studium 0.14.16

data/lib/studium/exam_topics/bioanalytik_und_biosensoren

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+# === Bioanalytik und Biosensoren               (Bioanalytik tag, Bioana tag)
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+# Diese Datei beinhaltet Informationen über bioanalytische Methoden und
+# Biosensoren.
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+# Inkludiert zur Zeit auch Biochips. Biomarkers higegen werden in einer
+# anderen Datei gesammelt.
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+- Angenommen wir analysieren ein Protein mit Hilfe der Affinitätschromatographie und sehen zwei Peaks. Worauf deutet das hin? Das dieses Protein möglicherweise zwei aktive Untereinheiten besitzt.
+- Andere Bezeichnung für <one>Proteinfällung</one>? <one>Präzipitation</one>. []
+- <one>What kind of fluorescence</one> is measured in a <one>DELFIA assay</one>? The <one>Europium fluorescence</one>.
+- Name <one>three requirements for a useful detection strategy in bioanalytics</one>. A: (1) it must be "specific" (2) it must be "sensitive" (3) it must be <one>simple</one>
+- Löst sich <one>Agarose</one> in Wasser? <one>Ja</one> - aber nur <two>in heißem Wasser</two>.
+- Der <one>Nachweis fetaler Erythrozyten</one> im mütterlichen Blut kann mit Hilfe der <two>Durchflusszytometrie</two> erfolgen. Wir können hierbei fetales Hämoglobin (<one>HbF</one>) von regulärem Hämoglobin unterscheiden. Dazu müssen wir jedoch was noch verwenden? Wir müssen einen <one>spezifischen Antikörper</one> verwenden, der intrazellulär an Hämoglobin binden kann. Mütterliche F-Zellen haben eine schwächere Färbung da sie auch weniger beziehungsweise gar kein fetales Hämoglobin besitzen.
+- In Bioanalytics: what is the <one>true value</one>? This is <one>the actual value of the variable</one> (<two>analyte</two>) that we are trying to measure.
+- <one>Welche Proteine</one> sind in ihrer <two>natürlichen Umgebung</two> nicht von Wasser umgeben? Vor allem Proteine, die in (biologischen) <one>Membranen</one> verankert sind.
+- Können wir <one>Proteine</one> mit Hilfe der <two>Gaschromatographie</two> analysieren? <one>Nein</one>. []
+- <one>Microarrays</one> are not limited to DNA analysis. <two>Name two other microarrays</two>. A: (1) <one>antibody microarrays</one> (2) <one>protein  microarrays</one>
+- Bei der <one>Gelfiltrationschromatographie</one> - <two>wo</two> <three>wird das Proteingemisch aufgetragen</three>? Am <one>oberen Ende der Säule</one>.
+- <one>Lowry assay</one> versus <one>Bradford assay</one>: which one is <two>slower</two>? The <one>Lowry assay</one> is <two>slower</two>.
+- Wir sehen in <one>MALDI</one> ein <two>C-terminales Arginin</two>. Was vermuten wir hier? Das <one>Trypsin</one> eingesetzt wurde. []
+- Bei einem <one>MALDI-TOF</one>: <two>was erhalten alle Teilchen</two>/<two>Ionen</two>? Den <one>gleichen Impuls</one> (<two>über den Laser</two>).
+- <one>Woher</one> bezieht ein <two>Biosensor</two> seine <three>Empfindlichkeit und Selektivität</three>? Aus dem <one>verwendeten biologischen System</one>.
+- Nenne zwei <one>gebräuchliche Trägergase</one> in der <two>Gaschromatographie</two>. A: (1) <one>Helium</one>    (<royalblue>He</royalblue>) (2) <one>Stickstoff</one> (<two>N</two>)
+- Nenne einen qualitativen Unterschied zwischen dem <one>Lowry-Assay</one> und dem <one>Biuret-Assay</one>. A: Der <one>Lowry-Assay</one> ist sensitiver verglichen zu dem <one>Biuret-Assay</one>.
+- A. W. für die <one>mobile Phase</one> in der Chromatographie? <one>Laufmittel</one>.
+- Was meinen wir mit dem <one>Paraprotein</one>? Dies ist das <one>Bence-Jones Protein</one> - also <two>die leichte Kette von Antikörpern</two>). URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Bence_Jones_protein
+- Nenne <one>zwei Möglichkeiten</one>, eine <two>DNA-Duplex</two> zu denaturieren. A: (1) ein <one>extrem alkalischer pH-Wert</one> (2) <one>erhitzen auf 90°C-100°C</one>.
+- Can <one>LFAs</one> (<two>lateral flow devices</two>) <three>be used to detect mycotoxins</three>? <one>Yes</one>. []
+- Name one mechanistic difference between a DELFIA and an ELISA. A: The <one>DELFIA immunoassays</one> does not need to use an <two>enzyme</two>.
+- Bei einem typischen <one>Tripelresonanzexperiment</one> werden welche <two>drei Kerne</two> angeregt? (1) <one> 1 H</one> (2) <one>13 C</one> (3) <one>¹⁵N</one>
+- Can <one>FACS</one> be used to sort proteins? <one>No</one>.
+- <one>Welcher Farstoff</one> wird <two>am häufigsten eingesetzt für Proteinbanden auf einem Gel</two>? <one>Coomassie Brilliant Blue</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Coomassie_Brilliant_Blue []
+- In a <one>radioimmunoassay</one>: <two>what has to be made radioactive</two>, in general? A known quantity of an <one>antigen</one>.
+- Andere Bezeichnung für die <one>Substanzmischung</one> in der Chromatographie? Der <one>Analyt</one>.
+- Die <one>Flüssigkeitschromatographie</one> ist sehr populär, da etwa <two>n% aller organischer Verbindungen nicht unzersetzt verdampfbar sind</two>. A: Etwa <one>85%</one>.
+- Wie heißt die seit am längsten bekannte <one>Entsalzungsmethode</one>? <one>Dialyse</one>.
+- Beim <one>Edman-Abbau</one> wird auch verstärkt das Nebenprodukt <two>DPTU</two> gebildet. DPTU steht für ... ? <one>Diphenylthioharnstoff</one>.
+- Nenne <one>drei verschiedene</one> <two>Immunoassays</two>. A: (1) <royalblue>RIA</royalblue> (<one>Radioimmunoassay</one>) (2) <royalblue>EIA</royalblue> (<one>Enzymimmunoassay</one>) (3) <one>FIA</one> (<two>Fluoroimmunoassay</two>)
+- Ist <one>Biolumineszenz</one> eine Form der <two>Chemilumineszenz</two>? <one>Ja</one>.
+- Andere Bezeichnung für <one>Lowry</one>? <one>Folin C</one>. URL: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14907713/ []
+- Was meinen wir mit <one>Spezifität</one> in der Bioanalytik? Dies bezeichnet die Fähigkeit tatsächlich Gesunde als gesund zu identifizieren.
+- In der Bioanalytik, <one>beim Edman-Abbau</one>: <two>wie lange dauert ein Reaktionsschritt in etwa</two>? Etwa <one>30 Minuten</one>.
+- <one>Welche Substanz</one> kann (im Labor) verwendet werden um <two>Disulfidbrücken auszubilden</two>? <one>ß-Mercaptoethanol</one>.
+- Warum können wir sagen, das <one>Cholesterin</one> <lightseagreen>analytisch tot</lightseagreen> ist? Da <one>Cholesterin</one> nur <two>wenige funktionelle Gruppen</two> besitzt.
+- <one>Warum</one> setzen wir die <two>Amperometrie</two> ein bei Biosensoren? Um die <one>Konzentration von Analyten</one> zu bestimmen.
+- In der Bioanalytik, beim <one>Edman-Abbau</one>: <two>welche Temperatur ist hier ideal</two>? Etwa <one>50°C</one>. []
+- In der Bioanalytik: wie nennen wir die <one>Bestimmungsgrenze</one> auf englisch? <one>LOQ</one>: <two>Limit of Quantification</two>
+- Quasi das <one>Gegenteil</one> in der Bioanalytik zum <two>Signal</two> ist ... ? Das <one>Rauschen</one>.
+- Wie wird der <one>Probenbereich</one> im <two>lateral flow test</two> genannt? <one>Sample pad</one>. URL: https://www.nature.com/articles/s41598-018-35694-9 []
+- Ist es möglich <one>Lungenkrebs</one> aus der Atemluft zu diagnostizieren? <one>Ja</one>, teilweise zumindest. Man kann die Isoformen von <two>GATA6</two> und <two>NKX2-1</two> nachweisen.
+- <one>Welche Farbe</one> hat der <two>Lowry-Assay</two>? <one>Blau</one>. []
+- Ist der <one>RIA</one> (<one>Radioimmunoassay</one>) <two>kompetitiv</two>? <one>Ja</one>. []
+- Das <one>Lambert-Beersche Gesetz</one> gilt nur für welches Licht? Für <one>monochromatisches Licht</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Lambert-beersches_Gesetz []
+- Ist <one>der Ionenaustausch</one> bei der <two>Ionenaustauschchromatographie</two> <three>eine chemische Reaktion</three>? <one>Ja</one>.
+- <one>Why</one> is <two>PCR-diagnostics</two> not always an awesome technique on its own? Because there may be <one>mutations in the target gene</one>, e. g. in a <two>virus genome</two>.
+- Bei der <one>HPLC</one>: <two>welche Phase</two> <three>wird unter hohem Druck durch die Säule gepresst</three>? Die <one>mobile Phase</one>. []
+- Können wir Zellen mit Hilfe von <one>Ultraschallwellen</one> aufbrechen? <one>Ja</one>. []
+- <one>GdnHCl</one> ist <two>eine schwache Säure, die zur Denaturierung von Proteinen eingesetzt wird</two>. Wieviele -NH₂ Gruppen besitzt dieses Molekül? <one>Drei</one>.
+- In der <one>Bioanalytik</one>: <two>was ist der Zweck der Kalibration</two>? Die Kalibration soll einen funktionalen Zusammenhange zwischen der Konzentration und dem gemessenen Informationswert (dem Signal, also der Konzentration) herstellen.
+- In <one>bioanalytics</one>: <two>which type of error</two> is worse than the <three>systematic error</three>? The <one>random error</one>.
+- Nenne drei <one>Elektrophorese-Verfahren</one>. A: (1) <one>Zonenelektrophorese</one> (2) <one>Isotachophorese</one> (3) <one>isoelektrische Fokussierung</one>
+- Bei einer <one>HPLC</one> wird für die <two>stationäre Phase</two> <three>oft welche Substanz verwendet</three>? <one>Kieselgel</one>. []
+- Is it possible to <one>measure the concentration of nerve growth factors</one> in the human body? <one>Yes</one>.
+- Das <one>Bence-Jones Protein</one> kann man mit welcher Technik nachweisen? Mit der <one>Serumelektrophorese</one>.
+- Muss die Substanz, die zu analysieren ist, in der Gaschromatographie gasförmig vorliegen? <one>Nein nicht unbedingt</one> - <two>es reicht wenn nur ein Teil der Probe gasförmig vorliegt</two>.
+- Is <one>Mass Spectrometry</one> more sensitive than <two>NMR</two>? <one>Yes</one>.
+- <one>Welchen Vorteil</one> besitzen die <two>spektroskopischen Methoden</two> gegenüber den <two>kolorimetrischen Methoden</two>? <one>Spektroskopische Methoden bewahren die biologische Funktion des Proteins</one>; das <two>Protein kann anschließend weiterverwendet werden</two>.
+- Wir können, <one>enzymatisch</one>, den Gehalt von Ethanol bestimmen. <two>Wie</two>? Über eine <one>photometrische Messung von NADH</one>.
+- Bei einem <one>Schwangerschaftstest</one>: <two>was genau</two> wird sichtbar bei einer <three>Schwangerschaft</three>? Ein <one>Pluszeichen</one> (<two>+</two>).
+- Die <one>Trennleistung</one> (englisch: <two>efficiency</two>) ist ein Maß für ... ? Die <one>Peak-Verbreitung</one>.
+- Nenne <one>drei Nachweismethoden</one> zur Sekundärstruktur von Proteinen. A: (1) <one>CD-Spektroskopie</one> (2) <one>NMR</one> (3) <one>Röntgenstrukturanalyse</one>
+- Compare the <one>efficiency</one>, that is the <one>detection sensitivity</one>, of <two>immuno-PCR</two> with that of the <two>ELISA</two>. A: The <one>immuno-PCR</one> is <two>a lot more sensitive than the ELISA</two>.
+- Welche <one>Aminosäure</one> wird vor allem vom <two>Biuret-Reagenz</two> erkannt? <one>Tyrosinreste</one>.
+- In der <one>Chromatographie</one> gibt es die sogenannte <two>eluotrope Reihe</two>. <three>Was ist das</three>? Die <one>eluotrope Reihe</one> sortiert die gängigsten organischen Lösungsmittel nach ihrer <two>Elutionswirkung</two> (<three>Elutionsselektivität</three>) bei der Chromatographie.
+- In bioanalytics, <one>upon analysing peptides</one>, we may identify the <two>y-series</two> and the <two>b-series</two>. To what do these two series refer to? (1) <one>b-series</one>: <two>N-terminal sequence</two> (2) <one>y-series</one>: <two>C-terminal sequence</two>
+- At the <one>world lateral flow test sales revenue</one>, <two>which branch</two> is leading the chart in 2015 in regards to buying the most of these devices? The <one>clinical use</one>, at about 89% - so hospitals and the like.
+- <one>Lateral flow devices</one>: <two>nenne drei Vorteile</two>. A: (1) einfache Herstellung der devices (2) <one>geringe Kosten</one> (3) <one>benutzerfreundliche Anwendung</one>
+- Mit <one>kommerziellen Sequenzautomaten</one> beträgt <two>die Zeit für den Edman-Abbau</two> einer (durchschnittlichen) Polypeptidkette etwa ... wie lange? Etwa <one>zwei Stunden</one>.
+- Name three <one>sources of errors</one>, according to Franklin, <two>in the bioanalytical process</two>, in the proper order. A: (1) sample collection (2) sample preparation (3) measurement
+- <one>Ab welchem Jahr</one> gab es <two>die ersten kommerziellen HPLC-Geräte auf dem Markt</two>? Ab dem Jahre <one>1970</one>.
+- Kann die <one>Elektrophorese</one> dazu verwendet werden um Fette im Blut nachzuweisen? <one>Ja</one> - über die sogenannte <two>Lipoprotein-Elektrophorese</two>.
+- Nenne <one>eine organische Substanz</one>, die bei der <two>Ionenaustauschchromatographie</two> verwendet wird. A: <one>Polystyrol</one>.
+- Bei <three>bioanalytischen Tests</three> gibt es oft die englischen Abkürzungen <one>LOB</one>, <one>LOD</one> und <one>LOQ</one>. <two>Wofür stehen diese Abkürzungen jeweils</two>? (1) <one>LOB</one>: <two>limit of blank</two> (2) <one>LOD</one>: <two>limit of detection</two> (3) <one>LOQ</one>: <two>limit of quantification</two>
+- Precipitation in a gel, aka <one>Immunodiffusion</one>, is done in <two>a soft agar gel</two>. How is the <three>percentage</three> of agar there? <one>1%</one>.
+- Der <one>BCA-Assay</one> in der Biochemie wird zur photometrischen Bestimmung von Proteinen eingesetzt. <two>Welche Wellenlänge wird hier verwendet (in nm)</two>? <one>562 nm</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Bicinchoninic_acid_assay []
+- In Bioanalytics: <one>immobilized pH gradient gels</one>, aka <two>IPG-gels</two>, are used in which technique? They are used in <one>isoelectric focusing</one> (<mediumturquoise>IEF</mediumturquoise>).
+- In der Bioanalytik gibt es die sogenannten <one>ROC Kurven</one> (<one>Receiver Operating Characteristics</one> Kurven). Nenne einen deutschen Begriff für solche Kurven. A: <one>Grenzwertoptimierungskurven</one>.
+- Nenne eine <one>Extraktionsmethode</one> in der Bioanalytik, bei der ein <two>Silikagel</two> Verwendung findet. A: Die <one>SPE</one>: <two>Solid Phase Extraction</two>.
+- The <one>green fluorescent protein</one>, <springgreen>GFP</springgreen>, was first observed in the jellyfish <two>Aequorea victoria</two>, in what year? In the year <one>1962</one>. []
+- Der <one>Starcher-Assay</one> bestimmt die Aminosäuren bei einer Wellenlänge von <two>570 nm</two>. Welche Substanz benötigt er zudem? <one>Ninhydrin</one>.
+- In der <one>Gelfiltationschromatographie</one>: <two>wie merken wir ob Proteine oder lediglich Puffersalze von der Säule eluieren</two>? <one>Proteine</one> können bei einer Wellenlänge von <two>280nm</two> <three>photometrisch detektiert</three> werden.
+- In <one>instrumental bioanalytics</one>: <two>how</two> is the <three>error</three> defined? The error is the difference between the <one>true value</one> and the <one>measured value</one>.
+- Gegeben sei ein <one>Schwangerschaftsschnelltest</one>. Wir sehen zwei vertikale Striche (<two>| |</two>) - <three>was bedeutet das</three>? <one>Positive Schwangerschaft</one>. []
+- <one>Proteine</one> taugen als analytische Werkzeuge? <one>Selbstverständlich</one> - zum Beispiel <two>Enzyme, die spezifische Reaktionen katalysieren können</two>.
+- Bei den <one>Enzymassays</one> gibt es eine Vielfalt von Methoden, mit denen die Enzymaktivität gemessen werden kann. Nenne diese vier. A: (1) <one>photometrisch</one> (2) <one>fluorimetrisch</one> (3) <one>elektrochemisch</one> (4) <one>Lumineszenzmessung</one>
+- The <one>Immuno-PCR</one> combines/integrates which <two>two methods</two>? (1) <one>PCR</one> (2) <one>ELISA</one> []
+- <one>Depletion columns</one> erlauben es, hoch abundante Proteine aus einer Plasma Probe zu entfernen. <two>Sie benötigen für ihren Einsatz was genau</two>? <one>Antikörper</one>. []
+- <one>Bioanalytical methods</one> care for ... at the least eight points. Name some of them, <two>at the least five</two>. A: (1) <one>accuracy</one> (2) <one>trueness</one> (3) <one>precision</one> (4) <one>recovery</one> (5) <one>speed</one> (6) <one>cost</one> (7) <one>robustness</one> (8) <one>working range</one>
+- <one>Der erste kommerzielle Biosensor zur Bestimmung von Glucose im Vollblut</one> <two>kam im welchen Jahr auf den Markt</two>? Im Jahre <one>1974</one>.
+- Die <one>Gaschromatographie</one> ist heute eigentlich ... ? <one>Flüssigchromatographie</one>.
+- From a structual point of view, the use of <one>acryl amide</one> - what can we say about its structure? Acryl amide <one>resembles a peptide bond</one>, since it contains a <two>-C=O-NH2 group</two>.
+- Bei <one>ICAT</one> (<two>Isotope-Coded Affinity Tags</two>) verwenden wir ... ? <one>Unterschiedlich schwere Isotope</one>.
+- Verwenden wir beim <one>Bradford-Assay</one> <two>Kupfer-Ionen</two>? <one>Nein</one>. []
+- Im <one>Edman-Abbau</one> <two>koppelt man mit ... </two>? <one>PITC</one>.
+- Bei der <one>Luminex-Technik</one>: <two>was genau erkennt der Laser</two>? Die <one>Beadklasse</one>. URL: https://www.biosyn.com/luminex-bead.aspx
+- <one>Warum</one> stellen wir <two>Wasser</two> in das Photometer rein? Beim Durchgang von Wasser erzeugt dieser <one>I0 Lichtstrom</one> einen Elektronenfluss, der auf der Anzeige auf 0 gestellt werden kann, durch Drücken der <two>Abs 0-Taste</two>.
+- <one>Lowry-Assay</one> versus <one>BCA-Assay</one>: nenne einen Nachteil des <two>BCA-Assays</two> gegenüber dem <two>Lowry-Assay</two>. A: Der <one>BCA-Assay</one> ist <two>deutlich teurer</two>.
+- In einer <one>Gelfiltrationschromatographie</one>: <two>wandern kleine Proteine schneller oder langsamer</two>? <one>Kleine Proteine wandern langsamer</one> - die <two>porösen Gelkügelchen</two> erlauben kleinen Proteinen Zutritt; grosse Proteine hingegen werden ausgesperrt. Dadurch wandern die grösseren Proteine schenller durch die Säule als die kleinen Proteine.
+- Die <one>N-terminale Aminosäure</one> kann mit <two>D...</two> bestimmt werden. Welche Substanz ist hier gemeint? <one>Dansylchlorid</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Dansylchlorid
+- Die <one>Gaschromatographie</one> hat <three>zwei Phasen</three>: die <three>mobile Phase</three> und die <three>stationäre Phase</three>. <four>Welche dieser Phasen ist leichter im Labor zu manipulieren</four>? Die <one>stationäre Phase</one>.
+- What is the <one>Scatchard equation</one> that is used for in molecular biology? This equation is used to <one>calculate the affinity constant of a ligand with a protein</one>.
+- Give an example for when <one>Glucose</one> may be a biomarker. A: For instance, it may become a biomarker for Diabetes.
+- Can we <one>immobilize proteins</one> that <two>occur on the surface of a virus</two> onto <three>plastic</three>? <one>Yes</one>. []
+- Name a <one>qualitative difference</one> between <two>Lectin</two> and antibodies used in analytics. A: <one>Lectins are not as specific as antibodies</one>.
+- Ist die <one>Elektrophorese</one> eine <two>chromatographische Trennmethode</two>? <one>Nein</one>.
+- In der Bioanalytik: andere Bezeichnung für <one>verzögert</one>? <one>Retardiert</one>. []
+- <one>Biuret</one>, in der <two>Biuret-Reaktion</two>, bevorzugt welches Metall? <one>Kupfer</one>; genauer, <two>Cu²⁺</two>-Ionen.
+- Fördern antichaotrope Salze die Proteinaggreagation? Ja.
+- Bei der <one>Aussalzung</one> sehen wir auch die H...-Reihe. A: <one>Hofmeister-Reihe</one>.
+- Bei der Homogenisierung von Zellen erhalten wir ein Gemisch aus ... ? Ein <one>Gemisch aus intakten und aufgebrochenen Zellen</one>.
+- Bei der <one>CTAB-Methode</one> in der Bioanalytik: wofür steht <two>CTAB</two>? A: <one>Cetyltrimethylammoniumbromid</one> (<two>Cetyl-trimethyl-ammonium-bromid</two>).
+- NAT testing means ... ? <one>Nucleic Acid Amplification Technique</one> testing.
+- In der Bioanalytik, bei der Untersuchung von Proteinen, können diese an <one>PITC</one> gekoppelt werden. Welches Ende eines Proteins wird hierbei gekoppelt? Das NH₃⁺Ende - also <one>der Aminoterminus</one>.
+- Die meisten <one>Glucose-Biosensoren</one> verwenden welches Enzym? <one>GOD</one>: die "Glucose-Oxidase". URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Glucose_oxidase
+- Welcher <one>Effekt</one> kann bei jedem Immunoassay auftreten? Der <one>Prozoneneffekt</one>. URL: https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-662-48986-4_2582
+- The <two>monoclonal antibodies</two> used in a <one>pregnancy test kit</one> bind to ... ? A <royalblue>hormone</royalblue> (<lightgreen>hCG</lightgreen>: <one>human chorionic gonadotropin</one>)
+- Bei der <one>FACS</one> benötigen wir <two>Oberflächenantigene</two> und ...? <one>Monoklonale Antikörper</one>.
+- Sind <one>elektrochemische Analysenverfahren</one> empfindlich? Ja, sogar <one>hochempfindlich</one>.
+- Separation of the proteins by <one>isoelectric point</one> is called ... ? <one>Isoelectric focusing</one> (<royalblue>IEF</royalblue>).
+- What is the <one>standard protein</one> used for the Bradford assay? The BSA - <one>Bovine Serum Albumin</one>.
+- Give another name for the term <one>biosensors</one>. A: <one>Lab-on-a-chip</one>.
+- Wir können <one>fetale Zellen</one> im mütterlichen Blut nachweisen. Dies erlaubt es uns <three>nicht-invasive Pränatal Diagnosen</three> durchzuführen. Wieso mag dies von Vorteil sein? Da <three>invasive Methoden</three>, wie zum Beispiel die <royalblue>Fruchtwasseruntersuchung</royalblue>, zu Fehlgeburten führen mag (<one>1:200</one>).
+- Die <one>Bioanalytik</one> beschäftigt sich allgemein mit ... ? <one>Biopolymeren</one>.
+- Nenne ein Beispiel für <one>ein antikonvektives Medium</one> in der <two>Bioanalytik</two>. A: <one>Gele</one>.
+- Andere Bezeichnung für <one>Niederschlag</one>? <one>Pellet</one>.
+- <one>Wie empfindlich</one> ist der <two>Biuret-Assay</two>? <orange>Nicht besonders empfindlich</orange>; unter den "kolorimetrischen Methoden" ist der <one>Biuret-Assay</one> am unempfindlichsten.
+- Nenne vier gebräuchliche Analyten (das <one>Material</one>) in der Bioanalytik. A: (1) <one>Proteine</one> (2) "Nukleinsäuren" (3) "Polysaccharide" (4) <one>Lipide</one>
+- Warum möchten wir bei einem <one>Teststreifen</one> oft nur eine <two>ja</two>/<two>nein</two> Antwort? Da, zum Beispiel, <one>55% Schwangerschaft</one> keinen Sinn macht.
+- Andere Bezeichnung für die <one>extrinsische Fluoreszenz</one>? <one>Sekundärfluoreszenz</one>.
+- Hat die Ladung eines Teilchens in der Bioanalytik Einfluss auf dessen Wanderung? Ja: je größer die Ladung, desto schneller ist die Wanderung dieses Teilchens.
+- Give another name for <one>unspecific detectors</one>. A: <one>Universal detectors</one>. URL: https://www.europeanpharmaceuticalreview.com/article/33076/universal-detection-in-high-performance-liquid-chromatography/
+- Gibt es <one>biolumineszente Pilze</one>? Ja; etwa <one>71</one> Pilzarten <two>biolumineszieren</two>.
+- In der <one>Hofmeister-Reihe</one>: nenne ein Anion das sehr gut zum Fällen ist. A: <one>SO₄ ²⁻</one>.
+- The <one>enzymatic activity</one> depends not only the enzyme itself, or the amount of enzymes, or temperature, but also on ... ? <one>pH</one>.
+- Der <one>Nachweis beim BCA-Assay</one> erfolgt bei einer Wellenlänge von ... ? <one>562 nm</one>.
+- Der <one>weltweite Umsatz</one>, der <one>durch die HPLC</one> erzielt wird, liegt bei etwa ... ? <one>2500 Milliarden Euro</one>.
+- Was meinen wir mit <one>POC-Testing</one>? <one>Point of Care Testing</one> - <two>Schnelltests an Ort und Stelle</two>.
+- Nenne ein gravierendes <one>ethisches Problem in der Bioanalytik</one>. A: Die betroffene Person weiss selten was die Konsequenzen sind, nach einer bestimmten Diagnose. (Oft wissen die Ärzte auch nicht wirklich viel mehr.)
+- In a <one>flow cytometer</one>: how many parameters can be measured at the same time? Up to <one>13-parameters</one>.
+- Worauf beruht der <one>BCA-Assay</one>? Auf der <one>Reduktion von Cu²⁺-Ionen</one>.
+- Name an <one>immuno enzymatic assay</one>. A: The <one>dip-stick immuno enzymatic assay</one>.
+- <one>Pehr Edman</one> hat den Aminosäureabbau (Edman-Abbau) entwickelt, im Jahre ... ? <one>1950</one>.
+- Englisch für <one>Rauschpegel</one>? <one>Noise level</one>.
+- Charakteristisch für <one>Sensoren</one> sind n in Serie geschaltete Grundkomponenten. A: <one>zwei</one>.
+- In <one>Agarose</one>, im Gel: welcher <two>Zucker</two> ist stark vertreten? Die <one>Galaktose</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Galactose
+- Beim <one>Starcher-Assay</one> wird womit gefärbt? Mit <one>Ninhydrin</one>. URL: https://www.semanticscholar.org/paper/A-ninhydrin-based-assay-to-quantitate-the-total-of-Starcher/5a7e49232f5829fce779d9c5bcd1aabcf7ebbe74
+- In der Bioanalytik, Immunoanalytik, nenne ein Beispiel für eine <one>nicht kompetitive</one> Reaktion. A: Dies ist zum Beispiel eine Reaktion mit einem <one>Überschuss an Antikörper</one> - oder einem <one>Überschuss an Antigenen</one>.
+- Beim <one>Lambert-Beerschen Gesetz</one> wird anstelle der <three>Absorption</three> oft was angegeben? Die <one>Transmission T</one>.
+- In der Bioanalytik: was könnten wir mit dem Begriff <one>Bruchstück-Analyse</one> meinen? Dies könnte die Analyse des <two>Peptidoms</two> meinen, also <one>teilweise verdaute Proteine, die eine Krankheit andeuten können</one>.
+- Andere Bezeichnung für die <one>intrinsische Fluoreszenz</one>? <one>Primärfluoreszenz</one>.
+- Die <one>Nephelometrie</one> beruht auf welcher Methode? Auf der <one>Immunpräzipitation</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Nephelometrie
+- Andere Bezeichnung für den <one>Verlust der Löslichkeit</one> eines <two>Immunkomplexes</two>? <one>Präzipitation</one>.
+- In der <one>Gelelektrophorese</one>: beeinflusst die Größe eines Teilchen dessen Wanderungsgeschwindigkeit? Ja. Je kleiner das Teilchen, desto schneller ist dessen Wanderung.
+- <one>Dansylchlorid</one> kann zur Bestimmung der N-terminalen Aminosäure verwendet werden. An die NH2-Gruppe ist danach direkt welche Gruppe angeheftet? Eine <one>SO₂-Gruppe</one>.
+- Nenne ein anderes Wort für den Begriff <one>Peptidome</one>. A: <royalblue>Fragmentome</royalblue>. URL: https://www.longdom.org/proceedings/fragments-fragmentome-and-fragmentomics-in-proteomics-34708.html
+- Welche <one>Eigenschaft</one> müssen Zellen vorweisen, damit sie von FACS-Geräten getrennt werden können? Sie müssen <one>fluoreszieren</one>.
+- Nenne eine Methode, mit der wir Proteine in einem elektrischen Feld anhand ihres Neutralpunktes auftrennen können. A: Die <one>isoelektrische Fokussierung</one>.
+- Bei der <one>CTAB-Methode</one>: was komplexiert mit CTAB? Die <one>DNA</one>.
+- Andere Bezeichnung für die <one>Proteinfällung</one>? <one>Präzipitation</one>.
+- Nenne drei Kosten bei der <one>enzymatischen Analytik</one>. A: (1) die <one>Reagenskosten</one> (2) die <one>Arbeitszeit</one> (2) die <one>Geräteamortisation</one>
+- Vergleiche die <one>Sensitivität</one> von <three>Nephelometrie</three> mit <three>RIA</three>. A: Die <one>Nephelometrie</one> hat eine niedrigere Sensitivität als der <one>RIA</one>.
+- Die in der Bioanalytik/Proteomik wichtige Substanz <one>PITC</one> steht, als Abkürzung, für ... ? <one>Phenylisothiocyanat</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Phenylisothiocyanat
+- Nenne ein konkretes Beispiel, bei dem ein <one>direkter Agglutinationstest</one> zum Einsatz kommt. A: Bei der <one>Blutgruppenbestimmung</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Blutgruppe
+- Die <one>Murexid-Reaktion</one> ist eine wichtige Nachweisreaktion. Als Endprodukt der Reaktion entsteht das im alkalischen Milieu tiefviolett gefärbte Ammoniumsalz welcher Säure? Der <one>Purpursäure</one> - eben dieses <two>Murexid</two>.
+- Was ist mit dem Begriff <one>präparative Elektrophorese</one> gemeint? Dies ist eine Elektrophorese, die dazu dient bestimmte Substanzen aus Stoffgemischen zu gewinnen.
+- Vergleiche <one>die Wasserlöslichkeit von Membranproteinen</one> verglichen zu <one>der Wasserlöslichkeit anderer Proteine</one>, allgemein. A: <two>Membranproteine</two> sind allgemein <one>schlechter löslich</one>.
+- Oft verwendete Mikrotiterplatten liegen im <one>96-Well-Format</one> vor, mit 12 Kavitäten in 8 Reihen. Das <two>Volumen pro Kavität</two> beträgt etwa n Mikroliter? Etwa <one>350 Mikroliter</one>.
+- In der <two>Bioanalytik</two> wird die <one>Gaschromatographie</one> wozu eingesetzt? (1) <one>Lipidanalytik</one> (2) <one>Kohlenhydratanalytik</one>
+- Wie ist der apparative Aufwand bei <one>elektrochemischen Analysenverfahren</one>? Dieser ist <one>relativ gering</one>.
+- <one>Mikrotiterplatten</one> haben Vertiefungen. Wie nennen wir diese Vertiefungen noch, mit einem deutschen Begriff? <one>Kavitäten</one>.
+- <one>Maximale Trennungsgröße</one> des <two>Polyacrylamidgels</two> bei <three>DNA</three>? <one>Unter 1000 Basenpaare</one>.
+- Wie lange dauert der <one>Biuret-Assay</one>? Etwa <one>20 Minuten</one> (<two>bei Raumtemperatur</two>).
+- Was ist die <one>Ausschlussgrenze</one> in der <three>Gelfiltrations-Chromatographie</three>? Dies sind Proteine, die nur von Molekülen bis zu einer bestimmten Molekülmasse passiert werden kann.
+- Provide <one>a specific example</one> for when we may want to employ <three>lateral flow devices</three>. A: For <one>home pregnancy tests</one>.
+- Nenne eine sehr oft verwendete stationäre Phase bei der Flüssigkeitschromatographie. A: <one>Kieselgur</one>.
+- Give another name for the term <one>FACS</one>. A: <one>Flow cytometry</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Flow_cytometry
+- <one>Welcher Druck</one> ist entscheidend für die Fähigkeit einer Verbindung mit Hilfe der Gaschromatographie analysiert werden zu können? Der <one>Dampfdruck über einer Lösung</one>. 
+- Was meint man mit <one>POC</one>-Testing, also die Abkürzung hierzu? <one>Point of care</one> - also <royalblue>ein Schnelltest an Ort und Stelle des Patienten</royalblue>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Point-of-care_testing
+- Vergleiche <one>spektroskopische Methoden</one> und <one>kolorimetrische Methoden</one> miteinander: welche Methode benötigt eine <three>höhere Konzentration an Protein</three>? Die <one>spektroskopischen Methoden</one>.
+- Die <one>HILIC-Chromatographie</one> ist ... ? <one>Hydrophile Interaktionschromatographie</one>.
+- Bioanalytical techniques may have to be <one>validated</one>. What do we mean with the term <one>validated</one> here? That we have to check, prove and verify the validity or accuracy of a given analytical system at hand.
+- In der <one>Gaschromatographie</one> müssen wir mitunter Substanzen derivatisieren, wie zum Beispiel Glycin. Für dessen Veresterung wird welche Substanz verwendet? <one>iso-Propanol</one>.
+- In der <one>Gaschromatographie</one> müssen wir mitunter Substanzen derivatisieren, wie zum Beispiel Glycin. Für dessen Acylierung wird oft welche Substanz verwendet? <one>Trifluoressigsäure</one>.
+- In der Bioanalytik, beim Edman-Abbau: bei welchem pH-Wert verläuft diese Reaktion am schnellsten? Bei einem <one>pH-Wert von 9</one>.
+- Die <one>Gaschromatographie</one> geht üblicherweise nur bis zu welcher Temperatur? Bis zu <one>450°C</one>.
+- Was meinen wir mit einem <one>tryptischem Peptid</one>? Dies ist ein Peptid das wir <one>nach Verdau mit Trypsin</one> erhalten haben.
+- Give an example, in biology, where <one>capillary electrophoresis</one> is used. A: For <one>DNA Sequencing</one>, for example.
+- <one>PITC</one> kann an Proteine gekoppelt werden. Welches Atom ist bei PITC final zu finden das hier zuerst itm einem Protein reagieren mag? Ein <one>S Atom</one> (Schwefel).
+- Nenne ein Beispiel wo die <one>Immunagglutination</one> im Labor eingesetzt wird. A: Bei der <one>Identifizierung von Zelloberflächenantigenen</one>, zum Beispiel im Zuge der <three>Blutgruppenbestimmung</three> (<two>Hämagglutinationstest</two>).
+- Die <one>Ionenaustauschchromatographie</one> trennt Proteine nach ... ? <one>ihrer elektrischen Ladung</one>.
+- Ist der <one>Bradford-Assay</one> schnell? Ja - <two>die Farbentwicklung</two> ist bereits nach etwa <one>zwei Minuten</one> zu sehen.
+- Manche Krankheiten sollten möglichst früh diagnostiziert werden. Nenne hierzu ein wichtiges Beispiel. A: <two>Erbkrankheiten</two> wie die <one>Phenylketonurie</one>. Hier ist natürlich die Bioanalytik gefragt. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Phenylketonurie
+- Was bedeutet <one>sheep anti-rabbit</one>? Dies sind Antikörper, die gegen alle Antikörper aus Kaninchen wirken können; und sie wurden <one>in Schafen hergestellt</one>.
+- What is meant with the term <one>prediction biomarker</one>? This is one that can be used to <one>predict the course of a given disease</one>.
+- Warum gibt es <one>kein einheitliches Verfahren zur Isolierung und Reinigung von Proteinen</one>? Da <one>Proteine schwer zu vereinheitlichen</one> sind; sie haben eine unterschiedliche Zusammensetzung, unterschiedliche Grössen, verschiedene Eigenschaften etc ...
+- <one>Messungen im UV-Bereich</one> sind allgemein unempfindlicher als Farbtests, aber die Anwendung ist beschränkt auf ... ? Auf <one>hochreine Proteinlösungen</one>.
+- In der Bioanalytik und Therapie: was meinen wir mit der merkwürdigen Abkürzung <one>PPPPPPM</one>? Dies steht für eine <royalblue>personalisierte, präventive, prognostische, prädiktive precision medicine</royalblue>, die zudem auch <royalblue>partizipativ</royalblue> ist.
+- <one>Welches Enzym</one> kommt zum Einsatz bei einem <three>Lactatsensor</three>? Eine <one>immobilisierte Lactatdehydrogenase</one>.
+- Bei der <one>reverse phase chromatgaphy</one>: muss die Säule immer sauer oder immer basisch sein? Immer <one>sauer</one>.
+- Aus Sicht der Bioanalytik: die <one>Methyl-Scope Microarrays</one> können zum Beispiel wofür eingesetzt werden? <one>Vergleich</one> von <one>Tumor</one> mit <one>gesundem Gewebe</one>.
+- Die <one>Flüssigkeitschromatographie</one> ist so populär da <two>die meisten organischen Verbindungen</two> welches Problem haben bei der Gaschromatographie? Etwa 85% aller organischer Verbindungen sind <one>nicht unzersetzt verdampfbar</one>.
+- In der Bioanalytik: <one>Zufallsfehler</one> betreffen die ... ? <one>Reproduzierbarkeit</one>.
+- Andere Bezeichnung für das <one>Signal</one> bei einer analytischen Messung. A: Dies ist <one>der Träger der erwünschten Information</one>:
+- Nenne drei verschiedene <one>Rotor-Typen</one>. A: (1) <one>Festwinkelrotor</one> (2) "Vertikalrotor" (3) <one>Ausschwingrotor</one>
+- Nenne den Hauptunterschied zwischen <one>FACS</one> und <one>Durchflusscytometrie</one>. A: (1) Bei <one>FACS</one> werden die Zellen gesammelt. (2) Bei der <one>Durchflusscytometrie</one> wird nur die Fluoreszenzmarkierung registriert.
+- Müssen wir beim <one>Peptide-Mass-Fingerprinting</one> Proteine aus dem Gel stanzen? Ja.
+- Was sind <one>Biosensoren</one>? Dies sind Messfühler, die mit biologischen Komponenten ausgestattet sind.
+- Nenne ein Beispiel für eine typische mobile Phase bei der Flüssigkeitschromatographie. A: <one>Hexan</one>.
+- <one>Which assay</one> makes use of the <two>Biuret chromophore</two>? The <one>Lowry assay</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Lowry_protein_assay
+- In der Bioanalytik: kommt es bei elektrochemischen Analysenverfahren zu Stromfluß? Nicht unbedingt. Die <one>Konduktometrie</one> und die <one>Potentiometrie</one> kommen ohne Stromfluß aus.
+- Nenne ein <one>Einsatzgebiet</one> für die <two>Lateral Flow Assays</two>. A: <one>Schwangerschaftstests</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Schwangerschaftstest
+- Können wir mit Hilfe einer elektrochemischen Analyse die <one>spezifische Oxidationszustände</one> determinieren? Ja.
+- Nenne die beiden <one>Hauptformen der Chromatographie</one>. A: (1) <one>Flüssigkeitschromatographie</one> (2) <one>Gaschromatographie</one>
+- In an <one>Immunodifussion test</one>, a <three>visible precitiptate</three> forms in the zone of ... ? In the <one>Zone of equivalence</one>.
+- Give another expression for an <one>enzyme</one> that is <two>chemically attached</two> to <three>a labeled antibody</three>. A: <one>Conjugated</one>.
+- Nenne drei Möglichkeiten für Probenmaterial eines Patienten, die für die Bioanalytik wichtig sein kann. A: (1) Vollblut (2) Blutplasma (Plasma) (3) <one>Serum</one>
+- Name the four most important components used by the <one>Luminex technology</one> in bioanalytics. A: (1) <one>Fluorescent bead</one> (2) Capture antibody (3) Antigen (aka the analyte-molecule) (4) <one>Biotinylated antibody</one>
+- Wenn wir eine <one>HPLC</one> verwenden möchten, um <two>die Kosten zu minimieren</two>: welche HPLC sollten wir verwenden? Die <one>Ultra fast HPLC</one>, <royalblue>UHPLC</royalblue>.
+- <one>MALDI</one> erzeugt Ionen mit Hilfe ... ? Eines <one>Lasers</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Matrix-unterst%C3%BCtzte_Laser-Desorption/Ionisation
+- In <one>Bioanalytics</one>: what does the abbreviation <three>LOD</three> stand for? <one>Limit of detection</one>.
+- Nenne drei Möglichkeiten wie wir ein <one>Trennverfahren</one> in der analytischen Chemie dimensionieren (und dadurch beeinflussen) können. A: (1) <one>Partikeldurchmesser</one> (2) <one>Säulendurchmesser</one> (3) <one>Säulenlänge</one>
+- Der <one>erste Biosensor</one> überhaupt war ... ? Ein <one>Glucosesensor</one>.
+- How can we purify the plant protein <slateblue>concanavalin A</slateblue>? A: We can <two>make use of affinity chromatography</two> and let this protein pass, as a crude extract, through a column of beads containing <one>covalently attached glucose residues</one>.
+- Ein <one>ideales Testverfahren</one> in der Bioanalytik muss nicht nur <three>sensitiv</three>, <three>korrekt</three> und <three>präzise</three> sein, sondern außerdem ...? <one>Reproduzierbar</one>.
+- <one>Chromatographische Trenntechniken</one> funktionieren primär in welchen zwei Phasen? (1) in <one>flüssiger Phase</one> (2) in der <one>Gasphase</one>
+- In der Zellbiologie: wofür steht die Abkürzung <one>FACS</one>? <one>Fluorescence-activated cell sorting</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Cell_sorting#Fluorescent_activated
+- Seit wann ist die <one>Elektrophorese</one> bekannt, zumindest deren Grundlagen? Seit <one>1899</one> - seit den <two>Versuchen von Kohlrausch</two>.
+- Das Prinzip der spektroskopischen Analyse beruht auf der Anregung von ... ? <one>Energiezuständen</one>.
+- In der <one>Bioanalytik</one>: was wäre ein <two>physikalisches Reagenz</two>? Zum Beispiel <one>Photonen</one>.
+- The <one>specific antibodies</one> in an <three>Immuno-PCR</three> are labeled with ... ? A <one>DNA marker</one>.
+- In der Bioanalytik, bei der <one>Affinitätschromatographie</one>: wie nennen wir <two>die Wiederherstellung des ursprünglichen Zustandes</two>? <one>Regeneration</one>.
+- Nenne einen sehr wichtigen <one>Farbstoff</one>, der in einem <two>Bradford-Assay</two> verwendet wird. A: <one>Coomassie-Brillantblau</one>.
+- <one>FACS-Geräte</one> sortieren n Zellen / Sekunde? <one>300.000</one>.
+- A <one>perfect measurement process</one>, in bioanalytics, would yield <two>what kind of values</two> to us? <one>True values</one>.
+- Das <one>Trägermaterial</one> in der <two>Papierchromatographie</two> ist ... ? <one>Cellulose</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Papierchromatographie
+- Nenne ein frühes (und einfaches) Beispiel für die Chromatographie. A: Ein Rotweinfleck am Tischtuch.
+- Name three different sources of <one>bias</one>, aka <three>systematic error</three>. A: (1) <lightblue>Instrument-related error</lightblue> (2) <lightblue>Method related error</lightblue> (3) <lightblue>Personal error of the operator</lightblue>
+- Eine wichtige Eigenschaft von <one>Detergenzien</one> ist ihre Fähigkeit zur Bildung von ... ? <one>Micellen</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Mizellen
+- Does <one>SELDI</one> require laser? Yes.
+- What is the main function of the <one>sample application pad</one> in a LFA? The basic function of the sample application pad is to transport the sample to other components of the <one>lateral flow test strip</one> (<one>LFTS</one>).
+- Beim <one>Edman-Abbau</one> wird <three>PITC</three> verwendet, bei <one>50°C</one>. <three>PITC</three> reagiert mit welcher Gruppe eines Proteins? Es reagiert mit der <one>terminalen Aminogruppe</one>.
+- <one>Lateral flow assay</one> (LFA) is typically performed over ... ? A <one>strip</one>.
+- Bei einem <one>RIA</one>: wenn wir mit <two>125 I</two> (<violet>Iod</violet>) markieren, welche Aminosäure haben wir hier als Ziel? <one>Tyrosin</one>.
+- <one>Western blotting</one> can also be called <three>horizontal semi-dry blotting</three> or <three>vertical semi-dry blotting</three>? <one>Horizontal semi-dry blotting</one>.
+- Andere Bezeichnung für <one>Polymorphismenmuster einer Person</one>? <one>Genetischer Fingerabdruck</one>.
+- In a <one>PA gel</one>: what acts as <three>the crosslinker</three>? <royalblue>Bis</royalblue> (<one>Bis-Acrylamide</one>).
+- Die <three>Caprylsäure-Fällung</three> wird oft vor der Ammonsulfatfällung durchgeführt. Sie bewirkt ein ausfällen der meisten Serumproteine, mit Ausnahme der IgG-Subtypen. Wie muss der pH-Wert sein: <one>sauer</one> oder <one>basisch</one>? <one>Sauer</one>; daher wird ein <one>saures Medium</one> benötigt.
+- Beim <one>semi-dry blotting</one>, wenn wir die Formel links aufschreiben: 2 H₂O + 2e⁻, was meinen wir damit? Das <royalblue>gasförmiges</royalblue> <one>H₂</one> entstehen wird; und <one>OH⁻</one>.
+- Abgesehen von Diabetikern, wo noch mögen wir einen <one>schnellen Biosensor</one> für die <three>Lactatbestimmung</three> benötigen? Innerhalb der <one>Sportmedizin</one>, und dem <one>Leistungssport</one>.
+- In der <one>Umweltanalytik</one> werden Werte oft als <one>log K OW</one> angegeben. Wofür steht hier O und W? (1) <one>O</one> ... <two>Octanol</two> (2) <one>W</one> ... <two>Wasser</two>
+- Bei einem <one>Enzymimmunoassays</one>: was sollten wir bei der Enzymaktivität beachten? Die <one>Enzymaktivität sollte leicht zu messen sein</one>.
+- Was beschreibt die <one>Hofmeister-Serie</one>? Diese Serie beschreibt <one>die Eigenschaft eines Salzes, Proteine zu fällen</one>.
+- In welchem Jahr wurden erstmals <one>fetale Zellen im mütterlichen Blut</one> nachgewiesen? Im Jahre <one>1893</one>, durch <two>Georg Schmorl</two>.
+- Was passiert beim <one>Densitometer</one>? Die Optische Dichte eines Farbareals wird bestimmt.
+- Name the <one>most famous curve in bioanalytics</one>. A: The <one>Van-Deemter curve</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Van_Deemter_equation
+- Small molecules, such as <one>haptens</one>, are generally measured by ... ? A <one>competitive immunoassay</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Immunoassay#Competitive,_homogeneous_immunoassays
+- Is the <one>UPLC</one> better than the <one>HPLC</one>? Yes.
+- In a typical <one>western blot setup</one>, the anode is positive and proteins will migrate towards the anode. <one>Top</one> or <one>bottom</one> of the western blot, where is the anode found? At the <one>bottom</one>.
+- Die charakteristische Zeit, die ein Protein vom Auftrag bis zur Ausschwemmung (Elution) von einer Chromatographie-Säule benötigt, wird wie genannt? <one>Retentionszeit</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Chromatographie#Retentionszeit
+- Nenne zwei verschiedene <one>fluoreszierende Verbindungen</one> die in der Bioanalytik bei einem <three>Fluoreszenzassay</three> eingesetzt werden. A: (1) <one>Fluoreszein</one> (2) <one>Rhodamin</one>
+- What does a <one>capillary electrophoresis</one> separate? It <one>can separate ions</one>.
+- <one>Multiplexing</one> in bioanalytics combines which two components for a <three>multiplex immunoassay</three>? (1) <one>lateral flow</one> (2) <one>microarray technologies</one>
+- <one>Ion exchange chromatography</one> separates what and how ...? Ion exchange chromatography separates compounds according to the nature and degree of their <one>ionic charge</one>.
+- Why may we have to keep the <one>temperature effect</one> in mind, in Bioanalytics? Because, for instance, the <one>volume</one> of a liquid is <two>temperature dependent</two>.
+- <one>HDX-MS</one> can be used to study structural conformation of a protein, including its interaction as a complex. We can identify epitopes too. How does this work? The protein is submerged into <one>D2O</one>, which will replace exposed hydrogen atoms to exchange with deuterium atoms.
+- A <one>lateral flow device</one> for immuno-analytics, may have which two lines on its <three>nitrocellulose membrane</three>? (1) <one>test line</one> (2) <one>control line</one>
+- Der <one>BCA-Assay</one> ist unterschiedlich sensitiv, abhängig von ... ? Der <one>gewählten Temperatur</one>.
+- <one>Cation exchange columns</one> will typically bind dipeptides that have which particular characteristic? They have <one>a net positive charge</one> (<two>⁺</two>).
+- Nenne ein Beispiel für die <one>Analytanreicherung</one> (also eine Technik). A: Die <one>Immunoaffinitätschromatraphie</one>.
+- In <one>gel electrophoresis</one>: the smaller molecules move more quickly than the larger molecules. Name a method used in bioanalytics where the opposite situation is the case, that is, the larger molecules will move more rapidly so. A: In <one>Sephadex molecular sieve chromatography</one>.
+- Wenn Zellen zu schnell durch eine enge Pore strömen, wie können wir die Strömungsgeschwindigkeit reduzieren und den Stromfluss verlangsamen? Wir verwenden eine <one>viskose Pufferflüssigkeit</one>.
+- In <one>Chromatography</one>: what means <two>RPC</two>? <one>Reversed Phase Chromatography</one>.
+- In <one>Bioanalytics</one>, in particular in chromatography: what is meant with the term <two>retention time</two>? This is the time between <one>injection to detection</one>; time spent <one>on the column</one>.
+- Die <one>meistverkauften Biotests</one> sind ... ? <one>Schwangerschaftstests</one>.
+- Kann die <one>Murexid-Reaktion</one> verwendet werden um Coffein nachzuweisen? Ja.
+- In <two>Bioanalytics</two>: what does the abbreviation <one>LOD</one> stand for? <one>Limit of detection</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Detection_limit
+- Was heisst <one>MALDI</one>? <one>Matrix-assisted laser desorption</one>/<one>ionization</one>.
+- Nenne ein allgemeines Problem bei <one>Protein-Biochips</one>. A: <one>Kreuzreaktionen</one>.
+- Fungiert die <one>Ionenaustauschchromatographie</one> reversibel? Ja.
+- Was ist die <one>Fluoreszenzlebensdauer</one>? Dies ist die mittlere Zeit, die ein Molekül bei der Fluoreszenz in einem angeregten Zustand verbleibt, bevor es ein Photon emittiert und dadurch in den Grundzustand zurückkehrt. 
+- Andere Bezeichnung für einen <one>theoretischen Verdau mit Hilfe einer Protease</one>? <one>In-silico digestion</one>.
+- Was passiert bei der <one>Chemilumineszenz</one>? Hier wird chemische Energie in Licht umgewandelt.
+- Bei <violet>FACS</violet>, der <one>Durchflusscytometrie</one>, gibt es zwei Arten von "scatter". Welche sind dies? (1) <one>Forward Scatter</one> (<one>FSC</one>) (2) <one>Side Scatter</one>   (<one>SSC</one>)
+- Was ist mit dem Begriff <one>Biolumineszenz</one> gemeint? Dies bezeichnet die Fähigkeit von Lebewesen <one>selbst</one>, oder mit Hilfe von Symbionten, <one>Licht zu erzeugen</one>.
+- What is the <one>Kinomics</one>? This refers to methods used in order to <one>decipher the kinome</one>.
+- In MALDI-MS wird als Matrix oft <one>DHB</one> verwendet. Welche Substanz ist damit gemeint? <one>2,5-Dihydroxybenzoesäure</one>.
+- Name two examples for <one>colorimetric assays</one>. A: (1) <one>Bradford Assay</one> (2) <one>Lowry Assay</one>
+- Nenne eine <one>Stärke der Fluoreszenzmethode</one> in der Bioanalytik. A: Eine <one>sehr niedrige Nachweisgrenze</one>.
+- Nenne vier verschiedene <one>Proteinkomplexe</one> die in der Bioanalytik wichtig sein mögen. A: (1) <one>Glykoproteine</one> (2) <one>Lipoproteine</one> (3) <one>Phosphoproteine</one> (4) <one>Metalloproteine</one>
+- Der <one>BCA-Assay</one> baut auf welch anderem Assay auf? Auf dem <one>Biuret-Assay</one>.
+- Was heisst <one>Sensor</one>, also <two>sensus</two>? Das <one>Gefühl</one>.
+- Was ist die <one>Chromatofokussierung</one>? Dies ist eine Methode, die <one>eine Trennung von Proteinen gemäß ihrer isoelektrischen Punkte erlaubt</one>.
+- Anderer Begriff für <one>Signalumwandler</one>? <one>Transduktor</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Transduktor_%28Elektrotechnik%29
+- Kommt bei einem <one>Schwangerschaftstest</one> ein <two>Papier</two> zum Einsatz? Ja - ein <royalblue>Papierstreifen</royalblue> für die Aufnahme des <one>Urins</one>.
+- In X-ray studies of proteins: what does the abbreviation <one>SAXS</one> stand for? <one>Small angle X-ray scattering</one>.
+- What was the first <one>biosensor</one> in human history? The <one>glass pH electrode</one>, invented in <royalblue>1922</royalblue> by Hughes.
+- What <one>pressure</one> does the <two>UPLC</two> typically use? Up to <one>100M Pa</one>.
+- In der Gentechnik können wir die <one>Ionenaustauschchromatographie</one> verwenden. Nach welchem Prinzip funktioniert sie? Dank dieser analytischen Methode können wir <one>Stoffe anhand ihrer Ladung trennen</one>.
+- Welcher <one>pH-Wert</one>, im sauren Bereich, sollte idealerweise verwendet werden, um <two>Antigen-Antikörper-Komplexe</two> zu trennen? <one>pH 2.6</one>.
+- <one>CsCl-Gradienten</one> eignen sich besonders gut für die Auftrennung von ... ? <violet>Nucleinsäuren</violet>.
+- Nenne einen Nachteil des <one>Starcher-Assays</one>. A: Er ist <royalblue>sehr zeitaufwändig</royalblue>; sogar <one>über 24 Stunden</one>.
+- Beim <one>Biuret-Assay</one> wird bei welcher Wellenlänge gemessen? Bei <one>550nm</one>.
+- Allgemein - <one>wie fällen wir Nukleinsäuren aus</one>? Da Nukleinsäuren <royalblue>hoch negativ geladene Polyanionen</royalblue> sind, können sie mit <one>stark basischen Substanzen</one> gefällt werden.
+- Nenne <one>zwei Bedingungen</one> damit wir das Lambert-Beersche Gesetz auch praktisch einsetzen können. A: (1) Die absorbierende Substanz muss homogen in der Lösung verteilt sein (2) es darf keine Lichstreuung vorliegen
+- Was für eine Art Gas muss bei der <one>Gaschromatographie</one> verwendet werden? Ein <one>inertes Trägergas</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Gaschromatographie#Verwendete_Trenns%C3%A4ulen
+- Wir können <one>die Proteinsequenz sequenzieren</one>, indem wir den <two>N-Terminus</two> oder vom <two>C-Terminus</two> her abbauen. Beim N-Terminus kommt der <three>Edman-Abbau</three> häufig zum Einsatz, aber welche Abbaumethode wird für den C-Terminus verwendet? Der <one>Schlack-Kumpf-Abbau</one>.
+- Wann wurde der Begriff <one>Chromatographie</one> erstmals beschrieben? Im Jahre <one>1901</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Chromatographie
+- In Bioanalytics, we can say that the <one>concept of sensitivity</one> is one of probability. What is meant with this? This is the question at what concentration one would be uncertain that the sample was not actually zero.
+- Wir können in der Bioanalytik die <one>Komplexität der Matrix</one>, wie zum Beispiel Proteine im Blut, durch sogenannte <two>depletion-columns</two> reduzieren. Nenne eine <three>Firma</three> die dies anbietet. A: Die Firma <one>Agilent</one>.
+- What assay is the <one>LFIA</one>? This refers to a <one>Lateral flow immunoassay</one>.
+- In der Chromatographie, so zum Beispiel bei der Gelfiltrationschromatographie: was meinen wir mit dem <one>Laufmittel</one>? Das Laufmittel ist jenes Lösungsmittel, mit dem <one>die Trennung der Probe</one> erfolgen soll.
+- Der <one>Lowry Assay</one> benutzt welches Reagens? Das <one>Folin-Ciocalteu-Phenol Reagens</one>. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Folin%E2%80%93Ciocalteu_reagent
+- Wieso verwenden wir einen <one>Monochromator</one> in einem Photometer? Um nur eine <one>bestimmte Messwellenlänge</one> durch die Küvette durchzuschicken.
+- In der <one>Ionenaustauschchromatographie</one> wird <two>DEAE</two> verwendet. Welche Ladung hat <two>DEAE</two>? <royalblue>DEAE</royalblue> ist <one>positiv geladen</one>.
+- Biosensoren sind <one>Messfühler</one>, die mit ... Komponenten ausgestattet sind. A: <one>biologischen Komponenten</one>.
+- Beim <one>Bradford-Assay</one> messen wir bei einer Wellenlänge von ... ? <one>595 nm</one>.
+- In der Bioanalytik: was heisst die Abkürzung <one>LIF</one>? <one>Laser Induzierte Fluoreszenz</one>.
+- <one>Lateral flow devices</one>: nenne 3 Nachteile. A: (1) das Ergebnis ist nur <one>semi-quantitativ</one> (2) die Reproduzierbarkeit ist von der Charge abhängig (3) Kreuzreaktivität der Antikörper
+- What is done in <one>immunohistochemistry</one>? We will immuno-localize a particular antigen in a tissue.
+- <one>SELDI</one> ist ... ? SELDI ist <one>ein Proteinchip</one>. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC514271/
+- Bei einem <one>Glucosesensor</one> der in der Bioanalytik eingesetzt wird, wird meistens welches Enzym eingesetzt? Die <one>Glucoseoxidase</one> (<royalblue>GOD</royalblue>). URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Glucose-Oxidase
+- In bioanalytics we have the <one>DELFIA</one>. What does this abbreviation stand for? <one>Dissociation-enhanced lanthanide fluorescent immunoassay</one>.
+- In a <one>Polyacrylamide-Gel</one>: who or what defines the <two>pore size</two>? The <royalblue>linker</royalblue> employed defines the <one>pore size</one>.
+- Wie nennen wir eine <one>nicht schwanger</one>-Anzeige, bei einem <one>Schwangerschaftstest</one>, obwohl eine Schwangerschaft vorliegt? Dies ist ein <one>falsch-negatives Ergebnis</one>.
+- <one>2-D electrophoresis</one> generates what kind of <two>gram</two>? It creates an <one>electropherogram</one>.
+- Ist der <one>Sandwich-Assay</one> für den <two>Nachweis von Haptenen</two> geeignet? Nein.
+- In a <one>DELFIA-assay</one>, the reagents must be labeled with ... ? With <royalblue>lanthanide chelates</royalblue> containing <violet>Europium</violet>, <violet>Terbium</violet> or <violet>Samarium</violet>.
+- Wieso werden <one>Reinigungsschritte</one> für Proteine benötigt und auch real eingesetzt? Da Proteine oft mit anderen Substanzen, wie DNA oder Lipiden, vorkommen.
+- What is the <one>CE electrophoresis</one>? <royalblue>CE</royalblue> is the abbreviation for <one>capillary electrophoresis</one>.
+- What is the <one>Immuno-PCR</one>, essentially? It is <one>an antigen detection system</one>.
+- A. W. für <one>Coomassie Blue dye</one>? <one>Bradford Assay</one>.
+- <one>iBAQ</one> is used to estimate ...? <one>Protein abundance</one> in a cell. URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2212968514000403
+- Für die Bioanalytik - nenne eine Form der Massenspektrometrie, die hilfreich ist beim <slateblue>Verfolgen von Krankheitsprogressionen</slateblue>. A: <violet>SIMS</violet>: <one>Second Ion Mass Spectrometry</one>.
+- <one>SELDI</one> steht für ... ? <one>Selektive Elution Laser Desorption Ionisation</one>.
+- Anderes Wort für <one>Biuret</one>? <one>Carbamoylharnstoff</one>. URL: http://www.chemie.de/lexikon/Biuret.html
+- Die <one>Immunpräzipitation</one> kann eingesetzt weden um bestimmte Proteine anzureichern/isolieren. Hierbei werden oft <two>beads</two> verwendet, die an der Oberfläche mit Antikörper-bindenden Proteinen beschichtet werden können. Nenne zwei Beispiele für solche Proteine. A: (1) <one>Protein A</one> (2) <one>Protein G</one>
+- <one>Schwangerschaftstests</one> sind oft einfach <two>ELISA-Assays</two>. Welches Protein weisen sie nach? <royalblue>hCG</royalblue> (<one>human Choriongonadotropin</one>).
+- <one>IPG strips</one> can have an <two>ultra short range</two> and a <two>wide range</two>. What is the pH range for a typical <two>ultra short range</two>? From about <one>4.35</one> to <one>4.55</one>.
+- In der Bioanalytik bei einem Messsystem: was ist die <one>untere Nachweisgrenze</one>? Die untere Nachweisgrenze ist der extremste Wert, bis zu dem die Messgröße <one>gerade noch zuverlässig nachgewiesen werden kann</one>.
+- Was muss <one>nach</one> der Messung mit einem Biosensor passieren? Der <one>Ausgangszustand des Sensorsystems</one> muss wiederhergestellt werden.
+- <one>GFP-RFP FRET Pairs</one>: what does <two>RFP</two> mean? <crimson>Red Fret Pair</crimson>.
+- Für spezielle Trennungen, vor allem in der Pharmaforschung, werden <one>chirale Trennsysteme</one> eingesetzt. Gib ein Beispiel hierzu an. A: <one>Cyclodextrine</one>.
+- In der Bioanalytik, bei der Chromatographie: was meinen wir mit <one>unspezifischen Detektionsmethoden</one>? Dies sind Detektionsmethoden, die den gesamten Proteingehalt einer Probe erfassen.
+- Wieso setzen wir mitunter eine <one>Vorsäulenderivatisierung</one> ein? Um zum Beispiel bessere photometrische oder fluorimetrische Detektierbarkeit zu erreichen.
+- Beim <one>Lambert-Beerschen Gesetz</one>: was ist E (epsilon)? Dies ist <one>der molare Absorptionskoeffizient</one>.
+- Durch <one>depletion columns</one>, zum Beispiel gegen Blut, wird was angereichert? <one>Niedriger abundante Proteine</one>.
+- Was ist die <one>Elektrophorese</one>? Die Wanderung geladener Teilchen in einem <one>elektrischen Feld</one>.
+- Warum heisst die <one>Chromatographie</one> eigentlich so? Weil man hierbei ursprünglich gelbe und grüne Pflanzenpigmente getrennt hat.
+- In Bioanalytics there is the <one>Eddy-diffusion parameter</one>, which is related to channeling through ... ? A non-ideal packing.
+- Was meinen wir mit dem Begriff <one>Richtigkeit</one> in der Bioanalytik? Dies ist die Abweichung des Mittelwertes von Mehrfachbestimmungen vom tatsächlichen Wert.
+- Wie funktioniert eine <one>HLPC-Chromatographie</one>? Die mobile Phase wird mit Hochdruck über eine Trennsäule gepumpt, und nimmt dabei die Bestandteile der aufgebrachten Probe mit.
+- Bei der <one>Affinitätschromatographie</one>: was kommt meistens <orange>vor</orange> dem <two>Elutionsschritt</two>? Ein <one>Waschschritt</one>.
+- What is the main purpose or use case of the <one>starcher assay</one>? We can <one>quantitate the total protein content of tissue samples</one>.
+- In bioanalytics, in <one>biochromatographic separation techniques</one>: name four different properties of the analytes. A: (1) size (2) shape (3) charge (4) hydrophobicity
+- Andrer Begriff für <one>Aufbrechen einer Zelle</one>? <one>Zelldisruption</one>.
+- Was ist die <one>Hofmeister-Reihe</one>? Die "Hofmeister-Reihe" beschreibt die "unterschiedlichen Fällungswirkungen von Salzen".
+- Damit wir das <one>Lambert-Beersche Gesetz</one> in der Bioanalytik praktisch anwenden können ist was extrem wichtig? Die <one>homogene Verteilung der absorbierenden Substanz</one>. URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Lambert-Beer%E2%80%99sches_Gesetz
+- <one>Protein-Biochips</one> ähneln welcher anderen Technik? Dem <one>ELISA</one>.
+- Was ist <one>Immunagglutination</one>? Wenn die antigentragende Zellen mit einem Serum, das entsprechende Antikörper enthält, vermischt werden. Es kommt hierbei zu einer Zusammenballung sowie einer sichtbaren Sedimentation.
+- Nenne zwei fundamentale <one>bioanalytische Fragestellungen</one>. A: (1) Welche Substanzen sind zu analysieren? (2) Welche Methoden sind dafür erforderlich?
+- Seit welchem Jahr existiert die <one>UHPLC</one> (<two>Ultra fast HPLC</two>)? Seit dem Jahre <one>2004</one>.
+- In bioanalytics: what is meant with the term <one>random error</one>? This is when the sign and magnitude of the error changes randomly between measurements.
+- Nenne zwei Gründe wieso (experimentell betrachtet), die <one>Stabilität von Proteinen</one> reduziert sein mag. A: (1) Proteasen bauen die Proteine ab (2) Proteine mögen unlösliche Aggregate bilden.
+- Das <one>Photometer</one> hat welches Element vor der Küvette? Einen <mediumseagreen>Monochromator</mediumseagreen>.
+- Bei der <one>Phenol-Extraktion</one> kann man zwischen welchen <one>zwei Phasen</one> unterscheiden? (1) der <one>wässrigen Phase</one> (2) der <one>organischen Phase</one>
+- Für die Erkennung der zu bestimmenden Substanzen nutzen Biosensoren ... Systeme. A: <one>Biologische Systeme</one>.
+- Können wir alleine über die Masse ein Protein bestimmen? Nein, nicht direkt, da die Aminosäuren, selbst wenn wir die Masse kennen, unterschiedlich angeordnet werden können.
+- Why may <one>electrospray mass spectrometry</one> be used? For <one>proteomic analysis</one>, for example.
+- A <one>DELFIA assay</one> is virtually identical to which other assay? To a <one>standard sandwich ELISA</one>.
+- Name three different chemical groups of a protein which can interact with the stationary phase, in <one>Bioanalytics</one>. A: (1) <one>-NH2</one> (2) <one>-SH</one> (3) <one>-OH</one>
+- Provide a reason as to why <one>SNPs</one> may be relevant from the point of view of (genetic) bioanalysis. A: SNPs lead to <one>polymorphisms</one>, and some of these polymorphisms may be biologically significant. For example, some polymorphisms may show different responses in regards to applied drugs to the person at hand.
+- Name a <one>disadvantage</one> of using "polyacrylamid gels" in the laboratory. A: <one>Polyacrylamid gels</one> are "<u>toxic</u>".
+- Das <one>immobilisierte biologische System eines Biosensors</one> tritt in Wechselwirkung mit ... ? Dem <one>Analyten</one>.
+- We can measure mRNA in biopsies of oral tissue, but we may have to immediately stabilize said RNA. Name a substance or kit with which this could be done. A: <one>PAXgene</one>.
+- Nenne zwei Nachteile der radioaktiven Markierung. A: (1) Sicherheitsvorkehrungen sind erforderlich (2) Entsorgung von radioaktivem Abfall ist notwendig
+- Nenne die vier wichtigsten biologischen Bausteine des Lebens. A: (1) Proteine (2) Nucleinsäure (3) Oligosaccharide (4) Lipide

data/lib/studium/exam_topics/biochips

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+# =========================================================================== #
+# === Biochips
+#
+# This will be about Biochips and Microarrays.
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+- Give another name for <one>microarrays</one>. A: <one>Gene Chips</one>.
+- <one>Which person</one> invented the microarray technology? <one>Stephen Fodor</one>.
+- In microarrays: what is meant with the term <one>direct labeling</one>? This is when we put e. g. a "fluorophore" on primers or nucleotides directly.
+- Name a microarray that starts with the letter "T". A: <one>Tilingarrays</one>.
+- In <one>contact printing</one> for biochips: what is the droplet volume (from-to)? About 400-600 pl.
+- In what year was the first genechip, a prototype, developed? In <one>1989</one>. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4011503/ []
+- The concept and methodology of "protein microarrays" was first introduced and illustrated in ... ? <one>antibody microarrays</one>.
+- In a microarray experiment, we may use the dye C3 and C5. Which colour do they display usually? (1) <one>Cy3</one>: Green (2) <one>Cy5</one>: Red []
+- In microfluidics, for lab-on-a-chip: name three parameters for the <one>integration of functionality</one>. A: (1) <one>compactness</one> (2) <one>parallelization</one> (3) <one>high-throughput</one>
+- In <one>live cell microarrays</one>, we may wish to put ESCs onto the surface, but prior to that, we may have to coat the surface of our substrate with ...? <one>Fibronectin</one>.
+- Is a <one>reference genome</one> necessary for the design of probes of a DNA microarray? Yes.
+- Why are <one>Carbohydrate Microarrays</one> typically used? This is to study <one>post-translational modifications</one>.
+- Nenne einen Vorteil der Organchips gegenüber Tierversuchen. A: Man kann, dank der Organchips, mit menschlichen Zellen arbeiten.
+- Wann mögen wir den <tomato>MethylScope Microarray</tomato> einsetzen? Wenn wir einen Tumor mit gesundem Gewebe vergleichen möchten.
+- TMAs are ... what microarrays? <tomato>Tissue microarrays</tomato<: 
+- In DNA-microarrays, what do we mean with the "target"? These are the amplified, labeled cDNAs generated from the total RNA from a cell or tissue.
+- Photolitography is a process based on semiconductor technology. It uses light but also ... ? "Light-blocking masks".
+- Name three different "Microarray manufacturers". A: (1) Affymetrix (2) Agilent (3) Illumina
+- In Biochips design, why may we want to swap dyes? The dyes may behave differently; this way we can assess whether they do.
+- In Biochip design, what do we mean with "MDMs"? These are "microbial diagnostic microarrays".
+- In Biochip technology, we may have to check "data quality" on different levels. Name three different levels here. A: (1) Probe level (2) Array level (3) Gene level
+- In Biochip design, we may use spaces, after a NH2 group at one end. This may be Thymidine. How many Thymidines are used? About 12 T.
+- How are microarrays read out? Microarrays are read out via a "laser-based fluorescence scanner".
+- What is the "central assumption" of Gene Expression Microarrays? That the level of a given mRNA is positively correlated with the expression of the associated protein.
+- What does an "expression array" measure? It measures the amount and type of mRNA transcripts.
+- If we may wish to do "patient stratification", which microarray method may we employ? An "antibody microarray".
+- In Biochips, contactless printing requires humidity of ... n%? About 65%.
+- In Biochips, which two different pins are oten used for "contact printing"? (1) split pin (2) solid pin
+- In Biochip design, the 16S rRNA is often used for phylogeny, but it is not always ideal. Name an intrinsic problem that the 16S rRNA has. A: It can not provide for "strain-specific information".
+- A phylogenetic marker should ... ? Reflect taxonomy.
+- Name 3 disadvantages of "spotted cDNA microarrays". A: (1) Sequence verification (2) poor surface-adhesion properties (3) The data can be variable
+- For microarrays, we may need a "molecular marker". What do we mean with this? This is a DNA sequence, which is specific for a certain phenotype or genotype.
+- In Biochips, how do we call the method that can find a spot, in general? This is called "spot identification".
+- What must come before applying a microarray to real datasets? Validation.
+- How many cDNA probes can be easily put on an average microarray? About 20.000 cDNAs.
+- Give a reason why "diagnostic microarrays" are used. A: So that we can detect disease-related genes.
+- Give on example for an "alternative microarray format". A: Clondiag, the "ArrayTube".
+- In Macroarrays, probes are on ...? The membrane.
+- Name two fixatives commonly used for CMAs ("cell microarrays"). A: (1) formalin (2) paraformaldehyde
+- In Biochip design, when we use "mixed-genome microarrays", name an advantage in their construction. A: We do not need to have any "a priori" knowledge about the genomes, in order to construct these microarrays.
+- In Biochip sciences, what does "MGM" stand for? Mixed-genome microarrays. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12574259  
+- In Biochip design, we may use the material "PMMA". What does this abbreviation stand for? Polymethymethacrylate.
+- Name three different types of microarrays. A: (1) DNA Microarrays (2) Peptide Microarrays (3) Carbohydrate Microarrays
+- Why do Biochips usually use plastic rather than glass? Because plastic is much cheaper than glass.
+- The two major dyes used in Biochips, Cy3 and Cy5, have which colour, respectively? (1) Cy3: green dye (2) Cy5: red   dye
+- In Biochip-design, the oligonucleotides (mers) should not be too short. Why not? Because too short mers tend to be too unspecific.
+- Cartridge-based microarrays are typically surrounded via ...? A plastic housing.
+- Name 3 different "non-contact printing" ways to create microarrays. A: (1) Thermal (2) Piezo (3) Valve
+- Who developed the "PhyloChip"? Affymetrix.
+- The PhyloChip from Affymetrix uses n-mers biochips? 25-mers.
+- In probe design of biochips, why are different lengths used for different oligos? So that they have, roughly, the same melting temperatures
+- SSELO is a novel labeling approach in biochips design. What does SSELO stand for? "Sequence-specific end-labeling of oligonucleotides".
+- Name the four major "Unique Selling Points" of Biochips. A: (1) parallel approach (2) miniaturization (3) automation (4) integration of functions
+- In Biochips, what are "PM probes"? Perfectlymatching probes. URL: https://www.vsni.co.uk/software/genstat/htmlhelp/marray/AffymetrixChips.htm
+- In Biochips, what are "CMAs"? These are "cell microarrays".
+- Can we use the DNA microarray to determine whether the DNA from a particular individual contains a mutation in different genes? Yes. In fact, this can be used to look at differenial expressions between BRCA1 and BRCA2.
+- What is "fold change" in context of a DNA microarray experiment? Fold change is a measure describing how much a quantity changes going from an initial to a final value. For instance, an initial value of 30 and a final value of 60 corresponds to a fold change of 1, or in common terms, a "one-fold increase".
+- "Experimental design" of microarray experiments has which 3 different design possibilities? (1) Direct Design (2) Reference Design (3) Loop Design
+- For "one colour arrays", of DNA microarrays, what do we actually compare? We compare different arrays here.
+- What means "limma"? Linear models for microarray data.
+- Welche andere Technik kombiniert die ChIP-chip? Microarray Technologie.
+- A. W. für "Microarrays" in der Gentechnik? "lab-on-a-chip"
+- In Chip-Design, was heisst "LOC"? Lab-on-a-Chip.
+- Was ist am teuersten bei einem Microarray-Experiment? Die Farbstoffe.
+- We may use expression profiles, such as via a "DNA microarray". When we use a one-colour array, what exactly do we measure there? Only the signal intensities will be measured.
+- Why is glass used rather than silica in microarray-chip design? Because we can see through glass; we can't see through silica.
+- In Chip-Design, what means "OOAC"? Organ-on-a-Chip.
+- In Chip-Design, what means "TMAs"? Tissue microrrays.
+- When were the first cDNA arrays developed? In 1994, at the Stanford University.
+- Name a "clinically validated HPV genotyping assay". A: The PapilloCheck.
+- In a standard microarray, if we see a yellow dot, what does this mean? This means "no net change", thus uninteresting to us.
+- What means "DArT" in biochips technology? Diversity Arrays Technology. URL: https://en.wikipedia.org/wiki/Diversity_Arrays_Technology
+- DArT is useful for ...? DArT is useful for large gnomes, such as plant genomes.