carray 1.4.0 → 1.5.1

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Files changed (126) hide show
  1. checksums.yaml +4 -4
  2. data/LICENSES +22 -0
  3. data/README.md +18 -14
  4. data/Rakefile +1 -1
  5. data/carray.gemspec +5 -13
  6. data/{ca_iter_block.c → ext/ca_iter_block.c} +13 -13
  7. data/{ca_iter_dimension.c → ext/ca_iter_dimension.c} +16 -16
  8. data/{ca_iter_window.c → ext/ca_iter_window.c} +10 -10
  9. data/{ca_obj_array.c → ext/ca_obj_array.c} +60 -55
  10. data/{ca_obj_bitarray.c → ext/ca_obj_bitarray.c} +12 -12
  11. data/{ca_obj_bitfield.c → ext/ca_obj_bitfield.c} +7 -7
  12. data/{ca_obj_block.c → ext/ca_obj_block.c} +42 -42
  13. data/{ca_obj_fake.c → ext/ca_obj_fake.c} +7 -7
  14. data/{ca_obj_farray.c → ext/ca_obj_farray.c} +18 -18
  15. data/{ca_obj_field.c → ext/ca_obj_field.c} +15 -15
  16. data/{ca_obj_grid.c → ext/ca_obj_grid.c} +27 -27
  17. data/{ca_obj_mapping.c → ext/ca_obj_mapping.c} +9 -9
  18. data/{ca_obj_object.c → ext/ca_obj_object.c} +37 -37
  19. data/{ca_obj_reduce.c → ext/ca_obj_reduce.c} +1 -1
  20. data/{ca_obj_refer.c → ext/ca_obj_refer.c} +33 -33
  21. data/{ca_obj_repeat.c → ext/ca_obj_repeat.c} +43 -43
  22. data/{ca_obj_select.c → ext/ca_obj_select.c} +2 -2
  23. data/{ca_obj_shift.c → ext/ca_obj_shift.c} +23 -23
  24. data/{ca_obj_transpose.c → ext/ca_obj_transpose.c} +23 -23
  25. data/{ca_obj_unbound_repeat.c → ext/ca_obj_unbound_repeat.c} +55 -55
  26. data/{ca_obj_window.c → ext/ca_obj_window.c} +26 -26
  27. data/{carray.h → ext/carray.h} +73 -51
  28. data/{carray_access.c → ext/carray_access.c} +83 -83
  29. data/{carray_attribute.c → ext/carray_attribute.c} +12 -12
  30. data/{carray_call_cfunc.c → ext/carray_call_cfunc.c} +0 -0
  31. data/{carray_cast.c → ext/carray_cast.c} +6 -6
  32. data/{carray_cast_func.rb → ext/carray_cast_func.rb} +0 -0
  33. data/{carray_class.c → ext/carray_class.c} +0 -0
  34. data/{carray_conversion.c → ext/carray_conversion.c} +8 -10
  35. data/{carray_copy.c → ext/carray_copy.c} +19 -19
  36. data/{carray_core.c → ext/carray_core.c} +2 -2
  37. data/ext/carray_data_type.c +66 -0
  38. data/{carray_element.c → ext/carray_element.c} +9 -9
  39. data/{carray_generate.c → ext/carray_generate.c} +0 -0
  40. data/{carray_iterator.c → ext/carray_iterator.c} +40 -38
  41. data/{carray_loop.c → ext/carray_loop.c} +24 -24
  42. data/{carray_mask.c → ext/carray_mask.c} +17 -6
  43. data/{carray_math.rb → ext/carray_math.rb} +3 -3
  44. data/ext/{mathfunc/carray_mathfunc.c → carray_mathfunc.c} +0 -0
  45. data/{carray_numeric.c → ext/carray_numeric.c} +1 -1
  46. data/{carray_operator.c → ext/carray_operator.c} +9 -9
  47. data/{carray_order.c → ext/carray_order.c} +2 -153
  48. data/{carray_sort_addr.c → ext/carray_sort_addr.c} +0 -0
  49. data/{carray_stat.c → ext/carray_stat.c} +5 -5
  50. data/{carray_stat_proc.rb → ext/carray_stat_proc.rb} +23 -23
  51. data/{carray_test.c → ext/carray_test.c} +22 -21
  52. data/{carray_undef.c → ext/carray_undef.c} +0 -0
  53. data/{carray_utils.c → ext/carray_utils.c} +0 -0
  54. data/{extconf.rb → ext/extconf.rb} +0 -5
  55. data/{mkmath.rb → ext/mkmath.rb} +0 -0
  56. data/{ruby_carray.c → ext/ruby_carray.c} +9 -2
  57. data/{ruby_ccomplex.c → ext/ruby_ccomplex.c} +0 -0
  58. data/{ruby_float_func.c → ext/ruby_float_func.c} +0 -0
  59. data/{version.h → ext/version.h} +5 -5
  60. data/{version.rb → ext/version.rb} +0 -0
  61. data/lib/carray.rb +48 -37
  62. data/lib/carray/{base/autoload.rb → autoload.rb} +1 -1
  63. data/lib/carray/autoload/autoload_base.rb +1 -1
  64. data/lib/carray/autoload/autoload_gem_numo_narray.rb +4 -3
  65. data/lib/carray/autoload/autoload_gem_random.rb +8 -0
  66. data/lib/carray/basic.rb +193 -0
  67. data/lib/carray/compose.rb +291 -0
  68. data/lib/carray/construct.rb +445 -0
  69. data/lib/carray/convert.rb +115 -0
  70. data/lib/carray/{base/inspect.rb → inspect.rb} +6 -6
  71. data/lib/carray/io/imagemagick.rb +1 -1
  72. data/lib/carray/{base/iterator.rb → iterator.rb} +3 -3
  73. data/lib/carray/mask.rb +91 -0
  74. data/lib/carray/{base/math.rb → math.rb} +16 -46
  75. data/lib/carray/math/histogram.rb +7 -7
  76. data/lib/carray/mkmf.rb +8 -0
  77. data/lib/carray/object/ca_obj_pack.rb +8 -8
  78. data/lib/carray/obsolete.rb +272 -0
  79. data/lib/carray/ordering.rb +157 -0
  80. data/lib/carray/{base/serialize.rb → serialize.rb} +28 -53
  81. data/lib/carray/{base/string.rb → string.rb} +12 -64
  82. data/lib/carray/{base/struct.rb → struct.rb} +16 -16
  83. data/lib/carray/{io/table.rb → table.rb} +1 -10
  84. data/lib/carray/testing.rb +56 -0
  85. data/lib/carray/time.rb +78 -0
  86. data/lib/carray/transform.rb +100 -0
  87. data/misc/Methods.ja.md +182 -0
  88. data/{NOTE → misc/NOTE} +0 -0
  89. data/test/test_ALL.rb +0 -2
  90. data/test/test_order.rb +7 -7
  91. data/test/test_ref_store.rb +13 -13
  92. data/test/test_stat.rb +7 -15
  93. data/{devel → utils}/guess_shape.rb +0 -0
  94. data/utils/{diff_method.rb → monkey_patch_methods.rb} +17 -7
  95. metadata +88 -151
  96. data/COPYING +0 -56
  97. data/GPL +0 -340
  98. data/LEGAL +0 -50
  99. data/TODO +0 -5
  100. data/carray_random.c +0 -531
  101. data/devel/im2col.rb +0 -17
  102. data/ext/calculus/carray_calculus.c +0 -931
  103. data/ext/calculus/carray_interp.c +0 -358
  104. data/ext/calculus/extconf.rb +0 -12
  105. data/ext/calculus/lib/math/calculus.rb +0 -119
  106. data/ext/calculus/lib/math/interp/adapter_interp1d.rb +0 -31
  107. data/ext/mathfunc/extconf.rb +0 -18
  108. data/ext/mathfunc/test/test_hypot.rb +0 -5
  109. data/ext/mathfunc/test/test_j0.rb +0 -22
  110. data/ext/mathfunc/test/test_jn.rb +0 -8
  111. data/ext/mathfunc/test/test_sph.rb +0 -9
  112. data/lib/carray/autoload/autoload_io_table.rb +0 -1
  113. data/lib/carray/autoload/autoload_math_interp.rb +0 -4
  114. data/lib/carray/base/basic.rb +0 -1146
  115. data/lib/carray/base/obsolete.rb +0 -131
  116. data/lib/carray/math/interp.rb +0 -57
  117. data/lib/carray/math/interp/adapter_gsl_spline.rb +0 -47
  118. data/mt19937ar.c +0 -182
  119. data/mt19937ar.h +0 -86
  120. data/rdoc_main.rb +0 -27
  121. data/rdoc_math.rb +0 -5
  122. data/rdoc_stat.rb +0 -31
  123. data/test/test_narray.rb +0 -64
  124. data/test/test_random.rb +0 -15
  125. data/utils/create_rdoc.sh +0 -9
  126. data/utils/make_tgz.sh +0 -3
@@ -1,5 +1,5 @@
1
1
 
2
- module CA
2
+ class CArray
3
3
 
4
4
  module TableMethods
5
5
 
@@ -67,12 +67,3 @@ module CA
67
67
 
68
68
  end
69
69
 
70
- class CArray
71
-
72
- def extend_as_table (column_names)
73
- self.extend CA::TableMethods
74
- self.column_names = column_names
75
- self
76
- end
77
-
78
- end
@@ -0,0 +1,56 @@
1
+ # ----------------------------------------------------------------------------
2
+ #
3
+ # carray/test.rb
4
+ #
5
+ # This file is part of Ruby/CArray extension library.
6
+ # You can redistribute it and/or modify it under the terms of
7
+ # the Ruby Licence.
8
+ #
9
+ # Copyright (C) 2005 Hiroki Motoyoshi
10
+ #
11
+ # ----------------------------------------------------------------------------
12
+
13
+ class CArray
14
+
15
+ def test (&block)
16
+ return convert(:boolean) {|v| yield(v) ? true : false }
17
+ end
18
+
19
+ def contains (*list)
20
+ result = self.false()
21
+ list.each do |item|
22
+ result = result | self.eq(item)
23
+ end
24
+ return result
25
+ end
26
+
27
+ def between (a, b)
28
+ return (self >= a) & (self <= b)
29
+ end
30
+
31
+ def where_range
32
+ w = where
33
+ x = (w - w.shifted(1){-2}).sub!(1).where
34
+ y = (w - w.shifted(-1){-2}).add!(1).where
35
+ list = []
36
+ x.each_addr do |i|
37
+ list.push(w[x[i]]..w[y[i]])
38
+ end
39
+ return list
40
+ end
41
+
42
+ # Returns the array eliminated all the duplicated elements.
43
+ def uniq
44
+ ary = to_a.uniq
45
+ if has_mask?
46
+ ary.delete(UNDEF)
47
+ end
48
+ if has_data_class?
49
+ return CArray.new(data_class, [ary.length]) { ary }
50
+ else
51
+ return CArray.new(data_type, [ary.length], :bytes=>bytes) { ary }
52
+ end
53
+ end
54
+
55
+
56
+ end
@@ -0,0 +1,78 @@
1
+ # ----------------------------------------------------------------------------
2
+ #
3
+ # carray/time.rb
4
+ #
5
+ # This file is part of Ruby/CArray extension library.
6
+ # You can redistribute it and/or modify it under the terms of
7
+ # the Ruby Licence.
8
+ #
9
+ # Copyright (C) 2005 Hiroki Motoyoshi
10
+ #
11
+ # ----------------------------------------------------------------------------
12
+
13
+ require "date"
14
+
15
+ class CArray
16
+
17
+ def str_to_datetime (template = nil)
18
+ if template
19
+ return convert() {|v| DateTime.strptime(v, template) }
20
+ else
21
+ return convert() {|v| DateTime.parse(v) }
22
+ end
23
+ end
24
+
25
+ def str_to_time (template = nil)
26
+ if template
27
+ return str_strptime(template)
28
+ else
29
+ return convert() {|v| Time.parse(v) }
30
+ end
31
+ end
32
+
33
+ def time_format (template = nil)
34
+ if template
35
+ return str_strftime(template)
36
+ else
37
+ return convert(&:to_s)
38
+ end
39
+ end
40
+
41
+ def time_year
42
+ return convert(:int, &:year)
43
+ end
44
+
45
+ def time_month
46
+ return convert(:int, &:month)
47
+ end
48
+
49
+ def time_day
50
+ return convert(:int, &:day)
51
+ end
52
+
53
+ def time_hour
54
+ return convert(:int, &:hour)
55
+ end
56
+
57
+ def time_minute
58
+ return convert(:int, &:minute)
59
+ end
60
+
61
+ def time_second
62
+ return convert(:double) {|d| d.second + d.second_fraction }
63
+ end
64
+
65
+ def time_jd
66
+ return convert(:int, &:jd)
67
+ end
68
+
69
+ def time_ajd
70
+ return convert(:double, &:ajd)
71
+ end
72
+
73
+ def time_is_leap
74
+ return test(&:leap?)
75
+ end
76
+
77
+ end
78
+
@@ -0,0 +1,100 @@
1
+ # ----------------------------------------------------------------------------
2
+ #
3
+ # carray/composition.rb
4
+ #
5
+ # This file is part of Ruby/CArray extension library.
6
+ # You can redistribute it and/or modify it under the terms of
7
+ # the Ruby Licence.
8
+ #
9
+ # Copyright (C) 2005 Hiroki Motoyoshi
10
+ #
11
+ # ----------------------------------------------------------------------------
12
+
13
+ class CArray
14
+
15
+ # reshape
16
+
17
+ def reshape (*newdim)
18
+ ifalse = nil
19
+ i = 0
20
+ 0.upto(newdim.size-1) do |i|
21
+ if newdim[i].nil?
22
+ newdim[i] = dim[i]
23
+ elsif newdim[i] == false
24
+ ifalse = i
25
+ break
26
+ end
27
+ end
28
+ k = 0
29
+ (newdim.size-1).downto(i+1) do |j|
30
+ if newdim[j].nil?
31
+ newdim[j] = dim[ndim-1-k]
32
+ end
33
+ k += 1
34
+ end
35
+ if ifalse
36
+ newdim[ifalse] =
37
+ elements/newdim.select{|x| x!=false}.inject(1){|s,x| s*x}
38
+ end
39
+ return refer(data_type, newdim, :bytes=>bytes)
40
+ end
41
+
42
+ # flatten
43
+
44
+ def flattened
45
+ return reshape(elements)
46
+ end
47
+
48
+ def flatten
49
+ return reshape(elements).to_ca
50
+ end
51
+
52
+ def transpose! (*argv)
53
+ self[] = self.transposed(*argv)
54
+ return self
55
+ end
56
+
57
+ def transpose (*argv)
58
+ return self.transposed(*argv).to_ca
59
+ end
60
+
61
+ # Reutrns the reference which ndim is reduced
62
+ # by eliminating the dimensions which size == 1
63
+ def compacted
64
+ if ndim == 1
65
+ return self[]
66
+ else
67
+ newdim = dim.reject{|x| x == 1 }
68
+ return ( ndim != newdim.size ) ? reshape(*newdim) : self[]
69
+ end
70
+ end
71
+
72
+ # Returns the array which ndim is reduced
73
+ # by eliminating the dimensions which size == 1
74
+ def compact
75
+ if ndim == 1
76
+ return self.to_ca
77
+ else
78
+ newdim = dim.reject{|x| x == 1 }
79
+ return ( ndim != newdim.size ) ? reshape(*newdim).to_ca : self.to_ca
80
+ end
81
+ end
82
+
83
+ # Returns (1,n) array from 1-dimensional array
84
+ def to_row
85
+ if ndim != 1
86
+ raise "ndim should be 1"
87
+ end
88
+ return self[1,:%]
89
+ end
90
+
91
+ # Returns (n,1) array from 1-dimensional array
92
+ def to_column
93
+ if ndim != 1
94
+ raise "ndim should be 1"
95
+ end
96
+ return self[:%,1]
97
+ end
98
+
99
+
100
+ end
@@ -0,0 +1,182 @@
1
+ メソッドドキュメント
2
+ ===================
3
+
4
+ 多次元配列クラスのRuby用ライブラリ
5
+
6
+ 特徴
7
+ ---
8
+
9
+ * 一様なデータを格納するための多次元配列
10
+ * データ要素への多様なアクセス方法
11
+ * 欠測値を扱うための要素別のマスク
12
+ * 要素毎の演算や数学関数
13
+ * 要素に対する統計関数
14
+ * 真の参照配列
15
+ * ユーザー定義配列
16
+ * 他オブジェクトとのメモリ共有(Experimental)
17
+
18
+ マスクに関するメソッド
19
+ -------------------
20
+
21
+ * 一度生成されたマスク配列を取り除く方法は提供されていない。
22
+
23
+ == メソッド
24
+
25
+ === --- CArray#has_mask?
26
+ マスク配列が付加されている場合にtrueを返す。
27
+ 全要素がマスクされていなくても、マスク配列が付加されていればtrueを返す。
28
+
29
+ a = CA_INT(0..2);
30
+ a.has_mask?
31
+ a[1] = UNDEF;
32
+ a.has_mask?
33
+
34
+ === --- CArray#any_masked?
35
+ マスクされた要素が1つ以上ある場合にtrueを返す。
36
+ どの要素もマスクされていない場合やマスク配列自体を持っていない場合にfalseを返す。
37
+
38
+ a = CA_INT(0..2);
39
+ a.mask = 0;
40
+ a.any_masked?
41
+ a[1] = UNDEF;
42
+ a.any_masked?
43
+ a.unmask;
44
+ a.any_masked?
45
+
46
+ === --- CArray#value
47
+ データ配列を参照する配列を返す。
48
+ マスクされているいないに関わらず、要素の値を参照したり、
49
+ 値を変更することができる。
50
+ この配列(もしくはこの配列を参照する配列)に対し、
51
+ マスクを付加しようとすると例外が発生する。
52
+
53
+ a = CA_INT(0..2);
54
+ a[1] = UNDEF;
55
+ a
56
+ a.value
57
+
58
+ === --- CArray#mask
59
+ マスク配列を参照するboolean型配列を返す。
60
+ この配列を変更すると、元の配列のマスク状態を変更することができる。
61
+ この配列(もしくはこの配列を参照する配列)に対し、
62
+ マスクを付加しようとすると例外が発生する。
63
+
64
+ a = CA_INT(0..2);
65
+ a[1] = UNDEF;
66
+ a.mask
67
+ a
68
+ a.mask[] ^= 1;
69
+ a
70
+
71
+ === --- CArray#mask=(new_mask)
72
+ new_maskをマスク配列に代入する。
73
+ new_maskは、<TBD>でなければならない。
74
+ 配列がマスク配列を持っていない場合は、代入前にマスク配列が生成される。
75
+
76
+ a = CA_INT(0..2);
77
+ a.mask
78
+ a.mask = 0;
79
+ a.mask
80
+ a.mask = [0,1,0];
81
+ a.mask
82
+ a.mask ^= 1;
83
+ a.mask
84
+
85
+ === --- CArray#is_masked
86
+ マスク状態を表すboolean型配列を返す。
87
+ この配列はマスクされた要素が1で、マスクされていない要素が0となる。
88
+
89
+ a = CA_INT(0..2);
90
+ a[1] = UNDEF;
91
+ a.is_masked
92
+
93
+ === --- CArray#is_not_masked
94
+ マスク状態を表すboolean型配列を返す。
95
+ この配列はマスクされた要素が0で、マスクされていない要素が1となる。
96
+
97
+ a = CA_INT(0..2);
98
+ a[1] = UNDEF;
99
+ a.is_not_masked
100
+
101
+ === --- CArray#count_masked (*axis)
102
+ マスクされた要素の数を返す。
103
+ axisで与えられた次元で集計し、残りの次元の配列を返す。
104
+ axisが与えられない場合は、整数を返す。
105
+
106
+ a = CA_INT(0..2);
107
+ a[1] = UNDEF;
108
+ a.count_masked
109
+
110
+ === --- CArray#count_not_masked
111
+ マスクされていない要素の数を返す。
112
+ axisで与えられた次元で集計し、残りの次元の配列を返す。
113
+ axisが与えられない場合は、整数を返す。
114
+
115
+ a = CA_INT(0..2);
116
+ a[1] = UNDEF;
117
+ a.count_not_masked
118
+
119
+ === --- CArray#unmask([fill_value])
120
+ すべての要素のマスクを解除する。
121
+ fill_valueが与えられている場合は、マスクされた要素をすべてfill_valueで置き換える。
122
+ このメソッドでは、マスク配列自体を取り除かれることはない。
123
+
124
+ a = CA_INT(0..2);
125
+ # example for fill_value not to be given
126
+ a[1] = UNDEF;
127
+ a
128
+ a.unmask();
129
+ a
130
+
131
+ # example for fill_value to be given
132
+ b = CA_INT(0..2);
133
+ b[1] = UNDEF;
134
+ b.unmask(-9999);
135
+ b
136
+
137
+ === --- CArray#unmask_copy([fill_value])
138
+ すべての要素のマスクが解除された複製を返す。
139
+ fill_valueが与えられている場合は、マスクされた要素をすべてfill_valueで置き換える。
140
+ 返り値の配列はマスク配列を持たない状態で生成される。
141
+
142
+ a = CA_INT(0..2);
143
+ a[1] = UNDEF;
144
+ a
145
+
146
+ b = a.unmask_copy(-9999)
147
+ b.has_mask?
148
+
149
+ === --- CArray#inherit_mask(a1, a2, ...)
150
+ オブジェクトと引数で与えられた配列の集合で(self,a1,a2,...)でマスク状態の論理和をとり、
151
+ 新しいマスク状態として置き換える。
152
+
153
+ a = CA_INT(0..2);
154
+ b = CA_INT(0..2);
155
+ c = CA_INT(0..2);
156
+ a[0] = UNDEF;
157
+ b[1] = UNDEF;
158
+ c[2] = UNDEF;
159
+ a ### => [_,1,2]
160
+ b ### => [0,_,2]
161
+ c ### => [0,1,_]
162
+ a.inherit_mask(b,c);
163
+ a ### => [_,_,_]
164
+
165
+ === --- CArray#inherit_mask_replace(a1, a2, ...)
166
+ 引数で与えられた配列 a1、a2、… のマスク状態の論理和をとり、
167
+ 新しいマスク状態として設定する。
168
+ オブジェクト自身のマスク値は上記の論理和に含まれない点に注意する。
169
+
170
+ a = CA_INT(0..2);
171
+ b = CA_INT(0..2);
172
+ c = CA_INT(0..2);
173
+ a[0] = UNDEF;
174
+ b[1] = UNDEF;
175
+ c[2] = UNDEF;
176
+ a ### => [_,1,2]
177
+ b ### => [0,_,2]
178
+ c ### => [0,1,_]
179
+ a.inherit_mask_replace(b,c);
180
+ a ### => [0,_,_]
181
+
182
+
File without changes
@@ -38,9 +38,7 @@ load 'test_generate.rb'
38
38
  load 'test_index.rb'
39
39
  load 'test_mask.rb'
40
40
  load 'test_math.rb'
41
- load 'test_narray.rb' if defined?(CArray::HAVE_NARRAY)
42
41
  load 'test_order.rb'
43
- load 'test_random.rb'
44
42
  load 'test_ref_store.rb'
45
43
  load 'test_stat.rb'
46
44
  load 'test_struct.rb'