plotfig 1.3.0__tar.gz → 1.3.2__tar.gz

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/CHANGELOG.md

@@ -1,4 +1,16 @@
-## v1.3.0 (2025-07-28)
+## 1.3.2 (2025-07-29)
+
+### Fix
+
+- **deps**: use the correct version of surfplot
+
+## 1.3.1 (2025-07-28)
+
+### Fix
+
+- **deps**: update surfplot dependency info to use GitHub version
+
+## 1.3.0 (2025-07-28)
 
 ### Feat
 
@@ -15,13 +27,13 @@
 - **bar**: rename arguments in plot_one_group_bar_figure
 - **tests**: remove unused tests folder
 
-## v1.2.1 (2025-07-24)
+## 1.2.1 (2025-07-24)
 
 ### Fix
 
 - **bar**: rename `y_lim_range` to `y_lim` in `plot_one_group_bar_figure`
 
-## v1.2.0 (2025-07-24)
+## 1.2.0 (2025-07-24)
 
 ### Feat
 
@@ -31,14 +43,14 @@
 
 - **matrix**: changed return value to None
 
-## v1.1.0 (2025-07-21)
+## 1.1.0 (2025-07-21)
 
 ### Feat
 
 - **corr**: allow hexbin to show dense scatter points in correlation plot
 - **bar**: support gradient color bars and now can change border color
 
-## v1.0.0 (2025-07-03)
+## 1.0.0 (2025-07-03)
 
 ### Feat
 

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/PKG-INFO

@@ -1,6 +1,6 @@
 Metadata-Version: 2.4
 Name: plotfig
-Version: 1.3.0
+Version: 1.3.2
 Summary: Scientific plotting package for Cognitive neuroscience
 Author-email: Ricardo Ryn <ricardoRyn1317@gmail.com>
 License-File: LICENSE
@@ -21,7 +21,7 @@ Description-Content-Type: text/markdown
 `plotfig` 是一个专为科学数据可视化设计的 Python 库，致力于为认知神经科研工作人员提供高效、易用且美观的图形绘制工具。
 该项目基于业界主流的可视化库—— `matplotlib`、`surfplot` 和 `plotly` 开发，融合了三者的强大功能，能够满足神经科学、脑连接组学、相关性分析、矩阵可视化等多种科研场景下的复杂绘图需求。
 
-![plotfig](./docs/assets/plotfig.png)
+![plotfig](https://github.com/RicardoRyn/plotfig/blob/main/docs/assets/plotfig.png)
 
 
 ## 项目结构
@@ -80,7 +80,7 @@ pip install -e .
 
 ## 依赖要求
 
-`plotfig` 依赖若干核心库，这些依赖会在安装过程中自动处理，但建议用户事先了解其版本要求以避免兼容性问题。
+`plotfig` 依赖若干核心库，这些依赖均会在安装过程中自动处理。
 
 - [matplotlib](https://matplotlib.org/) &ge; 3.10.1  
 - [mne-connectivity](https://mne.tools/mne-connectivity/stable/index.html) &ge; 0.7.0  
@@ -89,4 +89,4 @@ pip install -e .
 - [pandas](https://pandas.pydata.org/) &ge; 2.2.3  
 - [plotly](https://plotly.com/) &ge; 6.0.1  
 - [scipy](https://scipy.org/) &ge; 1.15.2  
-- [surfplot](https://surfplot.readthedocs.io/en/latest/index.html) &ge; 0.2.0  
+- [surfplot](https://github.com/danjgale/surfplot)（使用其 GitHub 仓库最新版，而非 PyPI 发布版本，因后者尚未包含所需功能）

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/README.md

@@ -3,7 +3,7 @@
 `plotfig` 是一个专为科学数据可视化设计的 Python 库，致力于为认知神经科研工作人员提供高效、易用且美观的图形绘制工具。
 该项目基于业界主流的可视化库—— `matplotlib`、`surfplot` 和 `plotly` 开发，融合了三者的强大功能，能够满足神经科学、脑连接组学、相关性分析、矩阵可视化等多种科研场景下的复杂绘图需求。
 
-![plotfig](./docs/assets/plotfig.png)
+![plotfig](https://github.com/RicardoRyn/plotfig/blob/main/docs/assets/plotfig.png)
 
 
 ## 项目结构
@@ -62,7 +62,7 @@ pip install -e .
 
 ## 依赖要求
 
-`plotfig` 依赖若干核心库，这些依赖会在安装过程中自动处理，但建议用户事先了解其版本要求以避免兼容性问题。
+`plotfig` 依赖若干核心库，这些依赖均会在安装过程中自动处理。
 
 - [matplotlib](https://matplotlib.org/) ≥ 3.10.1  
 - [mne-connectivity](https://mne.tools/mne-connectivity/stable/index.html) ≥ 0.7.0  
@@ -71,4 +71,4 @@ pip install -e .
 - [pandas](https://pandas.pydata.org/) ≥ 2.2.3  
 - [plotly](https://plotly.com/) ≥ 6.0.1  
 - [scipy](https://scipy.org/) ≥ 1.15.2  
-- [surfplot](https://surfplot.readthedocs.io/en/latest/index.html) ≥ 0.2.0  
+- [surfplot](https://github.com/danjgale/surfplot)（使用其 GitHub 仓库最新版，而非 PyPI 发布版本，因后者尚未包含所需功能）

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/docs/installation.md

@@ -32,7 +32,7 @@ pip install -e .
 
 ## 依赖要求
 
-`plotfig` 依赖若干核心库，这些依赖会在安装过程中自动处理，但建议用户事先了解其版本要求以避免兼容性问题。
+`plotfig` 依赖若干核心库，这些依赖均会在安装过程中自动处理。
 
 - [matplotlib](https://matplotlib.org/) ≥ 3.10.1  
 - [mne-connectivity](https://mne.tools/mne-connectivity/stable/index.html) ≥ 0.7.0  
@@ -41,4 +41,4 @@ pip install -e .
 - [pandas](https://pandas.pydata.org/) ≥ 2.2.3  
 - [plotly](https://plotly.com/) ≥ 6.0.1  
 - [scipy](https://scipy.org/) ≥ 1.15.2  
-- [surfplot](https://surfplot.readthedocs.io/en/latest/index.html) ≥ 0.2.0  
+- [surfplot](https://github.com/danjgale/surfplot)（使用其 GitHub 仓库最新版，而非 PyPI 发布版本，因后者尚未包含所需功能）

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/docs/usage/single_group.md

@@ -504,14 +504,15 @@ plot_one_group_bar_figure(
 
 `plot_one_group_bar_figure` 可快速实现柱间统计比较。当前支持以下统计方法：
 
-1. 独立样本 t 检验（`ttest_ind`）  
-2. 配对样本 t 检验（`ttest_rel`）  
-3. Mann-Whitney U 检验（`mannwhitneyu`）  
-4. 外部统计检验 （`external`）
+1. 独立样本 t 检验（`ttest_ind`）
+2. 配对样本 t 检验（`ttest_rel`）
+3. 单样本t检验（`ttest_1samp`）
+4. Mann-Whitney U 检验（`mannwhitneyu`）
+5. 外部统计检验 （`external`）
 
-> “外部统计检验”（`external`）指用户可使用其他统计软件完成检验，只需将计算好的 p 值传入函数。
+> 
 
-使用时需先通过 `statistic` 选项启用统计功能，并在 `test_method` 中指定方法名；外部统计检验还需通过 `p_list` 额外传入对应的 p 值列表。
+使用时需先通过 `statistic` 选项启用统计功能，并在 `test_method` 中指定方法名。
 
 
 
@@ -530,6 +531,8 @@ data2 = np.random.normal(4, 1, 31)
 data3 = np.random.normal(5, 1, 31)
 data4 = np.random.normal(2, 1, 9)
 data5 = np.random.normal(4, 1, 10)
+data6 = np.random.normal(0, 1, 20)
+data7 = np.random.normal(1, 1, 20)
 
 fig, axes = plt.subplots(2, 2, figsize=(6, 6))
 fig.subplots_adjust(wspace=0.5, hspace=0.5)
@@ -554,25 +557,25 @@ plot_one_group_bar_figure(
     test_method="ttest_rel"
 )
 plot_one_group_bar_figure(
-    [data4, data5],
+    [data6, data7],
     ax=axes[1,0],
     labels_name=["A", "B"],
     y_label_name="y",
-    title_name="Mann-Whitney U检验",
+    title_name="单样本t检验",
     title_fontsize=15,
-    statistic=True, 
-    test_method="mannwhitneyu"
+    statistic=True,
+    test_method="ttest_1samp",
+    popmean=0,
 )
 plot_one_group_bar_figure(
-    [data1, data2],
+    [data4, data5],
     ax=axes[1,1],
     labels_name=["A", "B"],
     y_label_name="y",
-    title_name="外部统计检验",
+    title_name="Mann-Whitney U检验",
     title_fontsize=15,
     statistic=True, 
-    test_method="external",
-    p_list=[0.01],
+    test_method="mannwhitneyu"
 )
 ```
 
@@ -582,6 +585,9 @@ plot_one_group_bar_figure(
     
 
 
+“外部统计检验”（`external`）指用户可使用其他统计软件完成检验，只需将计算好的 p 值传入函数。
+外部统计检验需通过 `p_list` 额外传入对应的 p 值列表。
+
 !!! note
     当使用“外部统计检验”且有多个柱子需要比较时，传入的 *p* 值应遵循以下顺序：
 
@@ -622,7 +628,7 @@ plot_one_group_bar_figure(
 
 
     
-![png](single_group_files/single_group_36_0.png)
+![png](single_group_files/single_group_37_0.png)
     
 
 
@@ -673,6 +679,6 @@ plot_one_group_violin_figure(
 
 
     
-![png](single_group_files/single_group_39_0.png)
+![png](single_group_files/single_group_40_0.png)
     
 

plotfig-1.3.2/overrides/main.html

@@ -0,0 +1,5 @@
+{% extends "base.html" %}
+
+{% block announce %}
+  <strong>📢 新功能：单组bar图可以进行单样本t检验！点击<a href="/plotfig/changelog">更新日志</a>了解更多。</strong>
+{% endblock %}

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/pyproject.toml

@@ -1,6 +1,6 @@
 [project]
 name = "plotfig"
-version = "1.3.0"
+version = "1.3.2"
 description = "Scientific plotting package for Cognitive neuroscience"
 keywords = ["neuroscience", "plotting", "visualization"]
 readme = "README.md"
@@ -38,11 +38,28 @@ exclude = [
 
 [tool.commitizen]
 name = "cz_conventional_commits"
-tag_format = "v$version"
+tag_format = "$version"
+legacy_tag_formats = "v$version"
 version_scheme = "pep440"
 version_provider = "uv"
 update_changelog_on_bump = true
 major_version_zero = false
 
+[tool.hatch.metadata]
+allow-direct-references = true
+
 [tool.uv.sources]
-surfplot = { git = "https://github.com/RicardoRyn/surfplot.git" }
+surfplot = { git = "https://github.com/danjgale/surfplot.git", rev = "9d59fa06c941b5ac2a8759b472f5db24883c8a48" }
+
+[[tool.uv.index]]
+name = "pypi"
+url = "https://pypi.org/simple/"
+publish-url = "https://upload.pypi.org/legacy/"
+explicit = true
+
+[[tool.uv.index]]
+name = "testpypi"
+url = "https://test.pypi.org/simple/"
+publish-url = "https://test.pypi.org/legacy/"
+explicit = true
+

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/src/plotfig/bar.py

@@ -282,8 +282,6 @@ def plot_one_group_bar_figure(
     if colors is None:
         colors = ["gray"] * len(data)
 
-    # 创建局部随机数生成器
-
     means, sds, ses = [], [], []
     x_positions = np.arange(len(labels_name))
     scatter_positions = []

{plotfig-1.3.0 → plotfig-1.3.2}/uv.lock

@@ -965,7 +965,7 @@ wheels = [
 
 [[package]]
 name = "plotfig"
-version = "1.3.0"
+version = "1.3.2"
 source = { editable = "." }
 dependencies = [
     { name = "matplotlib" },
@@ -995,7 +995,7 @@ requires-dist = [
     { name = "pandas", specifier = ">=2.2.3" },
     { name = "plotly", specifier = ">=6.0.1" },
     { name = "scipy", specifier = ">=1.15.2" },
-    { name = "surfplot", git = "https://github.com/RicardoRyn/surfplot.git" },
+    { name = "surfplot", git = "https://github.com/danjgale/surfplot.git?rev=9d59fa06c941b5ac2a8759b472f5db24883c8a48" },
 ]
 
 [package.metadata.requires-dev]
@@ -1249,7 +1249,7 @@ wheels = [
 [[package]]
 name = "surfplot"
 version = "0.2.0"
-source = { git = "https://github.com/RicardoRyn/surfplot.git#fdb914e17be0b05d9a7ba64b3df8ef103107b21a" }
+source = { git = "https://github.com/danjgale/surfplot.git?rev=9d59fa06c941b5ac2a8759b472f5db24883c8a48#9d59fa06c941b5ac2a8759b472f5db24883c8a48" }
 dependencies = [
     { name = "brainspace" },
     { name = "matplotlib" },

plotfig-1.3.0/overrides/main.html

@@ -1,5 +0,0 @@
-{% extends "base.html" %}
-
-{% block announce %}
-  <strong>📢 新功能：允许绘制单组小提琴图！点击<a href="/plotfig/changelog">更新日志</a>了解更多。</strong>
-{% endblock %}