.9, -3.9,],
283
- [-50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, 29.2, -50.0, 28.5, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, 33.3, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0, -50.0,],
284
- [-13.0, -7.0, -13.1, -8.3, -9.2, -6.5, -8.9, -7.6, -9.8, -0.7, -9.2, -2.1, -12.4, -10.3, -12.4, -11.6, -9.5, -4.6, -10.4, -5.7, -13.6, -10.1, -11.4, -10.9, -6.5, -1.5, -6.2, -3.6, -12.8, -8.0, -12.3, -9.7, -16.5, -12.7, -15.6, -14.3, -8.7, -6.0, -7.1, -7.5, -9.5, -4.1, -8.4, -6.1, -11.0, -8.6, -11.3, -9.3, -50.0, -1.5, -50.0, -3.0, -4.8, -1.5, -4.2, -3.1, -50.0, 16.4, -5.1, 14.2, -10.1, -4.3, -10.0, -5.4,],
285
- [-13.5, -16.3, -11.8, -15.5, -13.6, -15.3, -12.1, -16.1, -7.7, -13.3, -4.2, -12.6, -14.1, -16.2, -10.3, -15.4, -9.6, -11.6, -7.7, -9.8, -14.3, -17.5, -11.1, -17.2, -5.3, -7.1, -2.2, -7.1, -9.6, -11.9, -8.7, -11.4, -17.1, -20.6, -15.3, -19.9, -14.1, -14.8, -12.4, -16.5, -11.7, -12.8, -6.4, -13.4, -14.3, -15.7, -12.7, -14.0, -50.0, -7.8, -50.0, -7.1, -8.7, -11.3, -6.1, -11.4, -50.0, -5.1, 18.6, -4.8, -8.6, -8.1, -4.5, -7.3,],
286
- [-12.4, -8.2, -13.0, -5.9, -7.7, -7.8, -7.4, -5.8, -8.8, -2.0, -9.3, -0.4, -11.6, -11.3, -11.6, -9.4, -8.9, -5.6, -10.0, -3.2, -11.5, -11.1, -10.5, -8.3, -6.3, -4.9, -6.7, -1.2, -10.6, -9.7, -11.3, -8.0, -14.8, -13.1, -15.5, -11.4, -7.5, -7.5, -7.1, -5.9, -8.4, -5.8, -8.1, -3.6, -9.9, -9.7, -10.1, -8.2, -50.0, -3.0, -50.0, -0.1, -3.5, -3.3, -3.6, -0.7, -50.0, 14.2, -4.8, 16.4, -8.9, -5.8, -8.9, -3.4,],
287
- [-10.7, -13.2, -12.4, -11.6, -4.8, -8.4, -6.1, -7.2, -10.3, -11.8, -11.0, -11.6, 2.8, -1.7, 0.7, -1.1, -6.2, -9.7, -7.3, -8.4, -5.3, -8.6, -6.1, -8.3, -10.5, -11.2, -9.8, -10.2, 9.5, 6.5, 7.6, 6.8, -12.1, -16.0, -13.0, -16.2, -5.2, -8.6, -7.1, -7.8, -12.5, -14.4, -12.1, -13.0, 1.4, -3.0, -1.6, -2.4, -50.0, -8.1, -50.0, -7.3, -0.0, -5.4, -3.5, -4.6, -50.0, -10.1, -8.6, -8.9, 13.2, -0.9, 9.7, -0.3,],
288
- [-18.1, -12.3, -19.4, -14.2, -12.2, -9.5, -11.5, -10.8, -17.9, -11.9, -18.2, -13.9, -6.4, -3.7, -6.8, -5.4, -12.8, -5.9, -13.6, -7.4, -13.7, -9.9, -12.9, -12.7, -16.2, -11.6, -15.2, -12.7, -3.2, 0.5, -3.3, -1.8, -18.9, -16.6, -18.8, -19.2, -12.5, -9.4, -10.6, -11.1, -17.3, -14.1, -16.2, -16.0, -7.9, -3.7, -7.8, -6.3, -50.0, 3.6, -50.0, 2.3, -8.6, -4.2, -8.4, -6.6, -50.0, -4.3, -8.1, -5.8, -0.9, 14.2, -1.8, 11.6,],
289
- [-11.8, -13.1, -11.5, -12.0, -6.2, -8.3, -5.4, -7.4, -11.8, -12.3, -11.1, -11.4, 0.5, -2.5, 2.4, -1.6, -6.8, -9.9, -6.4, -8.9, -6.1, -8.6, -5.0, -7.8, -10.4, -11.6, -8.5, -9.9, 8.2, 6.4, 8.7, 6.9, -12.4, -17.0, -12.6, -15.8, -6.5, -8.5, -5.0, -7.8, -13.2, -13.6, -10.3, -13.7, -0.7, -3.2, -0.3, -2.4, -50.0, -9.4, -50.0, -8.7, -2.1, -5.6, -1.2, -4.9, -50.0, -10.0, -4.5, -8.9, 9.7, -1.8, 11.3, -0.9,],
290
- [-17.2, -13.3, -17.8, -11.6, -11.0, -11.1, -10.4, -9.0, -16.0, -12.7, -16.1, -11.1, -5.2, -5.4, -6.0, -3.3, -11.8, -7.3, -13.3, -5.9, -12.7, -11.9, -11.9, -9.3, -15.2, -15.0, -14.9, -11.0, -2.8, -1.8, -2.9, 0.4, -17.4, -18.4, -18.3, -15.9, -10.7, -11.2, -10.6, -9.0, -15.4, -14.8, -15.8, -13.3, -6.8, -5.9, -7.2, -3.9, -50.0, 2.0, -50.0, 3.9, -7.0, -6.8, -6.8, -3.9, -50.0, -5.4, -7.3, -3.4, -0.3, 11.6, -0.9, 14.1,]];
291
- this.TRANS = [[5, 0, 0, 4],
292
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293
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294
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295
- this.CONBLO = { 'A': 0, 'R': 1, 'N': 2, 'D': 3, 'C': 4, 'Q': 5, 'E': 6, 'G': 7, 'H': 8, 'I': 9, 'L': 10, 'K': 11, 'M': 12, 'F': 13, 'P': 14, 'S': 15, 'T': 16, 'W': 17, 'Y': 18, 'V': 19, 'B': 20, 'Z': 21, 'X': 22, '*': 23 };
296
- this.CONNUCL = { 'A': 0, 'T': 1, 'C': 2, 'G': 3 };
297
- this.CONSCHN = { 'AAA': 0, 'AAC': 1, 'AAG': 2, 'AAT': 3, 'ACA': 4, 'ACC': 5, 'ACG': 6, 'ACT': 7, 'AGA': 8, 'AGC': 9, 'AGG': 10, 'AGT': 11, 'ATA': 12, 'ATC': 13, 'ATG': 14, 'ATT': 15, 'CAA': 16, 'CAC': 17, 'CAG': 18, 'CAT': 19, 'CCA': 20, 'CCC': 21, 'CCG': 22, 'CCT': 23, 'CGA': 24, 'CGC': 25, 'CGG': 26, 'CGT': 27, 'CTA': 28, 'CTC': 29, 'CTG': 30, 'CTT': 31, 'GAA': 32, 'GAC': 33, 'GAG': 34, 'GAT': 35, 'GCA': 36, 'GCC': 37, 'GCG': 38, 'GCT': 39, 'GGA': 40, 'GGC': 41, 'GGG': 42, 'GGT': 43, 'GTA': 44, 'GTC': 45, 'GTG': 46, 'GTT': 47, 'TAA': 48, 'TAC': 49, 'TAG': 50, 'TAT': 51, 'TCA': 52, 'TCC': 53, 'TCG': 54, 'TCT': 55, 'TGA': 56, 'TGC': 57, 'TGG': 58, 'TGT': 59, 'TTA': 60, 'TTC': 61, 'TTG': 62, 'TTT': 63 };
298
- this.setMethod(alignGrid_);
299
- this.setSequences(seq1_, seq2_);
300
- this.setGap(gap_);
301
- }
302
- SequenceAlignment.prototype.fillNeedleman = function () {
303
- for (var i = 0; i <= this.len1; i++) {
304
- this.dpGrid[i][0].value = -i * this.gap;
305
- this.dpGrid[i][0].parentI = i - 1;
306
- this.dpGrid[i][0].parentJ = 0;
307
- }
308
- for (var i = 1; i <= this.len2; i++) {
309
- this.dpGrid[0][i].value = -i * this.gap;
310
- this.dpGrid[0][i].parentI = 0;
311
- this.dpGrid[0][i].parentJ = i - 1;
312
- }
313
- };
314
- SequenceAlignment.prototype.fillOne = function (i, j) {
315
- this.dpGrid[i][j].value = Math.max(this.dpGrid[i - 1][j - 1].value + this.scores[i - 1][j - 1], Math.max(this.dpGrid[i - 1][j].value - this.gap, this.dpGrid[i][j - 1].value - this.gap));
316
- if (this.dpGrid[i][j].value == this.dpGrid[i - 1][j - 1].value + this.scores[i - 1][j - 1]) {
317
- this.dpGrid[i][j].parentI = i - 1;
318
- this.dpGrid[i][j].parentJ = j - 1;
319
- }
320
- else if (this.dpGrid[i][j].value == this.dpGrid[i - 1][j].value - this.gap) {
321
- this.dpGrid[i][j].parentI = i - 1;
322
- this.dpGrid[i][j].parentJ = j;
323
- }
324
- else {
325
- this.dpGrid[i][j].parentI = i;
326
- this.dpGrid[i][j].parentJ = j - 1;
327
- }
328
- };
329
- SequenceAlignment.prototype.gridFromName = function (path) {
330
- switch (path) {
331
- case 'BLOSUM45':
332
- this.alignGrid = this.BLOSUM45;
333
- this.connections = this.CONBLO;
334
- this.step = 1;
335
- break;
336
- case 'BLOSUM50':
337
- this.alignGrid = this.BLOSUM50;
338
- this.connections = this.CONBLO;
339
- this.step = 1;
340
- break;
341
- case 'BLOSUM62':
342
- this.alignGrid = this.BLOSUM62;
343
- this.connections = this.CONBLO;
344
- this.step = 1;
345
- break;
346
- case 'BLOSUM80':
347
- this.alignGrid = this.BLOSUM80;
348
- this.connections = this.CONBLO;
349
- this.step = 1;
350
- break;
351
- case 'BLOSUM90':
352
- this.alignGrid = this.BLOSUM90;
353
- this.connections = this.CONBLO;
354
- this.step = 1;
355
- break;
356
- case 'PAM30':
357
- this.alignGrid = this.PAM30;
358
- this.connections = this.CONBLO;
359
- this.step = 1;
360
- break;
361
- case 'PAM70':
362
- this.alignGrid = this.PAM70;
363
- this.connections = this.CONBLO;
364
- this.step = 1;
365
- break;
366
- case 'PAM250':
367
- this.alignGrid = this.PAM250;
368
- this.connections = this.CONBLO;
369
- this.step = 1;
370
- break;
371
- case 'NUCLEOTIDES':
372
- this.alignGrid = this.NUCLEOTIDES;
373
- this.connections = this.CONNUCL;
374
- this.step = 1;
375
- break;
376
- case 'TRANS':
377
- this.alignGrid = this.TRANS;
378
- this.connections = this.CONNUCL;
379
- this.step = 1;
380
- break;
381
- case 'SCHNEIDER':
382
- this.alignGrid = this.SCHNEIDER;
383
- this.connections = this.CONSCHN;
384
- this.step = 3;
385
- break;
386
- }
387
- this.fillScores();
388
- };
389
- SequenceAlignment.prototype.constructResult = function (i, j) {
390
- var res1 = "", res2 = "", gapS = "";
391
- var total = this.dpGrid[i][j].value;
392
- for (var i_1 = 0; i_1 < this.step; i_1++) {
393
- gapS += '|';
394
- }
395
- while (i > 0 || j > 0) {
396
- if (this.dpGrid[i][j].parentI == i) {
397
- res1 = gapS + res1;
398
- res2 = this.seq2.substr((j - 1) * this.step, this.step) + res2;
399
- }
400
- else if (this.dpGrid[i][j].parentJ == j) {
401
- res2 = gapS + res2;
402
- res1 = this.seq1.substr((i - 1) * this.step, this.step) + res1;
403
- }
404
- else {
405
- if (i - 1 >= 0)
406
- res1 = this.seq1.substr((i - 1) * this.step, this.step) + res1;
407
- else
408
- res1 = gapS + res1;
409
- if (j - 1 >= 0)
410
- res2 = this.seq2.substr((j - 1) * this.step, this.step) + res2;
411
- else
412
- res2 = gapS + res2;
413
- }
414
- var tempI = i;
415
- i = this.dpGrid[i][j].parentI;
416
- j = this.dpGrid[tempI][j].parentJ;
417
- }
418
- return new Aligned(res1, res2, total);
419
- };
420
- SequenceAlignment.prototype.fillScores = function () {
421
- this.scores = [];
422
- for (var i = 0; i < this.len1; i++) {
423
- this.scores.push([]);
424
- for (var j = 0; j < this.len2; j++) {
425
- this.scores[i].push(this.alignGrid[this.connections[this.seq1.substr(i * this.step, this.step)]][this.connections[this.seq2.substr(j * this.step, this.step)]]);
426
- }
427
- }
428
- };
429
- SequenceAlignment.prototype.typeRec = function () {
430
- if (/[ATGC]*/.test(this.seq1) && /[ATGC]*/.test(this.seq2))
431
- return "NUCLEOTIDES";
432
- if (/[ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX*]*/.test(this.seq1) && /[ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX*]*/.test(this.seq2))
433
- return "BLOSUM62";
434
- throw Error("Can't recognize sequence type");
435
- };
436
- SequenceAlignment.prototype.needlemanWunch = function () {
437
- this.dpGrid = [];
438
- for (var i = 0; i < this.len1 + 1; i++) {
439
- var row = [];
440
- for (var j = 0; j < this.len2 + 1; j++)
441
- row.push(new Cell());
442
- this.dpGrid.push(row);
443
- }
444
- this.fillNeedleman();
445
- for (var i = 1; i <= this.len1; i++) {
446
- for (var j = 1; j <= this.len2; j++) {
447
- this.fillOne(i, j);
448
- }
449
- }
450
- return this.constructResult(this.len1, this.len2);
451
- };
452
- SequenceAlignment.prototype.smithWaterman = function () {
453
- this.dpGrid = [];
454
- for (var i = 0; i < this.len1 + 1; i++) {
455
- var row = [];
456
- for (var j = 0; j < this.len2 + 1; j++)
457
- row.push(new Cell());
458
- this.dpGrid.push(row);
459
- }
460
- var bestVal = 0;
461
- var bestI = 0, bestJ = 0;
462
- for (var i = 1; i <= this.len1; i++) {
463
- for (var j = 1; j <= this.len2; j++) {
464
- this.fillOne(i, j);
465
- if (this.dpGrid[i][j].value <= 0) {
466
- this.dpGrid[i][j].value = 0;
467
- this.dpGrid[i][j].parentI = 0;
468
- this.dpGrid[i][j].parentJ = 0;
469
- }
470
- else if (this.dpGrid[this.dpGrid[i][j].parentI][this.dpGrid[i][j].parentJ].value == 0) {
471
- this.dpGrid[i][j].parentI = 0;
472
- this.dpGrid[i][j].parentJ = 0;
473
- }
474
- if (this.dpGrid[i][j].value > bestVal) {
475
- bestVal = this.dpGrid[i][j].value;
476
- bestI = i;
477
- bestJ = j;
478
- }
479
- }
480
- }
481
- return this.constructResult(bestI, bestJ);
482
- };
483
- SequenceAlignment.prototype.setSequences = function (seq1_, seq2_) {
484
- this.seq1 = seq1_;
485
- this.seq2 = seq2_;
486
- this.len1 = this.seq1.length / this.step;
487
- this.len2 = this.seq2.length / this.step;
488
- this.fillScores();
489
- };
490
- SequenceAlignment.prototype.setGap = function (gap_) {
491
- this.gap = gap_;
492
- };
493
- SequenceAlignment.prototype.setMethod = function (alignGrid_) {
494
- if (alignGrid_ === void 0) { alignGrid_ = ""; }
495
- if (alignGrid_ == "AUTO") {
496
- alignGrid_ = this.typeRec();
497
- }
498
- this.gridFromName(alignGrid_);
499
- };
500
- return SequenceAlignment;
501
- }());
502
- //name: sequenceAlignment
503
- function sequenceAlignment() {
504
- var choice = ui.choiceInput('ALignment table', 'AUTO', ['AUTO', 'NUCLEOTIDES', 'BLOSUM45', 'BLOSUM50', 'BLOSUM62', 'BLOSUM80', 'BLOSUM90', 'PAM30', 'PAM70', 'PAM250', 'SCHNEIDER', 'TRANS']);
505
- var algo = ui.choiceInput('Alignment type', 'Local alignment', ['Local alignment', 'Global alignment']);
506
- var gap = ui.intInput('Gap', 1);
507
- var seq1 = ui.stringInput('First sequence', '');
508
- var seq2 = ui.stringInput('Second sequence', '');
509
- ui.dialog('ALignment')
510
- .add(ui.div([ui.p('Set alignment parameters'),
511
- algo,
512
- choice,
513
- gap,
514
- seq1,
515
- seq2]))
516
- .onOK(function (_) {
517
- var toAlign = new SequenceAlignment(seq1.value, seq2.value, gap.value, choice.value);
518
- var res;
519
- if (algo.value == 'Local alignment') {
520
- res = toAlign.smithWaterman();
521
- }
522
- else {
523
- res = toAlign.needlemanWunch();
524
- }
525
- grok.shell.info(res.seq1 + "\n" + res.seq2 + "\nScore:" + res.score);
526
- })
527
- .showModal(false);
528
- }
529
- exports.sequenceAlignment = sequenceAlignment;