dcicutils 8.8.1.1b14__tar.gz → 8.8.1.1b15__tar.gz

Sign up to get free protection for your applications and to get access to all the features.
Files changed (76) hide show
  1. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/PKG-INFO +1 -1
  2. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/structured_data.py +3 -3
  3. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/pyproject.toml +1 -1
  4. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/LICENSE.txt +0 -0
  5. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/README.rst +0 -0
  6. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/__init__.py +0 -0
  7. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/base.py +0 -0
  8. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/beanstalk_utils.py +0 -0
  9. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/bundle_utils.py +0 -0
  10. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/captured_output.py +0 -0
  11. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/cloudformation_utils.py +0 -0
  12. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/codebuild_utils.py +0 -0
  13. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/command_utils.py +0 -0
  14. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/common.py +0 -0
  15. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/contribution_scripts.py +0 -0
  16. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/contribution_utils.py +0 -0
  17. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/creds_utils.py +0 -0
  18. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/data_readers.py +0 -0
  19. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/data_utils.py +0 -0
  20. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/datetime_utils.py +0 -0
  21. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/deployment_utils.py +0 -0
  22. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/diff_utils.py +0 -0
  23. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/docker_utils.py +0 -0
  24. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/ecr_scripts.py +0 -0
  25. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/ecr_utils.py +0 -0
  26. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/ecs_utils.py +0 -0
  27. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/env_base.py +0 -0
  28. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/env_manager.py +0 -0
  29. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/env_scripts.py +0 -0
  30. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/env_utils.py +0 -0
  31. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/env_utils_legacy.py +0 -0
  32. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/es_utils.py +0 -0
  33. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/exceptions.py +0 -0
  34. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/ff_mocks.py +0 -0
  35. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/ff_utils.py +0 -0
  36. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/file_utils.py +0 -0
  37. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/function_cache_decorator.py +0 -0
  38. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/glacier_utils.py +0 -0
  39. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/jh_utils.py +0 -0
  40. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/kibana/dashboards.json +0 -0
  41. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/kibana/readme.md +0 -0
  42. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/lang_utils.py +0 -0
  43. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/license_policies/c4-infrastructure.jsonc +0 -0
  44. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/license_policies/c4-python-infrastructure.jsonc +0 -0
  45. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/license_policies/park-lab-common-server.jsonc +0 -0
  46. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/license_policies/park-lab-common.jsonc +0 -0
  47. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/license_policies/park-lab-gpl-pipeline.jsonc +0 -0
  48. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/license_policies/park-lab-pipeline.jsonc +0 -0
  49. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/license_utils.py +0 -0
  50. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/log_utils.py +0 -0
  51. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/misc_utils.py +0 -0
  52. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/obfuscation_utils.py +0 -0
  53. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/opensearch_utils.py +0 -0
  54. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/portal_object_utils.py +0 -0
  55. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/portal_utils.py +0 -0
  56. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/progress_constants.py +0 -0
  57. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/project_utils.py +0 -0
  58. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/qa_checkers.py +0 -0
  59. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/qa_utils.py +0 -0
  60. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/redis_tools.py +0 -0
  61. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/redis_utils.py +0 -0
  62. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/s3_utils.py +0 -0
  63. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/schema_utils.py +0 -0
  64. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/scripts/publish_to_pypi.py +0 -0
  65. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/scripts/run_license_checker.py +0 -0
  66. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/scripts/view_portal_object.py +0 -0
  67. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/secrets_utils.py +0 -0
  68. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/sheet_utils.py +0 -0
  69. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/snapshot_utils.py +0 -0
  70. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/ssl_certificate_utils.py +0 -0
  71. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/task_utils.py +0 -0
  72. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/tmpfile_utils.py +0 -0
  73. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/trace_utils.py +0 -0
  74. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/validation_utils.py +0 -0
  75. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/variant_utils.py +0 -0
  76. {dcicutils-8.8.1.1b14 → dcicutils-8.8.1.1b15}/dcicutils/zip_utils.py +0 -0
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  Metadata-Version: 2.1
2
2
  Name: dcicutils
3
- Version: 8.8.1.1b14
3
+ Version: 8.8.1.1b15
4
4
  Summary: Utility package for interacting with the 4DN Data Portal and other 4DN resources
5
5
  Home-page: https://github.com/4dn-dcic/utils
6
6
  License: MIT
@@ -192,7 +192,7 @@ class StructuredDataSet:
192
192
  diffs = {}
193
193
  if callable(progress):
194
194
  ntypes, nobjects = get_counts()
195
- progress({PROGRESS.ANALYZE_START.value: True,
195
+ progress({PROGRESS.ANALYZE_START.value: PROGRESS.NOW(),
196
196
  PROGRESS.ANALYZE_COUNT_TYPES.value: ntypes, PROGRESS.ANALYZE_COUNT_ITEMS.value: nobjects})
197
197
  if self.data or self.portal: # TODO: what is this OR biz?
198
198
  refs = self.resolved_refs_with_uuids
@@ -225,7 +225,7 @@ class StructuredDataSet:
225
225
  if callable(progress):
226
226
  progress({PROGRESS.ANALYZE_COUNT_LOOKUP.value: nlookups})
227
227
  if callable(progress):
228
- progress({PROGRESS.ANALYZE_DONE.value: True})
228
+ progress({PROGRESS.ANALYZE_DONE.value: PROGRESS.NOW()})
229
229
  return diffs
230
230
 
231
231
  def load_file(self, file: str) -> None:
@@ -272,7 +272,7 @@ class StructuredDataSet:
272
272
  return nrows, len(excel.sheet_names)
273
273
  if self._progress: # TODO: Move to _load_reader
274
274
  nrows, nsheets = get_counts()
275
- self._progress({PROGRESS.LOAD_START.value: True,
275
+ self._progress({PROGRESS.LOAD_START.value: PROGRESS.NOW(),
276
276
  PROGRESS.LOAD_COUNT_SHEETS.value: nsheets, PROGRESS.LOAD_COUNT_ROWS.value: nrows})
277
277
  excel = Excel(file) # Order the sheet names by any specified ordering (e.g. ala snovault.loadxl).
278
278
  order = {Schema.type_name(key): index for index, key in enumerate(self._order)} if self._order else {}
@@ -1,6 +1,6 @@
1
1
  [tool.poetry]
2
2
  name = "dcicutils"
3
- version = "8.8.1.1b14" # TODO: To become 8.8.2
3
+ version = "8.8.1.1b15" # TODO: To become 8.8.2
4
4
  description = "Utility package for interacting with the 4DN Data Portal and other 4DN resources"
5
5
  authors = ["4DN-DCIC Team <support@4dnucleome.org>"]
6
6
  license = "MIT"