@datagrok/bio 2.1.8 → 2.1.9

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
Files changed (5) hide show
  1. package/dist/package-test.js +1 -3
  2. package/dist/package.js +1 -3
  3. package/package.json +1 -1
  4. package/src/package.ts +0 -3
  5. package/{test-Bio-62cc009524f3-9c526574.html → test-Bio-62cc009524f3-820f73b0.html} +102 -102
package/package.json CHANGED
@@ -5,7 +5,7 @@
5
5
  "name": "Leonid Stolbov",
6
6
  "email": "lstolbov@datagrok.ai"
7
7
  },
8
- "version": "2.1.8",
8
+ "version": "2.1.9",
9
9
  "description": "Bio is a [package](https://datagrok.ai/help/develop/develop#packages) for the [Datagrok](https://datagrok.ai) platform",
10
10
  "repository": {
11
11
  "type": "git",
package/src/package.ts CHANGED
@@ -588,9 +588,6 @@ export async function testDetectMacromolecule(path: string): Promise<DG.DataFram
588
588
  //tags: panel, bio
589
589
  //input: column col {semType: Macromolecule}
590
590
  export function splitToMonomers(col: DG.Column<string>): void {
591
- if (!col.getTag(bio_TAGS.aligned).includes(C.MSA))
592
- return grok.shell.error('Splitting is applicable only for aligned sequences');
593
-
594
591
  const tempDf = splitAlignedSequences(col);
595
592
  const originalDf = col.dataFrame;
596
593
  for (const tempCol of tempDf.columns) {
package/{test-Bio-62cc009524f3-9c526574.html → test-Bio-62cc009524f3-820f73b0.html} RENAMED
@@ -1,4 +1,4 @@
1
- <html><head><meta charset="utf-8"/><title>Bio Test Report. Datagrok version datagrok/datagrok:latest SHA=62cc009524f3. Commit 9c526574.</title><style type="text/css">html,
1
+ <html><head><meta charset="utf-8"/><title>Bio Test Report. Datagrok version datagrok/datagrok:latest SHA=62cc009524f3. Commit 820f73b0.</title><style type="text/css">html,
2
2
  body {
3
3
  font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;
4
4
  font-size: 1rem;
@@ -229,7 +229,7 @@ header {
229
229
  font-size: 1rem;
230
230
  padding: 0 0.5rem;
231
231
  }
232
- </style></head><body><div id="jesthtml-content"><header><h1 id="title">Bio Test Report. Datagrok version datagrok/datagrok:latest SHA=62cc009524f3. Commit 9c526574.</h1></header><div id="metadata-container"><div id="timestamp">Started: 2022-11-18 19:11:24</div><div id="summary"><div id="suite-summary"><div class="summary-total">Suites (1)</div><div class="summary-passed">1 passed</div><div class="summary-failed summary-empty">0 failed</div><div class="summary-pending summary-empty">0 pending</div></div><div id="test-summary"><div class="summary-total">Tests (1)</div><div class="summary-passed">1 passed</div><div class="summary-failed summary-empty">0 failed</div><div class="summary-pending summary-empty">0 pending</div></div></div></div><div id="suite-1" class="suite-container"><div class="suite-info"><div class="suite-path">/home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/remote.test.ts</div><div class="suite-time warn">54.487s</div></div><div class="suite-tests"><div class="test-result passed"><div class="test-info"><div class="test-suitename"> </div><div class="test-title">TEST</div><div class="test-status">passed</div><div class="test-duration">38.273s</div></div></div></div><div class="suite-consolelog"><div class="suite-consolelog-header">Console Log</div><div class="suite-consolelog-item"><pre class="suite-consolelog-item-origin"> at Object.&lt;anonymous&gt; (/home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/test-node.ts:63:11)
232
+ </style></head><body><div id="jesthtml-content"><header><h1 id="title">Bio Test Report. Datagrok version datagrok/datagrok:latest SHA=62cc009524f3. Commit 820f73b0.</h1></header><div id="metadata-container"><div id="timestamp">Started: 2022-11-21 17:50:27</div><div id="summary"><div id="suite-summary"><div class="summary-total">Suites (1)</div><div class="summary-passed">1 passed</div><div class="summary-failed summary-empty">0 failed</div><div class="summary-pending summary-empty">0 pending</div></div><div id="test-summary"><div class="summary-total">Tests (1)</div><div class="summary-passed">1 passed</div><div class="summary-failed summary-empty">0 failed</div><div class="summary-pending summary-empty">0 pending</div></div></div></div><div id="suite-1" class="suite-container"><div class="suite-info"><div class="suite-path">/home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/remote.test.ts</div><div class="suite-time warn">51.915s</div></div><div class="suite-tests"><div class="test-result passed"><div class="test-info"><div class="test-suitename"> </div><div class="test-title">TEST</div><div class="test-status">passed</div><div class="test-duration">35.984s</div></div></div></div><div class="suite-consolelog"><div class="suite-consolelog-header">Console Log</div><div class="suite-consolelog-item"><pre class="suite-consolelog-item-origin"> at Object.&lt;anonymous&gt; (/home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/test-node.ts:63:11)
233
233
  at Generator.next (&lt;anonymous&gt;)
234
234
  at fulfilled (/home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/test-node.ts:28:58)
235
235
  at processTicksAndRejections (internal/process/task_queues.js:97:5)</pre><pre class="suite-consolelog-item-message">Using web root: http://localhost:8080</pre></div><div class="suite-consolelog-item"><pre class="suite-consolelog-item-origin"> at /home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/remote.test.ts:40:11
@@ -246,113 +246,113 @@ header {
246
246
  at processTicksAndRejections (internal/process/task_queues.js:97:5)</pre><pre class="suite-consolelog-item-message">Test result : Success : 1 : Bio.Palettes.testPaletteN : OK
247
247
  Test result : Success : 0 : Bio.Palettes.testPaletteAA : OK
248
248
  Test result : Success : 0 : Bio.Palettes.testPalettePtMe : OK
249
- Test result : Success : 281 : Bio.detectors.NegativeEmpty : OK
250
- Test result : Success : 94 : Bio.detectors.Negative1 : OK
251
- Test result : Success : 52 : Bio.detectors.Negative2 : OK
252
- Test result : Success : 27 : Bio.detectors.Negative3 : OK
253
- Test result : Success : 641 : Bio.detectors.NegativeSmiles : OK
254
- Test result : Success : 71 : Bio.detectors.Dna1 : OK
255
- Test result : Success : 48 : Bio.detectors.Rna1 : OK
256
- Test result : Success : 51 : Bio.detectors.AA1 : OK
257
- Test result : Success : 58 : Bio.detectors.MsaDna1 : OK
258
- Test result : Success : 49 : Bio.detectors.MsaAA1 : OK
259
- Test result : Success : 51 : Bio.detectors.SepDna : OK
260
- Test result : Success : 37 : Bio.detectors.SepRna : OK
261
- Test result : Success : 46 : Bio.detectors.SepPt : OK
262
- Test result : Success : 29 : Bio.detectors.SepUn1 : OK
263
- Test result : Success : 27 : Bio.detectors.SepUn2 : OK
264
- Test result : Success : 56 : Bio.detectors.SepMsaN1 : OK
265
- Test result : Success : 775 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvPt : OK
266
- Test result : Success : 24 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvNegativeEntry : OK
267
- Test result : Success : 6 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvNegativeLength : OK
268
- Test result : Success : 49 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvNegativeUniProtKB : OK
269
- Test result : Success : 394 : Bio.detectors.SamplesFastaFastaPt : OK
270
- Test result : Success : 1344 : Bio.detectors.samplesPeptidesComplexNegativeID : OK
271
- Test result : Success : 40 : Bio.detectors.SamplesPeptidesComplexNegativeMeasured : OK
272
- Test result : Success : 32 : Bio.detectors.SamplesPeptidesComplexNegativeValue : OK
273
- Test result : Success : 338 : Bio.detectors.samplesMsaComplexUn : OK
274
- Test result : Success : 16 : Bio.detectors.samplesMsaComplexNegativeActivity : OK
275
- Test result : Success : 302 : Bio.detectors.samplesIdCsvNegativeID : OK
276
- Test result : Success : 262 : Bio.detectors.samplesSarSmallCsvNegativeSmiles : OK
277
- Test result : Success : 250 : Bio.detectors.samplesHelmCsvHELM : OK
278
- Test result : Success : 21 : Bio.detectors.samplesHelmCsvNegativeActivity : OK
279
- Test result : Success : 223 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeID : OK
249
+ Test result : Success : 266 : Bio.detectors.NegativeEmpty : OK
250
+ Test result : Success : 46 : Bio.detectors.Negative1 : OK
251
+ Test result : Success : 76 : Bio.detectors.Negative2 : OK
252
+ Test result : Success : 25 : Bio.detectors.Negative3 : OK
253
+ Test result : Success : 647 : Bio.detectors.NegativeSmiles : OK
254
+ Test result : Success : 64 : Bio.detectors.Dna1 : OK
255
+ Test result : Success : 24 : Bio.detectors.Rna1 : OK
256
+ Test result : Success : 23 : Bio.detectors.AA1 : OK
257
+ Test result : Success : 17 : Bio.detectors.MsaDna1 : OK
258
+ Test result : Success : 34 : Bio.detectors.MsaAA1 : OK
259
+ Test result : Success : 23 : Bio.detectors.SepDna : OK
260
+ Test result : Success : 24 : Bio.detectors.SepRna : OK
261
+ Test result : Success : 24 : Bio.detectors.SepPt : OK
262
+ Test result : Success : 32 : Bio.detectors.SepUn1 : OK
263
+ Test result : Success : 41 : Bio.detectors.SepUn2 : OK
264
+ Test result : Success : 33 : Bio.detectors.SepMsaN1 : OK
265
+ Test result : Success : 750 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvPt : OK
266
+ Test result : Success : 17 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvNegativeEntry : OK
267
+ Test result : Success : 16 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvNegativeLength : OK
268
+ Test result : Success : 41 : Bio.detectors.SamplesFastaCsvNegativeUniProtKB : OK
269
+ Test result : Success : 347 : Bio.detectors.SamplesFastaFastaPt : OK
270
+ Test result : Success : 1222 : Bio.detectors.samplesPeptidesComplexNegativeID : OK
271
+ Test result : Success : 43 : Bio.detectors.SamplesPeptidesComplexNegativeMeasured : OK
272
+ Test result : Success : 20 : Bio.detectors.SamplesPeptidesComplexNegativeValue : OK
273
+ Test result : Success : 300 : Bio.detectors.samplesMsaComplexUn : OK
274
+ Test result : Success : 7 : Bio.detectors.samplesMsaComplexNegativeActivity : OK
275
+ Test result : Success : 191 : Bio.detectors.samplesIdCsvNegativeID : OK
276
+ Test result : Success : 172 : Bio.detectors.samplesSarSmallCsvNegativeSmiles : OK
277
+ Test result : Success : 168 : Bio.detectors.samplesHelmCsvHELM : OK
278
+ Test result : Success : 9 : Bio.detectors.samplesHelmCsvNegativeActivity : OK
279
+ Test result : Success : 180 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeID : OK
280
280
  Test result : Success : 32 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeTestType : OK
281
281
  Test result : Success : 26 : Bio.detectors.samplesTestHelmPositiveHelmString : OK
282
- Test result : Success : 16 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeValid : OK
283
- Test result : Success : 18 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeMolWeight : OK
284
- Test result : Success : 5 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeMolFormula : OK
285
- Test result : Success : 15 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeSmiles : OK
286
- Test result : Success : 787 : Bio.detectors.samplesTestDemogNegativeAll : OK
287
- Test result : Success : 330 : Bio.detectors.samplesTestSmiles2NegativeSmiles : OK
288
- Test result : Success : 155 : Bio.detectors.samplesTestActivityCliffsNegativeSmiles : OK
289
- Test result : Success : 153 : Bio.detectors.samplesFastaPtPosSequence : OK
290
- Test result : Success : 128 : Bio.detectors.samplesTestCerealNegativeCerealName : OK
291
- Test result : Success : 236 : Bio.detectors.samplesTestSpgi100NegativeStereoCategory : OK
292
- Test result : Success : 8 : Bio.detectors.samplesTestSpgi100NegativeScaffoldNames : OK
293
- Test result : Success : 20 : Bio.detectors.samplesTestSpgi100NegativePrimaryScaffoldName : OK
282
+ Test result : Success : 20 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeValid : OK
283
+ Test result : Success : 7 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeMolWeight : OK
284
+ Test result : Success : 39 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeMolFormula : OK
285
+ Test result : Success : 16 : Bio.detectors.samplesTestHelmNegativeSmiles : OK
286
+ Test result : Success : 1164 : Bio.detectors.samplesTestDemogNegativeAll : OK
287
+ Test result : Success : 366 : Bio.detectors.samplesTestSmiles2NegativeSmiles : OK
288
+ Test result : Success : 183 : Bio.detectors.samplesTestActivityCliffsNegativeSmiles : OK
289
+ Test result : Success : 149 : Bio.detectors.samplesFastaPtPosSequence : OK
290
+ Test result : Success : 141 : Bio.detectors.samplesTestCerealNegativeCerealName : OK
291
+ Test result : Success : 228 : Bio.detectors.samplesTestSpgi100NegativeStereoCategory : OK
292
+ Test result : Success : 7 : Bio.detectors.samplesTestSpgi100NegativeScaffoldNames : OK
293
+ Test result : Success : 7 : Bio.detectors.samplesTestSpgi100NegativePrimaryScaffoldName : OK
294
294
  Test result : Success : 7 : Bio.detectors.samplesTestSpgi100NegativeSampleName : OK
295
- Test result : Success : 163 : Bio.detectors.samplesTestUnichemSourcesNegativeSrcUrl : OK
296
- Test result : Success : 7 : Bio.detectors.samplesTestUnichemSourcesNegativeBaseIdUrl : OK
297
- Test result : Success : 165 : Bio.detectors.samplesTestDmvOfficesNegativeOfficeName : OK
295
+ Test result : Success : 190 : Bio.detectors.samplesTestUnichemSourcesNegativeSrcUrl : OK
296
+ Test result : Success : 5 : Bio.detectors.samplesTestUnichemSourcesNegativeBaseIdUrl : OK
297
+ Test result : Success : 158 : Bio.detectors.samplesTestDmvOfficesNegativeOfficeName : OK
298
298
  Test result : Success : 10 : Bio.detectors.samplesTestDmvOfficesNegativeCity : OK
299
- Test result : Success : 165 : Bio.detectors.samplesTestAlertCollectionNegativeSmarts : OK
300
- Test result : Success : 141 : Bio.detectors.samplesTestSpgiNegativeVals : OK
301
- Test result : Success : 6 : Bio.detectorsBenchmark.separatorDnaShorts50Few50 : OK
302
- Test result : Success : 10420 : Bio.detectorsBenchmark.separatorDnaShorts50Many1E6 : OK
303
- Test result : Success : 2371 : Bio.MSA.isCorrect : OK
304
- Test result : Success : 121 : Bio.MSA.isCorrectLong : OK
305
- Test result : Success : 1444 : Bio.sequenceSpace.sequenceSpaceOpens : OK
306
- Test result : Success : 590 : Bio.sequenceSpace.sequenceSpaceWithEmptyRows : OK
307
- Test result : Success : 1021 : Bio.activityCliffs.activityCliffsOpens : OK
308
- Test result : Success : 1073 : Bio.activityCliffs.activityCliffsWithEmptyRows : OK
309
- Test result : Success : 2 : Bio.splitters.fastaMulti : OK
299
+ Test result : Success : 300 : Bio.detectors.samplesTestAlertCollectionNegativeSmarts : OK
300
+ Test result : Success : 140 : Bio.detectors.samplesTestSpgiNegativeVals : OK
301
+ Test result : Success : 12 : Bio.detectorsBenchmark.separatorDnaShorts50Few50 : OK
302
+ Test result : Success : 10234 : Bio.detectorsBenchmark.separatorDnaShorts50Many1E6 : OK
303
+ Test result : Success : 1702 : Bio.MSA.isCorrect : OK
304
+ Test result : Success : 95 : Bio.MSA.isCorrectLong : OK
305
+ Test result : Success : 1274 : Bio.sequenceSpace.sequenceSpaceOpens : OK
306
+ Test result : Success : 609 : Bio.sequenceSpace.sequenceSpaceWithEmptyRows : OK
307
+ Test result : Success : 934 : Bio.activityCliffs.activityCliffsOpens : OK
308
+ Test result : Success : 1024 : Bio.activityCliffs.activityCliffsWithEmptyRows : OK
309
+ Test result : Success : 1 : Bio.splitters.fastaMulti : OK
310
310
  Test result : Success : 1 : Bio.splitters.helm1 : OK
311
- Test result : Success : 0 : Bio.splitters.helm2 : OK
312
- Test result : Success : 0 : Bio.splitters.helm3-multichar : OK
313
- Test result : Success : 1 : Bio.splitters.testHelm1 : OK
314
- Test result : Success : 0 : Bio.splitters.testHelm2 : OK
315
- Test result : Success : 1 : Bio.splitters.testHelm3 : OK
316
- Test result : Success : 360 : Bio.splitters.splitToMonomers : OK
311
+ Test result : Success : 1 : Bio.splitters.helm2 : OK
312
+ Test result : Success : 1 : Bio.splitters.helm3-multichar : OK
313
+ Test result : Success : 0 : Bio.splitters.testHelm1 : OK
314
+ Test result : Success : 1 : Bio.splitters.testHelm2 : OK
315
+ Test result : Success : 0 : Bio.splitters.testHelm3 : OK
316
+ Test result : Success : 352 : Bio.splitters.splitToMonomers : OK
317
317
  Test result : Success : 2 : Bio.splitters.getHelmMonomers : OK
318
- Test result : Success : 96 : Bio.renderers.long sequence performance : OK
319
- Test result : Success : 975 : Bio.renderers.many sequence performance : OK
320
- Test result : Success : 422 : Bio.renderers.rendererMacromoleculeFasta : OK
321
- Test result : Success : 253 : Bio.renderers.rendererMacromoleculeSeparator : OK
322
- Test result : Success : 207 : Bio.renderers.rendererMacromoleculeDifference : OK
323
- Test result : Success : 695 : Bio.renderers.afterMsa : OK
324
- Test result : Success : 672 : Bio.renderers.afterConvert : OK
325
- Test result : Success : 212 : Bio.renderers.selectRendererBySemType : OK
326
- Test result : Success : 7 : Bio.converters.testFastaPtToSeparator : OK
327
- Test result : Success : 4 : Bio.converters.testFastaDnaToSeparator : OK
328
- Test result : Success : 12 : Bio.converters.testFastaRnaToSeparator : OK
329
- Test result : Success : 5 : Bio.converters.testFastaGapsToSeparator : OK
330
- Test result : Success : 3 : Bio.converters.testFastaPtToHelm : OK
331
- Test result : Success : 2 : Bio.converters.testFastaDnaToHelm : OK
332
- Test result : Success : 2 : Bio.converters.testFastaRnaToHelm : OK
333
- Test result : Success : 2 : Bio.converters.testFastaGapsToHelm : OK
318
+ Test result : Success : 92 : Bio.renderers.long sequence performance : OK
319
+ Test result : Success : 964 : Bio.renderers.many sequence performance : OK
320
+ Test result : Success : 367 : Bio.renderers.rendererMacromoleculeFasta : OK
321
+ Test result : Success : 254 : Bio.renderers.rendererMacromoleculeSeparator : OK
322
+ Test result : Success : 97 : Bio.renderers.rendererMacromoleculeDifference : OK
323
+ Test result : Success : 554 : Bio.renderers.afterMsa : OK
324
+ Test result : Success : 389 : Bio.renderers.afterConvert : OK
325
+ Test result : Success : 215 : Bio.renderers.selectRendererBySemType : OK
326
+ Test result : Success : 8 : Bio.converters.testFastaPtToSeparator : OK
327
+ Test result : Success : 7 : Bio.converters.testFastaDnaToSeparator : OK
328
+ Test result : Success : 6 : Bio.converters.testFastaRnaToSeparator : OK
329
+ Test result : Success : 6 : Bio.converters.testFastaGapsToSeparator : OK
330
+ Test result : Success : 4 : Bio.converters.testFastaPtToHelm : OK
331
+ Test result : Success : 3 : Bio.converters.testFastaDnaToHelm : OK
332
+ Test result : Success : 4 : Bio.converters.testFastaRnaToHelm : OK
333
+ Test result : Success : 11 : Bio.converters.testFastaGapsToHelm : OK
334
334
  Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorPtToFasta : OK
335
335
  Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorDnaToFasta : OK
336
- Test result : Success : 2 : Bio.converters.testSeparatorRnaToFasta : OK
337
- Test result : Success : 0 : Bio.converters.testSeparatorGapsToFasta : OK
338
- Test result : Success : 0 : Bio.converters.testSeparatorPtToHelm : OK
336
+ Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorRnaToFasta : OK
337
+ Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorGapsToFasta : OK
338
+ Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorPtToHelm : OK
339
339
  Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorDnaToHelm : OK
340
- Test result : Success : 0 : Bio.converters.testSeparatorRnaToHelm : OK
340
+ Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorRnaToHelm : OK
341
341
  Test result : Success : 1 : Bio.converters.testSeparatorGapsToHelm : OK
342
342
  Test result : Success : 1 : Bio.converters.testHelmDnaToFasta : OK
343
- Test result : Success : 0 : Bio.converters.testHelmRnaToFasta : OK
343
+ Test result : Success : 1 : Bio.converters.testHelmRnaToFasta : OK
344
344
  Test result : Success : 1 : Bio.converters.testHelmPtToFasta : OK
345
- Test result : Success : 0 : Bio.converters.testHelmDnaToSeparator : OK
345
+ Test result : Success : 1 : Bio.converters.testHelmDnaToSeparator : OK
346
346
  Test result : Success : 0 : Bio.converters.testHelmRnaToSeparator : OK
347
347
  Test result : Success : 0 : Bio.converters.testHelmPtToSeparator : OK
348
- Test result : Success : 2 : Bio.converters.testHelmLoneRibose : OK
348
+ Test result : Success : 4 : Bio.converters.testHelmLoneRibose : OK
349
349
  Test result : Success : 2 : Bio.converters.testHelmLoneDeoxyribose : OK
350
- Test result : Success : 2 : Bio.converters.testHelmLonePhosphorus : OK
351
- Test result : Success : 0 : Bio.fastaFileHandler.testNormalFormatting : OK
350
+ Test result : Success : 4 : Bio.converters.testHelmLonePhosphorus : OK
351
+ Test result : Success : 1 : Bio.fastaFileHandler.testNormalFormatting : OK
352
352
  Test result : Success : 0 : Bio.fastaFileHandler.testExtraSpaces : OK
353
- Test result : Success : 0 : Bio.fastaFileHandler.testExtraNewlines : OK
353
+ Test result : Success : 1 : Bio.fastaFileHandler.testExtraNewlines : OK
354
354
  Test result : Success : 0 : Bio.fastaExport.wrapSequenceSingle : OK
355
- Test result : Success : 0 : Bio.fastaExport.wrapSequenceMulti : OK
355
+ Test result : Success : 1 : Bio.fastaExport.wrapSequenceMulti : OK
356
356
  Test result : Success : 1 : Bio.fastaExport.saveAsFastaTest1 : OK
357
357
  Test result : Success : 1 : Bio.fastaExport.saveAsFastaTest2 : OK
358
358
  Test result : Success : 1 : Bio.bio.testGetStatsHelm1 : OK
@@ -362,22 +362,22 @@ Test result : Success : 2 : Bio.bio.testPickupPaletteN1 : OK
362
362
  Test result : Success : 1 : Bio.bio.testPickupPaletteN1e : OK
363
363
  Test result : Success : 1 : Bio.bio.testPickupPaletteAA1 : OK
364
364
  Test result : Success : 1 : Bio.bio.testPickupPaletteX : OK
365
- Test result : Success : 1 : Bio.WebLogo.monomerToShort.longMonomerSingle : OK
365
+ Test result : Success : 0 : Bio.WebLogo.monomerToShort.longMonomerSingle : OK
366
366
  Test result : Success : 0 : Bio.WebLogo.monomerToShort.longMonomerShort : OK
367
367
  Test result : Success : 0 : Bio.WebLogo.monomerToShort.longMonomerLong56 : OK
368
368
  Test result : Success : 0 : Bio.WebLogo.monomerToShort.longMonomerComplexFirstPartShort : OK
369
369
  Test result : Success : 0 : Bio.WebLogo.monomerToShort.longMonomerComplexFirstPartLong56 : OK
370
- Test result : Success : 136 : Bio.WebLogo-positions.allPositions : OK
371
- Test result : Success : 132 : Bio.WebLogo-positions.positions with shrinkEmptyTail option true (filterd) : OK
372
- Test result : Success : 273 : Bio.WebLogo-positions.positions with skipEmptyPositions option : OK
373
- Test result : Success : 3 : Bio.checkInputColumn.testMsaPos : OK
374
- Test result : Success : 2 : Bio.checkInputColumn.testMsaNegHelm : OK
370
+ Test result : Success : 133 : Bio.WebLogo-positions.allPositions : OK
371
+ Test result : Success : 139 : Bio.WebLogo-positions.positions with shrinkEmptyTail option true (filterd) : OK
372
+ Test result : Success : 119 : Bio.WebLogo-positions.positions with skipEmptyPositions option : OK
373
+ Test result : Success : 4 : Bio.checkInputColumn.testMsaPos : OK
374
+ Test result : Success : 1 : Bio.checkInputColumn.testMsaNegHelm : OK
375
375
  Test result : Success : 1 : Bio.checkInputColumn.testMsaNegUN : OK
376
376
  Test result : Success : 1 : Bio.checkInputColumn.testGetActionFunctionMeta : OK
377
- Test result : Success : 462 : Bio.similarity/diversity.similaritySearchViewer : OK
378
- Test result : Success : 362 : Bio.similarity/diversity.diversitySearchViewer : OK
379
- Test result : Success : 253 : Bio.substructureFilters.fasta : OK
380
- Test result : Success : 436 : Bio.substructureFilters.separator : OK
377
+ Test result : Success : 493 : Bio.similarity/diversity.similaritySearchViewer : OK
378
+ Test result : Success : 337 : Bio.similarity/diversity.diversitySearchViewer : OK
379
+ Test result : Success : 242 : Bio.substructureFilters.fasta : OK
380
+ Test result : Success : 425 : Bio.substructureFilters.separator : OK
381
381
  </pre></div><div class="suite-consolelog-item"><pre class="suite-consolelog-item-origin"> at /home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/remote.test.ts:74:11
382
382
  at Generator.next (&lt;anonymous&gt;)
383
383
  at fulfilled (/home/runner/work/public/public/packages/Bio/src/__jest__/remote.test.ts:31:58)