niwrap-freesurfer 0.5.0__tar.gz
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- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/qatools_py.py +251 -0
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- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +184 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t1_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +188 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_subject_t2_auto_estimate_alveus_ml_sh.py +190 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/run_segment_thalamic_nuclei_sh.py +184 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg.py +682 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/samseg2recon.py +303 -0
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- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_long_sh.py +184 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t1_sh.py +220 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_ha_t2_sh.py +189 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_monkey.py +172 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subfields_t1_longitudinal.py +192 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject.py +232 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_notal.py +172 -0
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- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_subject_old_skull_strip.py +235 -0
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- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segment_thalamic_nuclei_sh.py +184 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/segpons.py +232 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/setlabelstat.py +212 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sfa2fieldsign.py +299 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/slicedelay.py +214 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/slicetimer_fsl.py +291 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject.py +194 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_lh.py +174 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sphere_subject_rh.py +176 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spline3_test.py +195 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spm_t_to_b.py +180 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/spmregister.py +324 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/sratio.py +208 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stat_normalize.py +260 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stattablediff.py +281 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/stem2fname.py +179 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/surf2vol.py +388 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/surfreg.py +338 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_preprocess.py +270 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/swi_process.py +320 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/t4img_4dfp.py +196 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/t4imgs_4dfp.py +291 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/table2map.py +240 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_compare.py +201 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tal_qc_azs.py +172 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach.py +210 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talairach2.py +182 -0
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- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/talsegprob.py +375 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_orientation_planes_from_parcellation.py +195 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_recon_all_csh.py +266 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/test_tutorials_sh.py +314 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/thickdiffmap.py +206 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmedit.py +186 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkmeditfv.py +508 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2.py +237 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregister2_cmdl.py +864 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tkregisterfv.py +524 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurfer.py +198 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tksurferfv.py +265 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_all.py +239 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_paths.py +305 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trac_preproc.py +292 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tractstats2table.py +277 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/train_gcs_atlas.py +294 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/tridec.py +200 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/trk_tools.py +244 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima1_tcl.py +188 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_ima_tcl.py +172 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpack_mnc_tcl.py +203 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir.py +188 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackimadir2.py +172 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpackmincdir.py +260 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/unpacksdcmdir.py +190 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/update_needed.py +181 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/v_3dvolreg_afni.py +194 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/v_4dfptoanalyze.py +223 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/ventfix.py +189 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vertexvol.py +210 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vno_match_check.py +201 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2segavg.py +335 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2subfield.py +326 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vol2symsurf.py +269 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/vsm_smooth.py +224 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wfilemask.py +232 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wm_anat_snr.py +245 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wmedits2surf.py +279 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/wmsaseg.py +284 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xcerebralseg.py +292 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xcorr.py +239 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xfmrot.py +202 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemi_tal.py +177 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xhemireg.py +297 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/xsanatreg.py +271 -0
- niwrap_freesurfer-0.5.0/src/niwrap_freesurfer/freesurfer/zero_lt_4dfp.py +215 -0
|
@@ -0,0 +1,301 @@
|
|
|
1
|
+
# NODE #
|
|
2
|
+
|
|
3
|
+
# Logs
|
|
4
|
+
logs
|
|
5
|
+
*.log
|
|
6
|
+
npm-debug.log*
|
|
7
|
+
yarn-debug.log*
|
|
8
|
+
yarn-error.log*
|
|
9
|
+
lerna-debug.log*
|
|
10
|
+
.pnpm-debug.log*
|
|
11
|
+
|
|
12
|
+
# Diagnostic reports (https://nodejs.org/api/report.html)
|
|
13
|
+
report.[0-9]*.[0-9]*.[0-9]*.[0-9]*.json
|
|
14
|
+
|
|
15
|
+
# Runtime data
|
|
16
|
+
pids
|
|
17
|
+
*.pid
|
|
18
|
+
*.seed
|
|
19
|
+
*.pid.lock
|
|
20
|
+
|
|
21
|
+
# Directory for instrumented libs generated by jscoverage/JSCover
|
|
22
|
+
lib-cov
|
|
23
|
+
|
|
24
|
+
# Coverage directory used by tools like istanbul
|
|
25
|
+
coverage
|
|
26
|
+
*.lcov
|
|
27
|
+
|
|
28
|
+
# nyc test coverage
|
|
29
|
+
.nyc_output
|
|
30
|
+
|
|
31
|
+
# Grunt intermediate storage (https://gruntjs.com/creating-plugins#storing-task-files)
|
|
32
|
+
.grunt
|
|
33
|
+
|
|
34
|
+
# Bower dependency directory (https://bower.io/)
|
|
35
|
+
bower_components
|
|
36
|
+
|
|
37
|
+
# node-waf configuration
|
|
38
|
+
.lock-wscript
|
|
39
|
+
|
|
40
|
+
# Compiled binary addons (https://nodejs.org/api/addons.html)
|
|
41
|
+
build/Release
|
|
42
|
+
|
|
43
|
+
# Dependency directories
|
|
44
|
+
node_modules/
|
|
45
|
+
jspm_packages/
|
|
46
|
+
|
|
47
|
+
# Snowpack dependency directory (https://snowpack.dev/)
|
|
48
|
+
web_modules/
|
|
49
|
+
|
|
50
|
+
# TypeScript cache
|
|
51
|
+
*.tsbuildinfo
|
|
52
|
+
|
|
53
|
+
# Optional npm cache directory
|
|
54
|
+
.npm
|
|
55
|
+
|
|
56
|
+
# Optional eslint cache
|
|
57
|
+
.eslintcache
|
|
58
|
+
|
|
59
|
+
# Optional stylelint cache
|
|
60
|
+
.stylelintcache
|
|
61
|
+
|
|
62
|
+
# Microbundle cache
|
|
63
|
+
.rpt2_cache/
|
|
64
|
+
.rts2_cache_cjs/
|
|
65
|
+
.rts2_cache_es/
|
|
66
|
+
.rts2_cache_umd/
|
|
67
|
+
|
|
68
|
+
# Optional REPL history
|
|
69
|
+
.node_repl_history
|
|
70
|
+
|
|
71
|
+
# Output of 'npm pack'
|
|
72
|
+
*.tgz
|
|
73
|
+
|
|
74
|
+
# Yarn Integrity file
|
|
75
|
+
.yarn-integrity
|
|
76
|
+
|
|
77
|
+
# dotenv environment variable files
|
|
78
|
+
.env
|
|
79
|
+
.env.development.local
|
|
80
|
+
.env.test.local
|
|
81
|
+
.env.production.local
|
|
82
|
+
.env.local
|
|
83
|
+
|
|
84
|
+
# parcel-bundler cache (https://parceljs.org/)
|
|
85
|
+
.cache
|
|
86
|
+
.parcel-cache
|
|
87
|
+
|
|
88
|
+
# Next.js build output
|
|
89
|
+
.next
|
|
90
|
+
out
|
|
91
|
+
|
|
92
|
+
# Nuxt.js build / generate output
|
|
93
|
+
.nuxt
|
|
94
|
+
dist
|
|
95
|
+
|
|
96
|
+
# Gatsby files
|
|
97
|
+
.cache/
|
|
98
|
+
# Comment in the public line in if your project uses Gatsby and not Next.js
|
|
99
|
+
# https://nextjs.org/blog/next-9-1#public-directory-support
|
|
100
|
+
# public
|
|
101
|
+
|
|
102
|
+
# vuepress build output
|
|
103
|
+
.vuepress/dist
|
|
104
|
+
|
|
105
|
+
# vuepress v2.x temp and cache directory
|
|
106
|
+
.temp
|
|
107
|
+
.cache
|
|
108
|
+
|
|
109
|
+
# Docusaurus cache and generated files
|
|
110
|
+
.docusaurus
|
|
111
|
+
|
|
112
|
+
# Serverless directories
|
|
113
|
+
.serverless/
|
|
114
|
+
|
|
115
|
+
# FuseBox cache
|
|
116
|
+
.fusebox/
|
|
117
|
+
|
|
118
|
+
# DynamoDB Local files
|
|
119
|
+
.dynamodb/
|
|
120
|
+
|
|
121
|
+
# TernJS port file
|
|
122
|
+
.tern-port
|
|
123
|
+
|
|
124
|
+
# Stores VSCode versions used for testing VSCode extensions
|
|
125
|
+
.vscode-test
|
|
126
|
+
|
|
127
|
+
# yarn v2
|
|
128
|
+
.yarn/cache
|
|
129
|
+
.yarn/unplugged
|
|
130
|
+
.yarn/build-state.yml
|
|
131
|
+
.yarn/install-state.gz
|
|
132
|
+
.pnp.*
|
|
133
|
+
|
|
134
|
+
# PYTHON #
|
|
135
|
+
|
|
136
|
+
# Byte-compiled / optimized / DLL files
|
|
137
|
+
__pycache__/
|
|
138
|
+
*.py[cod]
|
|
139
|
+
*$py.class
|
|
140
|
+
|
|
141
|
+
# C extensions
|
|
142
|
+
*.so
|
|
143
|
+
|
|
144
|
+
# Distribution / packaging
|
|
145
|
+
.Python
|
|
146
|
+
build/
|
|
147
|
+
develop-eggs/
|
|
148
|
+
dist/
|
|
149
|
+
downloads/
|
|
150
|
+
eggs/
|
|
151
|
+
.eggs/
|
|
152
|
+
lib/
|
|
153
|
+
lib64/
|
|
154
|
+
parts/
|
|
155
|
+
sdist/
|
|
156
|
+
var/
|
|
157
|
+
wheels/
|
|
158
|
+
share/python-wheels/
|
|
159
|
+
*.egg-info/
|
|
160
|
+
.installed.cfg
|
|
161
|
+
*.egg
|
|
162
|
+
MANIFEST
|
|
163
|
+
|
|
164
|
+
# PyInstaller
|
|
165
|
+
# Usually these files are written by a python script from a template
|
|
166
|
+
# before PyInstaller builds the exe, so as to inject date/other infos into it.
|
|
167
|
+
*.manifest
|
|
168
|
+
*.spec
|
|
169
|
+
|
|
170
|
+
# Installer logs
|
|
171
|
+
pip-log.txt
|
|
172
|
+
pip-delete-this-directory.txt
|
|
173
|
+
|
|
174
|
+
# Unit test / coverage reports
|
|
175
|
+
htmlcov/
|
|
176
|
+
.tox/
|
|
177
|
+
.nox/
|
|
178
|
+
.coverage
|
|
179
|
+
.coverage.*
|
|
180
|
+
.cache
|
|
181
|
+
nosetests.xml
|
|
182
|
+
coverage.xml
|
|
183
|
+
*.cover
|
|
184
|
+
*.py,cover
|
|
185
|
+
.hypothesis/
|
|
186
|
+
.pytest_cache/
|
|
187
|
+
cover/
|
|
188
|
+
|
|
189
|
+
# Translations
|
|
190
|
+
*.mo
|
|
191
|
+
*.pot
|
|
192
|
+
|
|
193
|
+
# Django stuff:
|
|
194
|
+
*.log
|
|
195
|
+
local_settings.py
|
|
196
|
+
db.sqlite3
|
|
197
|
+
db.sqlite3-journal
|
|
198
|
+
|
|
199
|
+
# Flask stuff:
|
|
200
|
+
instance/
|
|
201
|
+
.webassets-cache
|
|
202
|
+
|
|
203
|
+
# Scrapy stuff:
|
|
204
|
+
.scrapy
|
|
205
|
+
|
|
206
|
+
# Sphinx documentation
|
|
207
|
+
docs/_build/
|
|
208
|
+
|
|
209
|
+
# PyBuilder
|
|
210
|
+
.pybuilder/
|
|
211
|
+
target/
|
|
212
|
+
|
|
213
|
+
# Jupyter Notebook
|
|
214
|
+
.ipynb_checkpoints
|
|
215
|
+
|
|
216
|
+
# IPython
|
|
217
|
+
profile_default/
|
|
218
|
+
ipython_config.py
|
|
219
|
+
|
|
220
|
+
# pyenv
|
|
221
|
+
# For a library or package, you might want to ignore these files since the code is
|
|
222
|
+
# intended to run in multiple environments; otherwise, check them in:
|
|
223
|
+
# .python-version
|
|
224
|
+
|
|
225
|
+
# pipenv
|
|
226
|
+
# According to pypa/pipenv#598, it is recommended to include Pipfile.lock in version control.
|
|
227
|
+
# However, in case of collaboration, if having platform-specific dependencies or dependencies
|
|
228
|
+
# having no cross-platform support, pipenv may install dependencies that don't work, or not
|
|
229
|
+
# install all needed dependencies.
|
|
230
|
+
#Pipfile.lock
|
|
231
|
+
|
|
232
|
+
# poetry
|
|
233
|
+
# Similar to Pipfile.lock, it is generally recommended to include poetry.lock in version control.
|
|
234
|
+
# This is especially recommended for binary packages to ensure reproducibility, and is more
|
|
235
|
+
# commonly ignored for libraries.
|
|
236
|
+
# https://python-poetry.org/docs/basic-usage/#commit-your-poetrylock-file-to-version-control
|
|
237
|
+
#poetry.lock
|
|
238
|
+
|
|
239
|
+
# pdm
|
|
240
|
+
# Similar to Pipfile.lock, it is generally recommended to include pdm.lock in version control.
|
|
241
|
+
#pdm.lock
|
|
242
|
+
# pdm stores project-wide configurations in .pdm.toml, but it is recommended to not include it
|
|
243
|
+
# in version control.
|
|
244
|
+
# https://pdm.fming.dev/#use-with-ide
|
|
245
|
+
.pdm.toml
|
|
246
|
+
|
|
247
|
+
# PEP 582; used by e.g. github.com/David-OConnor/pyflow and github.com/pdm-project/pdm
|
|
248
|
+
__pypackages__/
|
|
249
|
+
|
|
250
|
+
# Celery stuff
|
|
251
|
+
celerybeat-schedule
|
|
252
|
+
celerybeat.pid
|
|
253
|
+
|
|
254
|
+
# SageMath parsed files
|
|
255
|
+
*.sage.py
|
|
256
|
+
|
|
257
|
+
# Environments
|
|
258
|
+
.env
|
|
259
|
+
.venv
|
|
260
|
+
env/
|
|
261
|
+
*venv/
|
|
262
|
+
ENV/
|
|
263
|
+
env.bak/
|
|
264
|
+
venv.bak/
|
|
265
|
+
|
|
266
|
+
# Spyder project settings
|
|
267
|
+
.spyderproject
|
|
268
|
+
.spyproject
|
|
269
|
+
|
|
270
|
+
# Rope project settings
|
|
271
|
+
.ropeproject
|
|
272
|
+
|
|
273
|
+
# mkdocs documentation
|
|
274
|
+
/site
|
|
275
|
+
|
|
276
|
+
# mypy
|
|
277
|
+
.mypy_cache/
|
|
278
|
+
.dmypy.json
|
|
279
|
+
dmypy.json
|
|
280
|
+
|
|
281
|
+
# Pyre type checker
|
|
282
|
+
.pyre/
|
|
283
|
+
|
|
284
|
+
# pytype static type analyzer
|
|
285
|
+
.pytype/
|
|
286
|
+
|
|
287
|
+
# Cython debug symbols
|
|
288
|
+
cython_debug/
|
|
289
|
+
|
|
290
|
+
# PyCharm
|
|
291
|
+
# JetBrains specific template is maintained in a separate JetBrains.gitignore that can
|
|
292
|
+
# be found at https://github.com/github/gitignore/blob/main/Global/JetBrains.gitignore
|
|
293
|
+
# and can be added to the global gitignore or merged into this file. For a more nuclear
|
|
294
|
+
# option (not recommended) you can uncomment the following to ignore the entire idea folder.
|
|
295
|
+
.idea/
|
|
296
|
+
|
|
297
|
+
.vscode
|
|
298
|
+
/local_scripts
|
|
299
|
+
report.html
|
|
300
|
+
assets
|
|
301
|
+
styx_tmp
|
|
@@ -0,0 +1,9 @@
|
|
|
1
|
+
# NiWrap wrappers for [FreeSurfer](https://github.com/freesurfer/freesurfer)
|
|
2
|
+
|
|
3
|
+
FreeSurfer is a software package for the analysis and visualization of neuroimaging data from cross-sectional and longitudinal studies. It is developed by the Laboratory for Computational Neuroimaging at the Martinos Center for Biomedical Imaging.
|
|
4
|
+
|
|
5
|
+
FreeSurfer provides full processing streams for structural and functional MRI and includes tools for linear and nonlinear registration, cortical and subcortical segmentation, cortical surface reconstruction, statistical analysis of group morphometry, diffusion MRI, PET analysis, and much more. It is also the structural MRI analysis software of choice for the Human Connectome Project.
|
|
6
|
+
|
|
7
|
+
FreeSurfer is made by FreeSurfer Developers.
|
|
8
|
+
|
|
9
|
+
This package contains wrappers only and has no affiliation with the original authors.
|
|
@@ -0,0 +1,17 @@
|
|
|
1
|
+
[project]
|
|
2
|
+
name = "niwrap_freesurfer"
|
|
3
|
+
version = "0.5.0"
|
|
4
|
+
description = "NiWrap wrappers for FreeSurfer."
|
|
5
|
+
license = "LGPL-2.1"
|
|
6
|
+
authors = [{ name = "CMI DAIR", email = "dair@childmind.org" }]
|
|
7
|
+
requires-python = ">=3.10"
|
|
8
|
+
dependencies = [
|
|
9
|
+
"styxdefs~=0.5.0"
|
|
10
|
+
]
|
|
11
|
+
|
|
12
|
+
[tool.hatch.build.targets.wheel]
|
|
13
|
+
packages = ["src/niwrap_freesurfer"]
|
|
14
|
+
|
|
15
|
+
[build-system]
|
|
16
|
+
requires = ["hatchling"]
|
|
17
|
+
build-backend = "hatchling.build"
|