psdi-data-conversion 0.1.4__tar.gz → 0.1.6__tar.gz

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
Files changed (143) hide show
  1. psdi_data_conversion-0.1.6/CHANGELOG.md +20 -0
  2. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/PKG-INFO +1 -1
  3. psdi_data_conversion-0.1.4/CHANGELOG.md +0 -10
  4. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/.gitignore +0 -0
  5. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/CONTRIBUTING.md +0 -0
  6. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/LICENSE +0 -0
  7. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/README.md +0 -0
  8. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/__init__.py +0 -0
  9. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/app.py +0 -0
  10. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/bin/LICENSE_ATOMSK +0 -0
  11. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/bin/LICENSE_C2X +0 -0
  12. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/bin/linux/atomsk +0 -0
  13. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/bin/linux/c2x +0 -0
  14. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/bin/mac/atomsk +0 -0
  15. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/bin/mac/c2x +0 -0
  16. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/constants.py +0 -0
  17. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/converter.py +0 -0
  18. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/converters/__init__.py +0 -0
  19. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/converters/atomsk.py +0 -0
  20. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/converters/base.py +0 -0
  21. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/converters/c2x.py +0 -0
  22. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/converters/openbabel.py +0 -0
  23. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/database.py +0 -0
  24. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/dist.py +0 -0
  25. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/file_io.py +0 -0
  26. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/log_utility.py +0 -0
  27. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/main.py +0 -0
  28. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/scripts/atomsk.sh +0 -0
  29. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/scripts/c2x.sh +0 -0
  30. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/security.py +0 -0
  31. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/accessibility.htm +0 -0
  32. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/convert.htm +0 -0
  33. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/convertato.htm +0 -0
  34. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/convertc2x.htm +0 -0
  35. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/documentation.htm +0 -0
  36. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/download.htm +0 -0
  37. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/feedback.htm +0 -0
  38. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/header-links.html +0 -0
  39. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/index-versions/header-links.html +0 -0
  40. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/index-versions/psdi-common-footer.html +0 -0
  41. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/index-versions/psdi-common-header.html +0 -0
  42. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/psdi-common-footer.html +0 -0
  43. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/psdi-common-header.html +0 -0
  44. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/content/report.htm +0 -0
  45. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/data/data.json +0 -0
  46. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/colormode-toggle-dm.svg +0 -0
  47. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/colormode-toggle-lm.svg +0 -0
  48. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/psdi-icon-dark.svg +0 -0
  49. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/psdi-icon-light.svg +0 -0
  50. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/psdi-logo-darktext-simple.png +0 -0
  51. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/psdi-logo-darktext.png +0 -0
  52. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/psdi-logo-lighttext-simple.png +0 -0
  53. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/psdi-logo-lighttext.png +0 -0
  54. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-bluesky-black.svg +0 -0
  55. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-bluesky-white.svg +0 -0
  56. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-instagram-black.svg +0 -0
  57. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-instagram-white.svg +0 -0
  58. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-linkedin-black.png +0 -0
  59. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-linkedin-white.png +0 -0
  60. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-mastodon-black.svg +0 -0
  61. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-mastodon-white.svg +0 -0
  62. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-x-black.svg +0 -0
  63. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-x-white.svg +0 -0
  64. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-youtube-black.png +0 -0
  65. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/social-logo-youtube-white.png +0 -0
  66. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/ukri-epsr-logo-darktext.png +0 -0
  67. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/ukri-epsr-logo-lighttext.png +0 -0
  68. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/ukri-logo-darktext.png +0 -0
  69. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/img/ukri-logo-lighttext.png +0 -0
  70. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/accessibility.js +0 -0
  71. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/common.js +0 -0
  72. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/convert.js +0 -0
  73. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/convert_common.js +0 -0
  74. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/convertato.js +0 -0
  75. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/convertc2x.js +0 -0
  76. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/data.js +0 -0
  77. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/format.js +0 -0
  78. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/load_accessibility.js +0 -0
  79. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/psdi-common.js +0 -0
  80. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/javascript/report.js +0 -0
  81. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/styles/format.css +0 -0
  82. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/static/styles/psdi-common.css +0 -0
  83. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/templates/index.htm +0 -0
  84. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/testing/__init__.py +0 -0
  85. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/testing/constants.py +0 -0
  86. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/testing/conversion_callbacks.py +0 -0
  87. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/testing/conversion_test_specs.py +0 -0
  88. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/testing/gui.py +0 -0
  89. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/testing/utils.py +0 -0
  90. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/psdi_data_conversion/utils.py +0 -0
  91. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/pyproject.toml +0 -0
  92. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/scripts/setup_bin.py +0 -0
  93. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/1ARJ.mmcif +0 -0
  94. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/1NE6.mmcif +0 -0
  95. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/5a9z-assembly1.cif +0 -0
  96. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/Fapatite.ins +0 -0
  97. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/aceticacid.mol +0 -0
  98. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/benzyne.molden +0 -0
  99. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/caffeine-smi.tar +0 -0
  100. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/caffeine-smi.tar.gz +0 -0
  101. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/caffeine-smi.zip +0 -0
  102. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/caffeine.inchi +0 -0
  103. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/ch3cl-esp.cub +0 -0
  104. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/cyclopropane_err.mol +0 -0
  105. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/ethanol.xyz +0 -0
  106. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/fullRhinovirus.pdb +0 -0
  107. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/hemoglobin.pdb +0 -0
  108. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/nacl.cif +0 -0
  109. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/nacl.mol +0 -0
  110. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/aceticacid.log.txt +0 -0
  111. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/aceticacid.mol2 +0 -0
  112. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine-2D-fastest.xyz +0 -0
  113. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine-3D-best.xyz +0 -0
  114. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine.smi +0 -0
  115. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine.xyz +0 -0
  116. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine_a_in.smi +0 -0
  117. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine_a_in_kx_f4_l5_out.smi +0 -0
  118. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine_a_in_kx_f4_out.smi +0 -0
  119. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine_a_in_kx_out.smi +0 -0
  120. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/caffeine_a_in_x_out.smi +0 -0
  121. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/hemoglobin_Atomsk.xyz +0 -0
  122. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/hemoglobin_c2x.xyz +0 -0
  123. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/nacl.log +0 -0
  124. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/nacl.mol +0 -0
  125. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/quartz_OB.cif +0 -0
  126. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/quartz_OB.log.txt +0 -0
  127. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/quartz_atomsk.cif +0 -0
  128. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/quartz_atomsk.log.txt +0 -0
  129. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/standard_test.inchi +0 -0
  130. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/xyz_files-mol.zip +0 -0
  131. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/output/xyz_files.log.txt +0 -0
  132. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/periodic_dmol3.outmol +0 -0
  133. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/quartz.xyz +0 -0
  134. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/quartz_err.xyz +0 -0
  135. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/test_data/standard_test.cdxml +0 -0
  136. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/gui/gui_test.py +0 -0
  137. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/python/cli_test.py +0 -0
  138. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/python/converter_test.py +0 -0
  139. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/python/database_test.py +0 -0
  140. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/python/dist_test.py +0 -0
  141. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/python/file_io_test.py +0 -0
  142. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/python/logging_test.py +0 -0
  143. {psdi_data_conversion-0.1.4 → psdi_data_conversion-0.1.6}/tests/python/security_test.py +0 -0
@@ -0,0 +1,20 @@
1
+ # Changelog for PSDI Data Conversion
2
+
3
+ ## v0.1.6
4
+
5
+ ### New and Changed Functionality
6
+
7
+ - SHA banner at the bottom of home page now preferentially shows the version, only showing the SHA if the current version doesn't match the last tag
8
+
9
+ ### Bugfixes
10
+
11
+ - Fixed bug which was blocking deployment to production
12
+
13
+ ## v0.1.0
14
+
15
+ Initial public release. Features included:
16
+
17
+ - Online server functionality
18
+ - Locally-hosted server
19
+ - Command-line interface
20
+ - Python library
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  Metadata-Version: 2.4
2
2
  Name: psdi_data_conversion
3
- Version: 0.1.4
3
+ Version: 0.1.6
4
4
  Summary: Chemistry file format conversion service, provided by PSDI
5
5
  Project-URL: Homepage, https://data-conversion.psdi.ac.uk/
6
6
  Project-URL: Documentation, https://psdi-uk.github.io/psdi-data-conversion/
@@ -1,10 +0,0 @@
1
- # Changelog for PSDI Data Conversion
2
-
3
- ## v0.1.0
4
-
5
- Initial public release. Features included:
6
-
7
- - Online server functionality
8
- - Locally-hosted server
9
- - Command-line interface
10
- - Python library