niwrap-freesurfer 0.6.3__tar.gz → 0.8.1__tar.gz

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
Files changed (1400) hide show
  1. niwrap_freesurfer-0.8.1/PKG-INFO +8 -0
  2. niwrap_freesurfer-0.8.1/pyproject.toml +17 -0
  3. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/__init__.py +1429 -0
  4. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/analyzeto4dfp.py +262 -0
  5. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/anatomi_cuts_utils.py +176 -0
  6. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/annot2std.py +460 -0
  7. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ants_denoise_image_fs.py +208 -0
  8. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ants_n4_bias_field_correction_fs.py +294 -0
  9. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparc2feat.py +306 -0
  10. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparc_stats_aseg.py +502 -0
  11. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparcstats2table.py +448 -0
  12. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparcstatsdiff.py +241 -0
  13. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/apas2aseg.py +215 -0
  14. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/apply_morph.py +244 -0
  15. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aseg2feat.py +303 -0
  16. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/asegstats2table.py +580 -0
  17. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/asegstatsdiff.py +202 -0
  18. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/avi2talxfm.py +212 -0
  19. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bblabel.py +327 -0
  20. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bbmask.py +292 -0
  21. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bbregister.py +427 -0
  22. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bedpostx_mgh.py +294 -0
  23. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/beta2sxa.py +230 -0
  24. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/biasfield.py +254 -0
  25. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bmedits2surf.py +324 -0
  26. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/brec.py +184 -0
  27. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/browse_minc_header_tcl.py +172 -0
  28. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bugr.py +222 -0
  29. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/build_desikan_killiany_gcs_csh.py +172 -0
  30. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/cblumwmgyri.py +260 -0
  31. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/check_mcr_sh.py +173 -0
  32. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/check_recons_sh.py +175 -0
  33. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/check_subject.py +170 -0
  34. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_interrater_variability_csh.py +247 -0
  35. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_label_volumes_csh.py +320 -0
  36. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_vox2vox.py +196 -0
  37. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/conf2hires.py +480 -0
  38. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/connected_components.py +206 -0
  39. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/cor_to_minc.py +186 -0
  40. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/cp_dicom.py +205 -0
  41. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/create_morph.py +257 -0
  42. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/csvprint.py +170 -0
  43. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdir_info_mgh.py +231 -0
  44. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdjpeg_fs.py +754 -0
  45. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdrle_fs.py +617 -0
  46. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmsplit.py +304 -0
  47. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmunpack.py +769 -0
  48. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/deface_subject.py +224 -0
  49. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/defect2seg.py +313 -0
  50. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/defect_seg.py +246 -0
  51. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dicom_rename.py +225 -0
  52. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/diffusion_utils.py +173 -0
  53. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_ac_sh.py +171 -0
  54. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_anatomi_cuts.py +276 -0
  55. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_bset.py +340 -0
  56. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_colored_fa.py +186 -0
  57. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_extract_surface_measurements.py +377 -0
  58. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_forrest.py +304 -0
  59. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_group.py +268 -0
  60. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_group_by_endpoints.py +205 -0
  61. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_match.py +330 -0
  62. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_mergepaths.py +270 -0
  63. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_motion.py +343 -0
  64. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_neighboring_regions.py +186 -0
  65. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_paths.py +776 -0
  66. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_pathstats.py +500 -0
  67. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_project_end_points.py +265 -0
  68. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_save_histograms.py +238 -0
  69. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_spline.py +303 -0
  70. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_stats_ac.py +243 -0
  71. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_train.py +633 -0
  72. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_trk2trk.py +636 -0
  73. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_violin_plots.py +205 -0
  74. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_vox2vox.py +371 -0
  75. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dt_recon.py +460 -0
  76. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/export_gcam.py +299 -0
  77. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/extract_seg_waveform.py +293 -0
  78. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/exvivo_hemi_proc.py +386 -0
  79. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/feat2segstats.py +469 -0
  80. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/feat2surf.py +344 -0
  81. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fiducials_calibration.py +175 -0
  82. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fiducials_correction.py +192 -0
  83. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject.py +175 -0
  84. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject_corrected.py +183 -0
  85. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject_corrected_rh.py +176 -0
  86. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject_rh.py +191 -0
  87. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fixup_mni_paths.py +210 -0
  88. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/flip_4dfp.py +252 -0
  89. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/flirt_newdefault_20080811_sch.py +204 -0
  90. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fname2ext.py +175 -0
  91. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fname2stem.py +174 -0
  92. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/freeview.py +171 -0
  93. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_check_version.py +267 -0
  94. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_install_mcr.py +172 -0
  95. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_lib_check.py +225 -0
  96. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_print_help.py +173 -0
  97. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_run_from_mcr.py +216 -0
  98. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_spmreg_glnxa64.py +186 -0
  99. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_temp_dir.py +193 -0
  100. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_temp_file.py +271 -0
  101. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_time.py +240 -0
  102. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_tutorial_data.py +177 -0
  103. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_update.py +215 -0
  104. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fscalc.py +299 -0
  105. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsdcmdecompress.py +248 -0
  106. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_5_0_2_xyztrans_sch.py +204 -0
  107. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_label2voxel.py +212 -0
  108. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_rigid_register.py +523 -0
  109. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_sub_mgh.py +382 -0
  110. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fslregister.py +647 -0
  111. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fspalm.py +370 -0
  112. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_coreg.py +262 -0
  113. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_getxopts.py +171 -0
  114. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_import.py +306 -0
  115. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsrealpath.py +184 -0
  116. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsvglrun.py +236 -0
  117. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fvcompare.py +570 -0
  118. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gauss_4dfp.py +251 -0
  119. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gca_apply.py +464 -0
  120. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcainit.py +173 -0
  121. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcaprepone.py +251 -0
  122. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcatrain.py +457 -0
  123. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcatrainskull.py +173 -0
  124. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gdcmconv_fs.py +766 -0
  125. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gems_compute_atlas_probs.py +418 -0
  126. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/get_label_thickness.py +170 -0
  127. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/getfullpath.py +170 -0
  128. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/grad_unwarp.py +306 -0
  129. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/groupstats.py +422 -0
  130. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/groupstatsdiff.py +465 -0
  131. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gtmseg.py +447 -0
  132. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/hiam_make_surfaces.py +187 -0
  133. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/hiam_make_template.py +212 -0
  134. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/hiam_register.py +201 -0
  135. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/histo_compute_joint_density.py +199 -0
  136. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/histo_register_block.py +256 -0
  137. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/histo_synthesize.py +199 -0
  138. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ico_supersample.py +207 -0
  139. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ifh2hdr.py +189 -0
  140. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/imgreg_4dfp.py +235 -0
  141. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject.py +174 -0
  142. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject3.py +183 -0
  143. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_lh.py +187 -0
  144. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_new.py +170 -0
  145. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_new_lh.py +176 -0
  146. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_new_rh.py +178 -0
  147. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_rh.py +178 -0
  148. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_sc.py +203 -0
  149. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/irepifitvol.py +186 -0
  150. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/irepifitvol_glnx64.py +188 -0
  151. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/is_lta.py +194 -0
  152. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/is_surface.py +175 -0
  153. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isanalyze.py +170 -0
  154. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isnifti.py +170 -0
  155. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isolate_labels_csh.py +271 -0
  156. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isolate_labels_keeporigval_csh.py +238 -0
  157. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/jkgcatrain.py +235 -0
  158. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label2flat.py +212 -0
  159. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label2patch.py +312 -0
  160. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_elderly_subject.py +215 -0
  161. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_subject.py +190 -0
  162. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_subject_flash.py +230 -0
  163. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_subject_mixed.py +228 -0
  164. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/labels_disjoint.py +205 -0
  165. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/labels_intersect.py +199 -0
  166. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/labels_union.py +201 -0
  167. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/list_otl_labels.py +173 -0
  168. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/listsubj.py +296 -0
  169. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_create_base_sigma.py +187 -0
  170. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_create_orig.py +189 -0
  171. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_mris_slopes.py +717 -0
  172. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_qdec_table.py +243 -0
  173. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_stats_combine.py +299 -0
  174. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_stats_slopes.py +614 -0
  175. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_stats_tps.py +289 -0
  176. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_submit_jobs.py +562 -0
  177. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_submit_postproc.py +290 -0
  178. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/longmc.py +263 -0
  179. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/lpcregister.py +381 -0
  180. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/lta_convert.py +509 -0
  181. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/lta_diff.py +289 -0
  182. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_subcort.py +196 -0
  183. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_subject.py +500 -0
  184. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_surface.py +502 -0
  185. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_volume.py +392 -0
  186. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_cortex_label.py +231 -0
  187. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_exvivo_filled.py +209 -0
  188. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_folding_atlas.py +480 -0
  189. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_hemi_mask.py +203 -0
  190. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_segvol_table.py +338 -0
  191. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_symmetric.py +223 -0
  192. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_upright.py +203 -0
  193. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/makevol.py +298 -0
  194. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_all_labels.py +241 -0
  195. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_all_labels_lh.py +246 -0
  196. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_central_sulcus.py +742 -0
  197. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_to_base.py +247 -0
  198. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/meanval.py +222 -0
  199. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/merge_stats_tables.py +418 -0
  200. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mergeseg.py +276 -0
  201. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mideface.py +649 -0
  202. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/minc2seqinfo.py +186 -0
  203. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkheadsurf.py +601 -0
  204. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkima_index_tcl.py +187 -0
  205. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkmnc_index_tcl.py +186 -0
  206. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mksubjdirs.py +259 -0
  207. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mksurfatlas.py +309 -0
  208. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkxsubjreg.py +289 -0
  209. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mmppsp.py +331 -0
  210. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mni152reg.py +240 -0
  211. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_only_subject.py +175 -0
  212. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_only_subject_lh.py +176 -0
  213. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_only_subject_rh.py +181 -0
  214. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_rgb_lh.py +179 -0
  215. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_rgb_rh.py +173 -0
  216. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_subject.py +172 -0
  217. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_subject_lh.py +173 -0
  218. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_subject_rh.py +173 -0
  219. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_tables_lh.py +192 -0
  220. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_tables_rh.py +176 -0
  221. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mpr2mni305.py +170 -0
  222. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_3d_photo_recon.py +408 -0
  223. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_add_new_tp.py +185 -0
  224. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_add_xform_to_header.py +227 -0
  225. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_align_long_csh.py +178 -0
  226. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_and.py +173 -0
  227. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_annotation2label.py +480 -0
  228. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_aparc2aseg.py +499 -0
  229. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_aparc2wmseg.py +219 -0
  230. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_apply_bias.py +201 -0
  231. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_average.py +498 -0
  232. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_binarize.py +710 -0
  233. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_brain_volume.py +218 -0
  234. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_brainvol_stats.py +246 -0
  235. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_label.py +1033 -0
  236. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_normalize.py +625 -0
  237. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_register.py +779 -0
  238. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_tissue_parms.py +217 -0
  239. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_train.py +414 -0
  240. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cal_renormalize_gca.py +225 -0
  241. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cc.py +356 -0
  242. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cnr.py +301 -0
  243. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compile_edits.py +188 -0
  244. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_bias.py +191 -0
  245. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_change_map.py +249 -0
  246. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_distances.py +201 -0
  247. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_layer_fractions.py +378 -0
  248. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_overlap.py +342 -0
  249. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_seg_overlap.py +321 -0
  250. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_volume_fractions.py +584 -0
  251. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_volume_intensities.py +201 -0
  252. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_concat.py +877 -0
  253. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_concatenate_gcam.py +273 -0
  254. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_concatenate_lta.py +338 -0
  255. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_convert.py +452 -0
  256. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_copy_params.py +215 -0
  257. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_copy_values.py +199 -0
  258. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cor2label.py +380 -0
  259. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_coreg.py +1072 -0
  260. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_correct_segmentations.py +183 -0
  261. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_create_t2combined.py +260 -0
  262. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_create_tests.py +476 -0
  263. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cvs_check.py +243 -0
  264. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cvs_data_copy.py +237 -0
  265. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cvs_register.py +601 -0
  266. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_dct_align.py +199 -0
  267. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_dct_align_binary.py +199 -0
  268. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_deface.py +214 -0
  269. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_defacer.py +575 -0
  270. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_diff.py +638 -0
  271. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_dist_surf_label.py +199 -0
  272. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_distance_transform.py +228 -0
  273. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_easyreg.py +342 -0
  274. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_easywarp.py +244 -0
  275. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_edit_segmentation.py +199 -0
  276. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_edit_segmentation_with_surfaces.py +299 -0
  277. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_edit_wm_with_aseg.py +372 -0
  278. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_em_register.py +1096 -0
  279. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_entowm_seg.py +587 -0
  280. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_evaluate_morph.py +204 -0
  281. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract.py +226 -0
  282. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract_fcd_features.py +215 -0
  283. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract_label.py +288 -0
  284. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract_largest_cc.py +274 -0
  285. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_exvivo_norm.py +404 -0
  286. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_exvivo_strip.py +361 -0
  287. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fdr.py +316 -0
  288. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fieldsign.py +543 -0
  289. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fill.py +492 -0
  290. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fit_bias.py +360 -0
  291. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fslmat_to_lta.py +215 -0
  292. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_func2sph.py +291 -0
  293. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_funcvits.py +359 -0
  294. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fuse_intensity_images.py +214 -0
  295. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fuse_segmentations.py +286 -0
  296. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fwhm.py +747 -0
  297. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gca_ambiguous.py +188 -0
  298. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gcab_train.py +177 -0
  299. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gcut.py +244 -0
  300. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gdfglm.py +179 -0
  301. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_glmfit.py +1376 -0
  302. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_glmfit_sim.py +662 -0
  303. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gradient_info.py +173 -0
  304. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gradunwarp.py +345 -0
  305. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gtmpvc.py +1158 -0
  306. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gtmseg.py +499 -0
  307. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_hausdorff_dist.py +285 -0
  308. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_head.py +241 -0
  309. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_hires_register.py +212 -0
  310. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_histo_eq.py +183 -0
  311. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_info.py +900 -0
  312. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_jacobian.py +364 -0
  313. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_joint_density.py +199 -0
  314. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label2label.py +924 -0
  315. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label2vol.py +487 -0
  316. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label_histo.py +212 -0
  317. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label_vals.py +213 -0
  318. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label_volume.py +429 -0
  319. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_linear_align.py +196 -0
  320. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_linear_align_binary.py +218 -0
  321. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_linear_register.py +199 -0
  322. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_log_likelihood.py +199 -0
  323. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_long_normalize.py +346 -0
  324. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_make_bem_surfaces.py +190 -0
  325. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_make_uchar.py +290 -0
  326. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_map_cpdat.py +262 -0
  327. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_maps2csd.py +339 -0
  328. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mark_temporal_lobe.py +217 -0
  329. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mask.py +513 -0
  330. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_matrix_multiply.py +278 -0
  331. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mc.py +215 -0
  332. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mcsim.py +542 -0
  333. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mergelabels.py +212 -0
  334. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mi.py +216 -0
  335. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_modify.py +387 -0
  336. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_morphology.py +239 -0
  337. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_motion_correct.py +189 -0
  338. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_motion_correct2.py +320 -0
  339. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ms_fitparms.py +739 -0
  340. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nl_align.py +958 -0
  341. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nl_align_binary.py +199 -0
  342. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nlfilter.py +345 -0
  343. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_normalize.py +723 -0
  344. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_normalize_tp2.py +338 -0
  345. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nu_correct_mni.py +372 -0
  346. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_or.py +191 -0
  347. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_paint.py +243 -0
  348. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_parse_sdcmdir.py +236 -0
  349. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_path2label.py +347 -0
  350. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_polv.py +206 -0
  351. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_pretess.py +294 -0
  352. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_probe_ima.py +299 -0
  353. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_probedicom.py +207 -0
  354. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_reduce.py +186 -0
  355. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_refine_seg.py +208 -0
  356. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_relabel_hypointensities.py +199 -0
  357. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_relabel_nonwm_hypos.py +258 -0
  358. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_remove_neck.py +212 -0
  359. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_reorient_lr_csh.py +264 -0
  360. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_label.py +839 -0
  361. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_long_label.py +171 -0
  362. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_long_train.py +310 -0
  363. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_train.py +309 -0
  364. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ribbon.py +229 -0
  365. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rigid_register.py +199 -0
  366. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_robust_register.py +985 -0
  367. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_robust_template.py +807 -0
  368. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_sbbr.py +549 -0
  369. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_sclimbic_seg.py +574 -0
  370. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_seg_diff.py +322 -0
  371. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_seg_overlap.py +328 -0
  372. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segcentroids.py +271 -0
  373. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_seghead.py +414 -0
  374. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segment.py +708 -0
  375. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segment_hypothalamic_subunits.py +380 -0
  376. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segment_thalamic_nuclei_dti_cnn.py +335 -0
  377. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segreg.py +188 -0
  378. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segstats.py +1159 -0
  379. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_sph2surf.py +315 -0
  380. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_stats2seg.py +236 -0
  381. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_stopmask.py +360 -0
  382. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_strip_nonwhite.py +216 -0
  383. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_strip_subject_info.py +186 -0
  384. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surf2surf.py +1108 -0
  385. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surf2vol.py +642 -0
  386. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surf2volseg.py +598 -0
  387. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surfacemask.py +203 -0
  388. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surfcluster.py +855 -0
  389. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthesize.py +256 -0
  390. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthmorph.py +392 -0
  391. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthseg.py +397 -0
  392. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthsr.py +313 -0
  393. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthsr_hyperfine.py +251 -0
  394. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthstrip.py +275 -0
  395. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_tessellate.py +250 -0
  396. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_threshold.py +249 -0
  397. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_topologycorrection.py +186 -0
  398. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_train.py +186 -0
  399. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_transform.py +230 -0
  400. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_twoclass.py +262 -0
  401. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_validate_skull_stripped.py +198 -0
  402. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vessel_segment.py +238 -0
  403. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vol2label.py +367 -0
  404. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vol2surf.py +323 -0
  405. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vol2vol.py +895 -0
  406. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_volcluster.py +962 -0
  407. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_voldiff.py +295 -0
  408. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_volsynth.py +941 -0
  409. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_warp_convert.py +395 -0
  410. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_watershed.py +659 -0
  411. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_wbc.py +437 -0
  412. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_xvolavg.py +232 -0
  413. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_z2p.py +404 -0
  414. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris2rgb.py +175 -0
  415. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_aa_shrinkwrap.py +267 -0
  416. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_add_template.py +174 -0
  417. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_anatomical_stats.py +395 -0
  418. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_annot_diff.py +211 -0
  419. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_annot_to_segmentation.py +238 -0
  420. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_apply_reg.py +524 -0
  421. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_autodet_gwstats.py +413 -0
  422. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_average_curvature.py +261 -0
  423. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ba_segment.py +214 -0
  424. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ca_deform.py +229 -0
  425. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ca_label.py +465 -0
  426. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ca_train.py +565 -0
  427. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_calc.py +261 -0
  428. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_acorr.py +248 -0
  429. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_layer_intensities.py +214 -0
  430. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_lgi.py +263 -0
  431. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_overlap.py +275 -0
  432. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_parc_overlap.py +412 -0
  433. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_volume_fractions.py +252 -0
  434. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_congeal.py +409 -0
  435. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_convert.py +763 -0
  436. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_copy_header.py +203 -0
  437. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_curvature.py +399 -0
  438. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_curvature2image.py +289 -0
  439. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_curvature_stats.py +758 -0
  440. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_defects_pointset.py +241 -0
  441. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_deform.py +214 -0
  442. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_diff.py +616 -0
  443. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_distance_map.py +188 -0
  444. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_distance_to_label.py +187 -0
  445. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_distance_transform.py +281 -0
  446. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_divide_parcellation.py +263 -0
  447. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_entropy.py +245 -0
  448. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_errors.py +170 -0
  449. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_estimate_wm.py +302 -0
  450. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_euler_number.py +190 -0
  451. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_expand.py +268 -0
  452. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_extract_main_component.py +186 -0
  453. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_extract_patches.py +183 -0
  454. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_extract_values.py +261 -0
  455. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_exvivo_surfaces.py +283 -0
  456. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_fill.py +221 -0
  457. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_find_flat_regions.py +206 -0
  458. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_fix_topology.py +557 -0
  459. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_flatten.py +296 -0
  460. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_fwhm.py +653 -0
  461. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_gradient.py +203 -0
  462. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_hausdorff_dist.py +220 -0
  463. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_image2vtk.py +253 -0
  464. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_inflate.py +305 -0
  465. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_info.py +536 -0
  466. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_init_global_tractography.py +196 -0
  467. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_intensity_profile.py +387 -0
  468. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_interpolate_warp.py +196 -0
  469. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_jacobian.py +241 -0
  470. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label2annot.py +388 -0
  471. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label_area.py +275 -0
  472. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label_calc.py +233 -0
  473. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label_mode.py +270 -0
  474. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_left_right_register.py +219 -0
  475. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_average_surface.py +401 -0
  476. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_face_parcellation.py +218 -0
  477. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_surfaces.py +1057 -0
  478. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_template.py +399 -0
  479. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_map_cuts.py +183 -0
  480. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_mef_surfaces.py +254 -0
  481. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_merge_parcellations.py +215 -0
  482. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_mesh_subdivide.py +232 -0
  483. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_morph_stats.py +218 -0
  484. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ms_refine.py +308 -0
  485. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multimodal.py +321 -0
  486. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multimodal_surface_placement.py +412 -0
  487. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multiscale_stats.py +246 -0
  488. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_niters2fwhm.py +295 -0
  489. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_nudge.py +225 -0
  490. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_parcellate_connectivity.py +218 -0
  491. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_place_surface.py +915 -0
  492. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_pmake.py +376 -0
  493. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_preproc.py +981 -0
  494. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_profile_clustering.py +200 -0
  495. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_refine_surfaces.py +279 -0
  496. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register.py +1191 -0
  497. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_label_map.py +327 -0
  498. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_label.py +356 -0
  499. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_volume.py +644 -0
  500. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remesh.py +278 -0
  501. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_intersection.py +236 -0
  502. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_negative_vertices.py +199 -0
  503. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_variance.py +216 -0
  504. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reposition_surface.py +275 -0
  505. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_resample.py +265 -0
  506. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rescale.py +186 -0
  507. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reverse.py +186 -0
  508. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_label.py +230 -0
  509. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_train.py +222 -0
  510. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rotate.py +258 -0
  511. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_label.py +199 -0
  512. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_parc.py +544 -0
  513. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_seg2annot.py +338 -0
  514. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment.py +202 -0
  515. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment_vals.py +233 -0
  516. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segmentation_stats.py +215 -0
  517. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_shrinkwrap.py +211 -0
  518. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_simulate_atrophy.py +259 -0
  519. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_skeletonize.py +412 -0
  520. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth.py +354 -0
  521. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth_intracortical.py +342 -0
  522. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sphere.py +199 -0
  523. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_spherical_average.py +377 -0
  524. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surf2vtk.py +192 -0
  525. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_stats.py +396 -0
  526. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_to_vol_distances.py +215 -0
  527. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_talairach.py +170 -0
  528. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_target_pos.py +368 -0
  529. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness.py +282 -0
  530. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_comparison.py +227 -0
  531. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_diff.py +376 -0
  532. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_topo_fixer.py +186 -0
  533. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transform.py +255 -0
  534. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_translate_annotation.py +225 -0
  535. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transmantle_dysplasia_paths.py +263 -0
  536. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask.py +467 -0
  537. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_novtk.py +451 -0
  538. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_vtk.py +477 -0
  539. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volsmooth.py +389 -0
  540. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volume.py +186 -0
  541. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_warp.py +289 -0
  542. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_watershed.py +237 -0
  543. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_wm_volume.py +250 -0
  544. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_paint.py +414 -0
  545. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_write.py +334 -0
  546. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ms_refine_subject.py +172 -0
  547. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/nmovie_qt.py +175 -0
  548. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/oct_register_mosaic.py +227 -0
  549. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/optseq2.py +738 -0
  550. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/orient_las.py +202 -0
  551. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/parc_atlas_jackknife_test.py +346 -0
  552. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/pctsurfcon.py +359 -0
  553. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/plot_structure_stats_tcl.py +186 -0
  554. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/pointset2label.py +226 -0
  555. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/polyorder.py +207 -0
  556. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/post_recon_all.py +442 -0
  557. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/predict_v1_sh.py +251 -0
  558. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/print_unique_labels_csh.py +235 -0
  559. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/qatools_py.py +279 -0
  560. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_brainstem_structures_sh.py +193 -0
  561. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_hasubregions_sh.py +215 -0
  562. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_thalamic_nuclei_sh.py +200 -0
  563. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rbbr.py +509 -0
  564. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_base_init.py +202 -0
  565. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config.py +218 -0
  566. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config2csh.py +175 -0
  567. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_fix_ento.py +250 -0
  568. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_long_tp_init.py +253 -0
  569. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rcbf_prep.py +275 -0
  570. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all.py +1264 -0
  571. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_clinical_sh.py +214 -0
  572. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_exvivo.py +204 -0
  573. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reconbatchjobs.py +186 -0
  574. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reg2subject.py +175 -0
  575. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_feat2anat.py +432 -0
  576. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_mni305_2mm.py +196 -0
  577. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/regdat2xfm.py +183 -0
  578. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_child.py +189 -0
  579. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_csh.py +200 -0
  580. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_elderly_subject.py +257 -0
  581. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_subject.py +249 -0
  582. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_subject_flash.py +176 -0
  583. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject.py +171 -0
  584. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_lh.py +176 -0
  585. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_rh.py +191 -0
  586. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/remove_talairach.py +190 -0
  587. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_subject_keep_editting.py +178 -0
  588. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_t1_subject.py +172 -0
  589. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reregister_subject_mixed.py +208 -0
  590. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rtview.py +383 -0
  591. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_mris_preproc.py +186 -0
  592. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_qdec_glm.py +173 -0
  593. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg.py +694 -0
  594. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg_long.py +536 -0
  595. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subfields_t1_longitudinal_sh.py +188 -0
  596. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_sh.py +191 -0
  597. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +186 -0
  598. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +190 -0
  599. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +195 -0
  600. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_thalamic_nuclei_sh.py +189 -0
  601. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg.py +903 -0
  602. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg2recon.py +352 -0
  603. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg_long.py +274 -0
  604. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samsegmesh2surf.py +263 -0
  605. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sbtiv.py +211 -0
  606. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/seg2filled.py +275 -0
  607. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/seg2recon.py +399 -0
  608. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_bs_sh.py +173 -0
  609. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_long_sh.py +186 -0
  610. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_sh.py +236 -0
  611. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t2_sh.py +191 -0
  612. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_monkey.py +175 -0
  613. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subfields_t1_longitudinal.py +199 -0
  614. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject.py +253 -0
  615. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal.py +170 -0
  616. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal2.py +180 -0
  617. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_old_skull_strip.py +256 -0
  618. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_sc.py +225 -0
  619. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml.py +188 -0
  620. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml.py +215 -0
  621. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml.py +174 -0
  622. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subregions.py +315 -0
  623. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei.py +186 -0
  624. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei_sh.py +186 -0
  625. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segpons.py +252 -0
  626. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/setlabelstat.py +224 -0
  627. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sfa2fieldsign.py +345 -0
  628. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/slicedelay.py +228 -0
  629. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject.py +200 -0
  630. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_lh.py +173 -0
  631. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_rh.py +175 -0
  632. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spline3_test.py +211 -0
  633. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spm_t_to_b.py +183 -0
  634. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spmregister.py +376 -0
  635. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sratio.py +219 -0
  636. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stat_normalize.py +288 -0
  637. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stattablediff.py +331 -0
  638. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stem2fname.py +176 -0
  639. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/surf2vol.py +457 -0
  640. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/surfreg.py +407 -0
  641. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_preprocess.py +295 -0
  642. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_process.py +359 -0
  643. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/t4img_4dfp.py +202 -0
  644. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/t4imgs_4dfp.py +349 -0
  645. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/table2map.py +262 -0
  646. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_compare.py +213 -0
  647. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_qc_azs.py +170 -0
  648. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach.py +222 -0
  649. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach2.py +184 -0
  650. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_afd.py +241 -0
  651. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_avi.py +242 -0
  652. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_mgh.py +186 -0
  653. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talsegprob.py +444 -0
  654. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_orientation_planes_from_parcellation.py +203 -0
  655. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_recon_all_csh.py +283 -0
  656. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_tutorials_sh.py +387 -0
  657. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/thickdiffmap.py +226 -0
  658. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmedit.py +188 -0
  659. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmeditfv.py +666 -0
  660. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2.py +269 -0
  661. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2_cmdl.py +1140 -0
  662. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregisterfv.py +664 -0
  663. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurfer.py +210 -0
  664. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurferfv.py +312 -0
  665. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_all.py +674 -0
  666. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_paths.py +359 -0
  667. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_preproc.py +341 -0
  668. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tractstats2table.py +317 -0
  669. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/train_gcs_atlas.py +356 -0
  670. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tridec.py +212 -0
  671. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trk_tools.py +263 -0
  672. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima1_tcl.py +190 -0
  673. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima_tcl.py +170 -0
  674. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_mnc_tcl.py +208 -0
  675. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir.py +191 -0
  676. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir2.py +170 -0
  677. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackmincdir.py +289 -0
  678. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpacksdcmdir.py +192 -0
  679. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/update_needed.py +204 -0
  680. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/v_3dvolreg_afni.py +200 -0
  681. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/v_4dfptoanalyze.py +238 -0
  682. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ventfix.py +190 -0
  683. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vertexvol.py +249 -0
  684. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vno_match_check.py +214 -0
  685. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2segavg.py +400 -0
  686. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2subfield.py +477 -0
  687. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2symsurf.py +298 -0
  688. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vsm_smooth.py +236 -0
  689. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wfilemask.py +253 -0
  690. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wm_anat_snr.py +270 -0
  691. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wmedits2surf.py +320 -0
  692. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wmsaseg.py +328 -0
  693. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xcerebralseg.py +328 -0
  694. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xcorr.py +259 -0
  695. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xfmrot.py +208 -0
  696. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemi_tal.py +175 -0
  697. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemireg.py +352 -0
  698. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xsanatreg.py +305 -0
  699. niwrap_freesurfer-0.8.1/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/zero_lt_4dfp.py +225 -0
  700. niwrap_freesurfer-0.6.3/.gitignore +0 -301
  701. niwrap_freesurfer-0.6.3/PKG-INFO +0 -8
  702. niwrap_freesurfer-0.6.3/README.md +0 -9
  703. niwrap_freesurfer-0.6.3/pyproject.toml +0 -17
  704. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/__init__.py +0 -715
  705. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/analyzeto4dfp.py +0 -234
  706. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/anatomi_cuts_utils.py +0 -176
  707. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/annot2std.py +0 -384
  708. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ants_denoise_image_fs.py +0 -201
  709. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ants_n4_bias_field_correction_fs.py +0 -269
  710. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparc2feat.py +0 -272
  711. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparc_stats_aseg.py +0 -402
  712. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparcstats2table.py +0 -372
  713. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aparcstatsdiff.py +0 -220
  714. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/apas2aseg.py +0 -211
  715. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/apply_morph.py +0 -220
  716. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/aseg2feat.py +0 -268
  717. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/asegstats2table.py +0 -468
  718. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/asegstatsdiff.py +0 -197
  719. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/avi2talxfm.py +0 -200
  720. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bblabel.py +0 -292
  721. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bbmask.py +0 -260
  722. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bbregister.py +0 -361
  723. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bedpostx_mgh.py +0 -267
  724. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/beta2sxa.py +0 -216
  725. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/biasfield.py +0 -231
  726. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bmedits2surf.py +0 -283
  727. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/brec.py +0 -181
  728. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/browse_minc_header_tcl.py +0 -172
  729. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/bugr.py +0 -210
  730. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/build_desikan_killiany_gcs_csh.py +0 -174
  731. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/cblumwmgyri.py +0 -242
  732. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/check_mcr_sh.py +0 -175
  733. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/check_recons_sh.py +0 -178
  734. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/check_subject.py +0 -172
  735. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_interrater_variability_csh.py +0 -230
  736. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_label_volumes_csh.py +0 -280
  737. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/compute_vox2vox.py +0 -192
  738. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/conf2hires.py +0 -387
  739. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/connected_components.py +0 -200
  740. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/cor_to_minc.py +0 -184
  741. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/cp_dicom.py +0 -197
  742. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/create_morph.py +0 -233
  743. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/csvprint.py +0 -172
  744. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdir_info_mgh.py +0 -219
  745. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdjpeg_fs.py +0 -555
  746. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmdrle_fs.py +0 -468
  747. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmsplit.py +0 -262
  748. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dcmunpack.py +0 -594
  749. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/deface_subject.py +0 -212
  750. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/defect2seg.py +0 -269
  751. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/defect_seg.py +0 -219
  752. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dicom_rename.py +0 -210
  753. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/diffusion_utils.py +0 -175
  754. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_ac_sh.py +0 -174
  755. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_anatomi_cuts.py +0 -247
  756. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_bset.py +0 -302
  757. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_colored_fa.py +0 -184
  758. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_extract_surface_measurements.py +0 -321
  759. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_forrest.py +0 -265
  760. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_group.py +0 -241
  761. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_group_by_endpoints.py +0 -197
  762. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_match.py +0 -284
  763. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_mergepaths.py +0 -238
  764. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_motion.py +0 -296
  765. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_neighboring_regions.py +0 -184
  766. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_paths.py +0 -636
  767. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_pathstats.py +0 -407
  768. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_project_end_points.py +0 -243
  769. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_save_histograms.py +0 -218
  770. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_spline.py +0 -274
  771. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_stats_ac.py +0 -223
  772. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_train.py +0 -476
  773. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_trk2trk.py +0 -507
  774. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_violin_plots.py +0 -197
  775. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dmri_vox2vox.py +0 -309
  776. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/dt_recon.py +0 -384
  777. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/export_gcam.py +0 -266
  778. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/extract_seg_waveform.py +0 -258
  779. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/exvivo_hemi_proc.py +0 -319
  780. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/feat2segstats.py +0 -384
  781. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/feat2surf.py +0 -305
  782. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fiducials_calibration.py +0 -178
  783. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fiducials_correction.py +0 -190
  784. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject.py +0 -178
  785. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject_corrected.py +0 -180
  786. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject_corrected_rh.py +0 -179
  787. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fix_subject_rh.py +0 -188
  788. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fixup_mni_paths.py +0 -213
  789. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/flip_4dfp.py +0 -230
  790. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/flirt_newdefault_20080811_sch.py +0 -195
  791. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fname2ext.py +0 -178
  792. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fname2stem.py +0 -176
  793. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/freeview.py +0 -174
  794. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_check_version.py +0 -241
  795. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_install_mcr.py +0 -174
  796. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_lib_check.py +0 -212
  797. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_print_help.py +0 -176
  798. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_run_from_mcr.py +0 -205
  799. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_spmreg_glnxa64.py +0 -184
  800. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_temp_dir.py +0 -192
  801. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_temp_file.py +0 -247
  802. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_time.py +0 -223
  803. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_tutorial_data.py +0 -178
  804. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fs_update.py +0 -203
  805. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fscalc.py +0 -266
  806. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsdcmdecompress.py +0 -226
  807. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_5_0_2_xyztrans_sch.py +0 -195
  808. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_label2voxel.py +0 -200
  809. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_rigid_register.py +0 -434
  810. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsl_sub_mgh.py +0 -335
  811. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fslregister.py +0 -520
  812. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fspalm.py +0 -310
  813. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_coreg.py +0 -243
  814. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_getxopts.py +0 -173
  815. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsr_import.py +0 -269
  816. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsrealpath.py +0 -181
  817. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fsvglrun.py +0 -217
  818. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/fvcompare.py +0 -453
  819. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gauss_4dfp.py +0 -231
  820. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gca_apply.py +0 -394
  821. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcainit.py +0 -175
  822. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcaprepone.py +0 -228
  823. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcatrain.py +0 -367
  824. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gcatrainskull.py +0 -175
  825. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gdcmconv_fs.py +0 -574
  826. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gems_compute_atlas_probs.py +0 -346
  827. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/get_label_thickness.py +0 -172
  828. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/getfullpath.py +0 -172
  829. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/grad_unwarp.py +0 -273
  830. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/groupstats.py +0 -351
  831. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/groupstatsdiff.py +0 -376
  832. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/gtmseg.py +0 -373
  833. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/hiam_make_surfaces.py +0 -182
  834. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/hiam_make_template.py +0 -196
  835. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/hiam_register.py +0 -194
  836. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/histo_compute_joint_density.py +0 -192
  837. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/histo_register_block.py +0 -230
  838. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/histo_synthesize.py +0 -192
  839. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ico_supersample.py +0 -199
  840. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ifh2hdr.py +0 -187
  841. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/imgreg_4dfp.py +0 -212
  842. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject.py +0 -178
  843. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject3.py +0 -180
  844. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_lh.py +0 -184
  845. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_new.py +0 -172
  846. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_new_lh.py +0 -179
  847. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_new_rh.py +0 -181
  848. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_rh.py +0 -181
  849. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/inflate_subject_sc.py +0 -196
  850. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/irepifitvol.py +0 -184
  851. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/irepifitvol_glnx64.py +0 -186
  852. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/is_lta.py +0 -192
  853. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/is_surface.py +0 -177
  854. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isanalyze.py +0 -172
  855. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isnifti.py +0 -172
  856. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isolate_labels_csh.py +0 -245
  857. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/isolate_labels_keeporigval_csh.py +0 -225
  858. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/jkgcatrain.py +0 -219
  859. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label2flat.py +0 -200
  860. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label2patch.py +0 -274
  861. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_elderly_subject.py +0 -204
  862. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_subject.py +0 -190
  863. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_subject_flash.py +0 -213
  864. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/label_subject_mixed.py +0 -211
  865. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/labels_disjoint.py +0 -198
  866. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/labels_intersect.py +0 -192
  867. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/labels_union.py +0 -194
  868. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/list_otl_labels.py +0 -175
  869. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/listsubj.py +0 -253
  870. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_create_base_sigma.py +0 -184
  871. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_create_orig.py +0 -189
  872. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_mris_slopes.py +0 -574
  873. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_qdec_table.py +0 -229
  874. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_stats_combine.py +0 -269
  875. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_stats_slopes.py +0 -499
  876. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_stats_tps.py +0 -258
  877. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_submit_jobs.py +0 -459
  878. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/long_submit_postproc.py +0 -262
  879. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/longmc.py +0 -236
  880. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/lpcregister.py +0 -326
  881. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/lta_convert.py +0 -429
  882. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/lta_diff.py +0 -260
  883. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_subcort.py +0 -189
  884. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_subject.py +0 -402
  885. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_surface.py +0 -399
  886. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_average_volume.py +0 -327
  887. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_cortex_label.py +0 -218
  888. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_exvivo_filled.py +0 -196
  889. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_folding_atlas.py +0 -399
  890. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_hemi_mask.py +0 -196
  891. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_segvol_table.py +0 -295
  892. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_symmetric.py +0 -211
  893. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/make_upright.py +0 -196
  894. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/makevol.py +0 -274
  895. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_all_labels.py +0 -216
  896. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_all_labels_lh.py +0 -221
  897. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_central_sulcus.py +0 -584
  898. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/map_to_base.py +0 -231
  899. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/meanval.py +0 -210
  900. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/merge_stats_tables.py +0 -353
  901. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mergeseg.py +0 -253
  902. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mideface.py +0 -521
  903. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/minc2seqinfo.py +0 -184
  904. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkheadsurf.py +0 -491
  905. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkima_index_tcl.py +0 -185
  906. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkmnc_index_tcl.py +0 -184
  907. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mksubjdirs.py +0 -232
  908. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mksurfatlas.py +0 -271
  909. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mkxsubjreg.py +0 -260
  910. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mmppsp.py +0 -287
  911. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mni152reg.py +0 -224
  912. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_only_subject.py +0 -178
  913. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_only_subject_lh.py +0 -179
  914. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_only_subject_rh.py +0 -184
  915. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_rgb_lh.py +0 -181
  916. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_rgb_rh.py +0 -175
  917. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_subject.py +0 -174
  918. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_subject_lh.py +0 -175
  919. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_subject_rh.py +0 -175
  920. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_tables_lh.py +0 -190
  921. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/morph_tables_rh.py +0 -179
  922. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mpr2mni305.py +0 -172
  923. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_3d_photo_recon.py +0 -345
  924. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_add_new_tp.py +0 -182
  925. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_add_xform_to_header.py +0 -210
  926. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_align_long_csh.py +0 -181
  927. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_and.py +0 -172
  928. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_annotation2label.py +0 -405
  929. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_aparc2aseg.py +0 -411
  930. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_aparc2wmseg.py +0 -206
  931. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_apply_bias.py +0 -194
  932. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_average.py +0 -397
  933. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_binarize.py +0 -560
  934. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_brain_volume.py +0 -208
  935. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_brainvol_stats.py +0 -231
  936. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_label.py +0 -802
  937. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_normalize.py +0 -503
  938. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_register.py +0 -616
  939. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_tissue_parms.py +0 -202
  940. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ca_train.py +0 -342
  941. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cal_renormalize_gca.py +0 -208
  942. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cc.py +0 -313
  943. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cnr.py +0 -256
  944. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compile_edits.py +0 -186
  945. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_bias.py +0 -186
  946. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_change_map.py +0 -228
  947. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_distances.py +0 -194
  948. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_layer_fractions.py +0 -324
  949. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_overlap.py +0 -285
  950. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_seg_overlap.py +0 -282
  951. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_volume_fractions.py +0 -482
  952. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_compute_volume_intensities.py +0 -194
  953. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_concat.py +0 -653
  954. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_concatenate_gcam.py +0 -245
  955. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_concatenate_lta.py +0 -291
  956. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_convert.py +0 -373
  957. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_copy_params.py +0 -203
  958. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_copy_values.py +0 -192
  959. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cor2label.py +0 -325
  960. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_coreg.py +0 -813
  961. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_correct_segmentations.py +0 -180
  962. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_create_t2combined.py +0 -234
  963. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_create_tests.py +0 -401
  964. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cvs_check.py +0 -225
  965. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cvs_data_copy.py +0 -219
  966. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_cvs_register.py +0 -480
  967. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_dct_align.py +0 -192
  968. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_dct_align_binary.py +0 -192
  969. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_deface.py +0 -202
  970. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_defacer.py +0 -456
  971. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_diff.py +0 -499
  972. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_dist_surf_label.py +0 -192
  973. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_distance_transform.py +0 -212
  974. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_easyreg.py +0 -307
  975. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_easywarp.py +0 -229
  976. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_edit_segmentation.py +0 -192
  977. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_edit_segmentation_with_surfaces.py +0 -267
  978. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_edit_wm_with_aseg.py +0 -312
  979. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_em_register.py +0 -847
  980. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_entowm_seg.py +0 -478
  981. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_evaluate_morph.py +0 -194
  982. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract.py +0 -211
  983. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract_fcd_features.py +0 -203
  984. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract_label.py +0 -257
  985. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_extract_largest_cc.py +0 -249
  986. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_exvivo_norm.py +0 -345
  987. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_exvivo_strip.py +0 -316
  988. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fdr.py +0 -275
  989. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fieldsign.py +0 -430
  990. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fill.py +0 -392
  991. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fit_bias.py +0 -313
  992. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fslmat_to_lta.py +0 -203
  993. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_func2sph.py +0 -260
  994. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_funcvits.py +0 -312
  995. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fuse_intensity_images.py +0 -202
  996. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fuse_segmentations.py +0 -249
  997. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_fwhm.py +0 -603
  998. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gca_ambiguous.py +0 -186
  999. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gcab_train.py +0 -180
  1000. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gcut.py +0 -227
  1001. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gdfglm.py +0 -181
  1002. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_glmfit.py +0 -1023
  1003. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_glmfit_sim.py +0 -537
  1004. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gradient_info.py +0 -176
  1005. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gradunwarp.py +0 -304
  1006. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gtmpvc.py +0 -879
  1007. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_gtmseg.py +0 -401
  1008. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_hausdorff_dist.py +0 -256
  1009. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_head.py +0 -219
  1010. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_hires_register.py +0 -200
  1011. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_histo_eq.py +0 -180
  1012. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_info.py +0 -646
  1013. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_jacobian.py +0 -299
  1014. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_joint_density.py +0 -192
  1015. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label2label.py +0 -740
  1016. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label2vol.py +0 -414
  1017. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label_histo.py +0 -200
  1018. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label_vals.py +0 -200
  1019. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_label_volume.py +0 -366
  1020. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_linear_align.py +0 -188
  1021. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_linear_align_binary.py +0 -207
  1022. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_linear_register.py +0 -192
  1023. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_log_likelihood.py +0 -188
  1024. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_long_normalize.py +0 -290
  1025. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_make_bem_surfaces.py +0 -189
  1026. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_make_uchar.py +0 -261
  1027. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_map_cpdat.py +0 -244
  1028. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_maps2csd.py +0 -296
  1029. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mark_temporal_lobe.py +0 -204
  1030. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mask.py +0 -420
  1031. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_matrix_multiply.py +0 -245
  1032. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mc.py +0 -205
  1033. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mcsim.py +0 -438
  1034. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mergelabels.py +0 -203
  1035. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_mi.py +0 -204
  1036. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_modify.py +0 -312
  1037. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_morphology.py +0 -221
  1038. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_motion_correct.py +0 -184
  1039. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_motion_correct2.py +0 -278
  1040. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ms_fitparms.py +0 -577
  1041. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nl_align.py +0 -749
  1042. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nl_align_binary.py +0 -192
  1043. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nlfilter.py +0 -296
  1044. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_normalize.py +0 -583
  1045. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_normalize_tp2.py +0 -297
  1046. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_nu_correct_mni.py +0 -319
  1047. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_or.py +0 -185
  1048. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_paint.py +0 -222
  1049. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_parse_sdcmdir.py +0 -219
  1050. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_path2label.py +0 -293
  1051. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_polv.py +0 -199
  1052. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_pretess.py +0 -253
  1053. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_probe_ima.py +0 -265
  1054. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_probedicom.py +0 -202
  1055. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_reduce.py +0 -184
  1056. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_refine_seg.py +0 -201
  1057. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_relabel_hypointensities.py +0 -192
  1058. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_relabel_nonwm_hypos.py +0 -234
  1059. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_remove_neck.py +0 -200
  1060. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_reorient_lr_csh.py +0 -237
  1061. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_label.py +0 -641
  1062. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_long_label.py +0 -174
  1063. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_long_train.py +0 -271
  1064. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rf_train.py +0 -269
  1065. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_ribbon.py +0 -213
  1066. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_rigid_register.py +0 -192
  1067. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_robust_register.py +0 -775
  1068. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_robust_template.py +0 -622
  1069. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_sbbr.py +0 -452
  1070. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_sclimbic_seg.py +0 -463
  1071. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_seg_diff.py +0 -285
  1072. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_seg_overlap.py +0 -282
  1073. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segcentroids.py +0 -247
  1074. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_seghead.py +0 -351
  1075. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segment.py +0 -563
  1076. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segment_hypothalamic_subunits.py +0 -336
  1077. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segment_thalamic_nuclei_dti_cnn.py +0 -298
  1078. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segreg.py +0 -186
  1079. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_segstats.py +0 -903
  1080. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_sph2surf.py +0 -281
  1081. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_stats2seg.py +0 -219
  1082. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_stopmask.py +0 -306
  1083. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_strip_nonwhite.py +0 -204
  1084. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_strip_subject_info.py +0 -180
  1085. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surf2surf.py +0 -857
  1086. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surf2vol.py +0 -524
  1087. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surf2volseg.py +0 -487
  1088. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surfacemask.py +0 -196
  1089. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_surfcluster.py +0 -686
  1090. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthesize.py +0 -229
  1091. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthmorph.py +0 -342
  1092. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthseg.py +0 -334
  1093. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthsr.py +0 -272
  1094. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthsr_hyperfine.py +0 -235
  1095. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_synthstrip.py +0 -252
  1096. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_tessellate.py +0 -229
  1097. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_threshold.py +0 -229
  1098. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_topologycorrection.py +0 -184
  1099. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_train.py +0 -184
  1100. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_transform.py +0 -214
  1101. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_twoclass.py +0 -230
  1102. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_validate_skull_stripped.py +0 -188
  1103. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vessel_segment.py +0 -221
  1104. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vol2label.py +0 -323
  1105. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vol2surf.py +0 -289
  1106. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_vol2vol.py +0 -687
  1107. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_volcluster.py +0 -765
  1108. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_voldiff.py +0 -259
  1109. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_volsynth.py +0 -705
  1110. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_warp_convert.py +0 -346
  1111. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_watershed.py +0 -512
  1112. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_wbc.py +0 -367
  1113. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_xvolavg.py +0 -218
  1114. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mri_z2p.py +0 -335
  1115. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris2rgb.py +0 -177
  1116. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_aa_shrinkwrap.py +0 -240
  1117. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_add_template.py +0 -178
  1118. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_anatomical_stats.py +0 -337
  1119. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_annot_diff.py +0 -198
  1120. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_annot_to_segmentation.py +0 -216
  1121. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_apply_reg.py +0 -429
  1122. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_autodet_gwstats.py +0 -355
  1123. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_average_curvature.py +0 -230
  1124. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ba_segment.py +0 -202
  1125. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ca_deform.py +0 -212
  1126. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ca_label.py +0 -388
  1127. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ca_train.py +0 -453
  1128. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_calc.py +0 -243
  1129. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_acorr.py +0 -217
  1130. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_layer_intensities.py +0 -202
  1131. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_lgi.py +0 -244
  1132. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_overlap.py +0 -239
  1133. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_parc_overlap.py +0 -346
  1134. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_compute_volume_fractions.py +0 -230
  1135. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_congeal.py +0 -329
  1136. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_convert.py +0 -597
  1137. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_copy_header.py +0 -196
  1138. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_curvature.py +0 -352
  1139. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_curvature2image.py +0 -257
  1140. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_curvature_stats.py +0 -598
  1141. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_defects_pointset.py +0 -225
  1142. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_deform.py +0 -202
  1143. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_diff.py +0 -493
  1144. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_distance_map.py +0 -186
  1145. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_distance_to_label.py +0 -184
  1146. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_distance_transform.py +0 -250
  1147. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_divide_parcellation.py +0 -238
  1148. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_entropy.py +0 -224
  1149. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_errors.py +0 -172
  1150. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_estimate_wm.py +0 -265
  1151. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_euler_number.py +0 -189
  1152. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_expand.py +0 -244
  1153. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_extract_main_component.py +0 -184
  1154. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_extract_patches.py +0 -180
  1155. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_extract_values.py +0 -236
  1156. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_exvivo_surfaces.py +0 -256
  1157. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_fill.py +0 -210
  1158. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_find_flat_regions.py +0 -200
  1159. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_fix_topology.py +0 -446
  1160. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_flatten.py +0 -264
  1161. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_fwhm.py +0 -521
  1162. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_gradient.py +0 -196
  1163. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_hausdorff_dist.py +0 -207
  1164. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_image2vtk.py +0 -224
  1165. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_inflate.py +0 -273
  1166. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_info.py +0 -443
  1167. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_init_global_tractography.py +0 -188
  1168. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_intensity_profile.py +0 -333
  1169. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_interpolate_warp.py +0 -188
  1170. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_jacobian.py +0 -219
  1171. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label2annot.py +0 -330
  1172. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label_area.py +0 -241
  1173. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label_calc.py +0 -215
  1174. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_label_mode.py +0 -236
  1175. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_left_right_register.py +0 -207
  1176. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_average_surface.py +0 -336
  1177. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_face_parcellation.py +0 -205
  1178. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_surfaces.py +0 -839
  1179. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_make_template.py +0 -325
  1180. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_map_cuts.py +0 -180
  1181. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_mef_surfaces.py +0 -232
  1182. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_merge_parcellations.py +0 -201
  1183. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_mesh_subdivide.py +0 -220
  1184. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_morph_stats.py +0 -204
  1185. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_ms_refine.py +0 -269
  1186. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multimodal.py +0 -279
  1187. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multimodal_surface_placement.py +0 -340
  1188. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_multiscale_stats.py +0 -217
  1189. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_niters2fwhm.py +0 -255
  1190. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_nudge.py +0 -208
  1191. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_parcellate_connectivity.py +0 -207
  1192. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_place_surface.py +0 -712
  1193. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_pmake.py +0 -327
  1194. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_preproc.py +0 -753
  1195. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_profile_clustering.py +0 -194
  1196. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_refine_surfaces.py +0 -250
  1197. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register.py +0 -927
  1198. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_label_map.py +0 -281
  1199. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_label.py +0 -310
  1200. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_register_to_volume.py +0 -508
  1201. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remesh.py +0 -255
  1202. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_intersection.py +0 -221
  1203. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_negative_vertices.py +0 -192
  1204. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_remove_variance.py +0 -204
  1205. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reposition_surface.py +0 -251
  1206. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_resample.py +0 -245
  1207. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rescale.py +0 -184
  1208. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_reverse.py +0 -184
  1209. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_label.py +0 -214
  1210. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rf_train.py +0 -208
  1211. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_rotate.py +0 -232
  1212. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_label.py +0 -192
  1213. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sample_parc.py +0 -449
  1214. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_seg2annot.py +0 -295
  1215. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment.py +0 -192
  1216. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segment_vals.py +0 -218
  1217. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_segmentation_stats.py +0 -200
  1218. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_shrinkwrap.py +0 -205
  1219. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_simulate_atrophy.py +0 -234
  1220. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_skeletonize.py +0 -353
  1221. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth.py +0 -309
  1222. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_smooth_intracortical.py +0 -304
  1223. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_sphere.py +0 -192
  1224. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_spherical_average.py +0 -312
  1225. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surf2vtk.py +0 -190
  1226. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_stats.py +0 -346
  1227. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_surface_to_vol_distances.py +0 -200
  1228. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_talairach.py +0 -172
  1229. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_target_pos.py +0 -309
  1230. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness.py +0 -248
  1231. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_comparison.py +0 -206
  1232. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_thickness_diff.py +0 -326
  1233. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_topo_fixer.py +0 -184
  1234. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transform.py +0 -233
  1235. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_translate_annotation.py +0 -208
  1236. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_transmantle_dysplasia_paths.py +0 -232
  1237. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask.py +0 -395
  1238. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_novtk.py +0 -379
  1239. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volmask_vtk.py +0 -400
  1240. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volsmooth.py +0 -339
  1241. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_volume.py +0 -181
  1242. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_warp.py +0 -262
  1243. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_watershed.py +0 -222
  1244. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mris_wm_volume.py +0 -230
  1245. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_paint.py +0 -348
  1246. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/mrisp_write.py +0 -293
  1247. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ms_refine_subject.py +0 -174
  1248. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/nmovie_qt.py +0 -174
  1249. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/oct_register_mosaic.py +0 -214
  1250. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/optseq2.py +0 -587
  1251. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/orient_las.py +0 -195
  1252. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/parc_atlas_jackknife_test.py +0 -300
  1253. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/pctsurfcon.py +0 -307
  1254. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/plot_structure_stats_tcl.py +0 -184
  1255. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/pointset2label.py +0 -209
  1256. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/polyorder.py +0 -199
  1257. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/post_recon_all.py +0 -350
  1258. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/predict_v1_sh.py +0 -227
  1259. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/print_unique_labels_csh.py +0 -219
  1260. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/qatools_py.py +0 -251
  1261. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_brainstem_structures_sh.py +0 -192
  1262. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_hasubregions_sh.py +0 -204
  1263. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/quantify_thalamic_nuclei_sh.py +0 -194
  1264. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rbbr.py +0 -418
  1265. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_base_init.py +0 -197
  1266. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config.py +0 -203
  1267. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_config2csh.py +0 -175
  1268. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_fix_ento.py +0 -235
  1269. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rca_long_tp_init.py +0 -231
  1270. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rcbf_prep.py +0 -254
  1271. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all.py +0 -930
  1272. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_clinical_sh.py +0 -202
  1273. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/recon_all_exvivo.py +0 -197
  1274. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reconbatchjobs.py +0 -180
  1275. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reg2subject.py +0 -177
  1276. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_feat2anat.py +0 -367
  1277. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reg_mni305_2mm.py +0 -194
  1278. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/regdat2xfm.py +0 -180
  1279. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_child.py +0 -187
  1280. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_csh.py +0 -194
  1281. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_elderly_subject.py +0 -234
  1282. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_subject.py +0 -233
  1283. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/register_subject_flash.py +0 -176
  1284. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject.py +0 -174
  1285. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_lh.py +0 -179
  1286. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reinflate_subject_rh.py +0 -189
  1287. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/remove_talairach.py +0 -188
  1288. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_subject_keep_editting.py +0 -182
  1289. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/renormalize_t1_subject.py +0 -174
  1290. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/reregister_subject_mixed.py +0 -202
  1291. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/rtview.py +0 -326
  1292. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_mris_preproc.py +0 -184
  1293. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_qdec_glm.py +0 -175
  1294. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg.py +0 -544
  1295. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_samseg_long.py +0 -430
  1296. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subfields_t1_longitudinal_sh.py +0 -186
  1297. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_sh.py +0 -190
  1298. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +0 -184
  1299. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +0 -188
  1300. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +0 -190
  1301. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_thalamic_nuclei_sh.py +0 -184
  1302. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg.py +0 -695
  1303. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg2recon.py +0 -303
  1304. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg_long.py +0 -245
  1305. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samsegmesh2surf.py +0 -245
  1306. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sbtiv.py +0 -206
  1307. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/seg2filled.py +0 -249
  1308. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/seg2recon.py +0 -344
  1309. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_bs_sh.py +0 -176
  1310. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_long_sh.py +0 -184
  1311. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_sh.py +0 -220
  1312. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t2_sh.py +0 -189
  1313. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_monkey.py +0 -172
  1314. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subfields_t1_longitudinal.py +0 -192
  1315. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject.py +0 -232
  1316. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal.py +0 -172
  1317. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal2.py +0 -183
  1318. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_old_skull_strip.py +0 -235
  1319. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_sc.py +0 -214
  1320. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml.py +0 -186
  1321. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml.py +0 -204
  1322. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml.py +0 -174
  1323. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subregions.py +0 -284
  1324. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei.py +0 -184
  1325. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei_sh.py +0 -184
  1326. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segpons.py +0 -232
  1327. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/setlabelstat.py +0 -212
  1328. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sfa2fieldsign.py +0 -299
  1329. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/slicedelay.py +0 -214
  1330. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject.py +0 -194
  1331. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_lh.py +0 -175
  1332. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_rh.py +0 -177
  1333. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spline3_test.py +0 -195
  1334. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spm_t_to_b.py +0 -180
  1335. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spmregister.py +0 -324
  1336. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sratio.py +0 -208
  1337. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stat_normalize.py +0 -260
  1338. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stattablediff.py +0 -281
  1339. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stem2fname.py +0 -179
  1340. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/surf2vol.py +0 -388
  1341. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/surfreg.py +0 -338
  1342. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_preprocess.py +0 -270
  1343. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_process.py +0 -320
  1344. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/t4img_4dfp.py +0 -196
  1345. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/t4imgs_4dfp.py +0 -291
  1346. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/table2map.py +0 -240
  1347. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_compare.py +0 -201
  1348. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_qc_azs.py +0 -172
  1349. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach.py +0 -210
  1350. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach2.py +0 -182
  1351. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_afd.py +0 -227
  1352. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_avi.py +0 -227
  1353. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach_mgh.py +0 -184
  1354. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talsegprob.py +0 -375
  1355. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_orientation_planes_from_parcellation.py +0 -195
  1356. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_recon_all_csh.py +0 -266
  1357. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_tutorials_sh.py +0 -314
  1358. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/thickdiffmap.py +0 -206
  1359. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmedit.py +0 -186
  1360. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmeditfv.py +0 -508
  1361. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2.py +0 -237
  1362. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2_cmdl.py +0 -864
  1363. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregisterfv.py +0 -524
  1364. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurfer.py +0 -198
  1365. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurferfv.py +0 -265
  1366. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_all.py +0 -521
  1367. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_paths.py +0 -305
  1368. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_preproc.py +0 -292
  1369. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tractstats2table.py +0 -277
  1370. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/train_gcs_atlas.py +0 -312
  1371. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tridec.py +0 -200
  1372. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trk_tools.py +0 -244
  1373. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima1_tcl.py +0 -188
  1374. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima_tcl.py +0 -172
  1375. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_mnc_tcl.py +0 -203
  1376. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir.py +0 -188
  1377. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir2.py +0 -172
  1378. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackmincdir.py +0 -260
  1379. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpacksdcmdir.py +0 -190
  1380. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/update_needed.py +0 -192
  1381. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/v_3dvolreg_afni.py +0 -194
  1382. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/v_4dfptoanalyze.py +0 -223
  1383. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ventfix.py +0 -189
  1384. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vertexvol.py +0 -228
  1385. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vno_match_check.py +0 -201
  1386. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2segavg.py +0 -335
  1387. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2subfield.py +0 -397
  1388. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2symsurf.py +0 -269
  1389. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vsm_smooth.py +0 -224
  1390. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wfilemask.py +0 -232
  1391. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wm_anat_snr.py +0 -245
  1392. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wmedits2surf.py +0 -279
  1393. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wmsaseg.py +0 -284
  1394. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xcerebralseg.py +0 -292
  1395. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xcorr.py +0 -239
  1396. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xfmrot.py +0 -202
  1397. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemi_tal.py +0 -177
  1398. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemireg.py +0 -297
  1399. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xsanatreg.py +0 -271
  1400. niwrap_freesurfer-0.6.3/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/zero_lt_4dfp.py +0 -215
@@ -0,0 +1,8 @@
1
+ Metadata-Version: 2.4
2
+ Name: niwrap-freesurfer
3
+ Version: 0.8.1
4
+ Summary: Neuroimaging wrappers.
5
+ Author: CMI DAIR
6
+ License-Expression: MIT
7
+ Requires-Dist: styxdefs>=0.6.0,<0.7.0
8
+ Requires-Python: >=3.10
@@ -0,0 +1,17 @@
1
+ [project]
2
+ name = "niwrap_freesurfer"
3
+ version = "0.8.1"
4
+ description = "Neuroimaging wrappers."
5
+ license = "MIT"
6
+ authors = [{ name = "CMI DAIR" }]
7
+ requires-python = ">=3.10"
8
+ dependencies = [
9
+ "styxdefs>=0.6.0,<0.7.0"
10
+ ]
11
+
12
+ [tool.uv.build-backend]
13
+ module-name = "niwrap_freesurfer.freesurfer"
14
+
15
+ [build-system]
16
+ requires = ["uv_build>=0.8.13,<0.9.0"]
17
+ build-backend = "uv_build"