nerdd-module 0.3.33__tar.gz → 0.3.34__tar.gz

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
Files changed (99) hide show
  1. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/PKG-INFO +1 -1
  2. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/cli.py +1 -1
  3. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/models.py +4 -3
  4. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module.egg-info/PKG-INFO +1 -1
  5. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/pyproject.toml +1 -1
  6. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/LICENSE +0 -0
  7. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/README.md +0 -0
  8. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/__init__.py +0 -0
  9. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/__init__.py +0 -0
  10. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/configuration.py +0 -0
  11. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/default_configuration.py +0 -0
  12. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/dict_configuration.py +0 -0
  13. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/merged_configuration.py +0 -0
  14. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/package_configuration.py +0 -0
  15. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/search_yaml_configuration.py +0 -0
  16. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/yaml_configuration.py +0 -0
  17. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/__init__.py +0 -0
  18. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/basic_type_converter.py +0 -0
  19. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/converter.py +0 -0
  20. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/converter_config.py +0 -0
  21. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/mol_converter.py +0 -0
  22. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/problem_list_converter.py +0 -0
  23. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/representation_converter.py +0 -0
  24. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/source_list_converter.py +0 -0
  25. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/converters/void_converter.py +0 -0
  26. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/__init__.py +0 -0
  27. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/depth_first_explorer.py +0 -0
  28. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/explorer.py +0 -0
  29. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/file_reader.py +0 -0
  30. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/gzip_reader.py +0 -0
  31. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/inchi_reader.py +0 -0
  32. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/list_reader.py +0 -0
  33. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/mol_reader.py +0 -0
  34. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/reader.py +0 -0
  35. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/reader_config.py +0 -0
  36. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/sdf_reader.py +0 -0
  37. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/smiles_reader.py +0 -0
  38. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/string_reader.py +0 -0
  39. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/tar_reader.py +0 -0
  40. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/input/zip_reader.py +0 -0
  41. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/__init__.py +0 -0
  42. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/assign_name_step.py +0 -0
  43. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/convert_representations_step.py +0 -0
  44. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/enforce_schema_step.py +0 -0
  45. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/model.py +0 -0
  46. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/read_input_step.py +0 -0
  47. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/simple_model.py +0 -0
  48. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/model/write_output_step.py +0 -0
  49. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/__init__.py +0 -0
  50. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/csv_writer.py +0 -0
  51. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/file_writer.py +0 -0
  52. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/iterator_writer.py +0 -0
  53. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/pandas_writer.py +0 -0
  54. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/record_list_writer.py +0 -0
  55. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/sdf_writer.py +0 -0
  56. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/writer.py +0 -0
  57. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/output/writer_config.py +0 -0
  58. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/__init__.py +0 -0
  59. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/block_logs.py +0 -0
  60. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/files.py +0 -0
  61. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/get_entry_points.py +0 -0
  62. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/literal.py +0 -0
  63. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/typed_dict.py +0 -0
  64. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/types.py +0 -0
  65. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/polyfills/version.py +0 -0
  66. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/__init__.py +0 -0
  67. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/check_valid_smiles.py +0 -0
  68. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/chembl_structure_pipeline.py +0 -0
  69. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/filter_by_element.py +0 -0
  70. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/filter_by_weight.py +0 -0
  71. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/preprocessing_step.py +0 -0
  72. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/remove_stereochemistry.py +0 -0
  73. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/preprocessing/sanitize.py +0 -0
  74. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/problem.py +0 -0
  75. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/py.typed +0 -0
  76. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/steps/__init__.py +0 -0
  77. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/steps/map_step.py +0 -0
  78. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/steps/output_step.py +0 -0
  79. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/steps/step.py +0 -0
  80. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/__init__.py +0 -0
  81. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/checks.py +0 -0
  82. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/files.py +0 -0
  83. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/models/AtomicMassModel.py +0 -0
  84. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/models/MolWeightModel.py +0 -0
  85. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/models/__init__.py +0 -0
  86. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/predictions.py +0 -0
  87. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/preprocessing/DummyPreprocessingStep.py +0 -0
  88. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/preprocessing/__init__.py +0 -0
  89. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/tests/representations.py +0 -0
  90. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/util/__init__.py +0 -0
  91. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/util/call_with_mappings.py +0 -0
  92. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/util/package.py +0 -0
  93. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/version.py +0 -0
  94. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module.egg-info/SOURCES.txt +0 -0
  95. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module.egg-info/dependency_links.txt +0 -0
  96. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module.egg-info/requires.txt +0 -0
  97. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module.egg-info/top_level.txt +0 -0
  98. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/setup.cfg +0 -0
  99. {nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/tests/test_features.py +0 -0
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/PKG-INFO RENAMED
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  Metadata-Version: 2.4
2
2
  Name: nerdd-module
3
- Version: 0.3.33
3
+ Version: 0.3.34
4
4
  Summary: Base package to create NERDD modules
5
5
  Author-email: Steffen Hirte <steffen.hirte@univie.ac.at>
6
6
  Maintainer-email: Steffen Hirte <steffen.hirte@univie.ac.at>
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/cli.py RENAMED
@@ -27,7 +27,7 @@ Note that input formats shouldn't be mixed.
27
27
 
28
28
  def infer_click_type(param: JobParameter) -> click.ParamType:
29
29
  if param.choices is not None:
30
- choices = [c.value for c in param.choices]
30
+ choices = [str(c.value) for c in param.choices]
31
31
  return click.Choice(choices)
32
32
 
33
33
  type_map = {
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module/config/models.py RENAMED
@@ -46,8 +46,8 @@ class ColorPalette(BaseModel):
46
46
  unknown: Optional[str] = None
47
47
 
48
48
 
49
- class JobParameterChoice(BaseModel):
50
- value: str
49
+ class Choice(BaseModel):
50
+ value: Union[str, int, float, bool]
51
51
  label: Optional[str] = None
52
52
 
53
53
 
@@ -58,7 +58,7 @@ class JobParameter(BaseModel):
58
58
  help_text: Optional[str] = None
59
59
  default: Any = None
60
60
  required: bool = False
61
- choices: Optional[List[JobParameterChoice]] = None
61
+ choices: Optional[List[Choice]] = None
62
62
 
63
63
 
64
64
  Task = Literal[
@@ -85,6 +85,7 @@ class ResultProperty(BaseModel):
85
85
  sortable: bool = False
86
86
  group: Optional[str] = None
87
87
  level: Level = "molecule"
88
+ choices: Optional[List[Choice]] = None
88
89
  formats: Union[FormatSpec, IncludeExcludeFormatSpec, None] = None
89
90
  representation: Optional[str] = None
90
91
  from_property: Optional[str] = None
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/nerdd_module.egg-info/PKG-INFO RENAMED
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  Metadata-Version: 2.4
2
2
  Name: nerdd-module
3
- Version: 0.3.33
3
+ Version: 0.3.34
4
4
  Summary: Base package to create NERDD modules
5
5
  Author-email: Steffen Hirte <steffen.hirte@univie.ac.at>
6
6
  Maintainer-email: Steffen Hirte <steffen.hirte@univie.ac.at>
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/pyproject.toml RENAMED
@@ -4,7 +4,7 @@ build-backend = "setuptools.build_meta"
4
4
 
5
5
  [project]
6
6
  name = "nerdd-module"
7
- version = "0.3.33"
7
+ version = "0.3.34"
8
8
  description = "Base package to create NERDD modules"
9
9
  readme = "README.md"
10
10
  license = { file = "LICENSE" }
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/LICENSE RENAMED
File without changes
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/README.md RENAMED
File without changes
{nerdd_module-0.3.33 → nerdd_module-0.3.34}/setup.cfg RENAMED
File without changes