RubyGems - genevalidator - Versions diffs - 1.6.12 → 2.1.3 - Mend

genevalidator 1.6.12 → 2.1.3

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.

Files changed (91) hide show

checksums.yaml +5 -5
data/.gitignore +30 -1
data/.ruby-version +1 -0
data/.travis.yml +13 -12
data/Gemfile +4 -1
data/Gemfile.lock +135 -0
data/README.md +104 -122
data/Rakefile +377 -5
data/aux/gv_results.slim +155 -0
data/aux/html_files/css/gv.compiled.min.css +8 -0
data/aux/{files → html_files}/css/src/bootstrap.min.css +0 -0
data/aux/{files → html_files}/css/src/font-awesome.min.css +0 -0
data/aux/{files → html_files}/css/src/style.css +0 -0
data/aux/{files → html_files}/fonts/FontAwesome.otf +0 -0
data/aux/{files → html_files}/fonts/fontawesome-webfont.eot +0 -0
data/aux/{files → html_files}/fonts/fontawesome-webfont.svg +0 -0
data/aux/{files → html_files}/fonts/fontawesome-webfont.ttf +0 -0
data/aux/{files → html_files}/fonts/fontawesome-webfont.woff +0 -0
data/aux/{files → html_files}/img/gene.png +0 -0
data/aux/html_files/js/gv.compiled.min.js +1 -0
data/aux/{files → html_files}/js/src/bootstrap.min.js +0 -0
data/aux/{files → html_files}/js/src/d3.v3.min.js +0 -0
data/aux/{files → html_files}/js/src/jquery-2.1.1.min.js +0 -0
data/aux/{files → html_files}/js/src/jquery.tablesorter.min.js +0 -0
data/aux/{files → html_files}/js/src/plots.js +1 -1
data/aux/{files → html_files}/js/src/script.js +0 -0
data/aux/{files → html_files}/json/.gitkeep +0 -0
data/bin/genevalidator +393 -56
data/exemplar_data/README.md +60 -0
data/{data/mrna_data.fasta → exemplar_data/mrna_data.fa} +1 -1
data/{data/protein_data.fasta → exemplar_data/protein_data.fa} +0 -0
data/genevalidator.gemspec +35 -20
data/install.sh +92 -0
data/lib/genevalidator.rb +171 -56
data/lib/genevalidator/arg_validation.rb +26 -55
data/lib/genevalidator/blast.rb +44 -99
data/lib/genevalidator/clusterization.rb +18 -22
data/lib/genevalidator/exceptions.rb +17 -17
data/lib/genevalidator/ext/array.rb +21 -4
data/lib/genevalidator/get_raw_sequences.rb +32 -31
data/lib/genevalidator/hsp.rb +31 -2
data/lib/genevalidator/json_to_gv_results.rb +38 -122
data/lib/genevalidator/output.rb +158 -172
data/lib/genevalidator/output_files.rb +134 -0
data/lib/genevalidator/pool.rb +2 -5
data/lib/genevalidator/query.rb +1 -1
data/lib/genevalidator/tabular_parser.rb +8 -29
data/lib/genevalidator/validation.rb +48 -90
data/lib/genevalidator/validation_alignment.rb +64 -75
data/lib/genevalidator/validation_blast_reading_frame.rb +13 -9
data/lib/genevalidator/validation_duplication.rb +85 -84
data/lib/genevalidator/validation_gene_merge.rb +46 -35
data/lib/genevalidator/validation_length_cluster.rb +18 -15
data/lib/genevalidator/validation_length_rank.rb +19 -15
data/lib/genevalidator/validation_maker_qi.rb +13 -12
data/lib/genevalidator/validation_open_reading_frame.rb +16 -13
data/lib/genevalidator/validation_report.rb +1 -1
data/lib/genevalidator/validation_test.rb +1 -1
data/lib/genevalidator/version.rb +1 -1
data/test/overall.rb +1 -1
data/test/test_all_validations.rb +36 -24
data/test/test_blast.rb +39 -24
data/test/test_clusterization_2d.rb +4 -4
data/test/test_helper.rb +2 -2
data/test/test_query.rb +16 -20
data/test/test_validation_open_reading_frame.rb +122 -122
data/test/test_validations.rb +12 -10
metadata +94 -79
data/aux/files/css/genevalidator.compiled.min.css +0 -16
data/aux/files/js/genevalidator.compiled.min.js +0 -28
data/aux/json_footer.erb +0 -8
data/aux/json_header.erb +0 -19
data/aux/json_query.erb +0 -15
data/aux/template_footer.erb +0 -8
data/aux/template_header.erb +0 -19
data/aux/template_query.erb +0 -14
data/data/README.md +0 -57
data/data/mrna_data.fasta.blast_tabular +0 -3567
data/data/mrna_data.fasta.blast_tabular.raw_seq +0 -53998
data/data/mrna_data.fasta.blast_tabular.raw_seq.idx +0 -5440
data/data/mrna_data.fasta.blast_xml +0 -39800
data/data/mrna_data.fasta.blast_xml.raw_seq +0 -2554
data/data/mrna_data.fasta.blast_xml.raw_seq.idx +0 -3127
data/data/mrna_data.fasta.json +0 -1
data/data/protein_data.fasta.blast_tabular +0 -3278
data/data/protein_data.fasta.blast_tabular.raw_seq +0 -61295
data/data/protein_data.fasta.blast_tabular.raw_seq.idx +0 -4438
data/data/protein_data.fasta.blast_xml +0 -26228
data/data/protein_data.fasta.blast_xml.raw_seq +0 -9803
data/data/protein_data.fasta.blast_xml.raw_seq.idx +0 -1777
data/data/protein_data.fasta.json +0 -1

data/data/protein_data.fasta.blast_xml.raw_seq.idx DELETED

@@ -1,1777 +0,0 @@
----
-gi|21362904|sp|Q9CYH6.1|RRS1_MOUSE:
-- 0
-- 407
-gi|182676579|sp|A1A5P2.1|RRS1_RAT:
-- 813
-- 1219
-gi|906460605|gb|KNC23288.1|:
-- 1219
-- 1602
-gi|298289231|sp|A8WY26.1|RRS1_CAEBR:
-- 1602
-- 1973
-gi|21362907|sp|Q9XVT0.1|RRS1_CAEEL:
-- 1973
-- 2347
-gi|74860288|sp|Q869Q2.1|RRS1_DICDI:
-- 2347
-- 2705
-gi|21362902|sp|O59678.1|RRS1_SCHPO:
-- 2705
-- 2910
-gi|3183481|sp|Q08746.1|RRS1_YEAST:
-- 2910
-- 3151
-gi|83305639|sp|Q9SH88.2|RRS1_ARATH:
-- 3151
-- 3510
-gi|84028250|sp|P41499.4|PTN11_RAT:
-- 4792
-- 5433
-gi|34922941|sp|Q90687.1|PTN11_CHICK:
-- 5433
-- 6072
-gi|21903454|sp|P29351.2|PTN6_MOUSE:
-- 6712
-- 7352
-gi|34922906|sp|P81718.1|PTN6_RAT:
-- 7352
-- 8008
-gi|906465081|gb|KNC26792.1|:
-- 8008
-- 9070
-gi|29427426|sp|Q24708.1|CSW_DROVI:
-- 9070
-- 9880
-gi|29427511|sp|Q8ISC9.1|CSW_DROSI:
-- 9880
-- 10478
-gi|317373592|sp|O14522.6|PTPRT_HUMAN:
-- 10478
-- 11978
-gi|33112429|sp|Q99M80.2|PTPRT_MOUSE:
-- 11978
-- 13490
-gi|29427539|sp|Q9BMN8.1|LAR_CAEEL:
-- 13490
-- 15757
-gi|548626|sp|P35822.1|PTPRK_MOUSE:
-- 15757
-- 17270
-gi|226723261|sp|A7MBJ4.1|PTPRF_BOVIN:
-- 27586
-- 29550
-gi|146345496|sp|Q15262.2|PTPRK_HUMAN:
-- 19234
-- 20732
-gi|226723263|sp|A2A8L5.1|PTPRF_MOUSE:
-- 20732
-- 22696
-gi|126467|sp|P18433.2|PTPRA_HUMAN:
-- 22696
-- 23545
-gi|81918347|sp|Q64604.1|PTPRF_RAT:
-- 23545
-- 25506
-gi|808886741|gb|KKF33258.1|:
-- 626615
-- 628695
-gi|341941771|sp|P28828.2|PTPRM_MOUSE:
-- 31061
-- 32572
-gi|1709906|sp|P23468.2|PTPRD_HUMAN:
-- 32572
-- 34548
-gi|462549|sp|Q03348.1|PTPRA_RAT:
-- 34548
-- 35389
-gi|387912897|sp|Q64487.3|PTPRD_MOUSE:
-- 35389
-- 37367
-gi|229463033|sp|P23470.4|PTPRG_HUMAN:
-- 37367
-- 38871
-gi|281185496|sp|P49446.3|PTPRE_MOUSE:
-- 38871
-- 39618
-gi|131468|sp|P20417.1|PTN1_RAT:
-- 39618
-- 40089
-gi|462551|sp|Q05909.1|PTPRG_MOUSE:
-- 40089
-- 41587
-gi|3914485|sp|O13016.1|PTN1_CHICK:
-- 41587
-- 42063
-gi|47117342|sp|Q9W0G1.1|PTP61_DROME:
-- 42063
-- 42656
-gi|281312446|sp|B2GV87.1|PTPRE_RAT:
-- 56424
-- 57169
-gi|2507225|sp|P35821.2|PTN1_MOUSE:
-- 43401
-- 43875
-gi|317373518|sp|P23467.3|PTPRB_HUMAN:
-- 43875
-- 45939
-gi|218525908|sp|B0V2N1.1|PTPRS_MOUSE:
-- 578229
-- 580202
-gi|158564331|sp|Q64605.2|PTPRS_RAT:
-- 576258
-- 578229
-gi|317373519|sp|Q13332.3|PTPRS_HUMAN:
-- 49883
-- 51897
-gi|906468490|gb|KNC29487.1|:
-- 51897
-- 52152
-gi|465981191|gb|EMP35761.1|:
-- 52152
-- 52377
-gi|317373522|sp|Q05209.3|PTN12_HUMAN:
-- 53207
-- 54037
-gi|229485537|sp|P23471.4|PTPRZ_HUMAN:
-- 54037
-- 56424
-gi|576017789|sp|B9EKR1.1|PRPTZ_MOUSE:
-- 57169
-- 59553
-gi|521038373|gb|EPQ20150.1|:
-- 59553
-- 61000
-gi|281312445|sp|B2RU80.1|PTPRB_MOUSE:
-- 61000
-- 63065
-gi|209572663|sp|Q16827.2|PTPRO_HUMAN:
-- 63065
-- 64337
-gi|3183128|sp|Q62656.1|PTPRZ_RAT:
-- 64337
-- 66721
-gi|341942176|sp|P06800.3|PTPRC_MOUSE:
-- 80971
-- 82319
-gi|906469567|gb|KNC30293.1|:
-- 491100
-- 491178
-gi|281185486|sp|Q64455.2|PTPRJ_MOUSE:
-- 68147
-- 69441
-gi|341942175|sp|P18052.3|PTPRA_MOUSE:
-- 69441
-- 70320
-gi|906461245|gb|KNC23771.1|:
-- 70320
-- 72462
-gi|363805502|sp|E9Q612.1|PTPRO_MOUSE:
-- 72462
-- 73744
-gi|296452983|sp|Q9HD43.3|PTPRH_HUMAN:
-- 73744
-- 74913
-gi|906457728|gb|KNC21092.1|:
-- 74913
-- 76528
-gi|357529030|sp|P35233.2|PTN2_RAT:
-- 76985
-- 77442
-gi|464500|sp|P34138.1|PTP2_DICDI:
-- 77442
-- 77859
-gi|223590137|sp|P54830.2|PTN5_MOUSE:
-- 77859
-- 78445
-gi|45477181|sp|Q64512.2|PTN13_MOUSE:
-- 87495
-- 90021
-gi|57015396|sp|Q06180.2|PTN2_MOUSE:
-- 82319
-- 82767
-gi|166899088|sp|Q12913.3|PTPRJ_HUMAN:
-- 82767
-- 84162
-gi|20139861|sp|Q9Y2R2.2|PTN22_HUMAN:
-- 86238
-- 87094
-gi|808867478|gb|KKF18024.1|:
-- 85018
-- 86238
-gi|81897583|sp|Q8BUM3.1|PTN7_MOUSE:
-- 87094
-- 87495
-gi|20141721|sp|P35236.3|PTN7_HUMAN:
-- 90021
-- 90423
-gi|1346899|sp|P49445.1|PTN7_RAT:
-- 90423
-- 90821
-gi|148887349|sp|P04157.2|PTPRC_RAT:
-- 90821
-- 92149
-gi|3183134|sp|P70289.1|PTPRV_MOUSE:
-- 92149
-- 93915
-gi|906464405|gb|KNC26236.1|:
-- 93915
-- 94730
-gi|81882156|sp|O55082.1|PTN20_MOUSE:
-- 94730
-- 95200
-gi|317373540|sp|P54829.4|PTN5_HUMAN:
-- 95200
-- 95811
-gi|229891501|sp|B3DK56.1|PTPRU_DANRE:
-- 95811
-- 97314
-gi|906464463|gb|KNC26285.1|:
-- 97314
-- 98344
-gi|182636673|sp|A2ALK8.1|PTN3_MOUSE:
-- 98344
-- 99308
-gi|158563998|sp|Q9UMZ3.2|PTPRQ_HUMAN:
-- 99308
-- 101712
-gi|229462761|sp|P26045.2|PTN3_HUMAN:
-- 101712
-- 102676
-gi|229891502|sp|B1AUH1.1|PTPRU_MOUSE:
-- 116462
-- 117967
-gi|906461211|gb|KNC23740.1|:
-- 104181
-- 105925
-gi|85701215|sp|O35239.2|PTN9_MOUSE:
-- 105925
-- 106563
-gi|2499757|sp|Q64612.1|PTPRV_RAT:
-- 106563
-- 108333
-gi|121944218|sp|Q4JDL3.1|PTN20_HUMAN:
-- 120411
-- 120875
-gi|483518008|gb|EOB04364.1|:
-- 108797
-- 110205
-gi|906474906|gb|KNC34386.1|:
-- 110205
-- 111711
-gi|134039192|sp|Q15256.2|PTPRR_HUMAN:
-- 111711
-- 112416
-gi|158517792|sp|P0C5E4.1|PTPRQ_MOUSE:
-- 112416
-- 114787
-gi|25091040|sp|O08617.2|PTPRR_RAT:
-- 114787
-- 115488
-gi|131531|sp|P29074.1|PTN4_HUMAN:
-- 115488
-- 116462
-gi|6226890|sp|P28191.3|PTP1_CAEEL:
-- 117967
-- 119043
-gi|906457670|gb|KNC21059.1|:
-- 119043
-- 119708
-gi|25091053|sp|Q62132.1|PTPRR_MOUSE:
-- 119708
-- 120411
-gi|215273871|sp|Q99952.2|PTN18_HUMAN:
-- 127547
-- 128052
-gi|152031661|sp|P28192.3|PTP4_CAEEL:
-- 121380
-- 122593
-gi|161789002|sp|P54637.2|PTP3_DICDI:
-- 122593
-- 123635
-gi|906470825|gb|KNC31291.1|:
-- 123635
-- 124862
-gi|2811018|sp|O02695.1|PTPR2_MACNE:
-- 124862
-- 125926
-gi|161784320|sp|P34137.2|PTP1_DICDI:
-- 125926
-- 126493
-gi|341941769|sp|P80560.2|PTPR2_MOUSE:
-- 128052
-- 129106
-gi|341941773|sp|Q60673.2|PTPRN_MOUSE:
-- 129106
-- 130137
-gi|3183542|sp|Q63259.2|PTPRN_RAT:
-- 130137
-- 131169
-gi|2499754|sp|Q16849.1|PTPRN_HUMAN:
-- 131169
-- 132198
-gi|6225895|sp|P56722.1|PTPRN_BOVIN:
-- 132198
-- 133227
-gi|906457413|gb|KNC20876.1|:
-- 133227
-- 134608
-gi|2493262|sp|Q62728.1|PTN21_RAT:
-- 134608
-- 135834
-gi|906470416|gb|KNC30978.1|:
-- 135834
-- 136762
-gi|765680626|sp|H2KZM6.1|PTPR_CAEEL:
-- 136762
-- 138229
-gi|290457654|sp|Q16825.2|PTN21_HUMAN:
-- 138229
-- 139458
-gi|460018232|sp|Q62130.2|PTN14_MOUSE:
-- 141083
-- 142327
-gi|75279131|sp|O82656.1|PTP1_ARATH:
-- 140702
-- 141083
-gi|131684|sp|P27574.1|PYP1_SCHPO:
-- 142327
-- 142919
-gi|82018048|sp|Q5I146.1|PTPH2_MDBVW:
-- 142919
-- 143286
-gi|82018047|sp|Q5I145.1|PTPH3_MDBVW:
-- 143286
-- 143648
-gi|81929903|sp|Q5I141.1|PTPJ1_MDBVW:
-- 143648
-- 143990
-gi|417568|sp|P32587.1|PYP3_SCHPO:
-- 143990
-- 144332
-gi|906472195|gb|KNC32365.1|:
-- 144332
-- 146250
-gi|68052858|sp|O88902.2|PTN23_RAT:
-- 146250
-- 147806
-gi|68053318|sp|Q9H3S7.1|PTN23_HUMAN:
-- 147806
-- 149503
-gi|131557|sp|P25044.1|PTP1_YEAST:
-- 149503
-- 149877
-gi|131461|sp|P28206.1|PTP14_STYPL:
-- 149877
-- 150030
-gi|417567|sp|P32586.1|PYP2_SCHPO:
-- 150030
-- 150786
-gi|82018046|sp|Q5I143.1|PTPH4_MDBVW:
-- 150786
-- 151008
-gi|81929892|sp|Q5I128.1|PTPN1_MDBVW:
-- 151008
-- 151368
-gi|81929906|sp|Q5I147.1|PTPH1_MDBVW:
-- 151368
-- 151746
-gi|130226|sp|P10686.1|PLCG1_RAT:
-- 151746
-- 153088
-gi|906458404|gb|KNC21621.1|:
-- 153088
-- 154384
-gi|85700388|sp|Q62077.2|PLCG1_MOUSE:
-- 155742
-- 157100
-gi|266860|sp|P29461.1|PTP2_YEAST:
-- 157100
-- 157895
-gi|347595697|sp|P40048.2|PTP3_YEAST:
-- 157895
-- 158874
-gi|131457|sp|P28203.1|PTP11_STYPL:
-- 158874
-- 159025
-gi|81929904|sp|Q5I142.1|PTPH5_MDBVW:
-- 159025
-- 159327
-gi|81929900|sp|Q5I137.1|PTPJ4_MDBVW:
-- 159327
-- 159668
-gi|81929902|sp|Q5I139.1|PTPJ2_MDBVW:
-- 159668
-- 160007
-gi|215274231|sp|P16885.4|PLCG2_HUMAN:
-- 160007
-- 161329
-gi|131456|sp|P28202.1|PTP10_STYPL:
-- 161329
-- 161482
-gi|81878210|sp|Q8CIH5.1|PLCG2_MOUSE:
-- 161482
-- 162803
-gi|130230|sp|P24135.1|PLCG2_RAT:
-- 162803
-- 164120
-gi|131455|sp|P28201.1|PTP9_STYPL:
-- 164120
-- 164267
-gi|81929891|sp|Q5I127.1|PTPN2_MDBVW:
-- 164267
-- 164438
-gi|131464|sp|P28209.1|PTP17_STYPL:
-- 164438
-- 164587
-gi|131463|sp|P28208.1|PTP16_STYPL:
-- 164587
-- 164733
-gi|374110733|sp|F1N9Y5.2|KSYK_CHICK:
-- 164733
-- 165392
-gi|131460|sp|P28205.1|PTP13_STYPL:
-- 165392
-- 165543
-gi|56405033|sp|Q9QXT1.1|DAPP1_MOUSE:
-- 165543
-- 165864
-gi|131484|sp|P28219.1|PTP27_STYPL:
-- 165864
-- 166015
-gi|6226682|sp|P28199.2|PTP7_STYPL:
-- 166015
-- 166164
-gi|51317293|sp|Q9UN19.1|DAPP1_HUMAN:
-- 166164
-- 166485
-gi|131450|sp|P28196.1|PTP4_STYPL:
-- 166485
-- 166630
-gi|121742|sp|P09851.1|RASA1_BOVIN:
-- 166630
-- 167724
-gi|906462402|gb|KNC24677.1|:
-- 167724
-- 168686
-gi|906457804|gb|KNC21153.1|:
-- 168686
-- 168817
-gi|81882155|sp|O55033.1|NCK2_MOUSE:
-- 169239
-- 169661
-gi|1174436|sp|P42686.1|SRK1_SPOLA:
-- 169661
-- 170209
-gi|81929890|sp|Q5I124.1|PTPN3_MDBVW:
-- 170209
-- 170570
-gi|131479|sp|P28214.1|PTP22_STYPL:
-- 170570
-- 170722
-gi|131466|sp|P28211.1|PTP19_STYPL:
-- 170722
-- 170874
-gi|131458|sp|P28204.1|PTP12_STYPL:
-- 170874
-- 171016
-gi|906467507|gb|KNC28732.1|:
-- 171016
-- 171597
-gi|81880301|sp|Q99M51.1|NCK1_MOUSE:
-- 171597
-- 172016
-gi|347595653|sp|P09760.2|FER_RAT:
-- 180828
-- 181697
-gi|131480|sp|P28215.1|PTP23_STYPL:
-- 172885
-- 173037
-gi|131481|sp|P28216.1|PTP24_STYPL:
-- 173037
-- 173189
-gi|808878032|gb|KKF26336.1|:
-- 173189
-- 173353
-gi|81929901|sp|Q5I138.1|PTPJ3_MDBVW:
-- 173353
-- 173645
-gi|1711636|sp|P48025.2|KSYK_MOUSE:
-- 202369
-- 203042
-gi|906472772|gb|KNC32818.1|:
-- 174318
-- 174740
-gi|3219819|sp|Q64725.1|KSYK_RAT:
-- 174740
-- 175411
-gi|81889657|sp|Q5U2U2.1|CRKL_RAT:
-- 178490
-- 178832
-gi|131477|sp|P28212.1|PTP20_STYPL:
-- 175753
-- 175906
-gi|131478|sp|P28213.1|PTP21_STYPL:
-- 176248
-- 176400
-gi|1174439|sp|P42690.1|SRK4_SPOLA:
-- 176400
-- 176949
-gi|166217263|sp|Q7Z7G1.2|CLNK_HUMAN:
-- 176949
-- 177421
-gi|6685491|sp|O89100.1|GRAP2_MOUSE:
-- 187341
-- 187704
-gi|341940698|sp|P14234.2|FGR_MOUSE:
-- 177784
-- 178345
-gi|131452|sp|P28198.1|PTP6_STYPL:
-- 178345
-- 178490
-gi|59797886|sp|Q9CX99.1|GRAP_MOUSE:
-- 178832
-- 179089
-gi|75051669|sp|Q9TTY2.1|FER_CANFA:
-- 179089
-- 179959
-gi|125717|sp|P17713.1|STK_HYDVU:
-- 181697
-- 182247
-gi|131465|sp|P28210.1|PTP18_STYPL:
-- 182247
-- 182399
-gi|344244326|gb|EGW00430.1|:
-- 182399
-- 182755
-gi|125869|sp|P09324.3|YES_CHICK:
-- 182755
-- 183337
-gi|118582158|sp|Q4JIM5.1|ABL2_MOUSE:
-- 183337
-- 184573
-gi|2507209|sp|Q07014.3|LYN_RAT:
-- 184573
-- 185125
-gi|2507208|sp|P25911.4|LYN_MOUSE:
-- 185125
-- 185679
-gi|85681908|sp|P00519.4|ABL1_HUMAN:
-- 191887
-- 193070
-gi|125134|sp|P10447.1|ABL_FSVHY:
-- 186862
-- 187341
-gi|118572253|sp|Q0VBZ0.1|CSK_BOVIN:
-- 187704
-- 188197
-gi|229836106|sp|Q01621.3|LCK_RAT:
-- 241090
-- 241641
-gi|357580556|sp|F1LM93.1|YES_RAT:
-- 200601
-- 201184
-gi|341940406|sp|P41241.2|CSK_MOUSE:
-- 189331
-- 189824
-gi|131447|sp|P28193.1|PTP1_STYPL:
-- 191590
-- 191733
-gi|131482|sp|P28217.1|PTP25_STYPL:
-- 191733
-- 191887
-gi|62512130|sp|P00522.3|ABL_DROME:
-- 193070
-- 194749
-gi|125871|sp|P10936.3|YES_XENLA:
-- 194749
-- 195327
-gi|3025159|sp|Q28923.3|YES_CANFA:
-- 195327
-- 195908
-gi|1351818|sp|P00527.2|YES_AVISY:
-- 195908
-- 196478
-gi|2498425|sp|Q60631.1|GRB2_MOUSE:
-- 196478
-- 196734
-gi|51702260|sp|P62994.1|GRB2_RAT:
-- 196734
-- 196989
-gi|444722121|gb|ELW62824.1|:
-- 196989
-- 197181
-gi|125354|sp|P00543.1|FES_FSVST:
-- 197181
-- 197698
-gi|906461206|gb|KNC23735.1|:
-- 197698
-- 199083
-gi|417209|sp|P32577.1|CSK_RAT:
-- 199083
-- 199571
-gi|444722122|gb|ELW62825.1|:
-- 199571
-- 200331
-gi|85700420|sp|P87379.2|GRB2A_XENLA:
-- 200331
-- 200601
-gi|75070228|sp|Q5ICW4.1|GRB14_BOVIN:
-- 210217
-- 210802
-gi|82236546|sp|Q6GPJ9.1|GRB2B_XENLA:
-- 201769
-- 202039
-gi|82234424|sp|Q66II3.1|GRB2_XENTR:
-- 202039
-- 202337
-'':
-- 336393
-- 336395
-Empty:
-- 336372
-- 336393
-gi|729886|sp|P41239.1|CSK_CHICK:
-- 203042
-- 203532
-gi|78099784|sp|P06240.4|LCK_MOUSE:
-- 204083
-- 204635
-gi|729368|sp|Q08012.1|DRK_DROME:
-- 204635
-- 204883
-gi|729890|sp|P41243.1|MATK_RAT:
-- 204883
-- 205389
-gi|23503051|sp|O14796.2|SH21B_HUMAN:
-- 205389
-- 205560
-gi|521033436|gb|EPQ15221.1|:
-- 205560
-- 206132
-gi|20138358|sp|Q9JLM9.1|GRB14_MOUSE:
-- 206132
-- 206715
-gi|1169123|sp|P42679.1|MATK_HUMAN:
-- 206715
-- 207265
-gi|403377901|sp|A1A5H8.1|YES_DANRE:
-- 207265
-- 207855
-gi|81885281|sp|Q6P6U0.1|FGR_RAT:
-- 207855
-- 208413
-gi|81892845|sp|Q6S5L9.1|SHC4_MOUSE:
-- 216856
-- 217527
-gi|125357|sp|P00544.1|FGR_FSVGR:
-- 209084
-- 209670
-gi|20138127|sp|Q95M30.3|HCK_MACFA:
-- 209670
-- 210217
-gi|81884570|sp|Q6AYC8.1|SH24A_RAT:
-- 250317
-- 250781
-gi|42558855|sp|Q8JH64.1|BTK_CHICK:
-- 211266
-- 211968
-gi|116242503|sp|Q14451.2|GRB7_HUMAN:
-- 211968
-- 212545
-gi|81861707|sp|P97573.1|SHIP1_RAT:
-- 212545
-- 213787
-gi|182676455|sp|P29353.4|SHC1_HUMAN:
-- 221667
-- 222296
-gi|81883074|sp|Q5M824.1|SHC1_RAT:
-- 214416
-- 214926
-gi|48474721|sp|O70143.1|SHC3_RAT:
-- 214926
-- 215563
-gi|143018072|sp|A1Y2K1.2|FYN_PIG:
-- 218687
-- 219266
-gi|906457964|gb|KNC21286.1|:
-- 216142
-- 216856
-gi|476007846|sp|P39688.4|FYN_MOUSE:
-- 217527
-- 218108
-gi|462444|sp|Q05876.2|FYN_CHICK:
-- 219266
-- 219841
-gi|143018052|sp|A0JNB0.1|FYN_BOVIN:
-- 219841
-- 220422
-gi|341940633|sp|P16277.4|BLK_MOUSE:
-- 220422
-- 220965
-gi|131483|sp|P28218.1|PTP26_STYPL:
-- 220965
-- 221119
-gi|1345852|sp|P41242.2|MATK_MOUSE:
-- 221119
-- 221667
-gi|110278994|sp|Q1RMW5.1|GRB7_BOVIN:
-- 222296
-- 222873
-gi|158564077|sp|Q92835.2|SHIP1_HUMAN:
-- 242660
-- 243904
-gi|351715558|gb|EHB18477.1|:
-- 224668
-- 225527
-gi|75066598|sp|Q95KR7.3|LCK_SAISC:
-- 225527
-- 226079
-gi|131449|sp|P28195.1|PTP3_STYPL:
-- 226079
-- 226225
-gi|906466032|gb|KNC27562.1|:
-- 226225
-- 227270
-gi|125366|sp|P00541.1|FPS_AVISP:
-- 227270
-- 227844
-gi|134425|sp|P29355.1|SEM5_CAEEL:
-- 227844
-- 228110
-gi|48474922|sp|Q92529.1|SHC3_HUMAN:
-- 228110
-- 228749
-gi|1174437|sp|P42688.1|SRK2_SPOLA:
-- 228749
-- 229152
-gi|906459480|gb|KNC22458.1|:
-- 229152
-- 231301
-gi|75054883|sp|Q5R7W7.1|SHC1_PONAB:
-- 231301
-- 231929
-gi|729629|sp|Q07883.1|GRB2_CHICK:
-- 231929
-- 232184
-gi|81882040|sp|Q9QZC5.1|GRB7_RAT:
-- 232184
-- 232761
-gi|125358|sp|P09769.2|FGR_HUMAN:
-- 232761
-- 233331
-gi|266436|sp|Q00655.1|KSYK_PIG:
-- 233331
-- 234000
-gi|6016156|sp|O88900.1|GRB14_RAT:
-- 234000
-- 234580
-gi|808883886|gb|KKF30947.1|:
-- 234580
-- 235186
-gi|182691592|sp|Q8AY68.2|SHC1_XENLA:
-- 235186
-- 235695
-gi|808879642|gb|KKF27641.1|:
-- 235695
-- 236233
-gi|808876883|gb|KKF25472.1|:
-- 236233
-- 236826
-gi|212287930|sp|P52735.2|VAV2_HUMAN:
-- 236826
-- 237754
-gi|131448|sp|P28194.1|PTP2_STYPL:
-- 237754
-- 237917
-gi|403399386|sp|F1RDG9.1|FYNB_DANRE:
-- 237917
-- 238506
-gi|341942028|sp|Q61120.2|SHC3_MOUSE:
-- 238506
-- 239024
-gi|6016154|sp|Q03160.1|GRB7_MOUSE:
-- 239024
-- 239602
-gi|1169095|sp|Q04929.1|CRK_CHICK:
-- 239602
-- 239946
-gi|125371|sp|P13406.3|FYN_XENLA:
-- 239946
-- 240524
-gi|122065200|sp|P50545.4|HCK_RAT:
-- 240524
-- 241090
-gi|3023561|sp|P87378.1|CRK_XENLA:
-- 241641
-- 241976
-gi|2842661|sp|Q63768.1|CRK_RAT:
-- 241976
-- 242317
-gi|2842663|sp|Q64010.1|CRK_MOUSE:
-- 242317
-- 242660
-gi|158939322|sp|P46108.2|CRK_HUMAN:
-- 243904
-- 244249
-gi|81870551|sp|O88834.1|SHD_MOUSE:
-- 244249
-- 244632
-gi|1708331|sp|P53356.1|HTK16_HYDVU:
-- 244632
-- 245436
-gi|131451|sp|P28197.1|PTP5_STYPL:
-- 245436
-- 245580
-gi|449277313|gb|EMC85539.1|:
-- 245580
-- 245811
-gi|906459117|gb|KNC22188.1|:
-- 245811
-- 246158
-gi|403399475|sp|Q6EWH2.2|FYNA_DANRE:
-- 246158
-- 246740
-gi|462471|sp|Q02977.2|YRK_CHICK:
-- 246740
-- 247317
-gi|82178338|sp|Q56A36.1|HSH2D_DANRE:
-- 247317
-- 247725
-gi|81872756|sp|Q9QZE2.1|CLNK_MOUSE:
-- 247725
-- 248203
-gi|14547917|sp|O35324.1|SH21B_MOUSE:
-- 248203
-- 248374
-gi|148225278|ref|NP_001083668.1|:
-- 248374
-- 249442
-gi|91208329|sp|Q58DL5.2|BCAR3_BOVIN:
-- 249442
-- 250317
-gi|81881569|sp|Q9D7V1.1|SH24A_MOUSE:
-- 250781
-- 251246
-gi|729903|sp|Q03526.1|ITK_MOUSE:
-- 251246
-- 251913
-gi|20143987|sp|Q9QXK9.1|SH22A_MOUSE:
-- 251913
-- 252330
-gi|30173326|sp|Q8R4L0.3|SLAP2_MOUSE:
-- 252330
-- 252630
-gi|27808642|sp|P03949.4|ABL1_CAEEL:
-- 252630
-- 253908
-gi|123884463|sp|Q08CX2.1|SH24A_XENTR:
-- 253908
-- 254406
-gi|2494862|sp|Q60992.1|VAV2_MOUSE:
-- 254406
-- 255322
-gi|51338829|sp|Q9R0C8.2|VAV3_MOUSE:
-- 255322
-- 256218
-gi|906466567|gb|KNC27983.1|:
-- 256218
-- 257105
-gi|30173237|sp|Q13239.3|SLAP1_HUMAN:
-- 257105
-- 257422
-gi|906466285|gb|KNC27742.1|:
-- 257422
-- 257505
-gi|55583959|sp|Q8STF6.1|DYC1_CAEEL:
-- 257505
-- 258441
-gi|341940559|sp|Q9D3A8.3|CAPON_MOUSE:
-- 259536
-- 260085
-gi|57012629|sp|O54960.1|CAPON_RAT:
-- 258990
-- 259536
-gi|906463280|gb|KNC25380.1|:
-- 260085
-- 260415
-gi|81883264|sp|Q5PQS4.1|GULP1_RAT:
-- 261448
-- 261792
-gi|123907782|sp|Q32PV0.1|GULP1_DANRE:
-- 260759
-- 261102
-gi|81878506|sp|Q8K2A1.1|GULP1_MOUSE:
-- 261102
-- 261448
-gi|341940592|sp|Q8C142.3|ARH_MOUSE:
-- 261792
-- 262141
-gi|73921716|sp|Q801G1.1|ARHA_XENLA:
-- 262141
-- 262491
-gi|906471269|gb|KNC31652.1|:
-- 262491
-- 262713
-gi|906462497|gb|KNC24742.1|:
-- 262713
-- 265716
-gi|906475064|gb|KNC34509.1|:
-- 265716
-- 266539
-gi|182627486|sp|P0C6S7.1|ANS1B_RAT:
-- 266539
-- 267853
-gi|332278155|sp|Q7Z6G8.2|ANS1B_HUMAN:
-- 267853
-- 269157
-gi|182627485|sp|A5PMU4.1|ANS1B_DANRE:
-- 269157
-- 270494
-gi|122003631|sp|Q2VQM5.1|VIT3_SOLIN:
-- 270494
-- 272318
-gi|122111208|sp|Q2VQM6.1|VIT2_SOLIN:
-- 272318
-- 274188
-gi|74841764|sp|Q868N5.1|VIT_APIME:
-- 274188
-- 276019
-gi|332020519|gb|EGI60934.1|:
-- 276019
-- 277720
-gi|307208884|gb|EFN86099.1|:
-- 277720
-- 279885
-gi|205831146|sp|Q16927.2|VIT1_AEDAE:
-- 279885
-- 282122
-gi|48428690|sp|Q9U8M0.1|VIT1_PERAM:
-- 282122
-- 284082
-gi|48428677|sp|Q9BPS0.1|VIT2_PERAM:
-- 284082
-- 286021
-gi|3123008|sp|Q27309.1|VIT_BOMMO:
-- 286021
-- 287863
-gi|205831148|sp|P05690.5|VIT2_CAEEL:
-- 287863
-- 289537
-gi|29429171|sp|P18947.3|VIT4_CAEEL:
-- 289537
-- 291199
-gi|205831147|sp|P06125.2|VIT5_CAEEL:
-- 291199
-- 292862
-gi|906468899|gb|KNC29817.1|:
-- 292862
-- 294355
-gi|29428264|sp|Q9N4J2.1|VIT3_CAEEL:
-- 294355
-- 296017
-gi|114152908|sp|P18948.5|VIT6_CAEEL:
-- 296017
-- 297729
-gi|3123014|sp|P87498.1|VIT1_CHICK:
-- 297729
-- 299704
-gi|808857525|gb|KKF10086.1|:
-- 299704
-- 301038
-gi|677153074|gb|KFP42277.1|:
-- 301038
-- 302924
-gi|332023797|gb|EGI64021.1|:
-- 302924
-- 304392
-gi|30315944|sp|Q9BYN0.2|SRXN1_HUMAN:
-- 304392
-- 304568
-gi|906460032|gb|KNC22884.1|:
-- 304568
-- 304750
-gi|30315946|sp|Q9D975.1|SRXN1_MOUSE:
-- 304750
-- 304925
-gi|74996974|sp|Q54RQ8.1|LVSE_DICDI:
-- 304925
-- 307185
-gi|12230842|sp|Q9URV9.1|SRX1_SCHPO:
-- 307185
-- 307347
-gi|549702|sp|P36077.1|SRX1_YEAST:
-- 307347
-- 307510
-gi|75151385|sp|Q8GY89.1|SRX_ARATH:
-- 307510
-- 307672
-gi|906464414|gb|KNC26245.1|:
-- 307672
-- 308608
-gi|71153051|sp|Q5SPL2.1|PHF12_MOUSE:
-- 308608
-- 309663
-gi|1175370|sp|Q09698.1|YA27_SCHPO:
-- 309663
-- 310314
-gi|2497139|sp|Q04779.1|RCO1_YEAST:
-- 310314
-- 311043
-gi|808860593|gb|KKF12575.1|:
-- 361114
-- 362236
-gi|311033360|sp|Q14839.2|CHD4_HUMAN:
-- 312165
-- 314142
-gi|51701319|sp|Q6PDQ2.1|CHD4_MOUSE:
-- 314142
-- 316121
-gi|405967495|gb|EKC32649.1|:
-- 362236
-- 362871
-gi|342187123|sp|Q924W6.3|TRI66_MOUSE:
-- 386934
-- 388232
-gi|657340920|sp|A2A8L1.1|CHD5_MOUSE:
-- 318054
-- 320065
-gi|657340922|sp|D3ZD32.1|CHD5_RAT:
-- 320065
-- 322076
-gi|51701343|sp|Q8TDI0.1|CHD5_HUMAN:
-- 322076
-- 324094
-gi|1175494|sp|Q09819.1|YAC5_SCHPO:
-- 324094
-- 324539
-gi|269849740|sp|O15016.4|TRI66_HUMAN:
-- 388232
-- 389504
-gi|88911273|sp|Q12873.3|CHD3_HUMAN:
-- 325811
-- 327876
-gi|465981935|gb|EMP35995.1|:
-- 358923
-- 360005
-gi|13124018|sp|O97159.2|CHDM_DROME:
-- 328958
-- 331005
-gi|313104270|sp|Q9UPN9.3|TRI33_HUMAN:
-- 356936
-- 358118
-gi|906465395|gb|KNC27055.1|:
-- 358118
-- 358923
-gi|82085579|sp|Q6E2N3.1|TRI33_DANRE:
-- 355719
-- 356936
-gi|3334119|sp|O43918.1|AIRE_HUMAN:
-- 334209
-- 334797
-gi|22256596|sp|Q9Z0E3.1|AIRE_MOUSE:
-- 334797
-- 335393
-gi|25089877|sp|O16102.3|CHD3_DROME:
-- 335393
-- 336363
-gi|704000318|sp|F4KBP5.1|CHR4_ARATH:
-- 336395
-- 338687
-gi|68565655|sp|O88491.1|NSD1_MOUSE:
-- 338687
-- 341348
-gi|32469769|sp|Q96L73.1|NSD1_HUMAN:
-- 341348
-- 344119
-gi|378405242|sp|Q9H930.3|SP14L_HUMAN:
-- 344119
-- 344746
-gi|906466623|gb|KNC28024.1|:
-- 344746
-- 347510
-gi|218511671|sp|Q13342.2|SP140_HUMAN:
-- 347510
-- 348428
-gi|90167365|sp|Q6ZPK0.2|PF21A_MOUSE:
-- 350982
-- 351688
-gi|6165993|sp|Q22516.2|CHD3_CAEEL:
-- 349134
-- 350982
-gi|215275613|sp|A6H619.2|PHRF1_MOUSE:
-- 351688
-- 353433
-gi|906459276|gb|KNC22303.1|:
-- 353433
-- 354514
-gi|906465746|gb|KNC27338.1|:
-- 354514
-- 355719
-gi|906460303|gb|KNC23094.1|:
-- 360005
-- 361114
-gi|90110721|sp|Q9H8W5.2|TRI45_HUMAN:
-- 362871
-- 363497
-gi|215273906|sp|O75382.2|TRIM3_HUMAN:
-- 364290
-- 365083
-gi|21362968|sp|O70277.1|TRIM3_RAT:
-- 365083
-- 365873
-gi|75060703|sp|Q5BIM1.1|TRI45_BOVIN:
-- 365873
-- 366499
-gi|353558884|sp|A4IF63.1|TRIM2_BOVIN:
-- 366499
-- 367292
-gi|21363034|sp|Q9C040.1|TRIM2_HUMAN:
-- 367292
-- 368084
-gi|353558883|sp|D2GXS7.1|TRIM2_AILME:
-- 368084
-- 368877
-gi|353558885|sp|F7H9X2.1|TRIM2_CALJA:
-- 368877
-- 369670
-gi|21363036|sp|Q9ESN6.1|TRIM2_MOUSE:
-- 369670
-- 370462
-gi|353558899|sp|D3ZQG6.2|TRIM2_RAT:
-- 370462
-- 371253
-gi|425938104|sp|E1BJS7.2|LIN41_BOVIN:
-- 373982
-- 374901
-gi|123778901|sp|Q1PSW8.1|LIN41_MOUSE:
-- 372172
-- 373078
-gi|425936252|sp|D3ZVM4.1|LIN41_RAT:
-- 373078
-- 373982
-gi|425936244|sp|E7FAM5.1|LIN41_DANRE:
-- 374901
-- 375775
-gi|123889648|sp|Q1PRL4.1|LIN41_CHICK:
-- 375775
-- 376702
-gi|221222481|sp|O08629.2|TIF1B_RAT:
-- 379332
-- 380215
-gi|425936264|sp|F6QEU4.1|LIN41_XENTR:
-- 377585
-- 378449
-gi|56749780|sp|Q80VI1.1|TRI56_MOUSE:
-- 380215
-- 380997
-gi|906467098|gb|KNC28391.1|:
-- 380997
-- 381834
-gi|322967632|sp|E1BD59.1|TRI56_BOVIN:
-- 381834
-- 382615
-gi|75025863|sp|Q9U489.1|LIN41_CAEEL:
-- 382615
-- 383816
-gi|56749788|sp|Q9BRZ2.3|TRI56_HUMAN:
-- 383816
-- 384619
-gi|906460823|gb|KNC23462.1|:
-- 384619
-- 386258
-gi|902763224|ref|NP_001298017.1|:
-- 398075
-- 398751
-gi|33516964|sp|Q9C026.1|TRIM9_HUMAN:
-- 389504
-- 390262
-gi|906457994|gb|KNC21313.1|:
-- 390262
-- 390612
-gi|33516959|sp|Q8C7M3.2|TRIM9_MOUSE:
-- 390612
-- 391478
-gi|906462563|gb|KNC24795.1|:
-- 391478
-- 392068
-gi|22653809|sp|P82458.1|TRI18_RAT:
-- 392068
-- 392780
-gi|342187073|sp|O70583.2|TRI18_MOUSE:
-- 393508
-- 394236
-gi|344241726|gb|EGV97829.1|:
-- 394236
-- 394942
-gi|56404869|sp|Q80WG7.2|TRI36_MOUSE:
-- 394942
-- 395719
-gi|313104034|sp|Q9NQ86.2|TRI36_HUMAN:
-- 395719
-- 396496
-gi|55976496|sp|Q7Z4K8.2|TRI46_HUMAN:
-- 396496
-- 397303
-gi|342187075|sp|Q9D2H5.2|TRI42_MOUSE:
-- 397303
-- 398075
-gi|62510692|sp|Q8N475.2|FSTL5_HUMAN:
-- 398751
-- 399648
-gi|62510690|sp|Q8BFR2.1|FSTL5_MOUSE:
-- 399648
-- 400545
-gi|81910115|sp|Q5STE3.1|FSTL4_MOUSE:
-- 400545
-- 401436
-gi|296439344|sp|Q6MZW2.3|FSTL4_HUMAN:
-- 401436
-- 402329
-gi|172044151|sp|A4IGL7.1|PXDN_XENTR:
-- 402329
-- 403844
-gi|263505330|sp|B4HNW4.1|PTK7_DROSE:
-- 403844
-- 404925
-gi|263505311|sp|B4GBH0.1|PTK7_DROPE:
-- 404925
-- 406012
-gi|263506283|sp|Q290N5.2|PTK7_DROPS:
-- 409267
-- 410356
-gi|263505338|sp|B4QC63.1|PTK7_DROSI:
-- 407101
-- 408182
-gi|263505289|sp|B3NS99.1|PTK7_DROER:
-- 408182
-- 409267
-gi|341941778|sp|Q3UQ28.2|PXDN_MOUSE:
-- 410356
-- 411890
-gi|263505352|sp|B4P5Q9.1|PTK7_DROYA:
-- 411890
-- 412975
-gi|906468961|gb|KNC29858.1|:
-- 412975
-- 414407
-gi|906460756|gb|KNC23398.1|:
-- 414407
-- 415482
-gi|263505280|sp|B3MH43.1|PTK7_DROAN:
-- 415482
-- 416571
-gi|906473767|gb|KNC33506.1|:
-- 416571
-- 417132
-gi|906466043|gb|KNC27570.1|:
-- 417132
-- 417451
-gi|263505344|sp|B4MR28.1|PTK7_DROWI:
-- 417451
-- 418563
-gi|341940916|sp|P70193.2|LRIG1_MOUSE:
-- 418563
-- 419708
-gi|81917365|sp|Q9EQS9.1|IGDC4_MOUSE:
-- 471273
-- 472580
-gi|143811415|sp|Q96JA1.2|LRIG1_HUMAN:
-- 421015
-- 422162
-gi|123910301|sp|Q2EY14.1|PRTGA_DANRE:
-- 422162
-- 423366
-gi|906463208|gb|KNC25324.1|:
-- 423366
-- 423953
-gi|906459901|gb|KNC22782.1|:
-- 423953
-- 424213
-gi|906463782|gb|KNC25773.1|:
-- 424213
-- 424594
-gi|906473409|gb|KNC33305.1|:
-- 424594
-- 426104
-gi|483522079|gb|EOB06937.1|:
-- 426104
-- 427211
-gi|49036483|sp|Q7TPD3.2|ROBO2_MOUSE:
-- 427211
-- 428739
-gi|317373412|sp|Q9NR99.3|MXRA5_HUMAN:
-- 428739
-- 431646
-gi|121946850|sp|Q2VWP7.1|PRTG_HUMAN:
-- 431646
-- 432850
-gi|82242600|sp|Q8AV58.1|SDK1_CHICK:
-- 432850
-- 435086
-gi|123782913|sp|Q2EY15.1|PRTG_MOUSE:
-- 435086
-- 436332
-gi|123789592|sp|Q2VWP9.1|PRTG_RAT:
-- 436332
-- 437578
-gi|906463409|gb|KNC25486.1|:
-- 437578
-- 438526
-gi|49036500|sp|Q9Y6N7.1|ROBO1_HUMAN:
-- 438526
-- 440238
-gi|2851523|sp|P13590.3|NCAM1_CHICK:
-- 440238
-- 441381
-gi|667467107|sp|B8VIW9.1|FP_ACRMI:
-- 441381
-- 442715
-gi|906468489|gb|KNC29486.1|:
-- 442715
-- 443099
-gi|156633664|sp|A2AAJ9.2|OBSCN_MOUSE:
-- 443099
-- 452156
-gi|906467383|gb|KNC28615.1|:
-- 452156
-- 453486
-gi|906471327|gb|KNC31690.1|:
-- 453486
-- 458806
-gi|906474803|gb|KNC34291.1|:
-- 458806
-- 459638
-gi|906468766|gb|KNC29713.1|:
-- 459638
-- 461196
-gi|399092|sp|Q02246.1|CNTN2_HUMAN:
-- 461196
-- 462286
-gi|37537817|sp|Q90478.1|L1CA1_DANRE:
-- 462286
-- 463538
-gi|55976223|sp|O94779.2|CNTN5_HUMAN:
-- 463538
-- 464691
-gi|49036492|sp|Q96MS0.2|ROBO3_HUMAN:
-- 464691
-- 466134
-gi|147646538|sp|Q3V1M1.2|IGS10_MOUSE:
-- 483872
-- 486542
-gi|906466620|gb|KNC28021.1|:
-- 468804
-- 469319
-gi|51704323|sp|Q61330.2|CNTN2_MOUSE:
-- 469319
-- 470411
-gi|56749657|sp|Q8BQC3.1|IGDC3_MOUSE:
-- 470411
-- 471273
-gi|408360048|sp|P70211.2|DCC_MOUSE:
-- 472580
-- 474084
-gi|81872103|sp|Q63155.2|DCC_RAT:
-- 474084
-- 475583
-gi|114736|sp|P22063.1|CNTN2_RAT:
-- 475583
-- 476671
-gi|158706512|sp|Q9UPX0.2|TUTLB_HUMAN:
-- 476671
-- 478078
-gi|296452965|sp|Q7Z5N4.3|SDK1_HUMAN:
-- 478078
-- 480360
-gi|808881895|gb|KKF29386.1|:
-- 480360
-- 481627
-gi|90183174|sp|Q8AV57.2|SDK2_CHICK:
-- 481627
-- 483872
-gi|11559953|ref|NP_071524.1|:
-- 486542
-- 488247
-gi|205830664|sp|O15394.2|NCAM2_HUMAN:
-- 488247
-- 489134
-gi|296434537|sp|Q8IVU1.2|IGDC3_HUMAN:
-- 489134
-- 489998
-gi|808866894|gb|KKF17525.1|:
-- 489998
-- 491100
-gi|906457537|gb|KNC20964.1|:
-- 491178
-- 491964
-gi|296434474|sp|P43146.2|DCC_HUMAN:
-- 491964
-- 493468
-gi|906471108|gb|KNC31505.1|:
-- 493468
-- 494483
-gi|116242736|sp|Q13308.2|PTK7_HUMAN:
-- 494483
-- 495606
-gi|906464939|gb|KNC26676.1|:
-- 495606
-- 497242
-gi|55976559|sp|Q90W79.1|CNTN5_CHICK:
-- 497242
-- 498321
-gi|81913306|sp|Q8BKG3.1|PTK7_MOUSE:
-- 498321
-- 499435
-gi|115558|sp|P11627.1|L1CAM_MOUSE:
-- 499435
-- 500748
-gi|55976372|sp|Q69Z26.2|CNTN4_MOUSE:
-- 500748
-- 501826
-gi|49036501|sp|Q9Z2I4.2|ROBO3_MOUSE:
-- 501826
-- 503249
-gi|55976164|sp|Q62845.1|CNTN4_RAT:
-- 503249
-- 504325
-gi|298286789|sp|Q8BLI0.2|ATL1_MOUSE:
-- 504325
-- 506132
-gi|808870997|gb|KKF20767.1|:
-- 506132
-- 507360
-gi|215274225|sp|Q5VST9.3|OBSCN_HUMAN:
-- 507360
-- 515480
-gi|127859|sp|P13596.1|NCAM1_RAT:
-- 515480
-- 516384
-gi|808885142|gb|KKF31986.1|:
-- 516384
-- 518325
-gi|81893041|sp|Q6V4S5.1|SDK2_MOUSE:
-- 518325
-- 520569
-gi|341941513|sp|Q9EPX2.2|PPN_MOUSE:
-- 520569
-- 521904
-gi|405973098|gb|EKC37830.1|:
-- 521904
-- 522030
-gi|449061888|sp|G5EBF1.1|SAX3_CAEEL:
-- 522030
-- 523359
-gi|906472632|gb|KNC32725.1|:
-- 523359
-- 527527
-gi|1705571|sp|P32004.2|L1CAM_HUMAN:
-- 527527
-- 528838
-gi|906465144|gb|KNC26850.1|:
-- 528838
-- 529204
-gi|20455467|sp|Q05695.3|L1CAM_RAT:
-- 529204
-- 530516
-gi|808877130|gb|KKF25681.1|:
-- 530516
-- 532008
-gi|1172451|sp|Q05793.1|PGBM_MOUSE:
-- 532008
-- 535803
-gi|906473164|gb|KNC33128.1|:
-- 535803
-- 537289
-gi|300669714|sp|Q15746.4|MYLK_HUMAN:
-- 580202
-- 582181
-gi|317373515|sp|A1KZ92.3|PXDNL_HUMAN:
-- 539268
-- 540790
-gi|906457269|gb|KNC20749.1|:
-- 540790
-- 542343
-gi|906460528|gb|KNC23240.1|:
-- 542343
-- 544725
-gi|205830666|sp|P13595.3|NCAM1_MOUSE:
-- 544725
-- 545894
-gi|10720133|sp|P97798.1|NEO1_MOUSE:
-- 545894
-- 547445
-gi|148225590|ref|NP_001081298.1|:
-- 547445
-- 548587
-gi|73620825|sp|Q8TD84.2|DSCL1_HUMAN:
-- 548587
-- 550707
-gi|906474950|gb|KNC34407.1|:
-- 550707
-- 551717
-gi|55976161|sp|P97527.1|CNTN5_RAT:
-- 551717
-- 552867
-gi|341940370|sp|P68500.2|CNTN5_MOUSE:
-- 552867
-- 554019
-gi|296439395|sp|Q9P232.3|CNTN3_HUMAN:
-- 554019
-- 555100
-gi|73621175|sp|Q52KR2.1|LRIG2_MOUSE:
-- 555100
-- 556207
-gi|82105132|sp|Q8QHL3.1|VGFR1_CHICK:
-- 556207
-- 557590
-gi|81917376|sp|Q9ERC8.1|DSCAM_MOUSE:
-- 557590
-- 559669
-gi|116242676|sp|Q92859.2|NEO1_HUMAN:
-- 559669
-- 561188
-gi|81916020|sp|Q8VHZ8.1|DSCAM_RAT:
-- 561188
-- 563265
-gi|55976163|sp|Q62682.1|CNTN3_RAT:
-- 563265
-- 564343
-gi|10720132|sp|P97603.1|NEO1_RAT:
-- 564343
-- 565774
-gi|292630781|sp|Q4VA61.2|DSCL1_MOUSE:
-- 565774
-- 567895
-gi|49036485|sp|Q8C310.2|ROBO4_MOUSE:
-- 567895
-- 568959
-gi|55976529|sp|Q8IWV2.1|CNTN4_HUMAN:
-- 568959
-- 570037
-gi|122119348|sp|Q1ENI8.1|PXDN_CAEEL:
-- 570037
-- 571378
-gi|31077126|ref|NP_852040.1|:
-- 571378
-- 572383
-gi|808863893|gb|KKF15123.1|:
-- 572383
-- 573923
-gi|205830665|sp|P13591.3|NCAM1_HUMAN:
-- 573923
-- 574832
-gi|38372283|sp|O42414.1|NFASC_CHICK:
-- 574832
-- 576258
-gi|341941987|sp|Q9Z139.2|ROR1_MOUSE:
-- 582181
-- 583169
-gi|158706515|sp|Q9P2J2.2|TUTLA_HUMAN:
-- 583169
-- 584403
-gi|906460488|gb|KNC23211.1|:
-- 584403
-- 585241
-gi|12643619|sp|O60469.2|DSCAM_HUMAN:
-- 585241
-- 587319
-gi|906475427|gb|KNC34801.1|:
-- 587319
-- 587693
-gi|54020938|ref|NP_001005713.1|:
-- 587693
-- 588166
-gi|808871835|gb|KKF21413.1|:
-- 588166
-- 589027
-gi|215274127|sp|Q92823.3|NRCAM_HUMAN:
-- 620534
-- 621895
-gi|808880457|gb|KKF28306.1|:
-- 590388
-- 591687
-gi|38372295|sp|Q810U3.1|NFASC_MOUSE:
-- 591687
-- 592982
-gi|148237004|ref|NP_001081296.1|:
-- 592982
-- 594120
-gi|808881011|gb|KKF28708.1|:
-- 594120
-- 595177
-gi|2851396|sp|P11799.2|MYLK_CHICK:
-- 595177
-- 597146
-gi|408360027|sp|Q07409.2|CNTN3_MOUSE:
-- 597146
-- 598227
-gi|38372259|sp|P97685.2|NFASC_RAT:
-- 598227
-- 599520
-gi|116917|sp|P14781.1|CNTN1_CHICK:
-- 599520
-- 600580
-gi|83304988|sp|O94856.4|NFASC_HUMAN:
-- 600580
-- 601984
-gi|408360031|sp|P70232.2|NCHL1_MOUSE:
-- 601984
-- 603249
-gi|2497301|sp|Q12860.1|CNTN1_HUMAN:
-- 603249
-- 604318
-gi|118572711|sp|Q01973.2|ROR1_HUMAN:
-- 604318
-- 605306
-gi|906468149|gb|KNC29207.1|:
-- 605306
-- 607267
-gi|483512179|gb|EOB00737.1|:
-- 607267
-- 607765
-gi|906473029|gb|KNC33020.1|:
-- 607765
-- 608144
-gi|116918|sp|P12960.1|CNTN1_MOUSE:
-- 608144
-- 609214
-gi|906474628|gb|KNC34156.1|:
-- 609214
-- 614111
-gi|677995372|sp|D3YYU8.1|OBSL1_MOUSE:
-- 614111
-- 615979
-gi|158706405|sp|P0C5H6.1|TUTLA_RAT:
-- 615979
-- 617211
-gi|1171701|sp|Q03696.2|NGCA_CHICK:
-- 617211
-- 618531
-gi|55976622|sp|Q9UQ52.1|CNTN6_HUMAN:
-- 618531
-- 619611
-gi|808860617|gb|KKF12591.1|:
-- 619611
-- 620534
-gi|50400717|sp|Q62838.1|MUSK_RAT:
-- 621895
-- 622810
-gi|38372441|sp|Q810U4.2|NRCAM_MOUSE:
-- 622810
-- 624121
-gi|85701289|sp|Q3T113.1|TMIG1_BOVIN:
-- 624121
-- 624423
-gi|332019203|gb|EGI59713.1|:
-- 624423
-- 624627
-gi|50400861|sp|Q61006.1|MUSK_MOUSE:
-- 624627
-- 625544
-gi|17432928|sp|Q63198.2|CNTN1_RAT:
-- 625544
-- 626615
-gi|1346269|sp|P31398.2|HEMO_MANSE:
-- 628695
-- 629149
-gi|55976304|sp|Q28106.1|CNTN1_BOVIN:
-- 629149
-- 630219
-gi|487524631|sp|D3ZZ80.3|OBSL1_RAT:
-- 630219
-- 632086
-gi|82072489|sp|Q5MD89.1|VGFR3_DANRE:
-- 632086
-- 633500
-gi|205830677|sp|A0JM20.1|TYRO3_XENTR:
-- 633500
-- 634432
-gi|68052359|sp|Q8N441.1|FGRL1_HUMAN:
-- 634432
-- 634981
-gi|549319|sp|P35969.1|VGFR1_MOUSE:
-- 634981
-- 636369
-gi|74821978|sp|Q95YM9.1|FGFR_HALRO:
-- 636369
-- 637179
-gi|158706516|sp|Q05BQ1.2|TUTLA_MOUSE:
-- 637179
-- 638413
-gi|906465974|gb|KNC27519.1|:
-- 638413
-- 638982
-gi|148237201|ref|NP_001080113.1|:
-- 638982
-- 639438
-gi|483503708|gb|EOA96185.1|:
-- 639438
-- 639909
-gi|81891315|sp|Q6AXM5.1|CEPT1_RAT:
-- 640825
-- 641282
-gi|81873728|sp|Q8BGS7.1|CEPT1_MOUSE:
-- 640366
-- 640825
-gi|82197726|sp|Q5ZHQ5.1|CHPT1_CHICK:
-- 641282
-- 641659
-gi|148222045|ref|NP_001089575.1|:
-- 641659
-- 642101
-gi|82209667|sp|Q7ZW02.1|CHPT1_DANRE:
-- 642101
-- 642526
-gi|81898254|sp|Q8C025.1|CHPT1_MOUSE:
-- 643417
-- 643858
-gi|122134295|sp|Q1LZE6.1|CHPT1_BOVIN:
-- 642967
-- 643417
-gi|81884140|sp|Q66H21.1|CHPT1_RAT:
-- 643858
-- 644297
-gi|74897246|sp|Q54XM0.1|CAPTB_DICDI:
-- 644297
-- 644749
-gi|74626612|sp|O13901.1|YF3A_SCHPO:
-- 644749
-- 645177
-gi|75220268|sp|O82567.1|AAPT1_ARATH:
-- 645177
-- 645609
-gi|122057022|sp|Q550W1.1|CAPTC_DICDI:
-- 645609
-- 646052
-gi|74897361|sp|Q55AQ3.1|CAPTA_DICDI:
-- 646052
-- 646476
-gi|75220269|sp|O82568.1|AAPT2_ARATH:
-- 646476
-- 646908
-gi|114152791|sp|P17898.3|CPT1_YEAST:
-- 646908
-- 647344
-gi|197103028|ref|NP_001127136.1|:
-- 647344
-- 647781
-gi|906469609|gb|KNC30316.1|:
-- 647781
-- 648226
-gi|729432|sp|P22140.2|EPT1_YEAST:
-- 648226
-- 648657
-gi|172046126|sp|Q80TA1.3|EPT1_MOUSE:
-- 648657
-- 649098
-gi|190352220|sp|Q17QM4.3|EPT1_BOVIN:
-- 649098
-- 649538
-gi|74933989|sp|Q8T2Q6.1|CAPTD_DICDI:
-- 649538
-- 649960
-gi|51701712|sp|Q95ZE2.1|PSS_ENCCU:
-- 649960
-- 650384