niwrap-freesurfer 0.5.0__tar.gz → 0.5.1__tar.gz
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subfields_t1_longitudinal.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_old_skull_strip.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei_sh.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/setlabelstat.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spline3_test.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spmregister.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_recon_all_csh.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurfer.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurferfv.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_all.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_paths.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_preproc.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tractstats2table.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/train_gcs_atlas.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tridec.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trk_tools.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima1_tcl.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima_tcl.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_mnc_tcl.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/update_needed.py +0 -0
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- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xsanatreg.py +0 -0
- {niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/zero_lt_4dfp.py +0 -0
{niwrap_freesurfer-0.5.0 → niwrap_freesurfer-0.5.1}/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregisterfv.py
RENAMED
|
@@ -116,7 +116,7 @@ def tkregisterfv_params(
|
|
|
116
116
|
reg3: InputPathType | None = None,
|
|
117
117
|
heat_flag: bool = False,
|
|
118
118
|
regheader_flag: bool = False,
|
|
119
|
-
|
|
119
|
+
params_: list[float] | None = None,
|
|
120
120
|
flip_x_flag: bool = False,
|
|
121
121
|
flip_y_flag: bool = False,
|
|
122
122
|
flip_z_flag: bool = False,
|
|
@@ -154,7 +154,7 @@ def tkregisterfv_params(
|
|
|
154
154
|
heat_flag: Use heat map color tables for all volumes.
|
|
155
155
|
regheader_flag: Create registration file assuming the two volumes share\
|
|
156
156
|
a RAS.
|
|
157
|
-
|
|
157
|
+
params_: Affine matrix parameters: translations in mm, rotations in\
|
|
158
158
|
degrees.
|
|
159
159
|
flip_x_flag: Regheader with rx=180.
|
|
160
160
|
flip_y_flag: Regheader with ry=180.
|
|
@@ -211,8 +211,8 @@ def tkregisterfv_params(
|
|
|
211
211
|
params["mov3"] = mov3
|
|
212
212
|
if reg3 is not None:
|
|
213
213
|
params["reg3"] = reg3
|
|
214
|
-
if
|
|
215
|
-
params["params"] =
|
|
214
|
+
if params_ is not None:
|
|
215
|
+
params["params"] = params_
|
|
216
216
|
if aux is not None:
|
|
217
217
|
params["aux"] = aux
|
|
218
218
|
return params
|
|
@@ -421,7 +421,7 @@ def tkregisterfv(
|
|
|
421
421
|
reg3: InputPathType | None = None,
|
|
422
422
|
heat_flag: bool = False,
|
|
423
423
|
regheader_flag: bool = False,
|
|
424
|
-
|
|
424
|
+
params_: list[float] | None = None,
|
|
425
425
|
flip_x_flag: bool = False,
|
|
426
426
|
flip_y_flag: bool = False,
|
|
427
427
|
flip_z_flag: bool = False,
|
|
@@ -465,7 +465,7 @@ def tkregisterfv(
|
|
|
465
465
|
heat_flag: Use heat map color tables for all volumes.
|
|
466
466
|
regheader_flag: Create registration file assuming the two volumes share\
|
|
467
467
|
a RAS.
|
|
468
|
-
|
|
468
|
+
params_: Affine matrix parameters: translations in mm, rotations in\
|
|
469
469
|
degrees.
|
|
470
470
|
flip_x_flag: Regheader with rx=180.
|
|
471
471
|
flip_y_flag: Regheader with ry=180.
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@@ -505,7 +505,7 @@ def tkregisterfv(
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505
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reg3=reg3,
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506
506
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heat_flag=heat_flag,
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507
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-
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+
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flip_x_flag=flip_x_flag,
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510
510
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511
511
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RENAMED
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RENAMED
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