PyPI - SigProfilerAssignment - Versions diffs - 1.1.1__tar.gz → 1.1.2__tar.gz - Mend

SigProfilerAssignment 1.1.1tar.gz → 1.1.2tar.gz

This diff represents the content of publicly available package versions that have been released to one of the supported registries. The information contained in this diff is provided for informational purposes only and reflects changes between package versions as they appear in their respective public registries.

Files changed (286) hide show

{sigprofilerassignment-1.1.1/SigProfilerAssignment.egg-info → sigprofilerassignment-1.1.2}/PKG-INFO RENAMED Viewed

@@ -1,6 +1,6 @@
 Metadata-Version: 2.4
 Name: SigProfilerAssignment
-Version: 1.1.1
+Version: 1.1.2
 Summary: Mutational signatures attribution and decomposition tool
 Home-page: https://github.com/AlexandrovLab/SigProfilerAssignment.git
 Author: Raviteja Vangara
@@ -34,7 +34,7 @@ Dynamic: summary
 [![Docs](https://img.shields.io/badge/docs-latest-blue.svg)](https://osf.io/mz79v/wiki/home/)
 [![License](https://img.shields.io/badge/License-BSD\%202--Clause-orange.svg)](https://opensource.org/licenses/BSD-2-Clause)
-[![Build Status](https://api.travis-ci.com/AlexandrovLab/SigProfilerAssignment.svg?branch=main)](https://app.travis-ci.com/AlexandrovLab/SigProfilerAssignment)
+[![CI](https://github.com/SigProfilerSuite/SigProfilerAssignment/actions/workflows/ci.yml/badge.svg)](https://github.com/SigProfilerSuite/SigProfilerAssignment/actions/workflows/ci.yml)
 <img src="SigProfilerAssignment/figures/SigProfilerAssignment.png" alt="drawing" width="1000"/>

{sigprofilerassignment-1.1.1 → sigprofilerassignment-1.1.2}/README.md RENAMED Viewed

@@ -1,6 +1,6 @@
 [![Docs](https://img.shields.io/badge/docs-latest-blue.svg)](https://osf.io/mz79v/wiki/home/)
 [![License](https://img.shields.io/badge/License-BSD\%202--Clause-orange.svg)](https://opensource.org/licenses/BSD-2-Clause)
-[![Build Status](https://api.travis-ci.com/AlexandrovLab/SigProfilerAssignment.svg?branch=main)](https://app.travis-ci.com/AlexandrovLab/SigProfilerAssignment)
+[![CI](https://github.com/SigProfilerSuite/SigProfilerAssignment/actions/workflows/ci.yml/badge.svg)](https://github.com/SigProfilerSuite/SigProfilerAssignment/actions/workflows/ci.yml)
 <img src="SigProfilerAssignment/figures/SigProfilerAssignment.png" alt="drawing" width="1000"/>

sigprofilerassignment-1.1.2/SigProfilerAssignment/DecompositionPlots/ExampleSample/CNV48_De-Novo_Signatures.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,49 @@
+MutationType	CNV48A	CNV48B	CNV48C	CNV48D	CNV48E
+0:homdel:0-100kb	0.00000083	0.00000295	0.00227050	0.00000075	0.00096858
+0:homdel:100kb-1Mb	0.00410855	0.00039561	0.00207384	0.02703219	0.00559786
+0:homdel:>1Mb	0.00000554	0.00122668	0.00000000	0.02703635	0.00696978
+1:LOH:0-100kb	0.00112830	0.00000063	0.01226193	0.00000000	0.00708714
+1:LOH:100kb-1Mb	0.00000391	0.01552501	0.00613728	0.03899750	0.03144637
+1:LOH:1Mb-10Mb	0.00401818	0.00000253	0.00000093	0.14062679	0.07397784
+1:LOH:10Mb-40Mb	0.00005266	0.00000012	0.00000048	0.10997624	0.04210990
+1:LOH:>40Mb	0.00000102	0.00000124	0.00000247	0.00002991	0.13316480
+2:LOH:0-100kb	0.00455813	0.00000060	0.00401138	0.01406873	0.00522486
+2:LOH:100kb-1Mb	0.00000259	0.01066978	0.04899240	0.00456627	0.00313024
+2:LOH:1Mb-10Mb	0.00019789	0.08507254	0.02222360	0.09357127	0.00935381
+2:LOH:10Mb-40Mb	0.00000000	0.08543525	0.04039981	0.08964456	0.00120907
+2:LOH:>40Mb	0.04000652	0.03252400	0.00482349	0.07308834	0.00000109
+3-4:LOH:0-100kb	0.00000000	0.00062965	0.00486737	0.00402011	0.00000348
+3-4:LOH:100kb-1Mb	0.00000000	0.02211930	0.00352244	0.01443590	0.00000289
+3-4:LOH:1Mb-10Mb	0.01154405	0.04058766	0.00000179	0.04505698	0.00000080
+3-4:LOH:10Mb-40Mb	0.00000431	0.01798391	0.03246762	0.01713715	0.00000000
+3-4:LOH:>40Mb	0.00010679	0.03244896	0.00503232	0.00000456	0.00000196
+5-8:LOH:0-100kb	0.00412411	0.00000286	0.00000075	0.00540728	0.00213831
+5-8:LOH:100kb-1Mb	0.00000000	0.01173257	0.00575306	0.00000030	0.00000283
+5-8:LOH:1Mb-10Mb	0.00831646	0.01147780	0.01165105	0.00003824	0.00000276
+5-8:LOH:10Mb-40Mb	0.00000041	0.00521012	0.00000159	0.00843632	0.00000427
+5-8:LOH:>40Mb	0.00082246	0.00295490	0.00000154	0.00000174	0.00000358
+9+:LOH:0-100kb	0.00000189	0.01177812	0.00000083	0.01804860	0.00002121
+9+:LOH:100kb-1Mb	0.00000000	0.00492384	0.00080071	0.00000000	0.00486780
+9+:LOH:1Mb-10Mb	0.00000000	0.01272578	0.00000243	0.00001046	0.00213166
+9+:LOH:10Mb-40Mb	0.00000168	0.00000432	0.00000648	0.00000194	0.00000654
+9+:LOH:>40Mb	0.00000168	0.00000432	0.00000648	0.00000194	0.00000654
+2:het:0-100kb	0.00424056	0.00000053	0.00183007	0.00000000	0.00545910
+2:het:100kb-1Mb	0.00000025	0.00000105	0.00494850	0.03848499	0.04887068
+2:het:1Mb-10Mb	0.02097226	0.00756213	0.00000000	0.00000012	0.12582459
+2:het:10Mb-40Mb	0.01623286	0.00846561	0.00877833	0.00000000	0.14361308
+2:het:>40Mb	0.00000046	0.00000128	0.00000645	0.00000556	0.32189335
+3-4:het:0-100kb	0.00000335	0.00000000	0.03500289	0.00305884	0.00017426
+3-4:het:100kb-1Mb	0.03277032	0.00000000	0.14771851	0.04636413	0.02342268
+3-4:het:1Mb-10Mb	0.47610782	0.00000132	0.00000610	0.07745060	0.00000115
+3-4:het:10Mb-40Mb	0.05013614	0.30243415	0.06416661	0.00749927	0.00000000
+3-4:het:>40Mb	0.00000735	0.00000731	0.46907268	0.00000069	0.00000308
+5-8:het:0-100kb	0.01322548	0.00000000	0.00611310	0.00000070	0.00000266
+5-8:het:100kb-1Mb	0.03631060	0.00000958	0.01778273	0.07310104	0.00000113
+5-8:het:1Mb-10Mb	0.20339816	0.09416172	0.00008219	0.00000176	0.00000000
+5-8:het:10Mb-40Mb	0.00006818	0.16540860	0.00001318	0.00000155	0.00000200
+5-8:het:>40Mb	0.01074217	0.00131701	0.01877488	0.00000803	0.00000051
+9+:het:0-100kb	0.00534523	0.00000160	0.00239221	0.00000048	0.00127719
+9+:het:100kb-1Mb	0.04305627	0.00000063	0.00095669	0.00312988	0.00000363
+9+:het:1Mb-10Mb	0.00000000	0.01518129	0.01502529	0.01964883	0.00000520
+9+:het:10Mb-40Mb	0.00837288	0.00000088	0.00000859	0.00000119	0.00000306
+9+:het:>40Mb	0.00000168	0.00000432	0.00000648	0.00000194	0.00000654

sigprofilerassignment-1.1.2/SigProfilerAssignment/DecompositionPlots/ExampleSample/COSMIC_CNV48_Signatures.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,49 @@
+MutationType	CN1	CN2	CN9	CN20	CN3	CN4
+0:homdel:0-100kb	0.00179505	0.00223767	0.00818184	0.00004078	0.00000295	0.00000075
+0:homdel:100kb-1Mb	0.00380710	0.00719579	0.02099919	0.00017845	0.00039561	0.02703219
+0:homdel:>1Mb	0.00243675	0.00383711	0.00900922	0.00011722	0.00122668	0.02703635
+1:LOH:0-100kb	0.00284045	0.00282654	0.01858365	0.00050182	0.00000063	0.00000000
+1:LOH:100kb-1Mb	0.01226306	0.00632391	0.13080787	0.00081924	0.01552501	0.03899750
+1:LOH:1Mb-10Mb	0.01916342	0.00102376	0.15994920	0.00624116	0.00000253	0.14062679
+1:LOH:10Mb-40Mb	0.04729776	0.00048336	0.07622936	0.00283775	0.00000012	0.10997624
+1:LOH:>40Mb	0.07364600	0.00012432	0.02700069	0.00001202	0.00000124	0.00002991
+2:LOH:0-100kb	0.00118798	0.00248892	0.00411906	0.00060974	0.00000060	0.01406873
+2:LOH:100kb-1Mb	0.00430310	0.01946487	0.01377423	0.00134094	0.01066978	0.00456627
+2:LOH:1Mb-10Mb	0.00443801	0.03355154	0.01159439	0.01443458	0.08507254	0.09357127
+2:LOH:10Mb-40Mb	0.00431859	0.05229117	0.00494515	0.00966270	0.08543525	0.08964456
+2:LOH:>40Mb	0.01221565	0.06737476	0.00240730	0.00049936	0.03252400	0.07308834
+3-4:LOH:0-100kb	0.00137995	0.00271740	0.00183353	0.00256100	0.00062965	0.00402011
+3-4:LOH:100kb-1Mb	0.00166785	0.01381945	0.00284860	0.02182453	0.02211930	0.01443590
+3-4:LOH:1Mb-10Mb	0.00151428	0.01247139	0.00344351	0.02055562	0.04058766	0.04505698
+3-4:LOH:10Mb-40Mb	0.00010220	0.01063124	0.00139001	0.00224340	0.01798391	0.01713715
+3-4:LOH:>40Mb	0.00736761	0.01742692	0.00119860	0.00094554	0.03244896	0.00000456
+5-8:LOH:0-100kb	0.00035130	0.00168941	0.00037594	0.00091844	0.00000286	0.00540728
+5-8:LOH:100kb-1Mb	0.00021211	0.00341625	0.00083617	0.00241053	0.01173257	0.00000030
+5-8:LOH:1Mb-10Mb	0.00020778	0.00449531	0.00066162	0.00524955	0.01147780	0.00003824
+5-8:LOH:10Mb-40Mb	0.00009972	0.00275604	0.00037649	0.00029923	0.00521012	0.00843632
+5-8:LOH:>40Mb	0.00033194	0.01008962	0.00038263	0.00012116	0.00295490	0.00000174
+9+:LOH:0-100kb	0.00013399	0.00052020	0.00075942	0.00014531	0.01177812	0.01804860
+9+:LOH:100kb-1Mb	0.00041199	0.00066864	0.00123437	0.00085741	0.00492384	0.00000000
+9+:LOH:1Mb-10Mb	0.00020077	0.00082900	0.00057456	0.00046208	0.01272578	0.00001046
+9+:LOH:10Mb-40Mb	0.00000651	0.00035090	0.00001019	0.00010940	0.00000432	0.00000194
+9+:LOH:>40Mb	0.00000276	0.00071277	0.00000455	0.00001071	0.00000432	0.00000194
+2:het:0-100kb	0.00012686	0.00107728	0.00281376	0.00053199	0.00000053	0.00000000
+2:het:100kb-1Mb	0.00239269	0.00144857	0.05745673	0.00464189	0.00000105	0.03848499
+2:het:1Mb-10Mb	0.01722643	0.00057147	0.15992032	0.00278654	0.00756213	0.00000012
+2:het:10Mb-40Mb	0.11204389	0.00040127	0.12954364	0.00139670	0.00846561	0.00000000
+2:het:>40Mb	0.64754824	0.00000162	0.00676787	0.00000815	0.00000128	0.00000556
+3-4:het:0-100kb	0.00098644	0.00130161	0.00668678	0.00077956	0.00000000	0.00305884
+3-4:het:100kb-1Mb	0.00362315	0.01521748	0.06747132	0.08651517	0.00000000	0.04636413
+3-4:het:1Mb-10Mb	0.00173459	0.05815643	0.04351086	0.33498798	0.00000132	0.07745060
+3-4:het:10Mb-40Mb	0.00300954	0.13520088	0.00753038	0.16201175	0.30243415	0.00749927
+3-4:het:>40Mb	0.00537392	0.39028478	0.00287618	0.00119273	0.00000731	0.00000069
+5-8:het:0-100kb	0.00074121	0.00171720	0.00171967	0.01515300	0.00000000	0.00000070
+5-8:het:100kb-1Mb	0.00011638	0.01163041	0.00135021	0.14454268	0.00000958	0.07310104
+5-8:het:1Mb-10Mb	0.00020400	0.01933555	0.00113611	0.10976846	0.09416172	0.00000176
+5-8:het:10Mb-40Mb	0.00001935	0.02564167	0.00046809	0.01800115	0.16540860	0.00000155
+5-8:het:>40Mb	0.00052566	0.04417481	0.00041355	0.00182344	0.00131701	0.00000803
+9+:het:0-100kb	0.00010526	0.00099145	0.00168183	0.00357070	0.00000160	0.00000048
+9+:het:100kb-1Mb	0.00031818	0.00324101	0.00425206	0.00971177	0.00000063	0.00312988
+9+:het:1Mb-10Mb	0.00018704	0.00377986	0.00080882	0.00568101	0.01518129	0.01964883
+9+:het:10Mb-40Mb	0.00000174	0.00190840	0.00003117	0.00085042	0.00000088	0.00000119
+9+:het:>40Mb	0.00001176	0.00209996	0.00002929	0.00003526	0.00000432	0.00000194

sigprofilerassignment-1.1.2/SigProfilerAssignment/DecompositionPlots/ExampleSample/COSMIC_DBS78_Signatures.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,79 @@
+MutationType	DBS1	DBS2	DBS3	DBS4	DBS5	DBS6	DBS7	DBS8	DBS9	DBS10	DBS11
+AC>CA	5.01701937314426e-05	0.00037763192433099	0.00633751919816087	0.0041466645172504	0.00214198792883815	0.00266518526451099	0.0459320112885566	0.215131968007548	0.0246556888496588	0.00958964366413706	0.00137721183664123
+AC>CG	2.66497608553337e-05	3.20078395756481e-05	4.64086051518866e-05	4.96798454240629e-05	0.00046242916968375	0.000146284604743836	0.00625435883558777	0.000973597231959742	0.0020746860129591	1.76258248032425e-05	0.000195021238181313
+AC>CT	0.00433058613899172	0.000127223589480494	0.00301406424857415	8.33339342597184e-18	0.00202187645619302	0.000240467843414526	0.013609484826239	0.318195189890234	0.0285645175697268	0.0134434256973884	0.000759979670438519
+AC>GA	0.00012820150108437	0.000239301513546644	0.00583850193846317	0.00440708306181203	0.000558518347799854	0.00859672540206928	0.00973678583524305	0.00116071201343607	0.0253572734917223	0.00532757981340948	0.000444326738536805
+AC>GG	5.76402024560437e-05	4.21049498518778e-18	0.000449115533727935	7.02128460529598e-18	1.11103112196745e-17	0.000104202732146294	0.00254177143078287	0.00081049718179588	0.00714614071130357	0.000587527493441419	0.0022618442572575
+AC>GT	0.00298800348984044	0.000282719087734432	0.0100801486458937	1.12180296118852e-08	0.000822763587619139	0.000132257313877989	0.00450313836162319	0.000151092684507627	0.0121273916699542	0.0285797272233369	0.00574005809286235
+AC>TA	0.00121135276615153	0.00149437232088199	0.00100801486458937	0.00127204442920484	0.00148137482928993	0.0101196884103613	0.00542377998222172	0.0124076111781097	0.0412932675043067	0.000104559977646354	0.00026538972618488
+AC>TG	0.000173627229815052	6.42176213568208e-06	1.1078183165289e-17	5.3185479677777e-05	0.00112104041135454	0.000449875257054674	0.000998696018866657	0.00257157747804372	0.0179405215613371	7.62789932162927e-06	0.000240258123326463
+AC>TT	0.0267507069191796	0.00294835620065907	1.77650144452383e-06	0.000161259175670849	0.00747693917215933	0.00318619892524246	0.00118082294815897	0.00026816449965592	0.0445005115823111	0.000707024610751539	0.00283484480242939
+AT>CA	0.000484052925155735	3.79704129765047e-05	0.00698995923811002	0.000912747084583705	0.000107543315783846	0.000113633671650282	0.0110505063255381	2.76737305155497e-05	0.0126631623811337	0.00349709402696314	0.00948079897599927
+AT>CC	0.000298264976703845	4.18879952677314e-18	0.00901545879006234	6.97514147607635e-18	2.12099317240363e-05	6.36946633197634e-05	0.00623208735115937	0.000142350484306605	0.00177483693215891	0.00114918670574427	0.00190016013232053
+AT>CG	3.99695153966769e-06	4.18879952677314e-18	0.0144962222835804	9.42640548052605e-18	1.04556001456517e-17	1.81415160003082e-06	0.00110505063255381	0.000264791809968928	9.19325646882309e-18	0.00256585652403245	1.74014664749354e-05
+AT>GA	0.00212902946334057	0.000168757391006687	0.00179713440638908	0.000322849405464106	0.00110530630111175	0.00161479428134611	0.0143357919898874	0.000161264185018671	0.00635152317856866	7.98486624853342e-05	0.0112009439378894
+AT>GC	0.000174741097462859	5.87637343684001e-06	0.00521268267046557	1.75374985684206e-05	1.04556001456517e-17	1.71447294068846e-05	0.00924857691569817	0.000224973492680368	0.00180474991416158	0.00404196703399706	0.00418035229110517
+AT>TA	0.0023499664831212	0.000460064792149184	0.00233329605249411	0.0045139129838037	0.000789646753857315	0.00219293050553176	0.0338483977539007	0.000313569248647416	0.00917331448082131	0.00290268711019887	0.0038403236358478
+CC>AA	1.05918794343151e-05	0.723624795251583	0.00898022503796504	6.94023815301923e-18	1.04032807495661e-17	8.23192932638496e-18	8.95465754871779e-18	0.0377371623225475	8.94883179785459e-18	0.0135043760749618	7.3138372596909e-18
+CC>AG	1.22905770794412e-05	0.0725623758774377	1.09659513664919e-17	0.00538364188155635	0.0240761640204245	0.0610948007837727	8.22164354583603e-05	0.0153523888713776	0.0261917028229891	7.02818988426843e-05	0.000967217662097899
+CC>AT	0.0186856740963861	0.0999481761397214	0.00581886968906645	0.0155659627146288	0.00240761640204245	0.000434407836741761	0.000843956662777386	0.0285257289997209	0.0193461441306169	0.0103500692545328	0.0343302565250797
+CC>GA	0.000133897343792286	0.0176908271767307	0.000627331452047062	0.00351969220617404	6.69773122543496e-05	0.0352088543477911	0.000299148957932828	0.000801295651415775	0.0109132095095787	0.003341593787892	0.000948311144011622
+CC>GG	9.81247698537496e-05	0.000449766792628746	7.16244571234835e-05	7.23767693100577e-05	1.17903848495083e-05	0.0179515567238034	0.00203064689987517	5.54666952772353e-05	0.00303585646357373	7.30419173105597e-18	0.00343302565250797
+CC>GT	0.00691469864957177	0.00109942993753694	1.12623284304512e-17	7.9217861203748e-05	2.45715583418324e-05	0.00341178757623666	0.000161461192526659	0.000226819164615837	0.0177587682019509	0.00106457855189479	0.0691580529997983
+CC>TA	0.0103920326525356	0.0159917081823554	0.0205488097678408	0.000168548640859039	0.00125830157637609	0.00220179314512947	8.95465754871779e-18	0.000709181318187509	0.000681579539370964	0.0235587290650793	0.0585106980775272
+CC>TG	0.00254804646768902	0.00023687717745114	2.86497828493934e-05	8.22913952429423e-06	0.0047656933719441	0.00681365716533309	0.000233772033351482	0.00416990691280643	0.0153777043089519	7.30419173105597e-18	0.0321410807466688
+CC>TT	0.857342693834187	4.16783894502638e-18	1.09659513664919e-17	6.94023815301923e-18	1.04032807495661e-17	8.23192932638496e-18	8.95465754871779e-18	0.0043382879520409	8.94883179785459e-18	0.0203058501565119	0.330366526560188
+CG>AT	6.16653830871348e-07	0.0011763313521222	0.000287143265528763	0.000294260040001608	0.0016629600883285	0.00765335476312575	6.2954837882978e-05	0.000326405219050766	0.000222362158326074	7.47530854576301e-18	0.00185347315330616
+CG>GC	5.54272597565955e-06	0.000377448929507038	1.12228529836946e-17	5.17491794485586e-06	0.000100588805342797	0.000598869935045648	0.000189574149502687	1.1454593090912e-17	1.21842278534835e-05	1.91674578096487e-05	0.000169053045851
+CG>GT	1.73849338719949e-06	0.00130930793975341	1.12228529836946e-17	7.10282855176294e-18	0.00657072034900529	0.00326840879804575	2.09849459609927e-05	0.00122655377345164	0.000100926020719688	1.02898984030746e-05	0.00120170237412157
+CG>TA	0.000364060968142951	4.26547977247791e-18	0.0989835411805136	7.10282855176294e-18	1.06470005655178e-17	8.4247804421676e-18	9.16444016847213e-18	0.000512922487079774	9.15847793653509e-18	0.361155257676539	7.51573179747221e-18
+CG>TC	1.28853039286551e-05	0.00219922818005455	0.000729990977858334	7.10282855176294e-18	3.02172016049935e-05	0.00904395105297751	4.93703801111276e-05	0.000917381128077462	0.000135041858709442	0.00267335595766154	0.000697598412095998
+CG>TT	0.000126807752948668	0.00568730636330387	0.00724935638676489	0.000366303015312347	0.00225108011956663	0.0189811318395824	3.17308603178295e-05	0.000333500984682303	8.41727074211485e-05	0.00783848143057741	0.000711855897890661
+CT>AA	2.7933194990298e-05	0.00323782659890067	0.000102691439563387	7.00403091014318e-18	0.465951395764967	0.00448409944446993	9.036966293971e-18	0.0205913663412117	9.03108699441082e-18	0.00390949072973925	0.00441859615813218
+CT>AC	0.000422527389925446	4.20614857240368e-18	0.0290128241873257	7.00403091014318e-18	0.208978201104889	0.0019517843564099	1.00966105718039e-17	0.0139941324649011	9.03108699441082e-18	0.0129321576301807	0.00235993203900241
+CT>AG	2.8739929863664e-18	0.000592088540048191	0.11365848650705	0.000363209031483139	0.0266972151650743	0.0395361446554826	0.00125957716044286	0.0203914501631417	0.000582715369262427	0.0263617059384453	0.000498096294189446
+CT>GA	8.99509383803096e-05	1.82569038754212e-05	1.7148473402818e-05	0.000673387543218051	0.0160983207549699	0.00734671650053777	0.00186937245240329	0.00556766555924998	0.00284349080533555	7.37132984920301e-18	0.0116490262350758
+CT>GC	0.000254121485110291	0.000135161608801461	2.68194147985932e-05	7.22415759589054e-05	0.0048494941404723	0.00179163794767884	0.0155947648435783	0.00023690067101297	0.00311382267767379	7.37132984920301e-18	0.00613582330140627
+CT>GG	1.08909207904411e-05	9.05784512714267e-05	5.97205556295812e-05	0.000926533231827512	0.000569940548467878	0.0068162315216161	0.00399865765219956	0.000305871752447126	0.0104127832308063	7.37132984920301e-18	0.0040369901262935
+CT>TA	0.00787574920123564	0.00340930028170849	0.000183448785239448	7.00403091014318e-18	0.00333965163488195	8.84808908239154e-05	9.036966293971e-18	0.0108954317048159	9.03108699441082e-18	0.00400896886535602	0.0418762408622981
+CT>TC	0.0105883952129288	3.87328789401202e-05	0.00632100705662012	7.00403091014318e-18	0.000236975280678749	8.30759495292418e-18	0.063178790904753	0.0177925398482315	3.00368747042488e-05	0.0027356487294613	0.00300263693473073
+CT>TG	0.00225885764542482	0.000393380801735595	0.0520436227690173	3.081773600463e-05	0.00087390884098408	0.0112102486111748	9.036966293971e-18	0.000965595140078182	9.47162782340647e-18	0.0454615079768661	0.00148625507137173
+GC>AA	0.00158449926475142	0.00509572963466284	2.14163215845169e-05	0.326375814639811	0.000132251453064467	8.26170007893507e-18	8.98704204614045e-18	0.012823357977946	8.98119522646331e-18	0.00403628581338043	0.000998678603332873
+GC>AG	0.000107304697043293	0.000326006325052249	0.000517561104959159	0.0112440448336277	0.00264502906128933	0.00364311111914487	7.25723528062227e-05	0.00846938061799223	0.123466541915903	7.33060732283065e-18	0.00328565260496515
+GC>AT	4.88386798692369e-05	0.00095595085469167	0.00395607051491771	0.00919424550997517	0.00156116376925724	0.00187132483715638	0.000347949636742163	0.00547726375647148	0.125457937753257	0.00766696447394568	0.0271640580106541
+GC>CA	5.77640238289127e-05	0.00106328216786272	0.000234984639607895	0.0118410737628468	0.0045542229701899	0.00864990044408985	0.000666075018906428	0.00480130380104488	0.02728212297174	0.000103875002550232	0.00210721185303236
+GC>CG	5.16466532498091e-06	6.71071481415245e-05	1.10056097031545e-17	9.78132395704069e-07	0.000321182100299419	8.99828538717747e-18	0.00263447582104781	0.000240562219431234	0.0024892447966916	7.33060732283065e-18	0.00403466155746481
+GC>TA	8.29354994904702e-07	0.000738278939195246	0.00419402964363457	0.0176123534119654	0.000220750545716628	0.000825174622341827	6.20344495220314e-06	0.00850914296831143	0.013939770861473	0.00277989292539192	0.000242678900609888
+TA>AT	0.000504971228544323	0.00275052540183135	0.00143350572498961	0.0301618523646949	0.00185408960514584	0.00850574690040247	0.0553124433348494	0.00961444216508748	0.0153886172750149	0.010258772260155	0.00222060293444846
+TA>CG	7.54956985249432e-06	1.89036109434954e-05	0.00330200629066574	0.00038595265032455	7.82287004524101e-06	0.000257058161867473	0.00302335039733496	2.07156537371472e-05	0.00134029892395291	0.0040541878835805	0.000581539064447487
+TA>CT	0.00070196000482795	0.000280053495459192	0.000340086875445813	0.00865168923092566	0.00225068631212891	0.0259043166978418	0.0288457365778515	0.00406383637905759	0.0140979590519492	0.00159800106360107	0.00336575691409676
+TA>GC	2.00988548390908e-05	8.22157047383769e-05	0.00196736302946851	6.96500669737364e-05	5.17558702612903e-05	0.000262020674644837	0.00149680626228714	0.000782040708067425	0.000574839316273137	7.30937523536046e-18	0.00101570179064458
+TA>GG	7.0295994785477e-05	7.89150742561793e-05	0.00539789052306435	0.0022026089555797	0.001616131580956	0.000216365557093086	0.00427234105328317	0.000215085974208658	0.00322664555766442	0.00847335131872421	0.000373419775972273
+TA>GT	0.00114993448084351	0.00130024837177482	0.000357882118928442	0.00799685954142899	0.00189374927584415	6.20314097170542e-05	0.0260702017868555	0.000151650479511174	0.00772409305803973	0.00356097767876535	0.00265874880492259
+TC>AA	1.10480988298362e-05	0.00147006576888118	0.00550160708190254	0.38116185568263	0.0406028271297742	0.0460768634513965	0.0196938448407757	0.0389825171904766	0.00371347122518981	0.00755909218025223	0.000219034021332678
+TC>AG	3.13198398020127e-06	0.000202767692259473	6.15298132657224e-06	0.00188066667579557	0.014974805055288	0.00833005304317821	4.01915200832158e-06	0.0116545669950909	0.0469970477551121	0.000270967457784173	0.0478442977473225
+TC>AT	0.00249342413957771	4.22770638361003e-18	0.00112236792927702	0.00845797152055652	0.000751755314184929	0.00059759076179322	0.0023009645247641	0.0185870249490674	0.0521294876598461	0.00308962894669039	0.0853929871186388
+TC>CA	4.48005475485101e-06	0.000691437830604804	0.0656384815782543	0.0850825672579169	0.00143717927711825	0.0118713316315825	0.00272297548563787	0.0176827913028965	0.0491104053629437	0.0251969739341741	0.000284643290395463
+TC>CG	3.34483726040912e-05	3.94383161444676e-06	0.000116245249817977	0.000402281641881404	1.06532170191982e-17	0.000867210836137635	0.00163780444339104	0.0109512741591803	0.00783955036428959	0.000841898890975182	0.00327036971943723
+TC>CT	0.00192581539235676	0.00339635884534619	0.0194410159178341	8.32722998694506e-06	0.00105527149718473	0.00944676305258979	0.00923400173911883	0.00880120748939626	0.0517269433535924	0.0261968538521969	0.0202884047409532
+TC>GA	6.50722885206865e-05	0.000897247038248169	0.0779644865158502	0.0366076294112077	2.47235036483279e-05	0.00738437069286571	9.08328353880676e-18	0.00965520593300206	0.0174100412454698	0.0437947404093979	0.000237202741996219
+TC>GG	0.000416584276978227	1.0006585613005e-05	0.000177374217394672	1.04593226889165e-05	3.49747124781224e-05	0.00151912803082115	0.000709380329468758	0.0019189847379848	0.00375372565581517	7.40911019254881e-18	0.00739870680354163
+TC>GT	0.005169293947905	8.68859561331843e-05	0.0434917572594845	7.03992873292456e-18	3.87937902774576e-05	8.35017394424869e-18	9.08328353880676e-18	0.000277298318159059	9.20820100555195e-18	0.0458944882372457	0.0153424752269895
+TG>AA	0.00138117400432027	0.00298488256850051	6.65825562048864e-05	0.00763240727083881	0.0179934395849107	0.0255166928805809	0.0225865373304628	0.00864412496921782	0.0158153045638171	0.00141222197884899	0.0078610467814133
+TG>AC	0.000238933021185331	0.000221849380091253	8.01382862106716e-05	0.000118037229090299	0.00145946787744276	0.0101066116899556	0.00261843928344303	0.00384738510190619	0.00727704203664244	0.000205866161705451	0.000869433781954523
+TG>AT	0.00242965646015462	0.00432606291177945	0.000954881569525168	7.0022085053567e-18	0.0203925648628988	0.221144671631701	0.00128923155558836	0.00821441702277115	0.000746722607886556	0.00248630630079047	0.0105416336149221
+TG>CA	0.000281275581901718	0.000145210503332457	0.0158482431685283	0.000804253662615256	0.000475826513467639	0.0114074626995538	0.0238857629291177	0.00505656327679099	0.0228220850667741	0.0290400575932327	0.0563224424568693
+TG>CC	0.000103840089375903	5.98993326246385e-05	0.000482424509029416	0.000120037860091829	0.000505815579442491	0.00789516497363855	0.00104937452199053	0.0012491510071124	0.0118114299906989	0.000188959278860076	0.00314241078235295
+TG>CT	0.00186508898393613	0.00309580725854613	0.00605024125993504	8.21259026128265e-05	0.000327880454658373	0.275180021261167	9.03461493218511e-18	0.0194867557109534	0.00096893764669462	0.00430628251296909	0.00560212529250143
+TG>GA	0.000410319576465947	0.00148235722151883	0.000521297558310713	0.00785247668100716	0.00326880819125878	0.007444870393393	0.00824508552992558	0.000270815938341968	0.00618598621546771	2.0089354910387e-05	0.00733898492619811
+TG>GC	8.96250868496873e-05	0.00027428650629464	0.000496378936976548	0.000604190562462208	0.000291893575488552	0.0056036658875001	0.00387768870983166	0.00353759565214232	0.0039137873952231	7.36941187554295e-18	0.00614426644984027
+TG>GT	0.00191549679431277	0.0064538001481092	0.0102664719896756	3.23101906747174e-05	0.0826698585373399	0.0274179366638398	0.0087048115109881	0.00785466153272277	0.00334323526855375	0.00215811386908613	0.00526077715639919
+TT>AA	0.00554720337294364	0.00435598849704567	0.00321672392307967	1.80461024721005e-05	0.00492924838783148	0.000193559918436418	0.235387282038808	0.00358560026647744	0.000342096607337598	0.0144529513067107	0.00479966485598206
+TT>AC	0.000727502081697526	0.00034868121380064	0.00242752768108185	6.61690423977018e-07	0.000967815842001059	0.000128371344869748	0.0400659203470312	1.13176768187696e-17	0.00668141760958476	7.38595649536045e-18	0.00104646780927072
+TT>AG	0.00042235537520773	0.000217294089759819	0.0228767011920882	7.01792873915019e-18	0.000894678619986486	0.00212615039940521	0.0539888276676245	0.0146228390755784	0.000920952156996819	0.00693741662722115	0.00127789819016713
+TT>CA	0.000732554179487092	4.21449467115556e-18	0.0006932939138563	7.01792873915019e-18	1.0519737413055e-17	8.32407939389773e-18	0.0978610104476238	0.00629983957434166	9.05903919137394e-18	0.00128581428866599	0.0020325624756989
+TT>CC	0.00547647400388971	3.01179715108958e-06	0.00815169789202796	7.01792873915019e-18	0.000774453049551572	8.32407939389773e-18	0.0354583395071226	0.000294459910152057	0.00517659382364225	0.00287065515609151	0.00402487618950277
+TT>CG	8.46731589531287e-05	1.53621868109267e-05	0.0317676461968737	7.2685690512627e-18	1.0519737413055e-17	1.1232492676103e-05	0.00267440018316433	0.000116181461148431	1.98636739744412e-05	0.00855216015252263	1.00219417118619e-17
+TT>GA	0.0018793803777186	4.84111018581178e-05	0.0122874857931304	7.01792873915019e-18	2.99562046333661e-05	8.32407939389773e-18	0.043671853178264	0.00363567848248969	9.19948941139524e-18	0.00866180323140112	0.000711396866494616
+TT>GC	0.00107104473138802	1.55643208479127e-06	0.0664323418896887	7.01792873915019e-18	5.67063940551345e-05	4.10186562904117e-07	0.00367604819184011	0.000286447395590098	3.57144845197024e-05	0.0257162857733198	5.81594609383151e-06
+TT>GG	0.0016267754882403	4.21449467115556e-18	0.170826022002057	7.01792873915019e-18	1.0519737413055e-17	8.32407939389773e-18	9.05489799842905e-18	0.000538841604291861	9.04900703280099e-18	0.0844251707364413	7.38564780773759e-18

sigprofilerassignment-1.1.2/SigProfilerAssignment/DecompositionPlots/ExampleSample/COSMIC_ID83_Signatures.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,84 @@
+MutationType	ID1	ID2	ID3	ID4	ID5	ID6	ID7	ID8	ID9	ID10	ID11	ID12	ID13	ID14	ID15	ID16	ID17	ID18
+1:Del:C:0	0.000159889000761019	0.0048241160289447	0.124727109374181	0.00724971696375141	0.0222021078667874	0.0305067990915204	0.000466560997200634	0.0398275578805173	0.33493987999518	0.0251054140979111	0.00157656499873875	0.052787740788849	0.0655483705411614	0.0120160090841121	0.026527369337078	0.000952768885842137	0.00611759853519847	0.00601204810230084
+1:Del:C:1	0.000773523003681714	2.21000001326e-05	0.208876169626629	0.00273486898632566	0.0285472148287167	0.00549190301647571	1e-18	0.0239159379282522	0.0999942257000173	0.0293063201142946	0.000550317999559745	0.0146746649413013	0.0175364628772448	0.00194623201362362	0.12100978700592	2.63915642267698e-18	0.00366755530652	0.00200401603410028
+1:Del:C:2	3.31000001575451e-18	3.11000001866e-06	0.176324217528973	0.00204106298979469	0.0265969268404184	0.00803399402410198	0.00856194494862833	0.00333055399000834	0.00269065499192804	0.0188040560733358	0.00035733799971413	0.000561931997752272	0.00512021896415847	0.000683696004785872	0.147828864433683	8.1541662061712e-05	0.00122032669693285	0.00200401603410028
+1:Del:C:3	0.00190761300907961	0.00247207601483246	0.0640427641921283	0.00111228299443858	0.0141591219150453	0.00110237900330714	0.0423601467458391	0.00540315298379054	0.0106254159681238	0.0165035600643639	9.07999999273599e-18	0.000995576996017692	0.00535051596254639	0.000487468003412276	0.136006057901119	0.00162491353986988	2.25926833737838e-08	0.00400803206820056
+1:Del:C:4	0.000705990003360279	0.00385697602314186	0.0439898081319694	0.00107568399462158	0.00287342198275947	0.00247817000743451	0.114891908310649	0.00127570899617287	0.0124969019625093	0.00293063201142946	9.07999999273599e-18	0.0022400499910398	0.00434600496957797	0.00207192101450345	0.0841976961066638	0.00337864255670055	1.94094358196916e-08	1e-18
+1:Del:C:5	0.00337011501604064	0.0146154240876925	0.0224174860672525	0.00224617798876911	0.00260244898438531	0.00132207300396622	0.251763140489421	0.000933728997198813	4.47999998656e-05	8.420000032838e-18	0.000156464999874828	0.0294108078823568	0.000843055994098608	0.00237027601659193	0.0184582927326813	2.65063753759673e-18	0.00122093334450846	0.00200401603410028
+1:Del:T:0	0.00131160500624281	0.0079059660474358	0.0375992301127977	0.00663505196682473	0.101481148391113	0.00428416201285249	0.00266748998399506	0.0342436868972689	0.105105372684684	0.0283061051103938	0.000944205999244634	0.0451351178194595	0.0536987616241087	0.0183098031281686	0.0239516368486624	0.000628649514543184	0.0060883465666712	0.0861726904663161
+1:Del:T:1	3.31000001575451e-18	3.9500000237e-18	0.0133098240399295	0.00162246599188767	0.106099610363402	0.000677688002033064	0.00773272495360365	0.0104520759686438	0.0442936408671191	8.420000032838e-18	0.000258504999793196	1.41999999432e-17	0.498224164512431	0.000852559005967913	0.0799601100183372	0.000157040098524865	0.00490319649725692	0.172345379932628
+1:Del:T:2	0.000936453004457207	0.00703641804221851	0.0165018510495056	0.00263340498683298	0.114128463315229	0.011659665034979	0.00025475999847144	0.00899202997302391	0.0858619557424141	0.00151032600589027	0.000516518999586785	0.0109692039561232	0.0237778048335554	0.010856423075995	0.120410466467629	2.65806380183744e-18	0.00122548208393169	0.118236947011921
+1:Del:T:3	0.00229585501092751	0.0202347431214085	0.0201414770604244	0.00030603799846981	0.0889622074662269	0.0222423910667272	0.0289727418261635	0.00982504497052486	0.113250662660248	0.00142030600553919	0.000425679999659456	0.0221093659115625	0.0627809515605333	0.0171839501202877	0.113431215342833	2.6607938700793e-18	0.00122381019049612	0.238477910057941
+1:Del:T:4	0.00429142202042575	0.0471199252827195	0.0158143640474431	0.00102320199488399	0.0522595316864428	0.0176971410530914	0.158850552046897	0.00127377999617866	0.0944127367167618	0.00241052000940103	0.00193245099845404	0.0440779638236881	0.0230043818389693	0.0133479030934353	0.079178831808195	0.00100165069513296	1.34150268406511e-09	0.0901807225345166
+1:Del:T:5	3.31000001575451e-18	0.814697226888183	0.00806631402419893	0.00015444199922779	0.0306105228163369	0.00795434502386303	1.91999998848e-07	0.010620341968139	0.000929834997210495	1.270000004953e-17	0.00653939499476847	0.000348511998605952	0.00607957495744298	0.038616999270319	0.046903214753917	2.79097673434101e-18	4.62677534678498e-08	0.0701405621935138
+1:Ins:C:0	3.31000001575451e-18	3.9500000237e-18	0.00208309200624928	6.61999996689999e-18	0.000542251996746488	0.00208688700626066	0.000672366995965798	0.00276427099170719	5.40999998377e-18	8.420000032838e-18	0.00018623799985101	1.41999999432e-17	0.002850427980047	0.454386958180709	6.58004610552164e-18	0.0602713372040219	0.00487811801329939	1e-18
+1:Ins:C:1	3.31000001575451e-18	0.000227026001362156	0.00157888700473666	0.000272398998638005	0.00124289799254261	0.0017734330053203	2.61999998428e-05	0.00216911899349264	1.92999999421e-06	0.000345074001345789	0.163482883869214	0.000167696999329212	0.00165225598843421	0.012777431089442	6.58004610552164e-18	0.136484095403874	0.0147671987268637	0.00200401603410028
+1:Ins:C:2	3.31000001575451e-18	2.62000001572e-05	0.00174794600524384	6.87999996559999e-05	0.00315166698109	0.000246169000738507	2.57999998452e-05	0.001526999995419	0.000352622998942131	0.00027205900106103	0.0937388429250088	0.00159658599361366	0.00082124999425125	0.00065885000461195	6.58004610552164e-18	0.124683558062386	0.0292604047473039	1e-18
+1:Ins:C:3	0.000845986004026614	0.0004300500025803	0.00617764701853294	0.000512480997437595	0.000602847996382912	0.000232169000696507	0.00240773498555359	0.000116523999650428	5.40999998377e-18	0.00258055601006417	0.0361756399710595	0.000450318998198724	0.000375554997371115	0.00156440301095082	6.58004610552164e-18	0.0988831205554055	0.0492545218208812	1e-18
+1:Ins:C:4	0.00178552500849851	0.00291184601747108	0.00710444702131334	6.61999996689999e-18	0.000197581998814508	0.000376592001129776	0.0154854309070874	0.000554176998337469	2.15999999352e-06	0.000411089001603247	0.0111897889910482	0.00439392998242428	0.000148577998959954	0.00153950201077651	6.58004610552164e-18	0.0620943792528956	0.024538407850484	1e-18
+1:Ins:C:5	0.0242965361156435	0.00901753605410521	0.00735110102205329	0.000249142998754285	0.000433543997398736	0.000247997000743991	0.0603432286379406	0.000489488998531533	7.36999997789e-05	0.000851184003319617	0.00341224199727021	0.017051489931794	0.000706980995051133	0.00229299901605099	6.58004610552164e-18	0.0310346026384888	0.00979050282269531	1e-18
+1:Ins:T:0	0.00228382401087025	0.00132855600797134	0.0187223650561671	0.000333664998331675	0.00636196496182821	0.00639625101918875	1.35999999184e-06	0.00450797898647606	0.0126144839621565	0.0170036670663143	0.000406944999674444	0.0042653009829388	0.0411370127120409	0.032612007228284	6.58004610552164e-18	0.0301942868072769	0.00489279435946823	1e-18
+1:Ins:T:1	4.03000001918147e-05	3.9500000237e-18	0.0431190291293571	0.00101004399494978	0.0134626969192238	0.00104118700312356	0.000373647997758112	0.00486869598539391	0.0103852739688442	0.0438094491708568	0.314277275748578	0.00249651799001393	0.00474885296675803	0.00316588302216118	6.58004610552164e-18	0.103160227092233	0.0388936407223243	0.00200401603410028
+1:Ins:T:2	0.000192865000917974	0.000647033003882198	0.0401570401204711	1.0599999947e-05	0.0297211438216731	0.000738848002216544	0.0183827058897038	0.00142963599571109	0.00231466299305601	0.00365078701423807	0.161807822870554	1.41999999432e-17	0.0030541709786208	0.00177460601242224	6.58004610552164e-18	0.108738482879835	0.0439246079078755	1e-18
+1:Ins:T:3	0.00424326702019655	0.00108287900649727	0.0251254340753763	0.000173934999130325	0.0188402498869585	0.000930638002791914	0.00889163494665019	0.00108728599673814	0.00160088499519735	0.00375080901462815	0.10772532691382	0.000105673999577304	0.009271856935097	0.00117383600821685	6.58004610552164e-18	0.100939445323406	0.00487209062147903	0.00200000801803214
+1:Ins:T:4	0.0166491270792444	0.00348746102092477	0.00656330501968992	1.599999992e-05	0.0112687519323875	0.00134985200404956	0.0127879689232722	0.000822617997532146	0.00158535499524393	9.660000037674e-06	0.0490306799607755	0.00033647999865408	0.0120986409153095	0.00478499903349499	6.58004610552164e-18	0.0519623764470054	0.00490348556483425	0.00801606413640112
+1:Ins:T:5	0.890906468240421	0.00313258501879551	0.0261812390785437	0.000832925995835369	0.00143921499136471	0.0143900410431701	0.0107898489352609	0.0201612479395163	0.00577247998268256	1.110000004329e-08	0.0236290429810968	0.0001665499993338	0.0110997939223014	0.232747554629233	6.58004610552164e-18	0.0350076858492558	0.00487382956865314	0.00400803206820056
+2:Del:R:0	0.000686046003265353	0.000163809000982854	0.00689755302069266	0.0717242136413788	0.0280544068316736	0.00178364700535094	2.32999998602e-05	0.00876921897369234	0.0131747469604758	0.000839181003272806	9.07999999273599e-18	0.00626810497492758	0.0221843988447092	0.000661996004633972	6.58004610552164e-18	0.00192294222546196	0.0146820538320339	1e-18
+2:Del:R:1	0.00121996900580665	0.00356888502141331	0.00847465402542395	0.230512878847436	0.0245627288526236	0.00245434700736304	0.00818230195090619	0.0103071449690786	0.00319854099040438	0.00947204203694096	0.00136309899890952	0.0002784249988863	0.00433321496966749	0.00660003604620025	6.58004610552164e-18	0.00201464612586734	0.00853595089340418	0.036072288613805
+2:Del:R:2	0.000472749002250129	0.00184957401109744	0.0118006410354019	0.055059395724703	0.00456261797262429	0.0020886000062658	0.00899154094605075	0.000532025998403922	0.00118969699643091	0.0065414110255115	0.000150728999879417	0.00139816699440733	0.00310892397823753	0.00270193001891351	6.58004610552164e-18	0.001116794298881	1.46002268078368e-08	0.00200401603410028
+2:Del:R:3	0.000426720002031046	0.000739044004434264	0.00667112502001338	0.012811005935945	0.000395918997624486	0.000525746001577238	0.0721321375672072	2.70999999187e-05	9.58999997123e-05	0.000185040000721656	9.07999999273599e-18	0.00067330999730676	0.000105565999261038	0.000392799002749593	6.58004610552164e-18	0.000472257144989337	3.49583154490229e-08	1e-18
+2:Del:R:4	5.4600000259878e-05	0.000881932005291592	0.00282252500846758	0.00321921798390391	0.000867562994794623	0.000232527000697581	0.0522508416864949	0.000274026999177919	5.40999998377e-18	8.420000032838e-18	9.12999999269599e-06	0.011980738952077	6.12999995709e-06	1.41000000987e-06	6.58004610552164e-18	3.88261199448798e-05	4.34453853127852e-08	0.00200401603410028
+2:Del:R:5	3.31000001575451e-18	4.67000002802e-18	0.000101239000303717	0.0023827209880864	0.0214267798714393	0.000215685000647055	0.057046330657722	0.000833078997500763	5.40999998377e-18	8.420000032838e-18	0.00452771299637783	0.251519843993921	6.62999995359e-05	4.37000003059e-05	6.58004610552164e-18	2.64064568478846e-18	3.88695242109537e-08	1e-18
+3:Del:R:0	0.000128045000609452	1.2500000075e-05	0.000589124001767372	0.00506895397465523	0.0171363698971818	0.00105104700315314	0.000625411996247528	0.0109641009671077	0.00285809499142572	0.00120025900468101	0.000189441999848446	0.00759985896960056	0.00303966697872233	0.00114665900802661	6.58004610552164e-18	0.00106014137936679	0.00855857290020103	0.00400803206820056
+3:Del:R:1	0.00501108502385111	0.00500325803001955	0.000372386001117158	0.0971144655144276	0.00590979396454124	0.00541365301624096	0.011689002929866	0.0013488669959534	0.00430190998709427	0.0427092111665659	0.00039086299968731	0.000569428997722284	0.00118696299169126	0.00484016503388116	6.58004610552164e-18	0.00232592325104706	0.00244544588016729	0.00601204810230084
+3:Del:R:2	0.000769383003662009	0.00228989101373935	9.63000002888999e-05	0.0214842818925786	0.000842709994943741	0.000536054001608162	0.00547484896715091	0.000376570998870287	0.00127571699617285	0.00506109101973825	0.000170421999863662	0.00268033898927864	0.000384378997309347	0.00105348100737437	9.35232649418987e-05	0.00115037509281033	3.41157810969492e-08	1e-18
+3:Del:R:3	0.000371256001767056	0.000402587002415522	2.45000000735e-05	0.00383762698081187	0.00062115499627307	4.7000000141e-05	0.00345674797925951	0.000253508999239473	0.00030210999909367	0.0027305890106493	0.000127575999897939	0.0059200509763198	6.8999999517e-05	0.000249605001747235	6.58004610552164e-18	0.000120553148361788	1.98537113438362e-08	1e-18
+3:Del:R:4	3.31000001575451e-18	3.97000002382e-18	3.82000001146e-06	0.000786294996068524	0.00586707496479755	7.31000002193e-05	0.000492536997044778	2.67999999196e-06	5.40999998377e-18	8.420000032838e-18	0.00120210799903831	0.0686221427255114	3.08999997837e-06	9.19000006432999e-18	6.58004610552164e-18	1.60702399271993e-05	2.13065194170608e-08	1e-18
+3:Del:R:5	3.31000001575451e-18	3.9500000237e-18	3.83000001149e-07	0.00113860899430696	0.00837891094972654	0.000150616000451848	0.000436588997380466	9.0999999727e-05	5.40999998377e-18	8.420000032838e-18	0.00174236299860611	0.0974809436100762	9.95999993028e-05	9.19000006432999e-18	6.58004610552164e-18	9.5808476364924e-06	4.51480725749292e-08	1e-18
+4:Del:R:0	9.97000004745391e-05	1.21000000726e-05	0.000177645000532935	0.00725242896373785	0.0107912649352524	0.00231509800694529	0.000130876999214738	0.00669130897992607	0.00143277399570168	0.00147031700573424	9.07999999273599e-18	0.00173451599306194	0.00215534898491256	0.000193687001355809	6.58004610552164e-18	0.000698912463470956	0.00610958539657406	0.00400803206820056
+4:Del:R:1	0.000900503004286097	0.00211578701269472	0.000634573001903719	0.0635237296823813	0.00284356898293859	0.00280672900842019	0.00339680397961918	0.00162295499513113	0.00459421698621735	0.000521112002032337	0.000355503999715597	0.00230259499078962	2.2999999839e-05	0.000617337004321359	6.58004610552164e-18	0.00042629598802982	1.55350861485771e-08	0.00200401603410028
+4:Del:R:2	3.23000001537373e-06	0.000543292003259752	0.000116799000350397	0.0145489219272554	0.000164643999012136	0.00047449000142347	0.00277738698333568	0.000272622999182131	0.000896023997311928	7.50000002925e-05	9.07999999273599e-18	0.000611678997553284	7.91999994456e-05	0.000524295003670065	6.58004610552164e-18	7.83497537232868e-05	3.82649435383251e-08	1e-18
+4:Del:R:3	3.31000001575451e-18	7.27000004362e-06	4.12000001236e-18	0.00455475197722624	0.00387781397673312	0.000291345000874035	0.000439585997362484	2.87999999136e-05	2.37999999286e-05	0.000132028000514909	0.00031213699975029	0.0392590578429638	3.91999997256e-05	5.03000003521e-05	1.39447221625922e-06	2.63651088832343e-18	1.46064127217749e-08	1e-18
+4:Del:R:4	3.31000001575451e-18	3.9500000237e-18	4.12000001236e-18	0.000849678995751604	0.00455725397265648	0.000110576000331728	0.00020180999878914	9.72999997081e-05	5.40999998377e-18	8.420000032838e-18	0.000687365999450106	0.0532878727868485	9.46999993371e-06	7.73000005411e-06	6.58004610552164e-18	2.6309868244796e-06	3.1937229480471e-09	1e-18
+4:Del:R:5	2.89000001375545e-05	0.000210413001262478	2.83000000849e-06	0.000610779996946099	0.00158443599049338	5.68000001704e-05	0.000250763998495416	6.33999998098e-06	1.36999999589e-05	0.000209045000815275	0.000157602999873918	0.0186444489254222	6.2999999559e-05	9.19000006432999e-18	1.7594366617604e-06	2.63797428510975e-18	4.43808926111075e-09	1e-18
+5:Del:R:0	8.35000003974324e-06	3.8500000231e-05	0.00177678500533035	0.00413282597933587	0.0184479488893123	0.0193332910579999	8.5499999487e-05	0.237978862286063	0.000772051997683844	0.00139030000542217	0.00128145399897484	0.00338288498646846	0.0200975358593172	0.0060868140426077	0.000284018024499145	0.00556879013589966	0.0233963755718201	0.0240481924092034
+5:Del:R:1	0.000190676000907555	0.00297751201786507	7.41000002222999e-05	0.0157185329214073	0.00041033499753799	0.00750182502250548	0.00347672897913963	0.000572256998283229	0.000479550998561347	0.026205652102202	0.000474633999620293	0.00279703498881186	0.00298053397913626	0.000314462002201234	6.58004610552164e-18	0.000110240786487051	1.91584159796717e-08	1e-18
+5:Del:R:2	0.000126355000601408	0.00039752500238515	2.78000000834e-06	0.00234384498828078	0.00047092499717445	0.000370524001111572	0.0011688999929866	0.000516837998449486	0.000264968999205093	0.00177038200690449	9.07999999273599e-18	0.00510384197958463	6.98999995107e-05	2.13000001491e-05	6.58004610552164e-18	1.54338573933316e-05	4.85820225219303e-08	1e-18
+5:Del:R:3	1.89000000899578e-05	0.000158151000948906	4.12000001236e-18	0.0011824799940876	0.000257166998456998	0.000168175000504525	0.000406616997560298	8.15999997552e-06	6.11999998164e-06	0.000137030000534417	9.07999999273599e-18	0.00220095199119619	6.3999999552e-06	2.85000001995e-05	1.2457865811275e-06	6.72531113763592e-06	3.43435927859616e-08	1e-18
+5:Del:R:4	3.11000001480257e-06	8.47000005082e-05	4.37000001311e-05	0.000146922999265385	9.72999994162001e-05	5.32000001596e-05	0.000125881999244708	0.000112897999661306	7.24999997825e-06	0.000125027000487605	9.07999999273599e-18	0.00125618599497526	1.45999998978e-06	1.5000000105e-05	6.58004610552164e-18	2.67193468891148e-07	9.20661205435291e-09	1e-18
+5:Del:R:5	3.13000001489777e-05	2.12000001272e-05	3.82000001146e-06	0.00010617399946913	0.000585017996489892	1.15000000345e-05	2.07999998752e-05	4.42999998671e-05	2.98999999103e-05	0.00112024200436894	8.17999999345599e-08	0.00618125997527496	2.34999998355e-06	9.08000006356e-05	1.73649230813665e-06	2.62957009910824e-18	3.33535657530527e-08	1e-18
+2:Ins:R:0	0.000402036001913559	0.000331853001991118	0.00263595000790785	0.00049292199753539	0.00634945396190328	0.00199838700599516	3.03999998176e-05	0.00191670999424987	0.00116233899651298	0.0253054580986913	0.000190466999847626	0.00744033097023868	0.0106184109256711	0.0239422561675958	6.58004610552164e-18	0.0021917928286492	0.0343794135783801	1e-18
+2:Ins:R:1	7.8800000375062e-06	0.00027166500162999	0.00224268300672805	0.000553301997233489	0.0183876418896741	0.000208533000625599	0.000397625997614244	0.00166181599501455	0.00210019199369942	0.0389083921517427	9.07999999273599e-18	0.0010623009957508	0.00180136798739042	0.000123773000866411	6.58004610552164e-18	0.00108784776586042	0.0585086492632652	1e-18
+2:Ins:R:2	0.000221347001053539	0.00103534100621205	0.000955604002866811	0.000266334998668325	0.0072079519567523	0.000790414002371242	7.00999995794e-05	0.000304585999086242	0.000760940997717177	0.026205652102202	0.000247884999801692	0.000550237997799048	0.000688523995180332	0.00111419900779939	6.58004610552164e-18	0.000729931569198568	0.0636941929664411	1e-18
+2:Ins:R:3	0.000514268002447746	0.000381326002287956	0.000897238002691713	0.00013779399931103	0.00117229199296625	0.000499074001497222	0.00314703898111777	0.000177582999467251	0.000351634998945095	0.000280060001092234	0.000372355999702115	0.0001655249993379	0.000743543994795192	0.000871483006100381	6.58004610552164e-18	9.48112433024279e-05	0.00976271301510184	0.00200401603410028
+2:Ins:R:4	0.00291310001386539	0.00197742301186454	0.000253085000759255	7.18999996404999e-05	6.87999995872e-05	0.000189469000568407	0.00182827998903032	1.65999999502e-05	3.06999999079e-05	8.420000032838e-18	0.000442383999646093	0.00101820599592718	0.000213353998506522	0.00297397802081785	6.58004610552164e-18	0.000131664280470189	3.84371444624452e-09	1e-18
+2:Ins:R:5	0.0181215840862528	0.0136333760818003	6.67000002001e-06	0.000103688999481555	0.000994121994035269	0.000748642002245926	0.00024476999853138	0.00176438399470685	5.40999998377e-18	8.420000032838e-18	0.000288800999768959	0.0380051968479792	0.000846574994073975	0.000544275003809925	6.58004610552164e-18	1.18323308639907e-06	4.64406625218008e-08	0.00200401603410028
+3:Ins:R:0	3.06000001456459e-07	5.78000003468e-05	9.60000002879999e-05	2.62999998685e-05	0.00379247797724513	0.00121918500365755	1e-18	0.000667862997996411	0.000254572999236281	0.0181039050706052	9.07999999273599e-18	0.0151501399393994	8.20999994253e-05	0.00662349704636448	6.58004610552164e-18	0.000570589182021802	0.0195831374457896	0.00400803206820056
+3:Ins:R:1	0.000254695001212264	0.0012270500073623	0.000286144000858432	0.000450982997745085	0.00612276096326343	0.000288615000865845	5.50999996694e-06	0.000671722997984831	0.000823354997529935	0.0552119082153264	0.000207082999834334	0.000869572996521708	0.0036883279741817	0.0025232000176624	6.58004610552164e-18	0.001092184115997	0.112273274400416	1e-18
+3:Ins:R:2	4.41000002099014e-05	0.00021007500126045	9.75000002924999e-05	0.000600334996998325	0.00114346799313919	0.000746533002239599	5.46999996718e-05	0.000135767999592696	0.000118260999645217	0.00943203403678493	0.000221525999822779	0.000183890999264436	0.000202510998582423	0.000204501001431507	6.58004610552164e-18	0.000281270540937246	0.0388744786920139	1e-18
+3:Ins:R:3	0.000166702000793446	3.02000001812e-06	1.36000000408e-05	7.41999996289999e-05	1.01999999388e-05	0.000249737000749211	0.000177832998933002	3.78999998863e-05	5.17999998446e-06	0.000461099001798286	2.179999998256e-05	8.6999999652e-05	2.36999998341e-05	0.000327493002292451	6.58004610552164e-18	3.18038761003157e-05	1.39169498026687e-08	1e-18
+3:Ins:R:4	8.89000004231347e-05	0.000141807000850842	1.56000000468e-06	7.39999996299999e-05	1.17999999292e-05	0.000155952000467856	0.000415608997506346	0.000122040999633877	1.60999999517e-05	0.000187040000729456	9.07999999273599e-18	0.000340787998636848	3.48999997557e-06	0.00060186000421302	6.58004610552164e-18	7.5573360370254e-05	2.83510026533301e-08	1e-18
+3:Ins:R:5	0.00124869600594338	0.00186470701118824	4.12000001236e-18	3.9599999802e-05	0.000102573999384556	1.98000000594e-05	0.000769275995384344	3.65999998902e-05	5.40999998377e-18	0.000185040000721656	9.00999999279199e-05	0.00284031198863875	3.53999997522e-05	0.00220599701544198	6.58004610552164e-18	2.28987512369934e-05	2.78074941910782e-08	1e-18
+4:Ins:R:0	3.31000001575451e-18	1.68000001008e-05	4.12000001236e-18	0.000166644999166775	0.00243918598536488	0.00146791700440375	1e-18	0.000777757997666726	0.000164386999506839	0.0160034520624135	0.000159620999872303	0.00570117797719529	0.00111879699216842	0.00594693004162851	6.58004610552164e-18	0.000327559887237071	0.0146924521955361	1e-18
+4:Ins:R:1	0.000744381003543008	0.00120372800722237	0.000175982000527946	0.00126643499366782	0.00361229797832621	0.000476283001428849	2.60999998434e-05	0.0011039009966883	0.000715564997853305	0.0746160922910027	0.000377635999697891	0.00190888599236446	0.00269163498115856	0.00132692600928848	6.58004610552164e-18	0.00150697819353949	0.210245111019824	0.00200401603410028
+4:Ins:R:2	7.55000003593551e-05	1.22000000732e-05	2.74000000822e-05	9.83999995079999e-05	0.000376458997741246	0.000528663001585989	0.000194816998831098	7.98999997603e-05	4.23999998728e-05	0.00409088201595444	9.07999999273599e-18	0.00021848999912604	6.92999995149e-05	8.45000005915e-05	6.58004610552164e-18	4.49962737763675e-05	0.00974909693497787	1e-18
+4:Ins:R:3	0.000157544000749857	0.000134169000805014	4.77000001431e-05	5.24999997375e-05	1.86999998878e-06	0.000334824001004472	0.000273741998357548	8.57999997426e-06	2.14999999355e-05	0.000239052000932303	9.07999999273599e-18	0.000176568999293724	6.38999995527e-07	0.000713852004996964	1.36092421699612e-06	3.01646709616391e-07	1.86094344198747e-08	1e-18
+4:Ins:R:4	0.000319653001521443	0.00024938500149631	4.18000001254e-06	0.000146910999265445	6.40999996154e-06	5.6000000168e-05	0.000258756998447458	0.000205514999383455	5.40999998377e-18	0.00228049200889392	9.07999999273599e-18	0.000636052997455788	1.20999999153e-05	0.00166501001165507	1.44599935194735e-06	9.39515537716102e-06	9.67765006760512e-09	1e-18
+4:Ins:R:5	0.00100132000476595	0.00219354501316127	3.29000000987e-05	0.000135204999323975	0.000635976996184138	0.000106861000320583	8.73999994756e-06	0.000885224997344325	2.17999999346e-06	0.0138029770538316	9.07999999273599e-18	0.0116705369533179	3.13999997802e-07	0.000274449001921143	6.58004610552164e-18	2.65634407131845e-18	1.16548732028598e-08	1e-18
+5:Ins:R:0	3.31000001575451e-18	3.9500000237e-18	8.83000002649e-05	8.57999995709999e-05	0.00475007097149957	0.00871678102615034	1e-18	0.000318328999045013	0.000165845999502462	0.0492106131919214	0.000666059999467151	0.0137906449448374	0.00259023098186838	0.00271214101898499	6.58004610552164e-18	0.00117258662949932	0.0146738819971304	0.0120240962046017
+5:Ins:R:1	0.0014431260068688	0.000135658000813948	0.00065622000196866	0.00213585198932074	0.00479343097123941	0.00540564301621693	1e-18	0.00976111397071666	0.00125399599623801	0.278059972084434	0.00115190999907847	0.00383426498466294	0.0135019519054863	0.0264555251851887	6.58004610552164e-18	0.0011011924574188	0.00491953232698964	0.00200401603410028
+5:Ins:R:2	0.000254832001212916	5.53000003318e-06	5.51000001653e-06	0.000222026998889865	0.000298795998207224	0.00132184300396553	8.83999994696e-06	0.000101152999696541	0.000102848999691453	0.00922198903596576	0.000366006999707194	0.00213001599147994	4.58999996787e-05	0.000488313003418191	1.18199012643727e-06	8.28266792667268e-07	4.6445807436868e-08	1e-18
+5:Ins:R:3	0.000237087001128456	9.77000005862e-05	3.32000000996e-05	7.58999996204999e-06	0.000165545999006724	2.88000000864e-05	4.45999997324e-06	7.08999997873e-05	8.01999997594e-05	0.00366078901427708	8.33999999332799e-07	0.00266048898935804	4.60999996773e-05	0.000103831000726817	1.621273088488e-06	2.65757325630755e-18	4.75565784473372e-08	1e-18
+5:Ins:R:4	0.000261865001246391	2.1500000129e-06	7.87000002361e-06	2.52999998735e-05	0.000126706999239758	4.83000001449e-05	1.05999999364e-05	6.73999997978e-06	5.04999998485e-05	0.00334072001302881	2.2499999982e-06	0.00159240699363037	2.42999998299e-06	0.000157593001103151	6.58004610552164e-18	2.65563975048453e-18	3.95567326568308e-08	1e-18
+5:Ins:R:5	0.00011983400057037	0.000115629000693774	3.48000001044e-06	0.000160228999198855	0.000626341996241948	6.17000001851e-05	4.27999997432e-06	0.000190550999428347	9.88999997033e-06	0.0027405910106883	1.839999998528e-06	0.00613606997545572	4.32999996969e-05	2.15000001505e-05	6.58004610552164e-18	2.65069544116599e-18	4.48283910156371e-08	1e-18
+2:Del:M:1	0.0011978150057012	0.000175553001053318	0.00693076402079229	0.188997489055013	0.0286879458278723	0.000632866001898598	0.00312705798123765	0.00491367198525898	0.00390097198829708	0.000638138002488738	0.000382063999694349	0.00265350298938599	0.00887240793789315	0.00264092501848648	6.58004610552164e-18	0.00137420087593352	0.00366896648521895	0.0180361443069025
+3:Del:M:1	8.1900000389817e-05	5.46000003276e-07	0.000344612001033836	0.00703415596482921	0.0131571469210571	0.000990097002970291	0.00025475999847144	0.00929033697212899	0.00301132799096602	0.00396085401544733	0.000200442999839646	0.0103283519586866	0.00114008299201942	0.00157517301102621	6.58004610552164e-18	0.000764470282770831	0.0048873035805209	1e-18
+3:Del:M:2	0.00147959300704237	0.00294406301766438	0.00030285000090855	0.049416600752917	0.00900420994597475	0.00443363001330089	0.00463563897218617	0.00430269298709192	0.00154330199537009	0.0193041640752862	0.000301743999758605	0.00606115797575537	0.000450305996847858	0.00323693502265854	6.58004610552164e-18	0.000980363974341033	0.00368107551554234	1e-18
+4:Del:M:1	8.38000003988604e-05	0.00014700500088203	7.35000002204999e-05	0.0109817189450914	0.0087322019476068	0.00274539500823619	0.000183826998897038	0.00580955098257135	0.00192772099421684	0.000179039000698252	9.07999999273599e-18	0.00377171798491313	0.00127079799110441	8.2000000574e-06	6.58004610552164e-18	0.000504717900987043	0.0109797305945076	0.00601204810230084
+4:Del:M:2	0.000145479000692432	0.000550614003303684	0.000340216001020648	0.0294838768525806	0.00604718696371688	0.00868271002604813	0.00101904099388575	0.00159158699522524	0.00329744799010766	0.000387083001509624	9.07999999273599e-18	0.00457315298170739	0.000159722998881939	0.000950493006653451	6.58004610552164e-18	0.000409799520784757	0.00489044160567025	1e-18
+4:Del:M:3	0.000160684000764803	0.000693566004161396	0.000130463000391389	0.0488666397556668	0.00344244197934535	0.00477309401431928	0.00071732499569605	0.00109834199670497	0.00254407899236776	8.220000032058e-05	0.000789867999368105	0.000525262997898948	0.000270577998105954	0.00223043401561304	6.58004610552164e-18	0.000402367649801	0.00365961696983014	1e-18
+5:Del:M:1	8.16000003883891e-07	0.000624963003749778	0.0013696340041089	0.000453120997734395	0.00861707294829757	0.0710665792131997	2.35999998584e-05	0.280724260157827	3.53999998938e-05	0.00133028700518812	0.000282793999773765	0.000563377997746488	0.0117407769178146	0.00655170604586194	0.000660877105516124	0.00536204916184987	0.0207713280418549	0.0300602405115042
+5:Del:M:2	2.38000001132801e-10	0.000117708000706248	0.00175127200525382	0.00013623199931884	0.00785102095289388	0.253108347759325	0.000245768998525386	0.12361016262917	0.000221235999336292	0.000124027000483705	0.000372770999701783	1.41999999432e-17	0.00705542095061205	0.00449863403149044	0.000432409450773911	0.00502171467340586	0.012290058300929	0.0220441763751031
+5:Del:M:3	2.33000001109003e-12	5.67000003402e-05	0.000774958002324873	0.00111223599443882	0.00715797495705215	0.216806032650418	6.15999996304e-05	0.0461304078616088	0.000570906998287279	5.650000022035e-05	0.000750126999399897	0.000323567998705728	0.00216598398483811	0.00140448700983141	0.00026612607242146	0.00333883980844505	0.00859625789862607	0.00601204810230084
+5:Del:M:4	3.88000001846752e-05	0.000462842002777052	0.000640555001921665	0.00365294598173527	0.00249254898504471	0.120483943361452	6.81999995908e-05	0.0163672559508982	0.000448307998655076	0.000104022000405686	0.000130277999895778	0.000277662998889348	0.000281735998027848	0.000100143000701001	0.000247928132326935	0.00132989736605632	0.00489791342344186	0.00400803206820056
+5:Del:M:5	0.000665116003165733	0.00236731901420391	0.00036297000108891	4.5599999772e-05	0.0011123669933258	0.099282999297849	0.00173836498956981	0.0128148819615554	5.40999998377e-18	0.0414089311614948	0.000518954999584836	0.00665797297336811	0.0131319069080767	0.000931512006520584	0.000139828818249736	0.00160162870855497	0.00607563604544812	1e-18

sigprofilerassignment-1.1.2/SigProfilerAssignment/DecompositionPlots/ExampleSample/COSMIC_SBS288_Signatures.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,97 @@
+MutationType	SBS1	SBS2	SBS4	SBS5	SBS7c	SBS8	SBS10c	SBS12	SBS13	SBS16	SBS18	SBS19	SBS21	SBS22	SBS27	SBS28	SBS30	SBS32	SBS36	SBS39	SBS40	SBS44	SBS51	SBS90	SBS92
+A[C>A]A	0.00088616	0.00000058	0.04219650	0.01199760	0.00483041	0.04409822	0.00433145	0.00452059	0.00181992	0.01599504	0.05153386	0.00126938	0.00015699	0.00601276	0.00520782	0.00078391	0.00179968	0.02229777	0.02519378	0.01170152	0.02820375	0.00000000	0.14096391	0.00220165	0.01132934
+A[C>A]C	0.00228040	0.00014800	0.03329724	0.00943811	0.00115010	0.04779807	0.01483022	0.00113015	0.00072097	0.00289910	0.01581039	0.00064069	0.00235989	0.00009544	0.00473802	0.00252969	0.00050591	0.01879812	0.00831795	0.00715093	0.01340178	0.00015004	0.00168957	0.00070822	0.00974473
+A[C>A]G	0.00017703	0.00005230	0.01559871	0.00184963	0.00037703	0.00461981	0.00065712	0.00054007	0.00026399	0.00101968	0.00243160	0.00024588	0.00029399	0.00076535	0.00078267	0.00035296	0.00009128	0.00445955	0.00223945	0.00267035	0.00292039	0.00000092	0.00479877	0.00013857	0.00469657
+A[C>A]T	0.00128023	0.00009780	0.02949755	0.00660868	0.00196016	0.04699810	0.01312776	0.00122016	0.00034798	0.01059671	0.02141407	0.00057072	0.00062097	0.00172079	0.00271886	0.00396952	0.00055590	0.01459854	0.01789558	0.00740096	0.01480197	0.00578146	0.02119457	0.00175516	0.00775798
+A[C>G]A	0.00186033	0.00000000	0.00688943	0.01009798	0.00112009	0.00432983	0.00034763	0.00122016	0.00386983	0.00173946	0.00173114	0.00318845	0.00001690	0.00166076	0.00131945	0.00015398	0.00106981	0.00198980	0.00183955	0.04730615	0.01220162	0.00318081	0.00395899	0.00050807	0.00305586
+A[C>G]C	0.00122022	0.00013300	0.00283976	0.00569886	0.00031903	0.00294988	0.00032513	0.00064208	0.00095096	0.00200938	0.00259170	0.00178913	0.00071897	0.00019509	0.00176926	0.00022397	0.00046692	0.00202980	0.00166959	0.02250293	0.00868115	0.00023306	0.00453884	0.00027713	0.00168986
+A[C>G]G	0.00011502	0.00001520	0.00127989	0.00171966	0.00000000	0.00028599	0.00004243	0.00007511	0.00026399	0.00084674	0.00192126	0.00061570	0.00000000	0.00023111	0.00000000	0.00000000	0.00013098	0.00112989	0.00049988	0.01360177	0.00225030	0.00003141	0.00196950	0.00004620	0.00090730
+A[C>G]T	0.00114020	0.00009120	0.00354971	0.01009798	0.00193016	0.00570977	0.00051631	0.00144019	0.00399982	0.01149643	0.00408268	0.00213896	0.00006190	0.00006203	0.00131945	0.00008329	0.00073087	0.00174983	0.00190953	0.04340564	0.01460194	0.00329083	0.00089977	0.00092377	0.00411591
+A[C>T]A	0.02500444	0.00006110	0.00869928	0.03259348	0.00133011	0.00680972	0.00486707	0.00551072	0.00717968	0.00175945	0.00920605	0.02798638	0.00216990	0.00176081	0.01369426	0.00077691	0.10598120	0.08639137	0.00595853	0.00960125	0.01970262	0.08992278	0.03579084	0.00070802	0.02376637
+A[C>T]C	0.00632112	0.00138004	0.00417965	0.01789642	0.00768065	0.00281989	0.00524944	0.00212028	0.00000000	0.00372884	0.00465306	0.01409314	0.00391982	0.00022010	0.00541773	0.00337959	0.09038397	0.12298771	0.00327919	0.00404053	0.01210161	0.01690428	0.00564855	0.00029253	0.01409754
+A[C>T]G	0.36506477	0.00003270	0.00078294	0.00617876	0.00092708	0.00322987	0.01301999	0.00011802	0.00030299	0.00326899	0.01220802	0.00154925	0.00739965	0.00136063	0.00670719	0.00704915	0.01439745	0.03659634	0.00706825	0.00600078	0.00026704	0.01430362	0.00564855	0.00009240	0.00978578
+A[C>T]T	0.00958170	0.00186005	0.00424965	0.02199560	0.00748063	0.01249950	0.00615621	0.00238031	0.00031799	0.00599814	0.00797524	0.03678210	0.00004170	0.00061628	0.00447812	0.00505939	0.02929480	0.15198482	0.00430894	0.01280166	0.01690225	0.03030768	0.00319918	0.00064664	0.01645207
+A[T>A]A	0.00080014	0.00009590	0.00941922	0.00737852	0.01240104	0.01949921	0.00402006	0.00517068	0.00000000	0.02309283	0.00249164	0.00078562	0.00345984	0.06392938	0.14294012	0.00017198	0.00036294	0.00071293	0.00243940	0.00531069	0.00610081	0.00478121	0.11297108	0.06135367	0.01007203
+A[T>A]C	0.00223040	0.00087803	0.00352971	0.00692861	0.00342029	0.02129914	0.01364236	0.00271036	0.00006520	0.00773760	0.00087858	0.00025488	0.00564973	0.00701322	0.00145939	0.00047794	0.00039293	0.00088691	0.00142965	0.00288037	0.00444059	0.00260066	0.00134965	0.00035411	0.00358815
+A[T>A]G	0.00114020	0.00002550	0.01239897	0.00911818	0.00021102	0.02279908	0.00123009	0.00312041	0.00058997	0.00880727	0.00260171	0.00095154	0.00024799	0.06062786	0.00122948	0.00015198	0.00063789	0.00071193	0.00252938	0.00694090	0.00693092	0.00000108	0.03679058	0.00035411	0.00701173
+A[T>A]T	0.00018303	0.00000000	0.00420965	0.00619876	0.05070426	0.02499899	0.07177673	0.00282037	0.00060597	0.01099659	0.00784515	0.00065368	0.00159992	0.00251115	0.00253894	0.00169979	0.00048991	0.00084392	0.00306924	0.00612080	0.01070142	0.03080780	0.02949245	0.02346374	0.00918124
+A[T>C]A	0.00109019	0.00006170	0.00794934	0.04619076	0.00028802	0.00976961	0.01822254	0.07360964	0.00190992	0.24192493	0.00202133	0.00258874	0.01669922	0.02501150	0.00504789	0.00054893	0.00061089	0.00093591	0.00524870	0.01120146	0.01870249	0.01930489	0.00258934	0.00571197	0.08918805
+A[T>C]C	0.00304054	0.00002150	0.00071494	0.01339732	0.00053304	0.00500980	0.00907955	0.04030528	0.00014199	0.01289600	0.00209137	0.00059371	0.00999953	0.00089941	0.00184923	0.00044095	0.00045792	0.00070093	0.00168958	0.00564073	0.00734098	0.00324082	0.01929506	0.00018475	0.00463736
+A[T>C]G	0.00010602	0.00001320	0.00499959	0.03819236	0.00107009	0.00697972	0.01694303	0.07050924	0.00042798	0.06388018	0.00208137	0.00230888	0.00387982	0.00775356	0.00568762	0.00040495	0.00027695	0.00108989	0.00383905	0.00964125	0.01550206	0.02720689	0.00394899	0.00010777	0.04011199
+A[T>C]T	0.00574102	0.00015500	0.00155987	0.03829234	0.00265022	0.01489940	0.01277899	0.06380836	0.00095896	0.13595781	0.00424279	0.00173915	0.02559880	0.00075535	0.00258892	0.00059493	0.00054490	0.00060994	0.00511874	0.01360177	0.01940258	0.00026707	0.00186952	0.00286368	0.02956694
+A[T>G]A	0.00017203	0.00023801	0.00104991	0.00385923	0.01190100	0.00163993	0.00251924	0.00201026	0.00006140	0.01119653	0.00072147	0.00232887	0.00039198	0.00233107	0.00113952	0.00986881	0.00003899	0.00038596	0.00108973	0.00388050	0.00723096	0.00000002	0.00072281	0.00543484	0.00206966
+A[T>G]C	0.00020704	0.00007460	0.00015899	0.00259948	0.00105009	0.00066797	0.00097887	0.00066409	0.00000000	0.00440863	0.00085856	0.00188908	0.00043698	0.00005092	0.00095860	0.01729791	0.00010998	0.00042896	0.00062285	0.00297039	0.00705094	0.00003261	0.00408895	0.00004620	0.00035897
+A[T>G]G	0.00026805	0.00000205	0.00141988	0.00793841	0.00060405	0.00476981	0.00103877	0.00080811	0.00008250	0.00461857	0.00199131	0.00176914	0.00018699	0.00295136	0.00006767	0.00767907	0.00040993	0.00126987	0.00093577	0.00766100	0.00806107	0.00000747	0.02779289	0.00023094	0.00123837
+A[T>G]T	0.00011202	0.00000376	0.00021598	0.00482903	0.00000000	0.00073997	0.01305586	0.00128017	0.00031999	0.00795753	0.00184121	0.00161921	0.00006950	0.00004182	0.00025589	0.11498609	0.00079386	0.00000000	0.00098376	0.00642083	0.01800239	0.00142036	0.00212945	0.00204769	0.00354120
+C[C>A]A	0.00031206	0.00020801	0.08069330	0.00742851	0.00010901	0.04009838	0.01743293	0.00542071	0.00139994	0.01039677	0.07404865	0.00131936	0.00000000	0.00183084	0.00506788	0.00202975	0.00076786	0.00123988	0.05578622	0.01010131	0.02080277	0.00002841	0.00697821	0.00118550	0.01855035
+C[C>A]C	0.00179032	0.00009530	0.07969339	0.00613877	0.00309026	0.03879843	0.00967042	0.00428056	0.00096796	0.00902720	0.01961289	0.00076663	0.00259988	0.00443204	0.00222907	0.00010899	0.00038793	0.00491951	0.02019501	0.00906118	0.01470196	0.03030768	0.00316919	0.00044649	0.01395552
+C[C>A]G	0.00009322	0.00000000	0.02449797	0.00345931	0.00191016	0.00340986	0.00240461	0.00117015	0.00000433	0.00173946	0.01200789	0.00023589	0.00197991	0.00013606	0.00026589	0.00000000	0.00040693	0.00001660	0.00709825	0.00574075	0.00254034	0.00374095	0.00429890	0.00021601	0.00528203
+C[C>A]T	0.00000000	0.00042101	0.06899427	0.00648870	0.01350113	0.03299867	0.04488739	0.00110014	0.00000000	0.00248923	0.03632386	0.00003438	0.01909910	0.00011005	0.00309870	0.00020298	0.00029695	0.00266973	0.06048506	0.00603078	0.01470196	0.08672196	0.00506870	0.00101615	0.01254310
+C[C>G]A	0.00002410	0.00000000	0.00782935	0.00695861	0.00020602	0.00499980	0.00011020	0.00134018	0.00560975	0.00354890	0.00061340	0.00176914	0.00001970	0.00105048	0.00472802	0.00001440	0.00126977	0.00114989	0.00123969	0.02880374	0.00756101	0.00005361	0.00284927	0.00033871	0.00240959
+C[C>G]C	0.00007681	0.00035101	0.00686943	0.00906819	0.00226019	0.00545978	0.00020758	0.00089112	0.00064797	0.00453859	0.00226149	0.00180912	0.00027299	0.00078536	0.00125947	0.00007549	0.00079286	0.00082392	0.00136966	0.03770490	0.00935124	0.00002491	0.00011997	0.00007700	0.00396222
+C[C>G]G	0.00035206	0.00004870	0.00339972	0.00248950	0.00026202	0.00001050	0.00018022	0.00017302	0.00048798	0.00145955	0.00358235	0.00004808	0.00001010	0.00023911	0.00036085	0.00000000	0.00011998	0.00053695	0.00041890	0.01230160	0.00168022	0.00000000	0.00202948	0.00001540	0.00160101
+C[C>G]T	0.00000000	0.00006360	0.00681943	0.00952809	0.00424036	0.00548978	0.00023827	0.00156020	0.00639972	0.00961702	0.00379249	0.00321843	0.00017299	0.00032015	0.00026789	0.00000000	0.00101982	0.00049495	0.00208948	0.04020523	0.01390185	0.00008642	0.00260933	0.00029253	0.00536600
+C[C>T]A	0.00200035	0.00432012	0.01269895	0.01939612	0.00271023	0.00266989	0.00376117	0.00659086	0.00001930	0.00716778	0.01170769	0.11894211	0.00134994	0.00121056	0.01739271	0.00029196	0.10998049	0.01689831	0.00674833	0.00911118	0.01960261	0.00357090	0.00322917	0.00061585	0.03660735
+C[C>T]C	0.00027005	0.00017000	0.01149905	0.01899620	0.00597050	0.00401984	0.00664382	0.00025403	0.00134994	0.00283912	0.00676444	0.09195525	0.00515976	0.00319147	0.00713701	0.00020997	0.10298173	0.02839716	0.00667835	0.00386050	0.01730230	0.00286072	0.00469880	0.00030792	0.03476131
+C[C>T]G	0.19603478	0.00277008	0.00330973	0.01749650	0.00894075	0.00148994	0.00947159	0.00004091	0.00198991	0.00069079	0.01681104	0.01569236	0.00621971	0.00042620	0.00749686	0.00254969	0.01679702	0.01119888	0.00532868	0.00757098	0.00236031	0.01550393	0.02069470	0.00020015	0.01082396
+C[C>T]T	0.00019603	0.00145004	0.01599867	0.02309538	0.02060173	0.01449941	0.00983726	0.00338044	0.00144994	0.01929401	0.00665437	0.25787449	0.00032498	0.00160074	0.00714701	0.00331960	0.04619181	0.04279572	0.00574858	0.00699091	0.02160287	0.00504128	0.00405896	0.00036951	0.04532348
+C[T>A]A	0.00004301	0.00024301	0.01439880	0.00353929	0.00347029	0.01899923	0.00067318	0.00054607	0.00020899	0.00320900	0.00054236	0.00009595	0.00000619	0.12805886	0.33086140	0.00013998	0.00021396	0.00032497	0.00125969	0.00494064	0.00109014	0.00001240	0.00610844	0.10206109	0.00704592
+C[T>A]C	0.00039307	0.00024401	0.01219899	0.00518896	0.01340113	0.02919882	0.00279160	0.00560073	0.00034198	0.00569823	0.00306201	0.00040280	0.00068797	0.05512534	0.00280882	0.00134984	0.00077686	0.00064994	0.00145964	0.00644084	0.00762101	0.00325082	0.00148962	0.00035411	0.00393189
+C[T>A]G	0.00032406	0.00014900	0.03249730	0.00500900	0.00096108	0.02759889	0.00090019	0.00141018	0.00022599	0.00102968	0.00321211	0.00029386	0.00012499	0.16807725	0.00439816	0.00080590	0.00058690	0.00140986	0.00213947	0.00680088	0.00346046	0.00058215	0.00651833	0.00036951	0.01024476
+C[T>A]T	0.00026005	0.00000000	0.01179902	0.00429914	0.04870409	0.04179831	0.00335317	0.00150020	0.00052298	0.00652797	0.00226149	0.00021789	0.00000000	0.06032773	0.00542773	0.00102988	0.00061189	0.00066293	0.00195952	0.00827108	0.00928123	0.00001380	0.00361907	0.10052148	0.00644868
+C[T>C]A	0.00000000	0.00030201	0.00517957	0.01329734	0.00757064	0.00238990	0.01197149	0.04540595	0.00004740	0.01069668	0.00038625	0.00045178	0.01149946	0.00674310	0.00489795	0.00131984	0.00126977	0.00059294	0.00149963	0.00734095	0.01090145	0.01460370	0.00417893	0.00477281	0.03076459
+C[T>C]C	0.00250044	0.00002850	0.00235980	0.01039792	0.00358030	0.00699972	0.00978329	0.04970651	0.00012199	0.00316902	0.00246162	0.00008136	0.00281987	0.00134062	0.00571760	0.00261968	0.00137976	0.00092691	0.00187954	0.00791103	0.00987131	0.00320081	0.07108180	0.00021555	0.00401078
+C[T>C]G	0.00036006	0.00000000	0.00549954	0.02079584	0.00217018	0.00125995	0.01462779	0.03740490	0.00000000	0.00960702	0.00162107	0.00049776	0.01439932	0.00203093	0.00565763	0.00248970	0.00126977	0.00183982	0.00184954	0.00777101	0.01050140	0.03380856	0.00292925	0.00020015	0.01412281
+C[T>C]T	0.00004261	0.00018601	0.00255979	0.01489702	0.04310362	0.00645974	0.01924899	0.04590601	0.00011200	0.01549519	0.00256168	0.00039081	0.02169898	0.00053625	0.00389837	0.00036696	0.00409927	0.00108989	0.00215947	0.00859112	0.01360181	0.00771195	0.00663830	0.00635861	0.01367035
+C[T>G]A	0.00003551	0.00015300	0.00086993	0.00258948	0.00328028	0.00121995	0.01081415	0.00089312	0.00004140	0.00395877	0.00011107	0.00071365	0.00000435	0.00491226	0.00000000	0.01459823	0.00019796	0.00005809	0.00047788	0.00530069	0.00335045	0.00023406	0.00277929	0.00894516	0.00092840
+C[T>G]C	0.00021204	0.00015500	0.00044096	0.00460908	0.00558047	0.00194992	0.00229700	0.00114015	0.00000282	0.00107966	0.00199131	0.00208898	0.00005440	0.00088040	0.00038084	0.02209733	0.00021496	0.00044996	0.00056586	0.00739096	0.00567075	0.00253064	0.00255934	0.00004620	0.00041878
+C[T>G]G	0.00012802	0.00012100	0.00378969	0.00612877	0.00119010	0.00469981	0.00686483	0.00059308	0.00000000	0.00223931	0.00293193	0.00132935	0.00002010	0.00803369	0.00040283	0.01549812	0.00007849	0.00108989	0.00088678	0.00983128	0.00559074	0.00347088	0.00592848	0.00012317	0.00209052
+C[T>G]T	0.00017103	0.00020301	0.00119990	0.00729854	0.00340029	0.00057398	0.03001246	0.00034405	0.00005550	0.00253921	0.00414272	0.00219893	0.00018499	0.00119055	0.00143940	0.10098778	0.00026495	0.00067593	0.00106974	0.00494064	0.01310174	0.00038410	0.00229941	0.00970026	0.00054519
+G[C>A]A	0.00158028	0.00008620	0.03159738	0.01019796	0.00105009	0.02419902	0.00841771	0.00198026	0.00094896	0.00860733	0.10907166	0.00081360	0.00213990	0.00223103	0.01079548	0.00015598	0.00094283	0.00450955	0.06768328	0.00688089	0.01420189	0.00000000	0.00393899	0.00096996	0.00893931
+G[C>A]C	0.00033906	0.00000000	0.03479711	0.00764847	0.00074206	0.02619894	0.00743436	0.00041705	0.00045098	0.00424868	0.01731137	0.00027187	0.00706967	0.00173080	0.01239481	0.00101988	0.00049391	0.00361964	0.01919526	0.00695090	0.01020136	0.00467118	0.00327916	0.00041570	0.00782492
+G[C>A]G	0.00058710	0.00001390	0.01529873	0.00233953	0.00000000	0.00273989	0.00089221	0.00044706	0.00016399	0.00135958	0.00756497	0.00020490	0.00168992	0.00051524	0.00162932	0.00003950	0.00000000	0.00087691	0.00482881	0.00453059	0.00255034	0.00060515	0.00427890	0.00012300	0.00445574
+G[C>A]T	0.00000000	0.00005120	0.02119824	0.00681864	0.00036303	0.02689891	0.01205754	0.00002750	0.00006150	0.00579820	0.06234096	0.00027287	0.00889958	0.00055125	0.00740690	0.00015798	0.00086185	0.00326967	0.06898296	0.00589077	0.01080144	0.01130286	0.00344912	0.00040030	0.00655609
+G[C>G]A	0.00000959	0.00006540	0.00528956	0.00467906	0.00018202	0.00257990	0.00017011	0.00056407	0.00149993	0.00104967	0.00063542	0.00130936	0.00038798	0.00140064	0.00141941	0.00018298	0.00051491	0.00087591	0.00088578	0.02400312	0.00506067	0.00021906	0.00340913	0.00043109	0.00234881
+G[C>G]C	0.00016403	0.00026101	0.00574952	0.00507898	0.00047304	0.00238990	0.00038835	0.00028904	0.00047898	0.00308904	0.00134088	0.00128937	0.00141993	0.00093043	0.00134943	0.00000000	0.00025595	0.00089991	0.00107973	0.02130277	0.00537071	0.00119030	0.00113971	0.00029253	0.00216132
+G[C>G]G	0.00016603	0.00000000	0.00329973	0.00150970	0.00018002	0.00048798	0.00003285	0.00009541	0.00024099	0.00008127	0.00063942	0.00059671	0.00011699	0.00021110	0.00000000	0.00000000	0.00011698	0.00006859	0.00017196	0.00986128	0.00119016	0.00000000	0.00026693	0.00004620	0.00089337
+G[C>G]T	0.00000000	0.00013400	0.00303975	0.00671866	0.00128011	0.00485980	0.00015468	0.00050407	0.00269988	0.00322900	0.00123081	0.00031984	0.00020699	0.00045521	0.00455809	0.00000000	0.00039893	0.00022798	0.00104974	0.03240421	0.00698093	0.00185047	0.00284927	0.00026173	0.00152748
+G[C>T]A	0.00444079	0.00000000	0.00408966	0.01939612	0.00015701	0.00027599	0.00361387	0.00448059	0.00717968	0.00649798	0.00968636	0.06097033	0.00931956	0.00238109	0.01419405	0.00324961	0.04969118	0.02259774	0.00371908	0.00803104	0.01430190	0.09552419	0.00446886	0.00044649	0.01282583
+G[C>T]C	0.00009282	0.00000013	0.00445963	0.02159568	0.00000951	0.00024499	0.00902991	0.00182024	0.00092096	0.00528836	0.00817537	0.03968069	0.01959908	0.00187086	0.02009158	0.00018798	0.06098918	0.03789621	0.00339916	0.00450059	0.01160154	0.08142062	0.00308921	0.00032332	0.01351091
+G[C>T]G	0.21803869	0.00000000	0.00048196	0.01229754	0.00003430	0.00190992	0.00922420	0.00007461	0.00017799	0.00116964	0.01480973	0.00320844	0.00004340	0.00000000	0.00936608	0.00021497	0.00523907	0.01039896	0.00569859	0.00548071	0.00000000	0.04961257	0.00427890	0.00016900	0.00593888
+G[C>T]T	0.00003841	0.00005040	0.00380968	0.01859628	0.00075806	0.00460981	0.01038312	0.00267035	0.00126994	0.00671792	0.00669440	0.10894698	0.00804962	0.00176081	0.00758682	0.00010199	0.01769686	0.05319469	0.00362910	0.00861112	0.01270169	0.06661687	0.00594848	0.00050807	0.01684613
+G[T>A]A	0.00008121	0.00000000	0.00921923	0.00366927	0.00173015	0.01279948	0.00190232	0.00082611	0.00000670	0.00093971	0.00160105	0.00018891	0.00116995	0.05372469	0.10995394	0.00011599	0.00032894	0.00878912	0.00087978	0.00496064	0.00265035	0.00116029	0.02039478	0.03896766	0.00562396
+G[T>A]C	0.00012902	0.00013100	0.00359970	0.00290942	0.00227019	0.01349945	0.00688939	0.00181024	0.00012999	0.00060781	0.00195128	0.00007776	0.00325985	0.01020469	0.00002349	0.00011799	0.00018197	0.00821918	0.00063084	0.00352046	0.00343046	0.00236060	0.00384901	0.00016936	0.00192496
+G[T>A]G	0.00024604	0.00006380	0.01309891	0.00410918	0.00000000	0.01559937	0.00193028	0.00251033	0.00004700	0.00554828	0.00183120	0.00048576	0.00074197	0.03751724	0.00156934	0.00007169	0.00009858	0.01309869	0.00116971	0.00667087	0.00441059	0.00221056	0.00428890	0.00015396	0.00599620
+G[T>A]T	0.00025805	0.00006280	0.00551954	0.00321936	0.02030171	0.02809886	0.01281500	0.00091512	0.00035798	0.00096570	0.00346227	0.00028286	0.00093696	0.00932429	0.00000000	0.00032396	0.00019097	0.00615938	0.00111972	0.00409053	0.00577077	0.00318081	0.00014596	0.01662785	0.00411785
+G[T>C]A	0.00105019	0.00000000	0.00289976	0.01409718	0.00000000	0.00259989	0.01273936	0.07110932	0.00028699	0.00205936	0.00070847	0.00095354	0.22298953	0.00072133	0.00477800	0.00049094	0.00093483	0.00913909	0.00233942	0.00747097	0.00601080	0.02700684	0.00117970	0.00328009	0.02920934
+G[T>C]C	0.00190034	0.00002740	0.00117990	0.00793841	0.00042304	0.00261989	0.00606970	0.03040398	0.00018199	0.00118963	0.00226149	0.00037082	0.06629689	0.00124057	0.00195918	0.00058693	0.00055490	0.00766923	0.00139965	0.00689090	0.00458061	0.00116029	0.00226942	0.00009240	0.00268576
+G[T>C]G	0.00117021	0.00010700	0.00236980	0.01499700	0.00023202	0.00280989	0.01272993	0.04150544	0.00019499	0.00427867	0.00398262	0.00095254	0.11699451	0.00058127	0.00122948	0.00073091	0.00050091	0.00961904	0.00183955	0.00574075	0.00565075	0.01730438	0.00455883	0.00007700	0.00925981
+G[T>C]T	0.00007131	0.00001250	0.00075494	0.01369726	0.00707059	0.00628975	0.01056995	0.04630607	0.00000000	0.00239926	0.00315207	0.00235885	0.13299376	0.00083438	0.00374843	0.00085090	0.00044492	0.01289871	0.00264935	0.00751098	0.00731097	0.01110281	0.00400897	0.00132407	0.01267295
+G[T>G]A	0.00000000	0.00020901	0.00059795	0.00251950	0.00248021	0.00130995	0.00035506	0.00041205	0.00008770	0.00090172	0.00087057	0.00063569	0.00028599	0.00159073	0.00000000	0.00115986	0.00018797	0.00114989	0.00018495	0.00333043	0.00249033	0.00000000	0.00218944	0.00635861	0.00055049
+G[T>G]C	0.00000000	0.00013300	0.00025298	0.00170966	0.00166014	0.00065597	0.00062031	0.00021303	0.00000000	0.00090072	0.00003702	0.00070266	0.00053297	0.00023611	0.00005078	0.00192977	0.00035294	0.00073993	0.00031292	0.00580075	0.00224030	0.00001830	0.00529864	0.00004620	0.00029423
+G[T>G]G	0.00034806	0.00003710	0.00242980	0.00529894	0.00603051	0.00396984	0.00061425	0.00049606	0.00042598	0.00067479	0.00583383	0.00050975	0.00021299	0.00045021	0.00473802	0.00312962	0.00137976	0.00300970	0.00152962	0.00772100	0.00445059	0.00010303	0.07618050	0.00023094	0.00154435
+G[T>G]T	0.00001460	0.00000000	0.00025198	0.00234953	0.00675057	0.00128995	0.00747367	0.00016502	0.00000289	0.00238926	0.00214141	0.00034083	0.00258988	0.00001961	0.00229904	0.02059751	0.00015997	0.00078492	0.00048888	0.00594077	0.00548073	0.00280071	0.00208947	0.00288008	0.00019960
+T[C>A]A	0.00006581	0.00063902	0.03979670	0.00785843	0.00252021	0.02979880	0.06018580	0.00348046	0.07899652	0.01079665	0.07384852	0.00137933	0.00145993	0.00078436	0.00707704	0.01429827	0.00069588	0.00972903	0.14096518	0.00598078	0.02600346	0.00085322	0.03569086	0.00201690	0.01484858
+T[C>A]C	0.00253045	0.00017000	0.04689611	0.00916817	0.01420119	0.02509899	0.00854316	0.00288038	0.02939871	0.00586818	0.04362866	0.00112945	0.00023599	0.00174080	0.00626737	0.00045195	0.00024296	0.00928907	0.07718094	0.00786102	0.02100279	0.00222056	0.00285927	0.00078520	0.01283178
+T[C>A]G	0.00000000	0.00008530	0.01089910	0.00229954	0.00000000	0.00189992	0.00265737	0.00050507	0.01209947	0.00148954	0.01270835	0.00028486	0.00006830	0.00000000	0.00144939	0.00012898	0.00008259	0.00237976	0.01469637	0.00301039	0.00317042	0.00000032	0.00453884	0.00007700	0.00239317
+T[C>A]T	0.00000588	0.00044001	0.04129657	0.01269746	0.00373031	0.03189871	0.18880397	0.00235031	0.03549844	0.00924713	0.12208021	0.00137933	0.00000000	0.00039618	0.00980589	0.00055693	0.00066488	0.00963904	0.20794864	0.00655085	0.02410321	0.01660421	0.00036991	0.00144724	0.01318626
+T[C>G]A	0.00000000	0.00000000	0.00357970	0.00780844	0.00194016	0.00146994	0.00025875	0.00096913	0.31698604	0.00250922	0.00214141	0.00174915	0.00065397	0.00356164	0.00286880	0.00011499	0.00012698	0.00000000	0.00397902	0.03470451	0.01250166	0.00067317	0.00204948	0.00064664	0.01945116
+T[C>G]C	0.00020304	0.00009870	0.00594951	0.00759848	0.00461039	0.00133995	0.00039568	0.00155020	0.06349720	0.00522838	0.00464305	0.00311848	0.00063097	0.00152070	0.00310870	0.00013598	0.00098583	0.00109989	0.00240940	0.03670477	0.01410188	0.00000940	0.00360908	0.00032332	0.00408750
+T[C>G]G	0.00006941	0.00004120	0.00182985	0.00170966	0.00000875	0.00007820	0.00001039	0.00021403	0.01379939	0.00043886	0.00089959	0.00044079	0.00006270	0.00038118	0.00001279	0.00002460	0.00010598	0.00099690	0.00030193	0.00962125	0.00174023	0.00000000	0.00215945	0.00006160	0.00029840
+T[C>G]T	0.00156028	0.00118003	0.00337972	0.01249750	0.01230103	0.00024899	0.00034715	0.00305040	0.36898375	0.02849116	0.00318209	0.00160922	0.00068697	0.00038818	0.00212911	0.00014298	0.00010898	0.00069193	0.00758813	0.05070659	0.02370315	0.00259066	0.00332915	0.00143184	0.02298928
+T[C>T]A	0.00111020	0.53601548	0.00373969	0.02029594	0.01730145	0.00503980	0.00240343	0.00552072	0.00692969	0.00635803	0.01140749	0.04387864	0.00359983	0.00159073	0.01879213	0.00483941	0.09798262	0.02479752	0.01069736	0.00388050	0.03000399	0.00140035	0.00169956	0.00211006	0.01710459
+T[C>T]C	0.00003731	0.09730281	0.00698942	0.02299540	0.01370115	0.00025199	0.00901811	0.00264035	0.00447980	0.00367886	0.01140749	0.02498784	0.00008070	0.00132061	0.00798665	0.00412950	0.13397623	0.03869613	0.00685831	0.00528069	0.02310307	0.00225057	0.00176955	0.00098535	0.01736940
+T[C>T]G	0.11001952	0.04420128	0.00028098	0.01589682	0.00004640	0.00004170	0.00859142	0.00008851	0.00118995	0.00301906	0.01180776	0.00431790	0.00031699	0.00003772	0.00460807	0.00173979	0.01469739	0.00984902	0.00388904	0.00486063	0.00212028	0.00000000	0.00648834	0.00029253	0.00359965
+T[C>T]T	0.00000000	0.30000866	0.00721940	0.02099580	0.00232019	0.00526979	0.01280128	0.00612080	0.00141994	0.02209314	0.00375247	0.06286940	0.00007310	0.00000000	0.01189502	0.00198976	0.05249069	0.06699331	0.00832794	0.00423055	0.02240298	0.00302077	0.04238915	0.00277131	0.02458275
+T[T>A]A	0.00672119	0.00042201	0.00887926	0.00630874	0.01540129	0.01149954	0.00996265	0.00375049	0.00029599	0.01229618	0.01080710	0.00049376	0.00025699	0.07183301	0.05277789	0.00018798	0.00028195	0.00051195	0.00245939	0.00669087	0.00713095	0.00696176	0.02009486	0.35700939	0.00817815
+T[T>A]C	0.00000000	0.00019201	0.00430964	0.00413917	0.03420287	0.01949921	0.00247466	0.00645085	0.00023199	0.00466855	0.00273179	0.00047477	0.00079496	0.02361085	0.00004708	0.00124985	0.00024096	0.00244976	0.00101975	0.00369048	0.01030137	0.00002071	0.00257934	0.00087758	0.00284712
+T[T>A]G	0.00002800	0.00005010	0.00953921	0.00478904	0.01220103	0.01289948	0.00056580	0.00277036	0.00018799	0.00517839	0.00179118	0.00037282	0.00009850	0.07323366	0.00000000	0.00032096	0.00018997	0.00175982	0.00087178	0.00546071	0.00502067	0.00000502	0.00402897	0.00060045	0.00675146
+T[T>A]T	0.00225040	0.00020501	0.00561953	0.00874825	0.27902345	0.03789847	0.00483127	0.00525069	0.00006200	0.00715778	0.00710467	0.00067267	0.00007640	0.03011384	0.00192919	0.00571931	0.00070088	0.00071093	0.00269933	0.01070139	0.02100279	0.01390352	0.00637837	0.16267575	0.00604418
+T[T>C]A	0.00025505	0.00000000	0.00240980	0.01799640	0.03020254	0.00207992	0.01699877	0.08611128	0.00002210	0.01299597	0.00180118	0.00123940	0.08419605	0.00463213	0.00171928	0.00130984	0.00054390	0.00089691	0.00296927	0.00594077	0.01020136	0.01990504	0.00445886	0.01011527	0.03453614
+T[T>C]C	0.00339060	0.00004350	0.00050296	0.00970806	0.02090176	0.00263989	0.01675970	0.04630607	0.00002490	0.00366886	0.00618406	0.00055273	0.05479743	0.00000000	0.00348854	0.00204975	0.00028595	0.00121988	0.00227944	0.00644084	0.00755100	0.01050266	0.00392899	0.00044649	0.00435020
+T[T>C]G	0.00041607	0.00011700	0.00173986	0.01269746	0.01290108	0.00000000	0.01511532	0.04000524	0.00009980	0.00722776	0.00326214	0.00107947	0.02759870	0.00122056	0.00114952	0.00140983	0.00020296	0.00168983	0.00137966	0.00498065	0.00601080	0.01910484	0.00246937	0.00013857	0.01293528
+T[T>C]T	0.00433077	0.00003580	0.00063595	0.01849630	0.08810740	0.00456982	0.01992081	0.05970782	0.00053098	0.00838740	0.00337222	0.00146928	0.04069809	0.00000000	0.00152936	0.00205975	0.00044492	0.00068393	0.00279931	0.00948123	0.01020136	0.03710940	0.02129455	0.00400011	0.01428691
+T[T>G]A	0.00000000	0.00001670	0.00037697	0.00521896	0.01930162	0.00000000	0.00873077	0.00163021	0.00018399	0.00977697	0.00069646	0.00165919	0.00046498	0.00506233	0.00118950	0.04229488	0.00011798	0.00002260	0.00078781	0.00839109	0.00846113	0.00000000	0.00254935	0.01858316	0.00220843
+T[T>G]C	0.00005511	0.00007040	0.00017399	0.00655869	0.01740146	0.00113995	0.00095216	0.00113015	0.00000000	0.00550829	0.00210138	0.00201902	0.00037898	0.00075235	0.00027988	0.03569568	0.00009638	0.00022398	0.00074382	0.00508066	0.01140152	0.00000000	0.00346911	0.00018475	0.00030058
+T[T>G]G	0.00058310	0.00009540	0.00231981	0.00693861	0.00764064	0.00308988	0.00110836	0.00087511	0.00003670	0.00523837	0.00145095	0.00206899	0.00013099	0.00557256	0.00234902	0.01399831	0.00081286	0.00081792	0.00090178	0.00728095	0.00866115	0.00091723	0.00275929	0.00029253	0.00174284
+T[T>G]T	0.00000000	0.00000000	0.00056795	0.01349730	0.02170182	0.00099596	0.02511471	0.00221029	0.00001890	0.01579510	0.00516339	0.00422794	0.00000000	0.00059527	0.00013994	0.47894205	0.00888842	0.00063494	0.00180955	0.01090142	0.02500333	0.00900228	0.00290926	0.00833022	0.00179435

sigprofilerassignment-1.1.2/SigProfilerAssignment/DecompositionPlots/ExampleSample/COSMIC_SV32_Signatures.txt ADDED Viewed

@@ -0,0 +1,33 @@
+MutationType	SV1	SV2	SV3	SV4	SV5	SV6	SV7	SV9
+clustered_del_1-10Kb	0.00001830	0.00001750	0.00000831	0.00558463	0.00162643	0.00484161	0.00036457	0.01689226
+clustered_del_10-100Kb	0.00000013	0.00000500	0.00000000	0.00883802	0.00395326	0.00397105	0.00493403	0.02027149
+clustered_del_100Kb-1Mb	0.00004260	0.00000257	0.00000253	0.01342056	0.00264242	0.01567818	0.00175481	0.04559844
+clustered_del_1Mb-10Mb	0.00000003	0.00000557	0.00000000	0.01941683	0.00079517	0.06315566	0.00000135	0.08553749
+clustered_del_>10Mb	0.00000003	0.00000224	0.00000009	0.01212996	0.00000205	0.13914616	0.00000121	0.00004090
+clustered_tds_1-10Kb	0.00000029	0.00002000	0.00233538	0.00119602	0.00044748	0.00173254	0.00023931	0.00407692
+clustered_tds_10-100Kb	0.00080029	0.00003770	0.00137651	0.00406629	0.00092090	0.00411956	0.00031235	0.00799563
+clustered_tds_100Kb-1Mb	0.00217807	0.00001180	0.00018608	0.00927806	0.00180766	0.01359699	0.00000078	0.04878886
+clustered_tds_1Mb-10Mb	0.00006350	0.00000161	0.00000004	0.01669456	0.00008410	0.06927579	0.00000076	0.07607224
+clustered_tds_>10Mb	0.00000003	0.00000314	0.00000010	0.00950079	0.00003530	0.14468700	0.00000187	0.00019873
+clustered_inv_1-10Kb	0.00003510	0.00009050	0.00000000	0.01188233	0.01068676	0.00333129	0.00000116	0.00901519
+clustered_inv_10-100Kb	0.00000113	0.00002000	0.00000415	0.01283746	0.00421801	0.00778075	0.00000166	0.03440818
+clustered_inv_100Kb-1Mb	0.00062736	0.00000829	0.00000000	0.01893295	0.00104651	0.02657075	0.00000052	0.08534106
+clustered_inv_1Mb-10Mb	0.00000637	0.00000052	0.00000003	0.03875053	0.00018613	0.13269196	0.00000021	0.15018331
+clustered_inv_>10Mb	0.00000001	0.00000229	0.00000003	0.02250855	0.00000130	0.26682614	0.00000158	0.00004010
+clustered_trans	0.00005860	0.00000182	0.00000829	0.74672823	0.01500836	0.00000039	0.00000036	0.00000269
+non-clustered_del_1-10Kb	0.00016322	0.01077137	0.03108973	0.00000143	0.27051044	0.00049070	0.11080824	0.03271109
+non-clustered_del_10-100Kb	0.01062551	0.00189318	0.00026854	0.00000001	0.04236249	0.00047467	0.40908574	0.03762502
+non-clustered_del_100Kb-1Mb	0.01031305	0.00009900	0.00051531	0.00110315	0.02494482	0.00056581	0.34862452	0.05284083
+non-clustered_del_1Mb-10Mb	0.00810848	0.04772402	0.00323839	0.00114858	0.04036508	0.00908681	0.02776373	0.04842356
+non-clustered_del_>10Mb	0.00460793	0.05938062	0.00861972	0.00280099	0.02737192	0.01709695	0.01575099	0.01781587
+non-clustered_tds_1-10Kb	0.00000013	0.00004480	0.42763680	0.00000015	0.08730244	0.00000010	0.01078117	0.01195956
+non-clustered_tds_10-100Kb	0.04599380	0.00002460	0.32675443	0.00000001	0.12292716	0.00000054	0.00652355	0.01970948
+non-clustered_tds_100Kb-1Mb	0.45491853	0.01413625	0.01600693	0.00008590	0.06600995	0.00067638	0.00545841	0.01400244
+non-clustered_tds_1Mb-10Mb	0.35062795	0.04029646	0.00096917	0.00013931	0.01815304	0.00881413	0.00239992	0.02583554
+non-clustered_tds_>10Mb	0.00580397	0.03967873	0.00649925	0.00298543	0.01284238	0.01668428	0.00007000	0.00744539
+non-clustered_inv_1-10Kb	0.00440008	0.00000085	0.00411229	0.00018744	0.04638068	0.00022783	0.00000043	0.01662502
+non-clustered_inv_10-100Kb	0.01048762	0.00459802	0.00275734	0.00116401	0.03219888	0.00171438	0.03025930	0.01859228
+non-clustered_inv_100Kb-1Mb	0.01700822	0.05558915	0.00038638	0.00198348	0.03887257	0.00243843	0.01706313	0.03888396
+non-clustered_inv_1Mb-10Mb	0.01075404	0.09313637	0.00482722	0.00198335	0.03699181	0.01686964	0.00553730	0.04676524
+non-clustered_inv_>10Mb	0.01304926	0.09976361	0.01624505	0.01157483	0.04637754	0.02742841	0.00186541	0.02399899
+non-clustered_trans	0.04930641	0.53263233	0.14615191	0.02307616	0.04292692	0.00002510	0.00039160	0.00230227

SigProfilerAssignment 1.1.1__tar.gz → 1.1.2__tar.gz

SigProfilerAssignment 1.1.1tar.gz → 1.1.2tar.gz