transfuse 0.1.1
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- data/.gitignore +3 -0
- data/Gemfile +3 -0
- data/Gemfile.lock +87 -0
- data/README.md +1 -0
- data/Rakefile +20 -0
- data/bin/transfuse +73 -0
- data/deps/deps.yaml +0 -0
- data/lib/transfuse/cluster.rb +113 -0
- data/lib/transfuse/cmd.rb +38 -0
- data/lib/transfuse/transfuse.rb +201 -0
- data/lib/transfuse/version.rb +17 -0
- data/lib/transfuse.rb +4 -0
- data/notes.md +3 -0
- data/test/data/assembly1.fasta +500 -0
- data/test/data/assembly2.fasta +500 -0
- data/test/data/contig_scores1.csv +100 -0
- data/test/helper.rb +16 -0
- data/test/test_cluster.rb +36 -0
- data/test/test_transfuse.rb +107 -0
- data/transfuse.gemspec +29 -0
- metadata +249 -0
@@ -0,0 +1,500 @@
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>sga_contig58378
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2
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3
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4
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+
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5
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6
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|
+
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8
|
+
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9
|
+
>trinity_contig189572
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10
|
+
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
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|
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|
+
>oases_contig149720
|
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|
+
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|
19
|
+
>oases_contig47139
|
20
|
+
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21
|
+
>trinity_contig118528
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22
|
+
CAAAATCTTTGCTTCTTCTTTTTTTCTGCCGCCTTCAACCCTAGAACCAAATTCGATCTGCTCCACAATGGCCATCACAGCTTTCACCACCGAACACAAAACCAATCACAATTCCCACAAGTTTGGCTTTAAATTAAGCCCTACCAACTACGGTTTTTGGAAAACGATGATTCAACCCTTTCTAATCACCAATAATCTCTTTGGCTATGTCGATGGATCTATTAAATGCCCACCTAAAGTGATTGCTGGTGATAGTCC
|
23
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+
>oases_contig125614
|
24
|
+
TGCGACCACCACCTCCTGTCAACACACACCTACCACCCCTTCCACCAAACACATCAAATCGCTACCAACCTCCATCAACGATGATTAATTTCCATGGAATCTTTATTCTTTTCACTTGGTCTAAAAGAAGGAAAAAAATCAACTTTTTAATTCTTCTTTGTTCAGTCCAGCACTCTCTTCTTGATTTCATCAATTTTAACACCTGGGTAATTCATGGTTTCTGCTCTGATAGCTTGCATAAGTTAGTTGATTCAAATGGCAATGAACCCAGAAGAAGAGGTTGTTCTTACTGAGGAAAAGGGTCATGTGAGATTGATCACCTTGAACCAACCAAGAAAGCTAAATGTGATCTCATCCAAAGTGGTTTATCTATTGGCAGAGAACTTGGAAAAGTGGGAAAAAGATGAAGATGCAAACTTAGTGATTATCAAGGGCGCTGGTCGCGCATTCTCTGCTGGTGGGGACTTAAAAATGTTTTATGATGGCATGAAATCAAAGGATTACTGTCTTGAAGTGGTATATAGATTTTATTGGCTTTGCTATCACATCCATACCTACAAGAAACCACAGGTTGCTCTTGTTCATGGGATTTCTATGGGTGGAGGTGCATCACTTATGGTTCCAATGAAGTTCTCAGTTGTCACAGAGAAAACCGTTTTCGCCATGCCAGAAGCAAGTATCGGGTTTCACACTGATTGTAGTTTCTCATACATTCTTTCTCGTCTTCCAGGCCGTTTGGGTGAATACTTTGCCTTAACCGGGGCCCGGTTAAGTGGTGAGGAACTAGTTGCAGCGGGGTTTGCAACCCATTTCGTTCCTTTAGATAAACTTTCGGTGCTAGAAAACCGTTTGGTGAGCTTGAACTCTGGGGATGAGAGTGCAGTGAAAGCTGCCATTGAAGAATTCTCTGTTAATGTTCAGATTAGTCAAGAAAGTGTATTACACAAACGGGAAGCAATTGATGAGTGTTTTTCAAAGGATTCTGTGGAAGAAATTTTAGAATCATTTGAAGCTGAGTCACGAAAGGAAGGAAATGAATGGATTGTACCCGTGCTTAAAGGCTTAAAAAGATCGTCTCCTACTGGTTTAAAGATAACACTTAAATCGATTCGTGATGGGAGGAAGCAAACATTATCAGAGTGCCTGAAGAAAGAATTTCGACTCACCATAAATATACTCCGATGCTTGATATCTGGTGATGTTTATGAGGGTATTCGTGCTCTTACCATAGACAAAGACAACTCTCCAAAGTGGGGTCCTCTGACTCTTGGTGAAGTTG
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25
|
+
>trinity_contig188539
|
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|
+
GGGGCTCACAAGATCACCCAGAGCAATGCCATCCTGCGCTACATTGCCCGCAAGCACAACCTGTGTGGGGAGACAGAAGAGGAGAAGATTCGTGTGGACATTTTGGAGAACCAGGTTATGGATAACCACATGGAGCTGGTCAGACTGTGCTATGACCCAGATTTTGAGAAACTGAAGCCAAAATACTTGGAGGAACTCCCTGAAAAGCTAAAGCTCTACTCAGAGTTTCTGGGGAAGCGGCCATGGTTTGCAGGAGACAAGATCACCTTTGTGGATTTCCTTGCCTATGATGTCCTTGACATGAAGCGTATATTTGAGCCCAAGTGCTTGGACGCCTT
|
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|
+
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|
28
|
+
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|
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|
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>oases_contig66008
|
30
|
+
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|
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|
+
>sga_contig29748
|
32
|
+
AAACTCCATGAGACATATCAACTCCCTCAGGATTTACATATCTCGAGTAGTCATTCCAATCATTGGTAGTACCATCAAAACCTAAATCAAGACAAGCAATAATCGAACATATATTTACCTAAATAAGAACATATGGTAACTAATTTGATAGAAATTAAACATATGAAATATAAAACATCTAAAATCTACATATGAATTTGTATCAAAGTACCTCCATAGTAATAAGCAGTTGATGGATAACCACTGGGAAAATAAGCCACTGTTGGATCCATAAAATCTGGAATCAAAGGGGTCACAGACCTA
|
33
|
+
>sga_contig6568
|
34
|
+
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|
35
|
+
>idba_contig9337
|
36
|
+
AGATCACTGCCAGTGTCGATGTCCAGCCAATAAGGTTTTGGTGGATTCCCTATGTTCACTGTCACATGATAGTACCTGCACAGAAGTTGAATTCATCCCTTCAACACAAATCATAAAAACTGTAATTTCCATCTGTAGCAACTGTGAAATTTCATAGAATTGACAACATTGTGAAACCTGATTCTGTAAGTTGTACTAAAAACCTGTGTTCCAAAATGACATTTCAGTATTATTCTGTGCCCCTGAAAATTTTTGTTAGGGAATTAACCCAGATAGGATCACTACATGTCTAAGGAGTAACAACAACTTCATAAACTGATAGTCCACCTCAATATATTTGTTAAGGTATCTTTGTTTAAAAAAGTGTGAGGCGCTCTAAGGTGTTTTGGTCCTAAAAGTCAGGGCGCGCACATCAGATGCGTGAGGTGCGTATCTATGTACAACCAAATAATCTTTATTTACAACCAAAAGTTTGACCTTTCATGTCTCTTAGGTTGTTTTTGCATATAAACCTCCTACGGAGCCAAAGTTTGAACTAGAACTACATGAGGTGTGCCTTCATCAACCTCATGTATTTTCCTCAGCGCGTCACATGCCGCCTTTTTAAAACAAGGTGTCCATTATAGCTGGCTGTCATGGTCAGAAATATTCTTGTTTTCACTCTTTTAGGATGCATACGGCCCCCTCAAGTCCCCAATAACAAATTTTCTAGTAAGAGTAGCACTTAAGTTCATAGCCTAACCTAGCAAGCATAAATACCAACTTTAAACACAATTTTAGGGCTCCTATTTGCACACATAGTTTGAATAACTAGAATTTCAAAATCAAAAAGTACTCAAGTTAATAGTCAATACTAAATTCCATGACATGAAAGCTATATTGACAAATGTTTATGTAGTGTAGTTTGACAGCAGTAATTTTGCATGCTATTAGGAATTTCACAATCATTATTGGAGATCAAAGTAGAAACTATATGACCCCAGATTGATATTTTTTCTAGCAATCTTACACATAAAACTACATATAGATAGCTTGCATAGGATCCAAAATCTTCACATGCAATAGTTATGATATGCAGATATTTACAAACAAGAACTTCATGCATCCACATAATCCATACATGCTTAACCACTAAAGAATTCCTCTCACTCAAACCTCCTACAAAATACCTAAAAAGTGGCCCTTTAACATGCATAAAGATTACAAACTACATAAGCCTAAAAATCTTACATACACACAACATATATTAGTGGGCCTACTAGATCTAGAAGGTGTACAGAAGGAAAATCAAGAAAAAGGCACAAATTGACATAAAAGTCCTACAGTTCAATCATCAACCGAATCCATACAAATTCACAATCTTTATAACATAAGAATATCAATTGATGAATATACCCTTTGGGATAAACATTTCCGGTGACTTGAAAAACGACGGAGGAGAACTGATCGGCGGAAGTTGATTTCTTGG
|
37
|
+
>idba_contig62906
|
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|
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CTTTAGTGCTTCTTATTGCCTTACTATTTTTTGTCAATGTGTTGTTTTATGATATTATATCTGTAGCTACATATCCTTGCACCATTTTGTTTGTTATTGGTATTTCTGTACTTCTATTATTGTTTGTTTGAGTGCTGTTTTTTGGAGCTGGAGGTCTCTCTGGTAGCAACCTTTCTATCCCCAGGGATAGAGGTAAGGTTTGCCTACATCCCACCCTCCCTAGACTCGACCCATAACTTTGTTATTTCCTTATGGGTGAGATTTACCGGGTAGGTTTGTTGGTTTTTAACTTTTTTATTCTTACCTTAGTTATTCAAATTGCATCTTTCTTTTTCCCTGGGTGTGTGCTGCTATAGATATAAGCCTATAAATTTTATAGGTTCTATCTTGTTTATTGATTGTGGAGTCTGTCTGTATTACAGTGGCAGTTTTAACTTGTTTACTTATGAATGGGTCAATTCGGTCTAATGAAGAAAAAATATAGCTAAAATGGAGAAAGGATAAATATGCACG
|
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|
+
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|
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|
+
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|
41
|
+
>trinity_contig170154
|
42
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|
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+
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|
+
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|
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
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|
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|
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|
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+
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|
+
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|
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|
+
>idba_contig149778
|
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|
+
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|
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|
+
>idba_contig75954
|
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|
+
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|
139
|
+
>soap_contig172170
|
140
|
+
CCACTACGTACATCATATAATCTCAGCCAAAGCAAGTCTATATAACTAAAATGCTATTTCATCGAAAAGGTACATAATTGAAGTTTGTAACAAAACTCACCAGAGTCACACCACCTGTTGGAACCACCATACCACCACCACTGTCGCCAAACCACCACTGCCGAAGGCGGTGCCTGCGGGTCACTAGACCGAGGCCGAAGGTGAAGGCAGTGCCTGCGGGTTGAAGGACAAAGCCGAAGGTGAAGGCGGTGCCGAAGGCGAGACCCGGTGCCTGCGAGGGGGTGCCAAAGGCGAAAGCGAAGGTTGTGGAGTCAGCCGGTCAGCATATTTTATTTTTAGGTCTGGGTTAGCAATGAGACCCGGTTAGCTAGCCACTTTTCCGAAATCAAACGGGTTGATCTGCTGACCGAGGCAGTCGATCAACCGGGTCAACTTTCTTATTATTTAACACAAGTTTCTTCTAAAAAAATAAAATAATTTGATATGCATTGAAAATAAATATTTAAAAAAAAATCCAATCCAACCATTAGTCTGGTTTGTGGGTTTAACCAGTTGGACTCATAACCAGCCAATTCCAATGAAGGAGTCCATATATACATAAAACGAACCCCTTATGTAGTCGGTTCACAATCCAACTAGTCATTTCAGTTTGATTCTAAGAATAATGTTACTCAAGTATAAATGCAAACACTTTGTATTTAACTTGGAGGAGGTAAGTTTCTTCAAATAGTTTGGATGCACCGTTACCTCTGTGATGGGACATTAACGCTACACTTCATGAACACATGGGCCGATATAGCTCATGGCCTTGACCTTATCATGCCACCATCGACTGAACCCCCTTCCTGCTCGTAAGTCGCCACAACCAGTCTATAAGCACATCGAATACCACCTCGGTCGACCAATAAAATTGCCACTCAAAGCCCAACCACATGAAACAACATTATCCATTTTCAAGTTAACATGATGCCAACTCAACGCGCTCAAAGCAAAACCGAGGGAAGATGGTAACACATTCAACTACAGTCATTGGTGGACCTACTTGTAGAGTAAGGGGTGCAACCGCCTACCCTAAAAAATAATTTTAAAATAACATCCCTCCATTGTTGTTTAGGGATCACTTGACCAACTCCATTGTTGCACAATTTTCTTGTTTTTCATAGATGAACATCAAAGAGGTGATACAGTGATACACACTTTCTATCGAAAGGGATACATATAGCACTGGATACATCTTCGAAGCAAGGCTCATAGGGAACCATAACACCGAAAAAATCAATATTGGTACAAGTAGGAGTACCACACAATCAAAAGGAGAAAATTCCTTGTCTTGTGGTTGATCATCCAAATAGAAACACACGACCACGATCCCAAACATTACACATGCGCCCAGATACCTGATCCAGTTGAGCTTGGAGGGAAGAAGTAACACTATCATAAGCGAGAAAGGAGCAAGAAATGCAGTGAAGCTATTAATAAACCTACAAGGGGTGAGAAAGAGACCCCTACTCGATGGTCTCAATTCTGAATAAAATTACATGACCACAGCTGAGGCTACATGGGCATAAACTGCAACAATGCCAATCGTCCTAAACACACTGTAAATTTCAAGAACAAGTTCGTTATTGGTGTATTGAACTCCCATCAGTGCGATTAAAAAAAA
|
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|
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229
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+
>idba_contig26082
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230
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231
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+
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237
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CAAACATTGATCTTGAGCAAGGCAAGGTCACGGTGTCGGGAAATGCTGATCCCGCAACTCTTATAAAGAAACTCAACAAGTCTGGTAAACATGCTGAGCTATGGGGCCCGCAGAAGGGCATGAACATGTTCAATAACCAGTTCAAGAACATGAGTTTCGATAACAAGAATCTAAAGGGGGGTGGCGGCGGCGGTGGTGGCGGTGGGAAAGATAATCAGAAGAACGGAAAAGGGCATCAGCAAATGCAAGCAGCATTCAATAAAGGGTTCAAAGATATTAAGCCACCTATGAAGGATCAGAAGTCGGTCAAATTTAATTTGCCCGTTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGGAGATTTGACGATGAGGATGATTTTGACGATGATGATAGCTTTGATGATGAGGATGATTTTGATGATGAATATGATGACGAGGATGATGATAGCTTTGATGGGGATGATAAGAAGGGCAATAATATGAATGTTGGCCCAGGGGTGGGTGGGCATGGACCCCATGGGGCATTTGCAATGATGAATGGAAAGAAGGGACCAGGTGCAGGGTTTGAAATACCAGTACAGTTCAAGGGGAAAGGTGGAAGTAATGATGTTAAAAATGGTAAAGGCGGGAAAAAGGGCGGTGATGGTGAAGGTGGTAAAAAGGGTAAAGGCGGTAAAGAAAGTGGTGGCGGTGGTGGGTTTGGTGGCTTTTTCGGTGGTAAGTTTGGAGGAGGACTCCTTGGTGGTGGTGGTGGTGGTAAGAAGAAACAGAGTGCCTCAAGTCCAAAGGGTGGCAAGAAAGGCGGTGATGGTGGTGGTGGACACGGGAAGGGTGGTAATTGGGACAAGAAAGGCGAAGGAAAGCACCACGATGAGGAAAATATTAGTAAAAAGCCAAGTGAGTTTCTTGACTTCAGCAAGCCTCAAAATGGCGGTGGCGGGGGGCGGAATATGGCCCATAACGGTGGTGGTGGAGGCGGCAATGGTGGTGGTCGGAATAATGGCAATCCGATGATGATGCCCCAGATGGGGAACTTTCCGATGGGTCAAATGGGTGGTCACCCAATGGCCCAAATGCAATCAGCACAAGGCTTACCGATGGCATACCGAGGTCCTCAAGGGATGGATCATGGTAACACATTTAACCAACATCAGTATCAACAACAGCAGTACATGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGTACATGCACGCGATGATGATGAACCAACAGCGAGCGAATATGTACCCTCAAATGATGTATGGTCAGCAGCCACATGCCGCCTATGGGCCGCCAATGGGAGCACCGGTGAACGATAATATCACTCACATCTTCAGTGATGAGAACACAGATAGTTGTAGTATTATGTAGTAGGATTTGGTAGTATTTGTGTTGGTTTTAATTTATTTTACAAGTGAATTTAGTTTTTATAGGGGAGTGAAAGGGGTAGAGTAGAAGAACTTGGAGCTTGTAGTTTGTGTATTGTTTATATGTATTAAGTGTTTATGTATGGAAAATCCAGAAGTTTTGGATTTGAGAATATCTTTGCATATCTAAACACCTCAAGGATACCAAGTTAATATATTTCATTTCAAGTTGAAAGGTTTAAAAAAAAAA
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|
241
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+
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242
|
+
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|
243
|
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244
|
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|
245
|
+
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|
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|
+
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248
|
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CATGTTTCATTTGCTGGAAACAAAGGTGGGTACACAACAGCCCAAGGGGAAGTGGGAAATGAGAAAGTTAAGTTTGATAAGGTAAACTACGTTCAATAATTACAAAATAACTTACTTTCAGTTTCTCAAATATGTGATAAAGGCTTCAAAGTAGTCTTTGACAACAAGAAGTGCTACGTTCTAAAGAAGGACTACGTGATACCGGAGGACCAAGTCCTAATGTCAGCTTCAAGATATAATGATCTTTATGTCTTGGATCTCTCAAAGGCCCCCACAACAGATCATGAAGTTCAATGCTTCTTGTCAAAAGCTACTGAGAAGGACTCCATCTCCTGGCATAGGAGAATGGGACACATTAATCCACGGAAGATGAGTCACTTGATCCAGAATGATCTAGTGT
|
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|
+
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|
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|
251
|
+
>oases_contig68735
|
252
|
+
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|
253
|
+
>idba_contig61745
|
254
|
+
GAAGATTGTTATTAAAAGGCGAGACGAGGTTAGAAATGGTGGTGCTATGTCTTCTCCAGACATCAGGAAGATCTTTTTTAAGGAAAGGTCTTCTAAAAACAATCTGTAGAGCCCAACGTAGACAAAAGAGGACATGAAGTGCTTCTTAGAAAAAACAAACACCCCTATAATCTTCAAGCCAACTAGGTGGTTTGGAAGGTCTTTTAGGCGATGGAAGAGTCGAAGTAGGAAGATCGTGTGTAGGAATATTAGTTGCAGGTTAGGGCAGAAGCATCAACTGAAGTCTCAAGTAAGATAACTTATGTAGGAGGCACAAAGCAGAAAGAATAAGTCGCTTAAATAGGTTTGTGTCATACCCACAAACATGTTCAACTAACGGGTCCTGGGCGGGTGTTGGGGTGACCTGTTTATATTAAGAAACTTTTAAGGAGGATTTGTGCCAAAACTTAATCTAGTTGGATATGTAATGTCAAAACCTTAAAAAGTAGAAATAAATGTTAGTTTTATTTGTCAACTGACT
|
255
|
+
>idba_contig39058
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|
+
GGTATCGAGCAATTACAAGTGCTTACTACCGAGGAGCTGTTGGTGCTCTACTAGTATACGATGTCACCCGTCATGCTACTTTTGAGAACATCCAGAGATGGTTGAAGGAGTTGAGAGACCACACTGACCCGAACATCGTTGTGATGCTAATTGGCAACAAATCAGACCTGCGTCACCTACTTGCTGTTTCAACCGAAGATGGGAAAACACTAGCTGAAGCAGAGTCCCTCTATTTCATGGAGACTTCAGCACTGGAAGCAACTAATGTTGAAAATGCTTTCAGTGAAGTGATTACACAGATATACCGAATTGTGAGCAAGAAGGCGGTTGAAGCTGGGGACGAGGGTGGTTCTGCTTCAGTTCCTTCAAAAGGAGCAACGATCGATGTGAAGGATGACTCTTTGGGTGGTAAACGGTTCGGGTGTTGCTCGAATTAGGTGTTGGTGTTAATTTGTTTTGTTTGGGTCTTGTTCATGAGAATGCATTAAGGAGTGTTTTCATGGAATTGTTTGAGAATGTTGAGCAGGTCAAAGGGGGTTTGTTATAGTTATGAACGGGGTCTTATTGAACTTGTGTATTACTTTTATTTGAACTTGGGTATTTGGTTTAGAAATATTTATTAAAATGAAGTAAATTCAAGATGAGACAAGTAATGAGAATGGATTTCTAAATCAGTTATAAATACTTGGTATGATAAATGGC
|
257
|
+
>oases_contig88810
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258
|
+
AAATGATTATTTTTTTTTGTAAATTTAATAAGTAAAAATTTGGAGTGGAAATTCTTGAGACGAAAACATGCCACACTACATGAAGATCAGGTTGTCATATTATCTTAACCCGTTTAAGGTCATGTCCAGGGTGGCCTACTTAACCCATTTAGTTAAACAAATCGACCAACTGACCCATTCAACACGTTTAAACTTGATTACGACCAATCAATCCGTCAACTTGTTTGACTTGTTAAGATAAATGGGTTGTATTTAGGTTACATGTTTTCAAATGTTTGAGTTAGGGTTGATATCTTTGACATGAACAAATATATGGGTTGTGTTCAAGTTAAATGATTTATCCAGCTAACTAGACACTAATGACACCCTAAGTAAAGCACACACCAACATTTGTAAGGGCATATACATGCCCAAATAACCAAGCTTTCC
|
259
|
+
>trinity_contig51825
|
260
|
+
GGCGAATTCACTCGAAAACCGAACCACCATAATCGATTCGATTCGATTCGATTCGATTCGATACAACACCTCCTCCATGGCTTATCTACCACGTGTCCTTCTTCCACAATTTACCAATTCAACCTGCACCAACTCCACCATTTTCCTCAAGCTAAACCCTCCGCCACCCACCACCACCACAAAGCGATTCTCCGTCATCTCAATGGCGGAATTCAACCGCACCACCGTCCTCGTCACCGGCGCCGGTGGCAGAACTGGGCAAATTGTTTACGAGAAGCTGAAGGAGAGATCTGGTGAATATATTGCACGAGGTATGGTTCGAACGGAGGAGAGTAAGGAGAAGATCGGTGGAGACGACGACGTTTTGATCGGAGATATAAGGAATATAGAAACTGTTGTTCCTGCTGTTGAAGGCATTGATGCTCTTGTAATTCTCACTAGTGCGGTTCCTAAGATGAAACCAGGGTTTGATCCAACTAAAGGTGGAAGGCCCGAGTTCTATTTTGAAGAGGGATCATACCCTGAACAAGTTGATTGGGAAGGGCAGAAGAATCAAATTGATGCAGCTAAAGCTGCTGGAGTGAAGCAAATTGTTCTGGTTGGCTCCATGGGTGGAACAAACATTAACCACCCTTTAAACAGCCTGGGAAACGGGAATATACTGGTCTGGAAAAGAAAGGCTGAACAGTATCTAGCAGACTCTGGGATCCCATACACTATTATAAGGTTAGCAATGATGATCTTTATCATTTTCCTTGAT
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261
|
+
>oases_contig42191
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262
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|
289
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290
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>trinity_contig222284
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|
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|
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|
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|
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
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|
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|
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|
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|
+
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
+
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|
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|
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>sga_contig143862
|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
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+
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|
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|
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+
TCTCCAAACCCTCATCCATACTTCTCTCTCCAAACCCTCATCCATACTTCTCTCTCATCAAAACAACACAATTTTTTGTGGGTTTTCTTGATCTTTCTTGCATCAATACCATCATCATCATCATCATCAAGTGATGTTCTTTGGATTCTTGTTATCTGGATTTTATAAAACCTCAATTGTTCTTTTGTCCTGCTTCAATTCATAGAAACACCAAAGGGTTGTTGGTGGATTCTTTAATCCTTAAGTTCAACAACTTCATCTCTCCAATGGCTTCTTCATTAAACTCCATCATTATGCCTGGGTATATGACTTCTTTCAAAGAAACCCAAATAAATTCAAATGGGTCTCTTCCTCCTTCAGTTATTTCCACTGATTTGAGCCAAAGATCTCAACTTTTGTCAGATCACAAGGGTTTAGCTTCAAGTTCTTGGAATACCAAAACCCCTGTTCTTGTATGTTCAAATTTTGAAACTTTTTTCAAAATTTTATCAATGGGTTTGGTTTAAACCTAATTTTGATATCATTTTTCATGATTACAGACACATGCTTCAATTTGTGTTAGCAAATCCATGAGATGGTGGGAAAAGACACTTAAACCCAACATGATTGAGATCAATTCAGCTCAAGAATTGGTGGACACACTATCAAACTCAGGGGATAGATTGGTCATTGTGGAATTTTATTCACCTGGTTGTGGTGGTTGTAAAGCTCTACACCCCAAGATCTGTCAGCTGGCTGAATCAAACCCTAATGCAATTTTCCTCCAAGTGAATTATGAAGAACTCAGACCCATGTGTCAATCTCTGCATATTCATGTTCTACCATTTTTCAGATTCTACAAAGGTCATGAGGGCAAGATTTGCAGCTTTAGCTGCACTGTTGCTACTATCAAGAAATTCAAGGATGCATTATCAAAGTATAAGCCAGATGGGTGTAATCATGGTCCAGCTAAAGGATTAGAGGAGTCTGAGCTGTTGACTTTAGCTTCAATTGGTCAAATTTCATATAAGTGGCCAGTAAAGTCAACTGAGGATGATTTACTTAAAGAGTTGAATACATCAAGCAATCATTTGCTTCCTGCATAGGGGTCTTAGATGCTAGTTTGACATGATTCAAGAATACTGTTTATCTCCAAGAATTTACTTCCTTGTTAGGTTTTAGATTAGCCGACCCGGGTCGGGTTGGTGAACACCTATATGGGTCGGGTTGGTGGACACCTATATGGGTTGGGTTAGTTGACCCATAAAAGGGCTTGGGCTTGTTGATTTTTAGTTGATGGACAAGCCCATTGTTTGATATTGTTTAGTTTGTCATATTGTAATTTGTGATTATTGAAATTAGTGGTTCACTTTTCTTTATCCTATCAGATGAATTTGATCCTCAGGTGTCGCATAACATTAATACAGGACAATAGTGCAACTTTTAAATGCTTTAAAACCTATGTTTTTAAGACCGACTAGCCAGTCGTAGCACGAAGTCAGGAACCGGCTATAGAATTGTTCTGGTCGAGTGA
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|
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+
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|
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|
+
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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+
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|
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|
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|
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|
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|
+
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382
|
+
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|
383
|
+
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|
384
|
+
TCCTTTCTTAACACACACCCAACAACCTCCTCTCTTCTTTACCACCACCACCACCACCGGCCGCTAACGGGCTACCACCTGCCGCCAACATGCTTAAACAGACAAATCTTTTTATGAAGATTCTCATAGCACTCATATTAGGCTGCAACTTTCACAAAAACAAAATCTCTTCTACGTCATATCCTCCACACCACACAACCATCACTTCATTAATGGAAGAACTAAAAGTAGTTGATGGTGATCTTAGTTTCCACAACATCCACCATGCATCCAAAGACTTTGGCAACAGATACAGTTTCCTCCCTTTAGCAGTTCTATACCCAAAATCAGTCTCTGATATCTCGAATCTCGTACGCCACATATTCCAAATGGGACCCACATCCGGGCTAACCATCGCGCCACGTGGTCATGGCCACTCACTTGAAGGTCAAGCCCAGGCTCATCAAGGGGTGGTCATAAACATGGAATCACTAGGGAAATCGCAACAAATGCATTTTCATGTCAATGGGAACACGAAAACGCCTTTTGTTGATGTTTCAGCTGGTGAACTTTGGATTAACATCTTGCATGAGAGTTTAAAACGTGGGTTTGCCCCCAAATCATGGACCGATTATCTTCATTTAACCGTTGGTGGCACGCTGTCTAATGCTGGAATTAGCGGTCAAGCTTTTCGACATGGACCTCAGATCAATAATGTCCACCAGTTACAAGTTGTTACAGGGACAGGAGAAGTAGTAACATGTACAGAAGAAACAAATTCTGATTTATTTCATGGTGTTCTTGGAGGACTTGGGCAATTCGGGATAATCACGCGAGCTCATATTTCGCTCGAACCAGCCCCCGAAATGGTGAAATGGATTAAAGTTCTTTACTTGGATTTTGCTACATTTACAAAAGATCAAGAACAACTAATATCATCAAATGATTCATTTGATTATGTGGAAGGGTTTGTTTTAATCAACAGAACCGGGCTCCTTAATAATTGGAGATCATCTCTTAATTATAAGGATCCGATTCGGGCTAAACGGTTTGTTTCTGAAGGAAAAACCATTTTCTGCCTGGAAATTGCTAAGTATTTTAAGCAGGAAGATGTTCACACCATTGATCAGAAAGTTGAAAGGTTGTTATCAAAACTGAATTACATTGAATTCACACTCTTCATATCAGAAGTGTCTTATATGGAATTTTTGGATAGAGTACATGTTTCTGAGTTAAAACTACAAGAAAAGGGGCTATGGGATGTACCTCATCCATGGTTAAATCTTCTGGTTCCTAAAAGCAAAATACACAAATTTGCTGATGAAGTTTTTGGGAAAATCCTAACCGATACGAGCAATGGGCCAATACTCATCTACCCCGTTGACAAGTCAAGGTGGAACACTAAAACATCAATGGTGACACCAAAGGAGAATGTGTTCTACTTGGTGGCATTTCTATCATCAGCAATGTCATCTTCAACTGGATCAGACGGTTTAGAAAACATTATAAGCCAAAACAAAAAGATTCTAGAAGCATGCAAAACGGCTAACCTTGAAACCAAACAATATTTGCCACACTACAACACACGTGAAGAATGGAAAAAACATTTTGGTAGTCAATGGGAAGGTTTTGCAAGAAGGAAATCTATGTATGACCCTTTGGCAATATTAACTCCCGGCCAAAAAATATTTCAAAAATCAATTAACTTTTTATGACGATTATCTCATGATGAAAGAAGTCATAAAACTATAAATTGATTAATTTGTACATATTATTAGAATCATTTCGTAATTTCTACTCGATCAGTTGTAACAATAGGAAAGCATATATTATGATATAACATAGTAATTTTCATTATGTTAGTTTTGAT
|
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|
+
>sga_contig20688
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+
CAACCATACACACACATAGCCCATCCACATTAGTCAAATTGGTGATCCACTTAAATGGATAAGTGAATTTTTCTTTATAAGTAAGGAAGTATTCTTTTTTGGTTCCAATGTGGGACAAATCTCACACATGACTTTAAACAAAGTTCCAACATTTCTTTCTCAAGCAAAACACCGGTCACGGGTGTCTCCTTCGGTCTCGGTCTAGGGCCGGTCTATTAAGGCTCGTCGGTCATTTTGGTCTCTTGTCGGAACTCACTTTCCGGTCACGGTCTTTCTCCCTTCGCTTCTCAGCTCTTCGCGCCGGTCCTTCTCTAGTGTCGGTCTCTTTCTCCGGTCTTATCTCTTTCTGCGATTCACATGAAATCGCCCCCCTTCTTCATCGTCTCCAACCATCGCTTGCTTCTACTTTCGTTCCGCCGATAGATGGCTTCCGATCAACCATTGCTTCTTCATACATTCTAGCTAATTGCAACAACAAAACTGTTGCGTTTCTTTCCCTTTCCGACATGCTTTTGGTGATAGCAGCCAAGGCTGTTGCGTTTCAATTCTGCTTTTGATTGCTTGCTGTTGTTAAATTCTTGCTTGATTGGCTGCTGCTGCTTCTCATTCTTCAGCCCAACAGCCAAGGGCTGCTCATTCTCTCGCAAGACGACTCTCAAAACGCCCGTTTTTTCTAACCTTGTGCTCTG
|
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|
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|
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|
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|
+
>trinity_contig48572
|
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|
+
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|
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|
+
>soap_contig17952
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|
+
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393
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+
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|
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
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|
+
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|
+
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+
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|
+
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|
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>trinity_contig202226
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|
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GTGGTACATGGCCTCCTCCTCACAGTTGTAGCACCACTGCTTCTTCTTGGTCTGAGAAATCAGTTGCTTGTGCTGTGTTGCCAGCTTCTTGATTTCTTCTACAAATTCCTCCTTACACTTTTCCTTTACTTGCTTACATTTTCTGTCCATCTCACCCTGCATGTTGGCTACAGCTTTATTTACAGCTTGTCTCTTTTCTTCTTCCATTTCAGAACGCAGCTTCTCCAGAGCTTCTCGG
|
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|
+
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|
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GTCTAGTTCCCTTGTAGAAACAAATGATTCTAGGACTTAAATTTGGGTATATGTTGGTGTTGGGAACCCTAGAGTTTTAGTTTATCGAAGATGTTTTTCCACATTGTCCTGGAGCGAAACATGCAGCTTCACCCTCGCCATTTCGGTCG
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