masster 0.5.21__tar.gz → 0.5.22__tar.gz

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.

Potentially problematic release.


This version of masster might be problematic. Click here for more details.

Files changed (89) hide show
  1. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/PKG-INFO +1 -1
  2. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/pyproject.toml +1 -1
  3. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/_version.py +1 -1
  4. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/wizard/wizard.py +2 -1
  5. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/uv.lock +1 -1
  6. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/.github/workflows/publish.yml +0 -0
  7. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/.github/workflows/security.yml +0 -0
  8. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/.github/workflows/test.yml +0 -0
  9. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/.gitignore +0 -0
  10. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/.pre-commit-config.yaml +0 -0
  11. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/LICENSE +0 -0
  12. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/Makefile +0 -0
  13. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/README.md +0 -0
  14. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/TESTING.md +0 -0
  15. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/demo/example_batch_process.py +0 -0
  16. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/demo/example_sample_process.py +0 -0
  17. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/__init__.py +0 -0
  18. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/chromatogram.py +0 -0
  19. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/data/libs/aa.csv +0 -0
  20. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/data/libs/ccm.csv +0 -0
  21. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/data/libs/urine.csv +0 -0
  22. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/data/wiff/2025_01_14_VW_7600_LpMx_DBS_CID_2min_TOP15_030msecMS1_005msecReac_CE35_DBS-ON_3.timeseries.data +0 -0
  23. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/data/wiff/2025_01_14_VW_7600_LpMx_DBS_CID_2min_TOP15_030msecMS1_005msecReac_CE35_DBS-ON_3.wiff +0 -0
  24. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/data/wiff/2025_01_14_VW_7600_LpMx_DBS_CID_2min_TOP15_030msecMS1_005msecReac_CE35_DBS-ON_3.wiff.scan +0 -0
  25. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/data/wiff/2025_01_14_VW_7600_LpMx_DBS_CID_2min_TOP15_030msecMS1_005msecReac_CE35_DBS-ON_3.wiff2 +0 -0
  26. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/lib/__init__.py +0 -0
  27. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/lib/lib.py +0 -0
  28. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/logger.py +0 -0
  29. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/__init__.py +0 -0
  30. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/adducts.py +0 -0
  31. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/defaults/__init__.py +0 -0
  32. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/defaults/find_adducts_def.py +0 -0
  33. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/defaults/find_features_def.py +0 -0
  34. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/defaults/find_ms2_def.py +0 -0
  35. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/defaults/get_spectrum_def.py +0 -0
  36. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/defaults/sample_def.py +0 -0
  37. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/h5.py +0 -0
  38. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/helpers.py +0 -0
  39. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/lib.py +0 -0
  40. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/load.py +0 -0
  41. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/parameters.py +0 -0
  42. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/plot.py +0 -0
  43. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/processing.py +0 -0
  44. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/quant.py +0 -0
  45. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/sample.py +0 -0
  46. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/sample5_schema.json +0 -0
  47. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/save.py +0 -0
  48. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/sciex.py +0 -0
  49. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/sample/thermo.py +0 -0
  50. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/spectrum.py +0 -0
  51. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/__init__.py +0 -0
  52. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/analysis.py +0 -0
  53. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/__init__.py +0 -0
  54. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/align_def.py +0 -0
  55. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/export_def.py +0 -0
  56. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/fill_def.py +0 -0
  57. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/find_consensus_def.py +0 -0
  58. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/find_ms2_def.py +0 -0
  59. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/identify_def.py +0 -0
  60. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/integrate_chrom_def.py +0 -0
  61. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/integrate_def.py +0 -0
  62. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/merge_def.py +0 -0
  63. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/defaults/study_def.py +0 -0
  64. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/export.py +0 -0
  65. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/h5.py +0 -0
  66. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/helpers.py +0 -0
  67. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/id.py +0 -0
  68. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/importers.py +0 -0
  69. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/load.py +0 -0
  70. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/merge.py +0 -0
  71. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/parameters.py +0 -0
  72. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/plot.py +0 -0
  73. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/processing.py +0 -0
  74. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/save.py +0 -0
  75. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/study.py +0 -0
  76. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/study/study5_schema.json +0 -0
  77. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/src/masster/wizard/__init__.py +0 -0
  78. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/conftest.py +0 -0
  79. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_chromatogram.py +0 -0
  80. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_defaults.py +0 -0
  81. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_imports.py +0 -0
  82. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_integration.py +0 -0
  83. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_logger.py +0 -0
  84. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_parameters.py +0 -0
  85. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_sample.py +0 -0
  86. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_spectrum.py +0 -0
  87. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_study.py +0 -0
  88. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tests/test_version.py +0 -0
  89. {masster-0.5.21 → masster-0.5.22}/tox.ini +0 -0
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  Metadata-Version: 2.4
2
2
  Name: masster
3
- Version: 0.5.21
3
+ Version: 0.5.22
4
4
  Summary: Mass spectrometry data analysis package
5
5
  Project-URL: homepage, https://github.com/zamboni-lab/masster
6
6
  Project-URL: repository, https://github.com/zamboni-lab/masster
@@ -1,7 +1,7 @@
1
1
 
2
2
  [project]
3
3
  name = "masster"
4
- version = "0.5.21"
4
+ version = "0.5.22"
5
5
  description = "Mass spectrometry data analysis package"
6
6
  authors = [
7
7
  { name = "Zamboni Lab" }
@@ -1,7 +1,7 @@
1
1
  from __future__ import annotations
2
2
 
3
3
 
4
- __version__ = "0.5.21"
4
+ __version__ = "0.5.22"
5
5
 
6
6
 
7
7
  def get_version():
@@ -818,7 +818,8 @@ class Wizard:
818
818
  '',
819
819
  '@app.cell',
820
820
  'def __(masster):',
821
- ' study = masster.Study(folder=".")',
821
+ f' study = masster.Study(folder={str(self.folder_path)!r})',
822
+ ' study.load()',
822
823
  ' return (study,)',
823
824
  '',
824
825
  '@app.cell',
@@ -1473,7 +1473,7 @@ wheels = [
1473
1473
 
1474
1474
  [[package]]
1475
1475
  name = "masster"
1476
- version = "0.5.21"
1476
+ version = "0.5.22"
1477
1477
  source = { editable = "." }
1478
1478
  dependencies = [
1479
1479
  { name = "alpharaw" },
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes
File without changes