labdata 0.1.20__tar.gz → 0.1.22__tar.gz

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.
Files changed (75) hide show
  1. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/PKG-INFO +1 -1
  2. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/__init__.py +1 -1
  3. labdata-0.1.22/labdata/accounts.py +1011 -0
  4. labdata-0.1.22/labdata/cli.py +2085 -0
  5. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/__init__.py +10 -1
  6. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/caiman.py +7 -3
  7. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/ec2.py +3 -3
  8. labdata-0.1.22/labdata/compute/pcluster.py +616 -0
  9. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/pose.py +17 -5
  10. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/schedulers.py +171 -23
  11. labdata-0.1.22/labdata/compute/submission.py +362 -0
  12. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/suite2p.py +1 -1
  13. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/utils.py +215 -76
  14. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/copy.py +12 -1
  15. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/admin.py +281 -24
  16. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/compute.py +88 -43
  17. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/drift.py +15 -7
  18. labdata-0.1.22/labdata/dashboard/events.py +58 -0
  19. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/imaging.py +2 -1
  20. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/index.py +51 -22
  21. labdata-0.1.22/labdata/dashboard/launch.py +151 -0
  22. labdata-0.1.22/labdata/dashboard/local_files.py +491 -0
  23. labdata-0.1.22/labdata/dashboard/raster.py +152 -0
  24. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/segmentation.py +200 -25
  25. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/sorting.py +28 -30
  26. labdata-0.1.22/labdata/dashboard/sync.py +448 -0
  27. labdata-0.1.22/labdata/dashboard/upload.py +57 -0
  28. labdata-0.1.22/labdata/dashboard/upload_worker.py +58 -0
  29. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/export.py +37 -0
  30. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/rules/ephys.py +74 -16
  31. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/rules/imaging.py +56 -47
  32. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/rules/utils.py +176 -10
  33. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/s3.py +131 -50
  34. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/ephys.py +6 -1
  35. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/general.py +8 -26
  36. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/stacks.py +157 -22
  37. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/utils.py +331 -28
  38. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata.egg-info/PKG-INFO +1 -1
  39. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata.egg-info/SOURCES.txt +10 -0
  40. labdata-0.1.20/labdata/cli.py +0 -1096
  41. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/LICENSE +0 -0
  42. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/README.md +0 -0
  43. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/ephys.py +0 -0
  44. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/compute/singularity.py +0 -0
  45. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/__init__.py +0 -0
  46. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/activity.py +0 -0
  47. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/ai_utils.py +0 -0
  48. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/console.py +0 -0
  49. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/decisiontask.py +0 -0
  50. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/docstrings.py +0 -0
  51. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/ephys.py +0 -0
  52. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/notes.py +0 -0
  53. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/procedures.py +0 -0
  54. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/reads.py +0 -0
  55. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/schema_graph.py +0 -0
  56. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/video.py +0 -0
  57. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/dashboard/writes.py +0 -0
  58. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/ephys_io.py +0 -0
  59. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/ephys_signal.py +0 -0
  60. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/rules/__init__.py +0 -0
  61. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/__init__.py +0 -0
  62. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/histology.py +0 -0
  63. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/onephoton.py +0 -0
  64. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/procedures.py +0 -0
  65. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/tasks.py +0 -0
  66. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/twophoton.py +0 -0
  67. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/utils.py +0 -0
  68. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/schema/video.py +0 -0
  69. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/widgets.py +0 -0
  70. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata.egg-info/dependency_links.txt +0 -0
  71. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata.egg-info/entry_points.txt +0 -0
  72. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata.egg-info/requires.txt +0 -0
  73. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata.egg-info/top_level.txt +0 -0
  74. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/pyproject.toml +0 -0
  75. {labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/setup.cfg +0 -0
{labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/PKG-INFO RENAMED
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  Metadata-Version: 2.4
2
2
  Name: labdata
3
- Version: 0.1.20
3
+ Version: 0.1.22
4
4
  Summary: Package to manage data in experimental neuroscience labs
5
5
  Author-email: Joao Couto <jpcouto@gmail.com>
6
6
  Project-URL: Homepage, https://github.com/jcouto/labdata
{labdata-0.1.20 → labdata-0.1.22}/labdata/__init__.py RENAMED
@@ -1,4 +1,4 @@
1
- VERSION = "0.1.20"
1
+ VERSION = "0.1.22"
2
2
 
3
3
  from .utils import *
4
4
  from .copy import copy_to_upload_server